Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-20T22:18:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ValidacaoMetodologiaAnalitica.pdf: 1357135 bytes, checksum: 0ddefd417c885b4db3c7d39d75f34b15 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-27T12:30:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ValidacaoMetodologiaAnalitica.pdf: 1357135 bytes, checksum: 0ddefd417c885b4db3c7d39d75f34b15 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T12:30:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ValidacaoMetodologiaAnalitica.pdf: 1357135 bytes, checksum: 0ddefd417c885b4db3c7d39d75f34b15 (MD5) Previous issue date: 2010 / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / Dentre as ferramentas para alcançar o tratamento ótimo para a malária, se destaca a monitorização das concentrações dos antimaláricos nos fluídos biológicos. Ao se considerar que o Coartem® é empregado na terapia de primeira linha para o tratamento da malária falciparum, justifica-se a realização deste estudo que objetivou validar metodologia analítica para determinação de lumefantrina em amostras de sangue total, adsorvidas em papel de filtro, e em plasma, por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE), em pacientes com malária por Plasmodium falciparum não complicada, empregando-se extração líquido-líquido. Foram realizados estudos de seletividade, linearidade, curva de calibração, limites de detecção e quantificação, recuperação, precisão intra e inter-ensaio, estabilidade e robustez. As amostras, para o estudo de aplicabilidade do método proposto, foram coletadas de pacientes com malária falciparum utilizando Coartem® (arteméter-20mg + lumefantrina- 120mg) no D3. As condições cromatográficas otimizadas foram: comprimento de onda de 335nm, fluxo 1,2mL/min. e fase móvel composta por acetonitrila-água (60:40, v/v) pH=3,5. A extração líquido-líquido demonstrou ser eficiente, pois a recuperação média foi de 101,3% para plasma e 84,3% para sangue total. O método foi seletivo e linear em intervalo de concentração de 160 a 1760ng/mL. Os limites de detecção e de quantificação foram 32ng/mL e 160ng/mL. O coeficiente de variação médio intra-ensaio, do plasma e sangue total, respectivamente, foram 10,88 e 8,38% e inter-ensaio de 13,21 e 11,78%. O analito demonstrou ser estável em sangue total adsorvido em papel de filtro por até 70 dias. Modificações no pH, fluxo e composição da fase móvel não alteraram significativamente a resolução do analito de interesse, sugerindo uma robustez adequada. O método demonstrou ser eficaz na quantificação de lumefantrina em amostras de sangue total de pacientes com malária falciparum bem como os parâmetros de validação estão de acordo com as recomendações dos órgãos regulamentadores no Brasil. / Among the tools to achieve the optimal treatment for malaria, it highlights the concentration monitoring of antimalarials in biological fluids. Considering that Coartem ® is used in first-line therapy for treatment of falciparum malaria, it is appropriate that this study aims to validate an analytical methodology for determination of lumefantrine in whole blood samples, adsorbed on filter paper, and in plasma by high performance liquid chromatography (HPLC) in patients with falciparum malaria uncomplicated, using liquid-liquid extraction. Were carried out studies of selectivity, linearity, calibration curve, limits of detection and quantification, recovery, intra and inter assay precision, stability and robustness. The samples for study of applicability of the proposed method, were collected from patients with falciparum malaria using Coartem ® (artemether-20mg + lumefantrine-120mg) on D3. The optimized chromatographic conditions were: wavelength 335nm, flow 1.2 mL / min. and a mobile phase consisting of acetonitrile-water (60:40, v / v) pH = 3,5. The liquid-liquid extraction can be efficient, because the average recovery was 101.3% for plasma and 84.3% for whole blood. The method was selective and linear in the concentration range of 160 to 1760ng/mL. The limits of detection and quantitation was 32ng/mL and 160ng/mL. The average coefficient of variation intra assay, plasma and whole blood, respectively, were 10.88 and 8.38% and inter assay of 13.21 and 11.78%. The compound proved to be stable in whole blood absorbed onto filter paper for 70 days. Modification of pH, flow and mobile phase composition did not significantly alter the resolution of the analytes, suggesting an adequate strength. The method proved effective in quantifying lumefantrine in whole blood samples from patients with falciparum malaria and the validation parameters are consistent with the recommendations of regulatory agencies in Brazil.