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Introdução à biocristalografia com o estudo estrutural da quinase dependente de ciclina 2 (CDK2) complexada com inibidores / Introduction to bio-crystallography through the structural study of the kinase dependent of cycline 2 (CDK2) complexed with inhibitorsAzevedo Junior, Walter Filgueira de 23 April 1997 (has links)
O ciclo celular é controlado pela atividade das quinases dependentes de ciclinas (Ciclin-dependent kinases, CDKs). As CDKs são inativas como monômeros, e a sua ativação necessita da ligação às ciclinas, uma família diversa de proteínas cujos os níveis oscilam durante o ciclo celular, e fosforilação pela CAK (CDK-activating kinase) sobre um resíduo de treonina específico. As CDKs são capazes de fosforilar muitas proteínas que estão envolvidas nos eventos do ciclo celular, incluindo histonas e proteínas supressoras de tumores como pRb. Além da função de regulação positiva das ciclinas e CAK, muitas proteínas inibidoras de CDKs (CDK inhibitors, CKIs) têm sido descobertas, tais como p16, p21 e p28. Visto que, a desregulação das ciclinas e/ou alteração ou ausência de CKIs têm sido associadas com muitos cânceres, há um forte interesse em inibidores químicos de CDKs que possam ter uma função importante na descoberta de novas famílias de agentes anti-tumores. Vistoque, ATP é o autêntico co-fator da CDK2 este pode ser considerado como um \"pseudo-composto líder\" para a descoberta de inibidores de CDK2. Entretanto, há duas preocupações maiores a serem consideradas: composto contendo adenina são ligantes comuns para muitas enzimas nas células, desta forma, qualquer composto altamente carregado como ATP não será absorvido pelas células. Nós descrevemos aqui as estruturas determinadas por difração de raios-X da CDK2 em complexo com dois inibidores diferentes, descloro-flavopiridol (DFP) e Roscovitine. A estrutura do complexo binário CDK2-DFP foi resolvida por substituição molecular e refinada até um Rfactor=20,3% e a estrutura da CDK-2Roscovitine foi refinada até um Rfactor=18%. O descloro-flavopiridol é uma flavona com uma nova estrutura,comparável àquelas de flavonas polihidroxiladas. Estudos prévios mostraram que flavopiridol, um flavonóide, pode inibir cânceres de mama e de pulmão. O Roscovitine é um derivado de adenina e um potente inibidor de CDK2. A comparação das estruturas tridimensionais de CDK2-DFP e CDK2-Roscovitine com a de CDK2-ATP mostraram que o bolsão hidrofóbico de ligação de adenina tem a habilidade surpreendente de acomodar estruturas moleculares diferentes daquelas da ATP / Cell cycle progression is tightly controlled by the activity of ciclin-dependent kinases (CDKs). CDKs are inactive as monomers, and activation requires binding to cyclins, a diverse family of proteins whose levels oscillate during cell cycle, and phosphorilation by CDK-activating kinase (CAK) on a specific threonine residue. CDKs are able to phosphorylate many proteins that are in volvedin cell cycle events, including histones and tumor suppressor proteins like the retinoblastoma gene product pRb. In addition to the positive regulatory role of cyclins and CAK, many negative regulatory proteins (CDK Inhibitors, CIGs) have been discovered, such as p16, p21, and p28. Since deregulation of cyclins and/or alteration or absence ofCKIs have been associated with many cancers, there is strong interest in chemical inhibitors of CDKs that could play an important role in the discovery of new family of antitumor agents. Since ATP is the authentic cofactor of CDK2 it can be considered as a \"pseudo-lead compound\" for discovery of CDK2 inhibitors. However there are two major concerns: adenine containing compounds are common ligants for many enzymes in cells, thus, any adenine derivatives may inhibit many enzymes in the cells: second, any highly charged compounds such as ATP will prevent them from uptake by cells. We report here the x-ray structures of CDK2 in complex with two different inhibitors, deschloro-flavopiridol(DFP) and Roscovitine. The structure of the binary complex CDK2-DFP was solved by molecular replacement and refined to Rfactor = 20.3% and the structure ofCDK2-Roscovitine was refined to Rfactor = 18.0 %. The deschloro-flavopiridol(DFP) is a flavone with a novel structure, compared to that of polyhydroxylated flavones. Previous studies have shown that flavopiridol, a flavonoid, can inhibit growth of breast and lung carcinoma cell lines. The Roscovitine is an adenine derivative and a potent CDK2 inhibitor. The two inhibitors are competitive inhibitors for ATP binding to CDK2 and bind to the ATP binding pocket ofCDK2. The comparison of the three-dimensional structures of CDK2-DFP and CDK2-Roscovitine with the CDK2-ATP shows that the hydrophobic adenine-binding pocket has a surprising ability to accommodate molecular structures that are different from ATP.
