A transformação genética é uma alternativa ao melhoramento convencional de citros que permite a modificação de genótipos pela introdução de um ou mais genes oriundos de organismos semelhantes ou filogeneticamente distantes do hospedeiro. Os genes transferidos para espécies de interesse devem ser controlados por promotores, os quais regulam a expressão gênica de forma temporal, espacial e na magnitude desejada. Na maioria dos casos, os genes são expressos de forma constitutiva utilizando o promotor CaMV35S isolado do Vírus do Mosaico da Couve Flor. No entanto, o desenvolvimento de novas abordagens de transformação de plantas (cisgenia e intragenia), que fazem o uso de genes e sequências regulatórias derivadas da mesma espécie ou espécies relacionadas, requer a disponibilidade de elementos genéticos, incluindo promotores constitutivos, isolados de citros. Assim, o objetivo do trabalho foi clonar e caracterizar promotores constitutivos de Citrus sinensis. Para isso, a região promotora dos genes Fator de elongação 1-α (CsEF1), Gliceraldeido-3-fosfato-desidrogenase C2 (CsGAPC2) e Cyclofilina (CsCYC) foi isolada e avaliados pela fusão ao gene repórter uidA. A funcionalidade dos três promotores foi confirmada por ensaio histoquímico da atividade GUS em folhas, caules e raízes de plantas transgênicas de citros cv. \'Hamlin\'. A análise de RT-qPCR mostra que a expressão do gene uidA sob controle dos promotores CsCYC, CsGAPC2 e CsEF1 correspondeu a uma atividade aproximada de 64%, 58% e 47%, respectivamente em comparação com o promotor CaMV35S. A análise in silico dos promotores CsGAPC2, CsCYC e CsEF1 mostra que a atividade de cada um é controlada por uma série de putativos elementos cis-regulatórios. A sequência completa e versões truncadas originadas a partir de deleções em cada promotor foram fundidas ao gene uidA e analisadas em plantas transgênicas de Nicotiana benthamiana pelo ensaio histoquímico e fluorimétrico da atividade GUS. As análises de deleções não causaram perda de função dos promotores em estudo, mas afetaram a expressão gênica nos promotores CsGAPC2 e CsEF1. Os promotores isolados representam bons candidatos a serem utilizados em trabalhos de transformação genética de citros. / Genetic transformation is an alternative to citros conventional breeding that allows the modification of genotypes by the introduction of one or more genes derived from different organisms that can not be crossed by natural means. The transferred genes to the species of interest are controlled by promoters, which regulate a gene expression temporally, spatially and in the desired magnitude. In most cases, the introduced genes have been constitutively expressed using the CaMV35S promoter obtained from the cauliflower mosaic virus. However, the development of novel plant transformation approaches (cisgenesis and intragenesis) imply the use of genetic material from the same species or from closely related species capable of sexual hybridization, which requires the isolation of genetic elements, including citros constitutive promoters. The objective of this study was clone and characterize Citrus sinensis constitutive promoters. For this, the promoter region of the genes Elongation Factor 1-α (CsEF1), Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase C2 (CsGAPC2) and Cyclofiline (CsCYC) was isolated and evaluated by fusion to the uidA reporter gene. The functionality of three promoter was confirmed by histochemical GUS assay in leaves, stems and roots of transgenic citrus plants cv. \'Hamlin\'. RT-qPCR analysis revealed that uidA gene expression under control of the CsCYC, CsGAPC2 and CsEF1 promoters was approximately 64%, 58% and 47% expression compared with the CaMV35S promoter. In silico analysis of the CsGAPC2, CsCYC and CsEF1 promoters displays their activity is controlled by a series of putative cis-regulatory elements. The full length promoter and truncated versions originated from deletions in promoters sequences were fused to the uidA gene and analyzed in Nicotiana benthamiana transgenic plants by histochemical and fluorimetric GUS assay. Deletion analysis did not cause loss of function on any of the promoters, but affected the gene expression on CsGAPC2 and CsEF1 truncated versions. The isolated promoters represent good candidates to be used in citros genetic transformation.