Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-05-16T15:33:54Z No. of bitstreams: 1 ROBERTA CHAIENE ALMEIDA BARBOSA - DISSERTAÇÃO PPGSA PROFISSIONAL 2013..pdf: 3526390 bytes, checksum: a21451c4bc6f201df292553f64e31284 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T15:33:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ROBERTA CHAIENE ALMEIDA BARBOSA - DISSERTAÇÃO PPGSA PROFISSIONAL 2013..pdf: 3526390 bytes, checksum: a21451c4bc6f201df292553f64e31284 (MD5) Previous issue date: 2013-11-21 / A citricultura é uma atividade importante para a região Nordeste do Brasil devido à geração de emprego e renda, porém, nessa região, a produtividade das árvores cítricas é reduzida em consequência da irregularidade das chuvas e ocorrência de estiagens e secas, havendo, nessas condições, a necessidade de irrigação. Como em vários locais as águas são salinas, com concentrações variadas de sais, são relevantes as pesquisas visando à sua utilização onde se fazem escassos os recursos hídricos de melhor qualidade. Assim, objetivou-se estudar o crescimento e a fisiologia de genótipos de citros, recomendados como porta-enxertos, sob diferentes níveis de salinidade da água de irrigação, visando à identificação de genótipos tolerantes e sensíveis ao estresse salino. O experimento foi conduzido em ambiente protegido de adversidades climáticas, no Campus da UFCG, em Pombal- PB, utilizando-se do delineamento experimental em blocos casualizados, com três repetições, composto por esquema fatorial, 8 x 5, sendo 8 genótipos de citros [limoeiro ‘Cravo Santa Cruz’ (LCRSTC), tangerineira ‘Sunki Comum’ (TSKC) x citrumelo ‘Swingle’ (CTSW) - 028, TSKC x CTSW - 033, TSKC x CTSW - 041, limoeiro ‘Volkameriano’ (LVK) x limoeiro ‘Cravo’ (LCR) - 038, tangerineira ‘Sunki da Flórida’ (TSKFL), TSKC e limoeiro ‘Rugoso da Flórida’ (LRF)] e 5 níveis de salinidade da água de irrigação (irrigação com águas de condutividade elétrica de 0,8; 1,6; 2,4; 3,2 e 4,0 dS m-1), até 120 dias após semeadura. Foram avaliadas variáveis de crescimento e fisiológicas, sendo os dados submetidos à análise de variância, nos casos de significância, foi realizada análise de regressão para o fator salinidade da água de irrigação e o teste de médias (Tukey) entre salinidades em cada época de avaliação nas trocas gasosas. Verificou-se que a concentração de sais na água de drenagem foi o dobro da concentração da água salina aplicada. As taxas de crescimento relativo são mais afetadas pela salinidade do que as variáveis em si (altura de planta, diâmetro do colo e número de folhas). A salinidade reduziu o crescimento da maioria dos genótipos de citros, podendo-se utilizar água de até 2,4 dS m-1 para irrigá-los e garantir um crescimento satisfatório; o maior crescimento foi observado no genótipo TSKFL; com relação às trocas gasosas, a variável mais afetada pela salinidade foi a condutância estomática; quando se produz porta-enxertos em tubetes de 115 mL, o período ideal para avaliação de trocas gasosas é aos 75 dias após semeadura. A salinidade não exerceu efeito significativo sobre os parâmetros da fluorescência da clorofila a em nenhum dos períodos avaliados. Relacionando-se às variáveis de crescimento o genótipo menos sensível à salinidade foi o híbrido TSKC x CTSW - 041 e o mais sensível foi o LRF. / The citrus industry is an important activity for the Northeast region of Brazil due to the generation of employment and income , however, in this region , the productivity of citrus trees is reduced as a result of erratic rainfall and occurrence of droughts and dry , and there , under these conditions the need for irrigation . As in many places the water is saline, with varying concentrations of salts, are relevant studies aiming at the use where water resources are scarce best quality. Thus, the objective was to study the growth and physiology of citrus genotypes, as recommended rootstocks under different levels of salinity of irrigation water, in order to identify tolerant and susceptible genotypes to salt stress. The experiment was conducted in greenhouse climate adversities , Campus UFCG in Pombal -PB , using the randomized complete block design with three replications , consisting of factorial , 8 x 5 , 8 genotypes of citrus [Rangpur lime Santa Cruz ' ( LCRSTC ) , tangerine' Sunki Common ' ( TSKC ) x Swingle Swingle' ( CTSW ) - 028 x TSKC CTSW - 033 x TSKC CTSW - 041 , 'Volkamer' lemon ( LVK ) x lemon Rangpur ( LCR ) - 038 , tangerine ' Sunki Florida ' ( TSKFL ) , and TSKC 'Rugoso Florida ' ( LRF ) ] and 5 salinity levels of irrigation water (irrigation water with electrical conductivity of 0 , 8 , 1.6, 2.4 , 3.2 and 4.0 dS m - 1 ) , up to 120 days after sowing. Growth and physiological variables were assessed, data were submitted to analysis of variance in cases of significance, and regression analysis was conducted for the factor salinity of irrigation water and the means (Tukey) between salinities at each assessment time in gas exchange. It was found that the concentration of salts in the water drainage was twice the concentration of salt water applied. The relative growth rates are more affected by salinity than the variable itself (plant height, stem diameter and number of leaves). The salinity reduced the growth of most citrus genotypes, water may be used up to 2.4 dS m-1 to irrigate them and a satisfactory growth, the highest growth was observed in TSKFL genotype, with respect to gas exchange, the variable most affected by salinity is stomatal conductance, when producing rootstocks in tubes of 115ml, ideal for evaluation of gas exchange period is 75 days after sowing. Salinity did not have significant effect on the parameters of chlorophyll a fluorescence in both seasons. Relating to the growth variables genotype less sensitive to salinity was the hybrid TSKC x CTSW - 041 and the most sensitive was the LRF.

