O ruído articular é comumente reconhecido como um sinal de desarranjo articular, e a sua análise faz parte do conjunto de dados coletados em vários sistemas de classificação e diagnóstico, tanto em pesquisas como nas atividades clínicas. Apesar desta importância, existe ainda dificuldade na interpretação dos sons, em virtude da variação natural do fenômeno, do subjetivismo por parte de examinadores e dos métodos e equipamentos empregados para o diagnóstico. Visando uma análise mais objetiva, foi desenvolvido um dispositivo para gravar e analisar graficamente os sons. Este método permite o armazenamento e sucessivas análises, eliminando ainda diferenças de percepção de sons entre os examinadores. O objetivo da pesquisa é verificar a eficácia do dispositivo desenvolvido efetuando a comparação com exames de ressonância magnética (RM). A concordância entre os examinadores e as análises das gravações também foram feitas, para se verificar o subjetivismo das percepções. Pacientes com idade entre 14 a 75 anos e que reportaram dor muscular e/ou a presença de sons articulares foram incluídos na pesquisa. Foram excluídos aqueles que já tivessem recebido tratamento prévio, apresentassem dores de cabeça, infecções, traumas faciais recentes, patologias sistêmicas, gravidez ou marca passos. De acordo com estes critérios, uma amostra de 18 pacientes foi selecionada para a pesquisa. Os pacientes tiveram os ruídos articulares detectados com o método de palpação e por estetoscópios , por quatro examinadores, e os sons então foram gravados e analisados, com o dispositivo desenvolvido. Por fim, as percepções dos sons por todos os métodos realizados na pesquisa foram aplicadas ao protocolo RDC/TMD, e diagnósticos para cada paciente foram obtidos. Desta forma, foi feita a comparação com os exames de ressonância magnética (RM), adotado como padrão ouro na pesquisa. O critério estatístico de Altman mostrou uma concordância em termos de valores de kappa muito baixa entre os quatro examinadores. Nos ciclos de abertura, de acordo com os resultados obtidos no estudo, o examinador 2 (método de palpação) apresentou uma fraca concordância com os examinadores 3 e 4, (método de estetoscópios), (k=0.272 e k=0.397, respectivamente). O examinador 3 apresentou uma boa concordância com o examinador 4 (k=0.698). Nos ciclos de fechamento, o examinador 3 apresentou uma fraca concordância com o examinador 4 (k=0.398). Na comparação entre as gravações e os examinadores, verificou-se a falta de concordância entre estes, com valores de kappa muito baixos, quando possíveis de serem calculados (k=0.021 até k=0.147). Quando os diagnósticos obtidos pelo RDC/TMD por todos os métodos foram comparados com os laudos de RM, a gravação apresentou melhor percentual de concordância (55,6%), em relação à percepção de som pelos examinadores (36,1% a 52,8%). O dispositivo desenvolvido para análise e gravação dos ruídos articulares mostrou ser um método de fácil manuseio e visualização, conseguindo uma superior detecção de ruídos. A comparação com exames de RM confirmou esta melhora. / The joint noise is commonly recognized as a sign of an articular derangement, and its analysis is part of the data set collected in many systems of classification and diagnosis, both in research and clinical activities. Despite this importance, there is some difficulty in interpreting the sounds due to the natural variability of the phenomenon, subjectivism by examiners and the methods and equipments used for diagnosis. In order to get a more objective analysis, we developed a device to record and graphically analyze the sounds. This method allows the storage and subsequent analysis, even eliminating differences in perception of sound between the examiners. The present research aims to verify the effectiveness of the device developed by comparisons with magnetic resonance imaging (MRI). The agreement between the examiners and the analysis of the recordings were also made to verify the subjectivity of perception. Patients aged 14 to 75 years who reported muscle pain and / or the presence of joint sounds were included in the survey. We excluded those who had already received previous treatment, experience headaches, infections, recent facial trauma, systemic diseases, and pregnancy or pacemakers users. According to these criteria, a sample of 18 subjects was selected for the survey. The patients had joint noises detected with the methods of palpation and stethoscope by four examiners, and the sounds were recorded and then analyzed with the developed device. Finally, perceptions of the sounds made by all methods were applied in the research protocol RDC / TMD, and diagnoses for each patient were obtained. Finally, the comparison was made with magnetic resonance imaging (MRI), adopted as the gold standard in research. From the results, according to Altman criteria, there was an agreement in terms of very low kappa values among the four examiners. In cycles of opening, according to the results obtained in the study, the examiner 2 (palpation method) showed a poor agreement with the examiners 3 and 4 (method of stethoscopes), (k = 0272 k = 0397, respectively). The examiner 3 had good agreement with the examiner 4 (k = 0698). In closing cycles, the examiner 3 had a poor agreement with the examiner 4 (k = 0398). In the comparison between the recordings and the examiners, there was a lack of agreement among these, with very low kappa values when possible to be calculated (k = k = 0021 to 0147). When the diagnoses obtained by RDC / TMD by all methods were compared with the findings of MRI, the recording method showed the best percentage of agreement (55.6%) compared to the perception of sound by the examiners (36.1 to 52%, 8%). The device developed for recording and analyzing the joint sounds proved to be an easy method of handling and display, achieving a better detection of the noise. The comparison with MRI confirmed this improvement.

