Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. / Made available in DSpace on 2012-10-17T10:01:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas, 2014. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-07-07T11:30:46Z No. of bitstreams: 1 2014_MonaLisaSousadeAssisBittencourt.pdf: 1148773 bytes, checksum: f37fdfb05c37d708042ee30bd9b4f8ee (MD5) / Approved for entry into archive by Ruthléa Nascimento(ruthleanascimento@bce.unb.br) on 2017-03-27T16:35:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_MonaLisaSousadeAssisBittencourt.pdf: 1148773 bytes, checksum: f37fdfb05c37d708042ee30bd9b4f8ee (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T16:35:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_MonaLisaSousadeAssisBittencourt.pdf: 1148773 bytes, checksum: f37fdfb05c37d708042ee30bd9b4f8ee (MD5) / As proteases se referem a um grupo de enzimas cuja função catalítica é hidrolisar proteínas. Enzimas proteolíticas encontram ampla aplicação em diversas indústrias e preparações farmacêuticas. Os fungos filamentosos são usados em muitos processos industriais para a produção de enzimas e metabólitos. Alguns desses fungos são produtores de uma série de enzimas, como amilases, pectinases e proteases. O presente trabalho teve como objetivo principal caracterizar proteases expressas por fungos filamentosos isolados de diferentes amostras do Cerrado do Centro-Oeste brasileiro, frente à produção de proteases de interesse industrial e farmacêutico em diversas condições de cultivo. Inicialmente, foi realizada uma triagem para avaliar a capacidade de 17 fungos quanto à produção de protease em meio de cultura contendo Ágar-leite. Oito espécies formaram halo no cultivo em placas de Petri contendo 10% de leite desnatado em Ágar indicando serem produtoras de proteases. Em seguida, quando cultivadas em estufa, no meio sabouraud, peptona e leite desnatado, seis espécies de fungos apresentaram altas atividades de protease sendo então cultivadas sob condição de agitação. Uma melhoria nas atividades de protease para as espécies Aspergillus foetidus, Penicillium variotti, Penicillium citrinum e Penicillium fellutanum foi obtida quando utilizado o cultivo em shaker. Um importante aumento na atividade proteolítica foi obtido para a espécie P.restrictum e P. fellutanum quando avaliado meio de cultivo contendo resíduo agroindustrial. No meio contendo farelo de trigo como fonte de carbono, a maior atividade proteolítica foi identificada quando realizado cultivo por P. restrictum (81,1 UI/mL), a as proteases presentes no meio possuem temperatura ótima igual a 45 °C e pH ótimo em uma faixa de 5,0 a 9,0. Sendo termoestáveis por 2 horas em pH e temperatura ótima. Desta forma, estas enzimas podem ser consideradas promissoras para aplicação industrial. / Proteases are a group of enzymes whose catalytic function is the hydrolysis of proteins. Proteolytic enzymes have wide application in various industries and pharmaceutical preparations. Due to technical and economic advantage, microorganisms are the preferred source of industrial application of protease enzymes, although it can be obtained from animals and plants. Filamentous fungi have beeb used in many industrial processes for the production of enzymes and metabolites. Some of these fungi are producers of several enzymes as amylases, proteases and pectinases. This work aimed to characterize proteases expressed by filamentous fungi isolated from different samples of the Cerrado of Central Brazil, focusing the production of these enzymes of industrial and/or pharmaceutical interest in different growing conditions. Initially, a screening was performed to assess the ability of 17 fungi initially isolated for production of proteases in culture media containing 10% skim milk in agar. Eight species formed a clear zone surrounding colonies, indicating production of protease. These species were then cultivated in Sabouraud broth, peptone and skim milk. Six species showed high protease activity and were then incubated under agitation. Protease activity for the species Aspergillus foetidus, Penicillium variotti, Penicillium citrinum and Penicillium fellutanum improved when used in the cultivation in shaker.A significant increase in proteolytic activity was obtained for the species Penicillium restrictum and Penicillium fellutanum when evaluated in culture media containing agro industrial residues. In a media containing wheat bran as carbon source, the major proteolytic activity has been identified as performed by growing Penicillium restrictum (81.1 IU/mL). Proteases present in the medium have an excellent temperature of 45 °C and optimum pH in a range 5.0 to 9.0. We evaluated the physicochemical characterization and the enzymatic profile of the species Penicilliumrestrictum and Penicillium fellutanum for production of protease in different culture media. Thus, these enzymes can be considered promising for industrial application.