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-22T19:21:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_GenotipagemHIVPara.pdf: 1424795 bytes, checksum: 4f5b27f83e87da35213d5321f340b874 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-27T17:33:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_GenotipagemHIVPara.pdf: 1424795 bytes, checksum: 4f5b27f83e87da35213d5321f340b874 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T17:33:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_GenotipagemHIVPara.pdf: 1424795 bytes, checksum: 4f5b27f83e87da35213d5321f340b874 (MD5) Previous issue date: 2011 / Terapia supressiva antirretroviral reduz significativamente morbidades e mortalidade relacionadas ao HIV, mas a emergência de vírus resistentes pode limitar o sucesso do tratamento. Objetivou-se neste estudo descrever, em portadores de HIV/sida experimentando falha à terapia antirretroviral (TARV), no estado do Pará, a prevalência de mutações nas enzimas transcriptase reversa e protease do HIV-1 e correlacioná-las à resistência aos antirretrovirais (ARV). Foi um estudo descritivo, retrospectivo, do tipo transversal, com dados obtidos na Unidade de Referência Especializada em Doenças Infecciosas e Parasitárias Especiais de Belém do Pará, de pacientes com perfil laboratorial de falha terapêutica. A presente amostra incluiu genotipagem de cinquenta pacientes no período de janeiro de 2004 a dezembro de 2005. Os critérios de inclusão foram: adesão à terapia imediata a genotipagem, falha terapêutica, perfil de resistência viral à TARV e ser paciente da rede pública de saúde. Foram descritos aspectos demográficos da população estudada, perfil de uso de TARV previamente a genotipagem, tempo conhecido de infecção pelo HIV, perfil quantitativo de células CD4+ e de carga viral, além do teste de genotipagem realizado. A resistência encontrada predominou em pacientes residentes em Belém (72%), no sexo masculino (90%) e na faixa etária de 30 a 49 anos de idade. As maiores prevalências de mutações na transcriptase reversa do HIV-1 foram: 214F (86%), 184V (76%), 215FY (56%), 211K (48%), 219QEN, 67N e 103N (42%) cada, 41L (32%), 70R (28%) e 210W (20%). Na protease 46IL (38%), 90M (32%) e 82AFT (20%) foram as mais prevalentes dentre as mutações principais e, dentre as secundárias, 63P (74%), 93LM (52%), 10FIV (48%) e 35D (46%). Atribuiu-se estas mutações a pressão seletiva dos ARV mais utilizados: 3TC, AZT, D4T, DDI, EFZ, IDV, NFV, RTV e SQV. O uso de múltiplos esquemas ARV, favoreceu a prevalência das mutações encontradas. Houve impacto dentro das classes com 32% de resistência completa a uma classe, 22% a duas classes e 4% a três classes. Conclui-se que pacientes expostos a única TARV previamente à genotipagem comparados aos expostos a mais de uma TARV, apresentaram menor prevalência de resistência aos ARV, com possibilidade de resgate terapêutico com ARV ativos disponíveis na época que, entretanto foi a minoria. / Suppressive antiretroviral therapy significantly reduces morbidity and mortality related to HIV, but the emergence of resistant virus may limit the success of treatment. The objective of this study describe, in HIV / AIDS experiencing failure with antiretroviral therapy, in state of Pará, the prevalence of mutations in reverse transcriptase and protease enzymes of HIV-1 and correlate them to resistance to antiretrovirals. A descriptive, retrospective crosssectional data obtained in the Reference Unit Specialized in Special Infectious and Parasitic Diseases from Belem-Pará, profile of patients with laboratory evidence of treatment failure. This sample was represented by genotyping of fifty patients from January 2004 to December 2005. Inclusion criteria were: adherence to therapy prior to genotype, treatment failure, viral resistance profile to antiretroviral therapy and be patient of public health. We described the demographic population profile of antiretroviral therapy prior to genotyping, long known HIV infection, quantitative profile of CD4 + and viral load, in addition to genotype testing performed. The predominant resistance found in patients living in Belém (72%), males (90%) and aged 30 to 49 years old. The highest rates of mutations in reverse transcriptase of HIV-1 were: 214F (86%), 184V (76%), 215FY (56%), 211K (48%), 219QEN, 67N and 103N (42% each), 41L (32%), 70R (28%) and 210W (20%). In 46IL protease (38%), 90M (32%) and 82AFT (20%) were most prevalent among the major replacements and, among the secondary, 63P (74%), 93LM (52%), 10FIV (48%), and 35D (46%) predominated. Was attributed to selective pressures these mutations most commonly used antiretrovirals: 3TC, AZT, D4T, DDI, EFV, IDV, NFV, RTV and SQV. The use of multiple antiretroviral regimens, boosted the prevalence of these mutations, with an impact within the classes in which there was 32% complete resistance to one class, 22% two classes and 4% to three classes of antiretrovirals. We conclude that patients exposed to HAART only prior to genotyping compared to those exposed to more than one HAART had a lower prevalence of resistance to antiretrovirals, with the possibility of rescue therapy with antiretrovirals assets available at the time that was the minority however.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-05-20T22:13:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DeteccaoCitosinasPerfil.pdf: 3974007 bytes, checksum: d434cce5b90d29c6e5dbb7a47b6ddc81 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-05-27T18:07:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DeteccaoCitosinasPerfil.pdf: 3974007 bytes, checksum: d434cce5b90d29c6e5dbb7a47b6ddc81 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T18:07:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DeteccaoCitosinasPerfil.pdf: 3974007 bytes, checksum: d434cce5b90d29c6e5dbb7a47b6ddc81 (MD5) Previous issue date: 2009 / A hanseníase é uma doença infecto-contagiosa, de evolução lenta e progressiva, com grande incidência e prevalência nos estados que compõem a Amazônia legal onde o Pará ocupa lugar de destaque no número de casos no contexto nacional. A fim de se avaliar o perfil de citocinas e a atividade de macrófagos nas formas polares da hanseníase e correlacionar com os seus aspectos histopatológicos, foi realizado um estudo transversal com uma amostra composta