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Análise morfológica e filogeográfica em jabutis brasileiros (Testudines) /Silva, Tiago Lucena da. January 2015 (has links)
Orientador: Claudia Regina Bonini Domingos / Banca: André Luis da Silva Casas / Banca: Richard Carl Vogt / Banca: Lilian Castiglioni / Banca: Luis Henrique Florindo / Resumo: Esse estudo avaliou dados sobre: biogeografia, vocalização, morfologia, citogenética, perfil de hemoglobinas e do marcador molecular citocromo b em jabutis brasileiros, no intuito de explorar o potencial taxonômico discriminativo das metodologias avaliadas. Duas espécies de jabutis são descritas para o Brasil, sendo elas, C. denticulatus e C. carbonarius, entretanto, observou-se, inicialmente com base em caracteres morfológicos e de coloração, a existência de populações que não correspondiam ao padrão típico da espécie C. carbonarius, sendo classificados neste estudo como morfotipos 1 e 2. A hipótese proposta é que os morfotipos correspondam a espécies já diferenciadas, e que não devem ser consideradas como uma mesma unidade taxonômica que C. carbonarius. Foram avaliados jabutis depositados no Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) e no Museu Paraense "Emílio Goeldi", nos bosques municipais de São José do Rio Preto - SP e Araçatuba - SP e no Criatório de Animais Silvestres e Exóticos "Reginaldo Uvo Leone" em Tabapuã - SP. Com base nos dados obtidos pela avaliação biogeográfica dos espécimes na literatura, observou-se que, a distribuição da espécie C. carbonarius está associado à região Nordeste do país, não havendo no entanto, espécimes depositados nas coleções visitadas. No Brasil, C. denticulatus ocorre em todos os estados da Amazônia Legal, além de apresentar registros isolados para o domínio da Floresta Atlântica, nos estados do Espírito Santo e do Rio de Janeiro, e para a região Centro-Oeste, nos estados de Goiás, Mato Grosso e Mato Grosso do Sul. Na região Nordeste, apresenta ocorrência no estado da Bahia. O morfotipo 1, apresenta distribuição geográfica mais abrangente que C. carbonarius e possivelmente é atribuído a ele, os relatos de distribuição associados a C. carbonarius, indicando associação equivocada do morfotipo 1 como uma mesma unidade taxonômica... / Abstract: This study evaluated associated data on biogeography, vocalization, morphology, cytogenetics, hemoglobin and molecular profile using cytochrome b, from Brazilian tortoises in order to explore the discriminative potential of the evaluated taxonomic techniques. In Brazil, two species of tortoises are described, C. carbonarius and C. denticulatus, however, some animals initially recognized based on morphological characters and coloring did not correspond to the typical pattern of C. carbonarius, being classified as morphotypes 1 and 2. The proposed hypothesis in this study is that the morphotypes are already differentiated species and should not be considered as a single taxonomic unit with C. carbonarius. Tortoises from the National Institute for Amazonian Research (INPA), "Emilio Goeldi" Museum - PA, municipal zoos of São José do Rio Preto - SP and Araçatuba - SP and "Reginaldo Uvo Leone" breeding farm for Wild and Exotic Animals in Tabapuã - SP, were analyzed. Based on the data obtained by biogeographic evaluation of specimens in the literature, it was found that the distribution of C. carbonarius is associated with the Northeast region, with no animals deposited in the visited collections. In Brazil, C. denticulatus occurs in all states of the Amazonia Legal besides presenting isolated individual records for the domain of the Atlantic Forest in the states of Espirito Santo and Rio de Janeiro, and in the Midwest region in the states of Goias, Mato Grosso and Mato Grosso do Sul. In the Northeast region, it occurrs in the state of Bahia. The morphotype 1 has a wider geographical distribution than C. carbonarius, and it is possibly attributed to several reports distribution associated with C. carbonarius, indicating erroneous association of morphotype 1 as a single taxonomic unit with C. carbonarius. The morphotype 2 was observed only in the states of Pará, Maranhão and Piauí. These data indicate that part of the allocated distribution.. / Doutor
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Acanthobothrium Blanchard, 1948 from the northwest Atlantic and their phylogenetic relationships with freshwater lineages / Acanthobothrium Blanchard, 1948 do Noroeste Atlântico e seu relacionamento filogenético com linhagens de água doceGolfetti, Yu 18 December 2018 (has links)