A proteína recombinante inibidora de serinoprotease denominada de Amblyomin-X foi obtida a partir de uma biblioteca de cDNA das glândulas salivares do carrapato Amblyomma cajannense, construída e utilizada para identificar um gene que codifica um inibidor de serinoprotease do tipo Kunitz. O Amblyomin-X inibe a formação da massa tumoral in vivo, no entanto o mecanismo envolvido neste efeito não está totalmente esclarecido. Visto que um dos mecanismos anti-carcinogênicos dos inibidores de serinoproteases é a inibição do processo de angiogênese, este trabalho foi delineado para avaliar as ações do Amblyomin-X sobre a angiogênese in vivo e sobre funções da célula endotelial envolvidas neste processo. A angiogênese in vivo foi estudada em modelo de câmara dorsal por microscopia intravital. Quarenta e oito horas após a implantação da câmara dorsal, os animais receberam tratamento tópico de salina ou de Amblyomin-X por 8 dias, com intervalos de 48 horas a cada dose (10, 100 ou 1000ng/mL). Os efeitos foram avaliados em condições basais e na vigência do crescimento tumoral (injeção de 1x105 células B16-F10 de melanoma murino no tecido subcutâneo). Adicionalmente, os efeitos do Amblyomin-X sobre a permeabilidade vascular foram avaliados pela mensuração espectrofotométrica da quantidade de corante extravasado no tecido dos animais após injeção intradérmica do fator de crescimento do endotélio vascular (VEGF) ou do Amblyomin-X. Uma série de estudos in vitro foram realizados em células endoteliais de linhagem de microcirculação (t-End) para avaliar os efeitos do Amblyomin-X (10, 100 e 1000ng/mL) sobre: 1) a migração destas células, usando modelos bidimensional (2D) de cicatrização in vitro e tridimensional (3D) em câmara de Boyden modificada, na ausência e frente ao fator de crescimento do endotélio vascular (VEGF; 100 ng/mL); 2) sobre a aderência em Matrigel® e 3) sobre a secreção de prostaglandina E2 (PGE2) e a produção de óxido nítrico (NO) por ensaio imunoenzimático e reação de Griess, respectivamente. Ademais, foram avaliados os efeitos do Amblyomin-X sobre a viabilidade das células B16-F10 (1x105) por citometria de fluxo. Os resultados obtidos mostram que a aplicação tópica de Amblyomin-X reduziu o número de vasos no tecido subcutâneo dorsal (10ng/mL = 21,7%; 100ng/mL= 35,7%; 1000ng/mL= 36,8% vs 1° dia de tratamento). O mesmo efeito foi observado na presença de células B16-F10 (1000ng/mL= 44,3% vs 1° dia de tratamento), além de uma redução no desenvolvimento da massa tumoral (1000ng/mL= 88% vs controle). O tratamento com Amblyomin-X reduziu a migração basal das células t-End no modelo 2D (10ng/mL=16,4%; 1OOng/mL=23, 1%; 1000ng/mL=26,8% vs controle) e 3D (10ng/mL=39,2%; 100ng/mL=49,4%; 1000ng/mL=50,4% vs controle); inibiu a adesão destas células endoteliais em Matrigel® (100ng/mL=46,4%; 1000ng/mL=48,4% vs controle); não alterou produção os mediadores químicos NO e PGE2 pelas células endoteliais; não modificou a permeabilidade vascular e não alterou a viabilidade das células de melanoma murino B16-F10. Em conjunto, os dados obtidos mostram que o Amblyomin-X inibe a formação de novos vasos em condições basais e na vigência de crescimento tumoral in vivo que este efeito pode estar relacionado à redução do desenvolvimento tumoral, uma vez que a concentração de Amblyomin-X que inibe a angiogênese não causou citotoxicidade às células tumorais in vitro. Além disso, os mecanismos envolvidos no processo de angiogênese podem ser decorrentes, pelo menos em parte, de prejuízos na migração e adesão das células endoteliais. / The recombinant serine protease inhibitor protein called Amblyomin-X was obtained from a cDNA library of the Amblyomma cajennense salivary glands constructed and used to identify a gene encoding a kunitz type serine protease inhibitor. Amblyomin-X presents inhibitory effect on tumoral mass formation in vivo. Nevertheless, the mechanisms involved in the effects have not been clarified. Considering that interference on angiogenesis process is one of the mechanisms responsible for the antitumor activity displayed by serine protease inhibitors, this project was undertaken to study the Amblyomin-X actions on this process and on related endothelial cell functions. In vivo angiogenesis was studied using dorsal chamber model associated to intravital microscopy. Forty eight hours after dorsal chamber implantation, the animals were topically treated with saline or Amblyomin-X during 8 days, with intervals at each 48hs (10, 100 ou 1000ng/mL). The effects were evaluated at basal conditions or during tumoral development (1x105 B16-F10 murine melanoma