O HHV-8 (herpesvírus 8 humano) é o agente etiológico do sarcoma de Kaposi (SK). Diferentemente dos outros herpesvírus, o HHV-8 é distribuído de modo não ubíquo ao redor do mundo. São sete os principais genótipos de HHV-8, de acordo com o padrão de variabilidade da ORF K1: A, B, C, D, E, F e Z. Estudos da variabilidade genética do HHV-8 poderão trazer melhores interpretações sobre o potencial patogênico dos genótipos de HHV-8 e das variações genotípicas funcionais. Dados sobre a variabilidade genética do HHV-8 no Brasil, em que o SK é associado ao HIV, permanecem escassos. Pelo nosso conhecimento, esse é o primeiro estudo que compara a variabilidade genética de HHV-8 em indivíduos infectados por HIV com SK e sem SK no Brasil. Objetivo. O estudo visou analisar a variabilidade genética do HHV-8 entre indivíduos infectados por HIV com SK e sem histórico de SK. Métodos. Sequências de DNA de HHV-8 foram investigadas em amostras criopreservadas de células mononucleares do sangue periférico a partir de 37 indivíduos infectados por HIV com SK (grupo 1); e de amostras de saliva de indivíduos sem SK (grupo 2), as quais foram selecionadas por meio da detecção positiva de DNA/ORF73/HHV-8 a partir de um total de 751 indivíduos. Dados demográficos e clínicos do estadio e evolução do SK, assim como parâmetros laboratoriais foram caracterizados. As análises moleculares e reconstruções filogenéticas foram baseadas nas ORFs K1 e K12 do HHV-8. Resultados. Foram obtidas sequências de DNA dos loci K1 e/ou K12 de 75 indivíduos, 34 indivíduos do grupo 1 e 41 do grupo 2. O sistema de primers empregado foi capaz de detectar os genótipos A, B, C, F e amplo perfil de subgenótipos de K1/HHV-8. Os dados não mostraram associação de genótipos de HHV-8 com a presença de SK ou estadio de SK. Todavia, o subgenótipo B1 predominou naqueles em que não houve registro de piora de SK (p=0,04). Os subgenótipos B1 e C3 foram igualmente predominantes em ambos os grupos. As frequências do genótipos A foram de 24% e 12,2% e dos genótipos B e C foram de 34,1 e 35,3%, nos grupos 1 e 2, respectivamente. O genótipo F foi descrito pela primeira no Brasil, um caso de cada grupo. Um amplo perfil de subgenótipos de C no grupo 2 sem SK foi encontrado (C1, C2, C3, C5 e C7). Subgenótipos K1 C5 e C7, exclusivos do grupo 2 (7%), foram confirmados como recombinantes. Não houve variabilidade genotípica de HHV-8 em amostras biológicas diferentes do mesmo indivíduo em oito casos estudados. Sítios polimórficos (6/59) em regiões codificadoras de miRNA do locus K12 foram observados, sendo 70% presentes exclusivamente em sequências de HHV-8 do grupo com SK e protótipos de SK. Conclusão. Embora não houvesse associação entre genótipos de HHV-8 e presença ou estadio de SK, o subgenótipo B1 foi significativamente relacionado ao melhor prognóstico de SK. Alguns recombinantes foram observados no locus K1 de HHV-8 em indivíduos do grupo 2 sem SK. A presença de SNPs em regiões codificadoras de miR12-12 e miR12-10 predominou em sequências de HHV-8 de indivíduos com SK, grupo 1, e protótipos de SK epidêmico, endêmico e clássico. A escoha de primers foi importante para garantir a amplificação de todos os genótipos e amplo perfil de subgenotipos de HHV-8. / HHV-8 (Human Herpes Virus 8) is the etiological agent of Kaposi\'s sarcoma (KS). Unlike other herpesviruses, the distribution of HHV-8 is not so ubiquitous around the world. There are seven major HHV-8 genotypes, according to the variability pattern of the ORF K1: A, B, C, D, E, F and Z. Studies on the genetic variability of HHV-8 may help to better understand the pathogenic potential of HHV-8 genotypes and their functional genotypic variations. Data on the genetic variability of HHV-8 in Brazil, where KS is associated with HIV infected people, remain scarce. To our knowledge, this is the first study comparing the genetic variability of HHV-8 among HIV-infected individuals with KS and without KS in Brazil. Objective. The study aimed to analyze the genetic variability of HHV-8 among HIV-infected individuals with and without KS. Casuistry and Methods. HHV-8 DNA sequences were obtained from samples of cryopreserved peripheral blood mononuclear cells from 37 individuals infected with HIV-KS (group 1); and saliva from individuals without KS (group 2) who were selected by means of detection of positive DNA/ORF73/HHV-8 from a total of 751 individuals. Demographic and clinical data (stage and progression of KS), as well as laboratory parameters were characterized. Molecular analysis and phylogenetic reconstructions were based on sequences of the ORFs K1 and/or K12 of HHV-8. Results. K1 and/or K12 DNA sequences of HHV-8 were obtained from 75 subjects, 34 from group 1 and 41 from group 2. The primer system used was able to detect the genotypes A, B, C, F and a wide profile of HHV- 8 K1 subgenotypes. Data showed no association of genotypes with the occurrence of KS or with visceral KS either. However, subgenotype B1 predominated in individuals who did not report any progression of KS (p=0.04). Subgenotypes B1 and C3 were equally prevalent in both groups. Genotype A frequencies were 24 % and 12.2% and genotypes B and C were 34.1 and 35.3 % in groups 1 and 2, respectively. We also described here for the first time the genotype F of HHV-8 in Brazil. A wide profile of subgenotypes C (C1, C2, C3, C5 and C7) in the group without KS was found. HHV-8 K1 DNA sequences of group 2 (7%) belonging to subgenotypes C5 and C7 were confirmed as recombinants. Our findings did not show virus variability in the same patient in samples collected at different times or from different biological material in the eight cases studied here. There was no statistical difference regarding the presence/absence of a given SNP from locus K12 between groups with and without KS. However, there were a total of 6/59 polymorphic sites in coding regions of miRNA, 70% of which present only in the HHV-8 DNA sequence of group with KS and KS prototypes. Conclusion. Although there was no association between HHV-8 genotypes and the presence of KS and KS clinical stage, subgenotype B1 was significantly related to the absence of progression of KS. Some recombinants in K1/HHV-8 locus were observed in the group without KS. The presence of SNPs in coding regions of miR12-12 and miR12- 10 predominated in sequences of HHV- 8 of SK cases (group 1) and of epidemic, endemic and classic KS prototypes. The choice of primers was essential to ensure amplification of all HHV- 8 genotypes and wide profile de subgenotypes.

