Submitted by Suzana Dias (suzana.dias@famerp.br) on 2018-10-19T18:22:34Z No. of bitstreams: 1 StephaniePiacentidosSantos_dissert.pdf: 499357 bytes, checksum: e7f6872448bfb8c9bb786b4bd30f9c94 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-19T18:22:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 StephaniePiacentidosSantos_dissert.pdf: 499357 bytes, checksum: e7f6872448bfb8c9bb786b4bd30f9c94 (MD5) Previous issue date: 2016-11-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Breast cancer is a leading cause of death in women worldwide. The etiology of this disease is multifactorial, including factors such as habits and lifestyle, hormonal, environmental and genetic. The xenobiotic metabolism contribute to the development of breast carcinoma and polymorphisms in genes encoding enzymes in this pathway, such as GST (GSTM1 and GSTT1) and CYPs (CYP1A1*2A and CYP1A1*2C) have been associated to breast cancer. Objectives: To investigate the influence of the GSTM1, GSTT1, CYP1A1*2A and CYP1A1*2C polymorphisms at the risk for developing breast cancer; to evaluate the association of polymorphisms and risk factors (age, smoking, alcohol, clinical features), tumor clinical and histopathologic features in breast cancer. Methods: This case-control study included 752 women, 219 patients and 533 controls. Molecular analysis were performed by PCR-multiplex (GSTM1 null and GSTT1 null), PCR-RFLP (CYP1A1*2A) and real-time PCR (CYP1A1*2C). For the statistical analysis, the MINITAB 16.0 (Multiple Logistic Regression Test), SNPstats (Inheritance Model tests) and BioEstat 5.0 (Hardy-Weinberg test) tests were used. Results: Women with old age and the alcohol consumption had increased risk for developing breast cancer. Women with breast cancer had slightly higher frequency (51%) of the GSTM1 null genotype than women without cancer (49%), however this difference was not significant statistically. GSTT1 null genotype was also not associated with breast cancer. CYP1A1*2A polymorphism was associated with the risk for breast cancer and CYP1A1*2C polymorphism was more frequent in tumors with no distant metastases. Conclusions: Women with age advanced and who drink alcohol present increased risk for developing breast cancer. CYP1A1*2A polymorphism is associated with breast cancer and CYP1A1*2C polymorphism is related to women with no distant metastases. The polymorphisms of the GSTM1 and GSTT1 genes are not associated with the development of breast cancer. / O câncer de mama é uma das principais causas de morte em mulheres no mundo. A etiologia desta doença é multifatorial e inclui fatores como hábitos, estilo de vida, hormonais, ambientais e genéticos. O metabolismo de xenobióticos contribui para o desenvolvimento do carcinoma mamário, e polimorfismos nos genes que codificam enzimas desta via, tais como GSTs (GSTM1 e GSTT1) e CYPs (CYP1A1*2A e CYP1A1*2C) têm sido associados ao câncer de mama. Objetivos: Investigar a influência dos polimorfismos GSTM1, GSTT1, CYP1A1*2A e CYP1A1*2C no risco de desenvolvimento de câncer de mama; avaliar a associação dos polimorfismos e fatores de risco (idade, fumo, álcool, características clínicas) no câncer de mama, assim como características clínicas e histopatológicas do tumor. Casuística e Métodos: O presente estudo caso-controle incluiu 752 mulheres, 219 pacientes e 533 controles. Para análise molecular foram realizadas as técnicas de PCR-Multiplex (GSTM1 e GSTT1), PCR-RFLP (CYP1A1*2A) e PCR em tempo real (CYP1A1*2C). Para a análise estatística foram utilizados os programas MINITAB 16.0 (teste de Regressão Logística Múltipla), SNPstats (testes de Modelos de Herança) e BioEstat 5.0 (teste de Equílibrio de Hardy-Weinberg). Resultados: Mulheres com idade avançada e com o hábito etilista apresentaram risco aumentado para o desenvolvimento de câncer de mama. Mulheres com carcinoma mamário apresentaram frequência discretamente maior (51%) do genótipo nulo GSTM1 em relação a mulheres sem câncer (49%), no entanto essa diferença não foi estatisticamente significante. O genótipo nulo de GSTT1 também não foi associado ao câncer de mama. O polimorfismo CYP1A1*2A foi associado ao risco para câncer de mama e o polimorfismo CYP1A1*2C foi mais frequente em tumores com ausência de metástase à distância. Conclusões: Mulheres com idade avançada e que ingerem bebida alcoólica apresentam risco aumentado para desenvolver câncer de mama. O polimorfismo CYP1A1*2A está associado ao câncer de mama e o polimorfismo CYP1A1*2C está relacionado às mulheres com ausência de metástase à distância. Os polimorfismos dos genes GSTM1 e GSTT1 não apresentam associação com o desenvolvimento do câncer de mama.