cells injected into subcutaneous tissue). In addition, the effects of Amblyomin-X on vascular permeability were evaluated by measuring the dye leakage into dorsal intradermic tissue after local injection of vascular endothelial growth factor (VEGF) or Amblyomin-X, or both. In vitro assays were also performed using endothelial cells from microcirculation (t-End) and the effects of Amblyomin-X (10, 100 e 1000ng/mL) were studied on: 1) cell migration, using bidimensional (2D) and tridimensional (3D) models in modified Boyden chamber using chemotatic factor (VEGF100 ng/mL); 2) Matrigel® adherence and, 3) prostaglandin E2 (PGE2) and nitric oxide (NO) secretion by enzymatic assay and Griess reaction, respectively. In addition, the Amblyomin-X toxicity was evaluated on the B16-F10 cells (1x105), using flow citometry. Results obtained show that topic application of Amblyomin-X reduced the number of vessels in the subcutaneous dorsal tissue (10ng/mL = 21,7%; 100ng/mL= 35,7%; 1000ng/mL= 36,8% vs 1st day of treatment). The same effect was observed in the presence of B16-F10 cells (1000ng/mL= 44,3% vs 1st day of treatment), simultanesouly to a significant reduction on tumoral mass development (1000ng/mL= 88% vs control). Amblyomin-X treatment impaired basal migration of tEnd in the 2D (10ng/mL=16,4%; 100ng/mL=23, 1%; 1000ng/mL=26,8% vs control) and 3D model (10ng/mL=39,2%; 100ng/mL=49,4%; 1000ng/mL=50,4% vs controle); inhibited the adhesion of t-End in Matrigel® (100ng/mL=46,4%; 1000ng/mL=48,4% vs control); did not alter the production of chemical mediators (PGE2 and NO); did not modify the vascular permeability and did not affect the B16-F10 cells viability. Taken together, data here obtained show that Amblyomin-X inhibited the new vessels formation under basal conditions, and during tumoral development. The effect could be related to the reduction of tumoral progress also detected in vivo, asthe schedule of treatment employed did not induce cancer cell toxicity. The mechanisms involved in the reduced angiogenesis may be related, at least in part, to the impaired endothelial cell migration and adhesion.

Com o objetivo de estudar a potencialidade do emprego de termolisina como catalisador nas reações de incorporação de N-acil-asparagina a ésteres de aminoácidos e peptídeos, foram sintetizados os seguintes di- e tripeptídeos: Boc-Asn-Ile-OBzl, Z-Asn-Ile-OBzl, Moz-Asn-Ile-OBzl, Boc-Asn-Leu- OBzl, Z-Asn-Leu-OBzl, Moz-Asn-Leu-OBzl, Z-Asn-Leu-OEt, Boc-Asn-Phe-OBzl, Z-Asn-Phe-OBzl, Moz-Asn-Phe-OBzl, Z-Asn-Phe- OEt, Z-Asn-Val-OBzl, Moz-Asp-Val-OBzl, Moz-Asn-Ile-Gly-OBzl, Moz-Asn-Ile-Ala-OBzl, Moz-Asn-Ile-Leu-OBzl e Moz-Asn- Ile-Phe-OBzl. Todos os peptídeos foram obtidos na forma pura, com bom rendimento e foram analisados e caracterizados por cromatografia em camada delgada, ponto de fusão, análise elementar, análise de aminoácidos e ressonância magnética protônica. Entre os grupos protetores de asparagina, benziloxicarbonil e p-metoxibenziloxicarbonil permitiram a obtenção dos dipeptídeos com excelentes rendimentos. Foi observado que os tripeptídeos requerem para a sua síntese menores concentração de enzima e tempo de reação em relação aos dipeptídeos. Não foi possível estabelecer a especificidade secundária da termolisina para o resíduo P\'2 pois os rendimentos dos tripeptídeos sintetizados não apresentaram diferença significativa. Foi também realizado um estudo metodológico para determinar as condições ótimas de síntese de Boc-Asn-Ile-OBzl, que consistiu em analisar a influência do pH, concentração de enzima, concentraçao e volume da solução de acetato de sódio, proporção entre os componentes carboxílico e amínico, temperatura e adição de solvente orgânico ao meio de reação. / With de objective of studying the potential for the use of thermolysin as a catalyst in reactions of incorporation of N-acyl-asparagine into esters of aminoacids and peptides, the following di- and tripeptides were synthesized: Boc-Asn-Ile-OBzl, Z-Asn-Ile-OBzl, Moz-Asn-Ile-OBzl, Boc-Asn-Leu-OBzl, Z-Asn-Leu-OBzI, Moz-Asn-Leu-OBzl, Z-Asn-Leu-OEt, Boc-Asn-Phe-OBzl,Z-Asn-Phe-OBzl, Moz-Asn-Phe-OBzl, Z-Z-Asn-Phe-OEt, Z-Asn-Val-OEt, Moz-Asn-Val-OBzl, Moz-Asn-Ile-Gly-OBzl, Moz-Asn-Ile-Ala-OBzl, Moz-Asn-Ile-Leu-OBzl e Moz-Asn-Ile-Phe-OBzl. All of these peptides were obtained in pure form in good yield and analyzed and characterized by thin layer chromatography, melting point, elemental analysis, aminoacid analysis and proton magnetic resonance. Among the protecting groups of asparagine, benzyloxycarbonyl and p-methoxybenzyloxycarbonyl gave excellent yields of the dipeptides. Relative to the dipeptides, the synthesis of the tripeptides was found to require lower enzyme concentrations and temperatures. Since the yields of the tripeptides failed to exhibit significant differences, it was not possible to establish the existence of a secondary specificity of thermolysin for the residue P\' 2 . A methodological study was also performed to determine the optimum conditions for synthesis of Boc-Asn-Ile-OBzl. This study consisted of an analysis of the influence of pH, enzyme concentration, concentration and volume of the solution of sodium acetate, relative proportions of the carboxyl and amino components, temperature, and addition of organic solvent to the reaction medium.