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Pensamento complexo : representa??es de professores de ci?ncias e matem?ticaMartinelli, Rodiane Ouriques 03 March 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-03-03 / O grande desafio lan?ado ? educa??o no s?culo XXI ? a contradi??o entre os problemas cada vez mais interdependentes e planet?rios, e a persist?ncia de um modo de conhecimento que privilegia os saberes fragmentados e compartimentalizados. Edgar Morin, soci?logo e pensador franc?s prop?e uma reforma do pensamento em dire??o a um pensar complexo, que d? subs?dios para a interpreta??o mais contextualizada da realidade. Suas id?ias v?m constituindo importante fonte de inspira??o para repensar a educa??o. Baseada nos fundamentos te?ricos de Edgar Morin, este trabalho investiga os elementos de um pensamento complexo presentes nos discursos de professores de ci?ncias e matem?tica. O grupo pesquisado ? formado por professores que cursam o Programa de P?s-Gradua??o em Educa??o em Ci?ncias e Matem?tica, cuja abordagem metodol?gica desenvolvida nas disciplinas ? problematizadora e reflexiva. A partir de questionamentos orais e escritos procurou-se identificar as representa??es sobre o conceito de complexidade, pensamento complexo e elementos do pensamento complexo expressos nas concep??es dos professores sobre a aprendizagem de seus alunos. Para a pesquisa adotaram-se instrumentos metodol?gicos, como entrevistas e question?rios, adequados para uma abordagem qualitativa dos dados. Foi realizada uma an?lise textual discursiva do corpus da pesquisa, de forma a responder ?s quest?es de pesquisa. Quanto ? complexidade, as categorias que emergiram dos discursos revelaram o entendimento dos professores da complexidade como rede comunicante e como organizadora do caos. Em rela??o ao pensamento complexo, as representa??es foram categorizadas em tr?s formas de pensamento: s?cio-cultural, ecologizante e em rede. No discurso sobre a aprendizagem, foram identificados inicialmente os desafios enfrentados para a efetiva??o da aprendizagem. Em rela??o aos elementos de um pensamento complexo que emergiram dos discursos, revelaram-se os fatores determinantes na constru??o do pensamento complexo, como a incerteza, incompletude e constru??o permanente do conhecimento, a auto-eco-organiza??o e o sujeito cognoscente. As manifesta??es dos professores demonstram a presen?a de elementos de um pensamento de complexidade, apesar deste tema n?o fazer parte de seu vocabul?rio de uso cotidiano ou de sua forma??o acad?mica. Conclui-se que o discurso dos professores apresenta sinais da emerg?ncia de um novo paradigma de pensamento complexo, revelando-se em suas representa??es sobre a aprendizagem.
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Avalia??o do fen?tipo de persist?ncia em isolados nasocomiais de Acinetobacter calcoaceticus-baumanniiGallo, Stephanie Wagner 27 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-27 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS) / Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (ACB) complex comprises opportunistic and
emerging pathogens that are responsible for several diseases, mainly affecting
immunocompromised patients and those hospitalized in intensive care units.
Therapeutic options for ACB infections are restricted, since these microorganisms are
often resistant to most antimicrobials. In addition, these bacteria may also form persister
cells, which constitute a small population of susceptible cells able to survive lethal
concentrations of bactericidal antimicrobials and other stressors. This phenotype is
associated with failure in antimicrobial therapy, especially in chronic and recurrent
infections. Therefore, the aim of this study was to evaluate the presence of persister
cells from ACB complex isolates exposed to meropenem and/or polymyxin B, in
biofilm and planktonic cells, as well as to analyze these cells regarding their
morphology and identify expression patterns of proteins possibly involved in the
formation and maintenance of persistence. For this, 20 clinical isolates were
characterized for the ability to form biofilm on polystyrene surface, and for meropenem
and polymyxin B susceptibility, by the assessment of Minimum Inhibitory
Concentration (MIC). All isolates were exposed to meropenem at different
concentrations above the MIC, while five isolates were exposed to polymyxin B for the
assessment of the persisters presence. For all experiments, in order to estimate the
fraction of remaining cells, aliquots were removed at determined time points, followed
by serial decimal dilutions and drop plating technique on nutrient agar. All isolates
presented persisters at different proportions, in both culture conditions when exposed to
meropenem or polymyxin B after 48 h. The higher fractions were verified in biofilm for
both antimicrobials in comparison with planktonic cultures. Meropenem concentrations
did not influence persisters levels. However, after polymyxin B exposure, persister cells
fractions were dependent on the concentration employed. After 24 h polymyxin B
exposure, a growth resumption of surviving cells was observed. These cells were again
evaluated for susceptibility to this antimicrobial, remaining susceptible with MIC of 1
?g/ mL. Moreover, integrity of polymyxin B in the supernatant of the cultures was
verified by chromatographic assay, demonstrating that polymyxin B is not significantly
