Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TesePSRM.pdf: 2134848 bytes, checksum: f2e72b242b86b33b1b87eef088f5bfc2 (MD5) Previous issue date: 2003-06-02 / Universidade Federal de Minas Gerais / This study was accomplished in the northeastern area of the state of São Paulo, obtaining biological material of maned wolves for the epidemiology (parasitic diseases) and populacional genetic study. The occurrences of deaths were also verified and the relationships between the farmers and wolves were appraised. In the studies of parasitic diseases, infestations by ancilostomídeos, tricurídeos, estrongilídeos, ascarídeos, Dypilidium sp., coccídeos, Dioctophyme renale, ticks and fleas were detected. The inedited parasitosis occurrences by Hymenolepis sp and Prosthenorchis sp were verified. in the parasitoses, it was possible to detect hematological alterations of animals infected by ancilostomídeos, Hymenolepis sp., coccídeos and ticks. The populational genetic studies were accomplished with proteic markers, to evaluate the heterozygosity and the existence of populational structuring in the area. The polymorphysm degree (20%) verified in this study does not differ from the values that were verified by other authors in maned wolves and others wild canids populational studies. F statistics indicated that there were not significant reduction of the heterozygosity in the sample. This test also indicated that there was not a populacional structuring in the area, indicating that the Moji Guaçu and Pardo rivers were not characterized as a gene flow block to the species. In this area, three translocations to the interior of the Ecological Station of Jataí were verified. Also verified four death by road kill accident in the highways, one death by firegun and an occurrence of an sub-adult animal with strong dehydration and caquexis. The main problems associated with the conservation of the species, identified by the inhabitants relates of the area were the domestic avian predation, the access to the garbage and supertitions. The preservative actions discussed in the present work include the establishment of the parasitic monitoring program in wolves, promotion of critic attitudes in relation to the translocations, traffic signs in highways and implementation of environmental education programs involving adults and childrens resident in the area. / Este estudo foi realizado na região nordeste do estado de São Paulo, com a obtenção de material biológico de lobos guarás para o estudo de epidemiologia (doenças parasitárias) e genética populacional. Foram levantadas também as ocorrências de mortes e avaliadas as relações entre os moradores da área rural e a espécie. Nos estudos de doenças parasitárias, foram detectadas infestações por ancilostomídeos, tricurídeos, estrongilídeos, ascarídeos, Dypilidium sp., coccídeos, Dioctophyme renale, carrapatos e pulgas. Foram constatadas também ocorrências inéditas de parasitoses por Hymenolepis sp e Prosthenorchis sp. Entre as parasitoses, foi possível detectar alterações do quadro hemático de animais parasitados por ancilostomídeos, Hymenolepis sp., coccídeos e carrapatos. Os estudos de genética populacional foram realizados com marcadores protéicos, com o objetivo de avaliar a heterozigosidade e a existência de estruturação populacional na região. O grau de polimorfismo encontrado (20%) não difere muito dos valores encontrados por outros autores em estudos populacionais de lobos guarás e outros canídeos silvestres. A estatística F indicou que não há uma redução significativa da heterozigosidade na amostra. Este teste indicou também que não há uma estruturação populacional na região, indicando que os rios Moji Guaçu e Pardo não se caracterizaram como bloqueadores do fluxo gênico para a espécie. Nesta região foram constatados 3 translocamentos para o interior da Estação Ecológica de Jataí, 4 atropelamentos em estradas, uma morte por arma de fogo e uma ocorrência de uma animal sub-adulto em avançado estado de desidratação e caquexia. Os principais problemas relacionados com a conservação da espécie, relatados pelos moradores da região, foram a predação de aves domésticas, o acesso ao lixo e crendices populares. Entre as ações conservativas discutidas no presente trabalho está a implantação de medidas de monitoramento da carga parasitária na espécie, a promoção de atitudes mais criteriosas em relação aos translocamentos, a sinalização das estradas e a implementação de programas de educação ambiental, envolvendo adultos e crianças residentes na região.