Parasite documentation has been an important tool to understand host history and co-evolutionary processes in these associations. Acanthobothrium is a worldwide genus of cestodes, and it is a parasite of sharks, skates and rays, with almost 200 nominal species. Recent studies are presenting new hypotheses on cestodes distribution and host specificity patterns. Due to their large distribution, geographical and in host taxa, Acanthobothrium seems to be a good model to evaluate these hypothesis. The Bay of Marajó is an estuarine area were freshwater stingrays of the family Potamotrygonidae share the same environment with marine dasyatid rays. There is no documentation about the dasyatid fauna of Acanthobothrium for Bay of Marajó, neither their relationships with freshwater lineages or their hosts. In our goal to understand those evolutionary events, our results revealed six new lineages of Acanthobothrium, parasites of Hypanus guttatus and Fontitrygon geijskesi, of which four are formally described. Five of those new lineages are included in a clade exclusive to Northwest Atlantic and Caribbean Sea. Acanthobothrium sp. 10 was recovered as sister of clade formed by marine Acanthobothrium sp. 9 sensu Trevisan and freshwater Acanthobothrium sp. 2 sensu Cardoso Jr. The specificity pattern of Acanthobothrium has been discussed and our results corroborate this discussion when we observed four species of Acanthobothrium sharing two different hosts of different genera. Also, host sample size may be correlated with the specificity and strict specificity patterns of the parasite to their hosts. The absence of Fontitrygon colarensis in our samples and the incongruities in comparison to Hypanus guttatus make us question the taxonomic status of F. Colarensis / A documentação de organismos parasitas tem sido uma ferramenta importante para entender a história de seus hospedeiros e os processos coevolutivos implícitos nessas associações. Acanthobothrium é um gênero de cestóideos mundialmente distribuido, parasita de tubarões, skates e raias, com quase 200 espécies nominais. Estudos recentes vem apresentando novas hipóteses sobre a distribuição e especificidade dos cestóides. Devido à sua larga distribuição geográfica e em taxons hospedeiros, Acanthobothrium parece ser um bom modelo para avaliar estas hipóteses. A Baía de Marajó é uma área estuarina onde arraias de água doce da família Potamotrygonidae compartilham o mesmo ambiente com raias marinhas, especialmente dasiatídeos. Não há documentação sobre a fauna de Dasyatidae para Acanthobothrium a Baía de Marajó, nem sobre as relações destas com linhagens de água doce e seus hospedeiros. Com o objetivo de entender esses eventos evolutivos, nossos resultados mostraram seis novas linhagens de Acanthobothrium, parasitas de Hypanus guttatus e Fontitrygon geijskesi, das quais quatro são descritas. Cinco dessas novas linhagens estão incluídas em um clado exclusivamente do Noroeste Atlântico e do Mar do Caribe. Acanthobothrium sp. 10 foi recuperado como grupo irmão de um clado formado pela linhagem marinha Acanthobothrium sp. 9 sensu Trevisan e pela linhagem de água doce Acanthobothrium sp. 2 sensu Cardoso Jr. O padrão de especificidade de Acanthobothrium tem sido discutido e nossos resultados corroboram esta discussão quando observamos quatro espécies de Acanthobothrium compartilhando duas hospedeiras de diferentes gêneros. Além disso, tamanho amostral de hospedeiros pode estar relacionado com nosso entendimento sobre os padrões de especificidade estrita do parasita aos seus hospedeiros. A ausência de F. Colarensis em nossas amostras e as incongruências em comparação com H. Guttatus nos fazem questionar o status taxonômico de F. Colarensis
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Comunidade de mamíferos em uma paisagem fragmentada no município de Cachoeiras de Macacu, RJ / Community of small mammals in a fragmented landscape on the Cachoeiras de Macacu municipality, RJHermano Gomes Albuquerque 11 July 2010 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A Mata Atlântica sofre fortes pressões antrópicas desde o descobrimento do Brasil. Desse contexto surge a necessidades de estudos que busquem os efeitos dessa degradação sobre a biodiversidade desse bioma. Mamíferos são bons bioindicadores da qualidade ambiental dos ecossistemas a eles associados. Sendo assim, esse estudo objetivou a busca da relação entre a estrutura da comunidade de mamíferos e a estrutura da cobertura vegetal de uma paisagem do município de Cachoeiras de Macacu, RJ. Os