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Aspectos fenotípicos e moleculares da adesão e atividade enzimática de Candida sp isoladas de pacientes com sinais clínicos de candidíase oral / Phenotypic and molecular aspects of adhesion and enzymatic activity of Candida sp recovered from patients with clinical signs of oral candidiasis

Karen Regina Carim da Costa 19 November 2009 (has links)
O amplo espectro da candidíase e respectiva importância clínica da infecção impulsionam as pesquisas que visam esclarecer os mecanismos de patogenicidade e identificação dos fatores de virulência de Candida sp. Portanto, o objetivo deste estudo foi verificar através de testes fenotípicos e moleculares a capacidade de adesão, atividade de proteases e variabilidade genética de isolados clínicos de C. albicans e C. tropicalis. A capacidade de adesão às glicoproteínas de matriz extracelular laminina e fibronectina foi avaliada utilizando-se a técnica de ELISA (Enzyme-linked imunosorbent assay). A pesquisa de proteases foi realizada pelos métodos semiquantitativo, em placa de ágar com albumina bovina, e quantitativo, em solução-tampão com hemoglobina. A presença dos genes ALS2, ALS3, SAP1, SAP3 e PLB1 foi verificada pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e os polimorfismos intra e interespécies pela técnica do DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso (RAPD). Todos os isolados de C. albicans e C. tropicalis apresentaram ligação a laminina e a fibronectina imobilizadas. Os isolados Ca33 e Ct13 apresentaram índice de adesão relativa significativamente maiores em relação aos demais isolados para as duas glicoproteínas (p < 0,001). A atividade de proteases foi observada em todos os isolados de C. albicans tanto pelo método semiquantitativo quanto pelo método quantitativo. A atividade de proteases dos isolados de C. tropicalis foi melhor evidenciada através do método quantitativo. A amplificação de fragmentos dos genes relacionados à adesão (ALS2 e ALS3), atividade de proteases (SAP1 e SAP3) e fosfolipase (PLB1) foi observada em todos os isolados de C. albicans. Os isolados de C. tropicalis não apresentaram produtos de amplificação para os genes pesquisados. A variabilidade genética avaliada pela técnica do RAPD revelou uma população heterogênea em ambas as espécies. No entanto, C. tropicalis apresentou maior diversidade genética que C. albicans. / The wide spectrum of candidiasis and its clinical importance encourage the research with the purpose of clarifying the mecanisms of pathogenicity and identification of virulence factors of Candida sp. Therefore, the aim of this study was to verify through phenotypic and molecular assays the adhesion, enzymatic activity e genetic variability of clinical C. albicans and C. tropicalis isolates. The adhesion ability to the extracellular matrix glycoproteins laminin and fibronectin was evaluated using the ELISA technique (Enzyme-linked imunosorbent assay). The research of proteases was carried out in agar plate containing bovine albumin and through a quantitative method in buffer solution containing hemoglobin. The presence of ALS2, ALS3, SAP1, SAP3 and PLB1 was verified using polimerase chain reaction (PCR) and intra and interespecies polimorphisms through Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. All C. albicans and C. tropicalis isolates binded to immobilized laminin and fibronectin. Ca33 and Ct13 isolates had relative adhesion index significantly higher than the other isolates for both glycoproteins (p < 0,001). Protease activity was observed in all isolates of C. albicans using either the semi-quantitative or quantitative assay. The protease activity of C. tropicalis was better detected through the quantitative assay. The amplification of genes related to adhesion (ALS2 and ALS3), proteases (SAP1 and SAP3) and phospholipase (PLB1) activity using PCR was observed in all C. albicans strains. PCR amplification products were not observed in C. tropicalis isolates for the researched genes. The genetic variability by RAPD revealed an heterogeneous population in both species. Nevertheless, C. tropicalis presented higher genetic variability than C. albicans strains.
