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Prospecção de genes de Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 com potencial para biocontrole. / Prospection for genes of Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 with potential for biocontrol.

Mano, Emy Tiyo 03 September 2015 (has links)
O gênero Burkholderia é composto por bactérias de elevada diversidade fisiológica e genética, sendo alvo para uma série de aplicações biotecnológicas. A linhagem Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 foi capaz de controlar fungos e bactérias patogênicas, bem como produzir antibióticos. A análise de perfil fisiológico da planta hospedeira indica que não há a elicitação de respostas de defesa no controle dos sintomas da podridão mole por B. seminalis. Foi observado que o sucesso do controle depende do contato direto do agente de biocontrole e o patógeno B. gladioli, e que B. seminalis possui atividade antimicrobiana in vitro contra com a formação de um halo de inibição e redução de 40% da densidade de B. gladioli em co-cultura líquida com B. seminalis. A análise do mutante M01 defectivo no controle da podridão mole, que apresenta a região intergênica da patatina-ferritina nocauteada pelo transposon, não mostrou diferenças significativas comparado ao isolado selvagem para os mesmos ensaios. / The genus Burkholderia is composed of bacteria with high physiological and genetic diversity, and it is being goal for a number of biotechnological applications. The Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 strain was able to control fungal and bacterial pathogens as well as produce antibiotics. The physiological profile analysis of the host plant indicates that there is no defense responses elicitation induced by B. seminalis involved in controlling symptoms of soft rot. It was observed that the success of control depends on the full contact of the biocontrol agent and the pathogen B. gladioli. B. seminalis has an antimicrobial activity in vitro showing a inhibition halo and reducing the density of B. gladioli in co-culture with B. seminalis by 40%. The M01 mutant, wich is defective in control of soft rot and showing a insertion of transposon in a intergenic region between patatin-ferritin, presented no significant differences compared to the wild strain for the same assays.
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As espécies da tribo Euglossini (Hymenoptera: Apidae) em diferentes cotas altimétricas em áreas de Mata Atlântica na região norte de Santa Catarina / The species of tribe Euglossini (Hymenoptera: Apidae) at different altitudes in areas of Atlantic Forest in northern Santa Catarina

Dec, Enderlei 13 October 2015 (has links)
Reconhecida pela sua megadiversidade, mas também pelo alto nível de desmatamento e perda de espécies que vem ocorrendo nas últimas décadas, a Mata Atlântica é um dos biomas mais ameaçados do planeta, recebendo a denominação de hotspot mundial. As abelhas exercem papel fundamental para a manutenção da vegetação por meio da polinização e o conhecimento sobre a composição do táxon contribui para ações de conservação. Abelhas da tribo Euglossini podem atuar como bioindicadoras da qualidade ambiental e exercem uma estreita relação com determinadas plantas, principalmente da família Orchidaceae, sendo fundamentais para a perpetuação de muitas espécies desta família. A tribo Euglossini apresenta riqueza de espécies nas florestas tropicais decaindo em direção às latitudes altas. Este estudo propôs investigar e reconhecer a fauna de Euglossini presente na região norte do estado de Santa Catarina, no sul do Brasil, a partir de coletas mensais em seis localidades, distribuídas ao longo de um gradiente altitudinal entre o nível do mar e 800 metros, nos municípios de Joinville e São Francisco do Sul. Duas localidades são constituídas por morros remanescentes de Mata Atlântica, inseridos na malha urbana de Joinville, com extensões de aproximadamente 390 e 525 hectares. As demais localidades compõem áreas contínuas de floresta na costa litorânea e Serra do Mar. Em cada local houve um dia de coleta por mês nos períodos de setembro/2013 até abril/2014 e de setembro/2014 até abril/2015. As iscas odoríferas disponibilizadas foram: benzoato de benzila, cineol, eugenol e vanilina. Nos últimos seis meses do estudo foi testada uma nova fragrância à base de menta: o mentol. O estudo registrou 794 machos de Euglossini dos gêneros Eufriesea, Euglossa e Eulaema, distribuídos em dez espécies válidas e uma potencialmente nova. As localidades com maiores riquezas foram os remanescentes no Morro do Finder e Morro do Boa Vista, e as maiores diversidades ocorreram na Vila da Glória e Mutucas. As espécies Eufriesea violacea Blanchard 1840, Euglossa annectans Dressler 1982 e Eulaema nigrita Lepeletier, 1841 foram registradas nas seis localidades estudadas. Ef. violacea, Eg. annectans Eg. stellfeldi representaram 91,56% da comunidade amostrada, sendo 66,87% somente da primeira espécie. O cineol atraiu 299 abelhas, o eugenol 190 e vanilina 165, mas em relação à riqueza, os mais atrativos foram o benzoato de benzila, cineol e vanilina, com seis espécies cada. O mentol mostrou eficácia, atraindo 75 abelhas de quatro espécies. A distribuição das abelhas em relação a variação altitudinal demonstrou que as maiores riqueza e abundância ocorreram entre o nível do mar e 200 metros de altitude com diminuição do número de indivíduos e espécies acima desta cota. Interações