A sistemática de Cnidaria Anthozoa foi revisada inúmeras vezes e por vários autores, sendo que os Ceriantharia sempre foram avaliados através de dados clássicos e muito pretéritos. O clado Ceriantharia, uma ordem dentre Hexacorallia, apresenta muitos caracteres dúbios e que poderiam colocar os animais em várias posições sistemáticas dentre Cnidaria. Ainda, as revisões de Ceriantharia são sempre derivadas de análises das mesmas espécies, principalmente do Mar Mediterrâneo. O presente trabalho tem como enfoque a discussão dos caracteres taxonômicos (morfológicos e moleculares) de Ceriantharia, sua posição sistemática, levantamento taxonômico de áreas no Oceano Atlântico praticamente inexploradas para o grupo e aspectos da biologia das espécies encontradas. Os resultados apontam para uma nova posição sistemática de Ceriantharia, levando o grupo à base de Anthozoa e como um ramo independente. A utilização de dados moleculares evidenciou o vigor do emprego de DNA barcoding na zoologia comparada de Ceriantharia. Aspectos de especiação e de revisão sistemática resultaram pelas análises moleculares. Ao mesmo tempo, os dados morfológicos são extremamente confusos e muito do que foi utilizado como caractere de delimitação de espécies pela tradição de se assumir homologias com Actiniaria é, aparentemente, inconsistente. O ciclo de vida de Isarachnanthus noturnus foi verificado, sendo que o seu estágio jovem, planctônico, e de dispersão é de longa duração. Dados sobre regeneração em pólipos também foi verificada e com a constatação de mecanismos divergentes entre as espécies. / The Cnidaria Anthozoa systematics was revised several times by a number of authors, and the Ceriantharia always evaluated using very classical and ancient data. The Ceriantharia clade, an Hexacorallia order, has many dubious characters that could place the animals in various systematic positions within Cnidaria. Also, the Ceriantharia reviews are always derived from analysis of the same species, mainly from the Mediterranean Sea. This work focuses on the discussion of taxonomic characters (morphological and molecular) of Ceriantharia, the systematic position, taxonomic survey of virtually unexplored Atlantic Ocean areas for the group and the biology of the observed species. The results suggest a new systematic position of Ceriantharia placing the group at the basis of Anthozoa and as an independent branch. The molecular data comparison showed the force of DNA barcoding use in Ceriantharia comparative zoology. The molecular data allowed the discussion of several aspects of speciation and systematics. At the same time, the morphological data are extremely confusing and much of it was used as delimiting species character by the tradition of assuming homologies with Actiniaria is, apparently, inconsistent. The life cycle of Isarachnanthus noturnus was observed, and the young, planktonic and dispersal stage is long-lived. Data on regeneration of polyps was also verified with the observation that mechanisms differ between species.

Orientador: Clarisse Palma da Silva / Colaboradora: Viviana G. Solís Neffa / Banca: Gecele Matos Paggi / Banca: Isabel Aparecida da Silva Bonmatelli / Resumo: O continente sul-americano é o mais biodiverso da Terra, sendo palco da interação de complexos processos climáticos e geológicos que moldaram sua biota de forma muito heterogênea. Um crescente numero de estudos estudos de filogeografia de especies Sul Americanos tem auxiliado no entendimento das respostas evolutivas envolvidas em tal diversificação. A família Bromeliaceae é caracterizada por extensa radiação adaptativa, apresenta heterogeneidade de estratégias reprodutivas e padrões distintos de fluxo gênico e estrutura genética. Tillandsia aeranthos (Lois.) L.B. Smith é uma bromeliácea epífita que habita matas ciliares por toda região dos Pampas. Sua ocorrência em densas populações ao longo de ambientes geograficamente distintos a torna um bom modelo para a estudos sobre a influência de fatores geoclimáticos e ecológicos no padrão de distribuição da variabilidade genética e decorrentes processos de especiação ou manutenção da integridade da espécie. Esta dissertação foi dividida em dois manuscritos a fim de fornecer dados e análises úteis para a compreensão da evolução desta espécie neotropical. No Capítulo 1 foi realizada a amplificação heteróloga em Tillandsia aeranthos e Tillandsia recurvata de marcadores microssatélites nucleares previamente desenvolvidos para outras espécies de Bromeliaceae. Conjuntos de sete e seis marcadores apresentaram índices satisfatórios de polimorfismos em T. aeranthos e T. recurvata, respectivamente. A análise dos dados em duas populações de 20... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: South America is the most biodiverse subcontinent of the planet, bearing interactions between complex geoclimatic processes that heterogeneously molded its biota. An increasing number of Phylographic studies in South American species have helped us to understand the evolutionary responses that gradually formed such great biodiversity. Bromeliaceae is a family of herbaceous plants characterized by extreme adaptive radiation, its species present a wide range of reproductive strategies and distinct patterns of gene flow and genetic structure. Tillandsia aeranhos (Lois.) L.B. Smith is an epiphyte that inhabits mainly riparian forests of the Pampas biome. It occurs in dense populations across distinct habitats and topographic profiles, which makes it a good model species in studies about the influence of