Made available in DSpace on 2014-12-17T15:14:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CristianACA_TESE.pdf: 1637371 bytes, checksum: 286a3a156c7aca7fdba8233b49b7891f (MD5) Previous issue date: 2010-12-02 / A rota??o estelar ? um dos mais importantes observ?veis da evolu??o estelar. Neste sentido, o sat?lite CoRoT representa uma oportunidade ?nica de medir os per?odos rotacionais para uma amostra de estrelas estatisticamente robusta, oferecendo dados absolutamente necess?rios para o estudo da rota??o e seu papel na evolu??o estelar. Para conseguir isto, um passo fundamental ? a caracteriza??o f?sica e qu?mica das estrelas observadas pelo CoRoT, especificamente devido ao fato de que o c?lculo de per?odos rotacionais confi?veis ? um trabalho dif?cil sem a ajuda dos par?metros estelares. Desta forma, foi elaborado um importante seguimento observacional das estrelas nos campos do CoRoT do anticentro LRa01 e do centro LRc01, permitindo a correta identifica??o dos per?odos que reflitam a modula??o rotacional. Nesta tese de doutorado s?o apresentados os resultados de tal seguimento. Par?metros f?sicos e qu?micos, tais como temperatura efetiva Teff , gravidade superficial log(g), velocidade de microturbul?ncia Vmic, abund?ncia de ferro [Fe/H], velocidade de rota??o projetada Vsin(i), e abund?ncia de l?tio A(Li) s?o apresentados para uma amostra de 116 estrelas dos campos CoRoT. Elas se encontram em diferentes est?gios evolutivos, desde a sequ?ncia principal (SP) at? o ramo das gigantes vermelhas (GV). As observa??es foram feitas utilizando os espectr?grafos UVES (VLT) e HYDRA (CTIO). Para a deriva??o de tais par?metros foram utilizados o programa TurboSpectrum e os modelos de atmosfera de MARCS. Paralelamente, velocidades rotacionais Vsin(i) foram obtidas a partir do ajuste dos perfis observados e sint?ticos das linhas de ferro e por meio de uma calibra??o de fun??o de correla??o cruzada (CCF). Per?odos rotacionais Prot para 77 estrelas da amostra foram obtidos a partir das curvas de luz do sat?lite CoRoT. Extensas tabelas destes par?metros e seus respectivos erros s?o apresentadas. Foram encontradas diferen?as nas distribui??es de Teff , [Fe/H] e est?gios evolutivos entre os diferentes campos do CoRoT, indicando poss?veis efeitos de sele??o na amostra, assim como a exist?ncia de diferentes popula??es estelares do disco Gal?ctico. Por outro lado, o comportamento rotacional e as abund?ncias de l?tio n?o apresentam diferen?as entre estrelas de par?metros f?sicos similares, mas que pertencem a diferentes campos do CoRoT. A partir da an?lise de temperaturas, foi encontrada uma maior extin??o por avermelhamento para estrelas do CoRoT localizadas no campo LRc01, assim como um gradiente deste valor em fun??o da dist?ncia. Os resultados mostram que as abund?ncias de l?tio, as velocidades de rota??o e os per?odos rotacionais apresentam o mesmo comportamento descrito na literatura. Por outro lado, ? apresentada pela primeira vez a rela??o que existe entre o l?tio e o per?odo de rota??o em diferentes est?gios evolutivos, mostrando, tal como era esperado, que ambas as grandezas possuem uma anticorrela??o. Tamb?m ? apresentada a evolu??o simult?nea da rota??o e do l?tio, e foram calculadas rela??es que permitem obter valores m?dios de A(Li) como fun??o da temperatura efetiva e do per?odo rotacional. Os dados apresentados nesta tese de doutorado representam um importante ponto de partida para serem utilizados como uma amostra de calibra??o para diferentes programas no contexto da miss?o do sat?lite CoRoT, uma vez que a lista de estrelas aqui analisadas s?o parte das mais brilhantes que comp?em o campo Exo do CoRoT

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-12T21:07:03Z No. of bitstreams: 1 ErickSharllsRamosDePontes_DISSERT.pdf: 5142026 bytes, checksum: c5d7c498155fa9693ffcb28bbc0c9c56 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-19T12:35:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ErickSharllsRamosDePontes_DISSERT.pdf: 5142026 bytes, checksum: c5d7c498155fa9693ffcb28bbc0c9c56 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-19T12:35:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ErickSharllsRamosDePontes_DISSERT.pdf: 5142026 bytes, checksum: c5d7c498155fa9693ffcb28bbc0c9c56 (MD5) Previous issue date: 2017-08-25 / Uma Linha de produto de software (LPS) representa uma fam?lia de sistemas relacionados que compartilham similaridades e variabilidades visando atender ?s necessidades de um segmento de mercado espec?fico. A ado??o de LPS tem sido aplicada em diversas ?reas na ind?stria de software devido aos benef?cios alcan?ados, tais como, redu??o dos custos no desenvolvimento, aumento da qualidade e redu??o do tempo de comercializa??o. No entanto, cen?rios distintos podem ser encontrados para implementa??o de uma linha de produtos, caracterizando 3 abordagens para ado??o de LPS: (1) abordagem proativa: n?o existe softwares em produ??o, e uma LPS ? desenvolvida do zero; (2) abordagem reativa: j? existe uma LPS em produ??o que vai sofrer incremento para atender novos requisitos; (3) abordagem extrativa: a LPS ? desenvolvida a partir dos artefatos de um sistema ou conjunto de sistemas relacionados que j? est?o em produ??o. No contexto de abordagens extrativa e reativa, este trabalho prop?e um m?todo de extra??o e evolu??o de LPSs a partir de sistemas existentes implementados na linguagem Java. O m?todo foi extra?do a partir da condu??o de um estudo emp?rico de desenvolvimento de uma LPS para o dom?nio de sistemas de controle de espa?os f?sicos