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:30:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6093.pdf: 4286116 bytes, checksum: 90a1a56ecb255a1ab9fec51056b77336 (MD5) Previous issue date: 2014-04-01 / Financiadora de Estudos e Projetos / brasiliensis (CUVIER, 1816) is distributed in several basins of South America. Commonly known by dourado, is a large fish and economical and social importance for artisanal and sport fishing. Due to the necessity of conservation and the absence of knowledge about the genetic structure of Neotropical migratory fish, the present study aimed to infer about the mating system and population genetic parameters of S. brasiliensis from the upper and middle Uruguay River basin. Populations of adult individuals were sampled during two years in the reproductive and non-reproductive periods in the upper and middle river Uruguay. The larvae of this species were obtained from natural spawning in the upper Uruguay River basin. Genetic analyses were performed using microsatellite markers to infer parameters of genetic diversity, population structure and estimation of kinship. All populations evaluated in this study showed high levels of genetic diversity. For the first reproductive period four genetically distinct populations were identified, one corresponding to the beginning of breeding season, two to the intermediate period and one to the end of the spawning season. The populations analyzed during the non-reproductive period were genetically different between the two years of study. Both populations of reproductive and nonreproductive period did not reveal any isolation by distance in the downstream of HPP Itá area. No bottleneck effect was observed in the populations sampled in the region fragmented by hydroelectric dams; however, the populations under the influence of the dams presented small effective population sizes. The results revealed no genetic structure among populations situated upstream and downstream of the Hydroelectric Power Plant (HPP) Machadinho and a particular differentiation between populations sampled upstream and downstream the HPP Itá, due, probably, of the barrier resulting from the preexisting of geographical barrier in the Uruguay River, Augusto César Gorge. The analyses of kinship indicated that multiple males and females participated effectively during reproduction and spawning of S. brasiliensis evaluated in the environment. The findings of this study provide new insights into the mating system and mode of organization during the reproductive and non-reproductive period of S. brasiliensis. This information must be taken into account in decisions about fisheries management programs and in broodstock samplings and for restocking programs. / Salminus brasiliensis (CUVIER, 1816) está distribuído em diversas bacias hidrográficas da América do Sul. Conhecido popularmente como dourado, é uma espécie de grande porte e com importância econômica e social para a pesca artesanal e esportiva. Frente à necessidade de conservação biológica e a falta de conhecimento sobre a estrutura genética de peixes migradores Neotropicais, o presente estudo teve como objetivos inferir sobre o sistema de acasalamento e os parâmetros genéticos populacionais de S. brasiliensis da bacia do alto e médio rio Uruguai, Brasil. Populações de indivíduos adultos foram amostradas durante dois períodos reprodutivos e dois períodos nãoreprodutivos na bacia do alto e médio rio Uruguai, e larvas da espécie foram obtidas de uma desova natural na região do alto rio Uruguai. As análises para inferir parâmetros de diversidade genética, estrutura populacional e estimativa de parentesco foram realizadas por meio de marcadores microssatélites. Todas as populações avaliadas no presente estudo apresentaram elevados valores de diversidade genética. Para o primeiro período reprodutivo foram identificadas quatro populações estruturadas geneticamente, uma correspondendo ao início da temporada de reprodução, duas ao período intermediário e uma ao fim da estação de desova. As populações analisadas no período não-reprodutivo exibiram diferenciação entre os dois anos analisados. Tanto as populações correspondentes ao período reprodutivo quanto as do não-reprodutivo não exibiram isolamento por distância no trecho a jusante da UHE Itá. Não foi identificado gargalo populacional nas populações amostrais da região fragmentada por barragens, porém, as populações sob influência dos barramentos apresentaram pequenos tamanhos populacionais efetivos. Identificamos ausência de estruturação genética entre as populações amostrais situadas a jusante e a montante da Usina Hidrelétrica (UHE) Machadinho e diferenciação entre as populações amostrais a jusante e a montante da UHE Itá, decorrente, possivelmente, da barreira geográfica preexistente no rio Uruguai, conhecida como Estreito Augusto César Gorge. As análises de parentesco indicaram que múltiplos machos e fêmeas participaram efetivamente durante a reprodução e a desova de S. brasiliensis avaliada em ambiente natural. Os resultados do presente estudo constituem novas descobertas sobre o sistema de acasalamento e modo de organização durante o período reprodutivo e não-reprodutivo de S. brasiliensis. Essas informações devem ser levadas em consideração para tomadas de decisão sobre programas de manejo da pesca, para a amostragem de reprodutores para programas de repovoamento.