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Citotaxonomia do gênero Mimosa L. e variabilidade molecular em Mimosa scabrella Benth. / Cytotaxonomy of the genus Mimosa L. and molecular variability in Mimosa scabrella Benth

Dahmer, Nair January 2011 (has links)
O gênero Mimosa, dividido nas seções Mimadenia, Batocaulon, Calothamnos, Habbasia e Mimosa, possui cerca de 530 espécies, e, destas, cerca de 490 ocorrem nas Américas, ocupando diferentes tipos de habitats. No Brasil, ocorrem principalmente no Cerrado, uma zona de alta biodiversidade. Muitas espécies de grande importância econômica e, dentre elas, destaca-se M. scabrella, arbórea nativa da região Sul do Brasil. Apesar da grande importância do gênero, poucos são os estudos de citogenética. Portanto, o objetivo maior do presente trabalho foi determinar o número cromossômico de um grande número de espécies de Mimosa e tentar estabelecer relações entre distribuição dos níveis de ploidia com posição taxonômica, filogenética e distribuição geográfica. O outro objetivo foi de analisar um grande número de populações de M. scabrella, da região Sul do Brasil, quanto ao número cromossômico e caracterizar sua variabilidade utilizando marcadores moleculares do tipo RAPD. Os resultados, que aumentaram o número de determinações de número cromossômico para o gênero de 10% para mais de 20% dos táxons, são inéditos para 83% das espécies estudadas. O nível diplóide, 2n=2x=26, foi verificado em 76% das espécies. Das demais espécies, 24% são tetraplóides (2n=4x=52), e uma triplóide (2n=3x=39). Variabilidade intraespecífica, com acessos di e tetraplóides, foi verificada em M. pigra var. dehiscens, M. setosa var. paludosa e M. somnians. Com exceção de Mimadenia, onde só uma espécie foi estudada, poliplóides estão presentes em todas as seções taxonômicas. Os resultados indicam que o número cromossômico não é uma característica citotaxonômica distintiva e a poliploidia não foi um fator decisivo para a evolução deste gênero. Células polissomáticas, em ponta de raiz, foram observadas em 43 espécies, com freqüência que variou de 3 a 86%, mas somente logo após a germinação das sementes, não sendo verificado em plantas adultas, sugerindo que a polissomatia parece estar relacionada com um rápido desenvolvimento e estabelecimento da plântula, logo após a germinação. As 25 populações de M. scabrella estudadas foram todas tetraplóides. O resultado da análise molecular RAPD mostrou que a similaridade genética média entre as populações variou de 0,18 a 0,48, indicando grande variabilidade interpopulacional. Os resultados deste trabalho representam uma importante contribuição para um melhor conhecimento do gênero Mimosa. / The genus Mimosa, divided in sections Mimadenia, Batocaulon, Calothamnos, Habbasia and Mimosa, has around 530 species and, from these, approximately 490 occur in the Americas , in a wide range of habitats. In Brazil, they occur mainly in the Cerrado, an area of high biodiversity. Many species are of great economic importance, and among them is M. scabrella, a tree native to southern Brazil. Despite the great importance of the genus, cytogenetic studies are few. Therefore, the main objective of this work was to determine chromosome numbers is a great number of Mimosa species and try to correlate ploidy levels with taxonomic and phylogenetic position and geographic distribution.The other objective was to analyze a great number of M. scabrella populations from southern Brazil regarding chromosome number and genetic variability using RAPD markers. The results, that increased the number of chromosome number determinations for the genus from 10% to more than 20% of the taxa are original for 83% of the studied species. The diploid level 2n=2x=26, was verified in 76% of the species. Among the others, 24% are tetraploid (2n=4x=52), and one triploid (2n=3x=39). Intraspecific variability, with diploid and tetraploid accessions, was found in M. pigra var. dehiscens, M. setosa var. paludosa and M. somnians. With the exception of Mimadenia section, with only one species studied, polyploids occur in all the taxonomic sections. The results indicate that chromosome number is not a distinctive cytotaxonomic characteristic and that polyploidy was a decisive factor in the genus evolution. Polysomatic root-tip cells were found in 43 species, ranging from 3 to 86%, but only soon after seed germination and not in adult plants, suggesting that polysomaty is related to a rapid seedling development and establishment after germination. The 25 M. scabrella populations studied were all tetraploid. RAPD molecular analysis disclosed an average similarity index among populations ranging from, 0.18 to 0.48, indicating great interpopulational variability. The results of this work represent an important contribution to a better knowledge of genus Mimosa.
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Caracterização morfológica e molecular da coleção básica de trevo-branco (Trifolium repens L.)

Bortolini, Fernanda January 2004 (has links)
O objetivo deste trabalhofoi avaliarcaracterísticas moleculares e morfológicasde 79 acessos pertencentes à coleção básica de trevo-branco obtida do Departamento de Agricultura dos Estados Unidos(USDA), a fim de caracterizar a variabilidade genética existente.