utilizados em diferentes centros da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN) e define tr?s atividades que apresentam um conjunto de diretrizes para refatora??o e modulariza??o de features em sistemas implementados em Java: (i) Modelar features da LPS, (ii) Projetar e implementar LPS atrav?s da refatora??o de um sistema existente, e (iii) Realizar testes para cada um dos produtos atuais existentes. Em seguida, o m?todo foi avaliado por meio da sua aplica??o durante evolu??es da LPS para atender novos requisitos demandados pelos clientes. Por fim, foi constatado um aumento de linhas de c?digo dos produtos da LPS, no entanto, o n?cleo da LPS possui uma quantidade de linhas de c?digo menor que qualquer produto antes e depois da extra??o da LPS. Com isso, os artefatos da LPS ficaram melhor modularizados em termos de features, o que pode facilitar a evolu??o tanto do c?digo do n?cleo quanto dos artefatos variantes de cada aplica??o. / A software product line (SPL) represents a family of related systems that share commonalities and variabilities to address the needs of a specific market or mission. The adoption of SPL has been applied in several areas in the software industry due to the benefits achieved, such as reduction of development costs, quality improvement and reduction of time to market. However, distinct scenarios can be found when developing a SPL, which lead to 3 approaches for adopting a SPL: (1) proactive approach: there are no previous software implementation and a SPL is developed from scratch; (2) reactive approach: there is a SPL available which is evolved to address new features and products; (3) extractive approach: SPL is developed from the assets of a system or a set of related systems that already exists. In the scenarios of the extractive and reactive approaches, this dissertation proposes a method of extraction and evolution of SPLs from existing systems implemented in the Java language. The method was extracted from an empirical study of an LPS for the domain of systems that manage physical spaces from different Federal University of Rio Grande do Norte (UFRN) departments and defined three activities that present a set of guidelines for refactoring and modularizing features in systems implemented in Java: (i) Model SPL features, (ii) Design and Implement LPS by refactoring an existing system, and (iii) Perform tests for each of the existing products. The method is evaluated through its application during SPL evolutions to address new requirements demanded by the customers. As a result of the study, we found an increase in the number of lines of code of the products of the products, however, the SPL core had lower lines of code than any product before and after the LPS extraction. Thus, the SPL assets have become better modularized in terms of features, which may facilitate the evolution of core and variant implementations of each application.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-04-02T15:02:43Z No. of bitstreams: 1 GustavoHenriqueOliveiraCavalcante_DISSERT.pdf: 14332647 bytes, checksum: 07f54cbd966599c411e90b07dbb86ba8 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-04-05T13:57:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 GustavoHenriqueOliveiraCavalcante_DISSERT.pdf: 14332647 bytes, checksum: 07f54cbd966599c411e90b07dbb86ba8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-05T13:57:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GustavoHenriqueOliveiraCavalcante_DISSERT.pdf: 14332647 bytes, checksum: 07f54cbd966599c411e90b07dbb86ba8 (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / O papilomav?rus humano (HPV) ? um pequeno v?rus de DNA de dupla fita circular, caracterizado como um dos mais comuns agentes sexualmente transmiss?veis no mundo, cuja detec??o e genotipagem acuradas s? s?o poss?veis por meio de t?cnicas de biologia molecular. Diferentes propriedades biol?gicas t?m sido reportadas dentre os mais de 170 tipos j? caracterizados, de maneira que um grupo particular de HPVs est? fortemente relacionado a infec??es persistentes, les?es intraepiteliais de diferentes graus e progress?o para c?nceres tais como cervical, anal, vulvar, vaginal, orofar?ngeo e de p?nis. No presente trabalho foram realizadas an?lises de variabilidade gen?tica e evolu??o molecular nos genomas dos principais HPVs de import?ncia cl?nica. Reconstru??es filogen?ticas e an?lises dos perfis de assinatura gen?tica nos genomas de cada gen?tipo sugeriram a presen?a de subgrupos de HPVs definidos por diferen?as nas sequ?ncias dos genes E1, E6, L1 e L2. Testes de evolu??o em n?vel de DNA revelaram uma atua??o mais forte da sele??o natural em c?dons espec?ficos, mais frequentemente nos genes E1, E2, L1 e L2. A partir dos dados obtidos nas an?lises de variabilidade, foi desenhado um novo conjunto de primers para a detec??o e genotipagem dos HPVs de import?ncia cl?nica por meio da t?cnica de rea??o em cadeia da polimerase (PCR). O gene E1 foi escolhido como alvo molecular devido a presen?a de uma regi?o conservada com tamanho vari?vel entre gen?tipos. O sistema proposto teve sua efici?ncia avaliada in vitro e foi comparado ao protocolo de PCR mais utilizado para detec??o do HPV em amostras cl?nicas. Utilizando a amplifica??o de ?cido nucleico de forma semianinhada (seminested), o sistema proposto foi capaz de detectar com boa sensibilidade alguns dos principais HPVs de alto risco oncog?nico e mostrou melhor especificidade em rela??o aos primers gen?ricos GP5+/6+, mesmo aplicando uma temperatura de anelamento consideravelmente