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T08:56:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 275631.pdf: 2037598 bytes, checksum: ed89eee41c3c72dd65e94af601f4b2ed (MD5) / O objetivo dessa tese foi caracterizar a relação entre regulação no trabalho e processos de decisão na atividade dos Promotores de Justiça em Santa Catarina. Para tanto, partiu-se do pressuposto de que o processo de decisão e regulação são fenômenos complexos das condutas no trabalho, uma vez que o trabalhador realiza, continuamente, micro e macro decisões, com base num conjunto de regulações, influenciadas por variáveis contingenciais e pessoais e, principalmente, pelo significado atribuído ao conhecimento de um determinado problema. Em termos metodológicos, tratou-se de um estudo de caso, de natureza descritivaexploratória. Para coleta de dados, foram analisados documentos, observados os locais de trabalho e entrevistadas pessoas-chave da instituição visando à identificação dos fatores macro e micro organizacionais. concomitantemente, foi realizada uma sistematização da literatura especializada em base de dados nacionais e internacionais sobre processo decisório, processo de regulação e trabalho dos Promotores de Justiça. Também como técnica de coleta de dados, foi realizada a AET (Guérin et al, 2001), para compreensão da atividade de quatro Promotores da área criminal responsáveis pelas: primeira, segunda, terceira e décima primeira Promotoria de Justiça de uma das oito Comarcas de Entrância Especial. Quanto ao tratamento e análise dos dados coletados através das entrevistas, foi utilizada a técnica de análise de conteúdo, bem como sistematizados, sob a forma de esquemas, tabelas e quadros. Em relação aos resultados, verificou-se que o trabalho do Promotor reúne um conjunto de atividades que se desenrolam sob a base da coordenação e cooperação em um ambiente dinâmico e instável. Sua atividade, além de significar a plena expressão de processos psicológicos básicos a serviço do trabalho, está inserida num contexto que, em parte, a condiciona, por isso, incita, impõe escolhas e arbitragens por parte dos trabalhadores, requerendo a demonstração de competências e modulando seu modo operatório. Conclui-se, portanto, que o conjunto de decisão e regulação produz e, ao mesmo tempo, é produzido pelo modo operatório síntese do trabalho de cada Promotor. Seu processamento depende da idiossincrasia e da força das circunstâncias, configurando assim, uma marca, um estilo pessoal peculiar no âmbito do trabalho. Destarte, pode-se dizer que a regulação relaciona-se com um processo de natureza intrínseca, que serve para intermediar a decisão. A decisão se vincula com o produto do trabalho do Promotor, portanto, caracteriza-se como extrínseca e que requer uma expressão práxica mais efetiva. Infere-se que são processos dialéticos, uma vez que se regula para decidir e se decide porque regula. Assim, quanto melhor a variabilidade da regulação, maior a variabilidade das decisões. / The objective of this thesis was to characterize the relationship between regulation at work and decision processes in the activity of Prosecutors in Santa Catarina. To this end, we start with the assumption that the decision-making and regulation are complex phenomena of conduct at work, since the worker makes continuously micro and macro decisions, based on a set of regulations, influenced by contingency and personal variables and, especially, on the meaning attributed to the knowledge of a particular problem. In methodological terms, this was a case study, descriptive and exploratory. For data collection, documents were analyzed, observing the workplace and interviewed key personnel of the institution in order to identify macro and micro organizational factors. Concurrently, we conducted a systematic literature in the database on national and international decision-making, regulatory process and work of prosecutors. Also as a technique for data collection an Ergonomic Analysis of Labor was performed (Guerin et al, 2001), for understanding the activity of four prosecutors responsible for the criminal area: first, second, third and eleventh Prosecutor's Office of the eight Districts of Special Sub-division. As for the treatment and analysis of data collected through the interviews, we used the technique of content analysis, and systematized it in the form of diagrams and tables. Regarding results, it was found that the work of the Prosecutor presents a set of activities that take place on the basis of coordination and cooperation in a dynamic and unstable environment. The prosecutor´s activity, in addition to being the full expression of basic psychological processes of service work, is embedded in a context which, in part, depends and, therefore, encourages and requires choices and referrals by employees, demanding the demonstration of skills and modulating its operative mode. It follows, therefore, that the whole decision-making and regulation produce and, at the same time, is produced by the test procedure summary of the work of each promoter. Processing depends on the idiosyncrasies and the force of circumstances, thus creating a brand, a unique personal style in the work. Thus, one can say that the regulation relates to a process of nature, which serves to mediate the decision. The decision is linked with the work product of the Promoter, then, is characterized as extrinsic and an expression that requires more effective praxis. It is inferred that they are dialectical processes, since they regulate to decide and decide because they are regulated. Thus, the better the variability of regulation, the greater the variability of decisions.