Uma das grandes dificuldades para o controle do rebanho em áreas tão extensas como o território brasileiro é a resistência por parte dos pecuaristas/proprietários de fazendas em usar a tecnologia. O não uso de tecnologias acaba tornando inviável a rastreabilidade e consequente controle da cadeia produtiva. A proposta deste trabalho é a implementação de um sistema, aqui denominado SARE (Sistema de Alerta de Risco Epidemiológico), para gerenciar informações de diagnóstico, comunicando em tempo real aos órgãos competentes de maneira hierarquizada as ocorrências de testes positivos e doenças, agregando confiabilidade e segurança na transmissão dos dados. O foco primário é agilizar o processo de comunicação com intuito de assegurar que medidas preventivas possam ser tomadas em tempo hábil. Considerando que a situação atual no Instituto Biológico (IB) é bastante burocrática e não existem processos informatizados integrados, o sistema proposto SARE foi desenvolvido para ser utilizado via web, de modo a facilitar a comunicação imediata dos órgãos fiscalizadores envolvidos no processo, que imediatamente podem intervir e tomar decisões para o controle de doenças zoossanitárias. A informatização do sistema de sanidade animal para um Centro de Referência como o Instituto Biológico em São Paulo aliado a implantação de um programa especialmente desenvolvido para gerenciar os dados e transmiti-los em tempo real aos órgãos de defesa sanitária contribuirá para a modernização dos processos de diagnóstico, facilitando a identificação de amostras, agilizando a comunicação e gerando rastreabilidade de todas as operações diagnósticas. O sistema proposto contempla também um módulo desenvolvido para auxiliar especialistas (veterinários e especialistas de campo) na solicitação de exames conforme situação detectada em campo. Para o desenvolvimento desse módulo foi proposto o uso de ontologias para a representação do conhecimento dos especialistas da área a fim de criar um vocabulário com termos formais e informais para auxílio na solicitação adequada de exames conforme sintomas aferidos em campo. / One of the major challenges for herd control in areas as large as the Brazilian territory is resistance by breeders/ranch owners to using technology. Failure to use technologies makes tracking and subsequent control of the productive chain unviable. The proposal of this work is to implement a system, hereby named Epidemiologic Risk Alert System (SARE), to manage diagnosis information, reporting occurrences of positive tests and diseases in real time and in a hierarchical manner to the competent agencies, adding reliability and security in data transmission. The primary focus is to expedite the communication process aiming to ensure that preventive measures can be taken in a timely manner. Considering the fact that the current situation at the Biological Institute (BI) is very bureaucratic and that there are no integrated computerized processes, the proposed SARE system was developed to be used via the web in order to facilitate immediate communication with the inspecting agencies involved in the process, which can immediately intervene and make decisions to control zoosanitary diseases. Computerization of the animal health system for a reference center such as the Biological Institute of São Paulo, together with implementation of a specially developed program to manage data and transmit it in real time to the health defense agencies will contribute to modernization of the processes of diagnosis, facilitating identification of samples, speeding communication and ensuring traceability of all the diagnostic operations. The proposed system also contains a module developed to assist specialists (veterinarians and field specialists) request exams depending on the situation detected in the field. To develop this module the use of ontologies was proposed, to represent the knowledge of specialists in the area in order to create a vocabulary with formal and informal terms to assist in the adequate requesting of exams depending on the symptoms noted in the field.

A nanomedicina aborda o uso de nanopartículas direcionadas ao sítio de ação como plataformas para construção de imagens e agentes terapêuticos contra o câncer e outras doenças humanas. Em particular, as nanopartículas de ouro (AuNps) já demonstraram ser eficientes para o diagnóstico e terapia. O interesse pelo desenvolvimento das AuNps deve-se as suas extraordinárias propriedades físicas e químicas resultantes do efeito de seu tamanho em escala nano, de possuir uma superfície de fácil modificação e pelo ouro radioativo ser um emissor  e β (198Au; E= 0,411 MeV, βmáx = 0,96 MeV; T1/2 = 2,69 dias), tendo como vantagem a possibilidade de ser aplicado como instrumento de diagnóstico molecular para tomografia de emissão de fóton único (SPECT) utilizando apenas uma pequena quantidade de ouro radioativo. Neste trabalho foram sintetizadas AuNps, cuja superfície foi funcionalizada com um polímero biocompatível (polietilenoglicol modificado ) e com o ácido fólico, afim de, torná-las furtivas e específicas a tumores que superexpressam receptores de folato. As técnicas de Espalhamento Dinâmico de Luz (DLS), potencial zeta ( ), Microscopia Eletrônica de Transmissão (MET) e Espectroscopia de absorção UV-Visível foram empregadas para caracterização do tamanho e da geometria das nanopartículas, além de confirmar sua ligação ao Tiol-PEG e Tiol-PEG-Folato. Os resultados de MET e UV-Vísivel mostraram a formação de AuNps dispersas com tamanhos entre 8 a 12 nm com forte absorção entorno de 520 nm, referente ao máximo de ressonância plasmônica de superfície. Resultados de DLS mostraram um diâmetro hidrodinâmico de 10 e 14 nm. Os valores de potencial das dispersões preparadas (pH ~ 5,0 a 6,0) variaram entre -16,2 e -42,1 mV, indicando suspensões coloidais estáveis. Para determinarmos a concentração real de ouro nas amostras, as mesmas passaram pelo processo de ativação neutrônica no reator nuclear TRIGA MARK I IPR-R1 do CDTN/CNEN de Belo Horizonte. Estudos de biocompatibilidade in vitro e in vivo das amostras foram realizados demonstrando que as mesmas possuem baixa toxicidade nos modelos utilizados. Foi avaliada também a internalização das nanopartículas de ouro funcionalizadas com Tiol-PEG-Folato-FITC em células que superexpressam receptores de folato. Verificou-se que as nanopartículas são capazes de penetrar na célula, distribuindo-se pelo citoplasma e núcleo. De acordo com os resultados obtidos, pode-se concluir que foram produzidas nanopartículas de ouro dispersas, furtivas e específicas para tumores que superexpressam folato.