maior. A an?lise do tamanho dos fragmentos amplificados usando a separa??o por eletroforese em gel de agarose pode favorecer a identifica??o do tipo de HPV presente nas amostras, permitindo a discrimina??o entre aqueles mais prevalentes na popula??o e a redu??o do tempo e do custo necess?rios para a identifica??o do agente. Opcionalmente, a separa??o dos produtos em matrizes de alta resolu??o e o sequenciamento direto podem ser usados para a tipagem, possibilitando a identifica??o de uma ampla variedade de gen?tipos de HPV descritos. / Human papillomavirus (HPV) is a small circular double-stranded DNA virus, characterized as one of the most common sexually transmitted agents in the world, whose accurate detection and genotyping is only possible through molecular biology techniques. Different biological properties have been reported among the more than 170 types already characterized, so that a particular group of HPVs is strongly related to persistent infections, intraepithelial lesions of different degrees and progression to cancers such as cervical, anal, vulvar, vaginal, oropharyngeal and penis. In the present work, analyzes of genetic variability and molecular evolution were performed in the genomes of the main clinically important HPVs. Phylogenetic reconstructions and analyzes of genetic signature profiles in the genomes of each genotype suggested the presence of subgroups of HPVs defined by differences in the E1, E6, L1 and L2 gene sequences. Evolution tests at DNA level have shown a stronger acting of natural selection at specific codons, more often in the E1, E2, L1 and L2 genes. From the data obtained in the analyzes of variability, a new set of primers was designed for the detection and genotyping of HPVs of clinical importance by polymerase chain reaction (PCR) technique. E1 gene was chosen as the molecular target due to the presence of a conserved region of variable size among genotypes. The proposed system had its efficiency evaluated in vitro and was compared to the most used PCR protocol for HPV detection in clinical samples. Using the seminested nucleic acid amplification, the proposed system was able to detect some of the major oncogenic HPVs with good sensitivity and showed a better specificity than the generic primers GP5+/6+, even applying a considerably higher annealing temperature. The analysis of the size of the amplified fragments using agarose gel electrophoresis may favor the identification of the HPV type present in the samples, allowing the discrimination between those more prevalent in the population and the reduction of the time and cost necessary for the identification of the agent. Optionally, the separation of products into high resolution matrices and direct sequencing can be used for typing, enabling the identification of a wide variety of HPV genotypes described.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-01-03T21:51:24Z No. of bitstreams: 1 MilenaCordeiroDeAmorimLopes_DISSERT.pdf: 2836934 bytes, checksum: 1293e7c06c3c5164d9a436cebeacb5cf (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-01-09T16:00:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MilenaCordeiroDeAmorimLopes_DISSERT.pdf: 2836934 bytes, checksum: 1293e7c06c3c5164d9a436cebeacb5cf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-09T16:00:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MilenaCordeiroDeAmorimLopes_DISSERT.pdf: 2836934 bytes, checksum: 1293e7c06c3c5164d9a436cebeacb5cf (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A alta diversidade de plantas vasculares nos tr?picos est? correlacionada com diversos fatores, como, por exemplo, fatores clim?ticos. Altera??es no ecossistema podem gerar oportunidade ecol?gica e impulsionar irradia??es adaptativas. Todavia, alguns clados n?o irradiam frente a uma aparente oportunidade ecol?gica, algumas linhagens mant?m seus nichos conservados ao longo do tempo ou convergem para nichos similares. Este trabalho avalia a evolu??o das toler?ncias clim?ticas de uma linhagem antiga de plantas arb?reas da fam?lia Leguminosae, especificamente do clado Bowdichia integrante do grande clado Genistoide da subfam?lia Papilionoideae. A fim de caracterizar a evolu??o do nicho clim?tico do clado, registros das distribui??es geogr?ficas das esp?cies foram coletados em banco de dados online nacionais e internacionais; foram efetivadas an?lises filogen?ticas e de data??o molecular; constru?dos modelos de nicho ecol?gico; calculados os ?ndices de sobreposi??o; produzidos Perfis de Ocupa??o de Nicho (PON) no contexto filogen?tico; e calculada a disparidade clim?tica atrav?s do tempo. Como resultado, foram evidenciados altos valores de sobreposi??o entre algumas esp?cies de subclados distintos, valores mais altos do que o esperado por Movimento Browniano entre outras altamente aparentadas, e baixos valores de sobreposi??o entre algumas esp?cies em um mesmo subclado. Uma heterogeneidade na ocupa??o de cada vari?vel bioclim?tica entre as esp?cies foi evidenciada atrav?s dos PONs, e, levando em considera??o o contexto filogen?tico, a irradia??o das esp?cies, atrav?s do tempo, se deu sobre uma grande variedade de espa?os e condi??es bioclim?ticas, sendo observados eventos de converg?ncia, diverg?ncia e conservantismo de nicho. Al?m disso, no que diz respeito ? disparidade atrav?s do tempo, ? sugerido que a evolu??o do clado tenha ocorrido sob eventos gradativos e tardios de diversifica??o ao inv?s de uma irradia??o adaptativa r?pida por oportunidade ecol?gica no momento anterior a irradia??o do clado. O