geo-climatic and ecologic factors over patterns of genetic variability and structure, as well as subsequent evolutionary processes of speciation or species cohesion maintenance. This dissertation presents two manuscripts aiming to provide data and analysis that will allow a better comprehension of T. aeranthos evolutionary history. In Chapter 1, we performed cross-amplifications of several nuclear microsatellite loci developed for other bromeliad species in Tillandsia aeranthos and T. recurvata. Sets of seven and six markers amplified satisfactorily and were polymorphic in T. aeanthos an T. recurvata respectively. The following analysis were carried in two populations of 20 indivi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Neste trabalho apresentamos estudos filogenéticos, taxonômicos e biogeográficos em Chamaecrista, um gênero de Leguminosae com centro de diversidade na região Neotropical. Os estudos de sistemática, filogenia e taxonomia, focaram uma série com 22 espécies (C. ser. Coriaceae), sendo a maioria destas ocorrentes em Campos Rupestres. Já o estudo de biogeografia abrange todo o gênero, visando compreender sua história e diversificação. As etapas de laboratório molecular do trabalho foram realizadas na Universidade Estadual de Feira de Santana, Bahia, em colaboração com o Prof. Dr. Luciano Paganucci de Queiroz. No capítulo 1, reconstruimos a filogenia de C. ser. Coriaceae utilizando quatro marcadores moleculares e também dados morfológicos. Nossos principais objetivos foram testar a monofilia da série e verificar possíveis padrões de evolução morfológica no grupo. Em nenhuma análise realizada o grupo foi reconstruído como monofilético, porque três espécies apareceram fora do clado que contém os demais representantes da série. Isso levou a uma definição de C. ser. Coriaceae strictu sensu, fortemente sustentada como monofilética nas análises combinadas, sendo que além de sinapomorfias moleculares, duas sinapomorfias morfológicas foram evidenciadas. No capítulo 2, propomos uma nova circunscrição de C. ser. Coriaceae s.s., baseada nos resultados do capítulo 1, destacando-se a exclusão das três espécies que emergiram distantes deste clado. Apresentamos um estudo morfológico mais detalhado das inflorescências, da morfologia floral e dos nectários extraflorais nessa série, comparativamente aos padrões observados nos demais clados do gênero, e visando a uma reavaliação da circunscrição taxonômica vigente. Compilamos uma sinopse taxonômica da série, incluindo as novidades nomenclaturais, chave de identificação e ilustrações diagnósticas. Chamaecrista ser. Coriaceae s.s. inclui 19 espécies, 2 variedades; três neotipificações são propostas, além de uma nova combinação, dois novos sinônimos. A série é restrita ao Brasil, tendo a maioria dos táxons uma distribuição restrita ou endêmica, sobretudo nos Campos Rupestres das serras do Planalto Central. Este capítulo inclui também um artigo publicado durante o doutorado sobre novidades taxonômicas da série, no qual sinonimizamos uma variedade e elevamos três variedades à categoria de espécie. No capítulo 3, realizamos a datação dos eventos cladogenéticos de Chamaecrista, seguida de análise biogeográfica e evolutiva. Esse estudo abrange mais de um terço das espécies de Chamaecrista. Visamos compreender como e quando se deu a origem e distribuição das espécies do gênero e verificar se esses processos teriam relação com transições morfológicas no grupo. As análises indicam uma origem do grupo relativamente antiga, no Terciário inferior na América do Sul, porém a maioria das espécies parece ter se diversificado mais recentemente e por meio de diferentes processos, sendo a dispersão o mais comum. Como observado em outros grupos de plantas lenhosas neotropicais, Chamaecrista também parece ter origem florestal com uma posterior invasão de áreas abertas, formações onde atualmente está concentrada sua maior diversidade. Alguns caracteres morfológicos derivados no grupo parecem estar relacionados com a ocupação dos habitats savânicos e rupestres, principalmente o surgimento de tricomas glandulares e a transição de hábito / This thesis focused on the phylogenetic, taxonomic and biogeographic studies in Chamaecrista, a genus of Leguminosae with the center of diversity in the Neotropics. The studies of systematic, phylogeny and taxonomy, were carried out on 22 species (Chamaecrista series Coriaceae), with most species occurring in Campos Rupestres (Chapter 1 and 2). The study of biogeography covers the entire genus, contributing to the understanding of its history and diversification (Chapter 3). Molecular work were conducted at the Universidade Estadual de Feira de Santana, Bahia, in collaboration with the Prof. Dr. Luciano Paganucci de Queiroz. In Chapter 1, we reconstructed the phylogeny of C. ser. Coriaceae using four molecular markers as well as morphological data. Our objectives were to test the monophyly of the series and to identify possible patterns of morphological evolution in this group. In all analysis the group was not reconstructed as monophyletic because three species appeared outside the clade containing the remaining representatives of the series. This led to a definition of C. ser. Coriaceae sensu strictu, strongly supported as monophyletic by several molecular and two morphological synapomorphies in the combined analyzis. In Chapter 2, we proposed a new circumscription of C. ser. Coriaceae s.s., based on the results of Chapter 1, highlighting the exclusion of the three species emerged out this clade. We present a