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-13T18:45:19Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2125079 bytes, checksum: 2f29b3e644ffe90cb9eac41d4f5568f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-13T18:45:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2125079 bytes, checksum: 2f29b3e644ffe90cb9eac41d4f5568f1 (MD5) Previous issue date: 2004-05-03 / O objetivo deste trabalho foi investigar o efeito de fatores determinados pela granelização do leite cru refrigerado na estabilidade do leite. Foram enfati- zados os efeitos da temperatura de refrigeração e do tempo de estocagem na composição da microbiota contaminante do leite cru, na atividade proteolítica do leite, na atividade enzimática residual após tratamento UHT, bem como seu possível efeito na estabilidade do leite UHT. Amostras de leite cru coletadas em tanques de refrigeração, na fonte de produção e no silo de uma indústria processadora de leite UHT, foram analisadas quanto as suas características microbiológicas. Bactérias psicrotróficas proteolíticas Gram-negativas e Gram- positivas foram isoladas do leite cru refrigerado, sendo o gênero Pseudomonas o mais freqüentemente isolado, especialmente a espécie P. fluorescens. Bactérias Gram-positivas e Gram-negativas fermentadoras de glicose apre- sentaram predominantemente atividade proteolítica a 6,5, 21 e 35oC e bactérias Gram-negativas não-fermentadoras de glicose apresentaram um maior percentual de isolados com atividades associadas de proteases, lipases e lecitinases a 6,5 e 21oC, ressaltando seu maior potencial deteriorador. A presença de atividade de enzimas proteolíticas termorresistentes foi observada em sobrenadantes de culturas de bactérias psicrotróficas proteolíticas. A capacidade de adesão a superfícies de aço inoxidável foi constatada em bactérias psicrotróficas proteolíticas Gram-positivas e Gram-negativas até uma densidade de 10 5 células por cm 2 , quando inoculadas em leite desnatado esterilizado a 7oC, por 48 horas. Observou-se o crescimento de P. fluorescens inoculado em leite desnatado a 2, 4, 7 e 10°C, constatando-se o aumento de sua população, do grau de proteólise e da velocidade específica máxima de crescimento com o aumento da temperatura de estocagem. O tempo, em dias, para a perda de estabilidade térmica dessas amostras foi maior a 2 e a 4oC, em relação a 7 e 10oC. Por meio da eletroforese em gel de poliacrilamida obser- vou-se que a temperatura e o tempo de estocagem influenciaram na hidrólise das frações de caseína e da albumina. As amostras de leite cru integral, coletadas assepticamente e usadas como controle, não diferiram quanto aos perfis eletroforéticos após seis dias de estocagem, nas temperaturas avaliadas, demonstrando a importância de investimentos para a implementação de práticas higiênicas de obtenção e conservação da matéria-prima. O tratamento UHT reduziu, em média, 93,2% da atividade proteolítica presente no leite cru integral usado como matéria-prima para o processamento do leite UHT, indicando a presença de atividade proteolítica residual de origem bacteriana e, ou, endógena. Observou-se o aumento da massa de sedimentos, do grau de proteólise e da atividade proteolítica durante a estocagem do leite UHT integral a 37°C, por 120 dias. Em nenhuma das amostras de leite UHT foram consta- tadas contaminações por bactérias mesofílicas e por bactérias mesofílicas esporuladas, além de indícios de gelificação. Todas as amostras permane- ceram termicamente estáveis durante o período de validade do produto. / This work aimed at investigating the effect of variables determined for refrigerated bulk raw milk on milk stability. Emphasis was given to the effects of refrigeration temperature and storage time on raw milk s contaminant microbiota composition, proteolytic activity, residual enzymatic activity after UHT treatment as well as their possible effect on UHT milk stability. Samples of bulk