O presente trabalho teve por objetivos propor um método para testar a contribuição de cada genótipo e ambiente para a interação genótipos X ambientes em ensaios multi-ambientais através de um teste F e implementar uma rotina computacional para a realização da análise de dados segundo o teste proposto. O estudo avalia quatro conjuntos de dados, cada um com diferentes números de genótipos dentro de ambientes com quatro blocos. Para um dos conjuntos, simulou-se as somas de quadrados das linhas (genótipos) e colunas (ambientes) da matriz de interação genótipos X ambientes (GE) gerando 500, 5000 e 10000 experimentos para verificar a distribuição empírica. Os resultados indicaram um ajuste à distribuição qui-quadrado não-central para as linhas e colunas da matriz de interação GE, verificados também pelo teste de Kolmogorov-Smirnov e o gráfico QQplot. Na aplicação do teste F proposto aos quatro conjuntos de dados, identificou-se os genótipos e ambientes que contribuiram mais para a interação genótipos X ambientes. Dessa forma, os melhoristas podem selecionar bons genótipos e ambientes nos seus estudos. / The objective of the present work was to propose a method for testing the con- tribution of each element in a genotypes X environments interaction using multi-environment analyses by means of an F test and implementation of a computational routine to analyze the data according to the test proposed. The study evaluated four data sets, each with a di®erent number of genotypes and environments, in a block design with four repetitions. In one group, the sum of squares within rows (genotypes) and columns (environments) of the genotypes X environments (GE) matrix was simulated, generating 500, 5000 and 10000 experiments to verify the empirical distribution. Results indicate a non-central chi-squared distribution for rows and columns of the GE interaction matrix, which was also verified by the Kolmogorov-Smirnov test and QQplot graph. Application of the F test to the four data sets identified the genotypes and environments that contributed the most to the genotypes X environments interaction. In this way, geneticists can select good genotypes and environments in their studies.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Lippia alba (Mill.) N. E. Br. is a medicinal plant widely distributed and used in Brazil, because of its sedative activity of the essential oil. This study aimed to characterize and evaluate the behavior of accessions of Lippia alba (Mill.) N. E. Br., collected in several states of Brazil, and maintained in the Active Germplasm Bank of the Federal University of Sergipe (UFS), São Cristóvão county. The first chapter presented a general introduction of the work, the theoretical study about the relationship between genetic resources, seasonality and sustainability in Agroecosystems, origin, botanical aspects and use of L. alba, the essential oil and morphological, agronomic and chemical characterization of germplasm. The second chapter consisted of morphological and agronomic characterization of L. alba germplasm grown in field, using a randomized block design with two replications. The evaluated variables were: length of branch, crown diameter, growth habit, length, width and length/width ratio of leaf, color of stems, veins, leaves, sepals and petals, dry weight of leaves, essential oil content and yield. The results showed morphological differences among accessions for the following variables: length of branch, crown diameter, color of stems, leaves and petals, growth habit, length, width and length/width ratio of leaves. Differences were observed for essential oil content and yield, and the accession LA-60 presented best results for essential oil yield. In the third chapter the chemical composition of the L. alba accessions of the Active Germplasm Bank of the UFS. The chemical composition of essential oils distinguished the accessions into six groups and we observed that Group 3 is formed only by the accession LA-13, which presented predominantly limonene and carvone. In the fourth chapter, the seasonal variation in L. alba genotypes were studied, harvesting in four different seasons. The best results were obtained in the first harvest, which was realized at the end of the rainy season (September/2008). The plants showed higher chemical constituents content at the third harvest (March/2009). / A erva-cidreira-brasileira [Lippia alba (Mill.) N. E. Br.], é uma espécie medicinal amplamente distribuída e utilizada no Brasil, em função da atividade sedativa de seu óleo essencial. Este trabalho visou caracterizar e avaliar o comportamento de acessos de erva-cidreira-brasileira [Lippia alba (Mill.) N. E. Br.], de vários Estados do Brasil, mantidos em Banco Ativo de Germoplasma em São Cristóvão. No primeiro capítulo, apresentou-se a introdução geral do trabalho, o referencial teórico sobre recursos genéticos e sazonalidade na sustentabilidade em Agroecossistemas, a origem, os aspectos botânicos e de uso erva-cidreira-brasileira, o óleo essencial e a caracterização de germoplasma (caracterização morfológica, agronômica e química). O segundo capítulo consistiu da caracterização morfológica e agronômica de acessos de ervacidreira-brasileira cultivados em campo, utilizando-se delineamento experimental em blocos ao acaso com duas repetições. Foram avaliadas as variáveis: comprimento de ramo, diâmetro de copa, hábito de crescimento, largura, comprimento e relação comprimento/largura de folha, cor de caule, nervura, folha, sépala e pétala, massa seca de folha, teor e rendimento de óleo essencial. Os resultados mostraram diferenças morfológicas nos acessos para as variáveis: comprimento de ramo, diâmetro de copa, cor de caule, folhas, pétalas, hábito de crescimento, comprimento e largura de folha e relação comprimento/largura de folha. Para as características agronômicas, foram evidenciadas diferenças para teor e rendimento óleo essencial, sendo o acesso LA-60 o que se destacou para a variável rendimento de óleo. No terceiro capítulo estudou-se a composição química dos acessos pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da UFS. A composição química dos óleos essenciais distinguiu os acessos em seis grupos e observou-se que Grupo 3 é formado apenas pelo acesso LA-13, onde predominam os compostos limoneno e carvona. No quarto capítulo, estudou-se a sazonalidade em genótipos de Lippia alba (Mill.) N. E. Br., em quatro épocas diferentes. Para as características agronômicas avaliadas, os melhores resultados foram obtidos no primeiro corte, que foi realizado na época do final das chuvas nesta região (setembro/2008). Com relação aos teores dos constituintes químicos, as plantas apresentaram melhores resultados para o terceiro corte (março/2009).