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-04-04T11:49:33Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nícolas Gustavo Matias de Oliveira - 2018.pdf: 1671663 bytes, checksum: 77209b17924ba8b6327e4442c9878a74 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-04-04T13:24:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nícolas Gustavo Matias de Oliveira - 2018.pdf: 1671663 bytes, checksum: 77209b17924ba8b6327e4442c9878a74 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-04T13:24:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nícolas Gustavo Matias de Oliveira - 2018.pdf: 1671663 bytes, checksum: 77209b17924ba8b6327e4442c9878a74 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Schizophrenia (EQZ) is a chronic mental illness that affects about 1% of the world population and is characterized by behavioral domains such as positive symptoms characterized by hallucinations and delusions and negative symptoms that involve apathy, anhedonia and social blunting. The cause of EQZ remains unknown, but it is known to be a disease whose etiology involves environmental and genetic factors. Several studies seek to identify factors that clarify the etiology of the disease. The agent that causes toxoplasmosis, Toxoplasma gondii, seems to be related to the development and progression of the disease, evidenced by studies that argue that T. gondii infection may be a triggering factor for psychosis in some individuals, since the parasite has a certain tropism by the central nervous system. Furthermore, studies have reported parasite infection as a factor related to genotoxicity, including toxoplasma infection in an animal model. Based on the foregoing, the present study aimed to evaluate the seropositivity to T. gondii (IgM or IgG) and the avidity of IgG in a group of individuals diagnosed with EQZ in the city of Goiânia and to evaluate the occurrence of genotoxicity in these, of genotoxicity with exposure to xenobiotics such as tobacco, alcohol, especially drugs, and / or T. gondii infection. Seropositivity was observed above 70% among individuals diagnosed with EQZ in relation to the controls, with avidity above 50%, indicating that individuals had contact with T. gondii at some time prior to the survey. Despite the genotoxic damage found, there was no significant difference in genotoxic damage among the infected individuals evaluated. The present study did not demonstrate that T. gondii may be a contributing factor to the occurrence of DNA damage, and the use of antipsychotic drugs, tobacco and alcohol, despite being a risk factor for genotoxicity, did not demonstrate an influence significant difference in the present study. However, it is necessary to carry out other analyzes and investigate parameters such as the time of drug use and exposure to other xenobiotics. In order to know better the life habits of individuals, it may help to provide more information about this relationship between T. gondii and EQZ. / A esquizofrenia (EQZ) é uma doença mental crônica que afeta cerca de 1% da população mundial e se caracteriza por domínios comportamentais, como sintomas positivos, caracterizados por alucinações e delírios e sintomas negativos, que envolvem apatia, anedonia e embotamento social. A causa da EQZ ainda permanece desconhecida, mas sabe-se que se trata de uma doença que cuja etiologia envolve fatores ambientais e genéticos. Vários estudos buscam identificar fatores que esclareçam a etiologia da doença. O agente causador da toxoplasmose, Toxoplasma gondii, parece ter relação com o desenvolvimento e progressão da doença, evidenciado por estudos que defendem que a infecção por T. gondii pode ser um fator desencadeante de psicoses em alguns indivíduos, já que o parasito apresenta um certo tropismo pelo sistema nervoso central. Ainda, estudos tem reportado a infecção por parasitos como fator relacionado a genotoxicidade, incluindo a infecção pelo toxoplasma em um modelo animal. Com base no exposto, o presente trabalho teve por objetivo avaliar a soropositividade para T. gondii (IgM ou IgG) e a avidez da IgG em um grupo de indivíduos diagnosticados com EQZ do município de Goiânia e avaliar a ocorrência de genotoxicidade nestes, procurando relação da genotoxicidade com a exposição a xenobióticos como tabaco, álcool, especialmente medicamentos, e/ou com a infecção pelo T. gondii. Observou- se soropositividade acima de 70% entre os indivíduos diagnosticados com EQZ em relação aos controles, com avidez acima de 50%, indicando que os indivíduos tiveram contato com o T. gondii em algum momento anterior a pesquisa. Apesar do dano genotóxico encontrado, não houve diferença significativa no dano genotóxico entre os indivíduos infectados avaliados. O presente estudo não demonstrou que T. gondii pode ser um fator contribuinte para a ocorrência de danos ao DNA, e o uso de fármacos antipsicóticos, o fumo e o álcool, apesar de serem um fator de risco para a genotoxicidade, não demonstraram uma influência significativa no presente estudo. Entretanto, há a necessidade de realizar outras análises e investigar parâmetros como o tempo de uso dos fármacos, e de exposição a outros xenobióticos, enfim, o melhor conhecimento dos hábitos de vida dos indivíduos pode ajudar a trazer mais informações acerca dessa relação entre T. gondii e a EQZ.