O principal fator de risco para tuberculose (TB) em receptores de transplante de células-tronco hematopoiéticas (TCTH) é viver em regiões de alta endemicidade da doença, uma vez que a imunossupressão favorece a reativação da tuberculose latente (TBL). O diagnóstico da TBL pela prova tuberculínica (PT) tem limitações nos imunocomprometidos e testes de detecção de interferon gama podem ser vantajosos. Os objetivos do presente estudo foram comparar a PT com o QuantiFERON® TB-Gold In-Tube (QFT-GIT) no diagnóstico da TBL e determinar a incidência de TB em duas coortes de pacientes submetidos ao TCTH. Duas coortes foram analisadas prospectivamente. Coorte1: receptores de TCTH incluídos desde o período pré-transplante. Coorte 2: receptores de TCTH com doença do enxerto contra o hospedeiro (DECH) crônica em atividade. A PT e o QFT-GIT foram realizados imediatamente após a inclusão em ambas as coortes. Pacientes na coorte 1 com diagnóstico de TBL receberam profilaxia com isoniazida (INH) por nove meses. Na coorte 2, os pacientes foram acompanhados clinicamente, sem receber profilaxia. TB ativa foi investigada prospectivamente de acordo com definição de caso e por coletas periódicas de escarro. Entre os candidatos ao TCTH, a prevalência de TBL detectada pela PT foi de 4,7% e de 7,1% pelo QFT-GIT. Entre os receptores com DECH crônica a prevalência de TBL detectada pela PT foi de 5,3% e de 12,5% pelo QFT-GIT. A comparação entre as técnicas revelou boa concordância (kappa=0.60). Não houve casos de TB na coorte 1. A incidência cumulativa de TB na coorte 2 foi de 3%. Em comparação com alguns estudos, nossos resultados apresentaram menor prevalência de TB, com menos resultados indeterminados pelo QFT-GIT e melhor concordância entre ambos os testes. É provável que a introdução de profilaxia com INH seja benéfica também para os pacientes com DECH crônica. / The main risk factor for tuberculosis (TB) in hematopoietic stem cell transplant recipients (HSCT) is to live in regions of high endemicity of the disease, since immunosuppression favors the reactivation of latent tuberculosis infection (LTBI). The diagnosis of LTBI by the tuberculin test (TT) has limitations in the immunocompromised hosts and the interferon gamma release assays (IGRAs) may be advantageous. The objectives of the present study were to compare the TT with QuantiFERON® TB-Gold In-Tube (QFT-GIT) in the diagnosis of LTBI and to determine the incidence of TB in two cohorts of patients undergoing HSCT. Two cohorts were analyzed prospectively. Cohort 1: HSCT recipients included since the pre-transplant period. Cohort 2: TCTH recipients with active chronic graft versus host disease (GVHD). TT and QFT-GIT were performed immediately after inclusion in both cohorts. Patients in cohort 1 with diagnosis of LTBI received prophylaxis with isoniazid (INH) for 9 months. In cohort 2, the patients were followed up clinically, without receiving prophylaxis. Active TB was investigated prospectively according to a case definition criteria and periodic sputum sampling. Among the HSCT candidates, the prevalence of LTBI detected by TT was 4.7% and 7.1% by QFT-GIT. Among the recipients with chronic GVHD, the prevalence of LTBI detected by TT was 5.3% and 12.5% by QFT-GIT. The comparison between the techniques showed good agreement (kappa = 0.60). There were no cases of TB in cohort 1. The cumulative incidence of TB in cohort 2 was 3%. Compared with some studies, our results showed a lower prevalence of LTBI, with less indeterminate results by QFT-GIT and better agreement between both tests. It is likely that prophylaxis with INH is also beneficial for patients with chronic GVHD.

A presente pesquisa busca demonstrar, por meio da Avaliação Pós-Ocupação (APO) funcional, os procedimentos mais adequados para alimentar processos de projeto arquitetônico para centros de diagnóstico por imagem em unidades autônomas, visando colaborar com a elaboração de programas de necessidades mais próximos das necessidades efetivas dos usuários de edifícios complexos dessa natureza. Está centrada na ênfase à flexibilidade do edifício e à funcionalidade da compartimentação dos seus ambientes. Os centros de diagnóstico representam um setor em expansão, apresentam alta rotatividade de equipamentos, sempre de última geração, com uma dinâmica de adaptação espacial acelerada, requerendo revisões e ampliações constantes. São, pela própria natureza, promotores do reuso de edifícios, uma vez que a maioria se encontra em casas adaptadas. Via de regra, estão localizados em grandes centros urbanos. A metodologia da Avaliação Pós-Ocupação (APO) funcional foi aplicada no decorrer do uso em dois centros de diagnóstico por imagem na cidade de Campinas, São Paulo, uma vez que a detecção de problemas após a ocupação é imprescindível como insumo para futuras ampliações e adaptações inerentes à realidade das unidades de diagnóstico em geral. Os estabelecimentos foram estudados dos pontos de vista do seu projeto, construção e uso. Observou-se de que forma ocorre o uso dos ambientes pelos seus usuários, levando-se em conta seus aspectos positivos e aspectos a serem melhorados. As bases teóricas da pesquisa abordaram temas relativos a estudos de caso constantes na literatura, o estudo das normas brasileiras pertinentes, bem como o estudo de um importante centro de radiologia referencial situado na cidade de São Paulo, um benchmark na área de diagnóstico por imagem. Os resultados da pesquisa demonstraram que as abordagens teóricas e práticas são complementares. Dentre