Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T01:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Queiroz_DianaAzevedo_M.pdf: 1675319 bytes, checksum: f069b324506d8cba908193d06299c754 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A compreensão das informações geradas pelos diversos Projetos Genoma já totalizados ou em andamento constitui-se em uma ferramenta essencial à pesquisa em biologia molecular. A identificação de genes diferencialmente expressos em estágios distintos de uma dada doença, por exemplo, constituirá um enorme avanço na determinação de sua fisiopatologia, fornecendo marcadores moleculares para seu prognóstico e possíveis alvos para a intervenção do processo. Dentre as moléstias humanas, o câncer constitui-se em um dos principais alvos de pesquisa em biologia molecular e clínica médica, basicamente porque envolve um quadro de reprogramação celular complexo e ainda pouco compreendido. Entre os vários tipos de cânceres, a leucemia linfóide aguda é bastante prevalente no Brasil, classificando-a como 8° lugar em número de casos e óbitos decorrentes. Buscando compreender as bases moleculares do câncer, o Projeto Genoma Humano do Câncer (LICR/ FAPESP) se destacou por ter gerado milhares de seqüências codantes do DNA de tecidos humanos normais e tumorais, possibilitando a descoberta de novos genes relacionados aos processos carcinogênicos. Assim, o presente estudo utilizou fragmentos produzidos durante o Projeto Genoma Humano do Câncer para investigar o perfil de expressão gênica em leucemias linfóides agudas através da técnica de microarranjos de DNA. Foram identificados como diferencialmente expressos os genes IgK VLJ (¿immunoglobulin kappa light chain VLJ region¿) e TPT1 (¿Tumor Protein , translationally-controlled 1¿), cuja expressão foi confirmada por ensaios de Northern blot / Abstract: The comprehension of data generated by many finished or in progress Genome Projects will provide essential informations to molecular biology research. The identification of differentially expressed genes in distinct stages of any given disease, for example, will permit an enormous advance in the determination of its physiopathology, identifying molecular markers for its prognostic and possible targets for the intervention of the process. Among human diseases, cancer consists in one of the main subjects of research in clinical and molecular biology, basically because involves a complex and poorly understood process of cellular reprogramming. Among the cancer subtypes, acute lymphoblastic leukemia is prevalent in Brazil, ranked in 8th position in number of clinical cases and decorrent deaths. Attempting to increase the understanding of cancer molecular bases, Human Cancer Genome Project (LICR/ FAPESP) had detached by generation of thousand of expressed sequences of normal and tumoral human tissues, increasing the possibility of discovery of novel genes related to carcinogenic processes. Thus, the present work employed the Human Cancer Genome Project fragments to investigate the global gene expression profile in acute lymphoblastic leukemia by DNA microarrays technique. It was identified the genes of IgK VLJ (imunoglobulina kappa light chain VLJ region) e TPT1 (Tumor Protein, ananslationally-controlled 1), which differential expression was confirmed by Northern blot assays / Mestrado / Bioquimica / Mestre em Biologia Funcional e Molecular

Orientador: Adilson Nascimento de Jesus / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação Fisica / Made available in DSpace on 2018-08-03T14:59:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Monis_FatimaCristina_M.pdf: 5008271 bytes, checksum: dd78a774f45ce9ffaa188526feb2cd2a (MD5) Previous issue date: 2003 / Mestrado

Orientador: Wagner Wey Moreira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação Fisica / Made available in DSpace on 2018-07-20T18:07:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Porto_ElineTerezaRozante_M.pdf: 6147547 bytes, checksum: e9e20ba89183f6e133a182d8ccea40f7 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: O foco central deste estudo é desvelar se as mensagens corporais transmitidas pelos alunos da pré-escola, durante as atividades físicas, são percebidas e interpretadas pelo professor. A revisão de literatura está centrada nas discussões sobre o corpo e a sua potencialidade de comunicação nas relações com o mundo; a criança se relacionando com o professor, com as outras crianças e com o ambiente pré-escolar; e também, alguns aspectos sobre a situação da pré-escola, nos dias de hoje, onde a Educação Física faz parte desse contexto. A pesquisa é de ordem qualitativa, sob a abordagem fenomenológica, onde o instrumento utilizado para a coleta dos dados foi a observação descritiva, em quatro escolas da Rede Oficial de Ensino de Campinas, em classes de alunos pré-escolares. Os resultados analisados através das análises ideográfica e nomotética, posssibilitaram a compreensão do fenômeno investigado, revelando maior convergência para