Los sensores y dispositivos basados en nanomateriales ofrecen ventajas que se derivan de su tamaño nanométrico y de las propiedades que los identifican, lográndose bajar en muchos casos los límites de detección, con tiempos más cortos de análisis y sin necesidad de pretratamientos de las muestras. En la presente tesis se desarrolla un transistor efecto campo basado en nanotubos de carbono (CNTFET) para la detección del bisfenol A (BFA) (compuesto xenobiótico) en agua. Por primera vez se usa un receptor nuclear, el receptor de estrógenos alfa (RE-α) para la funcionalización de los nanotubos de carbono de pared sencilla (SWCNTs), debido a la gran afinidad del RE-α y los compuestos xenobióticos. De esta manera se obtiene un biosensor que transforma la interacción selectiva biomolécula-analito en una señal eléctrica cuantificable, permitiendo detecciones de BFA por debajo de la dosis de referencia y de los límites de detección obtenidos por otros métodos de detección, con muy bajos tiempos de análisis (0.5 - 2 minutos). / Sensors and devices based on nanomaterials have advantages arising from their nanometric size and the properties that identify them, resulting in many cases in lower limits of detection, shorter times of analysis and the need for no pretreatment of samples. This thesis shows the development of a field effect transistor based on carbon nanotubes (CNTFET) for the detection of bisphenol A (BFA) (a xenobiotic compound) in water. For the first time we used a nuclear receptor, the estrogen receptor alpha (ER-α) for the functionalization of single-walled carbon nanotubes (SWCNTs) due to the high affinity of ER-α and xenobiotic compounds. We obtained a biosensor that transforms the selective interaction biomolecule-analyte in a measurable electrical signal, allowing detection of BFA below the reference dose and with lower detection limits than other detection methods in the literature, with very low time of analysis (0.5 - 2 minutes).

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5397.pdf: 2672237 bytes, checksum: 66d95a1c81d09e4aa7e3b8016ac5b2dc (MD5) Previous issue date: 2013-07-29 / Universidade Federal de Sao Carlos / Pesticides are potentially toxic compounds to humans and other living beings, which are indispensable for pests removal in agriculture worldwide. The result of their overuse is the inevitable contamination of aquatic and terrestrial ecosystems. The need for degradation of these compounds has been subject of several studies. The enzymatic biodegradation of synthetic pesticides by microorganisms is an important strategy for removing these pollutants from the environment. Marine fungi are an excellent source of highly oxygenated bioactive compounds with huge potential to biotransform xenobiotics such as pesticides. Thus, the objective of this project was to study the biotransformation of the organophosphate pesticide methyl parathion using fungi of marine origin isolated from the ascidian Didemnum ligulum. Initially, 17 fungi strains have undergone screening on agar culture medium containing different pesticide concentrations (120 mg/L, 240 mg/L and 360 mg/L), and the three strains that showed the greatest growth diameter of the colony, were subjected to culture in a liquid medium to quantify the possible degradation of the methyl parathion. For these strains, the eficiency of degradation was monitored by high performance liquid chromatography (HPLC). Methyl parathion was almost completely degraded in 20 days, but there was no significant difference between the reactions with the fungi strains and the abiotic control. The microorganisms, however, showed ability to metabolize p-nitrophenol, the main degradation product of methyl parathion. In conclusion, these three marine fungi, identified as two strains of Penicillium citrinum and one strain of Fusarium proliferatum, have proven to be important sources to study xenobiotic biotransformation. / Os pesticidas são compostos, potencialmente tóxicos ao homem e demais seres vivos, que hoje são indispensáveis na remoção de pragas na agricultura mundial. O resultado do seu uso excessivo é a inevitável contaminação dos ecossistemas aquáticos e terrestres. A necessidade da degradação destes compostos tem sido fonte de diversos estudos. A biodegradação enzimática de pesticidas sintéticos por micro-organismos representa uma importante estratégia para a remoção desses poluentes do meio ambiente. Uma excelente fonte de compostos bioativos altamente oxigenados, com enorme potencial bioenzimático a ser explorado na biotransformação de xenobióticos, como os pesticidas, são os fungos marinhos. Sendo assim, o objetivo deste projeto foi estudar a biotransformação do pesticida organofosforado metil paration utilizando-se de fungos de origem marinha isolados da ascídia Didemnum ligulum. Inicialmente, 17 linhagens de fungos passaram por uma triagem em meio de cultura sólido contendo diferentes concentrações (120 mg/L, 240 mg/L e 360 mg/L) de pesticida, e as que apresentaram o melhor desenvolvimento nesse meio, de acordo com observação por diâmetro de crescimento da colônia, foram submetidas a um cultivo em meio líquido para quantificar a possível degradação do metil paration. Três linhagens foram selecionadas para essa segunda etapa, na qual a eficiência de degradação foi monitorada por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). O metil paration foi completamente degradado em 20 dias, porém não houve significativa diferença entre as reações com as linhagens de fungos e o controle abiótico. Os micro-organismos, no entanto, se mostraram capazes de metabolizar o p-nitrofenol, principal produto de degradação do pesticida metil paration. Assim, esses três fungos marinhos, identificados como duas linhagens de Penicillium citrinum e uma de Fusarium proliferatum, demonstraram ser importantes fontes para estudos de biotransformação de xenobióticos.