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Distribuição de polimorfismos de base única (SNPs) em genes relacionados à infecção pelo HIV-1 em uma população do Nordeste Brasileiro

Silva, Ronaldo Celerino da 04 March 2015 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2015-05-14T16:07:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Ronaldo Celerino_Biblioteca.pdf: 11538818 bytes, checksum: bb7cc47b8cb9d49a4b1e691267ae2ff3 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-14T16:07:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Ronaldo Celerino_Biblioteca.pdf: 11538818 bytes, checksum: bb7cc47b8cb9d49a4b1e691267ae2ff3 (MD5) Previous issue date: 2015-03-04 / CAPES, CNPq / A variabilidade genética humana tem desempenhado um papel importante para a compreensão de mecanismos envolvidos na susceptibilidade à infeção pelo HIV-1. O presente trabalho avaliou as distribuições de polimorfismos de base única (SNPs) em genes humanos relacionados à entrada (CCL3, CCL4, CCL5, CXCL12, CXCR6) e à replicação viral (APOBEC3G, CUL5, TRIM5, HLA-C e ZNRD1), e suas prováveis associações com a modulação da susceptibilidade à infecção pelo HIV-1 em uma população do Nordeste brasileiro (Recife-Pernambuco), a fim de estabelecer um modelo imunogenético de susceptibilidade ao HIV-1. Foi desenvolvido um estudo tipo caso-controle, utilizando pacientes infectados (HIV-1+) e controles saudáveis, os quais foram genotipados para 18 SNPs em genes reconhecidamente envolvidos na entrada e na replicação viral. Verificou-se que variantes nos genes CCL3 (rs1719134), CCL4 (rs1719153), TRIM5 (rs10838525) e CUL5 (rs11212495) foram mais frequentes em controles saudáveis; enquanto variantes em APOBEC3G e ZNRD1 (rs3869068) foram mais frequentes em pacientes HIV-1+, sugerindo, respectivamente, proteção e susceptibilidade à infecção pelo HIV-1 na população pernambucana. Neste sentido, sugere–se que SNPs em genes relacionados com a entrada e a replicação viral podem modular a susceptibilidade a infecção pelo HIV-1.
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Ecologia e conservação dos testudines, Nordeste do Brasil

MOURA, Carina Carneiro de Melo 26 February 2013 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-19T15:39:02Z No. of bitstreams: 1 Carina Carneiro de Melo Moura.pdf: 2573558 bytes, checksum: 252687e022e5525fdfa76d18da7b8ef2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-19T15:39:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carina Carneiro de Melo Moura.pdf: 2573558 bytes, checksum: 252687e022e5525fdfa76d18da7b8ef2 (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Studies that aimed investigating the ecology and genetic diversity of populations of Testudines are essential to evaluate the response of aquatic communities of Testudines to human impacts and changes in the habitats of these animals. Research on this subject are few in the ecosystem of Caatinga and Atlantic Forest. Thus, in order to fill a gap in knowledge about these species, the present study aimed to investigate the conservation status of the Testudines populations located in the area of morphoclimatic Caatingas, Environmental Protection Area in the Araripe, Semi Arid region, Ceará, Northeast Brazil, regarding their population structure and genetic heterogeneity, and compile scientific actions related to the subject Testudines in northeastern Brazil. We used two traps convergence specific to clade Testudine called Covo (trap with bait), six days a month, for one year (August 2011 to July 2012). Each specimen captured was marked, sexed, had registered their biometric data and biological samples were collected for genetic analysis. For comparison of the genetic variability of populations of P. geoffroanus were used samples of Testudines collected at two points domain morphoclimatic Atlantic Forest, the Forest of Privê in Camaragibe and the Forest of Rio Paratibe in Paulista. Were captured in the area of Caatinga 63 individuals representing three species, 44 of Phrynops geoffroanus, nine of Kinosternon scorpioides and ten of Mesoclemmys tuberculata. Population size estimated by the Jolly-Seber method was 49.28±11 for K. scorpioides, 56±16.3 for M. tuberculata and 301.5 ± 67.09 for P. geoffroanus.The index of sexual dimorphism calculated the mean carapace of males and females was 1.06 (diverted for females) for P. geoffroanus and 1.04 (deflected males) for K. scopioides. We could not infer about sexual dimorphism and sex ratio for the species M. tuberculata, because only females were captured. Analysis of genetic diversity showed that the population of Caatinga showed similar genetic diversity of the populations of Atlantic forest, with genetic distance no significantly different between groups (Caatinga and Atlantic Forest), which may be the result probably of a population explosion or intense flow gene, demonstrating that despite the adverse conditions of the semi arid, the population studied in this environment presents similar adaptive capacity that populations of Atlantic Forest. / Estudos que visem investigar a ecologia e diversidade genética das populações de testudines são essenciais para avaliar a resposta das comunidades aquáticas dos testudines aos impactos antrópicos e as modificações nos habitats destes animais. Pesquisas relativas a este tema são consideravelmente poucos nos ecossistemas de Caatinga e Mata Atlântica. Desta forma, no intuito de preencher uma lacuna no conhecimento sobre estas espécies, o presente estudo objetivou investigar o status de conservação das populações de testudines localizadas no domínio morfoclimático das Caatingas, na Área de Proteção Ambiental Chapada do Araripe, região de Semi Árido, Ceará, Nordeste do Brasil, no que se refere as suas estruturas populacionais e heterogeneidade gênica, além de compilar as ações cientificas referentes ao tema Testudines no nordeste do Brasil. Foram utilizadas duas armadilhas de convergência específicas para o clado Testudine, denominada Covo (armadilha com isca), seis dias por mês, durante um ano (agosto de 2011 a julho de 2012). Cada espécime capturado foi marcado, sexado, teve seus dados biométricos registrados e foram coletadas amostras biológicas para análise genética. Para efeito de comparação da variabilidade genética das populações de P. geoffroanus foram utilizadas amostras de testudines coletadas em dois pontos do domínio morfoclimático de Mata Atlântica, Mata do Privê em Camaragibe e Mata do Rio Paratibe em Paulista. Foram capturados na área de Caatinga 63 indivíduos, representando três espécies, 44 Phrynops geoffroanus, nove Kinosternon scorpioides e dez Mesoclemmys tuberculata. O tamanho da população estimado pelo método de Jolly-seber foi de 49.28±11 para K. scorpioides ,56±16.3 para M. tuberculata e 301.5±67,09 para P. geoffroanus. O índice de dimorfismo sexual calculado com a média dos valores da carapaça dos machos e fêmeas foi de 1.06 (desviado para fêmeas) para P. geoffroanus e 1.04 (desviado para machos) para K. scopioides. Não foi possível inferir a cerca de dimorfismo sexual ou razão sexual para a espécie M. tuberculata, pois foram capturadas apenas fêmeas. A análise da diversidade genética demonstrou que a população da Caatinga apresentou diversidade genética semelhante a das populações de Mata Atlântica, não havendo distância genética significativamente diferente entre os grupos (Caatinga e Mata Atlântica), que pode ser resultado provavelmente de uma explosão populacional ou intenso fluxo gênico, demonstrando que apesar das condições adversas da caatinga, a população estudada neste ambiente apresenta semelhante capacidade adaptativa que as populações da Mata Atlântica.