entre as abelhas e oito espécies de orquídeas foram registradas a partir de polinários aderidos às abelhas. Apesar da ocupação humana no entorno dos fragmentos da área urbana, os Morros do Finder e do Boa Vista apresentaram bom estado de conservação para a comunidade de Euglossini. Novos esforços e utilização de outras metodologias podem enriquecer os dados obtidos contribuindo para uma melhor caracterização ambiental da região. A partir dos dados existentes na literatura sobre a tribo Euglossini em Santa Catarina, nota-se uma riqueza significativa nos municípios de Joinville e São Francisco do Sul. / Recognized for its megadiversity, but also the high level of deforestation and species loss that has occurred in recent decades, the Atlantic Forest is one of the most threatened biomes on the planet, getting the global name hotspot. Bees play a crucial role in the maintenance of vegetation through pollination and knowledge about the taxon composition contributes to conservation actions. The tribe Euglossini can act as bioindicators of environmental quality and exert a close relationship with certain plants, particularly the orchid family, being fundamental to the perpetuation of many species of this family. The tribe Euglossini has a species richness in tropical forests which decreases in the higher latitudes. This study aimed to investigate and identify the Euglossini fauna present in the northern state of Santa Catarina, in southern Brazil, from monthly collections in six locations distributed along an altitudinal gradient between sea level and 800 meters, in the cities of Joinville and São Francisco do Sul. Two locations are composed of remnants of Atlantic Forest hills, situated in the urban area of Joinville, with extensions of approximately 390 and 525 hectares. Other locations comprise continuous areas of forest on the coastline and Serra do Mar. At each site there was one collection day per month in the period from September / 2013 to April / 2014 and September / 2014 to April / 2015. The available scent baits were: benzyl benzoate, cineol, eugenol and vanillin. In the last six months of the study a new mint-based fragrance was tested : menthol. The study recorded 794 Euglossini males of the genera Eufriesea, Euglossa and Eulaema, distributed in ten valid species and one potentially new species. The localities with the greatest richness were in Morro do Finder and Morro do Boa Vista, and the largest diversity occurred in the Vila da Glória and Mutucas. The species Eufriesea violacea Blanchard 1840, Euglossa annectans Dressler 1982 e Eulaema nigrita Lepeletier, 1841 were recorded in the six studied locations. Ef. violacea, Eg. annectans and Eg. stellfeldi represented 91.56% of the sampled community, with the first species making up 66.87% of that figure. The cineole attracted 299 bees, eugenol 190 and vanillin 165, but in relation to richness, the most attractive were the benzyl benzoate, cineole and vanillin, with six species each. The menthol was effective, attracting 75 bees from four species. The distribution of bees in relation to altitudinal variation showed that the greatest richness and abundance occured between sea level and an altitude of 200 metres, with a decrease in the number of individuals and species above this altimetry quota. Interactions between bees and eight species of orchids were recorded from pollinaria adhered to the bees. Despite the surrounding human occupation of urban fragments, Morros Finder and Boa Vista showed good conditions for the community of Euglossini. New efforts and using other methodologies can enrich the data, contributing to a better environmental characterization of the area. From the literature data on the tribe Euglossini in Santa Catarina, there is a significant richness in the cities of Joinville and São Francisco do Sul.
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Diversidade de fungos micorrízicos e endofíticos associados a orquídeas ameaçadas do bioma Mata Atlântica / Diversity of mycorrhizal and endophytic fungi associated with endangered orchids from the Atlantic Forest biome

Oliveira, Sabrina Feliciano 06 July 2012 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-28T15:07:29Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1959285 bytes, checksum: 899be21930ffc050976fe55ee57f724f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-28T15:07:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1959285 bytes, checksum: 899be21930ffc050976fe55ee57f724f (MD5) Previous issue date: 2012-07-06 / O Brasil possui uma grande biodiversidade de orquídeas, principalmente de espécies epífitas. Dentre essa diversidade ressaltam-se as espécies Hadrolaelia jongheana, Hoffmannseggella cinnabarina, Hoffmannseggella caulescens presentes em diferentes formações vegetacionais da Floresta Atlântica. As espécies pertencentes à família Orchidaceae associam-se com fungos micorrízicos para promover a germinação de sementes e o estabelecimento do protocormo em seu ambiente natural. O conhecimento da diversidade da comunidade microbiana com qual a orquídea mantém essa associação é de extrema relevância para a compreensão da ecologia e complexidade das associações simbióticas. O presente trabalho teve como objetivo estudar a diversidade genética dos fungos associados às orquídeas H. jongheana, H. cinnabarina, H. caulescens, utilizando-se abordagens moleculares, como a contrução de bibliotecas de clones e amplificação do DNA diretamente das raízes. Os