resultados apontaram para uma relação entre a distância entre os fragmentos e sua composição, ou seja, quanto mais próximos os fragmentos estão entre si, mais semelhantes eles são em relação a composição da comunidade de mamíferos. Nessa perspectiva, refletimos sobre a importância da Teoria de Biogeografia de Ilhas e da Teoria de Metapopulações no pensar de estratégias conservacionistas e entendemos que elas podem ajudar na construção de modelos complexos sobre a composição das espécies de mamíferos. / The Atlantic Forest suffers strong anthropogenic pressures since the discovery of Brazil. Because of this context, the need for studies that seek the effects of degradation on the biodiversity of this biome is substantial. Mammals are good bioindicators of ecosystem quality. Thus, this study aimed to search the relationship between the structure of mammal community and vegetation cover in a landscape of the city of Cachoeiras de Macacu, RJ. Results showed a relationship between the distance between the fragments and their composition, so how closer the fragments are, more similar they are in relation to community composition of mammals. From this perspective, we reflect on the importance of the Theory of Island Biogeography and Metapopulation Theory to think of conservation strategies and understand that they can help in the construction of complex models on the composition of species of mammals
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O Complexo Cliona celata Grant, 1826 (Porifera, Demospongiae) na América do Sul: uma abordagem molecular e morfológica / The Cliona celata Grant, 1826 (Porifera, Demospongiae) complex in South America: a molecular and morphologic approach.Thiago Silva de Paula 18 February 2009 (has links)
Este trabalho visou a averiguação do status taxonômico das esponjas bioerosivas do complexo Cliona celata da América do Sul por meio de técnicas moleculares, utilizando como marcadores a subunidade I da Citocromo c oxidase (cox1) e os Espaçadores Internos Transcritos do RNAr nuclear (ITS1 e ITS2), além de testar outros marcadores. Igualmente, avaliou o grau de variabilidade morfológica encontrado nessas espécies, principalmente por meio da morfometria dos tilóstilos, a fim de estabelecer uma diagnose para elas. Ainda, tentou determinar as relações filogenéticas dessas espécies com as demais esponjas bioerosivas utilizando o gene 28S do RNAr nuclear. Foi possível determinar a existência de cinco clados de esponjas bioerosivas do complexo Cliona celata para a América do Sul, e dois outros clados não-sulamericanos, por meio dos marcadores moleculares utilizados. Embora seja discutida a validade desses clados como espécies distintas, continua impossível, por meio de
caracteres morfológicos, distingui-los, e dessa forma, a proposição formal de novas espécies é evitada. Através da reconstrução filogenética do grupo, é possível verificar que as esponjas bioerosivas analisadas se apresentaram como um grupo monofilético, e se separa em três principais clados: Pione, Spirastrellidae, e Clionaidae. Por meio desta, é sugerida a alocação das espécies do complexo C. viridis e C. schimidti dentro de Spirastrella, além de ser necessária a criação de um novo gênero para alocar as espécies do novo complexo identificado aqui, o complexo C. delitrix. / This work intended the validation of the taxonomic status of boring sponges from the Cliona celata complex of South America by molecular techniques, using Cytochrome coxidase, subunit I (cox1), and Internal Transcribed Spacers (ITS) of rRNA nuclear genes as molecular markers. Additionally, the degree of morphological variation necessary to establisha correct diagnosis for the studied species was evaluated, and additional markers were tested. Finally, a phylogenetic analysis comparing this species with other boring sponges, using the 28S rRNA nuclear gene was carried out. It was possible to point out the existence of five clades of boring sponges from the C. celata complex in South America, and two more from Mexico and Australia. Although these clades can comprise new valide species, no morphological evidence was found to separate them, and thus, no formal species descriptions were presented. Through out phylogenetic analyses it was possible to conclude that boring sponges form a monophyletic group, which can be separated in three clades: Pione, Spirastrellidae, and Clionaidae. This work suggests to allocate C. viridis and C. schimidti species complexes inside Spirastrella, and to create a new genus for the new C. delitrix species complex.