por 29 pacientes portadores de uma das formas polares da hanseníase, tuberculoide ou virchowiana, dos quais foram colhidas biópsias de pele de lesões hansênicas. Pode-se observar, através da análise imonoistoquímica deste material que os grupos estudados não apresentaram diferença significativa quanto aos níveis de IL-10, TGF-β, CD68, iNOS e Lisozima. Os níveis de IL-4 não foram expressivos nos tecidos analisados e os níveis de IFN-γ foram maiores nos pacientes do grupo MHV. No polo virchowiano todas as citocinas tiveram uma tendência a uma correlação negativa com a atividade de macrófagos, no polo tuberculoide a IL-10 apresentou uma tendência à correlação negativa com os níveis de iNOS, IFN-γ e lisozima, evidenciando uma inibição da atividade macrofágica por esta citocina. Pode-se concluir que não há diferença na expressão de citocinas de perfil TH1 e TH2 nas formas polares da doença de Hansen e as citocinas apresentam uma tendência a correlação negativa com a atividade de macrófagos no pólo MHV e uma tendência a correlação positiva no pólo MHT. Novas pesquisas são necessárias para esclarecer como populações apresentam mais susceptibilidade à hanseníase que outras, um estudo semelhante com um maior número de indivíduos poderá ter resultados mais expressivos. / Leprosy is an infectious disease that has a slow and progressive evolution, with high incidence and prevalence in the states that compose the Legal Amazon. Considering the number of cases, the Pará state plays a prominent role in the national context. In order to evaluate the cytokine profile and the macrophages activity in the polar forms of leprosy and correlate with their histopathological aspects, a transversal study was performed, with a sample of 29 patients who had one of the polar forms of leprosy, namely tuberculoid or virchowian, from who skin biopsies of leprosy lesions were taken. It could be observed, through the analysis of this immunohistochemical material, that the studied groups showed no significant variation in the levels of IL-10, TGF-β, CD68, iNOS and Lysozyme. The levels of IL-4 were not expressive in the analyzed tissues and the levels of IFN-γ were higher in patients in the MHV group. In the virchowian pole, all cytokines tended towards a negative correlation with the macrophages activity. In the tuberculoid pole, the level of IL-10 showed a negative correlation with the levels of iNOS, IFN-γ and lysozyme, indicating a macrophage activity inhibition for this cytokine. It can be concluded that there is no difference in cytokine expression of TH1 and TH2 profile in polar forms of Hansen's disease and cytokines have a tendency to negative correlation with the activity of macrophages in MHV pole and a tendency to positive correlation in the pole MHT. Further research is needed to clarify why some populations have more susceptibility to leprosy than others. A similar study with a larger number of individuals may have a more significant outcome.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:14:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-04T14:55:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-04T14:55:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) Previous issue date: 2011 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os rotavírus são os principais agentes virais causadores de gastrenterite aguda e responsáveis por 36% dos casos hospitalizações entre crianças menores de cinco anos, resultando em 453.000 óbitos anualmente, principalmente em países em desenvolvimento. Pertencem à família Reoviridae, gênero Rotavirus, possui RNA de dupla fita (dsRNA) com 11 segmentos codificando 12 proteínas. O genótipo G1 se apresenta geralmente com maior frequência nas investigações epidemiológicas, circulando em várias partes do mundo sob diferentes prevalências. Este estudo teve como objetivo analisar a variabilidade genética dos genes VP4, VP7 e NSP4 dos rotavírus G1 circulantes nos municípios de Belém e Marituba, Pará, Brasil, no período de 1982 a 2008. Foram selecionadas 83 amostras previamente caracterizadas como G1 e submetidas a RT-PCR. Os espécimes foram provenientes de sete estudos realizados no IEC. Foi possível a amplificação para os três genes em estudo de 63 (75,9%) espécimes. Foram detectadas as linhagens 1 (8/63, 12,7 %), 2 (29/63, 46,0%), 3 (18/63, 28,6%) e 9 (8/63, 12,7%) para o gene VP7. Co-predominaram as sublinhagens 2E e 3A concorrendo com um total de 57,1% (36/63) das amostras. Foram observadas três substituições de aminoácidos (97 [D→E], 147 [S→N] e 218 [I→V]) no gene VP7 nas regiões antigênicas (A, B e C) nas amostras das linhagens 1, 2 e 9. Todas as amostras apresentaram a especificidade P[8] para o gene VP4 e as linhagens 2 (21/63, 33,3%) e 3 (42/63, 66,7%) foram detectadas. No gene da VP4 ocorreram duas alterações (35 [I→V] e 38 [S→G]) na região antigênica em todas as amostras analisadas. Para o gene NSP4, todas as amostras pertenceram ao tipo E1. Houve mudanças de nucleotídeos nas posições 47 (C→T) e 101 (T→C), resultando em alteração aminoacídica nos resíduos 16 (S→P) e 34 (L→P) em todas as amostras analisadas e nove espécimes demonstraram alteração no sítio de toxicidade da NSP4 (aa 131). Tal análise permitiu ampliar o conhecimento da diversidade genética e da circulação de variantes de rotavírus G1, representando o primeiro estudo da epidemiologia molecular deste genótipo no Brasil e confirmar a alta heterogeneidade que este tipo apresenta. / Rotaviruses are major viral agents of acute gastroenteritis