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Virus do mosaico angular do feijoeiro : purificação, peso molecular da proteina e utraestrutura dos tecidos infectados

Gaspar, Jose Osmar 28 May 1987 (has links)
Orientador : Alvaro Santos Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T04:57:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gaspar_JoseOsmar_D.pdf: 3808807 bytes, checksum: 7cd95060b1651d03a8be7925b6402fc2 (MD5) Previous issue date: 1987 / Resumo: As particulas do virus do mosaico angular do feijoeiro (VMAF) são alongadas, ligeiramente flexiveis ,com comprimento normal de 650 nm e 13 nm de diâmetro. Em células infectadas de feijoeiro Jalo e soja, o VMAF ocorre como feixes de particulas paralelas ou, de maneira caracteristica, na forma de feixes de particulas onde estas apresentam-se presas em uma extremidade do feixe e sol tas na outra. Aqui, elas se curvam tornando-se falcadas. O VMAF apresenta sua capa envol tória constituida de um só tipo de proteina de peso molecular 32600 D e uma concentração de ácido nucleico ao redor de 7'/0.Baseado na similaridade da morfologia, comprimento normal da particula, presença de feixes de particulas falcadas, peso molecular proteina da capa, contéudo de ácido nucleico, além de dados da anteriormente conhecidos de patologia e serologia, é concluido-que o.VMAF' é idêntico ao virus do mosqueado fraco do caupi (VMAC), descrito em outras partes do mundo. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The particles of bean angular mosaic virus (BAMV) are filamentous and slightly flexuous with 650 nm in normal length and 13 nm in diameter. In Jalo bean and soybean infected cells, the BAMV occeurs in bundles of falcate particles or, more rarely, parallel particles. The BAMV contains a single protein (M. Wt. 32,600) and 7% of nucleic acid. Particle morphology, its oceurrenee in falcate bundles, protein molecular weight, and nucleic acid content, besides pathological and serological characteristics indicate that bean angular mosaic virus and cowpea mild mottle virus (CpMMV) , are the same virus. The presence of falcate bundles in infected tissues alone is considered of diagnostic value for BAMV and CpMMV infections. ... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Doutor em Ciências Biológicas
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Begomovirus evolution in the New World: Genetic variability of populations and its effect on speciation / Evolução de begomovírus no Novo Mundo: Variabilidade genética de populações e seu efeito na especiação

Ramos Sobrinho, Roberto 26 February 2014 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-09T13:25:54Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5304872 bytes, checksum: c7e0a87885d9d7ca4c2ef6d55611b704 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-09T13:25:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5304872 bytes, checksum: c7e0a87885d9d7ca4c2ef6d55611b704 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Vírus pertencentes à família Geminiviridae possuem genoma circular de fita simples e infectam uma ampla gama de hospedeiros causando perdas significativas, principalmente em países tropicais e subtropicais. A família é dividida em sete gêneros (Begomovirus, Becurtovirus, Curtovirus, Eragrovirus, Mastrevirus, Topocuvirus e Turncurtovirus) de acordo com o tipo de inseto vetor, gama de hospedeiros, organização genômica e filogenia. Begomovírus são transmitidos por mosca-branca e causam epidemias em culturas economicamente importantes em todo o mundo. Plantas silvestres/não-cultivadas possuem um papel epidemiológico importante, agindo como reservatórios de begomovírus e como hospedeiros promíscuos onde recombinação pode ocorrer. Além disso, resultados anteriores sugerem que populações de begomovírus presentes em plantas não-cultivadas possuem maior variabilidade genética do que aquelas presentes em plantas cultivadas. A maioria dos begomovírus do Novo Mundo (NM) possuem dois componentes genômicos denominados DNA-A e DNA-B, e seu genoma tem a capacidade de evoluir rapidamente via mutação, pseudo-recombinação e recombinação. Neste contexto, este trabalho objetivou: (i) avaliar o efeito do hospedeiro na variabilidade genética de populações de begomovírus; e (ii) estudar o efeito de recombinação na evolução de begomovírus no Novo Mundo. Para o primeiro objetivo, duas plantas leguminosas cultivadas (feijão-comum, Phaseolus vulgaris, e fava, P. lunatus) e uma não-cultivada (Macroptilium lathyroides) foram intensamente amostradas em duas regiões no Brasil entre 2005 e 2012. Um total de 212 genomas (DNA-A) foram clonados e sequenciados, e populações dos begomovírus Bean golden mosaic virus (BGMV) e Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) foram obtidas a partir dos três hospedeiros. Os resultados indicam que a variabilidade genética presumida dos hospedeiros não afetou a variabilidade viral. O MaYSV (N = 99) apresentou maior variabilidade genética que o BGMV (N = 147), com a população de BGMV (porém não de MaYSV) estruturada por hospedeiro e região geográfica. Para o segundo objetivo, conjuntos de dados incluindo todas as sequências- referência de DNA-A e DNA-B de begomovírus do NM foram obtidas do GenBank. As análises indicaram que begomovírus sul-americanos não exibem monofilia geográfica, com evidência de pelo menos dois eventos independentes de introdução nesta região. Recombinação foi detectada como um importante mecanismo evolutivo agindo sobre a evolução do DNA-A. Encontrou-se evidência de elevada variabilidade genética em begomovírus presentes na América Central e Caribe, e em menor grau em begomovírus na América do Sul (AS). Novos eventos de introdução podem acelerar a evolução desses patógenos na AS, favorecendo a recombinação e aumentando a adaptabilidade e/ou a virulência dos begomovírus nativos. / Viruses belonging to the family Geminiviridae have circular ssDNA genomes and