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Caracterização morfológica e estimativas de parâmetros genéticos em melão do grupo momordica / Morfhological characterization and estimates of genetic parameters in momordica melon group

VALADARES, Ricardo de Normandes 30 January 2014 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-01T12:24:38Z No. of bitstreams: 1 Ricardo de Normandes Valadares.pdf: 3969497 bytes, checksum: c099bd82231afad59b13a873926a8417 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-01T12:24:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ricardo de Normandes Valadares.pdf: 3969497 bytes, checksum: c099bd82231afad59b13a873926a8417 (MD5) Previous issue date: 2014-01-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The morphological characterization provides us several data bases about the existence of phenotype variability, allowing us to use the genetic resources in a rational and sustainable way, while the estimates of genetic parameters brief us about the nature of the gene action related to the inheritance of characters, and may be applied to help choosing more efficient methods of selection. This work goals to characterize and estimate the genetic parameters for morphologic characters of 19 accesses of melons of momordica group, two cultivars of inodorus group and two cultivars of cantalupensis group. Data was obtained from an experiment in randomized block design and eight replications, performed at the greenhouse of Rural Federal University of Pernambuco (UFRPE), at Recife – Brazil, between April and July 2013. The characterization of the fruits was made by the list of morphological descriptors for melons published by the Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply of Brazil and IPGRI – International Plant Genetic Resources Institute. The accesses showed genetic variability to the most of assessed characteristics. However, only the accesses A-10, A-13 and A-19 showed some difference of pulp and peel colors. In general, the accesses presented good production, earliness, long fruit with thick flesh and low rates of soluble solids. As for the estimates of genetic parameters, the numbers showed high heritability (71.77 to 98.66%), coefficient of genetic variation (from 3.70 to 72.04%) and ratio CVg / CVe (0.56 to 3.03), revealing high genetic variability between the accesses, suggesting that simpler selection methods can be applied, resulting in genetic gain when selection is made. The genetic correlations presented similar traces between them and higher values when compared to their respective phenotype and environmental correlations when assessed the major part of pairs. Positive and high magnitude correlations were obtained from the following pairs: pulp thickness x soluble solids, flesh thickness x average fruit weight, soluble solids x number of days to maturity and average fruit weight x number of days to maturity, while the reasons length / width of the fruit were negatively correlated with most of the assessed characteristics, suggesting us that the selection against the character will indirectly afford pulp thickness and average fruit weight at characteristics increase. / A caracterização morfológica fornece uma série de dados sobre a existência de variabilidade fenotípica, favorecendo o uso racional e sustentável dos recursos genéticos, enquanto que, as estimativas de parâmetros genéticos fornecem informações sobre a natureza da ação dos genes envolvidos na herança dos caracteres, e que podem ser utilizados para auxiliar na escolha de métodos de seleção mais eficientes. O objetivo deste trabalho foi caracterizar e estimar os parâmetros genéticos para caracteres morfológicos de 19 acessos de melão do grupo momordica, duas cultivares do grupo inodorus e duas cultivares do grupo cantalupensis. Os dados foram obtidos de um experimento em delineamento de blocos casualisados e oito repetições, conduzido em casa de vegetação da Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife – PE, entre os meses de Abril e Julho de 2013. Os acessos foram caracterizados com base na lista de descritores morfológicos publicado para melão (C. melo L.) do Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento e do IPGRI – International Plant Genetic Resources Institute. Os acessos mostraram variabilidade genética para a maioria das características avaliadas. Entretanto, apenas os acessos A-10, A-13 e A-19 apresentaram diferenças para coloração de polpa e casca. Em geral, os acessos mostraram boa produtividade, precocidade, frutos compridos com polpa espessa e baixo teor de sólidos solúveis. Quanto às estimativas de parâmetros genéticos, os resultados mostraram estimativas elevadas de herdabilidade (71,77 a 98,66%), coeficiente de variação genético (3,70 a 72,04%) e razão CVg/CVe (0,56 a 3,03), revelando alta variabilidade genética entre os acessos, sugerindo que métodos de seleção simples possam ser utilizados, proporcionado ganho genético considerável na seleção. Já as correlações genéticas apresentaram sinais semelhantes e com valores superiores as suas respectivas correlações fenotípicas e ambientais para a maioria dos pares avaliados. Correlação positiva e de alta magnitude foram obtidas para os pares: espessura de polpa x teor de sólidos solúveis, espessura de polpa x massa média de frutos, teor de sólidos solúveis x número de dias para a maturação e massa média de frutos x número de dias para a maturação, enquanto que a razão comprimento/largura do fruto se correlacionou negativamente com a maioria das características avaliadas, sugerindo que a seleção contra este caráter, proporcionará indiretamente no incremento das características: espessura de polpa e massa média de frutos.