and responsible for 36% of hospitalization for diarrhea among children less than five years of age, resulting in 453.000 deaths annually, mostly in developing countries. Rotavirus is a member of Reoviridae family, and its genome consists of 11 double-stranded RNA (dsRNA) which encode 12 proteins. G1 rotavirus is commonly detected in epidemiological investigations, occurring under different prevalence rates. The aim of this study was to analyze the VP4, VP7 and NSP4 diversity genetic of G1 rotavirus circulating in Belém and Marituba, Pará, Brazil, from 1982 to 2008. We selected 83 samples previously characterized as G1 type and submitted to RT-PCR. The samples were from seven studies conducted in IEC. It was possible amplification for 63 (75.9%) specimens. Lineages 1 (8/63, 12.7%), 2 (29/63, 46.0%), 3 (18/63, 28.6%) and 9 (8/63, 12.7%) of VP7 gene were detected. The sublineages 2E and 3A were co-predominant detected in 57.1% (36/63) of samples. Three amino acid substitutions (97 [D→E], 147 [S→N] and 218 [I→V]) were observed in VP7 antigenic regions (A, B and C) in samples of 1, 2 and 9 lineages. All samples showed P[8] specificity for VP4 gene and lineages 2 (21/63, 33.3%) and 3 (42/63, 66.7%) were detected. Two substitutions (35 [I→V] and 38 [S→G]) occurred in antigenic region of VP4 of samples analyzed. For NSP4 gene, all samples belonged to E1 type. Phylogenetic analysis of NSP4 gene revealed that occurred changes in nucleotide positions 47 (C→T) and 101 (T→C), resulting in amino acid substitutions at positions 16 (S→P) and 34 (L → P) in all samples and 9 specimens displayed amino acid substitution in NSP4 toxicity residue (aa 131). This study allowed us to broaden our understanding about genetic diversity and circulation of G1 variants and represents the first molecular epidemiology analyze of this genotype in Brazil corroborating the high heterogeneity of this genotype.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:15:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoPolimorfismoGene.pdf: 1247481 bytes, checksum: caa6ac4dedf40ecfa4f62e9b0ab99cdf (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-05T12:11:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoPolimorfismoGene.pdf: 1247481 bytes, checksum: caa6ac4dedf40ecfa4f62e9b0ab99cdf (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-05T12:11:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AssociacaoPolimorfismoGene.pdf: 1247481 bytes, checksum: caa6ac4dedf40ecfa4f62e9b0ab99cdf (MD5) Previous issue date: 2011 / Hanseníase é um problema de saúde pública no estado do Pará e um desafio para os Programas de Controle que almejam o estabelecimento de estratégias para minimização do agravo da doença. O entendimento do mecanismo genético e imunológico para explicar a manutenção da endemia pode ser uma das alternativas para melhoria da abordagem do problema na nossa região. O gene humano de resistência natural associada à proteína macrofágica – NRAMP1 é expresso em macrógfagos e parece estar envolvido com a influência no padrão de resposta imune à infecção com Mycobcaterium leprae. Nós avaliamos associação do polimorfismo deste gene, já descrito por BUU et al, 1995 com a hanseníase “per se” e com os tipos da doença, segundo os níveis de anticorpos anti-PGL-1 na população estudada. Um total de 122 pacientes com hanseníase e 110 não doentes procedentes de municípios endêmicos do estado do Pará, foram genotipados para o polimorfismo deste gene e analisados segundo os níveis de anticorpos anti-PGL-1 desta micobactéria. Observou-se associação com a hanseníase “per se” (p=0.0087), e o polimorfismo da região 3ۥ não traduzida do gene NRAMP1 com inserção/deleção de 4 pares de bases foi fortemente associado com a forma multibacilar (p= 0.025) comparado aos contatos não cosanguíneos. Heterozigotos e portadores do alelo com a deleção (159pb) foram mais freqüentes entre os casos multibacilares do que nos paucibacilares. Os haplótipos do gene NRAMP1 parecem exercer influência importante na apresentação clínica da hanseníase, revelada também pela positividade ao antígeno PGL-1 do mycobacterium leprae. / Leprosy is a public health problem in the Pará state and a challeng for the Control Programs that aim strategies improvement to elimination of this disease between us. The agreement of the genetic and immunology mechanism to explain maintenc endemic disease can be one of the alternatives for problem resolution. The human gene for natural resistance associated macrophage protein – NRAMP1 is expressed in macrophages and seems to be involved with influence cellular immune responses to mycobacterium leprae infection. We evaluated the polymorphism association of this gene as reported by Buu et al (1995) with leprosy “per se” and clinical forms according to the anti-PGL-1 levels in the population studied. A total of 122 leprosy patients and 110 individual healthy coming from endemic municipalities in Para were genotyped for the polymorphism of NRAMP1. Association was found with leprosy “per se” (p=0.0087) and 3’ untranslated region with insertion/deletion of four base pairs was significantly associated with multibacillary (p=0.025) compared to contacts not cosanguineos. Heterozygotes and haplotypes with four base pairs deletion were more frequent among multibacillary than paucibacillary. The NRAMP1 gene haplotypes seem to have important influence on leprosy clinical presentation also revealed by Mycobacterium leprae anti-PGL-1 positively.