Submitted by MÁRCIA HELENA OYAFUSO (marcia.oyafuso@yahoo.com.br) on 2017-02-14T15:13:10Z No. of bitstreams: 1 Tese Marcia Helena Oyafuso -repositório.pdf: 2219349 bytes, checksum: 6ffc6123e6fd4f3c4b83a56b1e422c1c (MD5) / Rejected by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido está sem a ficha catalográfica. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-02-16T12:40:24Z (GMT) / Submitted by MÁRCIA HELENA OYAFUSO (marcia.oyafuso@yahoo.com.br) on 2017-03-24T18:20:39Z No. of bitstreams: 1 Tese Marcia Helena Oyafuso 1 repositório.pdf: 2722784 bytes, checksum: 4fab9804151ec2c64fb7c538f9b80575 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-03-24T20:08:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 oyafuso_mh_dr_arafcf_par.pdf: 265942 bytes, checksum: de801e30b6be3831c4649a12e31f9b39 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T20:08:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oyafuso_mh_dr_arafcf_par.pdf: 265942 bytes, checksum: de801e30b6be3831c4649a12e31f9b39 (MD5) Previous issue date: 2016-01-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A administração de compostos na pele é dificultada principalmente pelo estrato córneo; dessa forma diversas técnicas químicas e físicas podem ser exploradas e combinadas de modo a vencer esta barreira. O acetato de dexametasona (DXM) é um potente antiinflamatório utilizado principalmente no tratamento de doenças inflamatórias e autoimunes que, embora muito utilizado, pode promover uma serie de efeitos colaterais sistêmicos. Dessa forma, sua aplicação tópica pode ser conveniente, de forma a localizá-lo no seu sítio de ação. O objetivo deste trabalho foi o desenvolvimento de sistemas líquido-cristalinos (SLC) estabilizados com polioxietileno 20 cetil éter como tensoativo utilizando diferentes fases oleosas: ácido oleico (AO), miristato de isoproprila (MI) e N metil pirrolidona (NMP), e posterior realização de ensaios de permeação cutânea in vitro e atividade anti-noceptiva in vivo. As amostras foram caracterizadas por microscopia de luz polarizada e espalhamento de raios-X a baixo ângulo, as quais resultaram em sistemas líquido-cristalinos de mesofases lamelares e hexagonais; estes sistemas apresentaram (G)’>(G”) nos estudos reológicos, indicando um comportamento predominantemente elástico. O ensaio de perfil de textura revelou que as amostras hexagonais constituídas por NMP e MI foram as que apresentaram maior adesividade e que as amostras lamelares foram mais bioadesivas. Os ensaios de liberação demonstraram que os sistemas lamelares liberaram maior porcentagem de fármaco em relação aos hexagonais . Nos ensaios de permeação cutânea, os resultados revelaram que o fármaco não permeou, porém alcançou a epiderme e derme para as formulações DAO22, DANMP22, DANMP23, DNMP23. O estudo da iontoforese demonstrou que a presença da corrente elétrica foi capaz de impulsionar o fluxo de permeação do fármaco. O ensaio in vivo demonstrou que os sistemas lamelares contendo AO + NMP e os hexagonais com a presença de MI apresentaram maior eficácia anti-nociceptiva comparado à formulação comercial. Sugere-se que os SLC desenvolvidos apresentam potencial para modular a permeação cutânea do DXM e que uso da iontoforese é capaz de aumentar o fluxo da permeação deste fármaco incorporados nos sistemas. / Administration of compounds in the skin is mainly hindered by stratum corneum. Thus, various chemical and physical techniques may be exploited and combined in order to overcome this barrier. Acetate dexamethasone (DXM) is a potent a nti-inflamatory and immunosuppressive primarily used in the treatment of inflammatory, autoimmune and allergic that although widely used, can promote a series of systemic side effects. Thus, topical application may be appropriate in order to find it on their site of action. The objective of this work was to develop liquid crystal systems (LCS) stabilized with polyoxyethylene 20 cetyl ether as surfactant using different oil phases: oleic acid (OA), isopropyl myristate (IM), N methyl pyrrolidone (NMP), and subsequent testing of skin permeation in vitro and in vivo anti-noceptiva activity.The samples were characterized by polarized light microscopy and SAXS, which showed the presence of liquid crystal systems of lamellar mesophases and hexagonal. These systems showed (G)’ > (G”) in rheology studies, indicating a predominantly elastic behavior. The texture profile test revealed that the hexagonal samples containing in its composition NMP and IM showed the highest adhesiveness and that the lamellar samples were more bioadhesive. Release tests showed that the lamellar systems release a higher percentage of drug when compared to the hexagonal systems.In cutaneous permeation tests, the results showed that the drug does not permeate, but reached the epidermis and dermis layers to the formulation (DAO22, DANMP22, DANMP23, DNMP23). The skin permeation with iontophoresis showed the presence of electric current was able to boost the drug permeation flux. The in vivo assay showed that the lamellar systems containing OA + NMP and the hexagonal with the presence of IM had higher antinociceptive effectiveness compared to the commercial formulation. It is suggested that the LCS developed in this work have the potencial to modulate the permeation of DXM and use of iontophoresis is capable of increasing the permeation flux of drug incorporated in the systems.

