Orientador: Patricia Jacqueline Thyssen / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T16:08:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mira_CaueTrani_M.pdf: 3071912 bytes, checksum: c01afc0e4e37aabc1ba91ac542ea964f (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Os dípteros estão associados aos diversos ambientes humanos podendo causar danos para a saúde pública, perdas econômicas ou, por outro lado, prestar auxílio dentro do âmbito médico-legal ao serem utilizados para estimar o tempo de óbito em casos de morte suspeita. Muitos levantamentos faunísticos de dípteros que têm sido realizados até o momento no Brasil são precários por relatarem a presença de espécimes até níveis taxonômicos superiores ao de espécie, dadas as dificuldades encontradas como ausência de chaves taxonômicas para certos grupos e insuficiência na descrição de caracteres. Assim, o avanço de quaisquer outros trabalhos que queiram investigar a biologia, ecologia ou dinâmica desses organismos na natureza também estará prejudicado. As chaves convencionais para identificação de espécies de Fanniidae (Diptera: Muscomorpha) são escassas, restritas a uma pequena região geográfica ou limitada para apenas um sexo (macho ou fêmea). A chave interativa, construída com auxílio de bases computacionais, pode representar uma alternativa relevante para uma melhor compreensão dos aspectos taxonômicos ainda pouco esclarecidos dentro deste grupo. Adicionalmente, a interatividade representa um processo de maior flexibilidade na consulta dos caracteres, inserção de fotografias e detalhes pormenorizados em glossários, promovendo identificações mais acuradas. Assim, neste estudo foram levantados os caracteres específicos para 21 espécies do gênero Fannia (Muscomorpha: Diptera, Fanniidae), e incluídos caracteres que possibilitam a separação entre este gênero e Euryomma. Foram selecionadas espécies listadas na literatura como tendo importância nas áreas médica, veterinária e forense de diversos ambientes e localidades que compõem a região Sudeste do Brasil. Ao todo 38 caracteres morfológicos encontram-se listados na chave interativa elaborada com o auxílio do programa LUCID®. A partir do levantamento de dados das espécies para construção da chave observou-se que Fannia carvalhoi Couri 2005 constitui registro de nova ocorrência para a região amostrada neste estudo. O trabalho final encontra-se disponível e publicado na web / Abstract: Species of Diptera associated with several human environments and may cause harm to public health, economic losses or on the other hand, assist in the forensic context when used to estimate the time of death in cases of suspicious death. Many dipteran fauna surveys that have been conducted so far in Brazil are precarious for reporting the presence of specimens taxonomic given the difficulties encountered such as a lack of taxonomic keys for certain groups and insufficiency in describing characters. Thus, the advancement of any other work that want to investigate the biology, ecology and dynamics of these organisms in nature will also be harmed. Conventional keys for identification of species of Fanniidae (Diptera: Muscomorpha) are scarce, restricted to a small geographic region or limited to only one gender (male or female). The interactive key, built with the aid of computational bases, may represent a relevant alternative to a better understanding of taxonomic aspects still not clarified within this group. In addition, interactivity is a process of greater flexibility in the consultation of the characters, insert photos and full details on glossaries, promoting more accurate identifications. In this study have been raised the specific characters for 21 species of the genus Fannia (Muscomorpha: Diptera, Fanniidae), and included characters that allow the separation between this genre and Euryomma. Were selected species listed in the literature as having importance in medical, veterinary and forensic areas of diverse environments and locales that compose the Southeast region of Brazil. Altogether 38 morphological characters are listed in the interactive key elaborated with the assistance of LUCID® software. From the survey data for the construction of key species it was observed that Fannia carvalhoi Couri 2005 establishes new record for the region sampled in this study. The final work is available and published on the web / Mestrado / Biodiversidade Animal / Mestre em Biologia Animal

Orientadores: Luiza Sumiko Kinoshita, André Olmos Simões / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T23:46:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Morokawa_Rosemeri_D.pdf: 29597148 bytes, checksum: fcd5c15a946818490b706701fb5b278c (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Apocynaceae é a segunda maior família de Gentianales com 366 gêneros e cerca de 5000 espécies, está dividida em cinco subfamílias. Um interessante grupo para estudar aspectos evolutivos e biogeográficos é o clado ViWiTa, que compreende as três maiores tribos (Vinceae, Willughbeieae, Tabernaemontaneae) de Rauvolfioideae, com 42 gêneros e 470 espécies distribuídas principalmente na região tropical do mundo, com exceção de Vinca em região temperada. Os objetivos do presente estudo são: reconstruir a hipótese filogenética de Willughbeieae, testar a monofilia das subtribos, elucidar as relações filogenéticas entre