detailed morphological study of inflorescences, floral structure and extrafloral nectaries in the series, compared to patterns observed in other clades of Chamaecrista, seeking a reevaluation of the current taxonomic circumscription. We produce a complete taxonomic synopsis of the series, including nomenclatural novelties, key identification and diagnostic illustrations. Chamaecrista ser. Coriaceae s.s. includes 19 species and 2 varieties; three neotypification are proposed, a new combination, and two new synonyms. The series is restricted to Brazil, most taxa have a restricted or endemic distribution, especially in the Campos Rupestres of the Brazilian central plateau. This chapter also includes an article published during the PhD about the taxonomic novelties of the series, in which we synonymized a variety and modified the taxonomic category of three varieties to species. In chapter 3, we carried out the dating of the cladogenetic events in Chamaecrista, and the subsequent biogeographic and evolutionary analysis. The taxa sampling covered more than a third of species. We aim to understand when the genus emerged and how the group has distributed in the Neotropics, especially in the Cerrado and Campos Rupestres. Finally, we also explored whether these processes were related with morphological transitions. Our analyses indicated a relatively ancient origin of the group, at the lower Tertiary in South America, though most species seems to have diversified more recently and through different processes, being the most common species dispersion. As observed in other groups of woody plants from Neotropics, Chamaecrista also seems to have forest origin with a subsequent occupation of open areas, in which the genus actually had its greatest diversity. Some derived morphological characters seem to be correlated with the occupation of drier habitats (Cerrado and Campos Rupestres), especially the appearance of glandular trichomes and the transition of habit

O município de São Paulo, a partir da década de 1970, apresentou uma rápida expansão de sua área periférica que resultou na perda de sua cobertura vegetal original. A cobertura vegetal foi reduzida a fragmentos isolados pelo rápido processo de expansão da urbanização. Esses remanescentes contam com a presença de vegetação natural secundária da Mata Atlântica, que antes ocupava boa parte do território paulista e que deu lugar à metrópole de hoje. Na tentativa de proteger esses remanescentes foram criadas unidades de conservação da natureza na paisagem urbana, como os Parques. Os parques estaduais Fontes do Ipiranga (PEFI) do Jaraguá (PEJ) e o Parque Natural Municipal Fazenda do Carmo (PNMFC) se encontram em uma situação semelhante no município de São Paulo: são unidades de proteção integral que guardam remanescentes florestais em áreas relativamente reduzidas e estão isolados em regiões densamente urbanizadas. Neste sentido trabalhou-se com a hipótese de que a condição de isolamento submeteu esses ambientes a situações que ameaçam sua conservação em longo prazo. Dentro dessa perspectiva, este estudo discute como a estrutura da paisagem pode influenciar na conservação dos remanescentes florestais protegidos por Parques que se encontram em situação de isolamento. Os Parques que devem garantir o mínimo de interferência de atividades humanas enfrentam grandes dificuldades em cumprir de forma efetiva sua função de unidade de proteção integral em ambientes urbanizados, existindo, uma relação conflituosa entre urbanização e conservação. A bacia hidrográfica foi definida como unidade de análise para este estudo, por se tratar de uma região natural e abranger também o entorno dos Parques: a bacia do córrego Ipiranga, que é um afluente do rio Tamanduateí, foi selecionada por apresentar em seu perímetro o Parque Estadual Fontes do Ipiranga (PEFI). As bacias hidrográficas dos ribeirões Vermelho e São Miguel e do córrego Santa Fé abrangem a área do Parque Estadual do Jaraguá (PEJ); e, a bacia hidrográfica do rio Aricanduva, conta com a presença do Parque Natural Municipal Fazenda do Carmo (PNMFC). Foram elaborados mapas de uso e cobertura da terra para a reconstituição da paisagem das bacias hidrográficas e para identificação das mudanças provocadas principalmente pelo processo de urbanização. Foram utilizadas fotografias áreas dos anos de 1962 e 1994, e, Imagens do satélite RapidEye para realização do mapeamento; e, posteriormente foram geradas métricas da paisagem para análise da situação atual e pretérita dos remanescentes florestais presentes nas bacias hidrográficas. Partiu-se dos pressupostos teóricos da Ecologia da Paisagem, observado como as mudanças do uso e cobertura da terra e o processo de urbanização interferiram na dinâmica e nas condições ecológicas desses remanescentes florestais protegidos por Parques no município de São Paulo. Com a análise dos dados obtidos a partir das métricas da paisagem foi possível estabelecer as principais tendências e prognósticos para a conservação desses fragmentos e discutir sobre ações possíveis para amenizar o isolamento e melhorar as condições ecológicas desses remanescentes. / The municipality of São Paulo, from the 1970s, presented a rapid expansion of its peripheral area that resulted in the loss of its original vegetation cover. The vegetation cover was reduced to fragments isolated by the process of urbanization expansion. These remnants have a presence of secondary natural vegetation of the Atlantic Rain Forest, which used to occupy a good part of the territory of São Paulo and that gave rise