os resultados obtidos, é possível considerar que o estudo dos fluxos de usuários, a aplicação dos grupos focais e as observações comportamentais dos usuários podem contribuir em diversos temas na elaboração dos projetos de centros de diagnóstico por imagem e ser adotados para a gestão da qualidade desse tipo de ambiente da saúde. / The present research intends to show, through the Functional Post-Occupancy Evaluation, the most suitable procedures to feed the architectural design processes for imaging centers of diagnosis in autonomous units, aiming at to collaborate with the development of architectural programming to meet user requirements of complex buildings of such nature. It focused on the building flexibility and in the functionality of the environment share. The centers of diagnosis represent a growing industry, present a high last generation equipment turnover, with a dynamics of speed up environment adjustment, requiring constant reviews and enlargements. They are, by nature, promoters of buildings reuse, once most of them are adapted houses and are generally located in large urban centers. The Functional Post-Occupancy Evaluation methodology was applied during the use of two centers of diagnosis in Campinas city, at São Paulo state, as the detection of post occupation problems is essential for future adaptations and extensions inherent to diagnostic units reality in general. The sites were studied in terms of its architectural design and its use. It was noted how is the use of environments by their users, taking into account its positive aspects and the aspects to be improved. The theoretical bases of the research approached themes are related to case studies in the literature, the study of Brazilian standards and the study of a major referential center of radiology located at the city of São Paulo, a benchmark in the field of diagnosis by image. The survey results showed that the theoretical and practical approaches are complementary. Among the results, it can be considered that the study of the flow of users, the application of focus groups and the observations of user behavior can help on several issues in the development of designs for the imaging centers of diagnosis and are used to manage the quality of this type of health environment.

O objetivo principal deste estudo foi avaliar a frequência de cepas do HBV com mutações de resistência aos análogos nucleos(t)ídeos (AN) utilizados no tratamento da hepatite B entre indivíduos cronicamente infectados, não submetidos a tratamento, procedentes de diferentes regiões do Brasil. Além disso, foram avaliadas a presença de mutações que alteram a antigenicidade do HBsAg promovendo escape dos anticorpos anti-HBs; mutações nos genes pré-core/core e a associação dos diferentes subgenótipos com as mutações encontradas e características demográficas e laboratoriais dos pacientes. Foram incluídas 779 amostras de soro de pacientes com infecção crônica pelo HBV e virgens de tratamento com AN ou interferon, as quais foram coletadas no período de 2006 a 2011. Os pacientes eram procedentes dos seguintes estados brasileiros: Pará, Maranhão, Bahia, Minas Gerais, São Paulo, Paraná e Rio Grande do Sul. O DNA do HBV foi extraído das amostras de soro utilizando o Kit QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen) e posteriormente foi realizada a amplificação das regiões S/polimerase (S/P) e pré-core/core (PCC) do genoma viral por nested PCR. O fragmento amplificado foi submetido a sequenciamento direto em sequenciador automático de DNA (ABI 3500) e as sequências obtidas foram analisadas para identificação dos genótipos e subgenótipos do HBV, pesquisa de mutações na polimerase, no HBsAg e nos genes pré-core/core. A região S/Pol foi amplificada e sequenciada com sucesso em 702 amostras, as quais foram incluídas para atender aos objetivos deste estudo. Entre as 702 amostras analisadas sete genótipos e 12 subgenótipos do HBV foram identificados. O subgenótipo A1 foi o mais frequente (63,7%, 447/702), seguido pelo HBV/D3 (14,5%, 102/702). Os demais genótipos e subgenótipos encontrados e suas frequências foram as seguintes: A2 (3,3%, 23/702), A3 (0,1%, 1/702), B1 (0,1%, 1/702), B2 (0,1%, 1/702), C2 (0,9%, 6/702), D1 (0,9%, 6/702), D2 (4,6%, 32/702), D4 (5,1%, 36/702), D com subgenótipo não identificado (0,7%, 5/702), E (0,6%, 4/702), F2a (4,6%, 32/702), F4 (0,4%, 3/702), e G (0,4%, 3/702). Cepas do HBV com mutações de resistência (rtS202G, rtM204V/I, rtA194T, rtM250I, rtA181T/S, rtT184S) associadas ou não a mutações compensatórias (rtL80I, rtV173L, rtL180M, rtV207I) foram identificadas em 1,6% (11/702) das amostras analisadas. Cepas com mutações potencialmente associadas com resistência ao adefovir (rtS85A, rtL217R, rtI233V, rtN238T, rtN238D, rtN248H, rtV214A,e rtQ215S) ou ao entecavir (rtS219A) foram identificadas em 7,7% (54/702) e 2,6% (16/702) dos pacientes, respectivamente. Cinquenta e sete (8,5%) amostras apresentaram cepas do HBV com mutações na principal região hidrofílica do HBsAg previamente relacionadas com escape dos anticorpos anti-HBs ou com prejuízo na secreção do HBsAg. Foram feitas análises estatísticas para avaliar a correlação entre os subgenótipos do HBV mais frequentes na casuística (A1, A2, D1, D2, D3, D4 e F2a) e a presença de mutações nos genes PCC. Dentre as mutações nos genes PCC associadas com redução ou falha na expressão do HBeAg, as mutações A1762T/T1764A estiveram associadas aos subgenótipos A1 e F2a; G1862T e mutações nas posições 1809-1812 ao subgenótipo A1; G1896A