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-07-11T17:09:18Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Bruno Souza Lemos - Versãodefinitiva.pdf: 782400 bytes, checksum: ad69337eab827e4daebef0eb78a32a58 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-12T12:09:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Bruno Souza Lemos - Versãodefinitiva.pdf: 782400 bytes, checksum: ad69337eab827e4daebef0eb78a32a58 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-12T12:12:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Bruno Souza Lemos - Versãodefinitiva.pdf: 782400 bytes, checksum: ad69337eab827e4daebef0eb78a32a58 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-12T12:12:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Bruno Souza Lemos - Versãodefinitiva.pdf: 782400 bytes, checksum: ad69337eab827e4daebef0eb78a32a58 (MD5) Previous issue date: 2015-05-02 / O incremento da área semeada em safrinha com feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.), no centro-oeste brasileiro, causou um aumento na demanda de sementes de boa qualidade e alto vigor. O teste de tetrazólio é uma das opções disponíveis para avaliar a qualidade e vigor das sementes e, embora exista metodologia padronizada pelas Regras para Análise de Sementes (Brasil, 2009), a metodologia mostra-se ineficiente sendo necessário adequá-la para obtenção de resultados confiáveis. Dessa maneira, foi conduzido trabalho com o objetivo de estudar diferentes concentrações de sal de tetrazólio e tempo de coloração na avaliação do potencial fisiológico de sementes de feijão-caupi. Utilizaram-se sementes das cultivares BRS Guariba (Classe Branco Liso), BRS Novaera (Classe Branco Rugoso) e BRS Pajeú (Classe Mulato Liso), cada uma representada por um lote, produzido na safrinha de 2014. As sementes foram submetidas ao teste de germinação e classificação do vigor de plântulas. O teste de tetrazólio foi conduzido utilizando três concentrações diferentes de sal de tetrazólio (0,500%, 0,075% e 0,050%) com tempo de exposição de 90 minutos, 150 minutos e 960 minutos. Os dados foram submetidos à análise de variância e, quando apresentaram diferença significativa, as médias foram comparadas pelo teste de Tukey à 5% e submetidas à análise de correlação de Pearson, correlacionando o teste em areia e diferentes tempos e concentrações testados no teste de tetrazólio. Os resultados revelaram que a leitura do teste de tetrazólio é possível nos três tempos de embebição para as três concentrações de solução, exceto na concentração de 0,500% de sal de tetrazólio no tempo de 960 minutos. / The increase in area sown in off-season with cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.), In the Brazilian Midwest, caused an increase in good quality seed demand and high force. The tetrazolium test is one of the options available to assess the quality and vigor and, although there is standardized methodology by the Rules for Seed Analysis (Brazil, 2009), the methodology proves to be inefficient and it is necessary to adapt it to obtain results reliable. Thus, work was conducted in order to study different tetrazolium salt concentrations and staining time in evaluating the physiological potential of cowpea seeds. They used seeds of BRS Guariba (Class White Smooth), BRS Novaera (White Class Rough) and BRS Pajeú (Class Mulato Straight), each represented by a lot, produced in 2014. The second-crop seeds were submitted to the test germination and seedling vigor classification. The tetrazolium test has been conducted using three different concentrations of tetrazolium salt (0.500%, 0.075% and 0.050%) with exposure time of 90 minutes, 150 minutes and 960 minutes. The data were submitted to variance analysis and when presented significant difference, the means were compared by Tukey test at 5% and subjected to Pearson correlation analysis, correlating the test in sand and different times and concentrations tested in the test tetrazolium . The results showed that the reading of the tetrazolium test is possible in the three soaking times for the three solution concentrations, except in the concentration of 0.500% tetrazolium salt in time of 960 minutes. Keywords:

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-10-29T14:55:41Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marina Pedroso de Oliveira - 2013.pdf: 1546029 bytes, checksum: 047574069d3a0ee543cf485aa4e61edd (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-10-30T10:52:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marina Pedroso de Oliveira - 2013.pdf: 1546029 bytes, checksum: 047574069d3a0ee543cf485aa4e61edd (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-30T10:52:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marina Pedroso de Oliveira - 2013.pdf: 1546029 bytes, checksum: 047574069d3a0ee543cf485aa4e61edd (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / It is estimated that about 10% of individuals infected with human immunodeficiency virus (HIV) throughout the world have chronic infection with hepatitis B virus (HBV). The HIV-HBV co-infection increases the risk for developing cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Also, co-infected individuals have atypical serological profiles more often than monoinfected patients, many of whom may have occult hepatitis B (presence of HBV-DNA in serum and/or liver in the absence of HBsAg) in addition to mutations in the viral genome that may have implications for the prognosis and therapeutics of hepatitis B. This study aimed to estimate the prevalence of occult HBV infection in HIV-infected treatment-naive patients, in Goiânia, Goiás, to determine the viral load of HBV-DNA positive samples, to identify circulating genotypes/subgenotypes and to investigate the occurrence of mutations in P and S regions of the HBV genome. This is a cross-sectional study conducted in HIV-infected treatment-naive patients attended at a reference hospital for infectious diseases in the Goiania city. After serological screening of the population (n = 505), two groups of patients were selected for this study: (i) 99 anti-HBc positive/HBsAg negative and (ii) 29 HBsAg reactive individuals. HBV-DNA was detected by semi-nested PCR and quantified by real time PCR. The amplicons were genotyped by RFLP and nucleotide sequencing. The identification of mutations in the viral genome was made by deduction of the amino acid sequences from the nucleotides sequences. The search for occult HBV infection performed in 99 anti-HBc positive/HBsAg negative samples (Group 1) showed a prevalence of 16.2% (16/99, 95% CI: 9.8-25.2). Of 29 HBsAg positive patients (Group 2), HBV-DNA was detected in 69% (20/29). As expected, DNA levels in the HBsAg reactive patients were significantly higher than those found in patients with occult infection (mean 2.89 x 108 copies/ml vs 6.59 x 102 copies/ml, p < 0.01). The genotypes (subgenotypes) A (A1 and A2), D (D2 and D3) and F (F2) were identified, being A/A1 the most frequently found. Mutations in the S region of HBV were found in both groups of patients, whereas mutations in the P region were observed only in patients HBsAg positive. These results revealed a high prevalence of occult HBV infection, the predominance of genotype A (A1), and the presence of mutations in the viral genome of HBV-HIV co-infected treatment-naive patients in Goiânia, Goiás. / Estima-se que cerca de 10% dos indivíduos infectados pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) em todo o mundo apresentam infecção crônica pelo vírus da hepatite B (HBV). A coinfecção HIV-HBV aumenta o risco para desenvolvimento de cirrose e hepatocarcinoma. Ainda, indivíduos coinfectados apresentam perfis sorológicos atípicos mais frequentemente do que os monoinfectados, sendo que muitos deles podem apresentar hepatite B oculta (presença do HBV-DNA no soro e/ou fígado na ausência do HBsAg), além de mutações no genoma viral que podem ter implicações no prognóstico da hepatite B e na terapêutica. Este estudo teve como objetivos estimar a prevalência de infecção oculta pelo HBV em indivíduos infectados pelo HIV, virgens de tratamento, em Goiânia-Goiás, determinar a carga viral das amostras HBV-DNA positivas, identificar os genótipos/subgenótipos circulantes e investigar a ocorrência de mutações nas regiões S e P do genoma do HBV. Este é um estudo transversal conduzido em pacientes infectados pelo HIV, virgens de tratamento, atendidos em um hospital de referência para doenças infecciosas na cidade de Goiânia. Após triagem sorológica da população (n=505), dois grupos de pacientes foram selecionados para o presente estudo: (i) 99 anti-HBc positivos/HBsAg negativos e (ii) 29 indivíduos HBsAg reagentes. O HBV-DNA foi detectado por semi-nested PCR e quantificado por PCR em tempo real. Os amplicons foram genotipados por RFLP e sequenciamento de nucleotídeos. A identificação de mutações no genoma viral foi feita pela dedução de aminoácidos a partir de sequências de nucleotídeos. Ao pesquisar a infecção oculta para o HBV nas 99 amostras anti-HBc positivas/HBsAg negativas (Grupo 1), estimou-se uma prevalência de 16,2% (16/99; IC 95%: 9,8-25,2). Dos 29 pacientes HBsAg positivos (Grupo 2), o HBV-DNA foi detectado em 69% (20/29). Como esperado, os níveis de HBV-DNA nos pacientes HBsAg reagentes foram significativamente maiores do que os encontrados nos pacientes com infecção oculta (média: 2,89 x 108 cópias/mL vs 6,59 x 102 cópias/mL; p < 0,01). Os genótipos (subgenótipos) A (A1 e A2), D (D2 e D3) e F (F2) foram identificados, sendo A/A1 os mais frequentes. Mutações na região S do HBV foram encontradas nos dois grupos de pacientes, enquanto que as mutações na região P foram evidenciadas somente nos pacientes HBsAg positivos. Estes resultados revelaram uma prevalência alta de infecção oculta pelo HBV, a predominância do genótipo A (A1), bem como a presença de mutações no genoma viral dos pacientes HBV-HIV coinfectados, virgens de tratamento, em Goiânia-Goiás.