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Variabilidade genética de Aedes aegypti (Diptera: Culicidae) no estado de Sergipe / GENETIC VARIATION IN AEDES AEGYPTI (DIPTERA: CULICIDAE) POPULATIONS IN THE STATE OF SERGIPE.

Steffler, Lizandra Makowski 30 July 2012 (has links)
Aedes aegypti is an important vector of human arboviruses as dengue, yellow fever and chikungunya in several tropical and subtropical countries. Studies of population genetic on Ae. aegypti has been growing in recent years and several molecular markers has been used to assess genetic variability of this vector. Among the molecular markers used is the ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) based on the use of nonspecific primers as microsatellites, and SNP (Single Nucleotide Polymorphism) that detect single base mutations in the chain of nitrogenous bases. The aim of this study was to determine the genetic variability in Ae. aegyti populations in the State of Sergipe through the molecular markers ISSR and SNP. Mosquito samples were caught using ovitraps in seven cities of Sergipe State: Canindé de São Francisco, Carira, Pinhão, Neópolis, Maruim, Aracaju and Umbaúba. DNA from adult mosquitoes was extracted and amplified with two ISSR primers and nine SNP markers. For ISSR marker analysis AMOVA resulted in 32% of genetic variation among populations and 68% within the population. The value of phiST was equal to 0.3225 indicating high genetic structure among populations. The dendrogram generated by UPGMA grouped the populations into two clusters that showed 61% similarity. The Mantel test by means of partial correlation between genetic distances and road excluding the interference of population size of the city was significant (r = -0.5399, p = 0.0359), assuming the occurrence of gene flow between Ae. aegypti populations passively by human action. For the marker SNP AMOVA analysis revealed genetic differentiation of FST = 0.07354 (p <0.01) and genetic diversity of 7.35% among populations. The analysis, showed the existence of two clusters based on genotypic similarities. For this analysis we found genetic differentiation between populations located in the countryside and on the coast. Both markers were efficient for the genetic study of natural populations of Ae. aegypti and able to differentiate among samples on a geographic scale from 30km to 240km. / Aedes aegypti é um importante vetor de graves arboviroses humanas como dengue, febre amarela e chikungunya em diversos países tropicais e subtropicais. O número de estudos envolvendo genética de população com Ae. aegypti vem crescendo nos últimos anos, sendo utilizados diversos marcadores moleculares para avaliar a variabilidade genética deste vetor. Entre os marcadores utilizados estão os ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) baseados na utilização de microssatélites como primers inespecíficos, e SNP (Single Nucleotide Polymorphism) que detectam mutações em bases únicas da cadeia de bases nitrogenadas. O objetivo do estudo foi determinar a variabilidade genética de populações de Ae. aegyti do estado de Sergipe por meio dos marcadores moleculares ISSR e SNP. Foram capturadas amostras do mosquito por meio de armadilhas ovitrampas de sete municípios sergipanos: Canindé de São Francisco, Carira, Pinhão, Neópolis, Maruim, Aracaju e Umbaúba. Para avaliação do polimorfismo genético foi extraído o DNA do mosquito adulto e amplificado com dois primers para ISSR e nove marcadores de SNP. Para o marcador ISSR a análise AMOVA resultou em 32% de variação genética entre as populações e 68% dentro das populações. O valor de phiST foi igual a 0,3225 indicando alta estruturação genética entre as populações. O dendograma gerado pelo método UPGMA agrupou as populações em dois clusters que apresentaram 61% de similaridade. O teste de Mantel por meio de correlação parcial entre as distâncias genética e rodoviária excluindo a interferência do tamanho da cidade foi significativo (r = - 0,5399 e p = 0,0359), supondo a ocorrência de fluxo gênico entre as populações de Ae. aegypti de forma passiva pela ação humana. Para o marcador SNP a análise AMOVA revelou diferenciação genética entre as populações de FST = 0,07354 (p < 0,01) e diversidade genética entre as populações de 7,35%. A análise por meio do software Structure 2.3.1, evidenciou a existência de dois clusters baseados em semelhanças genotípicas. Por essa análise foi observada uma diferenciação genética entre populações localizadas no interior do estado e populações mais próximas do litoral. Ambos marcadores moleculares foram eficientes no estudo genético de populações naturais de Ae. aegypti, sendo possível diferenciar amostras numa escala geográfica entre 30km a 240km.