raw milk, collected from cooling tanks at the production sites and from a silo of a UHT milk processing industry were analyzed for microbiological characteristics. Gram-negative and Gram-positive proteolytic psychrotrophs were isolated from the refrigerated raw milk, with the genus Pseudomonas being the most frequently isolated strain, especially the species P. fluorescens. Gram-positive and Gram-negative glucose-fermenting bacteria presented a predominantly proteolytic activity at 6.5, 21, and 35oC and Gram-negative non-glucose fermenting bacteria presented a higher percentage of isolates with activities associated to proteases, lipases, and lecithinase at 6.5 and 21oC, indicating their higher deteriorating potential. The presence of heat-resistant proteolytic activity was observed in the supernatants of psychrotrophic bacterial cultures. The capacity to adhere to stainless steel surfaces was confirmed in Gram- positive and Gram-negative proteolytic psychrotrophics up to a density of 10 5 cells per cm 2 inoculated in sterilized skim milk at 7oC after 48 h of incubation. The maximum specific growth rate and the proteolytic activity of P. fluorescens inoculated in skim milk increased with increasing storage temperatures (2, 4, 7 and 10°C). Heat-stability loss (in days) for these samples was higher at 2 and at 4oC, in relation to 7 and 10oC. Temperature and storage time influenced the hydrolysis of casein and albumim. The raw whole milk samples, aseptically collected and used as control, showed no changes in the eletrophoretic profiles after six storage days under the temperatures evaluated, showing the importance of investing on the implementation of hygienic practices of raw material acquisition and conservation. The UHT treatment reduced, on average, 93.2% of the proteolytic activity in the raw whole milk used as raw material for UHT milk processing, indicating the presence of residual proteolytic activity of bacterial and, or endogenous origin. Increased sediment mass, proteolysis degree, and proteolytic activity were observed during storage of UHT whole milk at 37°C, for 120 days. None of the UHT milk samples were found to be contaminated with sporulating mesophilic bacteria or showed signs of gelation. All the samples remained heat stable during shelf-life. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-07-12T13:14:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação versão biblioteca final pos publicada Hugo Genier.pdf: 671423 bytes, checksum: 3d49ee23a16cc7bfb324104dc12607fd (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-07-12T13:14:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação versão biblioteca final pos publicada Hugo Genier.pdf: 671423 bytes, checksum: 3d49ee23a16cc7bfb324104dc12607fd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T13:14:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertação versão biblioteca final pos publicada Hugo Genier.pdf: 671423 bytes, checksum: 3d49ee23a16cc7bfb324104dc12607fd (MD5) / Dentre as possíveis aplicações biotecnológicas de fungos e suas proteases, o controle biológico tem mostrado ser eficiente. O objetivo deste estudo foi avaliar a atividade nematicida do fungo Pleurotus ostreatus e suas proteases sobre larvas de Panagrellus sp. A atividade proteolítica de Pleurotus ostreatus (PLO 06) foi medida e caracterizada com pHs e temperaturas diferentes e na presença de um inibidor (PMSF). O tempo de produção máxima da enzima foi determinado coletando-se amostras a cada 24h durante 7 dias. O perfil das proteases foi observado através de zimograma. A atividade predatória do fungo Pleurotus ostreatus (PLO 06) foi avaliada sobre larvas de Panagrellus sp. (ensaio A), bem como a atividade nematicida de proteases de PLO 06 sobre as mesmas larvas (ensaio B). A atividade das proteases foi máxima em pH 9 e temperatura de 60 °C. Na presença de inibidor, não houve nenhuma atividade proteolítica. A maior atividade enzimática de P. ostreatus foi obtida com seis dias de incubação (71,6 U/mL). Os valores de redução das larvas (Ensaio A) foram: dia 1 (65,6%); dia 2 (77,4%); dia 3 (95,2%). A redução das larvas (Ensaio B) foi de 42%. P. ostreatus (PLO 06) e suas proteases mostraram eficácia contra larvas de Panagrellus sp., demonstrando ter potencial para aplicação no controle biológico integrado. / Among the possible biotechnological applications of fungi and their proteases biological control has proved to be efficient. The objective of this study was to evaluate the nematicidal activity of the fungus Pleurotus ostreatus and its proteases on Panagrellus sp. larvae. Proteolytic