os gêneros e identificar sinapomorfias morfológicas para os clados maiores (Capítulo 1); realizar a datação molecular do clado ViWita, testar hipóteses biogeográficas acerca da disjunção pantropical e testar possíveis padrões vicariantes e rotas de dispersão (Capítulo 2). As análises filogenéticas foram realizadas usando cinco marcadores plastidiais (rpl16, rps16, trnK, trnS-G, matK) para 97 espécimens pertencentes aos 18 gêneros reconhecidos em Willughbeieae. A porcentagem dos representantes amostrados para cada gênero foram acima de 60% em doze gêneros, 50-59% em três gêneros e 30-49% em três gêneros. As idades moleculares do clado ViWiTa foram estimadas a partir da hipótese filogenética de Willughbeieae, aliada as hipóteses filogenéticas existentes de Vinceae e Tabernaemontaneae, usando uma abordagem Bayesiana. A abordagem usada para reconstrução de áreas ancestrais foi a de Máxima Verossimilhança, que implementa o modelo de dispersão-extinção-cladogênise. Nossos resultados corroboram a monofilia da tribo e das subtribos: Lacmelleinae, Leuconotidinae, Landolphiinae, Willughbeiinae. Seis sinapomorfias morfológicas para Willughbeieae são sugeridas: (1) hábito liana; (2) apice da cabeça do estilete indiferenciado; (3) base da cabeça do estilete indiferenciado; (4) ovário sincárpico; (5) placentação parietal; e (6) fruto baga. Os gêneros Ancylobotris, Chamaeclitandra, Clitandra, Cylindropsis, Dyctiophleba, Orthopichonia, Pacouria, Saba e Vahadenia foram sinonimizados em Landolphia. Análises de datação combinados com as análises de reconstrução de área ancestral sugerem uma provável origem do clado no início do Paleoceno na Australásia, seguida de migração via Boreotrópicos e subsequentes eventos de colonização para os neotrópicos, África e Madagascar. Multiplos eventos de dispersão à longa distância foram inferidos, como por exemplo da África para a região Neotropical em Willughbeieae, dos neotrópicos para o Havaí em Vinceae e de Madagascar para Australásia em Tabernaemontaneae / Abstract: Apocynaceae is the second largest family of Gentianles, comprises 366 genera and ca. 5000 species and is divided in five subfamilies. An interesting group to study evolution and biogeography is ViWiTa clade, that comprises representatives of the three largest tribes (Vinceae, Willughbeieae, Tabernaemontaneae) within Rauvolfioideae. ViWiTa comprises 42 genera and 470 species distributed mainly in tropical regions of the world, with only one genus, Vinca, in temperate zone. The aims of the presente study are: to reconstruct a phylogenetic hypothesis of Willughbeieae, to test the monophyly of subtribes, to elucidate the phylogenetic relationships among its constituent genera, to identify morphological synapomorphies to the major clades (Chapter 1); to present a molecular dating to ViWiTa clade, to test biogeographical hypothesis about pantropical disjunction and test possible vicariant patterns and dispersal routes (Chapter 2). We performed phylogenetic analyses using chloroplast (rpl16, rps16, trnK, trnS-G and matK) data from 97 specimens that belongs to 18 genera recognized to Willughbeieae. The percentagen of species sampled of each genus were above 60% in twelve genera, 50-59% in three genera and 30-49% in three genera. Molecular age estimates were calculated using a Bayesian approach based on 281 specimens belonging to 42 genera recognized in ViWiTa and five chloroplast markers. Ancestral areas were reconstructed using a maximum likelihood approach that implements the dispersal-extinction-cladogenesis model. Our study supports the monophyly of Willughbeieae and subtribes. We identified six possible synapomorphies to the tribe: (1) liana habit; 2) style-head body apex undifferentiated; (3) style-head body base undifferentiated; (4) syncarpous ovary; and (5) parietal placentation; and (6) baccate fruits. The genera Ancylobotris, Chamaeclitandra, Clitandra, Cylindropsis, Dyctiophleba, Orthopichonia, Pacouria, Saba and Vahadenia were reduced to Landolphia. Necessary new combinations resulting from merging Landolphiinae genera into Landolphia were made. Dating and ancestral area analyses indicate that ViWiTa clade probably originated on early Paleocene in Australasia followed by migration via the Boretropics and subsequent colonizations to the Neotropics, Africa and Madagascar. Multiple long-distance dispersal events were inferred, such as from Africa to the Neotropics in Willughbeieae, from the Neotropics to Hawaii in Vinceae, and from Madagascar to Australasia in Tabernaemontaneae / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutora em Biologia Vegetal

