This is a documentation of the software package COCOS. The purpose of COCOS is the computation of corner singularities of elliptic equations in polyhedral corners and crack tips. COCOS provides a self-contained library for the generation of structured 2D finite element meshes, including various routines for mesh manipulation, as well as several algorithms for the solution of quadratic eigenvalue problems with Hamiltonian structure. These and further features will be described in this documentation.

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Os fungos de decomposição branca e parda produzem enzimas para degradar os componentes da madeira, os primeiros produzem enzimas hidrolíticas e oxidativas enquanto os outros produzem principalmente enzimas hidrolíticas. A degradação de polissacarídeos e lignina por fungos de decomposição parda e branca seletiva, respectivamente, não ocorre na região imediata à hifa, e, também, não pode ser explicada unicamente por ação enzimática devido a impermeabilidade das mesmas na parede celular. Neste trabalho estudou-se o sistema degradativo não enzimático envolvendo compostos de baixa massa molar (CBMM) redutores de ferro em fungos degradadores de madeira. O fungo de decomposição parda, Wolfiporia cocos e o de decomposição branca seletiva, Perenniporia medulla-panis foram cultivados em diferentes concentrações de ferro, e a atividade redutora de Fe3+ micelial e a extracelular, assim como a produção de quelantes específicos de ferro, como derivados de ácido hidroxâmico e de catecol, foram induzidas em condição de deficiência de ferro. Os géis de SDS-PAGE dos extratos fúngicos mostraram várias proteínas negativamente reguladas por ferro em P. medulla-panis e W. cocos, principalmente para proteínas entre 10 - 30 kDa. Quando os fungos foram cultivados em diferentes fontes de carbono simples com e sem suplementação de celulose microcristalina e deficiência de ferro, produziram CBMM redutores de Fe3+, os quais tiveram a produção estimulada nos meios com celulose. Análises de eletroforese capilar dos compostos quelantes de metal extraídos dos meios que proporcionaram a maior atividade redutora (Lornitina/ celulose para P. medulla-panis e glicose/celulose para W. cocos) na presença e ausência de ferro, confirmaram que, principalmente P. medulla-panis produz compostos extracelulares que são regulados por ferro. Os CBMM purificados das frações < 5 kDa apresentaram atividade redutora de Fe3+ em pH 2,0 mesmo quando ácido oxálico foi adicionado na concentração 20 vezes maior que a concentração de Fe3+. Em pH 4,5, a atividade redutora foi detectada até uma concentração de ácido oxálico 10 vezes superior a de Fe3+. Em ambos os casos a atividade redutora foi observada quando Fe3+ estava presente na forma livre ou complexada como Fe(oxalato)+. Dentre os vários CBMM produzidos por P. medulla-panis e W. cocos aqueles com atividade redutora foram o ácido 4-hidroxi-fenilacético, 1,2-dihidroxi-3-metil-benzeno, 1,2,3-trihidroxi-benzeno e o ácido 4- hidroxi-cinâmico para W. cocos, e para P. medulla-panis os principais foram 1,2-dihidroxibenzeno e 1,2,3-trihidroxi-benzeno. Além desses compostos, ambos os fungos produziram peptídeos de baixa massa molar com atividade redutora. Os CBMM redutores de Fe3+ de P. medulla-panis (Pmp) e de W. cocos (Wc) foram utilizados na ausência e presença de Fe3+ e H2O2 (reação de Fenton mediada) para oxidar polissacarídeos e lignina in vitro. Verificou-se que os maiores níveis de oxidação foram obtidos nas reações de Fenton mediadas (Wc-Fe3+/H2O2 e Pmp-Fe3+/H2O2). A degradação da celulose por estes sistemas foi caracterizada por uma rápida e extensiva despolimerização, seguida de significativa oxidação. Análises dos monômeros de lignina liberados de conífera tratada e não tratada após 13C-TMAH termoquimólise indicaram oxidação da lignina pelos sistemas Wc-Fe3+/H2O2 e Pmp- Fe3+/H2O2, principalmente por desmetoxilação e/ou desmetilação. A ação sinérgica entre os CBMM redutores de Fe3+ e as enzimas ligninolíticas ficou evidenciada para os fungos de decomposição branca Lentinula edodes, P. medulla-panis e Trametes versicolor através da oxidação do corante Azure B. / Brown and white rot fungi produce enzymes to degrade wood. The former produce hydrolytic and oxidative enzymes while the latter produce mainly hydrolytic enzymes. The degradation of polysaccharides and lignin by brown and white-rot fungi, respectively, do not occur next to the fungal hyphae and cannot be explained only by the enzymatic action due to the small pore size of sound wood. In this work, it was studied a non-enzymatic degradative system involving low molecular weight compounds (LMWC) with Fe3+-reducing activity in wood decay fungi. The brown rot fungus Wolfiporia cocos and the selective white rot Perenniporia medulla-panis were grown under varying concentration of iron. The micelial and extracellular Fe3+-reducing activity as well as the production of specific iron chelators (catechol and hydroxamate derivatives) were induced under iron starvation. SDS-PAGE gels of cellular proteins showed several proteins negatively iron-regulated in P. medulla-panis and in W. cocos, especially for proteins of 10 - 30 kDa. When the fungi were grown with different simple carbon source with and without microcrystalline cellulose supplementation and under iron restriction, they produced LMWC with Fe3+-reducing activity, which production was stimulated in the presence of cellulose. Capillary electrophoresis analyses of metal chelating compounds extracted from the growth media that promoted the highest Fe3+-reducing activity (L-ornithine/cellulose for P. medulla-panis and glucose/cellulose for W. cocos) in the presence and absence of iron, confirmed that, especially P. medulla-panis produces extracellular compounds that are iron-regulated. LMWC purified from these media showed Fe3+-reducing activity at pH 2.0 even when oxalic acid was added up to 20 fold the iron concentration. At pH 4.5, the Fe3+-reducing activity was detected at an oxalic acid concentration up to 10 fold the iron concentration. In both cases the LMWC were capable of reducing Fe3+ only when it was in its free form or complexed with oxalate to form Fe3+-monooxalate complex (Fe(C2O4)+). Among the several LMWC produced by P. medulla-panis and W. cocos those with Fe3+-reducing capability were 4-hydroxy-phenylacetic acid, 1,2- dihydroxy-methyl-benzene, 1,2,3-trihydroxy-benzene and 4-hydroxy-cinnamic acid to W. cocos and 1,2-dihydroxy-benzene, and 1,2,3-tri-hydroxy-benzene to P. medulla-panis. Both fungi also produce low molecular weight peptides with Fe3+-reducing capability. The purified LMWC with Fe3+-reducing activity from P. medulla-panis (Pmp) and from W. cocos (Wc) were utilized in the presence and absence of Fe3+ and H2O2 (mediated Fenton reaction) to oxidize polysaccharides and lignin in vitro. The highest oxidation levels were obtained with mediated Fenton reactions (Wc-Fe3+/H2O2 e Pmp-Fe3+/H2O2). Cellulose degradation by these systems was characterized by a rapid and extensive depolymerization followed by significant oxidation. Analyses of the lignin monomers released from treated and untreated softwood after 13C-TMAH thermochemolysis indicated lignin oxidation by the Wc-Fe3+/H2O2 and Pmp-Fe3+/H2O2 systems, mainly by demethoxylation and/or demethylation. The synergistic action between LMWC with Fe3+-reducing activity and the ligninolytic enzymes was evidenced to the white rot fungi Lentinula edodes, P. medulla-panis and Trametes versicolor with Azure B oxidation assays.