infect a broad range of plant species causing devastating diseases, mainly in subtropical and tropical countries. The family is divided into seven genera (Begomovirus, Becurtovirus, Curtovirus, Eragrovirus, Mastrevirus, Topocuvirus and Turncurtovirus) according to the type of insect vector, host range, genome organization and phylogeny. Begomoviruses are whitefly- transmitted and are among the most damaging pathogens causing epidemics in economically important crops worldwide. Wild/non-cultivated plants play a crucial epidemiological role, acting as begomovirus reservoirs and as "mixing vessels" where recombination can occur. Furthermore, previous results suggest that begomovirus populations in non-cultivated hosts are more genetically variable then those infecting cultivated hosts. Most New World (NW) begomoviruses have two genomic components designated as DNA-A and DNA-B, and their genomes have the capacity to evolve quickly via mutation, reassortment and recombination. In this context, this work aimed: (i) to assess the effect of the host on the standing genetic variability of begomovirus populations; and (ii) to study the effect of recombination on the evolution of New World begomoviruses. For the first objective, cultivated (common bean, Phaseolus vulgaris, and lima bean, P. lunatus) and non-cultivated (Macroptilium lathyroides) legume hosts were intensively sampled from two regions across Brazil between 2005 and 2012. A total of 212 full-length DNA-A components were cloned and sequenced, and populations of the begomoviruses Bean golden mosaic virus (BGMV) and Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) were obtained from the three hosts. Our results indicate that the presumed genetic variability of the host did not affect viral variability. MaYSV (N = 99) showed higher genetic variability than BGMV (N = 147), with the BGMV (but not the MaYSV) population being structured based on both host and geography. For the second objective, datasets including all DNA-A and DNA-B reference sequences of NW begomoviruses were obtained from GenBank. Our analyses indicate that South American begomoviruses do not exhibit geographic monophyly, with evidence of at least two independent introduction events in this region. Recombination was detected as a very important evolutionary mechanism acting on DNA-A evolution. We found evidence of greater genetic variability in begomoviruses from Central America and the Caribbean compared to South America (SA). Additional introduction events may impact the evolution of begomoviruses in SA by favoring recombination and introducing new virulence features to indigenous South American begomoviruses.
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Caracterização de um novo vírus de ssDNA infectando fruteiras de clima temperado, e aspectos da interação molecular begomovírus-hospedeiro / Characterization of a new ssDNA virus infecting temperate fruit trees, and molecular aspects of the begomovirus-host interaction

Basso, Marcos Fernando 27 February 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-19T07:31:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 6452406 bytes, checksum: 11a9270502dc083faeefb66ee407bd7f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-19T07:31:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 6452406 bytes, checksum: 11a9270502dc083faeefb66ee407bd7f (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Fruteiras de clima temperado são de grande importância econômica mundial e são suscetíveis a diversos patógenos transmissíveis por insetos ou nematoides. Seu caráter perene e a propagação vegetativa resultam no aparecimento de diversas doenças complexas, algumas das quais ainda etiologicamente desconhecidas. Em pomares e vinhedos brasileiros frequentemente são observados sintomas de possível origem viral, mas os agentes não foram identificados. Com o objetivo de prospectar agentes virais associados a estas culturas, 74 amostras de fruteiras foram coletadas em diferentes regiões produtoras e avaliadas por PCR e RCA. Um novo vírus altamente divergente, monossegmentado, com genoma de ssDNA circular de aproximadamente 3.400 nucleotídeos, apresentando características moleculares semelhantes às de vírus classificadas nas famílias Circo-, Nano- e Geminiviridae foi detectado em plantas de macieira, pereira e videira. A associação com os hospedeiros foi confirmada e sua infectividade comprovada por meio de inoculação com um clone correspondente ao genoma completo. A análise de sequências e suas características moleculares indicam que este novo vírus poderá pertencer a um novo gênero ou família viral. Os begomovírus (família Geminiviridae) são patógenos de grande importância econômica em diversas culturas, principalmente em regiões tropicais e subtropicais. Eles regulam, direta ou indiretamente, diversos mecanismos de defesa do hospedeiro, a exemplo da via dos pequenos RNAs (smRNAs), de forma a facilitar a infecção viral. O segundo objetivo deste trabalho foi avaliar o perfil de smRNAs em plantas de Nicotiana benthamiana infectadas pelo begomovírus Tomato yellow spot virus (ToYSV). Utilizando sequenciamento de nova geração, bibliotecas de smRNAs de plantas de N. benthamiana, sadias e infectadas com o ToYSV, foram sequenciadas a fim de investigar sua complexidade e compreender os mecanismos regulatórios envolvidos na patogênese. Os resultados indicam que os begomovírus são alvo das vias de silenciamento de RNA (VSR) nas etapas iniciais da infecção e que suas proteínas supressoras de silenciamento atuam in trans para interferir com as VSRs. O sucesso da infecção viral e a indução de sintomas estariam assim, ao menos em parte, correlacionados com a regulação negativa das VSRs, com a mudança do perfil de smRNAs e com a regulação da expressão de diversos genes do hospedeiro que transcrevem mRNAs e miRNAs. A proteína de movimento (MP) dos begomovírus bissegmentados é responsável