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-02-03T21:22:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoParatuberculoseBovinos.pdf: 264056 bytes, checksum: 5ce068ca20fbd8e870ce142990c3a769 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-04T14:47:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoParatuberculoseBovinos.pdf: 264056 bytes, checksum: 5ce068ca20fbd8e870ce142990c3a769 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-04T14:47:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_DiagnosticoParatuberculoseBovinos.pdf: 264056 bytes, checksum: 5ce068ca20fbd8e870ce142990c3a769 (MD5) Previous issue date: 2005 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / 514 amostras de sangue bovino foram analisadas para detecção de anticorpos anti-Mycobacterium avium (subsp.) paratuberculosis, utilizando um kit comercial do teste ELISA indireto. Os animais eram todos mestiços, machos e fêmeas, classificados em dois grupos, de acordo com a idade, menores ou iguais a 36 meses e maiores de 36 meses, provenientes de 23 municípios do Estado do Pará. Além deste teste, também foram colhidas 100 amostras de fragmentos de intestino delgado e de linfonodo mesentérico para análise bacteriológicaatravés da coloração de Ziehl-Neelsen, a fim de identificar o Mycobacterium avium (subsp.) paratuberculosis. As amostras foram colhidas aleatoriamente em matadouro da região metropolitana de Belém. No teste ELISA indireto, das 514 amostras de sangue bovino 182 (35,4%) foram reagentes para anticorpos anti-Mycobacterium avium (subsp.) paratuberculosis e 332 (64,6%) foram não-reagentes. Em todas as mesorregiões encontraramse animais soropositivos. As fêmeas com idade superior a 36 meses mostraram maior respostas ao teste , 92,06% de animais soropositivos. Entre os machos, a maior prevalência (76,79%), foi obtida nos mais novos, com idade abaixo de 36 meses. Das 100 lâminas coradas através do método de Ziehl-Neelsen, nenhum Mycobacterium sp. foi identificado. Conclui-se assim, que o elevado número de animais com anticorpos anti-Mycobacterium avium (subsp.) paratuberculosis indica a presença da doença em todas as mesorregiões estudadas, devendo-se atentar aos riscos desta enfermidade, através de pesquisas mais abrangentes sobre a Paratuberculose, com aplicação de métodos diagnósticos diretos e indiretos. / 514 blood samples from beef cattle were examined of to find anti- M. avium (subsp.) paratuberculosis antibodies, using commercial ELISA test kit. The animals from samples were all compous from cross between Indicus x Taurus race, between male and female, with two age class, over 36 months old and below 36 months old, from of the 23 municipality of Para State. Also were collected 100 samples of small intestine and mesenteric lymph nodes of bacteriological test through Ziehl-Neelsen method to detect the M. avium (subsp.) paratuberculosis. Were at random collected in slaughterhouse of Belem. In ELISA test, through these 514 samples, 182 (35,4%) were seropositive and 332 (64,6%) samples were seronegative. All the middle region were found soropositives animals. The female with over 36 months old presented larger response test, of the 92,06% seropositives animals. Among male the prevalency larger (76,79%,) were obtained between the most new, with below 36 months old. Of 100 samples stained through Ziehl-Neelsen method, not were found either Mycobacterium spp.. The conclusion, is the biggest number of seropositive animals of anti- M. avium (subsp.) paratuberculosis sign of disease is presented in all the regions studied, watching the risks of this disease with the elaborate more covering stud ies about the paratuberculosis with the appling of directs and indirects diagnosis methods.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-07T11:29:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_DirofilarioseCaninaDois.pdf: 38133734 bytes, checksum: 83241c53f7a0d0143dc23ec08290bda7 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-07T16:23:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_DirofilarioseCaninaDois.pdf: 38133734 bytes, checksum: 83241c53f7a0d0143dc23ec08290bda7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-07T16:23:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_DirofilarioseCaninaDois.pdf: 38133734 bytes, checksum: 83241c53f7a0d0143dc23ec08290bda7 (MD5) Previous issue date: 2009 / Os filarídeos são nematóides parasitas de corpo alongado em forma de fio. Os filarídeos parasitas de cães pertencem à Família Onchocercidae, sendo representados principalmente pelos gêneros Acanthocheilonema, Dipetalonema e Dirofilaria. Estes filarídeos se desenvolvem em locais diferentes no hospedeiro vertebrado, necessitando da passagem por um hospedeiro invertebrado hematófago para completar seu ciclo. No cão, diferentes níveis de infecção podem ocorrer, desde assintomática, até o comprometimento cardiovascular, podendo levar à morte. Na Amazônia, pouco se sabe sobre a distribuição destes parasitas, e até o momento, não se realizou um estudo de diagnóstico diferencial. Este estudo foi realizado em dois municípios na Ilha do Marajó (Salvaterra e São Sebastião da Boa Vista), com um enfoque epidemiológico (com a pesquisa de microfilárias em amostras de sangue de cães domésticos), morfológico (pela análise de características taxonômicas de vermes adultos) e molecular (pela comparação entre regiões gênicas de microfilárias circulantes em sangue canino e vermes adultos). O percentual de cães microfilarêmicos foi de 37,34% em Salvaterra e 6,67% em São Sebastião da