to today\'s metropolis. In an attempt to protect these remnants, nature conservation units were created in the urban landscape, such as the Parks. The Parque Estadual Fontes do Ipiranga (PEFI), Parque Estadual do Jaraguá (PEJ) and and the Parque Natural Municipal Fazenda do Carmo (PNMFC) are located in a non-municipal situation of São Paulo: they are integral protection units that keep remnants of forest in relatively small areas and are isolated in densely urbanized regions. In this sense we worked with a hypothesis of an isolation condition subjected these environments to situations that threaten their conservation in long term. From this perspective, this study discusses how a landscape structure can influence the conservation of forest remnants protected by Parks that are in isolation. The parks that must guarantee the minimum interference of human activities face great difficulties in effectively fulfilling their function as integral protection unit in urbanized environments, existing a conflicting relationship between urbanization and conservation. The hydrographic basin was defined as a unit of analysis for this study, because it is a natural region and also encompasses the surroundings of the Parks: a basin of the Ipiranga stream, which is a tributary of the Tamanduateí river, was selected for presenting in its perimeter Parque Estadual Fontes do Ipiranga (PEFI). As watersheds of the Vermelho and São Miguel streams and the Santa Fe stream cover an area of the Parque Estadual do Jaraguá (PEJ); And, a watershed of the Aricanduva river, counts on presence in the Parque Natural Municipal Fazenda do Carmo (PNMFC). Land use and land cover maps were prepared for a reconstruction of the river basin landscape and for the identification of the changes brought about by the urbanization process. Photographs were made of areas from the years 1962 and 1994, and, Images of the RapidEye satellite to perform the mapping; And, later, metrics of the landscape were generated to analyze the present and preterite situation of the forest remnants present in the hydrographic basins. It was based on the theoretical assumptions of Landscape Ecology, observed how changes in land use and coverage and the urbanization process interfered in the dynamics and ecological conditions of forest remnants protected by Parks in the city of São Paulo. With an analysis of the data obtained from the landscape metrics, it is possible to establish as main tendencies and prognoses for the conservation of the losses and to discuss possible actions to soften the isolation and to improve the ecological conditions of the remnants.

Brachyrhamdia é um gênero de bagres da família Heptapteridae do norte da América do Sul, ocorrendo nas bacias Amazônica (incluindo o Tocantins), do Orinoco e das Guianas. O presente trabalho compreende uma revisão taxonômica do gênero, com sua análise filogenética e inferências biogeográficas decorrentes. Atualmente, Brachyrhamdia é considerado ser constituído por cinco espécies, às quais este trabalho inclui a descrição de duas espécies novas, além do reconhecimento de uma possível terceira espécie. A análise filogenética confirmou o monofiletismo do gênero, apesar de colocá-lo como um agrupamento apical dentro de um grupo de Pimelodella, enquanto Pimelodella se demonstrou parafilético. Brachyrhamdia marthae e B. meesi são espécies-irmãs, basais a B. heteropleura, Brachyrhamdia sp. nova \"Araguaia-Tocantins\" e um grupo monofilético composto por B. imitator, B. rambarrani e Brachyrhamdia sp. nova \"Amanã\". As áreas de distribuição das espécies de Brachyrhamdia encerram localidades de terras baixas Amazônicas, em rios tipicamente de terras baixas ou de natureza mista, com uma porção de escudo. Fora isso, as espécies de Brachyrhamdia possuem possíveis associações miméticas com outras espécies de siluriformes, especialmente com o gênero Corydoras. Apesar da ausência de registros ecológicos do compartilhamento do mesmo nicho, em todas as localidades onde é encontrada uma espécie de Brachyrhamdia em particular também é encontrada outra espécie de siluriforme com grandes semelhanças no padrão de coloração, da qual se infere uma associação mimética. / Brachyrhamdia is a catfish genus of Heptapteridae family from northern South America, occurring in Amazonic (including Tocantins), Orinoco and Guyana basins. This work encompasses a taxonomic revision of the genus, as its phylogenetic analysis and derived biogeography\'s inferences. Nowadays, Brachyrhamdia is known to be constituted by five species, and this work includes the description of two new species, and recognizes a possible third species. The phylogenetic analysis confirmed the genus\' monophyletism, in spite of beign an apical grouping within Pimelodella, which is estabilished as paraphyletic. Brachyrhamdia marthae and B. meesi are sister-species, basal to B. heteropleura, Brachyrhamdia new species \"Araguaia-Tocantins\" and a monophyletic group compound by B. imitator, B. rambarrani and Brachyrhamdia new species \"Amanã\". The areas of distribution of Brachyrhamdia species are delimited within Amazonic lowlands, in tipically lowlands rivers or composite systems, which drains shield areas as well. Furthermore, Brachyrhamdia species have possible mimetic associations with other siluriforms, especially Corydoras. Despite the lack of ecological records about shared niche, in all Brachyrhamdia species localities is also found another siluriform species regarding huge coloration similarities, which the mimetic association is inferred.