activity of P. ostreatus (PLO 06) was measured and characterized at different pHs, temperatures and in the presence of a inhibitor (PMSF). The time of maximum production of the enzyme was determined collecting samples every 24 hours for 7 days. A zymogram showed the profile of several proteases. Predatory activity of the fungus P. ostreatus (PLO 06) was evaluated on Panagrellus sp. larvae (assay A) as well as the nematicidal activity of PLO 06 proteases on the same larvae (assay B). At pH 9 and 60°C, the activity of the proteases reached the maximum. In the presence of inhibitor, there was no proteolytic activity. A sample collected on the sixth day of incubation showed the highest enzyme activity (71, 6 U/mL). The values of the reduction of the larvae (Assay A) were: day 1 (65.6%); day 2 (77.4%); day 3 (95.2%). The reduction of the larvae (Assay B) was 42%. P. ostreatus (PLO 06) and its proteases were very effective against Panagrellus sp. larvae, demonstrating great potential for use in integrated biological control.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-21Bitstream added on 2014-06-13T20:54:00Z : No. of bitstreams: 1 giusti_j_me_jabo.pdf: 404389 bytes, checksum: 4ca4ff97dca68401b3e43806b72f5f85 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Todas as características de um organismo vivo são controladas pela expressão de genes específicos, e na qualidade da carne não é diferente. O presente estudo teve como objetivo correlacionar a expressão dos genes μ-Calpaína (CALP 1), m-Calpaína (CALP 2), Calpastatina (CAST), Tireoglobulina (TG), Diacilglicerol aciltransferase 1 (DGAT1) e a Leptina (LEP) com a qualidade da carne do Longissimus dorsi em dois grupos genéticos: Nelore (Bos indicus) e Canchim (5/8 de Bos taurus x 3/8 Bos indicus) em dois períodos (carne não maturada e com sete dias de maturação), e utilizá-la como marcador genético. Foram analisados 30 touros jovens, 15 Nelore e 15 Canchim, todos mantidos nas instalações do confinamento experimental da FMVZ-UNESP Botucatu, recebendo a mesma dieta e mesmo manejo. Alcançando peso de 370 kg e espessura de gordura de cobertura de 4 mm, foram abatidos e amostras do músculo Longissimus dorsi foram coletadas para análises de: lipídeos totais (LT), força de cisalhamento (FC), índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e análise da expressão gênica por RT-qPCR. Entre as características de qualidade da carne, LT e MFI0 apresentaram diferença entre as raças (P<0,01), sendo MFI0 superior no Canchim e LT no Nelore. Quanto à expressão gênica, as CALPs não mostraram expressão diferencial entre os grupos (P>0,05), assim como DGAT1, TG e LEP. CAST foi mais expresso na raça Nelore (P<0,05). Quanto às correlações, foi observada apenas uma positiva entre DGAT1 e MFI0 (r=0,79, P<0,01) no Canchim. Diante dos resultados, sugere-se que a maior expressão de CAST no Nelore propiciou aos animais uma carne mais dura, quando comparados ao Canchim, e que a expressão gênica não pode ser usada como um marcador genético / All the features of a living organism are controlled by the expression of specific genes, and the quality of the meat is no different. The present study was performed to correlate gene expression μ-calpain (CALP 1), m-calpain (CALP 2), calpastatin (CAST), thyroglobulin (TG), Diacylglycerol acyltransferase 1 (DGTA1) and leptin (LEP) with the meat quality of Longissimus dorsi muscle in two genetic groups: Nellore (Bos indicus) and Canchim (5/8 Bos taurus x 3/8 Bos indicus) in two periods, and use it as a genetic marker. We analyzed 30 young bulls, 15 and 15 Canchim Nellore. The animals were kept on the installation of the experimental confinement FMVZ-UNESP-Botucatu, receiving the same diet and management. When reached a weight of approximately 370 kg and a subcutaneous fat thickness of 4 mm, they were slaughtered and samples of the Longissimus dorsi muscle were collected for analysis of the: total lipids (TL), shear force (SF), myofibrillar fragmentation index (MFI) and analysis of gene expression by RT-qPCR. Among the characteristics of meat quality, LT and MFI0 showed differences between breeds (P<0,01), higher MFI0 in Canchim and LT higher in Nellore. Regarding gene expression, the CALPs showed no differential expression between groups (P>0.05), as well as DGAT1, TG, and LEP. CAST was more expressed in Nellore (P<0.05). Regarding the correlation was only observed a positive relationship between DGAT1 and MFI0 (r = 0.79, P <0.01) in Canchim. Considering the results, it is suggested that the increased expression of CAST in Nellore animals led to a tougher meat compared to Canchim, and that gene expression can not be used as a genetic marker