estudo refor?a a teoria de que regi?es com alta precipita??o e alta temperatura m?dia anual s?o altamente biodiversas e refuta a teoria dos ref?gios pleistoc?nicos como explica??o para a maior riqueza na Amaz?nia. Al?m disso, a maior heterogeneidade de h?bitats e de ocupa??o de nicho n?o est?o correlacionadas com o tempo de origem de uma linhagem. Tamb?m ? sugerido que a evolu??o divergente tenha sido favorecida no Plio-Pleistoceno com surgimento de oportunidades ecol?gicas ap?s eventos glaciais e interglaciais. / The neotropical region has a high diversity of vascular plant that is correlated with many variables, such as with the climatic factors. Changes in the ecosystem can facilitate ecological opportunity and promote adaptive radiation. However, some clades do not radiate when in an apparent ecological opportunity, some lineages maintain their niches unchanged overtime or can converge to similar niches. This research evaluates the evolution of climatic tolerances of an line of arboreal plants in the Leguminosae family, specifically from the Bowdichia clade, part of the great clade Genistoide, from the Papilionoideae subfamily. In order to characterize the evolution of the climate niche in the Bowdichia clade, we gathered records of the species geographic distributions in national and international online databases, we performed phylogenetic analyzes and molecular dating, we built ecological niche models, we calculated niche overlap indexes, we produced Predicted Niche Occupancy (PNO) in a phylogenetic context, and estimated climate disparity over time. As results, high values of overlap between certain species of distinct subclades have been evidenced, higher values than expected by Brownian motion between others closely related, and low values of overlap between some species of the same subclade. Heterogeneity in the occupation of each bioclimatic variable between species was evidenced by the PNOs, and, taking into account the phylogenetic context, species radiation, over time, occurred over a wide range of spaces and bioclimatic conditions, showing events of niche convergence, divergence and conservatism. Furthermore, with regards to the disparity over time, it is suggested that the evolution of the clade occurred under gradual and late diversification events, instead of under a fast adaptive radiation through ecological opportunity in a moment prior to the clade irradiation. It is also suggested that divergent evolution has been favored in the Plio-Pleistocene with the rise of ecological opportunities after glacial and interglacial events beyond the Andes uplift of the consequences.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-02-22T19:07:45Z No. of bitstreams: 1 JaertonCarvalhoDeSousaJunior_DISSERT.pdf: 6721325 bytes, checksum: 70b215dbb7cad5997d7834c35f11759b (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-03-06T22:50:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JaertonCarvalhoDeSousaJunior_DISSERT.pdf: 6721325 bytes, checksum: 70b215dbb7cad5997d7834c35f11759b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T22:50:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JaertonCarvalhoDeSousaJunior_DISSERT.pdf: 6721325 bytes, checksum: 70b215dbb7cad5997d7834c35f11759b (MD5) Previous issue date: 2016-08-31 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / O objetivo principal desse estudo foi realizar um invent?rio flor?stico taxon?mico das Apocin?ceas ocorrentes nos remanescentes de Mata Atl?ntica do Rio Grande do Norte, atrav?s de consulta aos esp?cimes depositados nos herb?rios, expedi??es de campo e descri??o em laborat?rio dos esp?cimes coletados. Foram registradas 25 esp?cies em 18 g?neros e tr?s subfam?lias. Os g?neros com maior n?mero de esp?cies foram: Ditassa R.Br (4 spp.), Aspidosperma Mart. & Zucc. e Mandevilla Lindl. (3 spp.). Os demais g?neros est?o representados por uma esp?cie cada. S?o apresentadas oito novas ocorr?ncias para a Flora do estado e seus respectivos status de conserva??o. Das novas ocorr?ncias, cinco esp?cies s?o de g?neros aqui registrados pela primeira vez no estado (Cynanchum L., Macoubea Aubl., Odontadenia Benth., Tabernaemontana L. e Temnadenia Miers). S?o apresentadas chave de identifica??o, coment?rios taxon?micos e de distribui??o geogr?fica dos g?neros e esp?cies, descri??es, ilustra??es, fotos e mapas das esp?cies encontradas na ?rea de estudo.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-06-02T22:53:26Z No. of bitstreams: 1 ArthurDeSouzaSoares_DISSERT.pdf: 3203622 bytes, checksum: 8b7b33ba2abe93cb3c9b8ba7ca489c8b (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-06-09T22:02:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ArthurDeSouzaSoares_DISSERT.pdf: 3203622 bytes, checksum: 8b7b33ba2abe93cb3c9b8ba7ca489c8b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-09T22:02:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ArthurDeSouzaSoares_DISSERT.pdf: 3203622 bytes, checksum: 8b7b33ba2abe93cb3c9b8ba7ca489c8b (MD5) Previous issue date: 2017-03-07 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Lamiaceae, 236 g?neros e cerca de 7.200 esp?cies distribu?das em sete subfam?lias, possui distribui??o cosmopolita, com a maioria de suas esp?cies ocorrendo na regi?o tropical do planeta. Para o Brasil s?o listadas 524 esp?cies em 46 g?neros, dentre as quais, seis g?neros e 343 esp?cies s?o end?micos. No estado do Rio Grande do Norte (RN), est?o catalogados oito g?neros e 13 esp?cies, onde apenas um g?nero e quatro esp?cies s?o end?micos do Brasil. Esta disserta??o