Boa Vista, resultando numa prevalência total de 32,45%. Os filarídeos adultos coletados em ambos os municípios são da Dirofilaria immitis, por análise morfolágica. Por análise de fragmentos gênicos, concluímos que as microfilárias encontradas na corrente sanguínea dos cães estudados também são da espécie D. immitis, e que estes cães não apresentaram infecção mista. / Filarids are elongate and filiforms nematodes parasites. Canids filarids parasites belong to the Onchocercidae Family and are represented mainly by Genus Acanthocheilonema, Dipetalonema and Dirofilaria. These filarids develop in different places in the vertebrate host, and need for haematophagus invertebrate host to complete your cycle. Different infection levels can occur, since assintomatic, until the death of dog. The filarids parasites of dogs are found mainly in the region between the tropics. In the Amazon region a little is known about the distribution of these parasites, and until this moment, a study of distinguishing diagnosis was not performed. With this objective, we choose two cities in the Marajó Island (Salvaterra and São Sebastião da Boa Vista) and carry through a epidemiologic, morphologic and molecular studies. The percentage of microfilaremics dogs was of 37.34% in Salvaterra and 6.67% in São Sebastião da Boa Vista, resulting in a total prevalence of 32.45%. Analyzing the morphologic characteristics of the collected adult filarids, we concluded that these worms are of the Dirofilaria immitis species. For analysis of genic region, we conclude that the microfilariaes found in the dogs blood studied are also D. immitis species, and that these dogs had not presented mixing infection.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-07T12:24:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoEpidemiologicoAgentes.pdf: 1947171 bytes, checksum: 6e5b26f28d72747b8ddf43e483e52232 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-11T15:40:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoEpidemiologicoAgentes.pdf: 1947171 bytes, checksum: 6e5b26f28d72747b8ddf43e483e52232 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-11T15:40:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoEpidemiologicoAgentes.pdf: 1947171 bytes, checksum: 6e5b26f28d72747b8ddf43e483e52232 (MD5) Previous issue date: 2010 / A prevalência da infecção por agentes virais como o HIV-1, HTLV1/2, VHB e CMV, ainda é pouco conhecida na população de adolescentes grávidas na região norte do Brasil. Este trabalho teve como um dos objetivos descrever esta prevalência das infecções HIV-1, HTLV1/2, VHB e CMV em adolescentes grávidas atendidas em um centro de referência do estado do Pará. Foram coletadas amostras de sangue de 324 gestantes procedentes de vários municípios do estado no período de novembro de 2009 a fevereiro de 2010. As amostras foram submetidas a um ensaio imunoenzimático do tipo ELISA, para a detecção de anticorpos anti-HIV, anti HTLV-1/2, anti-VHB e anti-CMV IgM/IgG. A análise sorológica revelou uma amostra soropositiva para o HIV-1, duas amostras positivas para HTLV1/2, enquanto a maioria das amostras apresentaram anticorpos anti-CMV IgG, embora a ocorrência da infecção aguda tenha sido baixa (2,2%). A prevalência da infecção para VHB em adolescentes gestantes foi de 0,62%, porém numero expressivo (83,3%) de adolescentes estão suscetíveis a infecção pelo VHB, o que sugere que não foram imunizadas. A maioria (63,4%) das adolescentes continuaram estudando mesmo sabendo da gravidez e 34,6% buscaram o pré-natal tardiamente possibilitando um numero mínimo de quatro consultas de pre natal O resultado reforça a hipótese que estas adolescentes grávidas possuem uma prevalência de infecções desses tipos virais, semelhante a taxas nacionais das gestantes de modo geral. A prevalência dos subtipos virais (HTLV-2 e HIV-1 subtipo B) obtidas através da caracterização molecular das amostras soropositivas das gestantes foi concordante com a prevalência dos subtipos da região norte. / The prevalence of infection by viral agents such as HIV-1, HTLV1/2, VHB and CMV is not so much known in pregnant teenage population from the North region of Brazil. One of the objectives of this study was to describe the prevalence of infections HIV-1, HTLV1/2, VHB and CMV in pregnant adolescents, attended in a Reference Center in the State of Pará. To achieve the objectives, it was collected blood samples from 324 pregnant adolescents, who came from several cities of the State, from November of 2009 to February of 2010. The samples were submitted to an immuno-enzymatic test (ELISA), in order to detect antibodies Anti- HIV, Anti- HTL V1/2, Anti- VHB and Anti- CMV IgM/ IgG. The serological analysis revealed one serum positive sample for HIV-1, two positives samples for HTLV1/2, while the majority of samples showed antibodies Anti-CMV-IgG, although the occurrence of high infection was low (2.2%). The prevalence of infection for VHB in pregnant adolescents was 0.62%, however a great number (83.3%) of adolescents are susceptible to the infection by VHB, what means they probably were not immunized. The majority of adolescents (63.4%) continued their studies, even though they know about their pregnancy and 34.6% started prenatal later, so they only had a minimum number of four consultations of prenatal. The result reinforces the hypothesis that pregnant adolescents have prevalence for those viral type infections, what is similar to the national pregnant women rates. The prevalence of viral subtypes (HTLV-2 and HIV-1 subtype B) obtained by the molecular characterization of serum positive samples from pregnant adolescents agreed with the prevalence of subtypes from the North region.