pelo movimento célula-a-célula, indução de sintomas e na determinação da gama de hospedeiros. O terceiro objetivo deste trabalho foi identificar proteínas de hospedeiros do ToYSV candidatas a interagirem com a MP. Complexos proteicos provenientes de plantas expressando constitutiva- ou transientemente NTAPi-MP foram purificados, seguido de identificação por espectrometria de massas. Entretanto, não foi possível encontrar proteínas que interagissem com MP do ToYSV. Ensaios de pull-down com a proteína MP fusionada a uma etiqueta de seis histidinas (6His-MP) identificaram 64 proteínas da planta candidatas a interagirem com a MP. Destas, 25 foram selecionadas para avaliação da interação pelo sistema duplo-híbrido em levedura, contudo, os resultados foram negativos para todas as 25 proteínas. / Temperate fruit trees are of great economical importance worldwide and are susceptible to several insect or nematode-transmitted pathogens. Their perennial nature and vegetative mode of propagation result in the appearance of several complex diseases, some of which are aetiologically undetermined. In Brazilian orchards and vineyards, virus-like symptoms are often observed, but the causal agents have not been identified. With the objective of prospecting viral agents associated with these plants, 74 fruit tree samples were collected at different regions and evaluated by PCR and RCA. A novel, highly divergent virus with a monopartite circular ssDNA genome of approximately 3400 nucleotides, with molecular characteristics similar to viruses in the Circo-, Nano- and Geminiviridae families was identified in apple, pear tree and grapevine plants. Its association with the hosts was confirmed and its infectivity was proven by inoculation with a full-length genomic clone. Sequence analysis and molecular characteristics indicate that this novel virus will be classified in a new viral genus or family. Begomoviruses (Geminiviridae family) cause diseases of major economic importance in many crops, especially in tropical and subtropical regions. They regulate, directly or indirectly, several host defense mechanisms such as small RNA (smRNA) pathways so as to facilitate viral infection. The second objective of this work was to evaluate the profile of smRNAs in Nicotiana benthamiana plants infected by the begomovirus Tomato yellow spot virus (ToYSV). Using Next Generation Sequencing approaches, we sequenced smRNA libraries from healthy or ToYSV-infected N. benthamiana plants to understand their complexity and to explore the regulatory mechanisms involved in pathogenesis. The results indicate that begomoviruses are targets of RNA silencing pathways (RSP) early in the infection and that their silencing suppressor proteins act in trans to interfere with RSP. The success of viral infection and the appearance of ToYSV-induced symptoms may be correlated, at least in part, with RSP downregulation, smRNA profile change and regulation of expression of several host genes (mRNA- and miRNA-transcribing). The movement protein (MP) of bipartite begomoviruses is responsible for cell-to-cell movement, symptom induction and determination of host range. The third objective of this work was to identify host proteins that interact with the ToYSV MP. Protein complexes were purified from plants expressing NTAPi-MP either constitutively or transiently, followed by mass spectrometry-based identification. However, no candidate host proteins were identified. Pull-down assays using the MP with a six histidine tag (6His-MP) identified 64 candidate proteins, 25 of which were selected for evaluation of the interaction using the yeast two- hybrid system. However, results were negative for all 25 proteins.
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Efeito de dois virus sobre pepino e tomate : estudos atraves de eletroforese e de ressonancia magnetica nuclear

Gouvea, Cibele Marli Cação Paiva 18 July 2018 (has links)
Orientadores : Candido Pereira Pinto Ricardo, Avelino Rodrigues de Oliveira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-18T20:47:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gouvea_CibeleMarliCacaoPaiva_D.pdf: 6464931 bytes, checksum: e3c55e63e6a09d2433e994255bc6ac09 (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: Foram analisadas alterações nos padrões de proteínas e compostos de fósforo e carbono em folhas de pepino e tomate infectadas pelos vírus do mosaico amarelo da abobrinha-de-moita (VMAA) e do mosaico do pepino (VMP), através de eletroforese e ressonância magnética nuclear (RMN). As extrações de proteínas foram feitas 48 h e aos 5,10, 15 e 20 dias após a inoculação dos vírus. Foi detectado aparecimento de proteína com PM 39.000 Da na fração microssomal de pepino com VMAA e de tomate com VMP. Foi observado que a infecção de pepino e tomate por TMV não induz aparecimento dessa proteína na fração microssomal. A metodologia utilizada para caracterização parcial revelou que a proteína de PM 39.000 Da não é glicosilada, é uma proteína periférica das membranas microssomais, não está presente no fluido intercelular e na parede celular. A eletroforese bidimensional mostrou que a proteína acumulada em pepino e tomate possui a mesma carga elétrica e o mesmo número de isoformas. Assim, é possível que esta seja uma proteína relacionada ao processo de patogênese (proteína PR) e seu aparecimento reflete alterações no metabolismo da planta hospedeira. Foi ainda observado aumento de atividade peroxidásica nas plantas infectadas. Através dos estudos de RMN foi observado acúmulo de sacarose, diminuição de açúcares fosfato e aumento de fosfato inorgânico nas folhas infectadas. Isto indica uma provável alteração no metabolismo de carboidratos, devido à infecção virótica. Foi, ainda, detectado aumento de glicolato em pepino infectado sugerindo uma possível interferência do processo infeccioso sobre a atividade de oxigenase da ribulose 1,5 bisfosfato carboxilase-oxigenase. Nos