e/ou G1899A aos subgenótipos D2, D3 e D4. Mutações associadas com evolução da doença foram detectadas e entre essas as mutações C1766T e T1768A estiveram associadas aos subgenótipos A1 e F2a, e a mutação G1888A foi associada ao subgenótipo A1. As cepas do HBV que circulam nas diferentes regiões brasileiras estudadas apresentam grande variabilidade genética e a distribuição dos genótipos e subgenótipos reflete a formação histórica de cada região e do fluxo migratório mais recente. A frequência de cepas do HBV com mutações de resistência aos AN circulando entre pacientes virgens de tratamento com esses medicamentos nas diferentes regiões do Brasil estudadas é baixa, sendo que o perfil de mutações que confere resistência total à lamivudina e parcial ao entecavir parece ser o mais disseminado. Embora tenham sido detectados casos de infecção com cepas do HBV portando mutações com grande impacto na antigenicidade dessa proteína todas as amostras apresentaram HBsAg detectável. Pacientes com HBeAg negativo foram mais frequentes na casuística estudada, independente do subgenótipo. As mutações encontradas nos genes PCC sugerem que há perfis de mutações diferentes envolvidos na negatividade do HBeAg para cada subgenótipo / The main aim of this study was to evaluate the frequency of HBV strains harboring mutations that confer resistance to nucleos(t)ide analogues (NA) used to hepatitis B treatment among treatment-naïve patients with chronic hepatitis B from different Brazilian region. Furthermore, we evaluated the presence of mutations that alter the antigenicity of HBsAg causing anti-HBs escape; mutations in genes pre-core/core and the association of different subgenotypes with the mutations detected and demographic and laboratory characteristics of the patients. Serum samples from 779 treatment-naïve patients with chronic HBV infection were included in this study. The samples were collected between 2006 to 2011 and the patients were from the following states: Pará, Maranhão, Bahia, Minas Gerais, São Paulo, Paraná and Rio Grande do Sul. HBV DNA was extracted from serum samples using the QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen) and amplification of S/polymerase (S/Pol) and pre-core/core (PCC) regions were performed by nested PCR. The amplified PCR products were submitted to sequencing in an automatic DNA sequencer (ABI 3500). The sequences obtained were analyzed to classify HBV genotypes/subgenotypes and to analyze the presence of mutations. S/Pol region was amplified and sequenced successfully from 702 samples, which were included in this study. Among these 702 samples, seven genotypes and 12 subgenotypes have been identified. HBV subgenotype A1 was the most frequent (63.7%, 447/702), followed by HBV/D3 (14.5%; 102/ 702). The remaining genotypes and subgenotypes identified and their frequencies were as follows: A2 (3.3%, 23/702), A3 (0.1%, 1/702), B1 (0.1%, 1/702), B2 (0.1%, 1/702), C2 (0.9%, 6/702), D1 (0.9%, 6/702), D2 (4.6%, 32/702), D4 (5.1%, 36/702), D unclassified subgenotype (0.7%, 5/702), E (0.6%, 4/702), F2a (4.6%, 32/702), F4 (0.4%, 3/702), and G (0.4%, 3/702). HBV strains harboring mutations conferring NA resistance alone (rtS202G, rtM204V/I, rtA194T, rtM250I, rtA181T/S, rtT184S) or combined with compensatory mutations (rtL80I, rtV173L, rtL180M, rtV207I) were identified in 1.6% (11/702) of the patients. Isolates harboring mutations potentially associated with adefovir resistance (rtS85A, rtL217R, rtI233V, rtN238T, rtN238D, rtN248H, rtV214A, and rtQ215S) or entecavir resistance (rtS219A) were identified in 7.7% (54/702) and 2.6% (16/702) of the patients, respectively. HBV with HBsAg mutations previous related with anti-HBs escape or impaired secretion were detected in 8.5% (57/702) of the samples. Statistical analyzes were performed to assess the correlation between the more frequent HBV subgenotypes found in this study (A1, A2, D1, D2, D3, D4 and F2a ) and mutations in PCC genes. Among the mutations found in these genes that were associated with reduction or failure in HBeAg synthesis, A1762T/T1764A mutations were associated to subgenotypes A1 and F2a; G1862T and mutations at positions 1809-1812 to subgenotype A1; G1896A and/or G1899A to subgenotypes D2, D3 and D4. Other mutations associated with disease progression were found: C1766T and T1768A mutations were associated with subgenotypes A1 and F2a, and the G1888A mutation was associated with subgenotype A1. HBV strains circulating in different Brazilian regions studied showed high genetic variability and distribution of genotypes and subgenotypes reflects the population formation history of each region and the occurrence of recent events of migration. The frequency of HBV strains with NA resistance mutations circulating among treatment-naive patients in different regions of Brazil studied is low and the profile of mutations that confer total resistance to lamivudine and partial resistance to entecavir is more widespread. Although some cases of infection have been detected with HBV strains carrying mutations associated with major impact on the antigenicity of this protein, all samples had detectable HBsAg. HBeAg negative cases were more frequent in the studied population, regardless of subgenotype. Different pattern of mutations were found in PCC genes, suggesting that different mechanisms are involved in HBeAg negativity for each subgenotype