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Caracterização morfológico reprodutiva de acessos de Jureminha (Desmanthus virgatus (L.) Willd.) nativa de Sergipe / Morphological-reproductive characterization of jureminha (Desmanthus virgatus L. (Willd) accessions natives of Sergipe

Fontenele, Ana Consuelo Ferreira 29 March 2007 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Among the most representative families of the world flora, the Legumonosae (Fabaceae) is one of most expressive her the capacity in fixing nitrogen in the soil and its releasing for the agroecosystems, presence in many agricultural systems, aggressive characteristic of seed dispersion, and by the considerable forage potential. The present work aimed to characterize accessions of the native legume Jureminha, collected in different ecological- geographic regions of Sergipe state, using morphological reproductive descriptors. Two-hundred and twelve accessions of Desmanthus were cultivated the Embrapa Tabuleiros Costeiros Experimental Station in Nossa Senhora das Dores, SE. The experiment was carried out in a completely randomized block design with 2 replications and 3 representative plants per plot, spaced by 2x2 m from each other. The characters of fertilization percentage (Ft), flowering after pruning (Flo), pods per flower (Vi), pod length (CpV), pod width (LgV), seeds per pod (SV), locus per pod (LoV), weight of 100 seeds (PS) were evaluated. Analysis of variance was processed by the GENES statistical program (Cruz, 2001), estimating for each characteristic the average genetic inheritance (h2 m), the experimental variation (CVe%) and genetic (CVg%) coefficients, and the correlation between such coefficients. Grouping multivariate techniques by the method of Tocher Optimization and Hierarchic Closest Neighbor and the Plane Distance Projections, utilizing the Mahalanobis generalized distance as the dissimilarity measurements were also applied. Significant genetic variability for the characters VI. PS, CpV, and LoV were found between the studied accessions, indicating a genetic potential to be used in breeding programs. Largest genetic inheritance were found for the CpV and LoV characters with respectively 59.59% and 50.61%. Such characters also showed the highest degree of correspondence between the genetic value and phenotypic value with respectively 0.72 % and 0,859 %. The SV and LoV characters had the greatest contribution for the divergence with respectively 37.20% and 14.39% of the variation. Seven divergent groups were formed. There was concluded that there are not a large genetic divergence among the accessions considering the majority of the accessions composed the first group and two groups were composed by four accessions and three groups were composed by two accessions each one, and one group by only one accessions. / Entre as famílias mais representativas da flora no mundo, a Leguminosae (Fabaceae) é uma das mais expressivas, pela fixação de nitrogênio no solo e seu repasse ao agroecossistema, presença em vários sistemas agrícolas, pela sua agressividade na dispersão de sementes, além de possuir relevante potencial forrageiro. Nesse sentido, este trabalho objetivou caracterizar através de descritores morfológicos reprodutivos acessos de jureminha, leguminosa nativa, coletadas em várias regiões ecogeográficas do Estado de Sergipe. Foram implantados 212 acessos no Campo Experimental em Nossa Senhora das Dores, SE, pertencente a Embrapa Tabuleiros Costeiros. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso com duas repetições e três plantas úteis por parcela, separadas entre si e entre linha por 2 m, além de uma linha de bordadura externa em cada bloco. Os caracteres avaliados foram percentual de fertilização (Ft), florescimento após o corte (Flo), número de vagens por inflorescência (VI), comprimento de vagem (CpV), largura de vagem (LgV), número de sementes por vagem (SV), número de locos por vagem (LoV) e peso de 100 sementes (PS). A análise de variância foi realizada utilizando o programa GENES, Cruz (2001), o qual estimou para cada característica, a herdabilidade média (h2 m), os coeficientes de variação experimental (CVe%) e genético (CVg%) e a relação entre esses coeficientes. Foram realizadas também, técnicas multivariadas de agrupamento pelo método de Otimização de Tocher e Hieráquico do Vizinho Mais Próximo e a Projeção das Distâncias no Plano, utilizando-se a distancia generalizada de Mahalanobis (D²) como medida de dissimilaridade. Existe variabilidade genética significativa entre os acessos avaliados, para os caracteres VI, PS, CpV e LoV, indicando como um potencial genético a ser explorado em programas de melhoramento. Sendo os caracteres CpV e LoV os que apresentaram maiores herdabilidades, 59,59% e 50,61%, e os maiores graus de correspondência entre o valor genético e o valor fenotípico 0,72% e 0,86%, respectivamente. Já os caracteres que mais contribuíram para a divergência foram SV com 37,20% da variação, seguido por LoV com 14,39%. No entanto, houve formação de sete grupos divergentes, concluindo-se que a divergência genética entre os acessos não é grande, pois o primeiro grupo formado englobou a maioria dos acessos, dois grupos foram formados por quatro acessos, três grupos com dois acessos e um grupo com apenas um acesso.