os aspectos que envolvem, diretamente, a didática do professor interferindo no processo ensino-aprendizagem. São eles: o corpo e sua fala; as relações intersubjetivas; o processo educativo e a ludicidade, e os aspectos motivacionais nas atividades físicas / Abstract: The main point of this research is to find out if the corporal messages transmitted by the kindergarten children, during their physical activities, are notticed and interpreted by the teacher. The literature revision is centralized in the discussions about the body and its communication potenciality in its relationship with the world: the relationship between the child and the teacher, the child with the other children and, the child and the kindergarten enviromnment. It is also taken in consideration some aspects about the kindergarten situation nowadays where physical Education is a part of this activities. The research is qualificative, under a phenomenological approach, where the instrumental used for the data assessment was the descriptive observation, in four different schools of the Official School Network of Campinas, in kindergarten classes. The analysis of the results throught the ideographical and nomotetical theories allows the comprehension of the phenomenon investigated, showing a higher convergence of the aspects directly involving, the teacher didatic interfering on the teaching ¿ learning process. They are: the body and its speech; the intersubjective relations, the educational process and its ludicrousness; and the motivational aspects in the physical activities / Mestrado / Mestre em Educação Física

Orientador: Maria Ines Fini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação Fisica / Made available in DSpace on 2018-07-16T00:05:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jesus_AdilsonNascimentode_M.pdf: 5701702 bytes, checksum: 1bf21b1f0759b80ae785e4095e7fcbbf (MD5) Previous issue date: 1992 / Resumo: A dissertação Vivencias Corporais: Proposta de Trabalho de Auto-Conscientização, trata da elaboração, desenvolvimento e aplicação sob a forma de pesquisa, de um trabalho que se desdobra em si mesma, através de propostas de vivências, pelas quais possam desenvolver a consciência sobre seu próprio corpo, sob a perspectiva de sua motricidade, que é a manifestação de sua própria existência. Este trabalho foi desenvolvido através de uma pesquisa qualitativa de sua motricidade que é a manifestação de sua própria existência. Este trabalho foi desenvolvido através de uma pesquisa qualitativa de analise de depoimentos dos sujeitos, de acordo com a metodologia desenvolvida e descrita no livro Análise de Conteúdo de Laurence Bardin, 1970, norteada pela seguinte questão pela seguinte questão: ¿Quais foram as mudanças corporais que você percebeu em si mesmo durante a realização das vivências ?¿, buscando desvelar qual o caminho percorrido pelo sujeito afim de desenvolver sua auto-conscientização. Junto a isto, no capitulo ¿Da vivencia como consciência¿. Tratamos do desenvolvimento do termo ¿Vivencia Corporal¿, associado aos termos correlatos: ¿Consciência¿, ¿Percepção¿ e ¿Tomada de Consciência¿. Em seguida, no capitulo ¿Metáforas que constroem o gesto¿, tratamos da criação, da necessidade e do uso de metáforas, como imagens que sugerem algo, como forma de capítulo ¿Da imitação¿, tratamos do processo de imitação como um compreendido como um ato de descoberta da própria expressividade, direcionada para a auto-percepção e afirmação da individualidade pelo gesto ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Body Experiences: A proposal of a self-awareness work is a research envolving an elaboration , development and application methodology to estimulate people to search their own seaf perdeption and self awareness under the ¿motricidade ¿ perspective. The qualitative method based on speech analysis was used according to Laurence Bardin, Contain Analysis¿ book, 1970. The question asked all the subject that guied the research was : ¿What kind of changes of the body have you perceived in yourself during the movement experiences:¿ Though the speech analysis technique the researcher tried to figure out the way by wich the person used to develop his self-awareness. The chapter on ¿Experiences as Awareness¿ was discussed the terms experiences of the body related to the terms ¿awareness¿, ¿perception¿ and ¿self-awarenenss¿. In the chapter on use the metaphors as images to represent the experiences of the body. The chapter on ¿Imitation¿ is about the imitational process as cultural element that inluences our expressions. Through the speech analysis it was detect that the subjects perceved the following changes during the body experiences work develop in this thesis: changes in physical structures posture of the changes in the aligment of the segments, better re-dimenson ofmovement and psychological factors ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Mestre em Educação Física