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissEL.pdf: 2495028 bytes, checksum: d96355fb30280d38e4159c481dd3947d (MD5) Previous issue date: 2006-04-10 / Universidade Federal de Sao Carlos / The natural populations of the white shrimp Litopenaeus schmitti are being threatened by intensive fishing, habitat destruction and introduction of exotic culture species. This species presents characteristics related to its distribution and life cycle that may lead to the fine-scale structuring of its populations. The results obtained in the present work by biometric and microsatellite analysis indicated the existence of genetic and morphological structure between three populations sampled off the coast of the State of Rio Grande do Norte. This structuring was more pronounced for females than males, observing the significant differentiation between Diogo Lopes x Touros and Diogo Lopes x Baía Formosa. The factors responsible for this differentiation seem to be related to the habitat and life cycle of the shrimp and the ocean currents. No population was in the Hardy- Weinberg equilibrium, probably due to the significant heterozygote deficit (FIS=0,212, p<0,05). The assignment tests indicated a larger inflow of migrants in the Baía Formosa Diogo Lopes direction, a probable result of the Brazilian Northern Current and the Brazilian North Undercurrent. When the allelic richness and number of private alleles were compared, it was seen that Diogo Lopes and Touros presented similar and significantly larger values than those of Baía Formosa, corroborating the situation of the estuaries that influences each of these populations. The Mantel test did not show isolation by distance, indicating that the populational structure found is due to genetic and genotypic differences. The results obtained in the present work show for the first time that Brazilian shrimp populations may be genetically distinct even with small geographic distances, reinforcing the particular role of estuaries in the maintenance of this genetic diversity. / As populações naturais do camarão branco Litopenaeus schmitti estão sendo ameaçadas pela pesca intensiva, pela destruição de habitat e pela introdução de espécies exóticas de cultivo. Esta espécie apresenta características relacionadas à sua distribuição e ao seu ciclo de vida que podem levar à estruturação em escala fina de suas populações. Os resultados obtidos no presente trabalho a partir de análises biométricas e de marcadores microssatélites indicaram a existência de estruturação genética e morfológica entre três populações amostradas na costa do Rio Grande do Norte. Essa estruturação foi mais pronunciada para as fêmeas e entre as populações de Diogo Lopes x Touros e Diogo Lopes x Baía Formosa. Os fatores atribuídos a essa diferenciação parecem estar relacionados ao habitat, ao ciclo de vida e às correntes oceânicas. Todas as populações se encontraram fora do equilíbrio de Hardy-Weinberg, devido provavelmente ao significativo déficit de heterozigotos (FIS=0,212, p<0,05). Os testes de assignmet indicaram um maior aporte de migrantes na direção Baía Formosa Diogo Lopes, um provável resultado da influência da Corrente Norte do Brasil e da Subcorrente Norte do Brasil. Quando se comparou a riqueza alélica e o número de alelos privados, foi verificado que Diogo Lopes e Touros apresentaram valores similares e significativamente superiores aos de Baía Formosa, dados condizentes com a situação dos estuários que influenciam cada uma dessas populações. O teste de Mantel não apontou isolamento pela distância, indicando que a estrutura populacional encontrada se deve às diferenças gênicas e genotípicas. Os resultados obtidos no presente trabalho mostraram pela primeira vez que as populações de camarões da costa brasileira podem ser genética e morfometricamente distintas mesmo entre curtas distâncias geográficas, reforçando o papel particular dos estuários na manutenção dessa diversidade genética.

Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-10-06T19:46:13Z No. of bitstreams: 1 TeseEAM.pdf: 2624367 bytes, checksum: 6fb400538bb8550750bc360ce1db0a37 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T13:52:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseEAM.pdf: 2624367 bytes, checksum: 6fb400538bb8550750bc360ce1db0a37 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T13:52:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseEAM.pdf: 2624367 bytes, checksum: 6fb400538bb8550750bc360ce1db0a37 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T13:52:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseEAM.pdf: 2624367 bytes, checksum: 6fb400538bb8550750bc360ce1db0a37 (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Partamona rustica is a stingless bee endemic to dry forests in Brazil. Despite its importance as a pollinator and its occurrence in endangered areas, such as the Caatinga (scrubland forest) and Cerrado (savanna) biomes, its natural history, biogeography, population genetics and evolutionary history are poorly known. This PhD Dissertation is presented in four chapters addressing specific aims to reduce the gaps in knowledge regarding P. rustica. In Chapter I, aspects of the natural history of this bee were investigated. The results revealed that P. rustica occurs from the northern portion of the state of Minas Gerais to the southern portion of the state of Bahia in the Caatinga and Cerrado biomes, contouring the plateaus and hills of Chapada Diamantina by the east. It is a floral visitor of at least 62 kinds of plant and its nests are built in arboreal termite nests constructed by Constrictotermes cyphergaster. In Chapter II, the hypothesis was tested that populations of stingless bees, such as P. rustica and Partamona helleri, have a high degree of differentiation