tomateiros infectados foi observado aumento de compostos aromáticos / Abstract: The changes in the leaf protein pattern, phosphorus and carbon coumpounds from cucumber and tomato infected with zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) and cucumber mosaic virus (CMV) were analysed by gel electrophoresis and nuclear magnetic resonance (NMR). The leaf proteins were extracted 48 hr and 5, 10, 15 and 20 days after virus inoculation. A MW 39,000 Da protein was induced in the microsomal fraction from cucumber infected with ZVMV and tomato with CMV. The partial characterization of the MW 39,000 Da revealed that it was not glycoprotein, but a peripheral protein from microsomal membranes and not present in the intercellular fluid and cell wall. The bidimensional electrophoresis analysis revealed the same characteristics of the protein induced in both infected plants. Thus, is possible that the protein is a pathogenesis related (PR protein) and its accumulation in infected plants reflects changes in host plant metabolism. The NMR studies showed sucrose accumulation, sugar phosphate decrease and inorganic phosphate increase. These findings indicate a probable change in host plant carbohydrate metabolism. An increase was observed in glycolate level in infected cucumber. It suggests a change on Rubisco oxigenase activity. An increase was detected in aromatic compounds in infected tomato plants / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Ciências
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Caracterização de Phaeomoniella chlamydospora de videiras do Brasil /

Marraschi, Renata. January 2019 (has links)
Orientador: Edson Luiz Furtado / Coorientador: César Júnior Bueno / Banca: Marco Antinio Tecchio / Banca: Adriana Zanin Kronka / Banca: Margarida Fumiko Ito / Banca: Ivan Herman Fischer / Resumo: Phaeomoniella chlamydospora é considerado o fungo mais agressivo do complexo de patógenos, responsáveis por causar a doença de Petri em videira. Esse trabalho teve como objetivo caracterizar patologicamente, morfoculturalmente e molecularmente, uma população com 57 isolados de P. chlamydospora, oriundos de videiras de sete estados brasileiros. Todos os isolados foram molecularmente identificados como pertencentes à espécie P. chlamydospora, através da amplificação da região ITS e de partes do gene da beta tubulina (β Tubulin). Essa espécie já foi descrita ocorrendo nos estados de São Paulo, Pernambuco e Rio Grande do Sul. O presente estudo relata pela primeira vez a ocorrência deste fungo em videiras nos estados do Paraná, Santa Catarina, Minas Gerais e Mato Grosso. Posterior aos estudos moleculares, realizaram-se os seguintes ensaios: caracterização cultural dos isolados em meio de cultura BDA (batata dextrose ágar) e MEA (extrato de malte); caracterização morfológica de conídios, conidióforos e clamidósporos em meio de cultura MEA e SNA (sintético nutriente ágar); crescimento dos isolados em temperaturas de 5, 10, 15, 20, 25, 30 e 35ºC por 42 dias em meio BDA; e teste de patogenicidade em videiras 'Niágara Rosada' (incidência e agressividade). A análise de cultura identificou quatro características de colônia. Dessas, a mais comumente observada dentre os estados foi com o centro verde oliváceo com reentranças, e as bordas brancas de aspecto cremoso. A caracterização morfoló... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Phaeomoniella chlamydospora is considered the most aggressive of the pathogen complex responsible for causing a Petri disease in vines. The goal of this work was to illustrate, morphologically and molecularly, a population with 57 isolates of Phaeomoniella from vines of seven Brazilian states. All the isolates were identified as belonging to the P. chlamydosphora species through the amplification of its area and parts of beta tubulina gene (β Tubulin). This series has already been carried out in the states of São Paulo, Pernambuco and Rio Grande do Sul. This was first reported in Paraná, Santa Catarina, Minas Gerais and Mato Grosso. Later studies in the behavior of PDA (potato dextrose agar) and MEA (malt extract); morphological characterization of conidia, conidiophores and chlamydospores in the MEA and SNA culture medium (synthetic nutrient agar); growth of the substrates at temperatures of 5, 10, 15, 20, 25, 30 and 35 ° C for 42 days in PDA medium; and pathogenicity test on Niagara Rosada vines (incidence and aggressiveness). A culture analysis identified 4 colony characteristics. Among these, the most commonly included in the states was with the green olive center with reentrances, and as white edges of creamy aspect. The morphological featuring was different in growth of structures when grown in medium culture, while the greater development in MEA medium culture when the conidia and chlamydospores were evaluated; and with higher growth in medium SNA when compared to the conidiophores. The ideal temperature range for the development of the pathogen is between 20 to 25ºC, while the temperature of 5ºC. By exposing the isolates kept from 5 ° C to 25 ° C for 42 days, they presented a more significant growth compared to those grown directly at 25 ° C (fungistatic effect). All the isolates were pathogenic to the 'Niagara Rosada' vine. The isolates showed different reisolation and aggressiveness ... / Doutor
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Atividade antif?ngica de cepas de bact?rias l?ticas e extratos de abacaxi (Ananas comosus (L.) Merril) sobre Fusarium guttiforme Nirenberg & O?Donnell