valores do índice de diversidade de Shannon-Wiener para H. cinnabarina, coletada em distintas áreas, foram diferentes, sugerindo que os fatores locais influenciam na diversidade. Observamos que as comunidades fúngicas das três espécies de orquídeas analisadas apresentaram alta diversidade, sendo a composição dessas comunidades estruturalmente diferentes entre si de acordo com as análises do LIBSHUFF. A construção de bibliotecas de clones permitiu identificar táxons de fungos basidiomicetos e ascomicetos associados às raízes dessas plantas. Os fungos basidiomicetos encontrados, em sua maioria, são potenciais candidatos a fungos micorrízicos de orquídeas. Ao passo que, os ascomicetos identificados são, possivelmente, fungos endofíticos dessas plantas. Além disso, verificamos que essas orquídeas tropicais são generalistas em suas associações micorrízicas com fungos rizoctonióides sebacinóides e tulasnelóides. Estes resultados são relevantes à medida que são informações importantes para traçar estratégias de conservação para espécies da flora brasileira ameaçadas de extinção e endêmicas de um importante e ameaçado hotspot. / Brazil has a huge orchid biodiversity, mostly epiphytic species. Among this we emphasize Hadrolaelia jongheana, Hoffmannseggella cinnabarina, and Hoffmannseggella caulescens species occur in different vegetation formations of the Atlantic Forest. The species belonging to the family Orchidaceae are associated with mycorrhizal fungi to promote seed germination and establishment of protocormo in their natural environment. The knowledge of the microbial community diversity which the orchids maintain association is extremely important for understanding the ecology and complexity of symbiotic associations. The present work aimed to study the genetic diversity of fungi associated with orchids H.jongheana, H. cinnabarina, H. caulescens, using molecular approaches, such as the clone library construction and DNA amplification directly from the roots. The values of diversity index Shannon-Wiener for H. cinnabarina, collected in different areas were different, suggesting that local factors influence the diversity.We observed that the fungal communities of those three orchid species analyzed showed high diversity, and the composition of these communities are structurally different from each other according to the LIBSHUFF analysis. The clones libraries construction allowed to identify Basidiomycetes and Ascomycetes taxa associated with the roots of these plants. Basidiomycete fungi found, mostly, are potential candidates for orchid mycorrhizal fungi. While the identified Ascomycete fungi found are possibly endophytes of these plants. Furthermore, we found that these tropical orchids are generalists in their mycorrhizal associations with sebacnioid and tulasnelloid Rhizoctonia-like fungi. These results are relevant as they are important information to develop conservation strategies to threaten and endemic Brazilian orchid species from an important and threatened hotspot. / Dissertação antiga
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GERMINAÇÃO E CRESCIMENTO IN VITRO DE Brassavola tuberculata Hook. (ORCHIDACEAE) / GERMINATION AND GROWTH IN VITRO Brassavola tuberculata Hook. (ORCHIDACEAE)

Sousa, Gisele Garcia de 22 November 2013 (has links)
Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-05-18T19:15:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) GISELESOUSA.pdf: 887544 bytes, checksum: 13afd905cf042644a131924f5ef22690 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-18T19:15:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) GISELESOUSA.pdf: 887544 bytes, checksum: 13afd905cf042644a131924f5ef22690 (MD5) Previous issue date: 2013-11-22 / In vitro propagation of orchids has been used for the production of commercially important plants and for the conservation of endangered species, while the storage of orchid seeds preserves genetic variability. Objectives of this research were: 1 – to study the effect of the concentration of 6-benzylaminopurine (BAP) (0.0, 0.1, 1.0 or 2.0 mg L-1), fruit maturation (60, 90, 120, 150, 180 or 210 days after pollination - DAP) and the three culture time (15, 30 or 45 days) in the asymbiotic seed germination of Brassavola tuberculata, from three types of pollination (hand self-pollination, hand cross-pollination or natural pollination); 2 - evaluate the initial in vitro stages of development of B. tuberculata, in response to the use of 6- benzylaminopurine (BAP) (0.0 , 0.1, 1.0 or 2.0 mg L- 1), fruit maturation (60, 90, 120, 150, 180 or 210 days after pollination - DAP) and the three types of pollination (hand self-pollination, hand cross-pollination or natural pollination); 3 - evaluate the storage time and agar concentrations in vitro germination of B. tuberculata and 4 - to evaluate the effect of different concentrations of MS medium, the initial growth of B. tuberculata. The research was performed at the Laboratory for in vitro cultivation of the Faculty of Agricultural Sciences (FCA) of the Federal University of Grande Dourados (UFGD), during the period from august 2010 to 2013. Were used for the research of germination and development in vitro, seeds of B. tuberculata from different types of pollination and ages of maturation, and for the growth, plants 180 days after sowing. The cultures were kept in a growth room at 25±2ºC and photoperiod of 12h, in completely randomized design. Being evaluated germination percentage; number