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:31:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cintia Mara Costa de Oliveira.pdf: 1536626 bytes, checksum: a546517f7c00e6b13c3a43eac85bbc3f (MD5) Previous issue date: 2007-06-01 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The hepatitis B virus (HBV) is an agent of universal distribution which produces in humanity both the gaud and chronic infection. According to the World health organization (WHO) approximately 30% of world population, or about 2 billion of the people, are infected by the HBV. Of these, more than 350, million have become chronic patients. The molecular analysis of the genome HBV has allowed the identification of different genotypes as well as the main mutations which are present in its genome. The present study had as objective to make the sequence of S and C of HBV isolated from different samples born in the Amazon State and to analyze the frequency of mutations in these genes related with the disease evolution. Samples of 80 patients positive for the HBV were obdied. From these, 60 were born on Manaus and 20 on the urban zone of Labrea city, AM.. The amplification of the S gene and C gene by PCR showed that from 80 samples that were analyzed, 68 (85%) were DNA-HBV positive. The filogenetic analyze identified 3 genotypic groups A, D and F. The prevalent genotype was the A type 40/51 (78,4%), followed by F genotype, (7%) and D 2/51 (3,9%) as walles two undetermined sequences. The A genotype was the most frequent in the samples obtained of people who were born in Manaus, while the F genotype was prevalent in the samples of people from the interior of the Amazon State. Considering the mutations, a very low frequency of mutations related with the development of the disease both in the S and C gene was observed. / O vírus da hepatite B (VHB) é um patógeno de distribuição universal que produz no homem tanto a infecção aguda quanto a crônica. De acordo com a Organização Mundial da Saúde (OMS), aproximadamente 30% da população do planeta, ou cerca de dois bilhões de pessoas no mundo, estão infectadas pelo VHB. Destas, mais de 350 milhões tornaram-se portadoras crônicas. A análise molecular do genoma VHB têm permitido a identificação de diferentes genótipos bem como das principais mutações presentes em seu genoma. O presente estudo teve como principais objetivos seqüenciar os genes S e C do genoma do VHB isolados de diferentes amostras obtidas de indivíduos naturais do Estado do Amazonas e analisar a freqüência de mutações nesses genes relacionando-as a evolução da doença. Foram analisadas um total de 80 amostras de plasma de indivíduos positivos para o VHB. Destas, 60 foram procedentes de Manaus e 20 da zona urbana do município de Lábrea, AM. A amplificação dos genes S e C por PCR mostrou que das 80 amostras analisadas, 68 (85%) foram DNA-VHB positivas. A análise filogenética identificou os três grupos genotípicos A, D e F. O genótipo A foi predominante em 40/51 (78,4%), seguido dos genótipos F 7/51 (13,7%) e D 2/51 (3,9%) além de duas seqüências não determinadas. O genótipo A foi mais freqüente nas amostras obtidas de indivíduos naturais da cidade de Manaus enquanto que o genótipo F predominou nas amostras de indivíduos procedentes do interior do Estado do Amazonas. Quanto às mutações observou uma baixa freqüência de mutações relacionadas ao desenvolvimento da doença tanto no gene S quanto no C.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-08T12:00:17Z No. of bitstreams: 2 Tese - Polianna Alves Silva Dias - 2017.pdf: 2130972 bytes, checksum: 17a85863b4938d2462080a2033d86cee (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-08T12:00:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Polianna Alves Silva Dias - 2017.pdf: 2130972 bytes, checksum: 17a85863b4938d2462080a2033d86cee (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T12:00:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Polianna Alves Silva Dias - 2017.pdf: 2130972 bytes, checksum: 17a85863b4938d2462080a2033d86cee (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-04-07 / In species rich in protein, like common bean, the nitrogen is considered as the most limiting nutrient in the development of the crop. One way to acquire the N by common bean is through biological nitrogen fixation (BNF). Despite its importance, there are no studies aiming the selection of common bean genotypes under rhizobia inoculation in multiple environments. Thus, the objectives of this studies were: to study the effect of interaction (GxF) of common bean elite lines with nitrogen fertilization and/or rhizobia inoculation; to select lines with high grain yield adaptability and stability and high agronomic performance when inoculated with rhizobia; to assess the variability of the elite lines for the nodulation traits; and to identify lines with superior nodulation traits under BNF cultivation. They were evaluated 19 carioca genotypes and 15 of the black group, in trials conducted separately by grain group. At first, experiments for the evaluation of agronomic traits were conducted at the states of Goiás, Paraná, Mato Grosso and at Distrito Federal, in three sowing seasons (rainy, winter and dry), in 2011 and 2012. Two trials were installed at each environment (location/sowing season/year), one with mineral nitrogen fertilization (80 kg N ha-1) and another with the inoculation of the seeds with Rhizobium tropici and R. freirei strains. The grain yield, sieve yield, 100 grains weight, plant architecture, lodging tolerance and the reaction to anthracnose and angular leaf spot were evaluated. Then, the lines were evaluated during rainy/2013 and winter/2014 seasons, at Santo Antônio de Goiás/GO, under rhizobia inoculation and nitrogen fertilization, in which they were assessed the nodule number, nodule dry and specific weight, nodules activity and shoot dry weight. The relative nodulation index was used on the selection of lines for the nodulation traits. Individual and combined analyses of variance were performed and they were estimated the Spearman correlations and the coincidence index on the selection of the best 30% lines with inoculation and with N fertilization. Grain yield adaptability and stability analyses were performed by the Nunes graphical method. Even though the interaction GxF was significant for some traits in both grain groups, it did not influence on the selection of the best genotypes. The lines of both groups are more productive when fertilized with mineral N, however, the carioca lines lodge less under BNF. The carioca line CNFC 15086 and the cultivars of black group BRS FP403 and BRS Esteio are indicated for cultivation under both N sources. The lines of both grain groups show higher performance for nodulation traits when inoculated. The genotypes BRS Sublime, CNFC 15010 and CNFC 15003 of the carioca group, and BRS Campeiro and CNFP 15177 of the black group are selected for the nodulation traits. / Em espécies ricas em proteína, como o feijoeiro-comum, o nitrogênio é tido como o