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Desenvolvimento regional e meio ambiente : desafios para a construção da região metropolitana de Bogotá (Colômbia) /Beltran, Jair Preciado. January 2012 (has links)
Orientador: Roberto Braga / Banca: Ana Maria Marques Camargo Marangoni / Banca: Silvia Aparecida Guarnieri Ortigoza / Banca: Angelita Matos Souza / Banca: Antonio Cesar Leal / Resumo: A cidade de Bogotá e seu território regional vêm experimentando um crescimento físico e demográfico desde o início da década de 1980 que determina diretamente o surgimento de fenômenos sociais e eventos ambientais extremamente complexos. A formação de Bogotá, como uma cidade importante no contexto nacional, desde meados do século passado, evidenciou uma maior procura de habitação, serviços públicos, infra-estrutura, serviços comunitários, o emprego e o bem-estar público. Nesse sentido, os municípios que compõem a área metropolitana de Bogotá constituem o cenário de uma dinâmica muito significativa, pois passaram de ser um território produtivo rural virando um território ocupado por pólos industriais, um crescimento desordenado, uma estagnação da produção agrícola e uma complexa e desordenada aglomeração urbana. Durante esse período, tem prevalecido uma abordagem regional baseada no desenvolvimento econômico. Questões como a industrialização, competitividade e integração da região no contexto de uma economia global, têm negligenciado a dimensão ambiental o que é um erro grave em termos de planejamento para o desenvolvimento regional. Nesse sentido, é claro que a consolidação da região metropolitana tem que estar associada à gestão ambiental do território, que possibilite melhores possibilidades à sociedade, garantindo uma sustentabilidade num contexto de tempo. É preciso reconhecer que a Região Metropolitana de Bogotá transbordou os limites de equilíbrio, pela dinâmica de crescimento da cidade de Bogotá até os municípios vizinhos e de eles até a cidade. Além disso, desde a perspectiva social surgem com mais força problemas como: o deslocamento forçado, a pobreza e a marginalização, fenômenos que merecem uma revisão para demonstrar a relação entre a dinâmica da... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The city of Bogotá and its regional territory have been experiencing a physical and demographic growth since the early 1980s that directly determines the emergence of social phenomena and environmental events extremely complex. The formation of Bogota, as an important city in the national context, since the middle of last century, revealed an increased demand for housing, utilities, infrastructure, community services, employment and public welfare. In this sense, the municipalities that comprise the metropolitan area of Bogota are setting up the dynamics of a very significant since passed from being a rural productive land turned into a territory occupied by industrial centers, a disordered growth, stagnation in agricultural production and a complex and chaotic urban agglomeration. During this period, there has prevailed an approach based on regional economic development. Issues such as industrialization, the region's competitiveness and integration in the context of a global economy, have neglected the environmental dimension, which is a serious mistake in terms of planning for regional development. Thus, it is clear that consolidation of the metropolitan region have to be associated with the environmental planning of the territory which enables better possibilities for ensuring a sustainable society in a context of time. We must recognize that the Metropolitan Area of Bogotá overflowed the bounds of balance, the dynamic growth of Bogota to the neighboring municipalities of them to the city. Moreover, from social problems emerge more strongly as the forced displacement, poverty and marginalization, phenomena that deserve a review to demonstrate the relationship between the dynamics of change of the territory and society that characterizes, especially because such phenomenon's must to be involved into a urban... (Complete abstract click electronic access below) / Resumen: La ciudad de Bogotá y su área de influencia ha venido experimentando un crecimiento físico y demográfico desde comienzos de la década de 1980 que ha determinado de forma directa la aparición de fenômenos sociales y hechos ambientales sumamente complejos. La conformación de Bogotá como una ciudad importante en el contexto nacional desde mediados del siglo pasado, se traduce en una mayor demanda de vivienda, servicios públicos, infraestructura vial, servicios comunitarios, empleo y asistencia social entre otros. A su vez, los municipios que conforman la Región Metropolitana de Bogotá constituyen un escenario municipal y rural con una dinámica muy significativa, pues han pasado de ser un territorio productivo en lo rural a ser depositarios de zonas francas, un crecimiento desordenado, un estancamiento en la producción agrícola y una conurbación que ha venido determinando un mapa cambiante especialmente en las dos últimas décadas. A lo largo de este periodo, ha sido prevalente un enfoque regional basado en el desarrollo econômico. Temas como la competitividad, la industrialización y la inserción de la región en el contexto de una economía global, han dejado de lado la dimensión ambiental, lo que constituye un grave error en términos de planificación del desarrollo regional. En ese orden de ideas, es claro que la consolidación de la Región Metropolitana, debe estar asociada a la gestión ambiental del territorio, pues es evidente que algunos enfoques privilegian el desarrollo econômico regional y no incorporan la dimensión ambiental en la magnitud que establece la normatividad y la dinámica mundial al respecto. Igualmente el concepto de sostenibilidad ambiental territorial no ha sido abordado de manera real desde las instituciones y la academia, mostrando un evidente rezago en comparación a ciudades región como... (Resumen completo clicar acceso eletronico abajo) / Doutor