A produção de microssistemas de análises totais (µTAS) tem sido objeto de esforços intensos pela comunidade científica. A necessidade de produção de uma plataforma que realize extração, amplificação e separação de DNA--um verdadeiro \"lab on a chip\"--é impulsionada pelas vantagens associadas com as análises em plataformas miniaturizadas. Esta Tese foca no desenvolvimento de métodos para análises de DNA em dispositivos microfluídicos que podem ser associados em µTAS. Inicialmente, foi feito o desenvolvimento de um novo método de extração em fase sólida em que a eficiência de extração depende da manipulação magnética das partículas e não do fluxo da solução através da fase sólida. A utilidade desta técnica em isolar DNA puro de alta qualidade (amplificável) a partir de uma amostra biológica complexa foi demonstrada através da purificação de DNA a partir de sangue total e a subsequente amplificação do fragmento do gene β-globina. A técnica descrita é rápida, simples e eficiente, permitindo uma recuperação de mais de 60% de DNA a partir de 600 nL de sangue em concentração suficiente para amplificação via reação em cadeia da polimerase (PCR). Após o desenvolvimento da extração dinâmica de DNA em fase sólida (dSPE) em microchip de vidro, o método foi adaptado para o uso em microchips de poliéster-toner (PT). Além da extração, a amplificação e separação de DNA também foram realizadas em microchips de PT. O processo convencional de fabricação dos dispositivos de PT produz canais com 12 µm de profundidade. Este trabalho descreve um novo processo de fabricação dos microchips de PT com canais mais profundos. Uma cortadora a laser de CO2 é usada para definir a estrutura desejada no filme de poliéster recoberto com toner. Estes filmes de poliéster recobertos com toner e os canais recortados são utilizados com partes intermediárias no microchip. A tampa e a base (filmes de poliéster) são laminadas juntamente com as partes intermediárias. Desta forma microchips com canais mais profundos podem ser criados. Microchips com 4 filmes de poliéster (base, tampa, e dois filmes centrais) foram utilizados para realizar dSPE. Estes microchips possuem canais com ~270 µm de profundidade. A dSPE adaptada para os microchips de PT demonstrou ser capaz de extrair eficientemente DNA (~65%), e o DNA purificado apresentou qualidade suficiente para PCR. A PCR realizada em microchips de PT demonstrou que os dispositivos de PT são compatíveis com os reagentes da PCR e o sucesso da reação de PCR foi demonstrado através da amplificação do fragmento de 520 pares de bases do λ-DNA. A possibilidade de manipular diferentes soluções que são necessárias para realizar a extração e a PCR demonstra o grande potencial desta plataforma para realizar análises genéticas. Além da extração e amplificação, a separação também foi demonstrada nos dispositivos de PT. Duas integrações foram feitas nos microchips de PT, dSPE-PCR e PCR-separação. Na primeira integração a dSPE e PCR foram realizadas em uma única câmara, e a amplificação do fragmento de 520 pb do λ-DNA foi demonstrada. Na segunda integração, o dispositivo foi fabricado com espessuras diferentes para os diferentes domínios. No domínio da PCR as câmaras possuem profundidade de ~270 µm de profundidade, e para o domínio da eletroforese os canais apresentam 12 µm de profundidade. A integração realizada sem válvulas foi demonstrada através da amplificação e detecção do fragmento de 520 pb do λ-DNA em um mesmo microchip. Este trabalho demonstra o grande potencial dos microchips de PT para produzir dispositivos descartáveis totalmente integrados para análise genética. / Efforts to develop a microfluidic-based total analysis system (µTAS) have been intense in the scientific community. The goal of achieving a device comprising DNA extraction, amplification, and detection in a single device, a true \"lab on a chip,\" is driven by the substantial advantages associated with such a device. This Thesis focus on development of methods for DNA analysis on microdevices, that can be associated with µTAS. Sequentially, the first step was the development of a novel solid-phase extraction technique in which DNA is bound and eluted from magnetic silica beads in a manner that efficiency is dependent on the magnetic manipulation of the beads and not on the flow of solution through a packed bed. The utility of this technique in the isolation of reasonably pure, PCR-amplifiable DNA from complex samples is shown by isolating DNA from whole human blood, and subsequently amplifying a fragment of the β-globin gene. The technique described here is rapid, simple, and efficient, allowing for recovery of more than 60% of DNA from 600 nL of blood at a concentration which is suitable for PCR amplification. The second step was the use of polyester-toner (PT) microchips for DNA analysis (extraction, PCR and separation). The laser-printing of toner onto polyester films has been shown to be effective for generating PT microfluidic devices with channel depths on the order of 12 µm. We describe a novel and innovative process that allows for the production of multilayer PT microdevices with substantially larger channel depths. Utilizing a CO2 laser to create the microchannel in polyester sheets containing a uniform layer of printed toner, multilayer devices can easily be constructed by sandwiching the channel layer between uncoated cover sheets of polyester containing precut access holes. The process allows for the fabrication of channels several hundred microns in depth, with ~270 µm deep microchannels utilized here to demonstrate the effectiveness of multilayer PT microchips for dynamic solid phase extraction (dSPE) and