nutriente mais limitante ao desenvolvimento da cultura. Uma das formas de aquisição do N pelo feijoeiro-comum é via fixação biológica de nitrogênio (FBN). Apesar de sua importância, inexistem estudos para seleção de genótipos de feijoeiro-comum sob inoculação com rizóbio em múltiplos ambientes para cultivo. Os objetivos do trabalho foram: estudar o efeito da interação (GxF) de linhagens elite de feijoeiro-comum com a adubação nitrogenada mineral e/ou inoculação com rizóbio; selecionar linhagens com alta adaptabilidade e estabilidade produtiva e alto desempenho agronômico quando inoculadas com rizóbio; avaliar a variabilidade das linhagens para os caracteres relativos à nodulação; e identificar linhagens com características de nodulação superiores para utilização em cultivo sob FBN. Foram avaliados 19 genótipos do grupo carioca e 15 do grupo preto, em ensaios separados por grupo de grão. Inicialmente foram feitos experimentos para avaliação de caracteres agronômicos, nos Estados de Goiás, Paraná, Mato Grosso e no Distrito Federal, em três épocas de semeadura (águas, inverno e seca), em 2011 e 2012. Foram instalados dois ensaios em cada ambiente (local/época de semeadura/ano), um com adubação nitrogenada mineral (80 kg ha-1 de N) e outro com inoculação das sementes com estirpes de Rhizobium tropici e R. freirei. Foram avaliadas a produtividade de grãos, rendimento de peneira, massa de 100 grãos, arquitetura de plantas, tolerância ao acamamento e a reação à antracnose e mancha-angular. Posteriormente, as linhagens foram avaliadas nas safras das águas/2013 e inverno/2014, em Santo Antônio de Goiás/GO, com inoculação de rizóbio e adubação com N mineral, em que foram avaliados o número de nódulos, a massa de nódulos secos e a específica, atividade de nódulos e massa da parte aérea seca. O índice de nodulação relativa foi utilizado na seleção de linhagens quanto aos caracteres de nodulação. Foram realizadas análises de variância individuais e conjuntas e estimadas as correlações de Spearman e o índice de coincidência da seleção das 30% melhores linhagens com inoculação e com N mineral. Foram feitas análises de adaptabilidade e estabilidade produtiva pelo método gráfico de Nunes. A interação GxF foi significativa para alguns caracteres em ambos os grupos de cores, porém não influenciaram na seleção das melhores linhagens. As linhagens de ambos os grupos são mais produtivas sob adubação com N mineral, porém, as do grupo carioca acamam menos sob FBN. A linhagem carioca CNFC 15086 e as cultivares do grupo preto BRS FP403 e BRS Esteio são indicadas para o cultivo em ambas as fontes de N. As linhagens de ambos os grupos apresentam melhor desempenho para os caracteres de nodulação quando inoculadas. Os genótipos do grupo carioca BRS Sublime, CNFC 15010 e CNFC 15003 e, os do grupo preto, BRS Campeiro e CNFP 15177 são selecionados quanto aos caracteres de nodulação.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-10T12:38:29Z No. of bitstreams: 2 Tese - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2017.pdf: 2590293 bytes, checksum: eacbd356cd7945faefe77da9fdc3d322 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-10T12:40:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2017.pdf: 2590293 bytes, checksum: eacbd356cd7945faefe77da9fdc3d322 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-10T12:40:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2017.pdf: 2590293 bytes, checksum: eacbd356cd7945faefe77da9fdc3d322 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The iron and zinc deficiency reaches millions of people worldwide, generating public health problems. One of the most viable alternatives to minimize this issue is the biofortification and the common bean stands out as a crop with wide potential to be biofortified. The objectives of this work were: i) to verify the importance of genetic (G), environmental (E) and G x E interaction effects for iron content (FeC) and zinc content (ZnC) in common bean grains and to identify the cultivars/lines that associate high potential for FeC, ZnC, protein content (PtC), yield and weight of 100 grains (W100); ii) to verify if exists genetic relation between these traits; iii) to obtain, evaluate and select promising common bean segregating populations for high FeC and ZnC, yield and W100; iv) to estimate parental general (GCA) and specific (SCA) combining ability for FeC and ZnC, aiming the understanding of genetic control and the selection of parental lines; v) to estimate genetic parameters and to select lines for FeC, ZnC, yield and W100; vi) to validate microsatellites molecular markers (SSR), previously identified as linked to QTLs for FeC and ZnC in common bean, in breeding populations, with high mean. On the first study, to verify the importance of G x E interaction, 34 genotypes were evaluated at 19 environments, assessing the FeC, ZnC, PtC, yield and W100. Combined analyses of variance, adaptability and stability analyses by Nunes graphical method were performed, in addition to the estimation of genetic correlations between the traits. There were significant differences between genotypes for all traits. The environment and interaction effects were significant, and the environment represented the most of total variation, 63% (FeC) and 65% (ZnC), followed by G x E interaction effect, 18% (FeC) and 15% (ZnC). The cultivar BRS Sublime, with carioca grains type, combined high FeC, ZnC, PtC, yield and grains with commercial size, in addition to wide adaptability and stability. The genetic correlations between FeC x ZnC, FeC x PtC and ZnC x PtC were significant and positive, indicating, likely, the occurrence of pleiotropy or that some genes that control these traits are linked. It is concluded that, due to the great environmental effect influencing FeC and ZnC the evaluation trials of these traits should be performed in multiple environments. On the second study, 15 segregating populations were obtained and evaluated from crosses on complete diallel design between six parental lines selected for high FeC and ZnC. The populations were assessed at Santo Antônio de Goiás-GO, on winter/2012 (F2), winter/2013 (F3) and rainy/2013 (F4) seasons, and at Brasília-DF, on rainy/2013 (F4) season. The traits evaluated were FeC and ZnC, yield and W100. Significant differences were detected between the populations for all traits. Based on the combine analysis, for FeC additive effects were more important and the line G 2358 stood out by its high GCA (5.63). For ZnC, both additive and non additive effects were important, however no parental line showed significant GCA. The populations selected simultaneously for all four traits, based on combined analysis, were Porto Real x G 2358, BRSMG Majestoso x G 2358, BRS Requinte x BRSMG Majestoso, Porto Real x BRS Requinte and Porto Real x BRSMG Majestoso. The population BRS Requinte x G 2358 is indicated for extraction of lines with high FeC and ZnC. It is concluded that the parental G 2358 has great potential and must be used in new crosses to increase FeC in