est? dividida em dois cap?tulos, os quais s?o apresentados aqui como manuscritos independentes j? nos padr?es exigidos pelas revistas escolhidas para publica??o, cujas normas est?o anexadas a esta disserta??o. Os cap?tulos s?o: Lamiaceae no Rio Grande do Norte, Brasil, onde ? apresentado o tratamento taxon?mico e flor?stico da fam?lia Lamiaceae no estado do Rio Grande do Norte. Neste estudo foram registradas 30 esp?cies, das quais 14 s?o ex?ticas, naturalizadas ou cultivadas e 16 constituem as esp?cies nativas. As esp?cies Hyptis brevipes Poit. e Vitex rufescens A.Juss. ocorrem apenas no dom?nio Mata Atl?ntica, enquanto Amasonia campestris (Aubl.) Moldenke, Eriope macrostachya Mart. ex Benth., Gymneia platanifolia (Benth.) Harley & J.F.B.Pastore, Mesosphaerum pectinatum (L.) Kuntze, Hyptis lantanifolia Poir., Mesosphaerum sp., Vitex gardneriana Schauer, Vitex schaueriana Moldenke, ocorrem apenas no dom?nio Caatinga. As esp?cies Mesosphaerum suaveolens (L.) Kuntze e Marsypianthes chamaedrys (Vahl.) Kuntze foram as que apresentaram a maior distribui??o dentro do territ?rio do estado. No segundo cap?tulo, New records, conservation assessments and distribution of Lamiaceae in Rio Grande do Norte, northeastern, Brazil, ? apresentado o Status de conserva??o das esp?cies de Lamiaceae e sua distribui??o no RN incluindo as esp?cies e g?neros citados pela primeira vez para o estado. Entre as esp?cies nativas, tr?s foram classificadas como ?Amea?adas?, quatro como ?Vulner?veis?, tr?s s?o de ?Pouco Preocupante?, duas s?o ?Quase Amea?adas? e quatro s?o ?Dados Insuficientes?. O dom?nio fitogeogr?fico Caatinga, uma Floresta Tropical Sazonalmente Seca (SDTF), tem o maior n?mero de esp?cies de Lamiaceae, embora menos de 1% desta regi?o seja protegida por unidades de conserva??o. Este estudo revela o estado preocupante da conserva??o da fam?lia Lamiaceae na RN e a necessidade de a??es de conserva??o, como a cria??o de novas unidades de conserva??o para preservar a qualidade do habitat e as forma??es naturais remanescentes e monitorar popula??es na natureza. / Lamiaceae, 236 genera and about 7,200 species distributed in seven subfamilies, has cosmopolitan distribution, with most of its species occurring in the tropical region of the planet. For Brazil, 524 species are listed in 46 genera, of which six genera and 343 species are endemic. In the state of Rio Grande do Norte (RN), they are cataloged of genera and 13 species, where only one genus and four species are endemic to Brazil. This dissertation is divided into two chapters, which are presented here as independent manuscripts already in the standards required for journals chosen for publication, whose norms are attached to this dissertation. The chapters are: Lamiaceae in Rio Grande do Norte, Brazil, where is the taxonomic and floristic treatment of the Lamiaceae family in the state of Rio Grande do Norte. In this study, 30 species were recorded, of which 14 are exotic, cultivated or cultivated, and 16 are native species. The species Hyptis brevipes Poit. e Vitex rufescens A.Juss. occur only in the Atlantic Forest domain, while Amasonia campestris (Aubl.) Moldenke, Eriope macrostachya Mart. Harley & J. F.B.Pastore, Mesosphaerum pectinatum (L.) Kuntze, Hyptis lantanifolia Poir., Mesosphaerum sp., Vitex gardneriana Schauer, Vitex schaueriana Moldenke, occur only in the Caatinga domain. The species Mesosphaerum suaveolens (L.) Kuntze and Marsypianthes chamaedrys (Vahl.) Kuntze were the ones that presented the largest distribution in the territory of the state. In the second chapter, New records, conservation assessments and distribution of Lamiaceae in Rio Grande do Norte, northeastern, Brazil, is presented the Status of conservation of the species of Lamiaceae and their distribution in the RN including the species and genera mentioned for the first time for the state. Among the native species, three were classified as 'Threatened', four as 'Vulnerable', three are 'Least Concern', two are 'Near Threatened' and four are 'Data Deficient'. The phytogeographical domain Caatinga, a Seasonally Dry Tropical Forest (SDTF), has the highest number of Lamiaceae species, although less than 1% of this region is protected by conservation units. This study reveals the worrying state of conservation of the Lamiaceae family in the NR and the need for conservation actions such as the creation of new conservation units to preserve the quality of the habitat and the remaining natural formations and to monitor populations in the wild.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-06-13T20:31:55Z No. of bitstreams: 1 AllysonSantosDeSouza_TESE.pdf: 3764109 bytes, checksum: 3586d800817b7e154772241a2ea2d533 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-06-19T15:05:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AllysonSantosDeSouza_TESE.pdf: 3764109 bytes, checksum: 3586d800817b7e154772241a2ea2d533 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T15:05:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AllysonSantosDeSouza_TESE.pdf: 3764109 bytes, checksum: 3586d800817b7e154772241a2ea2d533 (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / O extenso litoral brasileiro ? multipartido em diferentes ecossistemas, compostos por estu?rios, manguezais, sistemas recifais, ilhas costeiras e oce?nicas. Estes ambientes possuem uma ictiofauna bastante diversificada composta por 1.297 esp?cies, das quais aproximadamente 25% representam esp?cies end?micas. Esses n?veis de biodiversidade podem ser incertos, devido a ocorr?ncia de esp?cies