Os fungos de decomposição branca e parda produzem enzimas para degradar os componentes da madeira, os primeiros produzem enzimas hidrolíticas e oxidativas enquanto os outros produzem principalmente enzimas hidrolíticas. A degradação de polissacarídeos e lignina por fungos de decomposição parda e branca seletiva, respectivamente, não ocorre na região imediata à hifa, e, também, não pode ser explicada unicamente por ação enzimática devido a impermeabilidade das mesmas na parede celular. Neste trabalho estudou-se o sistema degradativo não enzimático envolvendo compostos de baixa massa molar (CBMM) redutores de ferro em fungos degradadores de madeira. O fungo de decomposição parda, Wolfiporia cocos e o de decomposição branca seletiva, Perenniporia medulla-panis foram cultivados em diferentes concentrações de ferro, e a atividade redutora de Fe3+ micelial e a extracelular, assim como a produção de quelantes específicos de ferro, como derivados de ácido hidroxâmico e de catecol, foram induzidas em condição de deficiência de ferro. Os géis de SDS-PAGE dos extratos fúngicos mostraram várias proteínas negativamente reguladas por ferro em P. medulla-panis e W. cocos, principalmente para proteínas entre 10 - 30 kDa. Quando os fungos foram cultivados em diferentes fontes de carbono simples com e sem suplementação de celulose microcristalina e deficiência de ferro, produziram CBMM redutores de Fe3+, os quais tiveram a produção estimulada nos meios com celulose. Análises de eletroforese capilar dos compostos quelantes de metal extraídos dos meios que proporcionaram a maior atividade redutora (Lornitina/ celulose para P. medulla-panis e glicose/celulose para W. cocos) na presença e ausência de ferro, confirmaram que, principalmente P. medulla-panis produz compostos extracelulares que são regulados por ferro. Os CBMM purificados das frações < 5 kDa apresentaram atividade redutora de Fe3+ em pH 2,0 mesmo quando ácido oxálico foi adicionado na concentração 20 vezes maior que a concentração de Fe3+. Em pH 4,5, a atividade redutora foi detectada até uma concentração de ácido oxálico 10 vezes superior a de Fe3+. Em ambos os casos a atividade redutora foi observada quando Fe3+ estava presente na forma livre ou complexada como Fe(oxalato)+. Dentre os vários CBMM produzidos por P. medulla-panis e W. cocos aqueles com atividade redutora foram o ácido 4-hidroxi-fenilacético, 1,2-dihidroxi-3-metil-benzeno, 1,2,3-trihidroxi-benzeno e o ácido 4- hidroxi-cinâmico para W. cocos, e para P. medulla-panis os principais foram 1,2-dihidroxibenzeno e 1,2,3-trihidroxi-benzeno. Além desses compostos, ambos os fungos produziram peptídeos de baixa massa molar com atividade redutora. Os CBMM redutores de Fe3+ de P. medulla-panis (Pmp) e de W. cocos (Wc) foram utilizados na ausência e presença de Fe3+ e H2O2 (reação de Fenton mediada) para oxidar polissacarídeos e lignina in vitro. Verificou-se que os maiores níveis de oxidação foram obtidos nas reações de Fenton mediadas (Wc-Fe3+/H2O2 e Pmp-Fe3+/H2O2). A degradação da celulose por estes sistemas foi caracterizada por uma rápida e extensiva despolimerização, seguida de significativa oxidação. Análises dos monômeros de lignina liberados de conífera tratada e não tratada após 13C-TMAH termoquimólise indicaram oxidação da lignina pelos sistemas Wc-Fe3+/H2O2 e Pmp- Fe3+/H2O2, principalmente por desmetoxilação e/ou desmetilação. A ação sinérgica entre os CBMM redutores de Fe3+ e as enzimas ligninolíticas ficou evidenciada para os fungos de decomposição branca Lentinula edodes, P. medulla-panis e Trametes versicolor através da oxidação do corante Azure B. / Brown and white rot fungi produce enzymes to degrade wood. The former produce hydrolytic and oxidative enzymes while the latter produce mainly hydrolytic enzymes. The degradation of polysaccharides and lignin by brown and white-rot fungi, respectively, do not occur next to the fungal hyphae and cannot be explained only by the enzymatic action due to the small pore size of sound wood. In this work, it was studied a non-enzymatic degradative system involving low molecular weight compounds (LMWC) with Fe3+-reducing activity in wood decay fungi. The brown rot fungus Wolfiporia cocos and the selective white rot Perenniporia medulla-panis were grown under varying concentration of iron. The micelial and extracellular Fe3+-reducing activity as well as the production of specific iron chelators (catechol and hydroxamate derivatives) were induced under iron starvation. SDS-PAGE gels of cellular proteins showed several proteins negatively iron-regulated in P. medulla-panis and in W. cocos, especially for proteins of 10 - 30 kDa. When the fungi were grown with different simple carbon source with and without microcrystalline cellulose supplementation and under iron restriction, they produced LMWC with Fe3+-reducing activity, which production was stimulated in the presence of cellulose. Capillary electrophoresis analyses of metal chelating compounds extracted from the growth media that promoted the highest Fe3+-reducing activity (L-ornithine/cellulose for P. medulla-panis and glucose/cellulose for W. cocos) in the presence and absence of iron, confirmed that, especially P. medulla-panis produces extracellular compounds that are iron-regulated. LMWC purified from these media showed Fe3+-reducing activity at pH 2.0 even when oxalic acid was added up to 20 fold the iron concentration. At pH 4.5, the Fe3+-reducing activity was detected at an oxalic acid concentration up to 10 fold the iron concentration. In both cases the LMWC were capable of reducing Fe3+ only when it was in its free form or complexed with oxalate to form Fe3+-monooxalate complex (Fe(C2O4)+). Among the several LMWC produced by P. medulla-panis and W. cocos those with Fe3+-reducing capability were 4-hydroxy-phenylacetic acid, 1,2- dihydroxy-methyl-benzene, 1,2,3-trihydroxy-benzene and 4-hydroxy-cinnamic acid to W. cocos and 1,2-dihydroxy-benzene, and 1,2,3-tri-hydroxy-benzene to