Made available in DSpace on 2012-09-06T01:11:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 848.pdf: 650400 bytes, checksum: bf41cd2080256b69cb25faf2ef9ff504 (MD5) Previous issue date: 2005 / Tem sido observado que, em camundongos infectados com Schistosoma mansoni, a atividade de enzimas de biotransformação de xenobióticos está alterada. Aos 55 dias após a infecção de camundongos com 100 cercárias, o fígado se apresenta repleto de granulomas que se formam em torno dos ovos do verme retidos no órgão. Neste momento há redução acentuada dos níveis de citocromos P450 totais e da atividade de várias isoformas hepáticas. A ciclofosfamida (CLF) e o dimetilbenzantraceno (DMBA) são pró-mutágenos que aumentam a freqüência de células micronucleadas no sangue periférico e na medula óssea. A CLF é bioativada pelas isoformas das subfamílias CYP2B e 3A, enquanto a ação genotóxica do DMBA depende da sua meolização por isoformas da subfamília 1A e possivelmente 1B. O objetivo deste trabalho foi investigar se a infecção com S. mansoni interfere com a ação clastogênica da CLF e do DMBA. Para isso camundongos suíços com dez dias de vida foram aleatoriamente divididos em dois grupos (infectados e não infectados). Cinqüenta e cinco dias após a infecção, cada grupo foi subdividido, ao acaso, em dois outros grupos que receberam CLF ou DMBA por via intraperitoneal. Camundongos tratados apenas com os veículos (salina e óleo de milho) foram usados como controles. Os animais foram mortos 24h após o tratamento, sendo as medulas ósseas do fêmur retiradas para preparo dos esfregaços e determinação das freqüências de eritrócitos policromáticos micronucleados (EPCMN). Os resultados foram analisados pelo teste de Kruskal-Wallis, seguido pelo teste U de Mann-Whitney. Os resultados foram: 1) A freqüência de EPCMN não diferiu entre animais (controles veículo e não tratados) não infectados e infectados com S. mansoni. 2) A infecção atenuou consideravelmente o efeito clastogênico (freqüência de EPCMN) da CLF e DMBA. Nossos resultados indicam que a infecção com S. mansoni atenuou o efeito genotóxico de pró-mutágenos que são ativados por isoformas citocromo P450 das subfamílias 1A, 2B em camundongos. Esses achados são consistentes com os resultados de estudos anteriores do nosso laboratório mostrando que a infecção com S. mansoni diminuiu a atividade de citocromos P450 1A1 e da subfamília 2B no fígado de camundongos.

Orientador: Valdecir Farias Ximenes / Banca: Rodrigo Rezende Kitagawa / Banca: Cibele Bonacorsi / Banca: Saulo Santesso Garrido / Banca: Daniel Rinaldo / Resumo: As proteínas são macromoléculas complexas de alto peso molecular e que desempenham inúmeras funções nas células. Estas funções podem ser comprometidas caso ocorram modificações nas suas estruturas. Fatores físicos e químicos podem provocar estas alterações, inclusive processos oxidativos mediados por espécies reativas de oxigênio. Entre essas modificações destaca-se a formação de proteínas amiloidais que estão relacionadas a diversas doenças como Parkinson e Alzheimer. O ácido hipocloroso (HOCl) e o ácido hipobromoso (HOBr) são oxidantes gerados pela ativação de leucócitos e há abundantes relatos de seus efeitos deletérios sobre proteínas. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo estudar as alterações estruturais e funcionais na proteína lisozima provocadas por sua oxidação através dos ácidos hipo-halosos, HOCl, HOBr e por suas haloaminas, taurina cloramina (Tau-NHCl), taurina bromamina (Tau-NHBr) e taurina dibromamina (Tau-NBr2). A oxidação de lisozima pela adição de Tau-NHBr ou Tau-NBr2 (excesso molar de quatro vezes) causou depleção completa da sua fluorescência intrínseca, entretanto, os ácidos HOCl e HOBr causaram a redução de apenas 40% e 50% respectivamente. Em contraste com o seu precursor, Tau-NHCl, foi incapaz de oxidar a lisozima. As haloaminas foram cerca de duas vezes mais eficazes como inibidores da atividade enzimática do que os seus precursores HOCl e HOBr. Por outro lado, os ácidos foram mais eficazes na promoção da agregação de lisozima, efeito este, evidenciado pelo aumento da turbidez, espalhamento de luz e anisotropia de fluorescência da proteína. Os agregados apresentaram propriedades espectroscópicas que sugeriram a formação de estruturas amiloidais, como foi observado pelo ensaio de Tioflavina T. Em contraste com os ácidos hipo-halosos, as haloaminas foram inibidores parciais da formação de proteínas amiloides. Em conclusão, estes resultados sugerem ... / Abstract: Proteins are complex macromolecules of high molecular weight and performing numerous functions in cells. These functions may be compromised if there are any modifications in their structures. Physical and chemical factors may cause these changes, including oxidative processes mediated by reactive oxygen species. Among these changes was the formation of amyloid proteins that are related to various diseases such as Parkinson's and Alzheimer's. The hypochlorous acid (HOCl) and hipobromous acid (HOBr) are oxidants generated by the activation of leukocytes and there are abundant reports of their deleterious effects on proteins. In this context this work aimed to study the structural and functional changes in the protein lysozyme caused by their oxidation through hypohalous acids, HOCl, HOBr, and haloamines taurine Chloramine (Tau-NHCl), taurine monobromamine (Tau-NHBr) and taurine dibromamine (Tau-NBr2). The oxidation of lysozyme by addition of Tau-NHBr or Tau-NBr2 (molar excess of four times) caused complete depletion of its intrinsic fluorescence, however, the acids HOCl and HOBr caused a reduction of only 40% and 50% respectively. In contrast to its precursor, Tau-NHCl was unable to oxidise the lysozyme. The haloamines were about twice as effective inhibitors of enzyme activity than their precursors HOCl and HOBr. On the other hand, the acids were more effective in promoting aggregation of lysozyme, this effect, evidenced by increased turbidity, light scattering and fluorescence anisotropy of the protein. The aggregates presented spectroscopic properties that suggested the formation of amyloid structures, as noted by thioflavin t test. In contrast with hypohalous acids, the haloamines were partial formation of protein inhibitors became. In conclusion, these results suggest that HOBr, like their haloamines Tau-NHBr and Tau-NBr2, are selective with regard to oxidation of tryptophan residues in proteins. This particularity directly affects ... / Doutor

Orientador: Ana Marisa Fusco de Almeida / Coorientador: Cleslei Fernando Zanelli / Banca: Edwil Aparecida de Lucca Gattás / Banca: Alessandro de Mello Varani / Resumo: Atualmente o Brasil possui uma estimativa de produção de bioetanol com a safra de 2013/14 de 27,17 bilhões de litros. Esta produção é derivada de um processo de fermentação das usinas sucroalcooleiras brasileiras e caracteriza-se atualmente como um processo semi-contínuo. A levedura Saccharomyces cerevisiae é a mais abrangente nos processos de fermentação, por ser adaptável aos diferentes ambientes, possuindo uma rica diversidade de perfis fenotípicos e genotípicos, evidenciando que as interações entre fatores ambientais e este organismo influenciam na identificação de características essenciais e específicas nos processos fermentativos. A construção de um banco de organismos relacionados com a produção de etanol é indispensável aos interesses de pesquisadores do programa Bioen da UNESP. Assim, é de fundamental importância a existência de uma coleção de linhagens de leveduras, com potencial fermentativo elevado. Em estudo anterior, desenvolvido por nosso grupo, foram selecionadas de uma usina brasileira duas linhagens (ZFC4 e ZFD4) com características potencialmente diferenciais no processo de produção de etanol. Com base nestes dados o objetivo deste estudo foi primeiramente analisar características genotípicas e fenotípicas das linhagens ZFC4 e ZFD4 para identificação de fatores genéticos funcionais por meio de sequenciamento do DNA e RNA global de nova geração Hiseq Ilumina e posteriormente, as linhagens selecionadas foram rastreadas por combinações com os padrões industriais (PE-2, CAT e SA-I), visando à seleção de associações sinérgicas promissoras no processo de fermentação para o setor sucroalcooleiro. Para tanto as associações destas linhagens foram avaliadas quanto ao crescimento celular, assimilação de açucares, tolerância à temperatura e ao etanol e capacidade fermentativa. Todas as combinações realizadas entre os padrões e as linhagens ZFC4 e ZFD4 foram sinérgicas para ... / Abstract: Brazil currently has an estimated production of bioethanol with crop 2013/14 from 27.17 billion liters. This production is derived from a fermentation process of Brazilian sugarcane mills and is characterized today as a semi-continuous process. The yeast Saccharomyces cerevisiae is the most comprehensive in fermentation processes, by being adaptable to different environments, having a rich diversity of phenotypic and genotypic profiles, showing that the interactions between environmental factors and influences in this organism identification of essential and specific features in the fermentative process. The construction of a bank of organisms related to ethanol production is vital to the interests of researchers Bioen UNESP program. Thus, it is fundamental to the existence of a collection of yeast strains with high fermentation potential. In a previous study conducted by our group, were selected from a Brazilian plant two strains (ZFC4 and ZFD4) with potentially differential characteristics in the ethanol production process. Based on these data, the aim of this study was first to analyze genotypic and phenotypic characteristics of strains ZFC4 and ZFD4 to identify functional genetic factors through sequencing DNA and RNA global new generation HiSeq Ilumina and subsequently selected strains were screened for combinations with industry standards (PE-2, CAT and SA-I), aiming at selecting promising synergistic associations in the fermentation process for the alcohol sector. For both the associations of these strains were evaluated for cell growth, assimilation of sugars, tolerance to temperature and ethanol and fermentative capacity. All combinations made between the patterns and ZFC4 and ZFD4 strains were synergistic for all parameters analyzed, especially in relation to resistance to high ethanol concentrations and temperature. Importantly, our lines alone were as effective as the fermentation patterns, however these in combination ... / Mestre