of protocorm, protocorm percentage at different stages of development and number of dead protocorms; survival percentage, number of tillers and roots, length of leaf and greater root mass fresh plant. Every variables and vegetal attributes were submitted to variance analysis and of the regression. The hand self-pollination produced seeds that did not germinate in vitro, whereas the seeds produced by hand crosspollination or natural pollination, produced seeds that germinated in vitro, when the fruits were harvested after 150 DAP. Germination percentages above 90% were recorded in fruits from the hand cross-pollination or natural pollination, harvested at 210 DAP and cultured for more than 30 days. The germination of B. tuberculata is more linked to the maturation of the fruit, since there was little influence of exogenous supply of cytokinin on seed germination in vitro. The number of protocorm of hand cross-pollination and natural pollination is higher in the fruits collected at 180 DAP. The percentage of protocorms in stage 1 (% P1) formed by hand cross-pollination and natural pollination is higher in fruit collected at 150 DAP. The percentage of protocorms in stage 4 (%P4) is higher in fruits collected at 150 DAP derived from natural pollination, and at 210 DAP, those derived from hand cross-pollination. The use of liquid and solid media favors the germination of B. tuberculata. Seeds of B. tuberculata stored for 90 days resulted in germination above 70%. The plants of B. tuberculata, have higher initial growth when cultured on MS medium with concentration between 70 and 75 %. Use of MS 50% medium is promising when the objective is the in vitro multiplications of B. tuberculata. / A propagação in vitro de orquídeas tem sido utilizada para produção de plantas comercialmente importantes e para a conservação de espécies ameaçadas de extinção, enquanto que o armazenamento de sementes de orquídeas preserva a variabilidade genética. Foram objetivos desta pesquisa 1 – estudar o efeito da concentração de 6-Benzilaminopurina (BAP) (0,0; 0,1; 1,0 ou 2,0 mg L-1), da maturação dos frutos (60, 90, 120, 150, 180 ou 210 dias após polinização - DAP) e de três tempos de cultivo (15, 30 ou 45 dias) na germinação assimbiótica de sementes de Brassavola. tuberculata Hook., oriundas de três tipos de polinização (autopolinização manual, polinização cruzada manual ou polinização natural); 2 - avaliar os estádios de desenvolvimento inicial in vitro de B. tuberculata, em resposta à utilização de 6-Benzilaminopurina (BAP) (0,0; 0,1; 1,0 ou 2,0 mg L-1), da maturação dos frutos (60, 90, 120, 150, 180 ou 210 dias após polinização - DAP) e de três tipo de polinização (autopolinização manual, polinização cruzada manual ou polinização natural); 3 - avaliar o tempo de armazenamento e as concentrações de ágar na germinação in vitro de B. tuberculata e 4 – avaliar o efeito de diferentes concentrações do meio MS, no crescimento inicial de plantas de B. tuberculata. Os trabalhos foram realizados no Laboratório de cultivo in vitro da Faculdade de Ciências Agrárias (FCA) da Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD), durante o período de agosto de 2010 a agosto de 2013. Foram utilizadas para os estudos de germinação e desenvolvimento in vitro, sementes de B. tuberculata provenientes de diferentes tipos de polinização e épocas de maturação, e para o crescimento, plantas com 180 dias após a semeadura. As culturas foram acondicionadas em sala de crescimento, com temperatura média 25±2ºC, fotoperíodo de 12h, em delineamento experimental inteiramente casualizado. Sendo avaliados porcentagem de germinação; número de protocormos, porcentagem de protocormos em diferentes estádios de desenvolvimento e número de protocormos mortos; porcentagem de sobrevivência, número de perfilhos e de raízes, comprimento da maior folha e da maior raiz, massa fresca da planta. Todas as variáveis e atributos vegetais foram submetidos às análises de variância e de regressão. A autopolinização manual produziu sementes que não germinaram in vitro, enquanto que as sementes produzidas por polinização cruzada manual ou polinização natural produziram sementes que germinaram in vitro quando os frutos foram colhidos após 150 DAP. Porcentagem de germinação superior a 90% foram registradas em frutos oriundos de polinização cruzada manual e polinização natural, colhidos aos 210 DAP e cultivados por período superior a 30 dias. A germinação de B. tuberculata está mais vinculada ao estádio de maturação dos frutos uma vez que houve pouca influência do fornecimento exógeno de citocinina sobre a sua germinação in vitro. O número de protocormos da polinização cruzada manual e da polinização natural é maior em frutos coletados aos 180 DAP. A porcentagem de protocormos em estádio 1(%P1) formada pela polinização cruzada manual e polinização natural é maior em frutos coletados aos 150 DAP. A porcentagem de protocormos em estádio 4 (%P4) é maior em frutos coletados aos 150 DAP oriundos de polinização natural e, aos 210 DAP, naqueles oriundos de polinização cruzada manual. O emprego dos meios líquido e sólido favorecem a germinação de B. tuberculata. Sementes de B. tuberculata armazenadas por 90 dias apresentam germinação acima de 70%. As plantas de B. tuberculata apresentam maior crescimento inicial quando cultivadas em meio MS com concentração entre 70 e 75%. A utilização do meio MS 50% é promissor quando o objetivo for a multiplicação in vitro de B. tuberculata.