Orientador: Messias Modesto dos Passos / Banca: Encarnita Salas Martin / Banca: Bartira Araújo da Silva Viana / Resumo: A pesquisa teve como objetivo geral realizar um estudo sobre a dinâmica fitossociológica da cobertura vegetal da FLONA Palmares e seu entorno, localizada no extremo oeste do município de Altos-PI, a partir do conhecimento das unidades de paisagem, das condições ambientais e das formas de uso e coupação da terra, sob a fundamentação teórico-metodológica do sistema GTP (Geossistema-Território-Paisagem) de Bertrand e Bertrand (2009). A UC está localizada na divisa administrativa do município de Altos com o município de Teresina, no Estado do Piauí, Brasil. É a única Unidade de Conservação na categoria Floresta Nacional do estado e foi criada pelo Decreto Federal S/N de 21 de fevereiro de 2005, com uma área de 170 hectares. A FLONA de Palmares está inserida em um contexto de transição natural, fitogeográfica e morfoclimática e tem como característica mais marcante a estacionalidade semidecídual da vegetação, formada eminentemente por espécies de floresta. O padrão de formas geomorfológicas da unidade está sustentado por um conjunto de estruturas geológicas da Bacia Sedimentar do Parnaíba, condicionado pela ação dos fatores atmosféricos e hidrológicos que regulam a dinâmica do sistema natural regional.A pesquisa se desenvolveu fundamentada e orientada pela abordagem geossistêmica do sistema GTP (Geossistema - Território - Paisagem), e apoiada na aplicação de procedimentos indicados na proposta metodológica desse sistema, contemplando levantamentos fitossociológicos, cartografia temática, representação da vegetação por meio de pirâmides e entrevistas com moradores (sujeitos) da área de influência da unidade. Objetivando: a) identificar e mapear as unidades ambientais da porção territorial estudada... / Abstract: The research aimed to conduct a study on the phytosociologic dynamics of vegetation cover from FLONA Palmares and its surroundings, located in the far west of the city of Altos-PI, from the knowledge of landscape units, environmental conditions and forms of land uses and covers, under the theoretical and methodological basis of the "GTP" system (Geosystem-Territory-Landscape) Bertrand and Bertrand (2009). The UC is located on the administrative border of the municipality Of Altos and Teresina, state of Piaui, Brazil. It is the only protected area in the category status of National Forest and it was created by the Federal Decree S/N of 21 February 2005, with an area of 170 hectares. The FLONA of Palmares is inserted in a context of natural transition, phytogeographic and morphoclimatic and it's most striking feature semidecidual the seasonality of vegetation, predominantly made up of forest species. The pattern of geomorphological forms of the unit is supported by a set of geological structures from the Parnaiba sedimentary basin, conditioned by the action of atmospheric and hydrological factors that regulate the dynamics of the regional natural system. The research is developed based and driven by the geosystemic approach of "GTP" system (Geosystem - Territory - Landscape), and based on the application of procedures indicates in the methodological proposal of this system, covering phytosociological surveys, thematic cartography, representation of vegetation through pyramids and interviews with residents (subjects) of the unit's area of influence. Aiming to: a) identify and map the environmental units of the studied territorial portion... / Mestre

Tynanthus Miers inclui 14 espécies distribuídas desde o sul do México até o sul do Brasil, que ocorrem predominantemente em áreas de florestas úmidas. Todas as espécies de Tynanthus são lianas, com flores pequenas e corola fortemente bilabiada, frutos com margens proeminentes e cheiro semelhante ao de cravo-da-índia em órgãos vegetativos. Esta tese compreende um estudo detalhado do gênero, abrangendo aspectos taxonômicos, evolutivos, biogeográficos e ecológicos. No primeiro capítulo, é apresentada a filogenia de Tynanthus, reconstruída com base em três marcadores moleculares (ndhF, rpl32-trnL e pepC). A filogenia de Tynanthus corroborou o monofiletismo do gênero e contribuiu com informações importantes para a circunscrição de espécies de delimitação confusa. Além disso, a filogenia também permitiu um melhor entendimento dos padrões de evolução morfológica no grupo, além de ter constituído a base para um estudo da história biogeográfica do gênero. No segundo capítulo, são apresentadas as descrições de duas espécies novas de Tynanthus, reconhecidas com base em caracteres morfológicos e corroboradas pelas análises filogenéticas moleculares. No terceiro capítulo, é apresentada uma monografia do gênero, incluindo descrições morfológicas detalhadas para todas as espécies reconhecidas, dados de fenologia, distribuição geográfica, comentários taxonômicos, ilustrações e uma chave para a identificação de todas as espécies. No quarto capítulo, é apresentado um estudo da evolução do nicho ecológico de Tynanthus, contribuindo com informações importantes para um melhor entendimento dos padrões biogeográficos observados / Tynanthus Miers includes 14 species distributed from southern Mexico to southern Brazil, that occur predominantly in rainforests. All species of Tynanthus are lianas with small flowers and a strongly bilabiate corolla, fruits with raised margins and a smell of cloves in vegetative portions. This thesis comprises a detailed study of the genus, including taxonomic, evolutionary, biogeographical and ecological aspects. The first chapter presents the phylogeny of Tynanthus, reconstructed based on three molecular markers (ndhF, rpl32-trnL and pepC). The phylogeny of Tynanthus corroborated the monophyly of the genus and contributed important information for the circumscription of species with confusing delimitation. In addition, this phylogeny also led to an improved understanding of morphological evolution in the group, as well as provided the basis for a study on the biogeographical history of the genus. The second chapter presents the description of two new species of Tynanthus recognized based on morphological features and corroborated by the molecular phylogenetic analyses. The third chapter presents a monograph of the genus, including detailed morphological descriptions for all species recognized, as well as information on phenology, geographical distribution, taxonomy, illustrations and a key for the identification of all species. The fourth chapter presents a study on the evolution of the ecological niche of Tynanthus, contributing important information for a better understanding of the observed biogeographic patterns