P. medulla-panis. Both fungi also produce low molecular weight peptides with Fe3+-reducing capability. The purified LMWC with Fe3+-reducing activity from P. medulla-panis (Pmp) and from W. cocos (Wc) were utilized in the presence and absence of Fe3+ and H2O2 (mediated Fenton reaction) to oxidize polysaccharides and lignin in vitro. The highest oxidation levels were obtained with mediated Fenton reactions (Wc-Fe3+/H2O2 e Pmp-Fe3+/H2O2). Cellulose degradation by these systems was characterized by a rapid and extensive depolymerization followed by significant oxidation. Analyses of the lignin monomers released from treated and untreated softwood after 13C-TMAH thermochemolysis indicated lignin oxidation by the Wc-Fe3+/H2O2 and Pmp-Fe3+/H2O2 systems, mainly by demethoxylation and/or demethylation. The synergistic action between LMWC with Fe3+-reducing activity and the ligninolytic enzymes was evidenced to the white rot fungi Lentinula edodes, P. medulla-panis and Trametes versicolor with Azure B oxidation assays.

Submitted by Lara Oliveira (lara@ufersa.edu.br) on 2017-01-04T13:05:22Z No. of bitstreams: 1 CarinaML_TESE.pdf: 1476302 bytes, checksum: d8ce6c34270ba40b6a6e97b30bf6d975 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-01-24T14:44:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarinaML_TESE.pdf: 1476302 bytes, checksum: d8ce6c34270ba40b6a6e97b30bf6d975 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:51:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarinaML_TESE.pdf: 1476302 bytes, checksum: d8ce6c34270ba40b6a6e97b30bf6d975 (MD5) Previous issue date: 2014-03-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The tall coconut palm is about 70% of the coconut farm in Brazil. Nonetheless the information about the genetic variability existing in Brazilian populations and their genetic relationships are still incipient. Microsatellite markers or SSR (Simple Sequence Repeats) and morphological markers are the techniques most suitable for studies of genetic diversity. Thus, knowledge of the variability and genetic structure in the giant coconut palm, it is necessary to direct the activities of conservation and use of germplasm in breeding programs of this species. The objectives of this study were: 1) to analyze the distribution of the genetic variability of the original population of Tall-Brazil-Praia-Forte ( GBrPF - PO), located on the north coast of Bahia, and four coming accesses this population; 2) levels of diversity and genetic relationships between two accesses tall coconut palm collected in Brazil and introduced seven accessions of different geographical regions, conserved in Banco Internacional de Coco for Latin America and the Caribbean (ICG - LAC). The accessions were analyzed using 25 SSR primers specific morphological descriptors and 16 of the list of IPGRI, 1995. Accesses tall- Brazil-Praia-Forte (GBrPF) are conserved in physical bases in Ceará (GBrPF-CE), Pará (GBrPF-PA ) and ICG - LAC, the latter two physical bases in Sergipe: one in the experimental field of the Betume in the city of Neópolis (GBrPF-CEB) and the other in the experimental field Itaporanga in the municipality of Itaporanga d'Ajuda (GBrPF-CEI) . The other accesses greens: tall-do-Brazil-Merepe (GBrMe), collected in the coastal Northeast, tall-Malaysia (GML), tall-Vanuatu (GVT), tall-West African (GOA), tall-Polynesia (GPY), tall-Rennel (GRL), tall-Tonga (GTG) and tall-Rotuma (GRT) introduced in different geographic regions of the world, too are conserved in the ICG - LAC in the experimental field of the Betume. Three studies from this research project will be presented. In the first study, we found 18 polymorphic primers, 91 alelos, with a mean of 5.05 alleles/locus. Genotypic indices indicate greater genetic variability of access GBrPF-PA, GBrPF-CE and GBrPF-CEB, the analysis of gene structure identified an allele sharing and access of the population, suggesting that accesses listed represent the genetic structure of the original population. The grouping (UPGMA) showed the formation of 14 groups, with the GBrPF-CEB and GBrPF-PA showed greater similarity to the original population accesses. In the second study, for the study of genetic relationships among accessions of tall coconut palm, 19 primers were polymorphic, detecting 125 alleles, with an average of 6.57 alleles/locus. Genotypic indices indicate greater genetic variability among accessions of coconut - derived giant introduced the Pacific region. The analysis of gene structure led to the formation of five groups and accessions collected in Brazil showed genetic relationship with the African access and the emergence of ecotypes giant coconut palm in Brazil. Cluster analysis by the Nearest Neighbor method formed two main groups. In group I, the accessions were grouped into three subgroups: Ia (GTG, GRT and GPY), Ib (GRL and GVT) and Ic (GML). In group II, the accessions were separated into two subgroups: IIa (GOA) and IIb (GBrMe, GBrPF),indicating that the genetic relationships of the accessions are based on ecogeographic regions. In the third work, the study of genetic diversity through morphological markers using techniques of univariate and multivariate genetic variability was observed among genotypes. The results of principal component analysis, obtained from 16 morphological characters shows that three components were needed, that the variance explained by them reached a minimum of 80% and the selection of six characters with the highest contribution to the study of diversity. UPGMA was formed by five groups. Group I meets the GVT and GML access; group II with GPY, GTG and GBrPF; group III and IV each with one access, GRT and GOA, respectively, while group V with GBrMe and GRL. Groups showed an inconsistency with respect to the origins of the accessions, probably due to the quantitative nature of those characteristics that are controlled by many genes, being affected by environmental factors. Diversity and genetic structure