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A família Squillidae (Crustacea : Hoplocarida : Stomatopoda) no Atlântico Sul ocidental : taxonomia e biogeografia /Bento, Rodrigo Tadeu. January 2009 (has links)
Orientador: Gustavo Augusto Schmidt de Melo / Banca: Ana Luiza Brossi Garcia / Banca: Valter José Cobo / Resumo: O estudo taxonômico e biogeográfico da família Squillidae Latreille, 1802, objetivou aprimorar o conhecimento das espécies que ocorrem no litoral brasileiro, uruguaio e argentino, esclarecendo aspectos sistemáticos e analisando a biogeografia das espécies distribuídas no Oceano Atlântico sul ocidental. De acordo com o presente trabalho, a família Squillidae, encontrada na região, é representada por 19 espécies, distribuídas em 7 gêneros. O gênero Rissoides, com R. calypso, é citado, pela primeira vez para o Atlântico ocidental, no litoral brasileiro. Três padrões longitudinais e seis padrões latitudinais de distribuição, foram verificados nos Squillidae. A análise do material forneceu dados para a ampliação dos registros de ocorrência de quatro espécies no Atlântico sul ocidental: Meiosquilla quadridens, M. tricarinata, R. calypso e Squilla brasiliensis. / Abstract: The taxonomic and biogeographical study of the family Squillidae Latreille, 1802, aimed to improve the knowledge of species occurring in the Brazilian, Uruguayan and Argentine coast, clarifying systematic aspects and analysing the biogeography of species distributed in the western South Atlantic Ocean. According to this work, family Squillidae found in the region is represented by 19 species, distributed in 7 genera. The genus Rissoides with R. calypso is cited for the first time for the western Atlantic Ocean from Brazilian coast. Three longitudinal patterns and six latitudinal patterns of distribution were recorded on the Squillidae. The analysis of the material provided data for the expansion of the records of occurrence of four species in the South West Atlantic: Meiosquilla quadridens, M. tricarinata, R. calypso e Squilla brasiliensis. / Doutor
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Riqueza e pambiogeografia de samambaias e licófitas da província da caatingaSilvestre, Leandro Costa 14 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-02-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Ferns and Lycophyta species that occur in the Caatinga Province were recorded and their
biogeographical relations established using a Pambiogeographic analysis. The study
aimed to conduct an analysis of the Panbiogeography of ferns and lycophytes species
inventoried for the Province of Caatinga, evaluating their global distribution, as well as
the explanation of this distribution based on the plant geography of South America and
biogeographic processes. 52 species of ferns and five of lycophytes were recorded. The
most represented genera in the neotropics were Anemia Sw (10 spp.), Adiantum L (2
spp.), Doryopteris J. Sm. (2 spp.), Sticherus C. Presl (2.spp.). About the species restricted
to Brazil, only Anemia dardanoi Brade was verified as endemic to the Caatinga Province.
Pambiogeographic analysis allowed the recognition of 54 individual tracks and 17
generalized tracks. The analyzes also showed 10 pambiogeographics nodes delimited to
Neotropical region. The ferns and Lycophyta distribution occurrent in the Caatinga
Province was mainly on seasonally dry tropical forests and Neotropical savannas in the
Americas, indicating a continues distribution on these areas. / As espécies de samambaias e Lycophyta que ocorrem na Província da Caatinga foram
registradas e suas relações biogeográficas estabelecidas empregando uma análise
Pambiogeográfica. O estudo visou realizar uma análise de Pambiogeografia das espécies
de samambaias e licófitas inventariadas para a Província da Caatinga avaliando a sua
distribuição global, bem como a explicação dessa distribuição com base na fitogeografia
da América do Sul e processos biogeográficos. Foram registradas 52 espécies de
samambaias e cinco licófitas. Os gêneros com maior representatividade na região
neotropical foram Anemia Sw (10 spp.), Adiantum L (2 spp.), Doryopteris J. Sm. (2
spp.), Sticherus C. Presl (2.spp.). Das espécies restritas ao Brasil apenas Anemia
dardanoi Brade foi constatada como endêmica da Província da Caatinga. A análise de
Pambiogeografia permitiu o reconhecimento de 54 traços individuais e 17 traços
generalizados. As análises também registraram 10 nós pambiogeográficos delimitados a
região neotropical. A distribuição das samambaias e Lycophyta ocorrentes na Província
da Caatinga deu-se principalmente sobre as florestas tropicais sazonalmente secas e
savanas neotropicais nas Américas, indicando uma distribuição continua sobre estas
áreas.