Objetivou-se avaliar a influência da monensina sódica sobre o acúmulo hepático de cobre em ovinos. Haja vista, que ionóforos podem alterar a absorção, disponibilidade e distribuição tecidual de minerais em muitos tecidos do organismo. Foram utilizados 24 ovinos mestiços das raças Santa Inês x Dorper com média de três meses de idade e peso medio de 30 kg ao início do experimento, que receberam dieta basal calculada em 2,75% do peso corpóreo, sendo 50% de concentrado comercial (7,13 ppm de Cu) e 50% de feno de capim coast-cross (3,72 ppm de Cu) e 10 gramas de sal mineral (5,9 ppm de Cu). Os cordeiros foram distribuídos em quatro grupos distintos, sendo: Controle apenas dieta basal; Monensina (Mon) - dieta basal e 30 ppm de monensina sódica; Cobre (Cu) - dieta basal acrescida de 10 mg/kg P.V./dia de cobre, na forma de sulfato de cobre pentahidratado; e grupo Monensina+Cobre (MonCu) - dieta basal acrescida de 10 mg/kg P.V./dia de cobre e 30 ppm de monensina sódica. O período experimental teve duração de 14 semanas. Foram coletadas amostras de figado e bile no início por biópsia, e ao final do experimento por necropsia, para determinação de minerais, assim como amostras semanais de sangue para avaliação bioquímica, hematológica e mineral. Foi realizada análise estatística por meio de fatorial 2x2 considerando como fatores a inclusão ou não de cobre e monensina na dieta. Somente um animal apresentou quadro clínico de intoxicação cúprica acumulativa. As concentrações de cobre no fígado no início do experimento variaram entre 243,8 e 345,4 ppm não havendo diferença entre os grupos experimentais. As concentrações médias e desvios-padrão em ppm do cobre hepático ao final do experimento foram 3.363 ± 576 para o grupo MonCu; 2560 ± 524 para o grupo Cu; 562 ± 168 para o grupo Mon e 253 ± 131 para o grupo Controle. Ao final do estudo a concentração de cobre hepático foi influenciada pela suplementação com cobre (P = 0,0001) e monensina (P = 0,0003). Os grupos suplementados com cobre tiveram redução dos teores de ferro hepático (P = 0,0287) e aumento das concentrações de cobre na bile. A avaliação bioquimica demonstrou elevação da atividade sérica da GGT e AST (P < 0,05) nos grupos Cu e MonCu a partir da décima primeira semana do experimento em relação aos grupos Controle e Mon. O aumento da atividade destas enzimas foram influenciadas pela suplementação de cobre (P = 0,0340), enquanto os grupos suplementados com monensina apresentaram menores valores de creatinina quinase. Os resultados obtidos permitem concluir que a monensina interfere positivamente com o acúmulo hepático de cobre sendo que a sumplentação deste aditivo pode predispor a quadros de intoxicações cúprica em ovinos. / The aim of this study was to verify if monensin can change the accumulation of cooper in the liver of sheep, in view of ionophores can alter the absorption, availability, tiissue distribution of many minerals in the body. Twenty four crossbred Dorper X Santa Inês lambs wiht mean age of 3 months and wheitgh 30 kg at the begining of trial recived a basal diete calculated by 2,75% of body wheigth of 50% concentrade (7,13 ppm of Cu) and 50% cost-cross hay (3,72 ppm of Cu) and 10 g of mineral salt (5,9 ppm of Cu). Lambs were randomly distributed in four groups: Control: basal diet, Mon Group reciving basal diet plus 30 mg of monensin; Cu group: basal diet plus 10 mg Cu B.W of CuSO4.5H2O solution; Group CuMon: basal diet plus 30 mg of monensin and 10 mg of Cu B.W. The exeperimental period lasted for fourteen weeks. Liver samples were obtined by liver biopsy initially and at the end by necropsy when lambs were slaughterd. Blood samples were obtained weekly for determination of biochemical, hematological and mineral. Statistical analysis using a 2x2 factorial was conducted considering the factors copper and monensin in the diet and the interaction between them to evaluate the hepatic copper at the beginning and at the end of the study. Only one of animal of group MonCu exhibit clinical sings of copper toxicosis. Copper concentrations in the liver at the beginning of the experiment ranged between 243,8 and 345,4 ppm with no difference between experimental groups. Mean concentrations and standard deviations in ppm of hepatic copper at the end of the experiment were 3,363 ± 576 for MonCu group; 2560 ± 524 for Cu group; 562 ± 168 for the Mon group and 2538 ± 131 for the control group. At the end of the study liver concentrations and total hepatic copper accumulation were influenced both by the amount of dietary copper (P = 0.0001) and of monensin (P = 0.0003). The groups supplemented with copper had reduced levels of hepatic iron (P = 0.0287) and increased concentrations of copper in the bile. The biochemical evaluation demonstrated elevated serum AST and GGT activity (P <0.05) with Cu and MonCu from the eleventh week of the experiment compared to the control groups and Mon. The increased activity of these enzymes were influenced by copper supplementation (P = 0.0340), while group monensin had lower values of creatinine kinase. The results indicate that monensin interferes positively with hepatic copper accumulation and supplementation of this additive can predispose cupric poisoning in sheep.