evaluations demonstrate the variability and genetic relations in giant coconut palm. These results will guide decisions about the activities of conservation and use of coconut germplasm in the country / O coqueiro-gigante representa cerca de 70% da exploração do coqueiro no Brasil. Apesar disso, as informações sobre a variabilidade genética existente nas populações brasileiras e suas relações genéticas ainda são incipientes. Os marcadores microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats), e os marcadores morfológicos, são as técnicas mais indicadas para os estudos de diversidade genética. Assim, o conhecimento da variabilidade e da estruturação genética em coqueiro-gigante, torna-se necessário para direcionar as atividades de conservação e utilização do germoplasma nos programas de melhoramento da espécie. Os objetivos do presente estudo foram: 1) analisar a distribuição da variabilidade genética da população original de gigante-do-Brasil-da-Praia-do-Forte (GBrPF-PO), localizada do litoral norte do Estado da Bahia, e de quatro acessos procedentes dessa população; 2) os níveis de diversidade e as relações genéticas entre dois acessos de coqueiro-gigante coletados no Brasil e sete acessos introduzidos de diferentes regiões geográficas do mundo, conservados no Banco Internacional de Coco para a América Latina e Caribe (ICG- LAC).Os acessos foram analisados por meio de 25 primers SSR específicos e 16 descritores morfoagronômicos da lista do IPGRI, 1995.Os acessos de gigante-do-Brasil-da-Praia-Forte (GBrPF) são conservados em bases físicas no Ceará (GBrPF-CE), Pará (GBrPF-PA) e no ICG-LAC, este último em duas bases físicas em Sergipe: uma no campo experimental do Betume, no município de Neopólis (GBrPF-CEB) e a outra no campo experimental de Itaporanga, no município de Itaporanga d’Ajuda (GBrPF-CEI). Os demais acessos de coqueiro: gigante-do-Brasil-de-Merepe (GBrMe), coletado no litoral do Nordeste do país, gigante-da-Malásia (GML), gigante-de-Vanuatu (GVT), gigante-do-Oeste-Africano (GOA), gigante-da-Polinésia (GPY), gigante-de-Rennel (GRL), gigante-de-Tonga (GTG) e gigante-de-Rotuma (GRT) introduzidos de diferentes regiões geográficas do mundo, também estão conservados no ICG-LAC no campo experimental do Betume. Três trabalhos oriundos deste projeto de pesquisa serão apresentados. No primeiro trabalho, constatou-se 18 primers polimórficos, 91alelos, com media de 5,05 alelos/loco. Os índices genotípicos indicam maior variabilidade genética dos acessos GBrPF-PA, GBrPF-CE e GBrPF-CEB, a análise da estrutura gênica identificou um compartilhamento de alelos da população e dos acessos, sugerindo que os acessos coletados, representam a estruturação genética da população original. O agrupamento (UPGMA), evidenciou a formação de 14 grupos, tendo os acessos GBrPF-CEB e GBrPF-PA mostrado maior similaridade com a população original. No segundo trabalho, para o estudo das relações genéticas entre acessos de coqueiro-gigante, 19 primers foram polimórficos, detectando 125 alelos, com média de 6,57 alelos/loco. Os índices genotípicos indicam uma maior variabilidade genética entre os acessos de coqueiros-gigantes introduzidos oriundos da região do Pacífico. A análise da estrutura gênica levou a formação de cinco grupos e os acessos coletados no Brasil apresentaram relação genética com o acesso Africano e o surgimento de ecótipos de coqueiro-gigante no Brasil. A análise de agrupamento pelo método do Vizinho mais Próximo formou dois grupos principais. No grupo I, os acessos foram agrupados em três subgrupos: Ia (GTG, GRT e GPY), Ib (GRL e GVT) e Ic (GML). No grupo II, os acessos foram separados em dois subgrupos : IIa (GOA) e IIb (GBrMe, GBrPF). Indicando que as relações genéticas dos acessos são fundamentadas nas regiões ecogeográficas. O terceiro trabalho,o estudo da diversidade genética, por meio de marcadores morfoagronômicos utilizando técnicas de análises uni e multivariadas, foi observada variabilidade genética entre os acessos. Os resultados da análise dos componentes principais, obtidos a partir de 16 caracteres morfoagronômicos mostra que foram necessários três componentes, para que a variância por eles explicada atingisse um mínimo de 80% e a seleção de seis caracteres de maior contribuição para o estudo da diversidade. Pelo método UPGMA formou-se cinco grupos. O grupo I reúne os acessos GVT e GML; o grupo II com o GPY, GTG e GBrPF; o grupo III e IV com apenas um acesso cada, GRT e o GOA, respectivamente e o grupo V com o GBrMe e GRL. Os grupos apresentaram uma incoerência com relação às origens dos acessos, provavelmente devido à natureza quantitativa das características avaliadas, que são controladas por muitos genes, sendo afetadas por fatores ambientais. As avaliações da diversidade e da estruturação genética evidenciam a variabilidade e as relações genéticas existentes em coqueiro-gigante. Esses resultados permitirão orientar as decisões sobre as atividades de conservação e uso do germoplasma do coqueiro no país / 2017-01-04

Existe ampla evidência do nível de seletividade exibido por macacos-prego (Sapajus sp) em situações de escolha de ferramentas para a quebra de frutos encapsulados; indicando que as características dos martelos (material, peso e distância de transporte), assim como as características físicas próprias dos indivíduos, afetam a eficiência do na quebra e determinam o processo individual de tomada de decisões no uso de ferramentas. Considerando a predição de que também é provável que a eficiência na quebra seja dependente do controle do macaco sobre a pedra e do ângulo de impacto; o presente trabalho teve como objetivo avaliar experimentalmente se a forma das ferramentas afeta a eficiência na quebra e é levada em consideração pelos macacos-prego, na hora de escolher as ferramentas a serem usadas. Para tal, testamos a escolha de pedras por cinco macacos-prego semilivres usuários de ferramentas - fazendo uso de pedras artificiais e realizando tentativas discretas de