cr?pticas e polit?picas e pela aus?ncia de estudos populacionais, sobretudo em esp?cies recifais. Neste sentido, foram analisados aspectos populacionais, taxon?micos e filogen?ticos de esp?cies das fam?lias Pomacentridae (Perciformes) e Carangidae (Carangiformes), distribu?dos ao longo da costa e ilhas oce?nicas brasileiras. As an?lises moleculares e morfom?tricas realizadas em S. variabilis, S. fuscus, S. rocasensis, S. sanctipauli e S. fuscus trindadensis indicaram sinon?mia entre S. rocasensis e S. sanctipauli, e entre S. fuscus e S. fuscus trindadensis. Al?m disso, revelaram a presen?a de uma poss?vel esp?cie cr?ptica que tem sido confundida com S. variabilis. As an?lises populacionais em Abudefduf saxatilis no Atl?ntico Ocidental, incluindo as ilhas oce?nicas, revelam um quadro de panmixia desde a Venezuela at? o sudeste do Brasil, enquanto que as popula??es insulares possuem diferentes n?veis de estrutura??o gen?tica, sobretudo a da Ilha de Trindade. As an?lises gen?ticas na esp?cie polit?pica Caranx lugubris indicaram uma grande popula??o panm?tica no Atl?ntico Ocidental, lan?ando novos dados sobre a origem dos morf?tipos que ocorrem no entorno do Arquip?lago de S?o Pedro e S?o Paulo. Os dados obtidos aprofundam o conhecimento da fauna ?ctica insular do Atl?ntico e servem de subs?dios para o manejo e conserva??o de esp?cies dessas importantes e particulares regi?es oce?nicas. / The extensive Brazilian coast is multi-party in different ecosystems, composed by estuaries, mangroves, reef systems, oceanic and coastal islands. These environments detain a largely diversified ichthyofauna composed by 1,297 species, in which 25% represents endemic species. These levels of biodiversity can be uncertain, because of the occurrence of cryptic and polytypic species and the absence of population studies, especially in reef species. In this sense, population, taxonomical and phylogenetical aspects were analyzed form species of the Pomacentridae (Perciformes) and Carangidae (Carangiformes) families, along the coast and oceanic islands of Brazil. The molecular and morphometric analyzes were performed in S. variabilis, S. fuscus, S. rocasensis, S. sanctipauli and S. fuscus trindadensis indicated synonym among S. rocasensis and S. sanctipauli, and between S. fuscus and S. fuscus trindadensis. Besides that, revealed the presence of a possible cryptic species which has been confused with S. variabilis. The population analyzes in Abudefduf saxatilis at the Western Atlantic, including the oceanic islands, reveals a status of panmixia from Venezuela to the Southeast of Brazil, while the island populations have different levels of genetic structuration, specially the population of the Trindade island. The genetic analyzes in the polytypic species Caranx lugubris indicated a large panmitic population in the Western Atlantic, revealing new data about the origins of the morphotypes that occurs in the surroundings of the Saint Paul Rocks archipelago. The data obtained expands the knowledge over the insular ichthyic fauna of the Atlantic and serves as subsidy to the conservation and management of species of these particular and important oceanic regions.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-04T14:06:52Z No. of bitstreams: 1 TianisaPratesBoeira_DISSERT.pdf: 9182882 bytes, checksum: 8fcb0e813beef7ee99fa80896802209b (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-13T11:37:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TianisaPratesBoeira_DISSERT.pdf: 9182882 bytes, checksum: 8fcb0e813beef7ee99fa80896802209b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-13T11:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TianisaPratesBoeira_DISSERT.pdf: 9182882 bytes, checksum: 8fcb0e813beef7ee99fa80896802209b (MD5) Previous issue date: 2016-08-31 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Rubiaceae ? a quarta fam?lia mais representativa em n?mero de esp?cies dentre as Angiospermas, com 13.526 esp?cies em 620 g?neros. No Brasil, a fam?lia ? representada por 1.375 esp?cies, sendo 389 ocorrentes no Nordeste. A tribo Spermacoceae apresenta distribui??o pantropical e ? caracterizada por plantas predominantemente herb?ceas com est?pulas fimbriadas e flores geralmente tetr?meras, representadas no Brasil por 217 esp?cies em 17 g?neros. O presente estudo teve como objetivo o estudo taxon?mico das Spermacoceae no Rio Grande do Norte (RN), a fim de contribuir para o conhecimento sobre a flora do estado, bem como auxiliar na identifica??o correta das esp?cies do grupo, as quais s?o facilmente confundidas morfologicamente, mesmo ao n?vel de g?nero. Para este estudo, foram realizadas expedi??es cient?ficas a campo, para coleta e observa??o das Spermacoceae, em ?reas de Mata Atl?ntica e Caatinga do estado, seguidas de identifica??o e descri??o das esp?cies coletadas e depositadas em herb?rios. Foram encontradas 24 esp?cies e oito g?neros. Os g?neros mais representativos foram Borreria (8 spp.), Mitracarpus (6 spp.) e Hexasepalum (4 spp.); os demais: Oldenlandia (2 spp.) e Leptoscela, Richardia, Spermacoce e Staelia com apenas uma esp?cie cada. Seis esp?cies s?o registradas pela primeira vez para a flora do Rio Grande do Norte: Borreria ocymifolia, Mitracarpus baturitensis, M. hirtus, M. longicalyx, Oldenlandia corymbosa e Staelia virgata. S?o apresentadas descri??es, ilustra??es, chave de identifica??o e dados acerca do h?bitat, fenologia e distribui??o geogr?fica das esp?cies. / Rubiaceae is the fourth largest family of Angiosperms, with 13.526 species and 620 genera. In