Orientador: Daniel Guariz Pinheiro / Resumo: O conjunto de microrganismos que vivem junto das plantas é chamado de microbioma ou fitomicrobioma, e exerce diversos papéis conjuntamente com seu hospedeiro inclusive para a manutenção da saúde conjunta, considerando que co-evoluíram juntos, como um holobionte e, portanto, podem ter desenvolvido mecanismos de adaptação mútua. No presente trabalho, exploramos a diversidade do microbioma de cana-de-açúcar pela mineração de dados de RNA-Seq: realizamos atribuição taxonômica às sequências daqueles organismos que foram sequenciados conjuntamente com as plantas, mas que não foram analisados em nenhum ponto. Dados de 15 acessos do SRA contendo 246 bibliotecas foram obtidos, totalizando 841 Gigabases. As leituras dessas bibliotecas foram processadas, montadas em sequências a fim de reconstruir as moléculas de RNA e passaram por processo de atribuição taxonômica com o Kraken2 usando um banco de referência expandido personalizado, gerando uma contagem de organismos por biblioteca, sendo que os \textit{taxa} microbianos foram quantificados a partir da identificação de 09 milhões de leituras correspondentes. Como prova de conceito do método, validamos diversas observações que já existiam sobre a diversidade do microbioma da cana-de-açúcar. Revelamos que em todas as plantas, há uma presença quase ubíqua de bactérias Gammaproteobacteria, especialmente Pseudomonas e Xanthomonas e de fungos Ascomycota. Além disso, que a diversidade é alterada pela natureza do estresse na planta, hídrico ou ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The set of microorganisms that live under the influence of its host is called microbiome or in case of plants, phytomicrobiome, and they play various roles alongside their host including in maintaining the health of the pair, considering that they co-evolved together as a holobiont and thus may developed mechanisms of mutual adaptation. In the present work, we explored the diversity of the sugarcane microbiome by mining RNA-Seq data: we performed taxonomic assignment to RNA sequences of those organisms that were sequenced together with the plants but were not analyzed at any point. As proof-of-concept, we were able to validate several known observations of the sugarcane microbiome. We revealed that in all plants there is an almost ubiquitous presence of Gammaproteobacteria, especially Pseudomonas and Xanthomonas and fungi Ascomycota. In addition, that diversity is altered the stress implied on the sugarcane plant, be it abiotic (drought) or biological (infection), and that the major modulators in the community are mostly the plant compartment and the type of stress involved. We also observed a set of original organisms negatively and positively correlated with smut disease, caused by Sporisorium scitamineum, potentially antagonistic to the disease agent. Additionally, we detected differentially abundant phytomicrobiome activity between treatments, including those in which plant-induced infection was performed. Finally, virus sequences were assembled, and we were able to retri... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Ana Maria Centola Vidal / Banca: Karina Paes Bürger / Banca: Mirele Daiana Poleti / Resumo: Bacillus cereus sensu stricto (s.s.) tem o potencial de produzir toxinas gastrointestinais, resistir a condições adversas, como tratamentos térmicos e pasteurização; produzir enzimas e formar biofilmes, causando diversos surtos ao redor do mundo relacionados com a sua presença em alimentos contaminados. Entretanto, não é bem elucidado o dano que o tratamento térmico causa à esta bactéria e à sua expressão gênica. Assim, o objetivo deste estudo foi verificar se a pasteurização e o armazenamento em refrigeração ao longo da shelf-life seriam capazes de influenciar a expressão dos genes relacionados com a produção de toxinas diarreicas, proteases e à formação de biofilmes em leite experimentalmente contaminado com B. cereus s.s.. Trinta litros de leite cru foram tindalizados e experimentalmente contaminados com aproximadamente 108 UFC.mL-1 de B. cereus s.s. SAMN07414939 (Bio Project PRJNA390851). Uma amostra foi coletada logo após a contaminação (LTC - T0) e então o leite foi pasteurizado e envasado em embalagens de polietileno com 1L de capacidade (LCP - T1, T2 e T3) e mantido em refrigeração até o momento das análises. Posteriormente, a extração de RNA total das amostras foi realizada, seguido pelo cDNA e qPCR utilizando os genes plcr, hblA, hblC, hblD, nheA, nheB, nheC, cytk e npr para avaliação da expressão gênica. A expressão dos genes se manteve ao longo de toda a shelf-life, sem diferença estatística significativa entre os momentos avaliados para os genes plcr, hblA, hblC,... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bacillus cereus sensu stricto (s.s.) has the potential to produce gastrointestinal toxins, resists to adverse conditions, such as heat-treatment and pasteurization; the ability to form biofilms and produce enzymes, causing several outbreaks worldwide related to its presence in contaminated food. However, it is not well elucidated what damage the pasteurization causes to this bacterium and its gene expression. Thus, the aim of this study was to verify if pasteurization and storage during shelf-life in refrigeration were able to influence the expression of genes related to the production of diarrheal toxins, proteases and biofilm formation in milk experimentally contaminated with B. cereus s.s. Thirty liters of raw milk were sterilized by tyndallization and experimentally contaminated with 108 vegetative cells of B. cereus s.s. SAMN07414939 (Bio Project PRJNA390851). A sample was collected right after contamination (LTC - 0h); then the milk was pasteurized and then packed in 1 L capacity polyethylene bags and samples LCP - T1, T2 and T3 were collected. Posteriorly, the total RNA were extracted from the samples and the cDNA and qPCR were performed using the primers plcr, hblA, hblC, hblD, nheA, nheB, nheC, cytk and npr for gene expression quantification. The gene expression was maintained along the shelf-life, without significant statistical difference between the moments evaluates for the plcr, hblA, hblC, hblD, nheA, nheB, nheC, cytk and npr gene expression, which persisted wi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A raiva é uma antropozoonose e causa a morte de 55 mil pessoas anualmente no mundo. Neste trabalho foi utilizado um sistema genético derivado do Vírus da Floresta de Semliki (SFV) carregando RNA para expressão gênica da glicoproteína do vírus da raiva (RVGP) e da proteína verde fluorescente (GFP), a título de controle do experimento. Lotes de partículas virais de SFV-RVGP e SFV-GFP foram obtidos em células BHK-21 e quantificados através de qRT-PCR. Foram realizados ensaios de infecção tanto com vírus ativado e não ativado em duas linhagens de macrófagos murinos IC-21 e J774A-1. A expressão da proteína RVGP foi avaliada pelo teste de Imunofluorescência Indireta (IFI) e a expressão da proteína GFP analisada por Microscopia de Fluorescência e Citometria de Fluxo em ambas as linhagens. A entrada do vírus SFV em células de mamíferos ocorre após 2 horas da infeção e de acordo com o experimento no qual analisamos a titulação viral do sobrenadante celular, indicaram que até as 72 horas pós infecção a titulação viral se manteve com o mesmo valor inicial, sugerindo que não houve entrada dos vírus na célula por transdução ou por fagocitose. / Rabies is a anthropozoonosis and causes the death of 55,000 people worldwide each year. In this work we used a genetic system derived from the Semliki forest virus (SFV) carrying RNA for gene expression of the rabies virus glycoprotein (RVGP) and green fluorescent protein (GFP), by way of experiment control. Plots of viral particles of SFV-RVGP and SFV-GFP were obtained in BHK-21 cells and quantified by qRT-PCR. Infection assays were performed both with activated and not activated in two virus strains of murine macrophages IC-21 and J774A-1. The expression of RVGP protein was assessed by indirect immunofluorescence test (IFI) and the expression of GFP protein analyzed by fluorescence microscopy and flow cytometry in both strains. The SFV entry of viruses into mammalian cells occurs after 2 hours of infection and according to the experiment in which we analyzed the viral titer of the cell supernatant showed that by 72 hours post-infection viral titer remained at the same initial value, suggesting no entry of virus into the cell by transduction or by phagocytosis.

Tanto os androgênios quanto os estrogênios possuem um papel significativo na próstata e são indispensáveis para o crescimento normal prostático. A enzima aromatase catalisa a reação de conversão de androgênios para estrogênios. O papel dos estrogênios e seus receptores na etiologia e progressão do câncer de próstata (CaP) e da hiperplasia prostática benigna (HPB) é muito pouco compreendido. Objetivo: Analisar a expressão do mRNA dos receptores de estrogênio ER , ER 2, ER 5 e da enzima aromatase. Analisar a expressão protéica do ER e ER nos grupos CaP e HPB. Métodos: Tecidos prostáticos oriundos de câncer de próstata e de hiperplasia prostática benigna foram submetidos à extração de RNA total com o reagente Trizol, o RNA foi reversamente transcrito para cDNA e avaliado usando RT-PCR para a expressão dos receptores de estrogênio , 2, 5 e aromatase. A expressão protéica de ER e ER foi analisada por Western blot. Resultados: Comparações entre os tecidos hiperplásico e de carcinoma indicaram uma maior expressão do mRNA ER (P<0,001) e da proteína (P<0,038) em amostras de câncer comparada a HPB. A expressão do mRNA do ER 5 foi significativamente aumentada nos tecidos hiperplásicos comparada ao grupo câncer. A expressão do mRNA do ER 2 e da aromatase não foi diferente entre os grupos HPB e CaP. Nossos resultados também mostraram que a expressão protéica do ER não foi diferente entre os grupos HPB e CaP. Conclusões: O presente estudo indicou que a expressão protéica e gênica do ER e a expressão gênica do ER 5 são diferentes entre os grupos