escolha com participação livre dos indivíduos - através de um delineamento fatorial de medidas repetidas com oito condições experimentais, correspondentes às possíveis combinações de três variáveis independentes em dois níveis: forma dos martelos (possibilidades de pegada e superfície potencial de contato), peso (leve e pesado) e distância de transporte exigida (perto e longe das bigornas). Avaliamos a seletividade exibida, os comportamentos manipulativos exploratórios e a proficiência natural de quebra de cada sujeito, visando elucidar os fatores determinantes do processo de escolha de ferramentas para a quebra de frutos. Os resultados apontam preferência dos macacos-prego pelos martelos que fornecem maior eficiência, pedras com maior possibilidade de pegada e maior superfície potencial de contato no golpe, aumentando os benefícios e diminuindo os custos do uso. Não encontramos um efeito evidente das variáveis de custo (peso e distância de transporte) sobre a preferência pelas características da forma, nem foi encontrada uma relação entre a preferência exibida em condições experimentais com o engajamento e proficiência natural dos indivíduos na quebra de cocos. Finalmente, verificamos que os macacos-prego baseiam suas escolhas principalmente a partir das dicas visuais, não obstante exibirem comportamentos manipulativos exploratórios que possivelmente permitem ganhar informação adicional sobre as propriedades da forma das ferramentas para realizar a escolha / Evidences point out that capuchin monkeys select stone tools for nut cracking based on the physical characteristics of tools (material, weight, transporting distance) in relation to their own physical characteristics (size, weight), and that selectivity seems to affect the efficiency of nut cracking, determining individual decision making in tool use. Considering the prediction that nut crack efficiency is affected by individual control, the stone and the impact angle; this study aimed to evaluate experimentally if the tools shape affect nut crack efficiency, and if this is considered in individual tool selection. We tested the choices of five semi-free individuals using artificial designed tools in eight different experimental conditions, manipulating hammers weight, shape and distance to the anvil, to determine the factors involved in tool selection process for nut cracking. The results shows the monkeys prefer hammers that increase cracking nut efficiency, with more holding possibility, and higher potential contact surface in the bites. There was no evidence for effect of variables related with costs (hammer weight and transporting distance) on the shape preference, and there was no relation between preferences in experimental conditions and engage or efficiency in baseline. We found that the capuchin monkeys based their tool choices in visual characteristics and exhibit manipulative exploratory behaviors that allow them to gain information about the tools shape to make choices

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-07T17:52:37Z No. of bitstreams: 1 Eric Xavier de Carvalho.pdf: 648807 bytes, checksum: 66df22d6c50815aa9aeee4122f493050 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T17:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eric Xavier de Carvalho.pdf: 648807 bytes, checksum: 66df22d6c50815aa9aeee4122f493050 (MD5) Previous issue date: 2006-02-07 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this work was to evaluate the variability among cultivars of dwarf coconut palms and among hybrids, besides identifying and quantifying associations among morphologic characters in dwarves in Tabuleiros Costeiros of the North of Sergipe State. The coconut palm exploration is an agricultural activity of elevate partner-economic importance, for its multiple uses and purposes, generation of jobs and income. It is economically important for about 86 countries. The Brazilian of coconut palm productivity is low due the poor genectic cultivars is the main problem for this activity in the country. Knowledging variability, through genetic parameters, genetic and phenotypical correlation, and the implications of the effect of the cultivar x environment to know the control of the characters, the potential of the population for selection besides facilitating and speeding up the indication to cultivate to use in programs of genetic improvement. Two experiments had been installed since 1997, in the Farm Agreste in Neópolis (SE). The used experimental desing was randomized block, with six cultivars of dwarf coconut palm and eight hybrids, respectively, with four blocks, 16 usefull plants/plot. The measurements of the characteristics were carried out quarterly from 2001 at 2004 of the analyses of variance and estimate of the components of phenotypical variation, genetic and ambient and 1999 and 2004 considering the characteristics of the juvenile and adult phase of the plants for determination of the correlations. To cultivars of dwarf coconut palm had presented potential variability to the genetic improvement with possibility of gain for selection and indication to the producer to cultivars more suitable to the diverse producing regions. The intervarietais hybrids had presented variability and little specificities in the behavior for the enviromental conditions of the four evaluated years. There are genetic associations among characters of the vegetative and reproductive phases of the dwarf coconut palms. / O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade entre cultivares de coqueiro anão e híbridos, além de identificar e quantificar associações entre caracteres morfológicos em anões nos tabuleiros costeiros do norte de Sergipe. O cultivo do coqueiro é uma atividade agrícola de elevada importância socioeconômica, por seus múltiplos usos e finalidades,geração de empregos e renda, além da fixação do homem ao campo sendo importante economicamente para cerca de 86 países. A baixa produtividade brasileira de coco