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:35:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6648.pdf: 4219788 bytes, checksum: 80aac49ad1c6f625b5a97327943740ca (MD5) Previous issue date: 2015-03-26 / Universidade Federal de Sao Carlos / A primeira etapa deste trabalho de pesquisa envolveu uma triagem de extratos de plantas do cerrado paulista através de ensaios frente à arginase (ARG) de Leishmania amazonensis. Os resultados de inibição enzimática da ARG apresentados pelos extratos, levaram ao fracionamento biodirecionado dos extratos de acetato de etila (folhas e galhos) de Byrsonima coccolobifolia Kunth. (Malpighiaceae). Alguns compostos bioativos foram isolados (flavonóides, ácido galoilquínicos, uma lignana, uma fenatrenona e uma ortoquinona) o que indicou que estes compostos seriam os responsáveis pela diminuição da atividade enzimática da ARG observada nos extratos de B. coccolobifolia. Os flavonoides e os ácidos galoilquínicos apresentaram modo de inibição do tipo não-competitivo da ARG, com atividade inibitórias significativas (IC50 = 0,13 à 4,8 &#956;M) e com forte afinidade (valores de Ki variando entre 0,10 à 3,80 &#956;M). Os estudos de relação entrutura atividade (SAR) revelaram que o grupo catecol dos flavonóides, tanto como a unidade galoila das estruturas dos ácidos galoilquínicos, forneceram importantes características em relação as interações ARG inibidor. Na segunda parte deste trabalho, experimentos subsequentes foram realizados para investigar os produtos naturais frente a proteases, as quais possuem funções importantes na patogenicidade de virus e parasitas, tais como: as serino proteases NS2B-NS3 dos vírus da dengue serotipos 2 e 3 (dengue), a rodesaína de Trypanosoma brucei rhodesiense (tripanossomíase africana), a cruzaina de Trypanosoma cruzi (doença de chagas), a catepsina L de Leishmania mexicana (leishmaniose) e a falcipaina-2 de Plasmodium falciparum (malária). Através destes estudos foram descobertos alguns inibidores das proteases NS2B- NS3 dos vírus da dengue (tipo 2 e 3) e da catepsina L (r-CPB2.8) de L. mexicana. Os flavonóides agatisflavona, miricetina, e quercetina (Ki = 11,1; 4,7; e 20,7 &#956;M; respectivamente) mostraram inibição do tipo não-competitiva frente à NS2B-NS3. Também foram realizados, um experimento de termoforese em microescala (MST) (ensaio livre de substrato) e um estudo in silico, de forma a obter maiores informações sobre as interações biomoleculares envolvidas. Os metabólitos secundários, agatisflavona e ácido 3-oxo-urs-12-en- 28-óico, foram determinados serem inibidores do tipo não-competitivo parcial da catepsina L do tipo r-CPB2.8, e a tetrahidrorobustaflavona como um inibidor incompetitivo desta catepsina L (r-CPB2.8), com valores de Ki na faixa de micromolar (Ki = 0,14&#8722;1,26 &#956;M). / The early phase of this work involved a screening of plant extracts of São Paulo cerrado using assays with arginase (ARG) from Leishmania amazonensis. The results of enzymatic inhibition of ARG by the extracts led to the bioactivity-guided fractionation of the ethyl acetate extracts (leaves and stems) of Byrsonima coccolobifolia Kunth. (Malpighiaceae). Thereafter, several bioactive compounds were isolated (flavonoids, galloylquinic acids, a lignan, a phenathrenone and an orthoquinone) indicating that these compounds may are the responsible for the decrease in ARG activity observed in B. coccolobifolia extracts. The flavonoids and galloylquinic acids showed to be noncompetitive inhibitors of ARG with significant inhibitory activities (IC50 = 0.13 to 4.8 &#956;M) and strong affinity (Ki values ranging from 0.10 to 3.8 &#956;M). Additionally, structure activity relationship study (SAR) revealed that catechol group in flavonoids, likewise as galloyl unit in galloylquinic acids structures yielded important features for ARG inhibitor interactions. In the second part of this work, subsequent experiments were performed to investigate the natural products against proteases. These enzymes play pivotal roles in the pathogenicity of virus and parasites, such as: serine proteases NS2B-NS3 from dengue virus serotype 2 and 3 (dengue fever), rhodesain from Trypanosoma brucei rhodesiense (African trypanosomiasis), cruzain from Trypanosoma cruzi (chagas disease), cathepsin L from Leishmania mexicana (leishmaniasis), and falcipain-2 from Plasmodium falciparum (malaria). Through these studies were discovered inhibitors of NS2B-NS3 proteases of dengue virus and inhibitors of the L. mexicana cathepsin L-like r- CPB2.8.