degraded after 48 h exposure. On the other hand, when meropenem and polymyxin B
were associated at different concentrations, no resumption of cell growth was observed,
as well as this combination was able to eradicate persister cells from A. baumannii (Acb-1) cultured in late exponential phase. Furthermore, Nano-Liquid Chromatography
Coupled to Tandem Mass Spectrometry was employed for the identification and relative
quantification of proteins possibly associated with persistence in A. baumannii, after
exposure to meropenem. Different patterns of expression were identified between
persister cells present in planktonic and biofilm cultures, suggesting that persistence
may be regulated by different mechanisms. Proteins involved in the cell division and
DNA replication were overexpressed in planktonic persisters, in agreement with the
electron scanning microscopy images that presented dividing cells in this culture
condition. Overexpression of glucose dehydrogenase (GDH), NADH dehydrogenase 1
(NDH-1), succinate dehydrogenase and ATP synthase indicates the electron transfer
from the GDH-catalyzed reaction to the electron transport chain as a possible energy
source for persisters, supporting the presence of cell division observed in planktonic
culture. Conversely, proteins involved in amino acid metabolism, as well as major
elongation factors were underexpressed in Acb-1 persister cells, suggesting that protein
synthesis is reduced, even though many proteins were overproduced. Increased
expression of several membrane-related proteins has also been observed, indicating
possible changes in its composition and function, although proteins related to lipid
metabolism were underexpressed. Overall, proteomic analysis of the persister cells
showed that these cells could be physiologically distinct when cultured under different
conditions, as well as overtime in the same condition. Therefore, considering the
different behaviors of Acb-1 when exposed alone to meropenem or polymyxin B, as
well as when exposed to these drugs in combination, it was concluded that each
antimicrobial might act as a different stressor, possibly leading and/or selecting distinct
tolerance mechanisms among persisters, which enabled their eradication when the drugs
were combined. / Os pat?genos pertencentes ao complexo Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (ACB)
s?o considerados oportunistas e emergentes, respons?veis por ocasionar diversas
enfermidades, acometendo principalmente pacientes imunocomprometidos e internados
em unidades de tratamento intensivo. As op??es terap?uticas para o tratamento de
infec??es ocasionadas por estes pat?genos s?o restritas, uma vez que estes apresentam
frequentemente resist?ncia ? maioria dos antimicrobianos. Al?m disso, essas bact?rias
podem ainda formar c?lulas persisters, que constituem uma pequena popula??o de
c?lulas suscet?veis capazes de tolerar concentra??es letais de antimicrobianos
bactericidas e outros agentes estressores. Este fen?tipo est? associado a falhas na terapia
antimicrobiana, especialmente nas infec??es cr?nicas e recorrentes. Desta forma, o
objetivo deste trabalho foi avaliar a presen?a de c?lulas persisters formadas por isolados
do complexo ACB frente ? exposi??o ao meropenem e/ou ? polimixina B, na condi??o
de biofilme e em cultivo planct?nico, assim como analisar estas c?lulas
morfologicamente e identificar padr?es de express?o de prote?nas que pudessem estar
envolvidos na forma??o e manuten??o da persist?ncia. Para tanto, 20 isolados cl?nicos
foram caracterizados quanto ? capacidade em formar biofilme em superf?cie de
poliestireno, e ? suscetibilidade ao meropenem e ? polimixina B, que foi avaliada por
meio da determina??o da Concentra??o Inibit?ria M?nima (CIM) a estes f?rmacos.
Todos os isolados foram submetidos ? exposi??o ao meropenem em diferentes
concentra??es acima da CIM, enquanto que cinco foram expostos ? polimixina B para a
avalia??o da presen?a de c?lulas persisters. Para todos os experimentos, a fim de
estimar a fra??o de c?lulas remanescentes, al?quotas foram removidas em tempos
determinados, efetuando-se dilui??es decimais seriadas e semeadura pela t?cnica da
gota em ?gar nutriente. C?lulas persisters, em diferentes fra??es, foram encontradas nos
cultivos de todos os isolados, tanto em biofilmes como na condi??o planct?nica, ap?s a
exposi??o por 48 h ao meropenem e ? polimixina B, sendo as fra??es mais elevadas
encontradas na condi??o de biofilme para ambos os antimicrobianos. As diferentes
concentra??es de meropenem avaliadas n?o influenciaram os n?veis de c?lulas
persisters; entretanto, frente ? exposi??o ? polimixina B, a fra??o de c?lulas mostrou-se
dependente da concentra??o empregada. Ap?s exposi??o ? polimixina B por 24 h, foi
observada retomada de crescimento das c?lulas sobreviventes, que foram avaliadas
novamente quanto ? suscetibilidade a este antimicrobiano, mantendo-se suscet?veis com CIM de 1 ?g/mL, bem como foi verificada a integridade do antimicrobiano no
sobrenadante destes cultivos por ensaios cromatogr?ficos, demonstrando que o mesmo
n?o sofre degrada??o ap?s 48 h de exposi??o. Entretanto, quando se associou
meropenem ? polimixina B em diferentes concentra??es, al?m de n?o ter sido observada
a retomada de crescimento das c?lulas remanescentes, ocorreu a erradica??o das c?lulas
persisters de um isolado de A. baumannii (Acb-1) cultivado em fase exponencial tardia.