é um dos principais problemas da cultura do coqueiro no país. O conhecimento da variabilidade devida às diferenças genéticas, através de parâmetros genéticos e correlações genética e fenotípica, e as implicações dos efeitos da interação cultivar x ambiente, permitem conhecer o controle genético dos caracteres, o potencial da população para seleção, além de facilitar e acelerar a indicação de cultivares para uso em programas de melhoramento genético. Dois experimentos foram conduzidos desde 1997, na Fazenda Agreste em Neópolis (SE), em delineamento experimental de blocos casualizados, com seis cultivares de coqueiro anão e oito híbridos, respectivamente,com quatro blocos e 16 plantas úteis/parcela. As mensurações dos caracteres foram realizadas trimestralmente de 2001 a 2004 para as realizações das análises de variância e estimativa dos componentes de variação fenotípica, genética e ambiental e nos anos de 1999 e 2003 para determinação das correlações considerando as características das fases juvenil e adulta das plantas. As cultivares de coqueiro anão apresentam variabilidade potencial ao melhoramento genético com possibilidade de ganhos por seleção. Os híbridos intervarietais apresentam variabilidade e pouca espeficidade no comportamento para as condições ambientais dos quatro anos avaliados. Existem associações genéticas entre caracteres das fases vegetativa e reprodutiva do coqueiro anão.

The Hess Deep Rift in the East Pacific Rise is a mid-ocean ridge spreading center that produces melts which exhibit geochemical characteristics of evolved MORB. Using basaltic glass samples collected from multiple dive cruises that explored Hess Deep geology, volatile and chemical data were collected at USF using FTIR and EMPA, respectively. In addition, a data suite of samples of glass from Hess Deep were compiled from the EarthChem database. The intention was to use the data suite and models to compare the Hess Deep regime to analog models for mid-ocean ridge crystallization regimes and tectonic structures. The USF and EarthChem samples were then compared to various crystallization models generated in Petrolog3 (Danyushevsky and Plechov, 2011) and COMAGMAT (Ariskin and Barmina, 2004). The starting compositions using depleted, normal, and enriched MORB (Gale et al, 2013) were modeled at depths reflecting an upper and lower melt lens along the rift axis. The volatile components of the USF samples were compared to models for water and carbon dioxide behavior in basalt made using VolatileCalc (Newman and Lowenstern, 2002). Based on the comparison of the samples to the forward modeling in Petrolog3, it appears that the geochemical behavior of major and trace elements most closely resembles that of small amounts of fractional crystallization and re-assimilation of accessory minerals. The VolatileCalc models suggest that the USF samples most likely followed a degassing pathway at depths corresponding to the shallow melt lens. When considering the analog models for ophiolite sequences and melt flow beneath a fast-spreading ridge, it appears that the melt regime at Hess Deep deviates from both standing theories. Instead the most likely mechanisms are shallow crystallization, at depths equal to or less than an upper melt lens, and shallow dynamic degassing.

SILVA, Alexandre Reuber Almeida da Silva. Respostas e adaptações de plantas de coqueiro "anão verde" ás interações entre deficiência hídrica e salinidade do solo. 2015. 237 f. : Tese (doutorado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Engenharia Agrícola, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Agrícola, Fortaleza-CE, 2015. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-07-08T15:25:35Z No. of bitstreams: 1 2015_tese_arasilva.pdf: 4598302 bytes, checksum: dc76917acc87d1d0031e4e0c50eced01 (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-07-08T15:25:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_tese_arasilva.pdf: 4598302 bytes, checksum: dc76917acc87d1d0031e4e0c50eced01 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-08T15:25:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_tese_arasilva.pdf: 4598302 bytes, checksum: dc76917acc87d1d0031e4e0c50eced01 (MD5) Previous issue date: 2015 / In this work morphological, physiological, biochemical and nutritional responses, to elucidate the possible adaptive strategies of young coconut plants, cultivating "Green Dwarf", involved with tolerance to the effects of stress isolated and combined soil salinity and water stress. In the experiment, conducted in a greenhouse, the greenhouse type, in Fortaleza, Ceará, were evaluated under statistical design of randomized blocks in a split plot arrangement, the effects of different levels of water stress by imposing different percentages resets the potential evapotranspiration - ETpc (20; 40; 60; 80 and 100%), related to increasing levels of soil salinity (1.72, 6.25, 25.80 and 40.70 dS m-1) provided by soils derived from the Irrigated Perimeter Morada Nova - PIMN. The effects of treatments on plants were evaluated using the variables: plant height, leaf number, stem diameter, leaf area, biomass production (root, shoot and total), compared root dry biomass of aerial-1, to salinity tolerance indices, leaf gas exchange (stomatal conductance, transpiration, photosynthesis, instant and intrinsic efficiency of water use), quantum yield of chlorophyll fluorescence (Fv Fm-1) level for total chlorophyll (Spad index) , total content of chlorophyll (a + b) and carotenoids, leaf water potential, leaf and root levels of inorganic solutes (potassium ions, sodium and chloride) and organic (total soluble carbohydrates, N - aminossolúveis and free proline) and nutritional state (foliar nutrients of nitrogen, phosphorus, potassium, calcium, magnesium, sulfur, iron, copper, manganese and zinc). The growth and biomass production of the plants are sharply reduced by the conditions of water stress and high soil salinity, apparently being more