Submitted by JULIANA SILVA RODRIGUES CABRAL null (jsrcabral@gmail.com) on 2016-08-30T23:49:11Z No. of bitstreams: 1 TESE - JULIANA SILVA RODRIGUES CABRAL.pdf: 1613065 bytes, checksum: 9d267faa19bdb0318205440f3bd75671 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-08-31T18:43:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 cabral_jsr_dr_ilha.pdf: 1613065 bytes, checksum: 9d267faa19bdb0318205440f3bd75671 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-31T18:43:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cabral_jsr_dr_ilha.pdf: 1613065 bytes, checksum: 9d267faa19bdb0318205440f3bd75671 (MD5) Previous issue date: 2016-07-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) se destaca entre as árvores frutíferas nativas do cerrado como uma das mais promissoras para programas de exploração sustentável. Apesar do potencial econômico, a falta de informações sobre esta cultura vem restringindo seu cultivo comercial. A propagação sexuada desta espécie é dificultada, pois suas sementes têm curta longevidade e a redução do teor de água prejudica sua viabilidade e vigor. A técnica de micropropagação possibilita a multiplicação em massa de mudas com características geneticamente superiores, uniformes, em espaço físico reduzido e curto período de tempo. Entretanto, ela elimina os microrganismos associados ao tecido vegetal, incluindo mutualistas como os fungos micorrízicos arbusculares (FMA), além dos promotores de crescimento vegetal, que podem melhorar o desempenho da planta sob condições de estresse, além de aumentar o rendimento. A inoculação destes microrganismos durante a micropropagação tem sido recomendada para reduzir o tempo de formação das mudas e de aclimatização, aumentar a tolerância a estresses bióticos e abióticos, resistência a patógenos e porcentagem de sobrevivência das mudas após o transplante. Objetivou-se com este trabalho a aclimatização de plantas micropropagadas de mangabeira com diferentes substratos e câmara úmida, inoculadas com fungos promotores do crescimento vegetal (FPCV) in vitro e ex vitro, associados com o FMA Glomus clarum, em casa de vegetação, para maximizar a produção de mudas a serem utilizadas em programas de formação de pomares e reflorestamento. Os experimentos foram conduzidos na UNESP - Universidade Estadual Paulista, Campus de Ilha Solteira e Instituto Federal Goiano – Campus Rio Verde (IF Goiano – Campus Rio Verde). O material vegetal utilizado na propagação in vitro foi retirado de frutos de diferentes plantas de mangabeira coletados na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da UNESP Campus Ilha Solteira e na Fazenda Gameleira, município de Montes Claros de Goiás - GO. Todos os experimentos foram realizados e conduzidos por 120 dias. A associação do saco plástico como câmara úmida com o substrato Bioplant®, seguido da pulverização de FPCV e inoculação do G. clarum é o método mais adequado para aclimatização de plantas micropropagadas de mangabeira, em casa de vegetação. / Mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) stands out among the native fruit trees of the Cerrado as one of the most promising for sustainable exploitation programs. Despite the economic potential, lack of information about this culture is limiting its commercial cultivation. The sexual propagation of this species is difficult as its seeds have a short longevity, and reduced water content impairs their viability and vigor. The micropropagation technique enables the mass multiplication of plants with genetically superior features, uniform, in a reduced physical space and a short length of time. However, it eliminates the microorganisms associated with plant tissue, including mutualistcs, as mycorrhizal fungi (AMF), in addition to plant growth promoters, which can improve plant performance under stress conditions, and increase the yield. Inoculation of these microorganisms during micropropagation has been recommended to reduce the time of seedlings formation and acclimatization, and to increase tolerance to biotic and abiotic stresses, resistance to pathogens and percentage of seedling survival after transplantation. This study aimed the acclimatization of micropropagated plants with different substrates and moister chamber, inoculated with plant growth-promoting fungi (PGPF) vitro and ex vitro, associated with AMF Glomus clarum, in a greenhouse, to maximize seedlings production to be used in the mangabeira and reforestation programs. Experiments were conducted at UNESP- Universidade Estadual Paulista, Ilha Solteira Campus, and Federal Institute Goiano - Rio Verde Campus (IF Goiano - Campus Rio Verde). The plant material used in the in vitro propagation was removed from fruits of different mangabeira plants collected in Teaching, Research and Extension Farm of the UNESP Ilha Solteira Campus and Gameleira Farm, Montes Claros de Goiás-GO. All experiments were performed and conducted for 120 days. The association of plastic bag as a moist chamber with Bioplant® substrate, followed by spray PGPF and inoculation of G. clarum is the most appropriate method for acclimatization of micropropagated plants mangabeira in the greenhouse. The association of plastic bag as moist chamber with Bioplant® substrate, followed by spray PGPF and inoculation of G. clarum is the most appropriate method for acclimatization of micropropagated of mangabeira plants in the greenhouse. / FAPESP: 2012/14489-9