Lundia DC. (Bignoniaceae, tribo Bignonieae) se caracteriza pelo hábito lianescente, pelas glândulas interpeciolares, anteras e ovários vilosos, e pelos tricomas simples na margem do estigma. Além disso, o gênero não apresenta o disco nectarífero que está localizado na base do ovário da maior parte dos representantes da tribo Bignonieae. Neste trabalho são reconhecidas 13 espécies de Lundia, das quais uma é nova (L. laevis). Para a compreensão do parentesco filogenético entre as espécies do gênero, foi reconstruída a filogenia de Lundia com base em um marcador de cloroplasto (ndhF), um marcador nuclear ( PepC), e caracteres morfológicos. Os dados foram analisados utilizando parcimônia e metodologia bayesiana, os quais reconstruíram topologias congruentes. Em todas as análises, Lundia emergiu como grupo monofilético, com alta sustentação de caracteres morfológicos e moleculares. Além disso, todas as espécies amostradas múltiplas vezes também formaram grupos monofiléticos, exceto no caso de L. nitidula a qual emergiu como parafilética, com L. obliqua inserida no clado L. nitidula; no entanto, o parentesco entre os indivíduos inseridos no clado L. nitidula + L. obliqua apresentou baixa resolução. A filogenia de Lundia contribuiu com informações importantes para uma melhor circunscrição das espécies e elaboração de uma revisão taxonômica do gênero que incluiu descrições, chaves de identificação, comentários taxonômicos e mapas de distribuição para as 13 espécies reconhecidas. Entre as mudanças taxonômicas resultantes da revisão estão o reconhecimento de um táxon previamente sinonimizado (L. nitidula), a sinonimização de duas outras espécies (L. cordata em L. corymbifera e L. glazioviana em L. virginalis), e o ajuste na utilização de um nome mal aplicado (L. longa). Além disso, a filogenia do gênero também serviu como base para um estudo biogeográfico de Lundia, o qual indicou que o gênero originou-se no Mioceno, em uma área que atualmente agrega a sub-região Amazônica e a região Andina. O primeiro evento de diversificação dentro de Lundia ocorreu quando o Mar de Pebas (uma extensa área submersa na Amazônia Oriental) ainda existia. Aparentemente, o Mar de Pebas serviu como uma barreira geográfica que isolou uma linhagem de Lundia exclusivamente Andina (L. spruceana) de uma linhagem amazônica. Este evento vicariante foi seguido de diversos eventos de dispersão em direção às sub-regiões Paranaense e Caribenha. / Lundia DC. (Bignoniaceae, tribe Bignonieae) is characterized by the liana habit, interpetiolar gland fields, villose anthers and ovary, and by the simple trichomes at the stigma margins. Furthermore, the genus lacks the nectary disc that is located at the base of the ovary of most other representatives of tribe Bignonieae. This study recognizes 13 species of Lundia, one of which is new (L. laevis). In order to gain a better understanding of the phylogenetic relationships between the species included in the genus, we reconstructed the phylogeny of Lundia based on a chloroplast (ndhF) and a nuclear marker (PepC), and morphological characters. The data was analyzed using parsimony and Bayesian methods, both of which reconstructed congruent topologies. In all analyses, Lundia emerged as monophyletic, strongly supported by morphological and molecular characters. Furthermore, all species sampled multiple times also emerged as monophyletic, except for L. nitidula which was paraphyletic, with L. obliqua nested within the L. nitidula clade; however, relationships between individuals within the L. nitidula + L. obliqua clade were poorly supported. The phylogeny of Lundia contributed important information for a better circumscription of species and for the preparation of a taxonomic revision of the genus that included descriptions, identification keys, taxonomic comments and distribution maps for all 13 recognized. The taxonomic changes proposed in the revision included the recognition of a previously synonymized taxon (L. nitidula), the synonymization of two other taxa (L. cordata under L. corymbifera and L. glazioviana under L. virginalis), and the correction of a misapplied name (L. longa). Furthermore, the phylogeny of the genus also served as basis for a biogeographic study of Lundia, which indicated that the genus originated during the Miocene, in an area that is currently occupied by the Amazonian sub-region and Andean region. The first diversification event within Lundia occurred when the Pebas System (an extensively submerged area in Western Amazonia) was still present. Apparently, the Pebas System served as a geographic barrier that isolated an exclusively Andean lineage of Lundia (L. spruceana) from an Amazonian lineage. This vicariant event was followed by multiple dispersal events towards the Paranaense and Caribean sub-regions.