Mam?dio, Ilana Maciel Paulo 27 March 2017 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2017-09-26T21:37:04Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o definitiva ILANA - revisada.pdf: 1964258 bytes, checksum: 73df2e7ec0b51bebe48619b3d272ec45 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-26T21:37:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o definitiva ILANA - revisada.pdf: 1964258 bytes, checksum: 73df2e7ec0b51bebe48619b3d272ec45 (MD5) Previous issue date: 2017-03-27 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB / Pineapple is a tropical fruit of great commercial value, Brazil is the second largest producer of pineapple in the world. The most produced variety in the country is the ?Perola?, followed by Smooth Cayenne and, both have a high degree of sus-ceptibility to fusariosis or pineapple gum disease, caused by the fungus Fusarium guttiforme.Once installed, this disease can reduce pineapple yield by up to 80%. Lactic bacteria (BAL) have their metabolic characteristics and the potential to inhibit bacterial and fungal growth, as well as to neutralize toxins produced by F. guttiforme.This work aimed to determine by in vitro tests the inhibitory effect of lactic acid bacteria on the etiologic agent of fusariosis. Qualitative and quantitative microbial inhibition tests were performed, comparing strains of lactic acid bacteria and crude pineapple extract against F. guttiforme isolates. Determination of mycotoxins in the fungal extracts of these isolates. The inhibitory effect of Lactobacillus plantarum Abx3 and Lactobacillus paracasei subsp.paracasei Abx5.2 was observed for isolateson F. guttiforme, the same did not occur with crude pineapple extract, and mycotoxin production was not detected in extracts of fungal isolates. The preliminary results of this work point out that lactic bacteria present potential to be used as a biocontrol product on F. guttiforme. / O abacaxi ? uma fruta tropical de grande valor comercial, sendo o Brasil o se-gundo maior produtor no mundo. A variedade mais produzida no pa?s ? a P?rola, seguida pela Smooth Cayenne, ambas possuem alto grau de suscetibilidade ? fusa-riose ou gomose do abacaxi, causada pelo fungo Fusarium guttiforme. Esta doen?a, uma vez instalada, pode reduzir em at? 80% a produ??o dos cultivares. As bact?rias l?ticas (BAL), devido as suas caracter?sticas metab?licas possuem potencial de inibir o crescimento bacteriano e f?ngico, bem como neutralizar toxinas produzidas por algunsmicro-organismos. Este trabalho teve como objetivodeterminar atrav?s de tes-tes ?in vitro? o efeito inibit?rio de bact?rias l?cticas sobre o agente etiol?gico da fusa-riose do abacaxi.Foram realizados ensaios qualitativo e quantitativode inibi??o mi-crobiana, confrontando cepas de bact?rias l?ticas e extrato bruto do abacaxifrente aisolados de F.guttiforme. Determinarse h? micotoxina nos extratos f?ngicos destes isolados. Constatou-se efeito inibit?rio do Lactobacillus plantarum Abx3 e Lactobacillus paracaseisubsp.paracasei Abx5.2 sobre os isolados de F. guttiforme. O mesmo n?o aconteceu com o extrato bruto de abacaxi, e n?o foi detectada a produ??o de micotoxina nos extratos dos isolados f?ngicos. Os resultados preliminares deste trabalho apontamque as bact?rias l?ticas apresentam potencial de serem utilizadas em formula??es de produto de biocontrolede F. guttiforme.
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Tectona grandis L.f. : patologia de frutos, patogenicidade e epidemiologia /

Delmadi, Leila Cristiane, 1974. January 2017 (has links)
Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Leo Zimback / Banca: Waldir Cintra de Jesus Junior / Banca: Willian Bucker Moraes / Banca: Anibal Alves de Carvalho Junior / Resumo: A espécie florestal Tectona grandis (Teca) é nativa do sudeste asiático, possui grande porte, rápido crescimento, produtora de madeira nobre e valorizada por sua beleza, resistência e durabilidade. No Brasil, surgiu como uma alternativa substituta a outras espécies, como o mogno (Swietenia macrophylla) e a cerejeira (Torresea acreana). A presente pesquisa teve como objetivo investigar a condição fitossanitária da teca em frutos e, testar a resistência de três diferentes clones à doenças fúngicas. Os objetivos específicos foram: i) avaliar frutos de teca de 3 procedências (Alta Floresta/MT, Cáceres/MT e Botucatu/SP) quanto a presença de patógenos; ii) testar a resistência de 3 clones (S0, S1 e S3) de T. grandis aos patógenos: Olivea tectonae, Fusarium oxysporum e Ceratocystis fimbriata em condições controladas; iii) elaborar uma escala diagramática com folhas adultas de T. grandis, para avaliação da ferrugem causada pelo fungo O. tectonae; iv) testar a resistência de 3 clones de teca (S0, S1 e S3) à doenças fúngicas em plantio de campo. Os experimentos foram conduzidos no Laboratório de Patologia Florestal - FCA/UNESP-Botucatu e também na Fazenda Experimental da UNESP em São Manoel/SP. Como resultados para o teste com frutos, obteve-se: Procedência Alta Floresta/MT, 13,33% de Aspergillus sp.; 3,33% de Colletotrichum sp. e Alternaria sp.; 1,66% de Septoria sp. e Penicillium sp.. Para os frutos procedentes de Cáceres/MT, 61,66% para o patógeno Fusarium sp., 8,33% com Penicillium... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The forest species Tectona grandis (Teak) is native to Southeast Asia, has large, rapidly growing producer of noble wood and valued for its beauty, strength and durability. In Brazil, it emerged as a replacement alternative to other species, such as mahogany (Swietenia macrophylla) and Cherry tree (Torresea acreana).The present research had as objective to investigate the phytosanitary condition of teak fruits and to test the resistance of three different clones to fungal diseases. The specific objectives were: i) to evaluate teak fruits from 3 provenances (Alta Floresta/MT, Cáceres/MT and Botucatu/SP) in the presence of pathogens; ii) to test the resistance of 3 clones (S0, S1 and S3) of T. grandis to pathogens: Olivea tectonae, Fusarium oxysporum and Ceratocystis fimbriata under controlled conditions; iii) to elaborate a diagrammatic scale with adult leaves of T. grandis, to evaluate the rust caused by the fungus O. tectonae; iv) to test the resistance of 3 teak clones (S0, S1 and S3) to fungal diseases