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-22Bitstream added on 2014-06-13T19:59:11Z : No. of bitstreams: 1 teixeira_dmf_me_botfmvz.pdf: 227151 bytes, checksum: 465fea91869886c5190fbb61d8e36275 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / No presente estudo foram avaliadas carcaças de frangos convencionais (originárias de aves que recebem promotores de crescimento) e alternativos (que não recebem promotores de crescimento), com o objetivo de: a) avaliar o efeito da não utilização de tais drogas sobre a prevalência de Salmonella spp. em frangos alternativos, comparando-a com a dos convencionais; b) determinar e comparar o perfil de resistência a antimicrobianos das cepas de Salmonella spp. isoladas de ambos os tipos de frangos; c) avaliar o efeito das operações de abate sobre a contaminação das carcaças, tanto em frangos convencionais quanto nos alternativos. Foram avaliadas 50 carcaças convencionais e 48 alternativas, as quais apresentaram prevalências de Salmonella spp. de 58% e 56,3%, respectivamente, ao longo da linha de abate. Na entrada dos frangos no abatedouro, não houve diferença significativa (p > 0,05) nas prevalências entre os dois grupos testados (38% nos convencionais e 47,9% nos alternativos), sendo que ao final do processamento os convencionais apresentaram 47,9% de positividade contra 14,6% dos alternativos, diferença essa significativa (p < 0,05). S. Enteritidis foi o sorotipo predominante entre as cepas identificadas. Quanto ao perfil de resistência, nossos resultados mostraram que, quando observada, ela foi maior nas cepas oriundas dos frangos convencionais. Conclui-se que: a) a não utilização dos promotores de crescimento não levou a um aumento da prevalência de Salmonella spp. nas aves alternativas; b) as cepas oriundas de frangos alternativos revelaram uma tendência a um menor nível de resistência aos antimicrobianos testados quando comparadas às dos convencionais; c) as operações de abate, no caso das aves alternativas, foram responsáveis por uma diminuição na contaminação inicialmente observada no tocante à Salmonella spp, sendo que no caso das convencionais, pelo seu aumento. / Conventional chicken (receiving growth promoters) and alternative chickens (not receiving growth promoters) carcasses had been valuated in the present study, with the following objectives: a) to estimate the effect of no utilization of such drugs on the prevalence of Salmonella spp. in alternative chicken as compared to that of the conventional ones; b) to determine and to compare the resistance profile to antimicrobial agents of Salmonella spp. strains isolated from both types of chickens; c) to valuate the effect of the slaughter operations on the carcasses contamination in conventional chickens and in alternative ones. Fifty conventional and 48 alternative carcasses had been valuated, with Salmonella spp. prevalences of 58% and 56.3%, respectively, along the slaughter line. At the entry of the chickens in the slaughter-house there was no significant difference (p > 0.05) in the prevalences between the two tested groups (38% in the conventional and 47,9% in the alternative), at the end of the processing the conventional presenting 47,9% of positiveness compared to 14,6% of the alternative, this difference being significant (p < 0,05). S. Enteritidis was the predominant serotype among the identified strains. In relation to the resistance profile, our results showed that when it had been observed, it was larger in the strains originated from the conventional chicken. It had been concluded that: a) the removal of the growth promoters did not produce an increase in the Salmonella spp. prevalence in the alternative chicken; b) the strains originated from alternative chicken showed a trend toward a smaller resistance level to the tested antimicrobial agents compared to those from the conventional ones: c) the slaughter operations in the case of the alternative chickens were responsible for a decrease in the contamination initially observed regarding Salmonella spp. and for its increase in the case of the conventional.

Orientador: Ana Maria Rodrigues Cassiolato / Resumo: A mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) se destaca entre as árvores frutíferas nativas do cerrado como uma das mais promissoras para programas de exploração sustentável. Apesar do potencial econômico, a falta de informações sobre esta cultura vem restringindo seu cultivo comercial. A propagação sexuada desta espécie é dificultada, pois suas sementes têm curta longevidade e a redução do teor de água prejudica sua viabilidade e vigor. A técnica de micropropagação possibilita a multiplicação em massa de mudas com características geneticamente superiores, uniformes, em espaço físico reduzido e curto período de tempo. Entretanto, ela elimina os microrganismos associados ao tecido vegetal, incluindo mutualistas como os fungos micorrízicos arbusculares (FMA), além dos promotores de crescimento vegetal, que podem melhorar o desempenho da planta sob condições de estresse, além de aumentar o rendimento. A inoculação destes microrganismos durante a micropropagação tem sido recomendada para reduzir o tempo de formação das mudas e de aclimatização, aumentar a tolerância a estresses bióticos e abióticos, resistência a patógenos e porcentagem de sobrevivência das mudas após o transplante. Objetivou-se com este trabalho a aclimatização de plantas micropropagadas de mangabeira com diferentes substratos e câmara úmida, inoculadas com fungos promotores do crescimento vegetal (FPCV) in vitro e ex vitro, associados com o FMA Glomus clarum, em casa de vegetação, para maximizar a produção de mudas ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) stands out among the native fruit trees of the Cerrado as one of the most promising for sustainable exploitation programs. Despite the economic potential, lack of information about this culture is limiting its commercial cultivation. The sexual propagation of this species is difficult as its seeds have a short longevity, and reduced water content impairs their viability and vigor. The micropropagation technique enables the mass multiplication of plants with genetically superior features, uniform, in a reduced physical space and a short length of