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DistribuiÃÃo geogrÃfica e modelagem de nicho de espÃcies endÃmicas de Erythroxylaceae na regiÃo neotropical. / Geographical distribution and ecological niche modelling of endemic species of Erythroxylaceae in the Neotropical regionLuciana Silva Cordeiro 18 February 2013 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / A grande riqueza de espÃcies e endemismos na regiÃo tropical à influenciada pela quantidade de tipos vegetacionais e condiÃÃes ambientais favorÃveis para a manutenÃÃo da diversidade. Para este estudo foi selecionado o gÃnero Erythroxylum que tem no Brasil um dos centros de endemismos mais importantes, totalizando 74 espÃcies com distribuiÃÃo restrita ao paÃs. Em Erythroxylum sÃo reconhecidas 19 seÃÃes, das quais nove estÃo representadas na flora brasileira. A partir de conhecimentos prÃvios sobre os padrÃes de distribuiÃÃo, Ãreas de endemismo e informaÃÃes obtidas sobre as espÃcies do gÃnero, as premissa desse trabalho sÃo: (1) espÃcies taxonomicamente prÃximas apresentam maior conservantismo filogenÃtico de nicho (2) Ãreas de endemismo sÃo unidades bÃsicas onde hà sobreposiÃÃo de um grupo complexo de espÃcies que coocorrem restritos a determinados locais, (3) os filtros ambientais e fatores abiÃticos atuam como limitadores para a sobrevivÃncia e dispersÃo de espÃcies vegetais e ajudam a compreender os limites de distribuiÃÃo de plantas. A hipÃtese deste estudo à que a distribuiÃÃo de espÃcies prÃximas taxonomicamente pode ser resultado de uma relaÃÃo estreita entre variÃveis ambientais e solo. O objetivo desse trabalho à investigar quais fatores ambientais poderiam estar influenciando na atual distribuiÃÃo das espÃcies de Erythroxylum em territÃrio brasileiro. Os locais de ocorrÃncia das espÃcies foram obtidos a partir de informaÃÃes provenientes do acervo virtual do CRIA e de bancos de dados cedidos por diferentes grupos. Para compreender a distribuiÃÃo das espÃcies e seÃÃes nas quais essas estÃo inseridas, e a confirmaÃÃo dos centros de riqueza, foram gerados modelos utilizando as camadas ambientais disponibilizadas pelo Wordclim e o algorÃtimo de mÃxima entropia. Para analisar as preferÃncias das espÃcies quanto as variÃveis climÃticas e edÃficas num recorte do territÃrio brasileiro foram gerados modelos de distribuiÃÃo espacial. As espÃcies analisadas tiveram os principais centros de riqueza e endemismo coincidentes em locais prÃximos a transiÃÃo entre domÃnios no territÃrio brasileiro. Algumas seÃÃes taxonÃmicas puderam ser delimitadas no espaÃo, tendo a distribuiÃÃo associada a domÃnios fitogeogrÃficos diferentes. Os modelos gerados demonstram maior afinidade do gÃnero a locais com forte estacionalidade climÃtica e presenÃa de solos rasos e Ãcidos. / The high species richness and endemism in the tropical region is influenced by the amount of vegetation types and environmental conditions favorable for the maintenance of diversity. For this study we selected the genus Erythroxylum, which in Brazil is one of the most important centers of endemism, totaling 74 species with restricted distribution in the country. Erythroxylum are recognized in 19 sections, nine of which are represented in the flora. From previous knowledge about the distribution patterns, areas of endemism and species information obtained about the genre, the premise of this study are: (1) species are more taxonomically close phylogenetic niche conservatism (2) areas of endemism are basic units where there is overlap of a complex group of species that co-ocorring restricted to certain locations, (3) environmental filtering and abiotic factors acting as limiters for the survival and dispersal of plant species and help to understand the limits of plant distribution. Our hypothesis is that the distribution of taxonomically close species may be the result of a close relationship between environmental variables and soil. The aim of this study is to investigate which environmental factors could be influencing the current distribution of species of Erythroxylum in Brazilian territory. The sites of occurrence of the species were obtained from information from the virtual collection of CRIA and databases yielded by different groups. To understand the distribution of species and sections in which these are inserted, and confirmation of the centers of richness were generated models using environmental layers available by Wordclim and maximum entropy algorithm. To analyse the preferences of the species as climatic variables and soil in a crop of Brazilian territory were generated models of spatial distribution. The species analysed were the main centers of richness and endemism coincide in places near the transition between areas in Brazil. Some taxonomic sections could be delimited in space, and the distribution associated with different phytogeographic domains. The models show higher affinity of the genre to places with strong seasonality and climate presence of shallow soils and acids.