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Extratos vegetais na propagação in vitro de Epidendrum ibaguense Kunth / Plant extracts on spread in vitro epidendrum ibaguense Kunth

Eliana de Souza e Silva 28 August 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A micropropagação de orquídeas é uma técnica utilizada com vários objetivos, podendo-se destacar a multiplicação rápida de plantas, propagação de novos híbridos, produção em larga escala e obtenção de matrizes livres de patógenos. A utilização de extratos naturais com ação antimicrobiana na micropropagação mostra-se como uma forma alternativa, ecológica e econômica de obtenção de plantas isentas de micro-organismos. Este trabalho teve como objetivo avaliar a utilização de extratos de Allium sativum (alho), de Syzygium aromaticum (cravo) e de própolis para evitar a contaminação com micro-organismos durante o processo de subcultivo in vitro de Epidendrum ibaguense Kunth e as possíveis interferências desses extratos no desenvolvimento vegetativo das plântulas. Foram isolados e identificados os micro-organismos Aspergillus sp., Candida sp., bactéria Gram-negativa, bactéria Gram-positiva e Penicillium sp. presentes em frascos com meio de cultura contaminados, oriundos do cultivo in vitro e do ambiente. Avaliou-se a ação antimicrobiana dos extratos sobre os micro-organismos isolados e observou-se que, o extrato de cravo inibiu o crescimento dos mesmos. Foram utilizados sete tratamentos compostos pelo meio Murashige; Skoog (1962) com metade da concentração de macronutrientes, acrescido de carvão vegetal e dos extratos de alho a 1,0 mgL-1 (T1), alho a 0,5 mgL-1 (T2), cravo a 1,0 mgL-1 (T3), cravo a 0,5 mgL-1 (T4), própolis a 1,0 mgL-1 (T5), própolis a 0,5 mgL-1 (T6) e o controle (T7) em um delineamento inteiramente casualizado, com cinco repetições e três plântulas por repetição. Após sessenta dias do subcultivo nos meios com os extratos avaliou-se a altura da parte aérea, o comprimento da maior raiz, o número de raízes, o número folhas, o comprimento da maior folha, o peso da massa fresca, o peso da massa seca e a taxa de multiplicação das plântulas. Houve influência dos extratos de alho, cravo e própolis no desenvolvimento in vitro de plântulas de E. ibaguense. O extrato de cravo apresentou ação antimicrobiana frente aos micro-organismos Aspergillus sp., Candida sp., Escherichia coli, Penicillium sp. e Streptococcus pneumoniae. Já os extratos de alho e própolis não demonstraram atividade antimicrobiana sobre nenhuma das cepas testadas. Através deste trabalho foi possível estabelecer um protocolo para o cultivo in vitro de E. ibaguense visando o controle da contaminação. / The micropropagation of orchids is a technique used for various purposes, may be noted the rapid multiplication of plants, propagation of new hybrid, large-scale production and obtaining free arrays of pathogens. The use of natural extracts with antimicrobial activity in micropropagation shows up as an alternative, environmentally friendly and economical way to obtain plants free of microorganisms. This study aimed to evaluate the use of extracts of Allium sativum (garlic), Syzygium aromaticum (clove) and propolis to prevent contamination with micro-organisms during the process of in vitro subculture of Epidendrum ibaguense Kunth and the possible interference of these extracts on vegetative growth of seedlings. The microorganisms Aspergillus sp. Candida sp. Gram-negative bacteria, Gram-positive and Penicillium sp. present in the contaminated bottles with culture, derived from in vitro culture and the environment, were isolated and identified. We evaluated the antimicrobial activity of the extracts on the isolated microorganisms and it was observed that the extract of clove inhibited their growth. Seven compound treatments were used by Murashige; Skoog (1962) with half the concentration of macronutrients, plus charcoal and garlic extracts to 1.0 mgL-1 (T1), garlic 0.5 mgL-1 (T2), cloves 1.0 mgL- 1 (T3), cloves 0.5 mgL-1 (T4), propolis to 1.0 mgL-1 (T5), propolis 0.5 mgL-1 (T6) and control (T7) on a randomized complete randomized with five replications and three seedlings per replication. Sixty days of subculture in the media with the extracts evaluated the shoot height, the length of roots, number of roots, leaves number, the length of the longest leaf, the weight of the fresh weight, the weight of the mass drought and the multiplication rate of the seedlings. There were significant effects of the extracts of garlic, clove and propolis in the development of in vitro plantlets of E. ibaguense. Clove extract showed antimicrobial activity against microorganisms Aspergillus sp., Candida sp., Escherichia coli, Penicillium sp. and Streptococcus pneumoniae and the extracts of garlic and propolis showed no antimicrobial activity against any of the tested strains. Through this work, it was possible to establish a protocol for the in vitro cultivation of E. ibaguense for the contamination control.
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A família Orchidaceae em um fragmento florestal no sul do Rio Grande do Sul, Brasil / Family Orchidaceae in a Forest Fragment in the South of Rio Grande do Sul, Brazil.

Perleberg, Tângela Denise 04 May 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:33:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Tangela_Denise_Perleberg.pdf: 8691099 bytes, checksum: 1f0a2e55e57d45a97d2b32e72803b425 (MD5) Previous issue date: 2009-05-04 / Rio Grande do Sul state south region is not well-known as for its forests floristic composition. This work conducted a taxonomic treatment of Orchidaceae species occurring in Morro Quilongongo, a seasonal semi-deciduous forest fragment located in Southeast Slope, in the municipality of Pelotas, Rio Grande do Sul state. The work shows descriptions, identification key and illustrations of the species, complemented with data about habitat, phenology and geographic distribution. Forty species of Orchidaceae were found distributed in 22 genders. The most representative genders in number of species were Oncidium (8 spp.), Acianthera (4 spp.), Anathallis and Specklinia (3 spp. for each of the plants), however, 14 genders (64%) presented only one specie. The most found species, 29 (72%), are epiphyte, 9 of them are frequently observed upon the rocks. Eleven (27.5%) are terrestrial, seven are frequently found occurring in rocks. The number of species in bloom by month varied from 8 to 14. In September and October a larger number of species come into bloom. In April and July a smaller number of species come into bloom. The regions of Rio Grande do Sul which presented the largest number of these species were the Superior Northeast Slope (30 spp.), Central Depression (27 spp.) and Coast (26 spp.). The Orchidaceae flora of the region is not much represented in the consulted herbaria; just only 11 (27.5%) species found in Morro Quilongongo have a representative exsiccate of the region of Pelotas. Therefore, this work contributes to the knowledge of the South region flora of Rio Grande do Sul, providing data that justify the preservation of this area. / A região sul do Rio Grande do Sul é pouco conhecida quanto à composição florística de suas florestas. Neste trabalho foi realizado o tratamento