in field planting. The experiments were conducted at the Laboratory of Forest Pathology - FCA/UNESP/Botucatu and also at the experimental farm of UNESP in São Manoel/SP. As results for the fruit test, we obtained: Provenance Alta Floresta/MT, 13.33% of Aspergillus sp.; 3.33% of Colletotrichum sp. and Alternaria sp.; 1.66% of Septoria sp. and Penicillium sp.. For fruits from Cáceres/MT, 61.66% for the pathogen Fusarium sp., 8.33% with Penicillium sp., 1.66% with Arthrosporium sp. and Cunninghamella sp. As for Botucatu/SP, 21.66% with Aspergillus sp., 23.33% with Alternaria sp., 8.33% with Fusarium sp., 10% with Penicillium sp., 5% for Nigrospora sp. and 3.33% with Ovularia and Humicola. The control under controlled conditions with fungus Olivea tectonae was carried out by spraying a suspension of spores in a concentration of 2,42 x 105 uredynopores/ml-1. It was observed that the latent period was ... / Doutor
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Frequência de hermafroditas e distribuição de tipos de acasalamento em populações de Fusarium verticillioides associadas ao milho em diferentes zonas climáticas do Brasil

GOMES, André Ângelo Medeiros 18 February 2013 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T12:29:16Z No. of bitstreams: 1 Andre Angelo Medeiros Gomes.pdf: 644128 bytes, checksum: cd67aaf23e82d52d2fc876105888dc75 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T12:29:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andre Angelo Medeiros Gomes.pdf: 644128 bytes, checksum: cd67aaf23e82d52d2fc876105888dc75 (MD5) Previous issue date: 2013-02-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Brazil is one of the biggest producers and consumers of maize (Zea mays L.) in the world and the fusariosis caused by F. verticillioides, on ears and or on stalk, is a recurrent problem when environmental conditions favor epidemics in the field or in storage. The present study aimed to characterize through crosses the F. verticillioides isolates from the three main climatic zones where maize is grown in Brazil. The fertility and effective population size were calculated from data generated by crossing field isolates with female fertile testers of F. verticillioides. For the entire population, 231 out of 300 isolates were cross-fertile with tester isolates. MAT-1 and MAT-2 idiomorphs of the fertile isolates segregated in a 105:126 rate. Female isolates (hermaphrodites) were 96 out of 231 fertile isolates, while 135 were male only isolates. The Ne(mt) was 99% of the count for the Brazilian population when the mating type idiomorphs were used as predictors in the estimative of the population size. But when this calculation was made on the basis of the female fertile isolates the Ne(f) was 83%. When the total population is divided into sub-populations representing climatic zones, the frequencies of female fertile isolates were 33 out of 80 fertile isolates from the Equatorial Tropical Zonal Climate (ETZC); 14 out of 78 fertile isolates from the Temperate Zonal Climate (TZC); and 49 out of 73 fertile isolates from the Tropical Central Brazil Zonal Climate (TCBZ). The effective population size expressed in percentage of the total number of individual in each population for the three populations represented by isolates from the ETZC, TZC and TCBZ were Ne(mt) = 99, 100, 97 and Ne(f) = 83, 52, 96 respectively. The Brazilian population of F. verticillioides shows high fertility and high effective population size, suggesting the possibility of frequent sexual reproduction in the field. Apparently there is a tendency of higher fertility in populations established at low latitudes, represented by the tropical climate. / O Brasil é um dos maiores produtores e consumidores de milho (Zea mays L.) do mundo e a fusariose, causada por Fusarium verticillioides, seja em espigas ou no colmo, é um problema recorrente quando condições ambientes favorecem o surgimento de epidemias no campo ou em armazenamento. O presente trabalho teve como objetivos caracterizar por meio de cruzamentos sexuais, isolados de F. verticillioides dos três principais climas zonais que se cultiva milho no Brasil. Através de cruzamentos de isolados do campo de F. verticillioides, com testadores de G. moniliformis; e determinar a taxa de fertilidade, frequência de hermafroditismo, e tamanho efetivo da população. Dos 300 isolados estudados, 231 tiveram cruzamento fértil. Os tipos de acasalamento MAT-1 e MAT-2 segregaram numa proporção 105:126. Entre os 231 isolados férteis, 96 se comportaram como hermafroditas e 135 como fêmeas estéreis. Na população total, do Brasil, levando em consideração o tipo de acasalamento, o tamanho efetivo da população Ne(mt), foi de 99% da população total, e tomando por base a frequência de hermafrodita , o tamanho efetivo Ne(f) foi de 83% da população total. Quando o número total de isolados é subdividido em três populações distintas, baseado nas condições de clima de local de coleta dos isolados, as frequências de hermafroditas foram; 33 hermafroditas dentre 80 isolados férteis do Clima Zonal Tropical Equatorial (ZTE), com 47 se comportando como fêmea estéril; 14 hermafroditas dentre 78 isolados férteis do Clima Zonal Temperado (ZT), com 64 se comportando como fêmea estéril; e 49 hermafroditas dentre 73 isolados do Clima Zonal Tropical Brasil Central (ZTBC), com apenas 24 se comportando como fêmea estéril. O tamanho efetivo das populações representadas por isolados dos climas ZTE, ZT e ZTBC, foram Ne(mt) = 99, 100, 97 e Ne(f) = 83, 52, 96 respectivamente, expresso em porcentagem do número total de indivíduos de cada população. A população brasileira de F. verticillioides analisada apresenta alto índice de fertilidade e tamanho efetivo, sugerindo a possibilidade de frequente reprodução sexuada no campo. Aparentemente, existe uma tendência de maior fertilidade da população em latitudes menores, representadas pelo clima tropical.