Orientador: Fábio Pinheiro / Banca: Julio Antonio Lombardi / Banca: Evandro Marsola de Moraes / Resumo: O Quaternário é marcado por grandes pulsações climáticas, com longos intervalos de tempo geológico sob regime glacial intercalados com curtos períodos mais quentes, onde grandes transformações na paleovegetação se deram em consequência dessas oscilações climáticas. Existem fortes evidências de que os padrões de distribuição da diversidade existente na Floresta Atlântica atual podem ser explicados, em grande parte, pelas alterações climáticas ocorridas durante esse período. Ainda assim, existem muitas lacunas e divergências na literatura quanto aos padrões de ocupação que essas vegetações desenvolveram durante essas mudanças ambientais. Através da utilização de uma espécie de cacto epifítico (Lepismium cruciforme) - com ampla distribuição na Floresta Atlântica - como modelo para estudos filogeográficos, realizamos análises intraespecíficas em oito populações ao longo de remanescentes florestais em unidades de conservação e manchas florestais urbanas para responder as seguintes questões: a) Podemos identificar multiplas linhagens de L. cruciforme entre diferentes populações localizadas na Floresta Estacional Semidecidual? b) Caso detectadas, essas diferentes linhagens estariam associadas a algum tipo de isolamento geográfico? c) As populações de L. cruciforme sofreram oscilações demográficas históricas? d) Existe um gradiente longitudinal continente/oceano de diversidade genética? Através do marcador molecular nuclear (ITS), analisamos 71 sequências de 638 locus e identificamos ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Quaternary period is well-known for its great climatic pulsations, that intercalates between long glacial regimes and shorter warmer periods which lead to significant changes in the paleovegetation occurred as a consequence of these climatic oscillations. Strong evidence that the diversity distribution patterns in the current Atlantic Forest can be largely explained by the climatic changes in this period. Nevertheless, there are many gaps and divergences in the literature regarding the occupancy patterns that these vegetations developed during these environmental changes. Using of an epiphytic cactus species (Lepismium cruciforme) - widely distributed in the Atlantic Forest - as a model for phylogeographic studies, performed intraspecific analyzes in eight populations along forest remnants in conservation units and urban forest spots to answer the following questions: a) Can multiple lineages of L. cruciforme among different populations in the seasonal semideciduous forest, be identified? b) If detected, would these different lineages be associated with some sort of geographical isolation? c) Have populations of L. cruciforme suffered from historical demographic fluctuations? Is there a growing genetic diversity in the continental/oceanic longitudinal gradient? d) Through the nuclear molecular marker (ITS), 71 sequences of 638 loci and identified nine different haplotypes. Highly diversified lineages were identified in Pontal do Paranapanema and Campos Gerais regions. In the ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Tiago da Silveira Vasconcelos / Resumo: A ecologia geográfica atua na busca por padrões da diversidade biológica que podem ser mapeados, sendo que o mapeamento de diferentes métricas compreende em um dos padrões da macroecologia como a determinação da distribuição global da diversidade beta de diversos organismos. O objetivo deste trabalho foi mapear o padrão de distribuição dos índices diversidade beta dos anuros da Mata Atlântica e do Cerrado utilizando 3 métodos de mapeamento; point-to-grid (PTG), mapas de extensão de ocorrência (EOO) e modelagem de nicho climático (ENM) e comparar esses a congruência desses padrões em cada método e avaliar como estruturação da diversidade beta com os componentes “aninhamento” e ‘’troca de espécies’’ variam de acordo com cada mapeamento. O método PTG, por ser um método de caráter pontual, vemos maior proporção de ausência de dados de ocorrência no sistema de grids das duas regiões. No Cerrado vemos valores altos da contribuição local da diversidade beta (Local Contribution to beta diversity: LCBD) nas regiões de ecótones enquanto na Mata Atlântica vemos valores maiores nas regiões costeiras. Os métodos ENM e EOO apresentaram uma congruência maior entre si do que com o método PTG nas duas regiões. A estruturação da diversidade beta mostrou que os métodos ENM e EOO apresentam valores maiores para o componente de “troca de espécies”, mas não tão alto do que a diversidade beta gerada por PTG. Com isso podemos ver que todos os métodos possuem seus defeitos e qualidadem, porém, na urg... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The geographical ecology aims to seek patterns of biological diversity that can be put on a map, such as the mapping of beta diversity gradients in a biogeographical scale of a range of organisms. The aim of this Dissertation is to map the distribution patterns of anuran beta diversity in the Atlantic Forest and Cerrado generated by three different mapping methods: point-to-grid (PTG), extent of occurrence maps (EOO), and ecological niche modelling (ENM), so we were able to compare the congruence of the beta diversity index generated by these different mapping methods. Moreover, we evaluate the turnover and nestedness components of the beta diversity among the mapping methods. PTG maps generated the most incongruent mapsprobably due to the punctual characteristics of species occurrences, so EEO and ENM generated similar beta diversity estimates for the Atlantic Forestand Cerrado. High beta diversity values in the Cerradowere recorded in ecotone regions, whereas in the Atlantic Forestthe highest beta diversity values were found along the Atlantic coast. The structure of beta diversity of PTG showed way too high values of importance for the turnover component compared to the EEO and ENM maps, which also recorded higher importance for turnover. Our results suggest that, for biogeographical and macroecological purposes, the use of PTG maps is unsuitable due to the high rates of omission erros. Then, in light of urgency of biogeographical conservation studies of threatened regions... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Fábio Fernandes Roxo / Resumo: O principal objetivo desse estudo é estimar uma filogênia molecular de Hypostominae, um grande grupo de bagres que está amplamente distribuído sobre a América do sul, para estimar a origem de seus maiores clados no tempo e espaço, e demonstrar o papel das capturas de cabeceira sobre os padrões de diversificação desses táxons. Nós usamos o método Bayesiano para estimar uma filogenia calibrada com o tempo com 220 espécies de Hypostominae, usando dois genes mitocondriais e quatro genes nucleares, nós usamos uma analise de biogeografia paramétrica (modelos DEC e DECj) para estimar a área geográfica ancestral, para inferir a rota de colonização e distribuição desses táxons. Hypostominae está composto por dez clados, e nossa filogenia calibrada com o tempo e nossa estimativa usando área ancestral indica uma origem de Hypostominae durante o médio Eoceno na área ancestral correspondente a área atual em que estão as drenagens costeiras do Pacifico, bacia do rio Madalena, Bacia Amazônica, Bacia do rio Orinoco, e drenagens costeiras das Guianas. As especiações em Hypostominae coincidem com importantes eventos geológicos na América do Sul. / Abstract: understanding both the origins of life on Earth and the ecosystem properties that are most critical to maintaining life into the future. Searching for these characteristics on a large scale has only recently become possible via advances in phylogenetic reconstruction, time-calibration, and comparative analyses. In this study, we combine these tools with habitat and phenotype data for 105 species in a clade of Neotropical suckermouth catfishes commonly known as cascudinhos. Our goal was to determine whether riverine mesohabitats defined by different flow rates (i.e., pools vs. rapids) may have affected rates of cascudinho cladogenesis and morphological diversification. In contrast to predictions based on general theory related to life in fast-flowing riverine habitats, cascudinho lineages associated with these habitats exhibited increased body size, head shape diversity, and lineage and phenotype diversification rates. These findings are consistent with a growing understanding of river rapids as incubators of biological diversification and specialization. They also support ongoing efforts to conserve rapids habitats in the face of ongoing hydroelectric powerplant construction throughout the major tropical rivers of the world. / Doutor

Orientador: Prof. Dr. Charles Morphy D. dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, 2017. / O conhecimento da história da vida na Terra é fundamental para entender a atual distribuição dos organismos e para prevê-la no futuro. O estabelecimento de áreas de endemismo e a análise da estruturação filogenética dessas áreas são os primeiros passos para que se possa compreender a história evolutiva e as interações ecológicas entre organismo-espaço e organismo-organismo, a fim de fornecer subsídios para ações conservacionistas. A infraordem Tabanomorpha (Diptera, Brachycera), um grupo antigo, de distribuição global e pouca resolução biogeográfica, é um bom modelo de estudo para discutir a relação entre biodiversidade, padrões filogenéticos e conservação. Os objetivos desta tese foram: i) estudar aspectos biogeográficos dos grupos de Tabanomorpha, em particular identificar áreas de endemismo neotropicais e globais, e ii) estudar o índice de diversidade filogenética de Faith. Para isso, um banco de dados com registros de ocorrência de ~5.000 espécies de Tabanomorpha foi compilado. As áreas de endemismo foram delimitadas a partir de uma análise de endemicidade, utilizando o programa NDM/VNDM. Na região Neotropical, 13 áreas de endemismo foram identificadas, compreendendo cinco componentes: Norte da América do Sul (NSA), Sudeste da América do Sul (SESA), América Central (CA), Savana Brasileira (BS), Andes Central (CAn). De modo geral, estes componentes são congruentes com as propostas de regionalização mais recentes para a região Neotropical. Na análise global, 18 áreas de endemismo foram identificadas: seis áreas na região Neártica, duas na região Paleártica, as regiões Oriental, Australiana e Africana tiveram três áreas cada, e a região Neotropical apareceu como uma área única. Essas áreas foram