time. However, it eliminates the microorganisms associated with plant tissue, including mutualistcs, as mycorrhizal fungi (AMF), in addition to plant growth promoters, which can improve plant performance under stress conditions, and increase the yield. Inoculation of these microorganisms during micropropagation has been recommended to reduce the time of seedlings formation and acclimatization, and to increase tolerance to biotic and abiotic stresses, resistance to pathogens and percentage of seedling survival after transplantation. This study aimed the acclimatization of micropropagated plants with different substrates and moister chamber, inoculated with plant growth-promoting fungi (PGPF) vitro and ex vitro, associated with AMF Glomus clarum, in a greenhouse, to maximize seedlings production to be used in the mangabeira and reforestation programs. Experiments were conducted at UNESP- Universidad... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:56:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MeikaIM.pdf: 766418 bytes, checksum: 87a604688aa5cd2c4f6aba8237c67210 (MD5) Previous issue date: 2005-12-13 / One of the most important goals of bioinformatics is the ability to identify genes in uncharacterized DNA sequences on world wide database. Gene expression on prokaryotes initiates when the RNA-polymerase enzyme interacts with DNA regions called promoters. In these regions are located the main regulatory elements of the transcription process. Despite the improvement of in vitro techniques for molecular biology analysis, characterizing and identifying a great number of promoters on a genome is a complex task. Nevertheless, the main drawback is the absence of a large set of promoters to identify conserved patterns among the species. Hence, a in silico method to predict them on any species is a challenge. Improved promoter prediction methods can be one step towards developing more reliable ab initio gene prediction methods. In this work, we present an empirical comparison of Machine Learning (ML) techniques such as Na??ve Bayes, Decision Trees, Support Vector Machines and Neural Networks, Voted Perceptron, PART, k-NN and and ensemble approaches (Bagging and Boosting) to the task of predicting Bacillus subtilis. In order to do so, we first built two data set of promoter and nonpromoter sequences for B. subtilis and a hybrid one. In order to evaluate of ML methods a cross-validation procedure is applied. Good results were obtained with methods of ML like SVM and Na?ve Bayes using B. subtilis. However, we have not reached good results on hybrid database / Um dos grandes desafios da Bioinform?tica ? manipular e analisar os dados acumulados nas bases de dados mundiais. A express?o dos genes em procariotos ? iniciada quando a enzima RNA polimerase une-se com uma regi?o pr?xima ao gene, chamada de promotor, onde ? localizado os principais elementos regulat?rios do processo de transcri??o. Apesar do crescente avan?o das t?cnicas experimentais (in vitro) em biologia molecular, caracterizar e identificar um n?mero significante de promotores ainda ? uma tarefa dif?cil. Os m?todos computacionais existentes enfrentam a falta de um n?mero adequado de promotores conhecidos para identificar padr?es conservados entre as esp?cies. Logo, um m?todo para prediz?-los em qualquer organismo procari?tico ainda ? um desafio. Neste trabalho, apresentamos uma compara??o emp?rica de t?cnicas individuais de aprendizado de m?quina, tais como: Classificador Bayesiano Ing?nuo, ?rvores de Decis?o, M?quinas de Vetores de Suporte, Redes Neurais do tipo VotedPerceptron, PART e k-Vizinhos Mais Pr?ximos e sistemas multiclassificadores (Bagging e Adaboosting) e Modelo Oculto de Markov ? tarefa de predi??o de promotores procariotos em Bacilos subtilis. Utilizamos a valida??o cruzada para avaliar todos os m?todos de AM. Para esses testes, foram constru?das base de dados com seq??ncias de promotores e n?o-promotores do Bacillus subtilis e uma base de dados h?brida. Os m?todos de AM obtiveram bons resultados com o SVM e o Na?ve Bayes. N?o conseguimos entretanto, obter resultados relevantes para a base de dados h?brida

The task of the university professor is a mission and not simply a profession and that is why higher education should be impregnated with values. Nowadays education is articulated into three areas: the State, the Market and the Volunteering, but no one of these three sectors by themselves has covered the needs of all the citizens, there have always been losers, therefore the conjunction of the three sectors became necessary. Communitarianism promotes an ethical-social pact that favors the progress of society without nullifying the individual dimension. It believes that the university is the space where a communitarian consciousness should be promoted to generate a social capital by means of education and it is a privilege place to substantiate the moral identity of the person beginning with the commitment of the professor with the university student. / El quehacer del profesor universitario es misión y no simplemente profesión, por ello la educación superior debe estar impregnada de valores. En la actualidad la educación se articula en tres vertientes: el Estado, el mercado, el voluntariado, pero ninguno de estos tres sectores por separado ha cubierto nunca las necesidades de todos los ciudadanos, siempre ha habido perdedores, haciéndose necesaria la conjunción de los tres sectores. El comunitarismo promueve un pacto socialético que favorezca el progreso de la sociedad sin anular la dimensión individual. Entiende que la universidad es el espacio donde se debe propiciar una conciencia comunitaria para la generación del capital social a través de la docencia, lugar privilegiado para fundamentar la identidad moral de la persona partiendo del compromiso del docente con el universitario.