critical to fluid restriction culture. The degree of water stress can enhance the susceptibility to salinity. The physiological mechanisms are effectively limited when water stress and salinity act separately and / or together. The effects of water stress are more effective in the reduction of physiological parameters, to the detriment soil salinity. The magnitudes of physiological responses of plants to water supply and salinity depend on the intensity of stress. Adaptive physiological responses of plants are related mainly to stomatal regulation. In conditions of drought and soil salinity, the plants have linear reductions in the total levels of chlorophyll. Carotenoid levels respond to the combined effects of water availability and soil salinity and reflect the antagonism between them. The coconut has a number of physiological adjustments mechanisms that give the species a partial tolerance to drought stress and / or saline. Saline ions K+, Na+ and Cl- accumulate significantly in young coconut plants, to the detriment of organic solutes, both in the leaves and in the roots, evidencing an apparent root retention ions. Salinity did not change the concentration of organic solutes, however, show up increments in leaf and root levels of free proline in response to water stress. Water stress and soil salinity interact, affecting the nutritional status of plants, except for the nutrient P. Leaf contents of nutrients N, Ca, S, Fe, Mn and Zn grow positively with the increase of water availability and are reduced substantially with increasing salinity. The interaction of smaller water deficit levels with the highest saline levels maximizes the leaf contents of Mg and Cu and minimizes K. During the establishment of coconut seedlings, the need for macronutrients follows the descending order: N, K Ca, Mg, S and P and micronutrients: Fe, Mn, Zn and Cu. The plant nutrition proved to be adequate, except for the imbalances observed in nutrients K, Mg, S and Mn. The coconut seedlings show full capacity of the establishment in saline soils PIMN, corresponding to the level of electrical conductivity to 6.50 dS m-1, but only when the water supply remains adequate. For the higher salinity levels the plants survive, yet the size of the same is reduced by around 50%, even when fully irrigated. / Neste trabalho foram estudadas repostas morfológicas, fisiológicas, bioquímicas e nutricionais, visando elucidar as possíveis estratégias adaptativas de plantas jovens de coqueiro, cultivar “Anão Verde”, envolvidas com sua tolerância aos efeitos dos estresses isolados e/ou combinados, salinidade do solo e deficiência hídrica. No experimento, conduzido em casa de vegetação, do tipo telado, em Fortaleza, Ceará, avaliaram-se, sob delineamento estatístico de blocos casualizados, no arranjo de parcelas subdivididas, os efeitos de diferentes níveis de deficiência hídrica, mediante a imposição de distintos percentuais de reposições da evapotranspiração potencial da cultura - ETpc (20; 40; 60; 80 e 100%), associados à crescentes níveis de salinidade do solo (1,72; 6,25; 25,80 e 40,70 dS m-1), proporcionados pelos solos oriundos do Perímetro Irrigado Morada Nova - PIMN. Os efeitos dos tratamentos sobre as plantas foram avaliados por meio das variáveis: altura de plantas, número de folhas, diâmetro do caule, área foliar, produção de biomassa (radicular, parte aérea e total), relação biomassa seca raiz parte aérea-1, índices de tolerância à salinidade, trocas gasosas foliares (condutância estomática, transpiração, fotossíntese, eficiência instantânea e intrínseca de uso da água), rendimento quântico da fluorescência da clorofila a (Fv Fm-1), teores relativos de clorofila total (índice Spad), teores totais de clorofilas (a+b) e de carotenóides, potencial hídrico foliar, teores foliares e radiculares dos solutos inorgânicos (íons potássio, sódio e cloreto) e orgânicos (carboidratos solúveis totais, N - aminossolúveis e prolina livre) e estado nutricional (teores foliares dos nutrientes nitrogênio, fósforo, potássio, cálcio, magnésio, enxofre, ferro, cobre, manganês e zinco). O crescimento e a produção de biomassa das plantas são acentuadamente reduzidos pelas condições de restrição hídrica e de elevada salinidade do solo, sendo aparentemente mais crítica à cultura a restrição hídrica. O grau de estresse hídrico é capaz de acentuar a suscetibilidade à salinidade. Os mecanismos fisiológicos são efetivamente limitados quando a deficiência hídrica e a salinidade atuam isoladamente e/ou em conjunto. Os efeitos do estresse hídrico se mostram mais efetivos nas reduções dos parâmetros fisiológicos, em detrimento à salinidade do solo. As magnitudes das respostas fisiológicas das plantas ao suprimento hídrico e à salinidade dependem das intensidades do estresses. As respostas fisiológicas adaptativas das plantas estão relacionadas, principalmente, à regulação estomática. Em condições de déficit hídrico e de salinidade do solo, as plantas apresentam reduções lineares nos teores totais de clorofilas. Os teores de carotenóides respondem aos efeitos combinados da disponibilidade hídrica e da salinidade do solo e refletem o antagonismo entre estes. O coqueiro apresenta uma série de mecanismos de ajustes fisiológicos que conferem à espécie uma parcial tolerância ao estresse hídrico e/ou salino. Os íons salinos K+, Na+ e Cl- acumulam-se significativamente em plantas jovens de coqueiro, em detrimento aos solutos orgânicos, tanto nas folhas quanto nas raízes, sendo evidenciada uma aparente retenção radicular de íons. A salinidade não altera os teores dos solutos orgânicos, todavia, denotam-se incrementos nos teores foliares e radiculares de prolina livre em resposta à deficiência hídrica. A deficiência hídrica e a salinidade do solo interagem, afetando o estado nutricional das plantas, excetuando o nutriente P. Os teores foliares dos nutrientes N, Ca, S, Fe, Mn e Zn crescem positivamente com a ampliação da disponibilidade hídrica e reduzem-se substancialmente com o aumento da salinidade. A interação dos menores níveis de deficiência hídrica com os maiores níveis salinos maximiza os teores foliares de Mg e Cu e minimiza os de K. Durante o estabelecimento das plantas jovens de coqueiro, a necessidade de macronutrientes obedece à ordem decrescente: N, K Ca, Mg, S e P e à de micronutrientes: Fe, Mn, Zn e Cu. A nutrição das plantas mostra-se adequada, excetuando-se, os desequilíbrios observados nos nutrientes K, Mg, S e Mn. As plantas jovens de coqueiro mostram plena capacidade de estabelecimento nos solos salinizados do PIMN, até o nível de condutividade elétrica correspondente a 6,50 dS m-1, porém apenas quando o suprimento hídrico se mantém adequado. Para os níveis de salinidade mais elevados as plantas sobrevivem, contudo o porte das mesmas reduz-se em torno de 50%, mesmo quando plenamente irrigadas.