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-07T14:01:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_IdentificacaoMolecularEspecies.pdf: 3577435 bytes, checksum: 1ec06b9895715025d7c02ddfc1768072 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-12T13:49:08Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_IdentificacaoMolecularEspecies.pdf: 3577435 bytes, checksum: 1ec06b9895715025d7c02ddfc1768072 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-12T13:49:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_IdentificacaoMolecularEspecies.pdf: 3577435 bytes, checksum: 1ec06b9895715025d7c02ddfc1768072 (MD5) Previous issue date: 2010 / Anofelinos membros de complexos de espécies crípticas podem exibir diferenças comportamentais, de susceptibilidade a infecção malárica, e resistência a inseticidas. Assim, a identificação de espécies vetoras tem relevância epidemiológica, o que nem sempre é possível por critérios morfológicos. Métodos alternativos têm sido empregados para tal, como os que analisam regiões altamente conservadas do DNA ribossômico, variável entre as espécies, conhecidas como espaçadoras internas transcritas (ITS). Considera-se atualmente que o complexo Anopheles c seja composto por seis espécies: An. albitarsis s.s., An. oryzalimnetes, An. albitarsis F, An. marajoara, An. deaneorum, e An. janconnae. Destas, pelo menos as três últimas são incriminadas como vetores de malária na Amazônia brasileira. O objetivo deste estudo foi realizar identificação molecular de espécies do complexo An. albitarsis, por análise da seqüências do ITS2 do rDNA, com vistas a analisar sua importância na transmissão de malária nos municípios de Macapá, Amapá e Peixe-Boi, Pará, inclusive investigando pela primeira vez a ocorrência do An. albitarsis F nestas duas áreas epidemiologicamente distintas: a primeira com histórico de alto risco de transmissão de malária e a segunda não. O estudo foi realizado entre janeiro de 2009 e abril de 2010, e consistiu de capturas de anofelinos de 12 horas de duração (ecostofase) no peridomicílio. Todas as fêmeas coletadas foram morfologicamente identificadas e apenas os An. albitarsis s.l. tiveram cabeça e tórax separadas para análise da infecção natural por ELISA; ovários para análise de paridade e patas, asas e carcaça para identificação molecular. Em Macapá foram realizadas seis coletas, obtendo-se um total de 584 anofelinos, sendo 366 An. albitarsis s.l. (62,7%), 167 An. darlingi (28,6%), 33 An. triannulatus s.l (5,6%), 15 An. braziliensis (2,6%) e 3 An. nuneztovari (0,5%). Pela PCR foi possível visualizar a banda específica de An. marajoara em 320 espécimes dos An. albitarsis s.l testados. Do restante, 33 foram negativos e 13 amplificaram um fragmento de ~490 pb nos iniciadores empregados, não permitindo chegar ao diagnóstico específico. O An. marajoara apresentou características biológicas e comportamentais que ratificam sua importância epidemiológica na transmissão de malária em Macapá, tais como: ser a espécie mais prevalente, com maior proporção de fêmeas paridas (73,0%), e portanto com maiores chances de se infectarem com o plasmódio, ocorrer tanto na estação menos quanto na mais chuvosa, e apresentar atividade hematofágica durante toda a ecostofase, alem disso, foi encontrado naturalmente infectado por P. vivax e P. falciparum (taxa de infecção natural de 3,1%). Em Peixe-Boi, foram capturados 43 anofelinos: An. triannulatus s.l (20 espécimes, 46,5 %), An. albitarsis s.l. (13: 30,2 %), An. darlingi (8: 18,6%), e An. nuneztovari (2: 4,7%). Todos os An. albitarsis s.l. coletados foram identificados pela ITS2 como An. oryzalimnetes. Nenhum deles foi encontrado infectado pelos plasmódios testados, e a maioria das fêmeas era parida (84,6%). São necessários levantamentos entomológicos sistemáticos que analisem a importância deste anofelino na transmissão de malária na cidade. O An. albitarsis F não foi encontrado nas duas áreas estudadas. Nossos resultados contribuem para o entendimento da epidemiologia da malária na região Amazônica brasileira. / Members of Anopheles cryptic species complexes may exhibit behavioral differences among them, the susceptibility to malaria infection, and resistance to insecticides, thus, the specific identification has epidemiological relevance, which is not always possible by morphological criteria. Alternative methods have been employed such as those that analyze highly conserved regions of ribosomal DNA, which varies among species, known as internal transcribed spacer (ITS). Anopheles albitarsis complex is currently composed of six species: An. albitarsis s.s., An. oryzalimnetes, An. albitarsis F, An. marajoara, An. deaneorum and An. janconnae. At least the last three are incriminated as malaria parasite vectors in the Brazilian Amazon. The aim of this study was to perform molecular identification of An. albitarsis complex species, for analysis of ITS2 rDNA sequences, in order to assess their importance in malaria transmission in the cities of Macapá, Amapa and Peixe-Boi, Para, including investigating the first time the occurrence of An. Albitarsis F in two epidemiologically distinct areas: the first with a history of high risk of malaria transmission and the second not (Peixe-Boi). All-night human landing catches of mosquitoes were carried out in the peridomestic