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Comportamento de variedades de cana-de-açúcar ao parasitismo de Meloidogyne incognita e M. enterolobii

SILVA, Arinaldo Pereira 29 February 2012 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T13:25:26Z No. of bitstreams: 1 Arinaldo Pereira da Silva.pdf: 466696 bytes, checksum: 29af3e3cc868a579886430ae6457c0e1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T13:25:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arinaldo Pereira da Silva.pdf: 466696 bytes, checksum: 29af3e3cc868a579886430ae6457c0e1 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The development of resistant varieties is one of the most important alternative for rot-knot management on sugarcane fields. The present work had as objective to evaluate the development of the sugarcane varieties RB92579, RB93509, RB867515 and SP81–3250 under different densities of M. incognita and M. enterolobii, as well the genotypes effect on nematode reproduction, under greenhouse. One month old plants had the soil infested with increasing inoculum densities (0, 5000, 10000 and 20000eggs and juveniles per plant), in a completely randomized design, with evaluations 90 days after. The RB varieties presented higher fresh shoots biomass weight than SP813250 when parasited by M. enterolobii. Meloidogyne enterolobii had the life cycle completed in RB863129, SP813250 and RB867515, in contrast to RB92579. In relation to M. incognita, RB92579 stood out presenting the highest height, stalk number, stalk diameter and fresh root biomass weight. RB863129 presented lower gall index than the other varieties and lower number of eggs per root than RB867515 and SP813250. SP813250 showed the lowest stalk diameter and number, the lowest number of shoot and fresh root biomass and the highest number of eggs per plant. Plant growth was not affect by inoculum density of M. incognita or M. enterolobii. Inversely to M. enterolobii, plants parasited by M. incognita presented gall index higher than 3 and high reproduction factors. No models fitted either M. incognita or M. enterolobii population density to evaluated variables. / O desenvolvimento de variedades resistentes constitui uma das principais alternativas para o manejo dos nematoides formadores de galhas em cana-de-açúcar. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o desenvolvimento das variedades, RB92-579, RB93-509, RB86-7515 e SP81–3250 sob diferentes densidades de M. incognita e M. enterolobii, e o efeito dos genótipos sobre a reprodução dos nematoides, em condições de casa de vegetação. Plantas com um mês de cultivo, tiveram o solo infestado com crescentes densidades de inoculo (0, 5000, 10000 e 20000 ovos e juvenis por planta) e foram avaliados ao 90 dias em delineamento inteiramente casualizado. As variedades RB apresentaram maior peso da biomassa fresca da parte aérea do que SP81-3250 quando parasitadas por M. enterolobii. RB86-3129, SP81-3250 e RB86-7515 garantiram o ciclo de vida de M. enterolobbi, enquanto que RB92579, não permitiu o seu completo desenvolvimento. Em relação a M. incognita, a variedade RB92-579 destacou-se das demais por apresentar significativamente maior altura do que RB86-3129 e RB86-7515, maior diâmetro do colmo que RB86-7515, maior número de colmos, número de perfilho e peso da biomassa fresca da parte aérea do que RB86-7515. RB86-3129 apresentou menor número e índice de galhas que as demais variedades e menor número de ovos por sistema radicular do que RB86-7515 e SP81-3250. SP81-3250 apresentou menor diâmetro e número de colmo, menor número de perfilho, menor biomassa fresca da raiz e maior número de ovos por planta. O desenvolvimento das plantas parasitadas por M. incognita ou M. enterolobii não foi afetado pela densidade de inoculo. No entanto, ao contrário de M. enterolobii, as plantas parasitadas por M. incognita apresentaram índices de galhas superiores a três e altos fatores de reprodução. Nenhum dos modelos testados descreveu significativamente as relações entre as variáveis analisadas e as densidades populacionais de M. incognita ou M. enterolobii.