taxonômico das espécies de Orchidaceae ocorrentes no Morro Quilongongo, um fragmento de floresta estacional semidecidual, localizado na Encosta do Sudeste, no município de Pelotas, Estado do Rio Grande do Sul. São apresentadas descrições, chave de identificação e ilustrações das espécies, complementadas com dados sobre habitat, fenologia e distribuição geográfica. Foram encontradas 40 espécies de Orchidaceae distribuídas em 22 gêneros. Os gêneros mais representativos, em número de espécies, foram Oncidium (8 spp.), Acianthera (4 spp.) e Anathallis e Specklinia (3 spp. cada), porém, 14 gêneros (64%), apresentam apenas uma espécie. A maioria das espécies encontradas, 29 (72,5%), é epífita, sendo 9 destas também observadas frequentemente sobre rochas. Onze (27,5%) são terrestres, sendo 7 frequentemente encontradas como rupícolas. O número de espécies floridas por mês variou de 8 a 14, sendo setembro e outubro os meses com maior número de espécies floridas e abril e julho os meses com menor número de espécies floridas. As regiões do Rio Grande do Sul que apresentaram o maior número de espécies comuns à área de estudo foram a Encosta Superior do Nordeste (30 spp.), Depressão Central (27 spp.) e Litoral (26 spp.). A flora de Orchidaceae da região é pouco representada nos herbários consultados, sendo que apenas 11 (27,5%) espécies encontradas no Morro Quilongongo possuem uma exsicata representativa da região de Pelotas. Portanto, o trabalho contribui para o conhecimento da flora da região sul do Rio Grande do Sul gerando dados que justificam a preservação da área.
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Prospecção de genes de Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 com potencial para biocontrole. / Prospection for genes of Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 with potential for biocontrol.

Emy Tiyo Mano 03 September 2015 (has links)
O gênero Burkholderia é composto por bactérias de elevada diversidade fisiológica e genética, sendo alvo para uma série de aplicações biotecnológicas. A linhagem Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 foi capaz de controlar fungos e bactérias patogênicas, bem como produzir antibióticos. A análise de perfil fisiológico da planta hospedeira indica que não há a elicitação de respostas de defesa no controle dos sintomas da podridão mole por B. seminalis. Foi observado que o sucesso do controle depende do contato direto do agente de biocontrole e o patógeno B. gladioli, e que B. seminalis possui atividade antimicrobiana in vitro contra com a formação de um halo de inibição e redução de 40% da densidade de B. gladioli em co-cultura líquida com B. seminalis. A análise do mutante M01 defectivo no controle da podridão mole, que apresenta a região intergênica da patatina-ferritina nocauteada pelo transposon, não mostrou diferenças significativas comparado ao isolado selvagem para os mesmos ensaios. / The genus Burkholderia is composed of bacteria with high physiological and genetic diversity, and it is being goal for a number of biotechnological applications. The Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 strain was able to control fungal and bacterial pathogens as well as produce antibiotics. The physiological profile analysis of the host plant indicates that there is no defense responses elicitation induced by B. seminalis involved in controlling symptoms of soft rot. It was observed that the success of control depends on the full contact of the biocontrol agent and the pathogen B. gladioli. B. seminalis has an antimicrobial activity in vitro showing a inhibition halo and reducing the density of B. gladioli in co-culture with B. seminalis by 40%. The M01 mutant, wich is defective in control of soft rot and showing a insertion of transposon in a intergenic region between patatin-ferritin, presented no significant differences compared to the wild strain for the same assays.
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Caracterização morfológica de micorrizas de Epidendrum secundum e Zygopetalum mackaii nativas do Parque Estadual da Serra do Brigadeiro (MG) / Morphological characterization of mycorrhizae of Epidendrum secundum and Zygopetalum mackaii natives of the Serra do Brigadeiro State Park (MG)

Linhares, Danielle Oliveira 14 March 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 649442 bytes, checksum: 480c7019b7f152a1aa0ec2308fbde07e (MD5) Previous issue date: 2006-03-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Epidendrum secundum and Zygopetalum mackaii, native from State Park of Serra do Brigadeiro, Minas Gerais State, Brazil, were studied to characterize the structure of mycorrhizae and associated mycorrhizal fungi. From August/2004 to July/2005, roots were collected from four different areas. A total of 28 isolates were obtained, all belonging to genus Epulorhiza, which were separated in three groups according their morphological and cultural characteristics. In both orchid species, mycorrhizae were tolipophagic, and colonizing all extension of the root system, presenting intact and degraded pelotons. Root colonization occurs mainly through root hairs and sometimes via epidermic cells, while cortex colonization occurs, mainly, via passage cells of the exodermis. Cortex colonization occurs by cell-to cell, and pelotons occupy all cellular space. Peloton degradation starts by hypha deformation, followed by a uniform reduction of peloton volume. Colonization intensity was higher in the dry season. The species growing on rocks showed higher colonization frequency and higher mycotrophic activity. This is the first report on the mycorrhizal association of Z. mackaii. Isolated fungi in this study show high potential to be used in commercial propagation of this orchid species. / Epidendrum secundum e Zygopetalum mackaii, nativas do Parque Estadual Serra do Brigadeiro (MG), foram estudadas com objetivo de caracterizar a associação micorrízica e os fungos micorrízicos associado a estas plantas. Durante o período de agosto/2004 a julho/2005, foram realizadas coletas do sistema radicular dessas espécies crescendo em quatro áreas com características distintas. Obtiveram-se o total de 28 isolados fúngicos, todos pertencentes ao gênero Epulorhiza, os quais foram divididos em três grupos, de acordo com as características culturais e morfológicas. A micorriza encontrada foi o tolipofágico, sendo observado pelotons intactos e degradados em toda a extensão do sistema radicular das espécies estudadas. A infecção da raiz ocorre via pêlo radicular ou células epidérmicas, enquanto a colonização do córtex é, principalmente, via célula de passagem da exoderme. A colonização no córtex ocorre via célula-célula, sendo todo o espaço celular ocupado pela estrutura fúngica, os pelotons. O estádio de degradação inicia-se pela deformação do peloton, seguida da redução uniforme de seu volume. A intensidade de colonização foi maior nos períodos de seca. As espécies crescidas diretamente sobre rochas apresentaram maior freqüência de colonização e maior atividade micotrófica. Este é o primeiro relato sobre o isolamento e caracterização de fungos micorrízicos em Z. mackaii. Os fungos isolados neste trabalho apresentam um grande potencial para serem utilizados na propagação comercial destas orquídeas.