environment, from January 2009 and April 2010. The females collected were morphologically identified and only An. albitarsis s.l. was dissected: head and thorax were separated for analysis of natural infection by ELISA; ovaries for parity analysis and the carcass, legs and wings for molecular identification. In Macapá were collected 584 mosquitoes: 366 An. albitarsis s.l. (62.7%), 167 An. darlingi (28.6%), 33 An. triannulatus s.l. (5.6%), 15 An. braziliensis (2.6%) and 3 An. nuneztovari (0.5%). It was possible to visualize the specific band An. marajoara in 320 specimens of An. albitarsis s.l. tested. Of the remainder, 33 were negative and 13 amplified a fragment of ~ 490pb, not allowing to reach the specific diagnosis. The An. marajoara specimens showed biological and behavioral characteristics that confirm their epidemiological importance in malaria transmission in Macapa, such as being the most prevalent species, with a higher proportion of parous females (73.0%), and therefore with the greatest chances of infected with Plasmodium, occur in both seasons (dry and wet), presenting biting activity in all hours worked, moreover, was found infected by P.vivax and P. falciparum (natural infection rate of 3.1%). In Peixe-Boi, were captured 43 anophelines: An. triannulatus s.l. (20 specimens, 46.5%), An. albitarsis s.l. (13, 30.2%) An. darlingi (8, 18.6%), and An. nuneztovari (2, 4.7%). All An. albitarsis s.l. collected were identified by ITS2 as An. oryzalimnetes. None was found infected by Plasmodium, and the vast majority was parous females (84.6%). Systematic entomological surveys are needed to analyse the importance of An. oryzalimnetes in malaria transmission in the city. The An. albitarsis F was not found in the two areas studied. Our results contribute to our understanding of the epidemiology of malaria in the Brazilian Amazon region.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T15:22:31Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EstudoSoroepidemiologicoCoinfeccao.pdf: 1481792 bytes, checksum: ea4e7fbd42e30ad41dfb5025b930e5cb (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-03T16:03:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EstudoSoroepidemiologicoCoinfeccao.pdf: 1481792 bytes, checksum: ea4e7fbd42e30ad41dfb5025b930e5cb (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-03T16:03:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EstudoSoroepidemiologicoCoinfeccao.pdf: 1481792 bytes, checksum: ea4e7fbd42e30ad41dfb5025b930e5cb (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2006 / Governo do Estado do Amapá / Fatores de risco e formas de transmissão do Vírus da Imunodeficiência humana (HIV) e o Vírus da hepatite B (VHB) são freqüentemente os mesmos, o qual explica a alta freqüência de co-infecção envolvendo esses dois agentes. O objetivo desta pesquisa foi estimar a prevalência da infecção pelo VHB, analisar possíveis fatores de risco bem como examinar a associação entre a contagem de linfócitos T CD4+, CD8<+ e carga viral plasmática em 129 portadores do HIV. Cada participante foi submetido a um questionário específico e tinha uma amostra de sangue testada para os marcadores sorológicos HBsAg, anti-HBc total, anti-HBs, contagem de linfócitos T CD4+, CD8+ e carga viral plasmática. A prevalência total de marcadores para o VHB foi de 46,5%, com 3,1% de soropositividade para o HBsAg, 27,1% para o anti-HBc total e 36,4% para o anti-HBs. Após ajuste por regressão logística, os marcadores sorológicos para hepatite B foram associados com as seguintes variáveis: sexo, preferência sexual e escolaridade. A freqüência de marcadores para hepatite B foi de 39,1% em homens e 16,6% em mulheres. A prevalência de marcadores para hepatite B foi 14,4% em homo/bissexuais e 15,4% em heterossexuais. A menor freqüência de hepatite B (1%) foi encontrada em pessoas com nível superior de escolaridade. Não foram observadas diferenças estatisticamente significante entre contagem de linfócitos CD4+, CD8+ e carga viral plasmática em pacientes co-infectados com VHB comparados com aqueles pacientes infectados somente com HIV. / Risk factors and forms of transmission for human immunodeficiency virus (HIV) and hepatitis B virus (HBV) are often the same, which explains the high frequency of co-infection involving these two agents. The objective of this investigation was to assess the prevalence of HBV and possible risk factors for this disease as well to examine association between CD4+, CD8+ lymphocytes T count and plasmatic viral load in 129 patients with HIV. Each participant was submitted to a specific questionnaire and had a blood sample tested for the serologic markers HBsAg, total anti-HBc, anti-HBs, CD4+, CD8+ lymphocytes T count and plasma viral load. The overall prevalence of hepatitis B virus infection was 46,5%, with positivity 3,1% for HBsAg, 27,1% for total anti-HBc and 36,4% for anti-HBs. After adjustment using logistic regression, hepatitis B serological markers were associated with the following variables: sex, sexual preference and education level. The frequency of hepatitis B markers was 39,1% in men and 16,6% in women. The prevalence of hepatitis B markers was 14,4% in homo/bisexual and 15,4% in heterosexuals. The lower frequency (1%) of hepatitis B was determined in group of individual with higher education level. No significant statiscally difference was observed between CD4 and CD8 lymphocytes count and plasmatic viral load in the co-infected with HBV compared to that in patients infected only with HIV.