Al?m disso, a t?cnica de Nano-Cromatografia L?quida acoplada ? Espectrometria de
Massas em Tandem foi empregada para a identifica??o e quantifica??o relativa de
prote?nas possivelmente associadas ? persist?ncia em A. baumannii, ap?s a exposi??o ao
meropenem. Diferentes padr?es de express?o foram identificados entre as c?lulas
persisters presentes em cultivo planct?nico e em biofilme, sugerindo que a regula??o da
persist?ncia possa ser realizada por mecanismos diferentes. Observou-se express?o
aumentada de prote?nas envolvidas nos processos de divis?o celular e replica??o de
DNA, especialmente no cultivo planct?nico, em concord?ncia com a presen?a de
divis?o celular observada nas imagens obtidas a partir da microscopia eletr?nica de
varredura nesta condi??o de cultivo. O aumento de express?o da glicose desidrogenase
(GDH), NADH desidrogenase (NDH-1), succinato desidrogenase e ATP sintase
indicam a transfer?ncia de el?trons a partir da rea??o catalisada por GDH para a cadeia
de transporte de el?trons como uma poss?vel fonte de energ?tica para as persisters,
corroborando a observa??o da presen?a de divis?o celular observada no cultivo
planct?nico. Em contraste, prote?nas envolvidas no metabolismo de amino?cidos, bem
como os principais fatores de elonga??o apresentaram express?o diminu?da em c?lulas
persisters de Acb-1, sugerindo que a s?ntese proteica esteja reduzida, mesmo que muitas
prote?nas tenham sido identificadas com express?o aumentada. Muitas prote?nas
relacionadas ? membrana apresentaram a sua express?o aumentada, indicando poss?veis
altera??es em sua composi??o e fun??o, embora prote?nas relacionadas ao metabolismo
de lip?deos tenham apresentado express?o diminu?da. A an?lise prote?mica das c?lulas
persisters, sobretudo, mostrou que estas c?lulas podem ser fisiologicamente distintas
quando cultivadas em condi??es diferentes, bem como ao longo do tempo em uma
mesma condi??o. Desta forma, considerando os distintos comportamentos do Acb-1
quando exposto isoladamente ao meropenem ou ? polimixina B, bem como quando
exposto a estes f?rmacos ao mesmo tempo, pode-se concluir que cada antimicrobiano
pode ter atuado como um diferente estressor, possivelmente, levando a e/ou selecionando mecanismos de toler?ncia diferentes entre as persisters, o que possibilitou
a sua erradica??o quando os f?rmacos foram combinados.
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Da consciência moral ao imperativo moral: a gênese do conceito de superego na teoria freudiana / From moral consciousness to moral imperative: the genesis of the superego concept in Freudian theoryRenato Rochwerger 29 June 2015 (has links)
O presente trabalho se propõe a pesquisar a gênese do conceito de superego na clínica e na metapsicologia freudiana. Partindo do sofrimento relacionado aos conflitos morais, esta dissertação acompanha a formulação do complexo de Édipo e da noção de identificação, e, estendendo-se até a segunda tópica, evidencia a relação do conceito de superego com a pulsão de morte. Neste percurso a dimensão cruel do superego é enfatizada. Por fim, questiona-se a possibilidade de conceituação de uma face benevolente do superego analisando os mecanismos presentes no humor / This study aims to investigate the genesis of the concept of superego in Freudian clinic and metapsychology. Starting from the suffering related to moral conflicts, this dissertation follows the formulation of the Oedipus complex and the notion of identification, and extending up to the second topic, shows the relationship of the concept of superego with the death drive. In this way the cruel dimension of the superego is emphasized. The final issue refers to the possibility of a conceptualization of a benevolent face of the superego, analyzing the mechanisms present in the humor
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Estudos de Filmes de Langmuir e LB de complexo fosfínico de rutênio visando potenciais aplicações biológicasSandrino, Bianca 30 September 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-09-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / One of the major challenges in drug design is to identify compounds with potential toxicity toward target cells, preferably with molecular-level understanding of their mode of action. In this study, the antitumor property of a ruthenium complex, mer-RuCl3(dppb)(VPy)] (dppb = 1,4-bis (diphenylphosphine) butane and VPy = 4-vinylpyridine),RuVPy) was analyzed. Results showed that this compound led to a mortality rate of 50% of human laryngeal carcinoma HEp-2 cell with 120 ±10 mol L-1, indicating its high toxicity. Toward a better understanding if its mode of action is associated with its interaction with cell membranes, Langmuir monolayers were used as a membrane model. RuVPy had a strong effect on the surface pressure isotherms, especially on the elastic properties of the zwitterionic dipalmitoylphosphatidylcholine (DPPC) and the negatively charged dipalmitoylphosphatidylglycerol (DPPG) and dipalmitoylphosphatidylserine (DPPS) phospholipids. Results of thermodynamic parameters indicated miscibility between the components is not ideal mixed monolayers. Preferably attractive and repulsive interactions between RuVPy and zwitterionic or anionic phospholipids, respectively, are observed with
mixed monolayer of DPPS/RuVPy energetically unfavorable. These data were confirmed polarization - modulated infrared reflection-absorption spectroscopy (PM-IRRAS). In addition, interactions between the positive group from RuVPy and the phosphate group from phospholipids were corroborated by density functional theory (DFT) calculations, allowing the determination of the Ru complex orientation at the air-water interface. Proof of interaction was confirmed by electrochemical results of Langmuir-Blodgett films of the phospholipid/RuVPy mixture. The presence of the RuVPy on the conductor substrate, which presents higher electron density, form "defects" in the monolayer of phospholipids increasing