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Conservação in vitro e aclimatização de Epidendroideae (Orchidaceae) do Estado de Sergipe / In vitro conservation and acclimatization of Epidendroideae (Orchidaceae) of the Sergipe State

Menezes, Thays Saynara Alves 31 July 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Orchids are considered the oldest among the ornamental species, and are herbaceous and perennial plants of high commercial value. The objective of this work was to develop protocols for in vitro conservation using the slow growth technique, and acclimatization of species of the subfamily Epidendroideae (Orchidaceae) of Sergipe State. The experiments were conducted in the Laboratory of Tissue Culture and Plant Breeding, Department of Agronomic Engineering, Federal University of Sergipe. We conducted two conservation experiments, both in a completely randomized design, the first in a 4x3x2 factorial scheme, testing four concentrations of salts of MS medium (100%, 75%, 50%, 25% salts), three species (Catasetum macrocarpum, Oeceoclades maculata and Polystachya estrellensis) and two temperatures (18 and 25ºC), and the second in a 3x3x2 factorial scheme, testing three combinations of carbon sources and osmotic regulators (20 g.L-1 sucrose, 10 g.L-1 sucrose + 5 g.L-1 mannitol, 10 g.L-1 sucrose + 5 g.L-1 sorbitol), three species (C. macrocarpum, O. maculata and P. estrellensis) and two temperatures (18 and 25ºC). For acclimatization, the experiment also was conducted in a completely randomized design, testing eight substrates [sand and earthworm castings (4:1); sand, coconut coir and earthworm castings (2:2:1); sand, crushed pine bark and earthworm castings (2:2:1); sand, crushed pine bark, coconut coir and earthworm castings (2:1:1:1); sand; sand and coconut coir (1:1); sand and crushed pine bark (1:1); sand, crushed pine bark and coconut coir (2:1:1)] and two species (O. macrocarpum and C. maculata). For in vitro conservation of C. macrocarpum, O. maculata and P. estrellensis for a period of 450 days, we should use culture medium containing 25% of MS salts at a temperature of 25°C or 20 g.L-1 of sucrose at 25°C. Acclimatization of micropropagated seedlings of C. macrocarpum can be performed using sand, crushed pine bark and earthworm castings (2:2:1) as the substrate, and for O. maculata we recommend to use only sand. / As orquídeas são consideradas as mais antigas entre as espécies ornamentais, sendo plantas herbáceas e perenes e de alto valor comercial. Diante disso objetivou-se com o presente trabalho desenvolver protocolos de conservação in vitro sob crescimento lento e aclimatização de espécies da subfamília Epidendroideae (Orchidaceae) do Estado de Sergipe. Os experimentos foram conduzidos no Laboratório de Cultura de Tecidos e Melhoramento Vegetal do Departamento de Engenharia Agronômica (DEA) da Universidade Federal de Sergipe (UFS). Foram realizados dois experimentos de conservação, ambos em delineamento inteiramente casualizado, sendo o primeiro em esquema fatorial 4x3x2, testando quatro concentrações de sais do meio MS (100%, 75%, 50%, 25% dos sais), três espécies (Catasetum macrocarpum, Oeceoclades maculata e Polystachya estrellensis) e duas temperaturas (18 e 25ºC), e o segundo em fatorial 3x3x2, testando três combinações de fontes de carbono e reguladores osmóticos (20 g.L- 1 de sacarose; 10 g.L-1 de sacarose + 5 g.L-1 de manitol; 10 g.L-1 de sacarose + 5 g.L-1 de sorbitol), três espécies (C. macrocarpum, O. maculata e P. estrellensis) e duas temperaturas (18 e 25ºC). Para a aclimatização o experimento também foi implantado em delineamento inteiramente casualizado, testando oito misturas de substratos [areia e húmus de minhoca (4:1); areia, pó de coco e húmus de minhoca (2:2:1); areia, casca de pinus triturada e húmus de minhoca (2:2:1); areia, casca de pinus triturada, pó de coco e húmus de minhoca (2:1:1:1); areia; areia e pó de coco (1:1); areia e casca de pinus triturada (1:1); areia, casca de pinus triturada e pó de coco (2:1:1)] e duas espécies (C. macrocarpum e O. maculata). Para conservação in vitro de C. macrocarpum, O. maculata e P. estrellensis por um período de 450 dias, deve-se utilizar meio de cultura contendo 25% dos sais MS à temperatura de 25ºC ou 20 g.L-1 de sacarose à 25ºC. A aclimatização de plântulas de C. macrocarpum pode ser realizada utilizando areia : casca de pinus triturada : húmus de minhoca (2:2:1) como substrato e para O. maculata recomenda-se somente a utilização de areia.