Brazil, the family is represented by 1.375 species, of which 389 occurs in the Northeast region. The Spermacoceae is a tribe with pantropical distribution pattern, characterized by predominantly herbaceous plants with fimbriate stipules and flowers usually tetramerous, represented in Brazil by 217 species and 17 genera. This study aimed the taxonomic survey of the Spermacoceae in Rio Grande do Norte (RN), in order to contribute to the knowledge of the flora, as well as offer support to the correct identification of this group's species, which are easily confused due to the morphological resemblance, even at the generic level. For this study, field expeditions were made to collect and observe the Spermacoceae in areas of the Atlantic Forest and Caatinga in the state, followed by the identification, description of the specimens and further incorporation in herbaria. Were registred 24 species and eight genera. The most species-rich genera were Borreria (8 spp.), Mitracarpus (6 spp.) and Hexasepalum (4 spp.); Oldenlandia (2 spp.) each and Leptoscela, Richardia, Spermacoce e Staelia had only one species each. Six species are new records for the flora of Rio Grande do Norte: Borreria ocymifolia, Mitracarpus baturitensis, M. hirtus, M. longicalyx, Oldenlandia corymbosa e Staelia virgata. Descriptions, illustrations, identification key, habitat data, fenology and distribution of the species are presented.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-17T13:30:06Z No. of bitstreams: 1 DonisDaSilvaAlfredo_TESE.pdf: 10703319 bytes, checksum: 2a0e83dae0526396b51ee03f2edc8b39 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-19T14:52:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DonisDaSilvaAlfredo_TESE.pdf: 10703319 bytes, checksum: 2a0e83dae0526396b51ee03f2edc8b39 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-19T14:52:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DonisDaSilvaAlfredo_TESE.pdf: 10703319 bytes, checksum: 2a0e83dae0526396b51ee03f2edc8b39 (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Em uma estimativa sobre a biodiversidade da terra acredita-se haver entorno de 50 milh?es de esp?cies e para os fungos acredita-se que essa estimativa gira em torno de 5,1 milh?es de esp?cies, o que levaria cerca de 1000 anos para os taxonomistas identificassem todas essas esp?cies. Os taxonomistas t?m empregado muito esfor?o para identificar essas esp?cies de fungos, incluindo o g?nero representante dos chamados ?puffballs? -Lycoperdon Pers. Durante um longo per?odo, a taxonomia do g?nero Lycoperdon se baseou fundamentalmente em caracteres morfol?gicos, e muitos conceitos adotados para nomear esp?cies tem se mostrado divergentes entre os taxonomistas. At? o final da d?cada de 80, diversos trabalhos de taxonomia morfol?gica foram publicados e ajudaram a ampliar o conhecimento sobre a diversidade de esp?cies de Lycoperdon em quase todos os continentes, no entanto, em muitos casos a morfologia n?o ? suficiente para segregar esp?cies cr?pticas, ou esclarecer problemas de diverg?ncia quanto a sinonimiza??o de t?xons. No in?cio da d?cada de 90 houve uma revolu??o na taxonomia de fungos com o uso de ferramentas moleculares na classifica??o de esp?cies, relac?es filogen?ticas e identifica??o novos t?xons. Representantes do g?nero Lycoperdon foram estudados por meio dessa nova ferramenta somente no in?cio do s?culo 21, e logo em seguida em 2008, com os trabalhos de Larsoon e Jeppson, sendo que alguns g?neros como Morganella e Vascellum foram reconhecidos como subg?neros de Lycoperdon. Durante esse per?odo outra ferramenta passou a ganhar espa?o na identifica??o de esp?cies por meio de um c?digo de barras molecular, e essa ferramenta passou a ser usada na identifica??o de animais, plantas e fungos, usando dentre outra, a regi?o espa?adora transcrita interna (ITS), embora, at? o presente momento, nenhum trabalho de DNA ?barcoding? havia sido realizado com as esp?cies do g?nero Lycoperdon. O presente trabalho teve o objetivo de revisar as esp?cies do g?nero Lycoperdon para Am?rica do Sul, identificando-as com base nos caracteres morfol?gicos e no uso da regi?o ITS como DNA ?barconding? de fungos e, posteriormente, adicionando a regi?o da subunidade maior (LSU) do nrDNA para avaliar se ao adicionar as esp?cies sul-americanas, Morganella seguiria como subg?nero de Lycoperdon. Para isso, foram realizados empr?stimos de herb?rios nacionais e internacionais; usando literatura especializada na taxonomia do g?nero Lycoperdon e com ajuda de renomados especialistas do grupo, as esp?cies de Lycoperdon foram identificadas. Posteriormente, foi extra?do o DNA de pequenas por??es internas do basidiomas; logo em seguida o produto extra?do foi amplificado e sequenciado; as sequ?ncias foram editadas e submetidas ? busca por similaridade no GenBank utilizando o programa BLAST para checar se as sequ?ncias se assemelhavam as regi?es comparadas; uma vez realizado esse processo as sequ?ncias foram corridas em an?lises de M?xima Parcim?nia e dist?ncia (K2P) utilizando o programa PAUP; a ?rvore de dist?ncia se obteve por Neighbor-Joining. Al?m disso, foi realizada a an?lise Bayesiana no programa MrBayes; as ?rvores geradas foram visualizadas no FigTree e editadas no programa InkScap. Com base somente no ITS como DNA barcoding do g?nero Lycoperdon, obteve-se os seguintes resultados: 65% das amostras obtiveram sucesso de amplifica??o; foram identificadas 19 esp?cies, excluindo aquelas que estavam sob Morganella, para Am?rica do Sul e Central; quatro t?xons s?o primeiros registros para o continente sul-americacano: Lycoperdon calvescens, L. endotephrum, L. ericaeum e L. eximium; e foi erguido um novo subg?nero: Lycoperdon subg. Arenicola. Com base nas an?lises de morfol?gia e DNA barcoding foi poss?vel identificar 43 esp?cies do g?nero Lycoperdon, sendo que destas, 30 esp?cies s?o reportadas para Am?rica do Sul e Central; poucas esp?cies se encontram nos dois hemisf?rios (aprox. 