accumulation of electrons in the electrode/solution interface making it more permeable material. Although possible contributions from receptors or other cell components cannot be discarded, the results reported here represent evidence for significant effects on the cell membranes which are probably associated with the high toxicity of RuVPy. / Um dos grandes desafios na concepção de medicamentos é a identificação de compostos com potencial toxicidade para as células-alvo e a compreensão do seu modo de ação. Nesta tese, foi analisada a propriedade antitumoral do complexo de rutênio mer-[RuCl3(dppb)(VPy)] (dppb = 1,4-bis (difenilfosfina)butano e VPy = 4-vinilpiridina) (RuVPy), e os resultados mostraram que este composto levou a uma taxa de mortalidade de 50% de células de câncer de laringe (HEp-2) com 120 ± 10 μmol L-1, indicando sua alta toxicidade. Para a compreensão do modo de ação em nível molecular deste complexo, associada à sua interação com membranas celulares, monocamadas de Langmuir foram utilizadas como um modelo simples de membrana. O RuVPy apresentou um forte efeito sobre as isotermas de pressão de superfície, especialmente sobre as propriedades elásticas do zwitteriônico dipalmitoilfosfatidilcolina (DPPC) e dos fosfolipídios carregados negativamente dipalmitoilfosfatidilglicerol (DPPG) e dipalmitoilfosfatidilserina (DPPS). Resultados dos parâmetros termodinâmicos indicaram que há miscibilidade entre os componentes das monocamadas mistas não ideais. Interações preferencialmente atrativas e repulsivas foram constatadas entre o RuVPy e os fosfolipídios zwitteriônico e aniônicos, respectivamente, sendo a monocamada mista de DPPS/RuVPy energeticamente desfavorável. A interação entre o grupo de maior densidade eletrônica do RuVPy, obtido por cálculo de teoria funcional da densidade (DFT), e o grupo fosfato dos fosfolipídios foi confirmada por espectroscopia de infravermelho de reflexão e absorção de modulo polarizado (PM-IRRAS) realizada na interface ar-água. Prova desta interação foi constatada por resultados eletroquímicos dos filmes Langmuir-Blodgett da mistura fosfolipídio/RuVPy. A presença do complexo no substrato condutor, por ter maior densidade eletrônica, forma “defeitos” na monocamada dos fosfolipídios aumentando o acúmulo de elétrons na interface eletrodo/solução tornando o material mais permeável. Desta forma, é evidente que além de eventuais contribuições de outros receptores ou componentes celulares não poderem ser descartadas, os resultados aqui apresentados trazem os efeitos significativos nas membranas celulares que provavelmente estão associados à alta toxicidade do RuVPy.
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Comprimento dos telômeros e expressão de genes do complexo shelterin em mulheres com obesidade submetidas à cirurgia bariátrica e eutróficas / Telomere length and gene expression of shelterin complex in women underwent bariatric surgery and normal weightWelendorf, Caroline Rossi 06 December 2018 (has links)
Telômeros são estruturas localizadas nas extremidades dos cromossomos associadas a um conjunto de proteínas, o complexo shelterin, as quais são responsáveis pela proteção e preservação do material genético. O complexo shelterin é formado por seis proteínas denominadas TRF1, TRF2, RAP1, TIN2, TPP1 e POT1. O comprimento dos telômeros (CT) diminui progressivamente a cada divisão celular e evidências recentes sugerem que o estilo de vida pode acarretar em um encurtamento dos telômeros. Nos indivíduos com obesidade, o excesso de tecido adiposo exerce um papel fundamental ao induzir um estado inflamatório crônico e sistêmico, capaz de gerar o encurtamento do CT. Neste contexto, a cirurgia bariátrica é uma das modalidades de tratamento mais eficaz na melhora do controle metabólico da obesidade. Assim, o presente estudo teve como objetivo avaliar o comprimento dos telômeros e a expressão dos genes POT1, TRF1 e TRF2 em mulheres com obesidade antes e após seis meses da cirurgia bariátrica e em mulheres eutróficas. A amostra foi composta por 48 indivíduos do sexo feminino com obesidade submetidas à derivação gástrica em Y de Roux (DGYR) e 16 mulheres eutróficas. Tratou-se de um estudo longitudinal prospectivo no qual foram coletadas medidas antropométricas de peso e altura para cálculo do índice de massa corporal (IMC), circunferência abdominal (CA), composição corporal [massa livre de gordura (MLG) e massa gorda (MG)], ingestão alimentar e coleta de sangue para avaliação bioquímica, análise do CT (DNA) e expressão gênica (RNA). As mulheres com obesidade foram avaliadas antes e após seis meses do procedimento cirúrgico e as eutróficas em um único momento. Como principal resultado, observou-se, após seis meses do procedimento cirúrgico, redução do peso, IMC, CA, MLG, MG, assim como dos parâmetros bioquímicos. Ainda, verificou-se um menor CT entre as pacientes com obesidade quando comparada as mulheres eutróficas e um aumento no CT após a cirurgia quando comparado ao período pré-operatório, entretanto, permaneceu significante menor em relação ao grupo controle. Adicionalmente, observou-se que as modificações das concentrações de triglicérides influenciaram o comprimento dos telômeros, mesmo quando ajustado por idade. Com relação à expressão gênica, observou-se maior expressão dos genes POT1, TRF1 e TRF2 em mulheres eutróficas quando comparadas as pacientes com obesidade antes da DGYR; e aumento da expressão do gene TRF1 após o procedimento cirúrgico. Conclui-se que o CT de mulheres com obesidade é significante menor em relação às mulheres eutróficas. A intervenção cirúrgica mostrou ser eficaz na melhora da composição corporal, dos indicadores bioquímicos