A cana-de-açúcar é uma gramínea com fotossíntese do tipo C4, com capacidade de acumular sacarose nos colmos em quantidades que excedem 50% de seu peso seco, característica única no reino vegetal (Moore, 1995). Sacarose e seu derivado mais importante, etanol, são dois produtos de grande importância mundial. Assim, o teor de sacarose em cana tem fundamental importância no aumento da produtividade dessas duas commodities. O melhoramento clássico parece ter alcançado seu limite, já que incrementos expressivos no teor de sacarose em novas variedades não têm sido observados e tudo aponta para a necessidade de estudos que levem a uma maior compreensão dos mecanismos moleculares associados à produção, transporte e acúmulo de sacarose em cana (Casu et al., 2005; Moore, 1995). Procurar seqüências promotoras de genes de interesse é importante para a obtenção de transgênicos, já que promotores constitutivos não apresentam resultados satisfatórios em cana (Lakshmanan et al., 2005). É também objetivo aqui hibridar mRNA de genótipos de cana-de-açúcar com segregação para acúmulo de sacarose, em uma plataforma customizada de oligos (Agilent), com aproximadamente 44k elementos, que compõe uma representatividade gênica não alcançada em esforços anteriores com microarranjos de cDNA. Genome walking foi a técnica utilizada na obtenção de regiões à montante do primeiro éxon, predito in silico, para três proteínas quinase de interesse, SASGMS11561, SASGMS16343 e SASGMS09047, que se mostraram moduladas em experimentos anteriores de hibridação com amostras segregantes para conteúdo de sacarose. Foi obtido sucesso nos três casos, tendo os fragmentos de DNA sido seqüenciados e oportunamente alinhados à montante dos correspondentes genes ortólogos em sorgo, bem como ao banco ainda em construção de contigs do genoma de cana-de-açúcar, obtidos por shotgun. A plataforma Agilent, com seus 43803 SAS únicos, mostrou-se uma ferramenta muito adequada para as hibridações de genótipos de mais alto Brix contra genótipos de mais baixo Brix. Um total de 569 genes diferencialmente expressos foram obtidos em pelo menos uma das três hibridações realizadas. Um grupo de genes, de diferentes categorias e perfis de modulação, foi validado por PCR em tempo real, obtendo uma taxa de aproximadamente 90%. Apesar do grande número de SAS diferencialmente expressos, por volta de 70% dos mesmos ainda se encontram não categorizados, seja por falta de similaridade de seqüência em bancos de dados de organismos próximos ou pela alta complexidade e esforço prático na cura desse processo de categorização manual. Assim, três fragmentos de seqüências promotoras para três proteínas quinase de interesse foram obtidos e seqüenciados, como parte dos esforços do grupo em formar um catálogo de promotores específicos para cana-de-açúcar. Um grupo de genes foi analisado dos resultados das hibridações por seus papéis relevantes nos processos que levam ao maior teor de sacarose em cana, devidamente corroborados por trabalhos do próprio grupo, bem como de outros / Sugarcane is a C4 plant with the unique characteristic of being capable of accumulating sucrose in its culms in quantities that exceed 50% of its dry weight (Moore, 1995). Sucrose and ethanol are highly valued products in the world of today. Sucrose content is a trait with fundamental importance in the on-going process of increasing productivity of these two sugarcane byproducts. Classic improvement of sugarcane seems to have reached its practical limits, given that it has become increasingly harder to obtain varieties with increased sugar content. This obstacle points towards the necessity of better comprehension of the molecular mechanisms associated to the production, transport and accumulation of sucrose in sugarcane (Casu et al., 2005; Moore, 1995). The search for promoter sequences of genes of interest is crucial for the production of transgenic lines, since the use of constitutive promoters in sugarcane has been highly problematic, leading to unsatisfactory results in most cases (Lakshmanan et al., 2005). Another objective was to hybridize sugarcane genotypes with contrasting sugar content in a customized Agilent oligo platform, containing approximately 44k elements, which signifies the best effort so far regarding gene representativeness. Genome walking was the chosen technique to obtain upstream regions of the first in silico predicted exon of three proteins kinases of interest, SASGMS11561, SASGMS16343 and SASGMS09047, all of them selected from previous hybridization experiments with contrasting sucrose content samples. Success was achieved in all three cases, and the obtained fragments were sequenced and aligned to their respective syntenic region on the sorghum genome as well as on contigs from an increasingly larger bank of genomic sugarcane sequences, from our group, which has been acquired using the shotgun sequencing method. The Agilent platform, with its 43803 unique sugarcane assembled sequences (SAS), has proven valuable as a powerful high scale tool for the hybridization of genotypes with contrasting Brix values (high versus low Brix). A total of 569 differentially expressed genes were obtained from at least one of the three experiments accomplished. A group of genes from different categories and modulation profiles was depicted and validated through real time PCR, with an approximate validation rate of 90%. Although the number of differentially expressed genes is high, around 70% of them is still uncategorized, mostly because of their unique identity and therefore lack of reference organisms to compare with and the high complexity and laboriousness of categorizing them manually. In summary, three promoter fragments from three different protein kinases of interest were obtained and sequenced, as a part of a greater effort to create a sugarcane promoter sequence catalogue. From the hybridization assays, a group of genes were analyzed, due to their putative importance in the processes that lead to a higher sucrose content in sugarcane, also corroborated by previous studies from our group as well as from others.