O grupo Bothrops neuwiedi é composto por serpentes neotropicais que desempenham grande impacto na saúde pública, em decorrência de acidentes ofídicos. O grupo apresenta ampla distribuição ao longo da diagonal seca de formações abertas, desde o nordeste do Brasil até o noroeste da Argentina. A taxonomia atual, baseada principalmente em dados morfológicos qualitativos, não recupera as linhagens evolutivas apontadas pelas abordagens moleculares. O objetivo deste trabalho foi investigar o grupo B. neuwiedi utilizando análises filogenéticas, filogeográficas, biogeográficas, estimativa de datação e delimitação de espécies em um total de 276 indivíduos amostrados ao longo de toda a sua distribuição, incluindo representantes do Brasil, Bolívia, Argentina, Paraguai e Uruguai. As análises contemplaram três genes mitocondriais, dois nucleares, dois introns e 33 locos de microssatélites obtidos por sequenciamento de nova geração. Estimou−se, por meio do método de delimitação de espécies e análises filogeográficas, que o grupo B. neuwiedi possui ao menos 14 espécies, das quais oito já são reconhecidas (B. erythromelas, B. lutzi, B. mattogrossensis, B. marmoratus, B. neuwiedi, B. pauloensis, B. pubescens e B. diporus) e seis possíveis espécies (Bothrops sp. 1 a Bothrops sp. 6). O grupo teria se originado durante o Mioceno e diversificado durante o Plio-Pleistoceno. As flutuações climáticas do Pleistoceno, decorrentes dos ciclos glaciais e interglaciais, desempenharam um importante papel na diversificação das espécies e suas populações. Adicionalmente, eventos tectônicos que ocorreram durante este período também teriam influenciado na estruturação espacial da diversidade genética. Foi revelada uma intrincada relação do domínio biogeográfico Chaquenho (áreas abertas) com os domínios do Sudoeste da Amazônia e do Paraná (áreas de floresta). Nuances na temperatura e aridez, ora permitiram a expansão do Cerrado sobre as florestas, ora possibilitaram a expansão do Chaco sobre o Cerrado, levando à interrupção da conexão entre as populações de manchas de Cerrado nestes domínios florestais. Os resultados evidenciaram a complexidade da diversificação das serpentes na diagonal seca de formações abertas e, dependendo da linhagem, diferentes padrões puderam ser observados. A Linhagem Leste−Oeste (B. marmoratus, B. neuwiedi, Bothrops sp. 1) apresentou elevado grau de diversidade genética e elevada estruturação espacial, concordante com unidades geomorfológicas do relevo. Nas linhagens do sul do Brasil (B. pubescens e B. diporus) verificou−se um padrão de diversificação consistente com espécies incipientes em estágios iniciais do processo de especiação. Na região central do Cerrado, propõe−se que as espécies B. marmoratus, B. pauloensis e B. mattogrossensis apresentam forte estruturação no DNAmt e baixa estruturação nos marcadores nucleares em decorrência de fluxo gênico desigual mediado por machos. Baseado nas informações obtidas neste trabalho, sugerimos fortemente que o grupo Bothrops neuwiedi seja revisado sob uma perspectiva multidisciplinar. / The Bothrops neuwiedi group is composed of Neotropical snakes that have a serious impact on Brazilian public health, as they are responsible for a large number of snakebite accidents. The group is widespread along the dry diagonal of open formations in South America (Chacoan dominion), since northeast Brazil to northwest Argentina. Current taxonomic arrangement is based on blotches and color pattern, which does not represent the evolutionary lineages uncovered in molecular analyses. This study aims to investigate the B. neuwiedi group using phylogenetic analyses, biogeography, phylogeography, estimates of divergence, and species delimitation. A total of 276 representatives of the B. neuwiedi group were obtained throughout the geographic distribution of the group, including samples from Brazil, Bolivia, Argentina, Paraguay, and Uruguay; in addition, three mitochondrial and two nuclear genes, two introns, and 33 microsatellite loci were used. According species delimitation and phylogeographic approach, 14 species in the B. neuwiedi group could be delimited as follows: eigth species already recognized (B. erythromelas, B. lutzi, B. mattogrossensis, B. marmoratus, B. neuwiedi, B. pubescens, B. diporus, and B. pauloensis) and six other putative species (Bothrops sp. 1 to Bothrops sp. 6). Estimates of divergence placed the origin of the B. neuwiedi group in the Miocene and diversification in the Plio−Pleistocene. Climatic fluctuations and tectonic events during the Pleistocene probably played an important role in the species and populations diversification. An intricate network was revealed with Chacoan dominion (open area) and South-west and Paraná dominion (forested areas). Nuances in temperature and aridity, sometimes allowed the expansion of the Cerrado on forests, sometimes allowed the expansion of the Chaco on the Cerrado, leading to the interruption of the connection between the populations of Cerrado patches of forest in these areas. The results showed the complexity of the diversification of snakes in the dry diagonal of open formations and depending on the lineage studied, different patterns were observed. East−West Lineage (B. marmoratus, B. neuwiedi, Bothrops sp. 1) presented high genetic diversity and high genetic and spatial structure associated with Brazilian geomorphology. B. pubescens and B. diporus revealed a pattern consistent with incipient species in the early stages of speciation. B. marmoratus, B. pauloensis and B. mattogrossensis presented strong structure in mtDNA and and weak structure in nuclear markers due to male−biased gene flow.