e capaz de aumentar o comprimento dos telômeros. Nossos resultados também demonstraram expressão aumentada de POT1, TRF1 e TRF2 em mulheres eutróficas e aumento na expressão de TRF1 após a cirurgia / Telomeres are structures located at the ends of chromosomes associated with proteins, the shelterin complex, which are responsible for the protection and preservation of the genetic material. The shelterin complex is formed by six proteins: TRF1, TRF2, RAP1, TIN2, TPP1 and POT1. The telomere length (TL) progressively decreases with each cell division and recent evidence suggests that lifestyle can lead to telomere shortening. In individuals with obesity, excess adipose tissue plays a key role in inducing a chronic and systemic inflammatory state, which can cause TL shortening. In this context, bariatric surgery is one of the most effective treatment modalities in improving the metabolic control of obesity. Thus, the present study aimed to evaluate the telomere length and expression of the POT1, TRF1 and TRF2 genes in obese women before and after six months of bariatric surgery and in eutrophic women. The sample consisted of 48 obese female subjects submitted to Roux-en-Y gastric bypass (RYGB) and 16 eutrophic women. This was a prospective longitudinal study in which anthropometric measures of body weight and height (BMI), abdominal circumference (AC), body composition [fat free mass (FFM) and fat mass (FM) were collected], food intake and blood collection for biochemical evaluation, TL analysis (DNA) and gene expression (RNA). Women with obesity were evaluated before and after six months of the surgical procedure and the eutrophic ones in a single moment. As a main result, was observed reduction of the weight, BMI, AC, FFM, FM, as well as the biochemical parameters after six months of the surgical procedure. Also, there was a lower TL among obese patients when compared to eutrophic women and a higher TL after surgery when compared to the preoperative period. However, even with a sixmonth stretch of the RYGB, patients with obesity remained with the TL lower than the control group. In addition, changes in triglyceride concentrations influenced telomere length, even when adjusted for age. Regarding the gene expression evaluated, the expression of POT1, TRF1 and TRF2 genes was higher in eutrophic women when compared to patients with obesity before RYGB; and increased expression of the TRF1 gene after the surgical procedure. It is concluded that the TL of obese women is less significant in relation to eutrophic women. The surgical intervention showed to be effective in the improvement of the body composition, the biochemical indicators and able to increase the telomere length. Our results also demonstrated increased expression of POT1, TRF1 and TRF2 in eutrophic women and increased expression of TRF1 after surgery
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Sítio histórico São Francisco: um estudo sob a ótica da arqueologia da paisagem / Historic site São Francisco - a study from the perspective of the landscape archaeologyBornal, Wagner Gomes 27 June 2008 (has links)
Em sua história, o município de São Sebastião, localizado no Litoral Norte do Estado de São Paulo, foi palco de inúmeras transformações ambientais, principalmente a partir do final do século XVI, quando chegaram à região as primeiras levas de colonizadores europeus, introduzindo novos hábitos e imprimindo na paisagem as marcas de sua ocupação. Apesar das constantes alterações e apropriações do espaço urbano e rural, ainda existem remanescentes culturais que, norteados pela pesquisa arqueológica, propiciam significativas informações sobre as paisagens culturais do passado. Nesse caso, destaca-se o Sítio Arqueológico São Francisco, um complexo construtivo e arquitetônico cujas instalações estão relacionadas a uma propriedade agrícola da primeira metade do século XIX e que constituiu o objeto de estudo apresentado nesta tese de doutorado. De maneira geral, as pesquisas foram realizadas no âmbito da Arqueologia da Paisagem com o objetivo de compreender o cenário de implantação do sítio arqueológico. Privilegiou-se a utilização de tecnologias para realizar a leitura do processo histórico a partir de uma visão de espectro amplo baseada no entendimento das relações homem/meio ambiente, analisando os processos de artificialização do meio e as principais características da paisagem na época de ocupação do sítio. / In its history, the municipality of São Sebastião, located at the north costal zone of the State of São Paulo, was the stage of uncountable environmental transformations, mainly after the end of the XVIth century, when the first waves of European settlers disembarked in the region, introducing new customs as well as printing their signals of occupation in the landscape. Despite the constant alteration and re-appropriation of the urban space and rural zones, there are cultural reminiscences that, based on archaeological research, have revealed significative information about past cultural landscapes. In this case, the archaeological site known as São Francisco is an impressive instance of that, and constituted by an architectonic and constructive complex in which the units are associated with a XIXth century agricultural property, the very object of study in this PhD dissertation. In general terms, this research is focused on landscape archaeology with the priority to understand the implantation scenario of this archaeological site. At this point, it was selected the use of technologies to read the historical process of man-envrionment interaction based on a wide spectrum vision, and also analyzing the environment artificial-transformative processes that took place. Additionally, the main characteristics of the landscape during the time of site occupation are revealed.