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Resistência em genótipos segregantes de Psidium guajava L. à Meloidogyne enterolobii / Resistance in segregating genotypes of psidium guajava L. to meloidogyne enterolobii

Vieira, Alessandra Abreu Rodrigues 08 August 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alessandra Abreu Rodrigues Vieira.pdf: 310728 bytes, checksum: 0e9cc138bfaeaf0b6e9c447ce14acf80 (MD5) Previous issue date: 2011-08-08 / Neste trabalho, avaliou-se a resistência da goiabeira Psidium guajava L. a Meloidogyne enterolobii (sin. M. mayaguensis) em condições de casa de vegetação. Foram estudados 16 genótipos segregantes, de ocorrência espontânea, coletados nos municípios de Alegre (ES) e Caparaó (MG). O experimento foi conduzido em delineamento inteiramente casualizado, seguindo o esquema fatorial com 16 genótipos x 3 concentrações (500, 2.000 e 4.000 ovos + J2 de Me) e 6 repetições. Os genótipos foram constituídos de plantas oriundas de frutos coletados em plantas matrizes nativas da região. As sementes foram retiradas desses frutos, semeadas e as plantas originadas de cada genótipo foram inoculadas aos seis meses com diferentes concentrações de inóculo. Avaliou-se a altura de plantas (ALT) aos 90 dias após a inoculação e aos 135 foram realizadas as análises de massa fresca de raiz (MFR), número de galhas (NG) e população final (PF) do nematoide. A classificação das progênies quanto à resistência foi realizada pelos critérios proposto por Oostenbrink (1966) e Moura e Régis (1987), ambos baseados no fator de reprodução (FR). Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Scott e Knott, a 5 % de probabilidade. Os genótipos 5, 6 e 7 apresentaram valores de médias para FR<1 pela classificação de Oostenbrink (1966), assim como dentro das famílias encontrou-se indivíduos com valores de FR<1. Foram encontrados nas progênies dos genótipos 1, 4, 9, 10, 12, 13 e 14 valores de FR<1, o que demonstrou a segregação de genes para resistência em progênies de plantas matrizes suscetíveis. Nos genótipos 2, 3, 8, 11, 15 e 16, todas as progênies apresentaram FR>1 sendo considerados suscetíveis de acordo com critérios de Oostenbrink (1966) e algumas progênies com resistência moderada de acordo com Moura e Régis (1987). Esses resultados permitiram inferir sobre a existência de genes de resistência em P. guajava a M. enterolobii. Houve pouca variação dentro de progênies dos genótipos 2, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 12 e 16 para as variáveis MFR, NG e PF, referente ao nível de 500 ovos + J2 de M. enterolobii, os quais se encontram sempre dentro do mesmo grupo de médias que não diferem entre si, mostrando maior homogeneidade desses genótipos quanto à reação ao nematoide. O genótipo 15 apresentou baixos valores de MFR e altos valores de NG e PF nas três concentrações de inóculo, o que demonstrou uma tendência desse genótipo ao parasitismo e reprodução do M. enterolobii / In this work, it was evaluated the resistance of the guava tree Psidium guajava L. to Meloidogyne enterolobii (syn. M. mayaguensis) in green house conditions. Were studied 16 segregating genotypes of spontaneous occurrence collected in the cities of Alegre (ES) and Caparaó (MG). The experiment was conducted in completely randomized design (CRD), following the factorial scheme with 16 genotypes x 3 concentrations (500, 2.000 e 4.000 eggs + J2 of Me) and 6 repetitions. The genotypes were constituted of plants from fruits collected in mother plants native of the region. The seeds were removed of these fruits, sown and the plants originated from each genotype were inoculated with six months old in different concentrations of inoculum. It was evaluated the plants height (ALT) at 90 days after inoculation and at 135 were realized the analysis of fresh weight of root (MFR), number of galls (NG), and final population (PF) of the nematode. The classification of progenies for resistance was carried out by the criteria proposed by Oostenbrink (1966) and Moura and Regis (1987), both based on the reproduction factor (FR). Data were submitted to the analysis of variance and the means compared by the Scott and Knott test in 5% of probability. The genotypes 5, 6 and 7 had mean values for FR<1 by the Oostenbrink (1966) classification, as well as within the families were found individuals with values of FR<1. Were found in the progenies of the genotypes 1, 4, 9, 10, 12, 13 and 14 values of FR<1, what showed the segregation of genes to resistance in progenies of mother plants susceptibles. In the genotypes 2, 3, 8, 11, 15 and 16, all the progenies had FR>1, being considered susceptible in accord with the criteria of Oostenbrink (1966) and some progenies with moderate resistance in accord with Moura e Régis (1987). These results allowed infer about the existence of resistance genes in P. guajava to M. enterolobii. There was little variation within the progenies of the genotypes 2, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 12 and 16 for the variables MFR, NG, and PF, on the level of 500 eggs + J2 of M. enterolobii, which are always within the same group averages that do not differ from each other, indicating greater homogeneity of these genotypes for reaction to the nematode. The genotype 15 showed low values of MFR and high values of NG and PF in the three concentrations of inoculum, what indicated a trend of this genotype to the parasitism and reproduction of M. enterolobii
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Identificação de famílias mutantes de arroz (Oryza sativa L.) para características de importância agronômica e tolerância a baixas temperaturas na germinação / Identification of mutant families of rice for traits of agronomic importance and tolerance to low temperatures during germination.