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Currently, the species faces frequents events of El Ni?o that affect the base of the food chain in the equatorial Pacific Ocean, consequently the predatory and top predatory species like the fur seals. Both hunting and El Ni?o events led the species to Red List of Endangered Species of International Union for Conservation of Nature, indicating a ?50% of population in the last 30 years. However, until now, there are no studies related to conservation problems and genetic variability and how genetic variability is represented in the space along the distribution range of Galapagos fur seal. To access the information about genetic diversity, population structure and demographic oscillation as well as how genetic variability is represented in the space we used molecular techniques applying two kinds of markers: a mitochondrial marker (control region, maternal inheritance) and nuclear marker (18 microsatellites loci, bi parental inheritance). The fur seals were sampled in the three major Galapagos fur seals colonies: Cape Hammond (Fernandina Island), Banks Bay (Isabela Island) and Cape Marshall (Isabela Islands). Our results showed that there is a strong female natal fidelity with 33.9% of mtDNA occurring among partitioned colonies. In this sense, this natal philopatry, was converted in fine-scale matrilineal population structure. In the other hand, the population structure inferred by nuclear loci was week. This suggests that males are the main responsible by gene flow among sampled localities, even in a highly mobile species like Galapagos fur seal. Here we discuss the importance of natal philopatry and fine-scale matrilineal population structure of Galapagos fur seal species and their implications for management and conservation in the one of the most representative wildlife sanctuaries, the Galapagos archipelago. / O lobo-marinho-de-Gal?pagos, Arctocephalus galapagoensis, apresenta uma das mais restritas distribui??es geogr?ficas dentro da fam?lia Otariidae, distribuindo-se especialmente ? regi?o noroeste das Ilhas Gal?pagos. Entre as principais amea?as ? conserva??o da esp?cie est? a ca?a, respons?vel pela quase extin??o da esp?cie no in?cio do s?culo XIX, devido ao alto valor econ?mico e de subsist?ncia da pele e gordura destes animais; e tamb?m os recorrentes eventos do fen?meno El Ni?o, o qual afeta toda a base da cadeia tr?fica do Pac?fico equatorial e, por consequ?ncia, as esp?cies predadoras e de topo de cadeia tr?fica como o lobo-marinho-de-Gal?pagos. Tanto a ca?a, quanto os recorrentes eventos de El Ni?o, levaram a esp?cie ? Lista Vermelha de Esp?cies Amea?adas de Extin??o da Uni?o Internacional para a Conserva??o da Natureza (do ingl?s IUCN), indicando que houve ?50% de redu??o populacional observada nos ?ltimos 30 anos. No entanto, at? o momento, n?o h? estudos que verificaram poss?veis efeitos dos problemas mencionados sobre a variabilidade gen?tica da esp?cie, nem como esta variabilidade est? representada espacialmente ao longo da ?rea de distribui??o do lobo-marinho-de-Gal?pagos. Para obter as informa??es de diversidade gen?tica, estrutura??o populacional e para verificar poss?veis oscila??es demogr?ficas, bem como verificar como a variabilidade est? distribu?da no espa?o n?s utilizamos de t?cnicas moleculares, aplicando o uso de dois tipos de marcadores de DNA: um mitocondrial (mtDNA - de heran?a exclusivamente materna), atrav?s da aplica??o de parte da regi?o controladora, e outro nuclear (heran?a bi-parental), atrav?s da aplica??o de 18 loci de microssat?lites de DNA em amostras coletadas nas tr?s maiores col?nias da esp?cie: Cabo Hammond (Ilha Fernandina), Ba?a Banks (Ilha Isabela) e Cabo Marshall (Ilha Isabela). Verificamos com nossos resultados que mesmo as col?nias analisadas estando distante cerca de 70 Km h? uma forte fidelidade das f?meas ao s?tio de nascimento, com 33,9% da varia??o no mtDNA estando particionada entre col?nias. Por outro lado, a estrutura populacional inferida atrav?s dos loci nucleares foi fraca. Nossos resultados al?m de mostrar uma forte fidelidade das f?meas ao s?tio de nascimento, mostrou que os machos s?o os principais respons?veis pelo fluxo g?nico e que a fidelidade ao s?tio de nascimento das f?meas pode ser convertida