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Bloqueio dos receptores β1 - adrenérgicos periféricos impede o desenvolvimento da ansiedade tardia induzida por estresse em ratos Wistar. / The blockage of peripheral β1-adrenergic receptors prevents the restraint stress-induced long-lasting anxiety in wistar rats.Perfetti, Juliano Genaro 08 June 2016 (has links)
INTRODUÇÃO: o estresse, causa importante de ansiedade, provoca ativação do eixo HPA, liberando hormônios glicocorticoides e adrenalina, e neurotransmissores, como a norepinefrina. Consequentemente, ocorrem mudanças morfológicas e biomoleculares em diversas regiões do SNC, destacando-se o complexo basolateral da amígdala, além de alterações comportamentais. OBJETIVOS: investigar, por meio de administrações (ip) de atenolol e metirapona, possíveis influências periféricas dos receptores de NE (β1) e GR no BLA de ratos na ansiedade tardia. Analisar também a via de sinalização intracelular ERK-MEK-CREB e a excitabilidade de neurônios da região. RESULTADOS: verificamos aumento do estado do tipo ansioso após 10 dias do estresse, efeito não visto com tratamento com atenolol (ip). Além disso, o estresse provocou aumento de EGR1 (p<0.05), dado indicador de maior taxa de atividade de neurônios do BLA, efeito não encontrado nos animais tratados com atenolol. Além disso, não encontramos alterações na fosforilação de ERK e na espressão de CREB. CONCLUSÃO: a sinalização adrenérgica/noradrenérgica periférica pode ter relevante função na modulação do comportamento do tipo ansioso tardio (10 dias) induzido por um único estresse de contenção. / INTRODUCTION: stress, an important cause of anxiety, triggers HPA activation, releasing epinephrine and glucocorticoids (GCs) hormones and neurotransmitters such as norepinephrine (NE). As result, morphological and biomolecular changes occurs in several regions of CNS, majorly in the amygdala basolateral complex, in addition to behaviors alterations. OBJECTIFS: to investigate, using atenolol and metyrapone administration (ip), the influence of NE receptors (β1) and GR, respectively, in the BLA of rats in the restraint stress-induced long-lasting anxiety. In addition, also investigate the participation of ERK-MEK-CREB signaling and neuronal BLA excitability in such paradigm. RESULTS: we showed that restraint stress (2h) induced anxiety-like behavior 10 days after stress, and the pre-treatment with atenolol blunted such effect. In addition, we observed that restraint stress increased the expression of EGR1 (p<0.05) in the BLA of stressed rats, which was also blunted by atenolol administration, suggesting a higher activity in BLA neurons. We found no modulation in ERK and CREB activation in restraint stress-induced long-lasting anxiety rats. CONCLUSION: we conclude that the peripheral adrenergic/noradrenergic signaling may have a relevant function in long-lasting anxiety-like behavior (10 days) induced by a single episode of restraint stress.
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Taxonomia e distribuição geográfica do complexo Penelope superciliaris Temminck, 1815 (Aves: Galliformes: Cracidae) / Taxonomy and geographic distribution of Penelope superciliaris complex Temminck, 1815 (Aves: Galliformes: Cracidae)Vargas, Oscar Diego Evangelista 09 May 2017 (has links)
Penelope superciliaris Temminck, 1815, comumente conhecido como jacupemba, é o jacu com a mais ampla área de distribuição, ocorrendo no Brasil, Paraguai, Argentina e Bolívia, sendo também uma das sete espécies do gênero Penelope distribuída no Brasil. Suas subespécies foram descritas com base na largura e a tonalidade das bordas das penas, no desenvolvimento da linha superciliar, pigmentação das partes nuas, coloração geral da plumagem e tamanho. A taxonomia deste táxon é complexa e até hoje muitos autores nunca chegaram a um consenso sobre a validade dos táxons subordinados, a maioria deles reconhece apenas três subespécies: P. s. superciliaris, P. s. jacupemba e P. s. major, outras populações propostas como novas subespécies geográficas são atualmente sinonimizadas com as três anteriores. Para este complexo nenhuma revisão foi realizada nos últimos 70 anos, é por isso que, com coletas recentes de material novo, estamos realizando uma revisão taxonômica com base em caráteres morfológicos externos. O objetivo deste trabalho é verificar quantos táxons estão no nível de espécie no complexo Penelope superciliaris e delimitar suas respectivas distribuições geográficas, de acordo com o bioma em que eles ocorrem. Para atingir esses objetivos, realizamos análises qualitativas de carácteres morfológicos externos como coloração da plumagem, pigmentação das partes nuas, e também foram testadas variações inter- e intra-populacionais de acordo com esses caráteres. Para a análise estatística foram realizados testes univariados e multivariados para avaliar o dimorfismo sexual e a variação geográfica. De dezoito grupos geográficos formados, as análises qualitativas revelam que não há dimorfismo sexual, e a maioria delas tem um alto grau de variação individual. As análises estatísticas não discriminaram os sexos e populações com base nas oito medidas corporais utilizadas, porém os táxons foram discriminados pela coloração da plumagem e a pigmentação das regiões nuas. De acordo com o Conceito Filogenético de Espécies (PSC), consideramos que o complexo Penelope superciliaris deve ser dividido em quatro espécies: Penelope pseudonyma Neumann, 1933, uma população de jacus de cara azul restrita ao interflúvio Madeira-Tapajós na floresta amazônica; Penelope ochromitra Neumann, 1933, da Caatinga e Cerrado que limita com este bioma; Penelope alagoensis Nardelli, 1993, do Centro de Endemismo Pernambuco; e Penelope superciliaris Temminck, 1815, que ocorre no resto da distribuição