30 %). Com estes resultados, conclu?mos que ITS como DNA ?barcoding? de Lycoperdon ? promissor, embora alguns grupos necessitem incluir mais esp?cimes e marcadores. A taxonomia morfol?gica continua sendo crucial na interpreta??o de dados geradas pela taxonomia molecular.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-17T13:30:06Z No. of bitstreams: 1 FrancoiseDantasDeLima_TESE.pdf: 8585044 bytes, checksum: 0ae8905bac9e200a95b966507fc7aa0e (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-19T15:09:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FrancoiseDantasDeLima_TESE.pdf: 8585044 bytes, checksum: 0ae8905bac9e200a95b966507fc7aa0e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-19T15:09:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FrancoiseDantasDeLima_TESE.pdf: 8585044 bytes, checksum: 0ae8905bac9e200a95b966507fc7aa0e (MD5) Previous issue date: 2017-04-07 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A abordagem integrativa aplicada ? conserva??o de uma esp?cie ? essencial para a compreens?o dos fatores que contribuem para a diversifica??o de popula??es, processos de especia??o e identifica??o de padr?es ecol?gicos. Para tra?ar um panorama de conserva??o para Octopus insularis, foi adotada uma abordagem integrativa que envolve elementos da filogenia, filogeografia, Barcoding, modelagem do nicho clim?tico e gen?tica da paisagem. O presente estudo foi realizado em 15 localidades da costa oeste e ilhas oce?nicas do Atl?ntico Tropical. Foi identificado um aumento da ?rea de distribui??o de O. insularis para o mar do Caribe, o qual confirma o alto potencial da esp?cie para dominar ambientes de ?guas quentes e rasas. Al?m disso, verificou-se problemas com a identifica??o incorreta das esp?cies que comp?em os estoques pesqueiros dessa regi?o e do Golfo do M?xico, o que pode amea?ar a esp?cie end?mica O. maya. Atrav?s do enfoque filogen?tico com infer?ncia biogeogr?fica, foi poss?vel identificar o Caribe como poss?vel centro de origem do O. insularis, a qual divergiu de outras do g?nero ap?s o soerguimento do Istmo do Panam?. Tr?s clados contendo esp?cies transistimianas confirmam a import?ncia desse evento geol?gico no processo de especia??o em oct?podes. A influ?ncia dos processos clim?ticos subsequentes nas popula??es de O. insularis foi analisada atrav?s da modelagem do nicho em cinco cen?rios temporais. A an?lise revelou expans?o do nicho de O. insularis, em dire??o a regi?es temperadas nos cen?rios de aquecimento global. J? a filogeografia, estrutura??o populacional mostrou quatro popula??es/estoques bem delimitados geneticamente, devido ao regime da Corrente Sul Equatorial e montes submersos. Tais resultados corroboram a hip?tese do isolamento por Resist?ncia. Os resultados do presente estudo permitiram uma vis?o hol?stica dos fatores gen?ticos, ecol?gicos e oceanogr?ficos que influenciam a esp?cie O. insularis e auxiliaram a tra?ar um atual panorama de conserva??o e regulamenta??o da esp?cie, bem como sugerir futuras medidas de manejo para e esp?cie. / The integrative approach applied to species conservation is essential to understand the factors that contribute to population diversification, speciation processes and identification of ecological patterns. To propose a panorama for the conservation of Octopus insularis, a wide distributed species in the Tropical Atlantic, an integrative approach involving phylogeny, phylogeography, Barcoding, climatic niche modeling and landscape genetics was adopted. The present study was performed in 15 localities of the Tropical Atlantic west coast and oceanic islands. It was identified a northward increase in the O. insularis distribution area towards the Caribbean Sea, which confirms high potential of this species to dominate warm and shallow waters. Furthermore, misidentification of the species that compose fisheries stocks in the Gulf of Mexico was detected, which may threaten the endemic species O. maya. By using phylogeny approach with biogeographic interference, it was possible to identify Caribbean Sea as an origin area of O. insularis, which diverged from others congeners after the uplift of Isthmus of Panama. Tree clades formed by transisthmian species confirmed the importance of this geological event on speciation processes in octopod. The influence of the historical e future climate changes on distribution and expansion of O. insularis populations was analyzed by ecological niche modeling in five temporal scenarios. The analysis revealed a climatic niche expansion of O. insularis towards temperate regions on global warming scenarios. Whereas, phylogeography and population structure showed four populations/stocks well delimited, mainly due to South Equatorial Current and seamounts. These results corroborate the Isolation by Distance hypothesis. The present results allowed a holistic view, including genetic, ecology and oceanographic factors, which influences O. insularis life history. Those findings can help to build an actual panorama of species conservation and regulation, as well, to suggest future management measures to attenuate possible consequence of global climatic changes.