em estrutura??o gen?tica espacial em fina escala, mesmo em esp?cies que apresentam alta capacidade de deslocamento como ? o caso de diversas esp?cies de pin?pedes e, em especial, o lobo-marinho-de-Gal?pagos. Neste sentido, discutimos tamb?m neste estudo a import?ncia da filopatria natal e consequente estrutura??o gen?tica em fina escala para o manejo e conserva??o do lobo-marinho-de-Gal?pagos, neste que um dos maiores e mais representativos santu?rios da vida silvestre, o arquip?lago de Gal?pagos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 425634.pdf: 11636772 bytes, checksum: 2b2fc72ae18a9abf8e4b116ae7903ff8 (MD5) Previous issue date: 2010-03-29 / A biogeografia hist?rica envolve estudos acerca dos padr?es de distribui??o dos seres vivos permitindo-nos compreender processos evolutivos. Este estudo objetivou aplicar e analisar dois m?todos (an?lise de parcim?nia de endemismo - PAE e panbiogeografia) com dados de peixes de ?gua doce da regi?o Neotropical e comparar com outros estudos, al?m de salientar o poder da biogeografia como ferramenta conservacionista baseada em levantamento de estudos biogeogr?ficos recentes da regi?o. Em um primeiro momento foi feito um trabalho usando dados de dez artigos recentes publicados com ?nfase em conserva??o e observou-se que tanto a an?lise de parcim?nia de endemismo quanto a panbiogeografia s?o m?todos biogeogr?ficos eficientes no aux?lio ao combate da perda de biodiversidade quando indicadas ?reas para se conservar. No m?todo PAE usa-se principalmente quadr?culas, e no m?todo panbiogeogr?fico os n?s s?o equiparados como hotspots da biogeografia ecol?gica. No segundo estudo foi feita uma an?lise de parcim?nia de endemismo incluindo 131 esp?cies e 44 unidades geogr?ficas operacionais onde se obteve a rela??o entre ?reas pr? estabelecidas como ecoregi?es de peixes de ?gua doce. No cladograma de consenso encontrado contendo 275 passos, ?ndice de consist?ncia 0,47 e ?ndice de reten??o 0,51 observaram-se congru?ncias compat?veis com caracter?sticas hist?ricas e ecol?gicas das unidades geogr?ficas, baseadas nos sistemas de drenagens que caracterizam as ecoregi?es utilizadas. No terceiro estudo aplicou-se a an?lise de tra?os para esp?cies de cinco g?neros inclu?dos em Siluriformes e Characiformes (Auchenipterichthys, Auchenipterus, Boulengerella, Cetopsis e Roeboides). A partir dos tra?os individuais de cada esp?cie obtiveram-se nove tra?os generalizados, e dois n?s panbiogeogr?ficos que podem ser indicados como regi?o para conserva??o, visto que s?o em ?reas j? detectadas como de grande biodiversidade. Compara??es foram feitas com outros estudos de panbiogeografia e semelhan?as em alguns tra?os foram apontadas. Baseado nas an?lises realizadas com peixes e compara??es realizadas entre as duas metodologias, este estudo conclui que a biogeografia hist?rica ? uma ferramenta importante e eficaz no aux?lio da conserva??o de grupos taxon?micos diversos da regi?o Neotropical.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431772.pdf: 662662 bytes, checksum: 03d09987b626e32b1598af236814d904 (MD5) Previous issue date: 2011-03-25 / O lobo-marinho sul-americano, Arctocephalus australis, est? distribu?do ao longo da costa do hemisf?rio sul com col?nias reprodutivas localizadas desde o Peru at? o Uruguai. Este trabalho foca na UES do Atl?ntico e cobre a maioria de suas col?nias. No passado recente, v?rias col?nias sofreram dr?sticas redu??es populacionais com a ca?a e os eventos de El Ni?o. Muitos estudos focaram na an?lise da UES do Pac?fico, no entanto, pouco se sabe sobre a UES do Atl?ntico. Neste estudo a estrutura populacional e a variabilidade gen?tica destas popula??es foram avaliadas atrav?s da regi?o controle do DNA mitocondrial e 11 loci de microssat?lites. Os resultados encontraram alto n?vel de diversidade gen?tica nesta regi?o, sem sinal de gargalo gen?tico recente, mas com sinais de uma expans?o populacional iniciada entre 200.000 e 100.000 anos atr?s. Um sinal de estrutura??o foi encontrado entre as col?nias do Uruguai e Chubut quando avaliado a partir do DNA mitocondrial, provavelmente causado pela forte filopatria das f?meas. No entanto, a an?lise de microssat?lite n?o revelou a exist?ncia de estrutura??o, mesmo entre as diversas subpopula??es mais distantes, sugerindo que o fluxo g?nico seja mediado pelos machos. Para fins de conserva??o, estes resultados mostram que o lobo-marinho sul-americano da UES do Atl?ntico ? uma ?nica popula??o, e por causa disso, medidas de seguran?a devem ser alinhadas entre os pa?ses de sua distribui??o