sugerindo que o aumento dos níveis do ER no CaP e do mRNA ER 5 na HPB pode ser importante na progressão das doenças prostáticas. / Both androgens and estrogens play a significant role in the prostate and are critical for normal prostate growth. The aromatase enzyme catalyzes the reaction to conversion of androgens to estrogens. The role of estrogen and its receptors in the etiology and progression of prostate cancer (PCa) and benign prostatic hyperplasia (BPH) is poorly understood. Objective: The purpose of this study was to evaluate the estrogen receptors ER , 2, 5 and aromatase enzyme mRNA expression and to investigate also the ER and ER protein expression in groups PCa and BPH. Method: Total RNA of prostate cancer and benign prostatic hyperplasia tissues was extracted from each sample by the Trizol method and cDNA was performed. ER , ER 2, ER 5 estrogen receptors and aromatase gene expression were quantified by RT-PCR. ER and ER protein expression was evaluated by Western blot. Results: Comparisons of the hyperplastic and tumor prostate tissues indicated an overexpression of ER mRNA (P<0,001) and protein (P<0,038) in tumor specimens. The mRNA expression of ER 5 was significantly increased in hyperplastic tissues compared to tumor group. The mRNA expression of ER 2 and aromatase was not different between BPH and PCa groups. Our results also showed that the protein expression of ER was not different between BPH and PCa groups. Conclusions: The present study indicated that gene and protein expression ER and gene expression ER 5 are different between the groups suggesting that the ER increased levels in PCa and mRNA ER 5 in BPH may be important in progression of prostate diseases.

Tanto os androgênios quanto os estrogênios possuem um papel significativo na próstata e são indispensáveis para o crescimento normal prostático. A enzima aromatase catalisa a reação de conversão de androgênios para estrogênios. O papel dos estrogênios e seus receptores na etiologia e progressão do câncer de próstata (CaP) e da hiperplasia prostática benigna (HPB) é muito pouco compreendido. Objetivo: Analisar a expressão do mRNA dos receptores de estrogênio ER , ER 2, ER 5 e da enzima aromatase. Analisar a expressão protéica do ER e ER nos grupos CaP e HPB. Métodos: Tecidos prostáticos oriundos de câncer de próstata e de hiperplasia prostática benigna foram submetidos à extração de RNA total com o reagente Trizol, o RNA foi reversamente transcrito para cDNA e avaliado usando RT-PCR para a expressão dos receptores de estrogênio , 2, 5 e aromatase. A expressão protéica de ER e ER foi analisada por Western blot. Resultados: Comparações entre os tecidos hiperplásico e de carcinoma indicaram uma maior expressão do mRNA ER (P<0,001) e da proteína (P<0,038) em amostras de câncer comparada a HPB. A expressão do mRNA do ER 5 foi significativamente aumentada nos tecidos hiperplásicos comparada ao grupo câncer. A expressão do mRNA do ER 2 e da aromatase não foi diferente entre os grupos HPB e CaP. Nossos resultados também mostraram que a expressão protéica do ER não foi diferente entre os grupos HPB e CaP. Conclusões: O presente estudo indicou que a expressão protéica e gênica do ER e a expressão gênica do ER 5 são diferentes entre os grupos sugerindo que o aumento dos níveis do ER no CaP e do mRNA ER 5 na HPB pode ser importante na progressão das doenças prostáticas. / Both androgens and estrogens play a significant role in the prostate and are critical for normal prostate growth. The aromatase enzyme catalyzes the reaction to conversion of androgens to estrogens. The role of estrogen and its receptors in the etiology and progression of prostate cancer (PCa) and benign prostatic hyperplasia (BPH) is poorly understood. Objective: The purpose of this study was to evaluate the estrogen receptors ER , 2, 5 and aromatase enzyme mRNA expression and to investigate also the ER and ER protein expression in groups PCa and BPH. Method: Total RNA of prostate cancer and benign prostatic hyperplasia tissues was extracted from each sample by the Trizol method and cDNA was performed. ER , ER 2, ER 5 estrogen receptors and aromatase gene expression were quantified by RT-PCR. ER and ER protein expression was evaluated by Western blot. Results: Comparisons of the hyperplastic and tumor prostate tissues indicated an overexpression of ER mRNA (P<0,001) and protein (P<0,038) in tumor specimens. The mRNA expression of ER 5 was significantly increased in hyperplastic tissues compared to tumor group. The mRNA expression of ER 2 and aromatase was not different between BPH and PCa groups. Our results also showed that the protein expression of ER was not different between BPH and PCa groups. Conclusions: The present study indicated that gene and protein expression ER and gene expression ER 5 are different between the groups suggesting that the ER increased levels in PCa and mRNA ER 5 in BPH may be important in progression of prostate diseases.

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