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Abelhas Euglossina (Hymenoptera, Apidae) do Parque Estadual do Ibitipoca, Minas Gerais, Brasil

Silva, Paula Netto 28 February 2011 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-09-12T13:40:01Z No. of bitstreams: 1 paulanettosilva.pdf: 1153373 bytes, checksum: 8181d2e647dd4c1e03663657d63a7785 (MD5) / Approved for entry into archive by Diamantino Mayra (mayra.diamantino@ufjf.edu.br) on 2016-09-13T12:59:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 paulanettosilva.pdf: 1153373 bytes, checksum: 8181d2e647dd4c1e03663657d63a7785 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-13T12:59:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 paulanettosilva.pdf: 1153373 bytes, checksum: 8181d2e647dd4c1e03663657d63a7785 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / As abelhas Euglossina são importantes polinizadoras de muitas espécies vegetais neotropicais. Os machos dessa tribo se destacam pelo comportamento peculiar de coletar compostos aromáticos. A utilização de compostos aromáticos sintéticos tem permitido a realização de levantamentos da fauna de Euglossina em diferentes regiões do Brasil. Os objetivos desse estudo foram inventariar as espécies de abelhas Euglossina do Parque Estadual do Ibitipoca (PEIB), avaliar diferenças na riqueza e abundância de espécies em duas formações fitofisionômicas (Mata Atlântica e Campo Rupestre) dentro do parque, analisar a sazonalidade e o horário de atividade do grupo nesses ambientes e comparar a atratividade dos compostos aromáticos utilizados. Os dados foram coletados de janeiro a dezembro de 2010. Foram coletados 162 machos de Euglossina pertencentes a três gêneros e oito espécies. A área de Mata Atlântica apresentou maior riqueza e abundância quando comparada a área de Campo Rupestre, sendo os índices de diversidade de H'= 0,65; J'= 0,33 para a primeira área e H'= 0,29; J'= 0,27 para a segunda. A similaridade da composição de espécies das duas áreas amostradas foi baixa (Q.S. = 0,4). A espécie Eulaema nigrita foi a única dominante em ambas as áreas. A umidade relativa foi correlacionada com a abundância de machos apenas na área de ―Campo Rupestre‖. Os machos foram ativos durante todo o dia de coleta, mostrando maior atividade das 13 ás 14 horas. Dentre os compostos utilizados o eucaliptol foi o mais atrativo em termos de abundância (83%). Em relação à diversidade, eugenol e vanilina foram mais atrativos, atraindo quatro e três espécies, respectivamente. O salicilato de metila atraiu apenas indivíduos de Eulaema cingulata, enquanto o acetato de benzila não foi atrativo. Este é o primeiro levantamento de abelhas Euglossina a ser realizado no PEIB, contribuindo para o conhecimento de alguns padrões dessas abelhas em regiões de Campo Rupestre. / Euglossina bees are important pollinators of many neotropical species of plants. Their males show the behavior of collecting aromatic compounds. The use of these compounds has been used to survey Euglossina bees in different regions of Brazil. This work aims to survey Euglossina bees on Parque Estadual do Ibitipoca (PEIB), comparing differences on: species richness and abundance in two physiognomic formations (Atlantic Forest and "Campo Rupestre"), seasonality and hours of activity of bees in these environments; the attractiveness of three aromatics in attracting bees. The study was conducted from January to December 2010. It was collected 162 Euglossina males belonging to three genera and eight species. The forest area had the highest richness and abundance when compared to "Campo Rupestre", (H'=0,65; J'=0,33 for the first area and H'= 0,29; J' = 0,27 for the second one). The similarity of species composition of the two sampled areas was low (QS = 0.4), this is probably due to differences of each physiognomic environment. The species Eulaema nigrita was the dominant secies in both areas. Euglossina bees were more active during the warm months of the year, coinciding with the rainy season. During the dry season, characterized by cloudy days, with high incidence of sawmill, males activity was very low or absent. Temperature was correlated with the abundance of males. The relative humidity was correlated with the abundance of males only in the "Campo Rupestre" area. Males were active throughout the day of collection, showing the highest activity at 1p.m. Among the attractive compounds, eucalyptol was the most attractive in terms of abundance (83%). In relation to diversity, Eugenol and vanillin were more attractive than eucalyptol, attracting four and three species respectively. The methyl salicylate attracted only Eulaema cingulata, while the benzyl acetate was not attractive. This study is the first survey of Euglossina accomplished in PEIB, contributing to the knowledge of some patterns of these bees "Campo Rupestre".

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