comparadas com estudos realizados para diversos táxons, apresentando congruências e evidenciando a possibilidade de utilização dos insetos na determinação de padrões globais de endemismo. A partir dos resultados de ambas as análises de endemicidade, a família Rhagionidae foi utilizada como modelo para sugestão de um protocolo de análise de biogeografia histórica, utilizando três distintos de biogeografia cladística: (1) um método baseado em padrão (BPA), um método baseado em eventos (DIVA) e um método baseado em barreiras (SAV). O método baseado em padrão descreve o padrão geral das relações das áreas, com possíveis áreas problemáticas a serem explicadas pelo método baseado em eventos (sob interpretação de diferentes processos: vicariância, dispersão, duplicação, extinção). O método baseado em barreiras testa a história biogeográfica estabelecida pelos métodos anteriores, apontando possíveis barreiras. Essas informações biogeográficas mais amplas facilitam a incorporação subsequente da história evolutiva nas análises de diversidade. Por fim, foi realizada uma análise de diversidade filogenética da família Tabanidae nas áreas de endemismo identificadas na região Neotropical, baseada no Índice de Diversidade Filogenética de Faith. O resultado mostrou que a distribuição geral dos gêneros de tabanídeos é agrupada filogeneticamente, ou seja, constituída por gêneros estreitamente relacionados. A presente tese configura o início de um inventário de dípteros tabanomorfos em áreas neotropicais potencialmente favorável aos estudos de biogeografia da conservação por tratar explicitamente da determinação de áreas de endemismo Neotropicais baseadas na distribuição de Tabanomorpha, e avaliadas em sua diversidade filogenética em Tabanidae, a família mais abrangente da infraordem. / The knowledge of the history of life on Earth is fundamental to understand the current distribution of organisms and to predict it in the future. The establishment of areas of endemism and the analysis of the phylogenetic structure of these areas are the first steps in understanding the evolutionary history and the ecological interactions between organismspace and organism-organism, in order to provide subsidies for conservation actions. The infraorder Tabanomorpha (Diptera, Brachycera), an ancient group with a global distribution and low biogeographic resolution, is a good study model to discuss the relationship between biodiversity, phylogenetic patterns and conservation. The objectives of this PhD thesis were: i) to study biogeographical aspects of groups of Tabanomorpha, particularly identifying Neotropical and global areas of endemism, and ii) to study Faith's phylogenetic diversity index. For this purpose, a database with occurrence records of ~ 5,000 species of Tabanomorpha was compiled. The areas of endemism were delimited from an endemicity analysis of this database, using the NDM/VNDM program. In the Neotropical region, 13 areas of endemism were identified for the Neotropical region, comprising five components: Northern South America (NSA), Southeastern South America (SESA), Central America(CA), Brazilian Savannah (BS), and Central Andes (CAn). In general, those components are congruent with the most recent bioregionalization proposals of Neotropical region. In the global analysis, 18 areas of endemism were identified: six areas in Neartic region, two areas in Palearctic region, Oriental, Australian and African regions presented three areas each, and Neotropical region appeared as a single area. Those areas were compared with global studies carried out for several taxa, presenting congruencies and showing the possibility of using insects in the determination of global patterns of endemism. From the results of both analyzesof endemicity, the family Rhagionidae was used as a model to suggest a protocol for historical biogeography analyses using three distinct methods of cladistic biogeography: (1) a pattern based method (BPA), an event-based method (DIVA) and a barrier-based method (SAV). The pattern-based method depicts the general pattern of area relationships, with possible problematic areas to be explained by the event-based method (under interpretation of different processes: vicariance, dispersion, duplication, extinction). The barrier-based method tests the biogeographical history established by the previous methods, revealing possible barriers. This broader biogeographical information facilitates the subsequent incorporation of evolutionary history into diversity analyses. Finally, an analysis of the phylogenetic diversity of the family Tabanidae was carried out in the areas of endemism identified in the Neotropical region, based on Faith¿s Phylogenetic Divers ty index. The result of the analysis showed that the general distribution of the tabanid genera in the five main areas of endemism in theNeotropical region is phylogenetically clustered, that is, composed of closely related genera. The present thesis is the beginning of an inventory of dipterans of infraorder Tabanomorpha in Neotropical areas, potentially favorable to conservation biogeography studies by explicitly determining Neotropical areas of endemism based on the Tabanomorpha distribution, and evaluating their phylogenetic diversity in Tabanidae, the major family of the infraorder.