Luz, Viviane Kopp da 02 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Viviane_Kopp_Luz.pdf: 1878214 bytes, checksum: 773673ed91b567de63552267f5779d03 (MD5) Previous issue date: 2011-07-02 / The existence of variability is essential for successful breeding. The use of mutagens can increase the mutation frequency, enabling the development of variation for traits of interest. The occurrence of low temperatures is a common stress in rice cultivation in temperate regions, therefore the tolerance to low temperatures is a desirable feature of Brazilian rice genotypes grown in the South, where low temperatures affect the germination and crop establishment causing reductions in the grain yield. This work aimed to identify mutants of rice genotypes for traits of agronomic importance and to evaluate the low temperature stress tolerance of genotypes on germination stage. In stage germination, 400 M3 families and control genotypes BRS Querência, BR IRGA 409 and Nourim Mochi, were subjected to treatments with different temperatures (13 C and 25 C) and compared for their relative performance, measured by the coleoptile, root and shoot length. To evaluate the traits of agronomic importance, M3 rice seeds were sown in the experimental field at Embrapa Clima Temperado. The experimental design was a completely randomized block with four replications. Seven traits of agronomic importance were evaluated: length of main panicle in cm, weight of main panicle in g; grain mass of the main panicle in g, length of flag leaf, in cm, width of flag leaf, in cm, plant height, in cm, and stem length, in cm. The results indicate that the ethylmethanesulfonate mutagen (EMS) was effective in generating mutants of rice for six of the traits, except for the character length of the flag leaf, which did not show increase in genetic variability. The induction of mutation was also efficient in generating genetic variability for tolerance to low temperatures at the stage of germination, but the results also indicated the occurrence of a large number of deleterious mutations, affecting negatively the performance of the mutant families. / A existência de variabilidade é fundamental para o sucesso do melhoramento genético. O uso de agentes mutagênicos pode incrementar a freqüência de mutação, possibilitando o desenvolvimento de variação para as características de interesse. A ocorrência de baixas temperaturas é um estresse comum na cultura do arroz em regiões temperadas, portanto a tolerância a baixas temperaturas é uma característica desejável em genótipos brasileiros de arroz cultivados no sul do país, onde as temperaturas baixas prejudicam a germinação, o estabelecimento da lavoura e diminuem o rendimento de grãos. Este trabalho teve como objetivo identificar genótipos mutantes de arroz para características de importância agronômica e avaliar a tolerância ao estresse por baixas temperaturas no estádio germinativo. No estádio germinativo 400 famílias M3 e as testemunhas BRS Querência, BR IRGA 409 e Nourim Mochi, foram submetidas a tratamentos com diferentes temperaturas (13 C e 25 C) e comparados quanto ao seu desempenho relativo, medido pelo comprimento do coleóptilo, comprimento de raiz e comprimento de parte aérea. Para avaliação dos caracteres de importância agronômica, sementes de arroz da geração M3 foram semeadas em campo experimental na Embrapa Clima Temperado. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos completamente casualizados com quatro repetições. Foram avaliados sete caracteres de importância agronômica: comprimento da panícula principal, em cm; peso da panícula principal, em g; massa de grãos da panícula principal, em g; comprimento da folha bandeira, em cm; largura da folha bandeira, em cm; estatura de planta, em cm, e comprimento de colmo, em cm. Os resultados indicam que o agente mutagênico etilmetanosulfonato (EMS), foi eficiente na geração de mutantes de arroz para seis dos caracteres avaliados, exceto para o caráter comprimento da folha bandeira, onde não foi verificado incremento da variabilidade genética. A indução de mutação também foi eficiente em gerar variabilidade genética para tolerância a baixas temperaturas no estádio de germinação, porém os resultados também indicaram a ocorrência de um grande número de mutações deletérias, afetando de forma negativa o desempenho das famílias mutantes.

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