common bean grains. The population BRS Requinte x G 2358, that presented excellent performance for FeC and ZnC, and the population BRS Requinte x Porto Real, selected simultaneously for all traits, must follow on the breeding program for lines extraction. On the third step of this work, 116 lines of these two populations and five controls were assessed, in a triple lattice experimental design 11x11, at three environments and FeC, ZnC, yield and W100 were evaluated. Analyses of variance and the estimation of genetic parameters were performed. It was also performed the genotyping of the parental lines and lines of these populations with 20 SSR previously identified as linked to FeC and ZnC QTLs and, later, it was performed the single marker mapping analysis. Differences were identified between the lines at all environments for all traits. The estimates of heritability and expected gain from selection indicated the possibility of obtaining genetic gains for each trait individually. On simultaneous selection of lines for the four traits, based on combined analysis, the expected gains from selection of the best 24 lines were 4.7% for FeC, 2.8% for ZnC, 3.9% for yield and 0.9% for W100. Only the marker BM 154 was polymorphic and only on population BRS Requinte x Porto Real. The single marker mapping analysis showed association only between BM 154 and FeC, at one environment, explaining 14.5% of the phenotypic variation. It is concluded that there is possibility on selecting lines that combine desired phenotypes for the four traits of interest and that, likely, the QTLs linked to the tested markers are already fixed and that there is the presence of QTLs x environments interaction. / A deficiência de ferro e de zinco atinge milhões de pessoas em todo o mundo e gera problemas de saúde pública. Uma das alternativas mais viáveis para minimizar este problema é a biofortificação e o feijoeiro-comum se destaca com uma cultura com amplo potencial para ser biofortificada. Os objetivos deste trabalho foram: i) verificar a importância do efeito genético (G), ambiental (E) e da interação G x E para teor de ferro (TFe) e teor de zinco (TZn) nos grãos de feijoeiro-comum e identificar as cultivares/linhagens que associem alto potencial para TFe, TZn, teor de proteína (TPt), produtividade (Prod) e massa de 100 grãos (M100); ii) verificar se existe relação genética entre estes caracteres; iii) obter, avaliar e selecionar populações segregantes de feijoeiro-comum promissoras para alto TFe e TZn, Prod e M100, iv) estimar a capacidade geral (CGC) e específica (CEC) de combinação de genitores para TFe e TZn, entender o controle genético e selecionar genitores; v) estimar parâmetros genéticos e selecionar linhagens para TFe, TZn, Prod e M100; vi) validar marcadores moleculares microssatélites (SSR), previamente identificados como ligados a QTLs para TFe e TZn em feijoeiro-comum, em populações de melhoramento, com alta média. No primeiro estudo, para verificar a importância da interação G x E, avaliou-se o TFe, TZn, TPt, Prod e M100 de 34 genótipos em 19 ambientes. Realizaram-se análises de variância, análises de adaptabilidade e estabilidade pelo método de Nunes, além da estimação de correlações genéticas entre os caracteres. Houve diferenças significativas entre os genótipos para todos os caracteres. Os efeitos de ambientes e de interação foram significativos, sendo que o de ambientes representou a maior parte da variação total, 63% (TFe) e 65% (TZn), seguido pelo efeito de interação G x E, 18% (TFe) e 15% (TZn). A cultivar BRS Sublime, de grãos tipo carioca, reuniu altos TFe, TZn, TPt, Prod e grãos com tamanho comercial, além de ampla adaptabilidade e estabilidade. As correlações genéticas entre TFe x TZn, TFe x TPt e TZn x TPt foram significativas e positivas, o que indica provavelmente a ocorrência de pleiotropia ou que alguns genes que controlam esses caracteres estejam ligados. Conclui-se que devido ao grande efeito ambiental influenciando TFe e TZn os ensaios de avaliação desses caracteres devem ser realizados em vários ambientes. No segundo estudo, foram obtidas e avaliadas 15 populações segregantes a partir de cruzamentos no esquema de dialelo completo entre seis genitores selecionados para altos TFe e TZn. As populações foram avaliadas em Santo Antônio de Goiás-GO, nas safras de inverno/2012 (F2), inverno/2013 (F3) e águas/2013 (F4), e em Brasília-DF, na safra das águas/2013 (F4). Os caracteres avaliados foram TFe e TZn, Prod e M100. Foram detectadas diferenças significativas entre as populações para todos os caracteres. Com base na análise conjunta, para TFe os efeitos aditivos foram mais importantes e a linhagem G 2358 se destacou pela alta CGC (5,63). Para TZn, tanto os efeitos aditivos como os não aditivos foram importantes, entretanto nenhum genitor apresentou CGC significativa. As populações selecionadas simultaneamente para os quatro caracteres, com base na análise conjunta, foram Porto Real x G 2358, BRSMG Majestoso x G 2358, BRS Requinte x BRSMG Majestoso, Porto Real x BRS Requinte e Porto Real x BRSMG Majestoso. A população BRS Requinte x G 2358 é indicada para extração de linhagens com altos TFe e TZn. Conclui-se que o genitor G 2358 possui grande potencial e deve ser utilizado em novos cruzamentos para aumentar o TFe nos grãos de feijoeiro-comum. A população BRS Requinte x G 2358, que apresentou ótimo desempenho para TFe e TZn, e a população BRS Requinte x Porto Real, selecionada simultaneamente para todos os caracteres, devem seguir no programa de melhoramento para extração de linhagens. Na terceira etapa do trabalho, foram avaliadas 116 linhagens destas duas populações e cinco testemunhas, em delineamento experimental látice triplo 11x11, em três ambientes e foram avaliados TFe, TZn, Prod e M100. Foram realizadas análises de variância e estimação de parâmetros genéticos. Também foi realizada a genotipagem dos genitores e das linhagens destas populações com 20 SSR previamente identificados como ligados a QTLs de TFe e TZn e, posteriormente, realizada a análise de mapeamento por marca simples. Foram identificadas diferenças entre as linhagens em todos os ambientes para todos os caracteres. As estimativas de herdabilidade e de ganho esperado com a seleção indicaram a possibilidade de obtenção de ganhos genéticos para cada caráter isoladamente. Na seleção simultânea das linhagens para os quatro caracteres, com base na análise conjunta, os ganhos esperados com a seleção das 24 melhores linhagens foram de 4,7% para TFe, 2,8% para TZn, 3,9% para Prod e 0,9% para M100. Somente o marcador BM 154 foi polimórfico e apenas na população BRS Requinte x Porto Real. A análise de mapeamento por marca simples mostrou associação apenas entre BM 154 e TFe, em um ambiente, que explica 14,5% da variação fenotípica. Conclui-se que há possibilidade selecionar linhagens que reúnam fenótipos desejáveis para os quatro caracteres de interesse e que, provavelmente os QTLs ligados aos marcadores testados já estão fixados e que há presença de interação de QTLs com ambientes.