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Filogenia e filogeografia do grupo Bothrops neuwiedi (Serpentes, Squamata) / Phylogeny and phylogeography of the Bothrops neuwiedi group (Serpentes, Squamata)Tais Machado 25 November 2015 (has links)
O grupo Bothrops neuwiedi é composto por serpentes neotropicais que desempenham grande impacto na saúde pública, em decorrência de acidentes ofídicos. O grupo apresenta ampla distribuição ao longo da diagonal seca de formações abertas, desde o nordeste do Brasil até o noroeste da Argentina. A taxonomia atual, baseada principalmente em dados morfológicos qualitativos, não recupera as linhagens evolutivas apontadas pelas abordagens moleculares. O objetivo deste trabalho foi investigar o grupo B. neuwiedi utilizando análises filogenéticas, filogeográficas, biogeográficas, estimativa de datação e delimitação de espécies em um total de 276 indivíduos amostrados ao longo de toda a sua distribuição, incluindo representantes do Brasil, Bolívia, Argentina, Paraguai e Uruguai. As análises contemplaram três genes mitocondriais, dois nucleares, dois introns e 33 locos de microssatélites obtidos por sequenciamento de nova geração. Estimou−se, por meio do método de delimitação de espécies e análises filogeográficas, que o grupo B. neuwiedi possui ao menos 14 espécies, das quais oito já são reconhecidas (B. erythromelas, B. lutzi, B. mattogrossensis, B. marmoratus, B. neuwiedi, B. pauloensis, B. pubescens e B. diporus) e seis possíveis espécies (Bothrops sp. 1 a Bothrops sp. 6). O grupo teria se originado durante o Mioceno e diversificado durante o Plio-Pleistoceno. As flutuações climáticas do Pleistoceno, decorrentes dos ciclos glaciais e interglaciais, desempenharam um importante papel na diversificação das espécies e suas populações. Adicionalmente, eventos tectônicos que ocorreram durante este período também teriam influenciado na estruturação espacial da diversidade genética. Foi revelada uma intrincada relação do domínio biogeográfico Chaquenho (áreas abertas) com os domínios do Sudoeste da Amazônia e do Paraná (áreas de floresta). Nuances na temperatura e aridez, ora permitiram a expansão do Cerrado sobre as florestas, ora possibilitaram a expansão do Chaco sobre o Cerrado, levando à interrupção da conexão entre as populações de manchas de Cerrado nestes domínios florestais. Os resultados evidenciaram a complexidade da diversificação das serpentes na diagonal seca de formações abertas e, dependendo da linhagem, diferentes padrões puderam ser observados. A Linhagem Leste−Oeste (B. marmoratus, B. neuwiedi, Bothrops sp. 1) apresentou elevado grau de diversidade genética e elevada estruturação espacial, concordante com unidades geomorfológicas do relevo. Nas linhagens do sul do Brasil (B. pubescens e B. diporus) verificou−se um padrão de diversificação consistente com espécies incipientes em estágios iniciais do processo de especiação. Na região central do Cerrado, propõe−se que as espécies B. marmoratus, B. pauloensis e B. mattogrossensis apresentam forte estruturação no DNAmt e baixa estruturação nos marcadores nucleares em decorrência de fluxo gênico desigual mediado por machos. Baseado nas informações obtidas neste trabalho, sugerimos fortemente que o grupo Bothrops neuwiedi seja revisado sob uma perspectiva multidisciplinar. / The Bothrops neuwiedi group is composed of Neotropical snakes that have a serious impact on Brazilian public health, as they are responsible for a large number of snakebite accidents. The group is widespread along the dry diagonal of open formations in South America (Chacoan dominion), since northeast Brazil to northwest Argentina. Current taxonomic arrangement is based on blotches and color pattern, which does not represent the evolutionary lineages uncovered in molecular analyses. This study aims to investigate the B. neuwiedi group using phylogenetic analyses, biogeography, phylogeography, estimates of divergence, and species delimitation. A total of 276 representatives of the B. neuwiedi group were obtained throughout the geographic distribution of the group, including samples from Brazil, Bolivia, Argentina, Paraguay, and Uruguay; in addition, three mitochondrial and two nuclear genes, two introns, and 33 microsatellite loci were used. According species delimitation and phylogeographic approach, 14 species in the B. neuwiedi group could be delimited as follows: eigth species already recognized (B. erythromelas, B. lutzi, B. mattogrossensis, B. marmoratus, B. neuwiedi, B. pubescens, B. diporus, and B. pauloensis) and six other putative species (Bothrops sp. 1 to Bothrops sp. 6). Estimates of divergence placed the origin of the B. neuwiedi group in the Miocene and diversification in the Plio−Pleistocene. Climatic fluctuations and tectonic events during the Pleistocene probably played an important role in the species and populations diversification. An intricate network was revealed with Chacoan dominion (open area) and South-west and Paraná dominion (forested areas). Nuances in temperature and aridity, sometimes allowed the expansion of the Cerrado on forests, sometimes allowed the expansion of the Chaco on the Cerrado, leading to the interruption of the connection between the populations of Cerrado patches of forest in these areas. The results showed the complexity of the diversification of snakes in the dry diagonal of open formations and depending on the lineage studied, different patterns were observed. East−West Lineage (B. marmoratus, B. neuwiedi, Bothrops sp. 1) presented high genetic diversity and high genetic and spatial structure associated with Brazilian geomorphology. B. pubescens and B. diporus revealed a pattern consistent with incipient species in the early stages of speciation. B. marmoratus, B. pauloensis and B. mattogrossensis presented strong structure in mtDNA and and weak structure in nuclear markers due to male−biased gene flow.