Orientador: Fabio Erminio Mingato / Banca: Daniel Nicodemo / Banca: Cecilio Soares Filho / Resumo: O fígado possui grande importância no organismo animal, pois realiza a biotransformação de substâncias exógenas (xenobióticos) e por esse motivo, o tecido hepático acaba sendo alvo potencial de substâncias tóxicas. A bixina, proveniente das sementes de urucum (Bixa orellana L.) é um antioxidante que pode contribuir para a proteção das células e tecidos contra os efeitos deletérios dos radicais livres e também possui efeitos farmacológicos como antiinflamatório, antibacteriano e antitumoral. No presente trabalho foi avaliado o efeito protetor da bixina sobre os danos hepáticos provocados pelo tetracloreto de carbono (CCl ) em ratos. Os animais foram divididos em quatro 4 grupos de seis animais cada. A dose de CCl4 (0,125 mL/kg de peso corporal) foi injetada por via intraperitoneal (i.p.) e a bixina (5,0 mg/kg de peso corporal) foi administrada por gavagem por 7 dias antes da injeção do CCl . Após a 4 eutanásia, o sangue de cada animal foi colhido e foram analisadas a atividade sérica das enzimas alanina aminotransferase (ALT) e aspartato aminotransferase (AST). O fígado foi removido e após a preparação do homogenato foi analisada a atividade da enzima glutationa redutase (GR), os níveis de glutationa reduzida (GSH) e nicotinamida adenina dinucleotídeo fosfato na forma reduzida (NADPH), além da peroxidação dos lipídios de membrana e alterações histopatológicas. A bixina protegeu os danos hepáticos provocados pelo CCl4 conforme observado pela diminuição da liberação das enzimas ALT e AST. A bixina também protegeu o fígado contra os efeitos oxidantes do CCl , uma vez que impediu a diminuição da atividade da enzima 4 GR e dos níveis de GSH e NADPH. A peroxidação dos lipídios de membrana também foi inibida pela bixina. Além disso, o dano histopatológico do fígado foi significativamente reduzido pelo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract:The liver has a great importance in the animal body since it is responsible to the biotransformation of exogenous chemicals (xenobiotics), making the liver tissue a potential target for toxic substances. The carotenoid bixin from annatto seeds (Bixa orellana L.) is an antioxidant that can contribute to protecting cells and tissues against the deleterious effects of free radicals and also has pharmacological effects such as anti-inflammatory, antibacterial and antitumoral activities. In the present study we evaluated the protective effect of the bixin on liver damage caused by carbon tetrachloride (CCl ) in rats. 4 The animals were divided in four groups of six rats in each. The dose of CCl4 (0.125 mL kg-1 body wt.) was injected i.p. and bixin (5.0 mg kg-1 body wt.) was given by gavage 7 days before the CCl4 injection. After euthanasia, the blood of each animal was collected and the serum activities of alanine aminotransferase (ALT) and aspartate aminotransferase (AST) were analyzed. The livers were removed and after preparation of the homogenate the activity of the enzyme glutathione reductase (GR), the levels of reduced glutathione (GSH) and NADPH, as well as the peroxidation of membrane lipids and histopathological changes were determined. Bixin reduced the liver damage caused by CCl4 as noted by the significant decrease of the release of the enzymes ALT and AST. Bixin also protected the liver against the oxidizing effects of CCl , since it 4 prevented the decrease in GR activity and levels of GSH and NADPH. The peroxidation of membrane lipids was also inhibited by bixin. Moreover, the histopathological damage of liver was also significantly reduced by bixin treatment. Therefore, we can conclude that the protective effect of bixin against... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-11-13T12:09:20Z No. of bitstreams: 1 PDF - Emanoel da Silva Carvalho.pdf: 12007349 bytes, checksum: c6ed0725a68d77f38078542be2d2367e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T12:09:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Emanoel da Silva Carvalho.pdf: 12007349 bytes, checksum: c6ed0725a68d77f38078542be2d2367e (MD5) Previous issue date: 2017-04-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The increase in population for manufactured consumer it is a consequence from the waste generated, has a direct consequence without health status of the population, due to the serious consequences with the bioaccumulation of composed, such as medicines, personal hygiene products, toxic organic substances, also known as xenobiotics. Furthermore, an alarming inadequacy from the treatment systems and legislation related to the water, because the quality of the water supply in most Brazilian capitals, according to research provided by the Instituto Nacional de Ciências e Tecnologias Analíticas Avançadas (INCTAA), need to be revised, even though it is according to the standards of potability. In last decades, some advances have been made in relation to instrumental methods destinated to identification and quantification contaminants in water, and lately the main challenges are related to the development intended for treatment of the samples. On what was exposed, developed a methodology with a low cost, based on aquafotomics standards capable of identifying and quantifying contaminants in trace concentrations in aqueous environment. Therefore, an extensive bibliographical survey was carried out on this new area of science, an aquafotomics. The experimental part was based on spectroscopy for UV-vis-NIR combined with pattern recognition techniques spectroscopy, such as a PCA, and multivariate calibration, such as PLS and MLR. The construction of the identification and quantification models was made in 62 models of synthetic standards containing caffeine in low concentrations (10e^-5 a 10e^-9) in aqueous environment. The PCA models for identification were able to distinguish as samples containing caffeine from those of pure water. The quantification models gives a satisfactory predictive capacity for samples with concentrations higher than 10e^-6g.L^-1 in caffeine. / O aumento da demanda da população por bens de consumo industrializados e consequentemente o aumento da geração de resíduos, tem relação direta com estado de saúde da população, devido à gravidade das implicações relativas a bioacumulalção de compostos como medicamentos, produtos de higiene pessoal, substâncias orgânicas tóxicas, também conhecidos como xenobióticos. Além disso, a inadequação dos sistemas de tratamento e legislação relacionados a água é alarmante pois a qualidade da agua de abastecimento fornecida na maioria das capitais brasileiras, de acordo com pesquisa realizada pelo Instituto Nacional de Ciências e Tecnologias Analíticas Avançadas (INCTAA), precisa ser melhorada, apesar de atender os padrões de potabilidade. Nas últimas décadas, muitos avanços foram feitos em relação aos métodos instrumentais destinados a identificação e quantificação contaminantes em água, e atualmente o maior desafio desta área está relacionado ao desenvolvimento de métodos destinados ao tratamento das amostras. Diante do exposto, desenvolveu-se uma metodologia de baixo custo, baseada nos princípios da aquafotomica capaz de identificar e quantificar contaminantes em concentrações traço em meio aquoso. Para isso foi realizado um extenso levantamento bibliográfico sobre esta nova área da ciência, a aquafotomica. A parte experimental foi baseada na espectroscopia UV-vis-NIR aliada a técnicas de reconhecimento de padrões, como a PCA, e de calibração multivariada, como PLS e MLR. A construção dos modelos de identificação e quantificação foi baseada em 62 espectros de padrões sintéticos contendo cafeína em baixas concentrações (10e^-5 a 10e^-9) em meio aquoso. Os modelos PCA para identificação foi capaz de distinguir as amostras contendo cafeína daquelas de água pura. Já os modelos de quantificação mostraram uma capacidade preditiva satisfatória para amostras com concentrações superiores a 10e^-6g.L^-1 em cafeína.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-17T11:51:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-17T11:51:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-17T11:51:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / In Brazilian agriculture, the State of Goiás is one of the largest producers of corn, beans, cotton, sorghum, sugarcane and soybeans, with 75% of its exports composed of products related to agriculture and minerals. Thus, a large part of the economy of the State of Goiás is focused on rural activities, justifying the intense use of pesticides in the region. These pesticides will be metabolized in the liver in two main phases, the first one of bioactivation converting the original substances into more polar metabolites, through oxidation reduction reactions, hydrogenation and dehalogenation, most of the reactions are made by the cytochrome P450 (CYP) superfamily And the second phase in which conjugation reactions occur, in which metabolites are converted into non-toxic products. Agrochemicals are also known to cause various human health damage, such as cancer, cholinergic syndrome, Parkinson's disease and Alzheimer's as well as cytogenetic changes such as DNA damage and chromosome translocations. Thus, polymorphisms in enzymes acting in the path of detoxification and DNA repair may