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-02T12:56:40Z No. of bitstreams: 1 Suerda Willna Jacome de Santana.pdf: 1856490 bytes, checksum: 1b1aa48c4a83323254b5694aeace4c8a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T12:56:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Suerda Willna Jacome de Santana.pdf: 1856490 bytes, checksum: 1b1aa48c4a83323254b5694aeace4c8a (MD5) Previous issue date: 2008-02-04 / Larvae of coconut moth, Atheloca subrufella (Hulst) (Lep.: Phycitidae), damage flowers and fruits of coconut, Cocos nucifera L., resulting in direct yield reduction. Thus, this work had three major objectives: to develop a feasible rearing methodology for all stages of this pest; to study the biology of A. subrufella reared at 18, 22, 25, 28, 30 and 32ºC and; to investigate the success of A. subrufella larvae colonizing coconut fruits related with the necrosis caused by the coconut mite, Aceria guerreronis Keifer (Acari: Eryophyidae). The rearing technique consisted of using green coconut fruits 10-12 cm of diameter and infested artificially with two to five larvae per fruit. Based on fertility life table parameters estimated for three successive generations, the best results were obtained with two and three A. subrufella larvae reared per fruit. The storage of egg and pupal stages at 12oC can be made upto five days without negative effect on egg viability and adult reproductive output, but storage periods over 10 days affected egg viability and adults’ performance. Developmental period of A. subrufella was reduced as temperature increases and marked effects were found at extreme temperatures of 18 and 32oC. The egg-adult period ranged from 19.3 to 59.8 days from 32ºC to 18ºC, respectively. Developmental viability from egg to adult was 25% at 18 and 32oC, and over 72% at the intermediate temperatures. The lower temperature threshold and thermal requirement for egg-adult period were 12.54oC and 362.75 degree-days, respectively. Basedon thermal requirement, A. subrufella can have 13 generations per year in the Zona da Mata and Sertão areas of Pernambuco State, Brazil. Data from field survey showed that only coconut fruits exhibiting necrosis caused by the coconut mite were infested with A. subrufella larvae. Moths of A. subrufella, however, exhibited similar oviposition preference on damage and undamaged coconut fruits. Neonate larvae and third instar larvae were not able to colonize undamaged coconut fruits. These results support the hypothesis that the necrosis in the coconut fruit caused by early infestation of the coconut mite is a key factor to A. subrufella larvae to colonize the mesocarp of the fruit protected by the fruit perianth. Therefore, the status of coconut fruit key pest of A. subrufella depends on fruit necrosis caused by the coconut mite. / A larva de Atheloca subrufella (Hulst) (Lep.: Phycitidae) ataca flores e frutos do coqueiro, Cocos nucifera L., resultando em perdas diretas na produção. Assim, este trabalho teve três objetivos principais: desenvolver uma técnica de criação para todos as fases de desenvolvimento desta praga; estudar a biologia de A. subrufella nas temperaturas de 18, 22, 25, 28, 30 e 32ºC e; investigar a capacidade da larva em colonizar frutos de coco, relacionado à necrose do ácaro, Aceria guerreronis Keifer (Acari: Eriophyidae). A técnica de criação consistiu no uso de frutos com 10-12 cm de diâmetro infestados artificialmente com duas a cinco larvas por fruto. Baseado nos parâmetros da tabela de vida de fertilidade estimados por três gerações sucessivas, os melhores resultados foram obtidos com duas e três larvas de A. subrufella por fruto. O armazenamento de ovos e pupas a 12oC pode ser feito até cinco dias sem perdas na viabilidade e reprodução dos adultos. No entanto, períodos maiores que 10 dias afetaram a viabilidade dos ovos e o desempenho dos adultos. O período de desenvolvimento de A. subrufella foi reduzido com o aumento da temperatura entre 18 e 30oC. O período ovo-adulto variou de 19,3 a 59,8 dias de 32 a 18ºC, respectivamente. A viabilidade do período ovo-adulto foi de 25% a 18 e 32oC, e acima de 72% nas temperaturas intermediárias. A temperatura base e requerimento térmico de ovo-adulto foram de 12,54oC e 362,75 graus-dias, respectivamente. Baseado nessas exigências térmicas, A. subrufella pode obter até 13 generações por ano na Zona da Mata e Sertão de Pernambuco. Resultados do levantamento de campo mostraram que somente frutos apresentando a necrose do ácaro possuíram infestação de A. subrufella. Mariposas de A. subrufella, no entanto, exibiram similar preferência para a oviposição em frutos com necrose e sem necrose. Larvas neonatas e de terceiro instar foram incapazes de colonizar frutos de coco sem necrose ou injúrias mecânicas. Portanto, estes resultados suportam a hipótese de que a necrose no fruto devido a infestações do ácaro é fator chave para as larvas de A. subrufella colonizarem o mesocarpo protegido pelo perianto dos frutos. Desta forma, o status de praga-chave em fruto de coco, somente ocorre devido à necrose no fruto provocada por A. guerreronis.