Estudos genético quantitativos e moleculares são fundamentais para o melhoramento animal e sua realização com a raça Nelore é de grande importância devido a ampla participação dessa no rebanho de corte nacional. A estimação constante dos parâmetros genéticos das características de produção é necessário para a adequada condução do processo de seleção dos animais. A melhoria de características relacionadas à carcaça bovina é essencial para a eficiência e sustentabilidade da atividade e a implementação de métodos de seleção animal baseados em informações moleculares pode revolucionar a produção zootécnica e deve ser profundamente estudado. Sendo assim, os objetivos do presente estudo foram estimar parâmetros genéticos e componentes de variância através de diferentes modelos matemáticos para um total de 14 características fenotípicas (o peso ao nascimento, peso a desmama, peso ao sobreano, ganho de peso entre a desmama e o sobreano ajustado para um intervalo de 345 dias, perímetro escrotal ao sobreano, altura de garupa ao sobreano, escores visuais avaliados ao sobreano de conformação, precocidade, musculosidade, comprimento de umbigo e ossatura, e ainda características de carcaça mensuradas por ultrassonografia realizada após 30 a 45 dias de confinamento como a área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea, espessura de gordura na picanha). Foram estimadas correlações entre todas estas características com as de carcaça mensuradas por ultrassonografia. Sob o enfoque molecular, desenvolveu-se um programa para imputação de genótipos faltantes e estudaram-se diferentes métodos de associação de marcadores moleculares do tipo mutação de base nitrogenada única (SNP) a características de produção incluídas no índice de seleção de um programa de melhoramento da raça Nelore, utilizando inferência bayesiana. Todas as características estudadas podem ser selecionadas esperando-se progresso genético na população. Os efeitos maternos foram importantes em algumas características onde normalmente estes efeitos não têm sido considerados atualmente. A quantidade de escores atribuídos a uma característica categórica assim como o número de observações fenotípicas resultam em diferenças nas estimativas quando avaliadas por modelos lineares ou de limiar. Não deverão ser obtidos resultados satisfatórios na melhoria das características de carcaça se a seleção for baseada nas tradicionais avaliações visuais utilizadas no momento. Os métodos utilizados na análise de associação dos marcadores podem originar diferentes resultados. Os marcadores que apresentaram efeitos altamente relevantes (P<0,01) geralmente apresentaram resultados semelhantes, independentemente do método utilizado. Certos marcadores podem ter efeitos positivos para algumas características componentes do índice de seleção e negativos para as demais. A análise em conjunto com todos os SNP\'s e todos os dados fenotípicos disponíveis é viável e parece ser a mais adequada. O método desenvolvido de imputação de genótipos faltantes a partir do parentesco de animais genotipados foi eficiente. / Quantitative and molecular genetic studies are very important for animal breeding and studies with Nellore cattle have great importance due to the large participation of that breed in the Brazilian beef cattle industry (around 80% of the herd). The constant estimation of genetic parameters for traits linked to production is necessary for properly perform selection of animals. The improvement of carcass traits is essential for efficiency and profitability of the activity. The implementation of methods for animal selection based on molecular information could revolutionize animal production and should be deeply studied. Thus, the objectives of this study were to estimate genetic parameters and variance components using different mathematical models for a total of 14 traits, such as birth weight, weaning weight, yearling weight, post-weaning weight gain between weaning and yearling adjusted for 345 days, yearling scrotal circumference, yearling hip height, yearling visual scores like conformation, finishing, muscularity, bone structure and navel length. Ultrasound measurements for carcass traits performed at feedlot (30 to 45 days, at approximate age of 20 months) such as rib-eye area, fat thickness, rump fat thickness were, also, evaluated. Estimate correlations between all these traits with the carcass traits measured by ultrasound were estimated. As concerned to molecular study, an algorithm for imputation of missing genotypes was developed and different methods to analyze molecular marker (single nucleotide polymorphism - SNP) association with traits components of the selection index of a breeding program that is applied to the population studied, using bayesian inference, were used. Genetic progress will be expected for selection of all the traits studied. Maternal effects were important in some traits in which those effects are not usually considered. The amount of scores assigned to a categorical trait and the number of observations could result in different estimates when evaluated by linear or threshold models. The selection for visual scores traditionally used in that population will not improve carcass traits. The methods used to analyze the association of markers may lead to different results. The SNP\'s with association effects of high relevance (P<0.01) generally express their effects regardless of the method used to analyze. Some markers may have positive effects for some traits of selection index, but negative for others. The joint analysis with all SNPs and with all available phenotypes is feasible and appears to be more appropriate. The algorithm developed for imputation of missing genotypes from pedigree information of genotyped animals was efficient.