be important biomarkers of diseases in individuals exposed to pesticides. The present study sequenced 3 regions of the following genes: CYP2E1 (promoter region), CYP1A1 (exon 7) and OGG1 (intron region) of 260 individuals from Goiânia and Aparecida de Goiânia, GO. 20 ml of blood was collected, DNA was extracted using commercial kits and PCR was performed. Subsequently, the amplicons were sequenced by the automated Sanger method and compared to the 1000 Genome project. The population of this study was composed of 159 men and 101 women, mean age of 38 years. A total of 5 SNP's were found in the Goias population, being rs2031922 (change of C> T and frequency of the T allele of 0.05) of the CYP2E1 gene, rs1048943 (change of A> G and frequency of the G allele of 0.1 ) And rs1799814 (change of C> A and frequency of allele A of 0.07) of the CYP1A1 gene and rs1052133 (change of C> G and frequency of allele G of 0.2) and rs293795 (change of A> G and frequency Of the 0.18 T allele) of the OGG1 gene. All loci did not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium, nor was a statistically significant difference between age and genotype composition. The rs1048943 and rs1799814 loci of the CYP1A1 gene showed a moderate disequilibrium linkage and the rs1052133 and rs293795 loci of the OGG1 gene showed a strong disequilibrium linkage. The haplotype inference revealed a frequency of the haplotypes of loci rs1048943 and rs1799814 of A / C = 0.8, G / A = 0.12, A / A = 0.07 of the CYP1A1 gene. The haplotypes of the loci rs293795 and rs1052133 had A / G = 0.07, A / C = 0.8, G / C = 0.13. Due to the important participation in detoxification or DNA repair and relationship with pesticides, SNPs rs2031920 of the CYP2E1 gene, rs1048943 of CYP1A1 and rs1052133 of the OGG1 gene are potential biomarkers of susceptibility to disease development in individuals who have contact with these xenobiotics / Na agricultura brasileira o Estado de Goiás é um dos maiores produtores de milho, feijão, algodão, sorgo, cana-de-açúcar e soja, tendo 75% de suas exportações compostas de produtos ligados às áreas de agricultura, agropecuária e minérios. Dessa forma, grande parte da economia do Estado de Goiás é voltada para atividades rurais, justificando o intenso uso de agrotóxicos na região. Esses agrotóxicos serão metabolizados no fígado em 2 fases principais, a primeira de bioativação convertendo as substâncias originais em metabolitos mais polares, por meio de reações de oxidação redução, hidrogenação e desalogenação, grande parte das reações são feitas pela superfamília de enzimas citocromo P450 (CYP) e a segunda fase na qual ocorrem reações de conjugação, na qual metabolitos são convertidos em produtos atóxicos. Os agrotóxicos também são conhecidos por causarem diversos danos à saúde humana, tais como, câncer, síndrome colinérgica, mal de Parkinson e Alzheimer assim como alterações citogenéticas, tais como dano no DNA e translocações cromossômicas. Assim, polimorfismos nas enzimas atuantes em vias de detoxificação e reparo de DNA podem ser importantes biomarcadores de doenças em indivíduos com exposição a agrotóxicos. O presente estudo sequenciou 3 regiões dos seguintes genes: CYP2E1 (região promotora), CYP1A1 (éxon 7) e OGG1 (região de íntron) de 260 indivíduos de Goiânia e Aparecida de Goiânia, GO. Foram coletados 20 ml de sangue, o DNA foi extraído com o uso de kits comercias e foi realizada a PCR. Posteriormente, os amplicons foram sequenciados pelo método de Sanger automatizado e comparados com a população do projeto 1000 genomas. A população deste estudo foi composta por 159 homens e 101 mulheres, médias de idade de 38 anos. Foram encontrados na população goiana um total de 5 SNP’s, sendo eles rs2031922 (mudança de C>T e frequência do alelo T de 0,05) do gene CYP2E1, rs1048943 (mudança de A>G e frequência do alelo G de 0,1) e rs1799814 (mudança de C>A e frequência do alelo A de 0,07) do gene CYP1A1 e rs1052133 (mudança de C>G e frequência do alelo G de 0,2) e rs293795 (mudança de A>G e frequência do alelo T de 0,18) do gene OGG1. Todos os locos não desviaram do equilíbrio de Hardy-Weinberg, também não houve diferença estatisticamente significativa entre a idade e a composição genotípica. Os locos rs1048943 e rs1799814 do gene CYP1A1 apresentaram um desequilíbrio de ligação moderado e os locos rs1052133 e rs293795 do gene OGG1 apresentaram um desequilíbrio de ligação forte. A inferência haplotípica revelou uma frequência dos haplótipos dos locos rs1048943 e rs1799814 de A/C=0,8, G/A= 0,12, A/A=0,07 do gene CYP1A1. Os haplótipos dos locos rs293795 e rs1052133 apresentaram frequência de A/G=0,07, A/C=0,8, G/C=0,13. Devido a importante participação em vias de detoxificação ou reparo de DNA e relação com agrotóxicos, os SNP’s rs2031920 do gene CYP2E1, rs1048943 do CYP1A1 e o rs1052133 do gene OGG1 são potenciais biomarcadores de susceptibilidade ao desenvolvimento de doenças em indivíduos que possuem contato com estes xenobióticos.