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Filogenia e história biogeográfica do grupo Callicebus moloch (Primates, Pitheciidae)CARNEIRO, Jeferson Costa 29 January 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-01-29 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Callicebus é um gênero de primata neotropical pertencente à família Pitheciidae, atualmente com 32 espécies reconhecidas. Estas espécies estão organizadas em grupos supraespecíficos, sendo dois subgêneros (Torquatus e Callicebus) e cinco grupos de espécies: C. torquatus, C. moloch, C. cupreus, C. donacophilus e C. personatus. A organização dos grupos foi realizada com base em dados morfológicos e de distribuição geográfica. Nesta dissertação de mestrado, fizemos inferências a partir de dados moleculares. No primerio capítulo, apresentamos uma introdução geral sobre a problemática taxonômica de Callicebus. No segundo capítulo realizamos inferências filogenéticas com base na presença e ausência de uma região molecular conhecida como elemento Alu, um transposon do genoma de primatas. Com base na análise desses marcadores Alu, descobrimos que os grupos C. moloch e C. cupreus são estreitamente relacionados e que C. torquatus é o grupo basal no gênero. No terceiro capítulo, a partir de uma abordagem multilocos investigamos as relações filogenéticas do grupo C. moloch e aplicamos o tempo de diversificação entre as espécies para testar a hipótese de formação das bacias hidrográficas da Amazônia durante o Plio-Pleistoceno. Nossos resultados corroboram a hipótese de formação dos rios amazônicos nos últimos 3 Ma. No entanto, nem todos os eventos de diversificão em Callicebus podem ser explicados pela teoria dos rios. Além disto, verificamos que os diferentes grupos de espécies de Callicebus são todos derivados de radiações na região Amazônica em diferentes momentos durante o Mioceno superior. Nossos resultados também sugerem que o conhecimento atual da diversidade de Callicebus está subestimado, e que espécies que diversificaram recentemente estão negligenciadas taxonomicamente. / Callicebus is a genus of Neotropical primate of the family Pitheciidae. Thirty-two species are currently recognized. They are classified in two subgenera, Torquatus and Callicebus, and five species groups: C. torquatus, C. moloch, C. cupreus, C. donacophilus and C. personatus. The arrangement of subgenera and groups is based on morphology and geographic distributions. The first section, we is introduction to the taxonomy of Callicebus. In the second section, I present an article for submission to the jounrla Primates concerning the chapter presence or absence of a molecular region known as an Alu element. An Alu element is a transposon in the genome of primates Because of this particular characteristic of Alu insertion, I discovered that the C. moloch and C. cupreus groups are closely related and that C. torquatus is the basal group in the genus. In the third section , from a multilocus approach I investigated the phylogenetic relationships of the C. moloch group and the time of diversification between the species, in order to test the hypothesis of formation of the Amazon River basin during the Plio-Pleistocene. Our results support the hypothesis of origin of Amazonian rivers in the last 3 Ma. However, not all diversification events in Callicebus can be explained by the theory of rivers. the results also indicate that the different species groups are derived from a radiation in the Amazonian region at different times during the upper Miocene. The phylogenetic analysis identified a number of potentioal taxa that a number of taxa which the current knowledge of species diversity in Callicebus is underestimated, and that recently diversified species are taxonomically neglected.
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