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Supressividade de um solo a murcha-de-fusário do caupi e influência da doença no rendimento da cultura

ELOY, Arlinda Pereira 14 March 2003 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-21T12:45:37Z No. of bitstreams: 1 Arlinda Pereira Eloy.pdf: 539902 bytes, checksum: b58cec9ba237d600ff69b073b4bcf24c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T12:45:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arlinda Pereira Eloy.pdf: 539902 bytes, checksum: b58cec9ba237d600ff69b073b4bcf24c (MD5) Previous issue date: 2003-03-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum, reduces cowpea yield in Northeastern Brazil. This work aimed to characterize the nature and ability to transfer cowpea Fusarium wilt suppressiveness of a soil; to analyze populational dynamic of F. oxysporum f. sp. tracheiphilum and others soilborne microorganisms in two soils with different levels of suppressiveness, as well as to determine the relation of disease severity and the reductions of yield in cowpea seeds, in two plant seasons. In the nature and transfer of suppressiveness analyses the two soils samples used were previously classified as suppressive (CAC) and conducive (GOI) to cowpea Fusarium wilt, and did not slown indigenous populations of Fusarium oxysporum. When the samples were infested with the pathogen and sown with BR 17 Gurguéia (highly susceptible) and IPA 206 (moderately susceptible) cowpea cultivars, total populations of both fungi and bacteria, and Bacillus spp. were higherin rhizosphere of the suppressive soil samples than in the conducive ones. The suppressiveness was not related to a suppressive effect on the pathogen population. Soil sterilization did not change the suppressive capability, pointing out its abiotic origin. The ability suppressiveness transfer to a conducive soil was demonstrated only. In the suppressive soil, a significant influence of pH levels on Fusarium wilt severity was verified, which decreased in increasing pH. The inoculum density alone did not determine the severity of Fusarium wilt on plants cultivated in both soils, due to the influence of the efficiency of the inoculum, which was significantly lower in the suppressive soil. Aiming to determine the linkage of disease severity to the reduction of cowpea seed yield, cultivated during two different period of time, an essay was carried out using plots artificially infested with the pathogen. The first planting was made in April 2002, while the second one in October, in thesame year. At the harvest, yield for each plot was determined through the total weight of seed per plant. After harvesting the severity of Fusarium wilt was evaluated in all plants. There was no significant correlation between inoculum densities of the pathogen that was present in the soil before planting and the disease severity. The yield in the first planting period was higher than in the second one, in non-infested plots, what may have been due to the water stress to which the plants were submitted right before the blossom.Differences between the severity average levels and yield losses were not verified for both essays. Fusarium wilt severity ranged between 3.2 and 93.3%, while the yield losses ranged between 2.2 and 98.1%. / A murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum, é responsável por grandes reduções de rendimento na cultura do caupi no Nordeste brasileiro. O trabalho teve como objetivos caracterizar a natureza e a capacidade de transferência de supressividade de um solo à murcha-de-fusário do caupi, analisar a dinâmica populacional de F. oxysporum f. sp tracheiphilum e outros microrganismos em dois solos com diferentes níveis de supressividade, bem como determinar a relação entre a severidade da doença e as reduções no rendimento de sementes de caupi em duas épocas de cultivo. Na análise da natureza e transferência da supressividade foram utilizadas amostras de dois solos, classificados previamente como supressivo (CAC) e conducivo (GOI) à murcha-de-fusário do caupi, nos quais não foram detectadas populações autóctones de F. oxysporum. Quando os solos foram infestados com o patógeno e semeados com as cultivares de caupi BR 17Gurguéia (altamente suscetível) e IPA 206 (moderadamente suscetível), as populações de fungos totais, bactérias totais e Bacillus spp. foram maiores na rizosfera no solo supressivo que no conducivo. A supressividade à doença não foi relacionada com um efeito supressivo sobre a população do patógeno. A esterilização não alterou a capacidade supressiva do solo, indicando sua natureza abiótica, bem como foi comprovada a capacidade de transferência da supressividade para o solo conducivo. Somente no solo supressivo foi constatada influência significativa dos níveis de pH na severidade da murcha-de-fusário, que decresceu proporcionalmente à elevação do pH. A eficiência do inóculo do patógeno foi significativamente inferior no solo supressivo. A análise da relação entre a severidade da doença e as reduções no rendimento de sementes de caupi cultivado em duas épocas, foiconduzida em parcelas artificialmente infestadas com o patógeno, em dois períodos de cultivo, sendo o primeiro plantio realizado em abril de 2002 e o segundo em outubro do mesmo ano. Na fase de colheita de cada época de plantio, foi determinado o rendimento por parcela, representado pelo peso total de sementes por planta. Após a colheita, a severidade da murcha-de-fusário foi avaliada em todas as plantas. Não foram constatadas correlações significativas entre as densidades de inóculo do patógeno detectadas nas parcelas antes do plantio e os níveis de severidade da doença. Nas parcelas não infestadas pelo patógeno, o rendimento no primeiro plantio foi superior ao do segundo plantio, o que pode ter sido conseqüência do estresse hídrico a que as plantas foram submetidas na fase de pré-floração. As reduções no rendimento de sementes foram influenciadas significativamente pelos níveis de severidade da doença. Não foram constatadas diferenças entre os níveis médios de severidade da doença e de perdas de rendimento nos dois períodos de cultivo. A severidade da murcha-de-fusário variou entre 3,2 e 93,3%, enquanto as perdas de rendimento entre 2,2 e 98,1%.

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