Enzimas são biocatalisadores específicos que são utilizadas em vários campos de atuação, desde a indústria de alimentos, até na formulação de detergentes. As proteases são biocatalisadores de grande interesse comercial na indústria, movimentando bilhões de dólares com produção de toneladas de detergentes para diferentes aplicações. A demana de proteases no mercado brasileiro promove pesquisas como também o empreendorismo nesse segmento embora mais investimentos por parte das agências do governo devem ser necessárias. A potencialidade da matéria prima renovável e o aumento do desenvolviemnto de tecnologias para enzimas, como o conhecimento sobre a conformação protéica e estabilidade com atividades catalítica são as bases que podem promover a exportação de enzimas. Ligações de hidrogênio, forças iônicas e de van der Walls, como também as interações hodrofóbicas precisam ser matindas entre os amimoácidos para gerenciar a conformação espacial das enzimas, evitando desnaturação protéica. No processo de formulação, é necessário investigar a interrrelação de parâmetros físicos e aditivos químicos cujas variáveis são importantes para manter a estabilidade da conformação espacial, adicionando elementos como conservantes, sais, polímeros, surfactantes, solventes, detergentes e outros elementos para manter a estrutura da enzima. Nesse trabalho foram analizadas as composições de três bioprodutos dispostos no mercado brasileiro para lavagem de roupa. A presença de agentes ativos entre eles: enzimas e tensioativos e, a interação entre esses aditivos durante o armazenamento e as condições operacionais promovem as respectivas diferenças e características que impulsionam a competitividade desses produtos. / Enzymes are specific biocatalysts that work in wide field of applications as food industry as detergent formulation. The proteases represents an important commercial bioproduct used in industry, managing billion of dollars year by year, producing tons of detergents for different applications. Enzymatic reactions are processed under mild temperature and pressure with great commercial interest, being these catalysts biodegradable. The proteases demand in the brazilian market promoves the researches, as the entrepreneurship in this area althought more investments from government agencies must be necessary. The potenciality in renewable raw material and the increase of development of enzyme technologies are the bases that can promove the enzymes exportation. Hydrogen and disulfide bonds, van der Waals and ionic powers, as well as hydrophobic interactions need to be keeped among these amino acids to manage the spacial conformation of the enzymes, avoiding the inactivation or the protein desnaturation. The formulation process need of physical and chemical managements to promove the stability of the protein chains to try to protect the catalytic site and the spacial structure, adding elements like preservatives, salts, polymers, surfactantes, solvents, detergents and others elements to manage the structure of the enzyme in this process of formulation is necessary. In this work was analyzed the chemical composition of three bioprocts sold in the brazilian market used for domestic laundry, the presence of the main active agents among them like: enzymes, tensioactives and others, and the interaction these additives during the formulation process that could promove the respective differences and characteristics that make these products competitive.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As refinarias de petróleo, assim como outros processos industriais em grande escala, são fontes potenciais de poluição ambiental. Os acidentes ocorridos com derramamento de petróleo e seus derivados no Brasil, no período de 1975 a 2012, somam milhões de litros de poluentes que promoveram a contaminação de solos, rios e mar. Os processos fisíco-químicos tais como, a centrifugação, ultrafiltração e flotação por ar dissolvido (FAD), podem ser eficazes quando usados para separar óleos emulsionados. Nesse sentido, o processo de FAD continua sendo amplamente utilizado nas indústrias, tanto para águas de abastecimento como para águas residuárias. A FAD pode ser considerada como uma tecnologia limpa, uma vez que utiliza pequenas quantidades de coagulantes e ar para promover a separação. A utilização de coletores/coagulantes é essencial para melhorar a eficiência do processo, tendo em vista suas características específicas que facilitam a adesão das partículas e, consequentemente, a separação dos poluentes. Por outro lado, esses coletores químicos são tóxicos, fator que representa um agravante no sentido da geração de outros poluentes ambientais. Assim, os surfactantes microbianos ou biossurfactantes, biomoléculas anfipáticas produzidas por bactérias e leveduras, em detrimento dos coagulantes sintéticos, apresentam-se como uma tecnologia sustentável e promissora no aumento de eficiência da flotação. Essas biomoéculas, além de serem muito eficientes, são biodegradáveis e atóxicas, motivando as pesquisas no sentido de produzir e utilizar cada vez mais esses agentes tensoativos. Dessa forma, o presente trabalho foi desenvolvido na busca de uma estratégia para comparar as eficiências de separação água/derivado de petróleo por FAD, em escala piloto, com e sem a adição de um biossurfactante. De acordo com os resultados obtidos, o biossurfactante produzido por Candida sphaerica cultivada em residuos industriais foi considerado adequado como coletor do processo de separação. A utilização da biomolécula elevou a eficiência do processo de FAD de 80,0% para 98,0%, proporcionando a determinação das melhores condições operacionais. Dessa forma, concluiu-se que o uso de biossurfactantes como auxiliares na flotação constitui uma alternativa promissora na mitigação da poluição provocada pelo derramamento de petróleo e derivados em ambientes marinhos. / Oil refineries, as well as other large-scale industrial processes, are potential sources of environmental pollution. Accidents involving spills of oil and oil products in Brazil, in the period 1975-2012, add infective million liters of soil, rivers and sea. In this sense, the process of dissolved air flotation (DAF) is still widely used in industry, both for water supply and for wastewater. The physico-chemical processes such as centrifugation, ultrafiltration and dissolved air flotation (DAF), can be effective when used to separate emulsified oils. The effluent from the oily water type cause many environmental problems, particularly in thermal power plants (TPPs). Thus the aim of the study was to propose the separation water/oil by FAD in pilot scale and to compare the efficiency of the pilot prototype of FAD with and without addition of biosurfactant separation of oily waste waters. According the results, the biosurfactant produced by Candida sphaerica was selected, this being cultivated in using low cost industrial waste. Use of this bioproduct increased the efficiency of the flotation 80.0% to 98.0 %, to provide better determination of the operating conditions. Thus, it is suggested that the use of biosurfactants as auxiliary flotation is a promising alternative for the mitigation of pollution caused by the accumulation of synthetic surfactants in the environment.