PCR amplification. Dynamic SPE adapted for PT microchip was able to recover more than 65% of DNA from 600 nL of blood and the DNA was compatible with downstream microchip-based PCR amplification. The compatibility of PT microchips was demonstrated by successful amplification of a 520 bp fragment of λ-phage DNA. The ability to handle the diverse chemistries associated with DNA purtification and extraction is a testimony to potential utility of PT microchips beyond separations, and presents a promising new platform for genetic analysis that is low cost and easy to fabricate. Two integrations were carrying out on PT microchip, dSPE - PCR and PCR-ME. The first integration was made in a single chamber and the amplification of 520 bp fragment of λ-phage was demonstrated. The second integration describes a process that allows the production of a multidomain microchip with different channel depths for the different domains for genetic analysis. The final device was made by the conventional sandwiching of the four polyester films of the PCR domain with the two polyester films for the electrophoresis domain. The successful valveless integration of PCR and separation was demonstrated by amplification and detection of a 520 bp fragment of λ-phage DNA. This work shows the enormous potential of PT microchips to be used for total genetic analysis.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-07-17T16:39:50Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Claudia Nascimento de Sousa - 2017.pdf: 3306075 bytes, checksum: 76a3aca10e72c17305ca0b586d730d66 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-07-18T10:58:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Claudia Nascimento de Sousa - 2017.pdf: 3306075 bytes, checksum: 76a3aca10e72c17305ca0b586d730d66 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-18T10:58:56Z (GMT). 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METHODOLOGY: This is a descriptive, cross-sectional and exploratory study based on a quantitative approach that was developed among HCS’s users in Aparecida de Goiânia – GO. To collect the data it was used the handbook and tools structured according to the Basic Human Needs Theory. The Nursing Diagnosis (ND) Survey was conducted through the Developing Nurse’s Thinking model and through the NANDA-I taxonomy. RESULTS: Most participants were elderly, with an average of 70 years old. From those 35% had previously had a Stroke, 22% presented Chronic Obstructive Pulmonary Disease and 10% showed Head Trauma. Type AD2 clinical method was present in 72,5% of the cases. The nursing diagnoses categories analysis resulted in 120 categories present in the NANDA-I taxonomy (2015). From those, 60.8% were classified under the focusing on the problem diagnosis category, 34.2% were under the nursing risk diagnosis category and only 5% were classified as nursing promotion. These results show that is necessary to invest more in prevention and in methods to promote health. CONCLUSION: The Nursing Diagnoses identified show the complexities involving HSC and its multi-tensional demands. It puts the nurse professional as the main actor in the process and also shows challenges to user assistance, family caregivers or not as well as to the Health Care Network dynamic. / INTRODUÇÃO: O Serviço de Atenção Domiciliar (SAD), vinculado ao Programa Melhor em Casa, surgiu como uma das estratégias para atender a população com Doenças Crônicas Não Transmissíveis, além de integrar as recomendações do HumanizaSUS. Para instrumentalizar e qualificar a assistência de enfermagem, tem-se o Processo de Enfermagem, que direcionado pela Teoria das Necessidades Humanas Básicas (TNHB), de Wanda de Aguiar Horta, possibilita um olhar integral na assistência ao usuário do SAD. Mediante a escassez de descrição dessa população na literatura, identificar diagnósticos de enfermagem pode auxiliar no direcionamento das intervenções. OBJETIVO: Analisar o perfil e os diagnósticos de enfermagem dos usuários do Serviço de Atenção Domiciliar do município de Aparecida de Goiânia – GO. METODOLOGIA: Estudo descritivo, transversal, exploratório de abordagem quantitativa, realizado com os usuários do SAD do município de Aparecida de Goiânia – GO. Para a coleta de dados, utilizou-se manual e instrumento estruturado na Teoria das Necessidades Humanas Básicas. O levantamento dos Diagnósticos de Enfermagem (DE) foi realizado por meio do modelo Developing Nurse’s Thinking e da taxonomia NANDA-I. RESULTADOS: Houve o predomínio de idosos entre os participantes, com mediana de 70 anos de idade, representados por 35% com Acidente Vascular Encefálico, 22% com Doença Pulmonar Obstrutiva Crônica e 10% com Traumatismo Craniano. A modalidade clínica do tipo AD2 prevaleceu com 72,5%. A análise das categorias diagnósticas de enfermagem resultou em 120 categorias presentes na taxonomia NANDA-I (2015). Destas, 60,8% com destaque de categoria diagnóstica com foco no problema, 34,2% categorias diagnósticas de enfermagem de risco e apenas 5% representaram as categorias diagnósticas de enfermagem de promoção. Isso retrata a necessidade de melhor investimento no contexto preventivo e com metodologias de promoção da saúde. CONCLUSÃO: Os Diagnósticos de Enfermagem identificados evidenciam a complexidade do atendimento do SAD, com demandas multidimensionais, as quais apontam para o protagonismo do enfermeiro neste atendimento, além de configurarem desafios à assistência ao usuário, cuidadores familiares ou não, e à dinâmica da Rede de Atenção à Saúde.