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 447225.pdf: 644483 bytes, checksum: 988f24a45a0bd2878db09f4dc1d4f992 (MD5) Previous issue date: 2012-03-26 / The genus Chiroxiphia, small birds of Pipridae, currently comprises five species, including C. pareola, the species with wider geographic distribution, with four subspecies. Chiroxiphia boliviana was until recently considered a subspecies of C. pareola, but no detailed analysis has been published to justify such treatment, and in the absence of robust data, some authors question the validity of C. boliviana as a species. In this study, we used sequences of two mitochondrial and two nuclear genes to infer evolutionary relationships between Chiroxiphia species and all subspecies of the C. pareola as well as the relationships between Chiroxiphia and Antilophia. All phylogenies shown Chiroxiphia as paraphyletic as currently defined, since the two species of the Antilophia are included within Chiroxiphia as sister of C. boliviana. Chiroxiphia boliviana should be treated as full species, since it is not closely related to C. pareola and is clearly distinct from Antilophia. Within C. pareola four independent evolutionary lineages were identified, two of them corresponding to the subspecies C. p. regina and C. p. napensis, the other two are lineages separated by the lower Amazon River, with individuals from the north mixed with individuals of C. p. atlantica. The pattern observed for the complex C. pareola suggests that there is no deep genetic structure between the Amazonian centers of endemism, except for the separation between the northern and southern of the lower Amazon River. Therefore, the theory that large Amazonian rivers were important barriers to gene flow was not supported for the formation of the distinct evolutionary lineages within the C. pareola group. We recommend the synonymization of Antilophia with Chiroxiphia, which has priority, and the treatment as full species to C. regina and C. napensis. / O g?nero Chiroxiphia, pequenos passeriformes da fam?lia Pipridae, compreende atualmente cinco esp?cies, sendo que C. pareola, a esp?cie com distribui??o geogr?fica mais ampla, inclui quatro subesp?cies. Anteriormente, todos estes t?xons foram tratados como esp?cies plenas, por outro lado, C. boliviana foi at? recentemente considerada como subesp?cie de C. pareola, por?m nenhuma an?lise detalhada foi publicada para justificar tal tratamento, e na aus?ncia de dados robustos, alguns autores questionam a validade de C. boliviana como esp?cie. Neste estudo, usamos sequ?ncias de dois genes mitocondriais e dois genes nucleares para inferir as rela??es evolutivas, atrav?s de diversos m?todos filogen?ticos, entre as esp?cies de Chiroxiphia e de todas as subesp?cies de C. pareola, assim como as rela??es entre Chiroxiphia e Antilophia. Os resultados mostram que Chiroxiphia como atualmente definido ? parafil?tico, uma vez que as duas esp?cies de Antilophia est?o inclu?das dentro de Chiroxiphia, como irm?s de C. boliviana. C. boliviana deve ser tratada como esp?cie plena, uma vez que esta esp?cie n?o est? proximamente relacionada com C. pareola. Dentro de C. pareola quatro linhagens evolutivas independentes foram identificadas, duas delas correspondendo ?s subesp?cies C. p. regina e C. p. napensis. As duas outras linhagens s?o separadas atualmente pelo baixo rio Amazonas, estando os indiv?duos do norte misturada com os indiv?duos de C. p .atlantica. O padr?o observado para o complexo C. pareola sugere que n?o exista nenhuma estrutura??o profunda entre os Centros de Endemismo Amaz?nicos, exceto para a separa??o Norte e Sul do baixo Amazonas. Portanto, a hip?tese dos grandes rios Amaz?nicos como barreira para o fluxo g?nico pode ser refutada para a forma??o da maior parte das distintas linhagens evolutivas dentro do grupo C. pareola. Em rela??o ? nomenclatura, recomendamos a inclus?o de Antilophia em Chiroxiphia, o qual tem prioridade, e o tratamento como esp?cie plena para C. regina e C. napensis.