do complexo. / Penelope superciliaris Temminck, 1815, known as Rusty-margined Guan, is a forest guan with the widest distribution, occurring in Brazil, Paraguay, Argentina and Bolivia, being also one of the seven species of the genus Penelope distributed in Brazil. Its subspecies have been described based on the width and shade of edges of feathers, the development of the superciliary stripe, naked parts pigmentation, general plumage coloration and size. The taxonomy of this taxon is complex and even today many authors never reached a consensus on the validity of the subordinate taxa; most of them recognize only three subspecies: P. s. superciliaris, P. s. jacupemba and P. s. major; other populations proposed as new races are currently synonymized with the previous three. For this complex, no review was conducted in the last 70 years that is why, with recent collection of new material, I performed a taxonomic revision based on external morphological characters. The aim on this work is to verify how many taxa exist at the species level in the Penelope superciliaris complex, and delimit their respective geographic distributions. To achieve these goals, we performed qualitative analyzes of external morphological characters as plumage coloration, naked parts pigmentation, and were tested inter- and intra-populational variations according to these characters. For statistical analyzes we performed univariate and multivariate tests to evaluate the sexual dimorphism and geographical variation. From eighteen geographic groups formed, the qualitative analyzes reveals that there is no sexual dimorphism, and most of them have a high degree of individual variation. Statistical analyzes did not discriminate the sexes and populations based on the eight body measurements used, but the taxa were discriminated by plumage coloration and naked parts pigmentation. According to the Phylogenetic Species Concept (PSC), we consider that the Penelope superciliaris complex must be divided in four species: Penelope pseudonyma Neumann, 1933, a blue-faced guans population restricted to the Madeira-Tapajós interfluvium in the Amazon forest; Penelope ochromitra Neumann, 1933, from the Caatinga and Cerrado that borders with this biome; Penelope alagoensis Nardelli, 1993, from the Pernambuco Center of Endemism; and Penelope superciliaris Temminck, 1815, which occurs in the rest of the distribution of the complex.
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Caracterização espectral das imagens de cor do oceano durante florações de fitoplâncton na Lagoa dos Patos / Spectral characterization of ocean color images during phytoplankton blooms at Lagoa dos PatosJorge, Daniel Schaffer Ferreira 07 October 2013 (has links)
A Lagoa dos Patos (LP) é um dos ambientes oticamente complexos mais bem estudados no Brasil, e sua grande abrangência espacial, permite a união de diferentes medidas in situ com produtos de sensoriamento remoto, sendo possível entender melhor como os componentes óticos da água influenciam na sua cor. Florações de fitoplâncton possuem grande relevância ecológica e econômica, sendo o desenvolvimento de metologias simples para o seu monitoramento de vital importância. O presente trabalho utilizou produtos de coloração do oceano de imagens diárias dos sensores MODIS/Aqua e SeaWiFS durante os anos de 2002-2005, dados de modelos meteorológicos de reanálise para precipitação e velocidade do vento e dados de clorofila-a e salinidade obtidos in situ. Foi identificado que o espectro de reflectância de sensoriamento remoto é controlado pelo regime de El Niño e La Niña, variação intra anual e espacial (p<0.05), sendo a cor da água da LP em geral, característica de ambientes com alta concentração de CDOM/sedimentos ou de domínio misto. Partindo do pressuposto que o fitoplâncton domina o coeficiente de absorção da luz durante florações de fitoplâncton, e que as possíveis florações na LP se restringem a diatomáceas e cianobactérias, foi desenvolvido um modelo de classificação para discriminar a ocorrência desses eventos. O modelo proposto permite a classificação de águas oticamente complexas de acordo com o componente ótico predominante, e é pioneiro na exploração de dados do sensor MODIS/Aqua para detecção de florações de fitoplâncton em um ambiente lagunar / Patos Lagoon (PL) is one of the optical complex environment best studied in Brazil, and it large spatial extent, allows the union of different in situ and remote sensing measures, enabling a better understandment of how the optical components in water can influence its color. Phytoplankton blooms have great ecological and economic relevance, and the development of simple methodologies for your monitoring of vital importance. The present work used ocean color products from daily MODIS/Aqua and SeaWiFS images during the years 2002-2005, meteorological model data for precipitation and wind speed and chlorophyll-a and sailinity data obtained in situ. It was detected that remote sensing reflectance spectra is controlled by the regime of El Niño and La Niña, intra annual and spatial changes (p<0.05), ande the water color from PL in general, characteristic of environments with high CDOM/sediments concentration or with mixed domain. Assuming that the phytoplankton dominate light absorption coefficient during phytoplankton blooms, and that PL possible blooms are restricted to diatom and cyanobacteria, a classification model was developed to discriminate the occurance of those events. The proposed model allows for the classification of optically complex waters according to the predominant optical component, and it is pioneer in the exploration of data from MODIS/Aqua sensor to detect phytoplankton blooms in lagunar environment
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