A presente pesquisa busca demonstrar, por meio da Avaliação Pós-Ocupação (APO) funcional, os procedimentos mais adequados para alimentar processos de projeto arquitetônico para centros de diagnóstico por imagem em unidades autônomas, visando colaborar com a elaboração de programas de necessidades mais próximos das necessidades efetivas dos usuários de edifícios complexos dessa natureza. Está centrada na ênfase à flexibilidade do edifício e à funcionalidade da compartimentação dos seus ambientes. Os centros de diagnóstico representam um setor em expansão, apresentam alta rotatividade de equipamentos, sempre de última geração, com uma dinâmica de adaptação espacial acelerada, requerendo revisões e ampliações constantes. São, pela própria natureza, promotores do reuso de edifícios, uma vez que a maioria se encontra em casas adaptadas. Via de regra, estão localizados em grandes centros urbanos. A metodologia da Avaliação Pós-Ocupação (APO) funcional foi aplicada no decorrer do uso em dois centros de diagnóstico por imagem na cidade de Campinas, São Paulo, uma vez que a detecção de problemas após a ocupação é imprescindível como insumo para futuras ampliações e adaptações inerentes à realidade das unidades de diagnóstico em geral. Os estabelecimentos foram estudados dos pontos de vista do seu projeto, construção e uso. Observou-se de que forma ocorre o uso dos ambientes pelos seus usuários, levando-se em conta seus aspectos positivos e aspectos a serem melhorados. As bases teóricas da pesquisa abordaram temas relativos a estudos de caso constantes na literatura, o estudo das normas brasileiras pertinentes, bem como o estudo de um importante centro de radiologia referencial situado na cidade de São Paulo, um benchmark na área de diagnóstico por imagem. Os resultados da pesquisa demonstraram que as abordagens teóricas e práticas são complementares. Dentre os resultados obtidos, é possível considerar que o estudo dos fluxos de usuários, a aplicação dos grupos focais e as observações comportamentais dos usuários podem contribuir em diversos temas na elaboração dos projetos de centros de diagnóstico por imagem e ser adotados para a gestão da qualidade desse tipo de ambiente da saúde. / The present research intends to show, through the Functional Post-Occupancy Evaluation, the most suitable procedures to feed the architectural design processes for imaging centers of diagnosis in autonomous units, aiming at to collaborate with the development of architectural programming to meet user requirements of complex buildings of such nature. It focused on the building flexibility and in the functionality of the environment share. The centers of diagnosis represent a growing industry, present a high last generation equipment turnover, with a dynamics of speed up environment adjustment, requiring constant reviews and enlargements. They are, by nature, promoters of buildings reuse, once most of them are adapted houses and are generally located in large urban centers. The Functional Post-Occupancy Evaluation methodology was applied during the use of two centers of diagnosis in Campinas city, at São Paulo state, as the detection of post occupation problems is essential for future adaptations and extensions inherent to diagnostic units reality in general. The sites were studied in terms of its architectural design and its use. It was noted how is the use of environments by their users, taking into account its positive aspects and the aspects to be improved. The theoretical bases of the research approached themes are related to case studies in the literature, the study of Brazilian standards and the study of a major referential center of radiology located at the city of São Paulo, a benchmark in the field of diagnosis by image. The survey results showed that the theoretical and practical approaches are complementary. Among the results, it can be considered that the study of the flow of users, the application of focus groups and the observations of user behavior can help on several issues in the development of designs for the imaging centers of diagnosis and are used to manage the quality of this type of health environment.

Made available in DSpace on 2017-07-10T19:24:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese__fabiana.pdf: 3413093 bytes, checksum: 69eef866f8ca47e7714ae83768804879 (MD5) Previous issue date: 2016-02-02 / Understanding the spatial distribution knowledge regarding georeferenced data has been essencial to various areas including agriculture. Thus, several trials have been carried out. However, most of these studies assume that the underlying stochastic process is Gaussian. When the data associated with this process do not present normality, data transformations are applied. And though the use of these transformations has presented satisfactory results, it is important to consider models which take into account the characteristics of such phenomenon. It may be more appropriate than using a normal model. So, this trial aimed at proposing a spatial model based on the Birnbaum-Saunders distribution (BS). This distribution has been shown effective to model data that take positive values and whose behavior presents positive asymmetry and unimodality. Thefore, this trial has proposed a methodology that includes the formulation of the spatial Birnbaum-Saunders model , estimation of its parameters using maximum likelihood (ML), and application of diagnostic techniques which can detect the sensitivity of the model to atypical data and evaluate the proposed model through a simulation study and studies using real data sets of agricultural engineering. These data were obtadined in a 167.35-ha commercial area for grain production, in Cascavel city, to validate the studied model. In the study with simulated data and large samples, estimation parameters and diagnostic analysis showed a good performance. According to the study with real data, calculations of AIC (Akaike s information criterion) and BIC (Bayesian information criterion) indexes, Bayes factor as well as Q-Q plots constrution have shown that the proposed model is appropriate to fit the obtained data. Influential cases were detected, and their removal from data set caused a considerable change in contour maps. It is therefore concluided that Birnbaum-Saunders spatial model is adequate to carry out studies with spatially correlated data. Is is also an alternative model to the normal model when the data set present positive asymmetrical distribution / O conhecimento da distribuição espacial de dados georrefenciados é de interesse de diversas áreas do conhecimento, incluindo a área agrícola. Neste sentido, diversos trabalhos já foram realizados; no entanto, a maioria destes trabalhos assumem que o processo estocástico subjacente é gaussiano. Quando os dados associados com este processo não apresentam normalidade, transformações de dados são usadas. E ainda que o uso dessas transformações tenha apresentado resultados satisfatórios, considerar modelos que levem em conta as características do fenômeno pode ser mais adequado do que a utilização do modelo normal. O objetivo deste trabalho é propor um modelo espacial baseado na distribuição Birnbaum-Saunders (BS). Esta distribuição tem se mostrado eficiente para modelar conjuntos de dados formados por valores estritamente positivos e cujo comportamento apresenta assimetria positiva e unimodalidade. A metodologia proposta neste trabalho inclui a formulação do modelo espacial Birnbaum-Saunders, a estimação de seus parâmetros utilizando o método de máxima verossimilhança (ML), a aplicação de técnicas de diagnóstico que permitem detectar a sensibilidade do modelo a dados atípicos, a avaliação do modelo proposto por um estudo de simulação e aplicação da metodologia desenvolvida em análise de dados reais da área agrícola. Os dados utilizados para validação do modelo estudado foram obtidos em uma área comercial de produção de grãos de 167,35 ha de Cascavel. No estudo com dados simulados, para amostras grandes, a estimação dos parâmetros e a análise de diagnóstico apresentaram boa performance. No estudo com dados reais, os cálculos dos índices AIC, BIC e fator Bayes bem como a construção de Q-Q plots mostraram que o modelo proposto é adequado para ajustar os dados. Casos influentes foram detectados e suas retiradas do conjunto de dados causaram uma mudança considerável nos mapas de contorno. Conclui-se portanto, que o modelo espacial Birnbaum-Saunders é adequado para realização de estudos com dados espacialmente correlacionados, e é um modelo alternativo ao modelo normal quando o conjunto de dados apresenta distribuição assimétrica positiva