Foram levantadas as espécies da tribo Mutisieae (Asteraceae), sensu CABRERA (1977) ocorrentes no Rio Grande do Sul, Brasil. No total foram encontradas 48 espécies, quatro subespécies e duas variedades distribuídas em doze gêneros e quatro subtribos. São apresentadas descrições da tribo e dos gêneros e chaves das subtribos, gêneros e espécies. É apresentado um índex com a relação organizada alfabeticamente das espécies e sinônimos. São citadas pela primeira vez para o Rio Grande do Sul Pamphalea smithii, Perezia catharinensis e Trixis thyrsoidea, e, para o Brasil, Chaptalia arechavaletae, Pamphalea missionum e Perezia squarrosa ssp. squarrosa. Cita-se uma nova espécie para a ciência, Holocheilus monocephalus. Discute-se as formas de vida, habitat e dispersão das espécies e estabelecem-se padrões de distribuição dos gêneros e espécies. São apresentados mapas de ocorrência das espécies, e faz-se uma análise qualitativa da sua distribuição nas regiões fisiográficas do Rio Grande do Sul, discutindose a diversidade de cada região associada a fatores ambientais e a amplitude de ocorrência dos táxons. Dez regiões fisiográficas do Rio Grande do Sul e quatro estações austro-sul-americanas constituíram quatorze unidades amostrais que foram comparadas entre si quanto à presença ou ausência das espécies da tribo Mutisieae, através da aplicação do índice de Jaccard, utilizando-se métodos de classificação e ordenação. Na análise de agrupamentos utilizou-se o critério "soma dos quadrados", e na ordenação o método utilizado foi o da "análise das coordenadas principais". Obtiveram-se dois grupos principais sensivelmente coincidentes com unidades biogeográficas reconhecidas por CABRERA & WILLINK (1980) e TAKHTAJAN (1986). Ficou evidente, ainda, a existência de um subgrupo de transição, geograficamente intermediário entre os dois grupos principais. São analisadas as afinidades entre as unidades amostrais baseadas em fatores ambientais. Faz-se uma reavaliação da área ancestral da família Asteraceae baseada nos resultados das análises deste estudo em relação àquela apresentada por BREMER (1992). Propõe-se que a área austro-sul-americana extra-andina situada desde a Patagônia até aproximadamente o paralelo de 30°S, no Rio Grande do Sul, passe a ser a região mais provavelmente vinculada à área ancestral da família Asteraceae. / The species of the tribe Mutisieae (Asteraceae) , sensu CABRERA (1977) occurring in Rio Grande do Sul, Brazil, w ere surveyed. Forty-eight species, four subspecies and two varieties were found, belonging to t welve genera and four subtribes. Descriptions of the tribe and genera as well as keys to the subtribes, genera and species are provided. An index with a list of the species and synonyms in alphabetical arder is displayed. Pampha/ea smithii, Perezia catharinensis and Trixis thyrsoidea are new geographical novelties to Rio Grande do Sul, whilst Chaptalia arechavaletae, Pamphalea missionum and Perezia squarrosa ssp. squarrosa are new botanical events to Brazil. A new species, Holocheilus monocephalus, is cited. Life forms, habitat and dispersai of the species are discussed and distributional patterns of the genera and species are established. Distribution maps of the species as well as a qualitative analysis of their distribution in the physiographical regions of Rio Grande do Sul are provided, with discussion of each region related to environmental features and geographical range of the species. Classification and ordenation techniques were used with application of Jaccard's coefficient to compare ten physiographical regions of Rio Grande do Sul and four austrosouth- american stands among themselves. "Sum-of-squares" was used in cluster analysis while "principal coordinates analysis" was applied in ordenation. Two main groups were obtained, strongly concurrent with biogeographical units recognized by CABRERA & WILLINK (1980) and TAKHTAJAN (1986). A transitional subgroup, geographically placed between the two main groups, was pointed out and cleared. Relationships among sampling units based on environmental features are analyzed. A new approach of ancestral area of the family Asteraceae is accomplished regarding BREMER'S (1992) analysis. lt is proposed that the austro-south-american extra-andean area situated since Patagonia to about 30°S in Rio Grande do Sul is the most likely region linked to ancestral area of the Asteraceae.