when analyzed for mitochondrial genes due to the fact that the occupation of a site is performed by a small number of founding females. Therefore, each occupation event may exhibit a founder effect. The results revealed few haplotypes per population as well as a high degree of genetic differentiation, which supports the hypothesis. Implications for future studies were also indicated, such as the need to change the current focus of studies related to the genetic structure of bee populations, which usually estimate the degree of inter-population differentiation, to x estimates of genetic relatedness among queens, workers and males who founded the colonies of a given population. In Chapter III, the genetic relatedness among workers of P. rustica was estimated to evaluate the role of males in dispersal and gene flow among colonies and populations. The results revealed a low degree of average genetic relatedness among workers of colonies from the same locality and even lower relatedness among workers of colonies from different localities, suggesting that, although the areas analyzed were occupied by few females, dispersal promoted by males reduces relatedness and, consequently, the risk of inbreeding, which is harmful to hymenopterans due to their complementary sex determination system (locus csd). In Chapter IV, we used an integrative approach to reconstruct the evolutionary history of P. rustica in a spatiotemporal framework. The results identified two groups: one to the west and the other to the east of the São Francisco River Valley, which putatively diverged during the late Pleistocene, and indicated the western group as ancestral to the eastern group. The results also indicate that the inferences from both the analysis of genetic data and spatial distribution modelling are compatible with a history of populations of a constant size. The data presented in this thesis can be used to guide conservation and management strategies concerning the species as well as the Caatinga and Cerrado biomes, broaden knowledge on the biology and genetics of stingless bees, which can be useful in beekeeping and bee management, as well as reinforce the need for more detailed investigations into Pleistocene climate changes and the effects on the diversification of the endemic biota in Neotropical dry forests, especially studies involving the considerable diversity of bees in this region. / Partamona rustica é uma abelha sem ferrão endêmica de florestas secas do Brasil. Apesar da sua importância como polinizadora e da sua localização em áreas ameaçadas, como a Caatinga e o Cerrado, pouco se sabe a respeito da sua história natural, biogeografia, genética de suas populações, bem como da sua história evolutiva. Esta tese é apresentada em quatro capítulos, os quais apresentam objetivos específicos que visam reduzir estas lacunas em nosso conhecimento acerca de P. rustica. No Capítulo I, buscou-se investigar alguns aspectos da história natural de P. rustica. Os resultados revelaram que o principal substrato de nidificação utilizado pela espécie são termiteiros da espécie Constrictotermes cyphergaster, que P. rustica é visitante floral de pelo menos 62 tipos de plantas, e se ditribui em áreas de Caatinga e Cerrado entre o norte de Minas Gerais e o sudoeste da Bahia, contornando a Chapada Diamantina. No Capítulo II foram utilizadas as espécies P. rustica e Partamona helleri como modelos para testar a hipótese de que, nas abelhas sem ferrão, a ocupação de uma determinada área é realizada por um número reduzido de fêmeas fundadoras; desta forma, cada evento de ocupação pode, eventualmente, apresentar as condições de efeito fundador. Os resultados deste estudo revelaram um ou poucos haplótipos por localidade e elevada diferenciação entre as populações analisadas, dados que suportaram a hipótese testada. Além disto, foram apontadas algumas implicações para os futuros estudos, dentre elas, a necessidade de mudança do foco atual dos estudos relacionados à estrutura genética das viii populações de abelhas, os quais, via de regra, apenas estimam o nível de diferenciação interpopulacional, para estimativas das relações genéticas entre rainhas e machos que fundaram as colônias de uma dada população. No Capítulo III foi estimado o parentesco genético entre operárias de P. rustica, buscando avaliar o papel dos machos na dispersão e fluxo gênico entre colônias e populações. Os resultados mostraram baixos índices de parentesco genético médio entre operárias de colônias da mesma localidade e parentesco ainda menor entre operárias de colônias de diferentes localidades, sugerindo que apesar da ocupação das áreas analisadas ter se dado por poucas fêmeas, a dispersão promovida pelos machos reduz o parentesco e, consequentemente, o risco de acasalamentos endogâmicos, nocivos para os himenópteros, devidos ao sistema de determinação complementar do sexo (csd). No Capítulo IV foi utilizada uma abordagem integrada para reconstruir a história evolutiva de P. rustica num contexto espaçotemporal. Os resultados apontaram para a formação de dois grupos (grupo leste e oeste), separados pelo Vale do Rio São Francisco, que apresentaram divergência datada ao final do Pleistoceno. Os resultados ainda indicaram o grupo oeste como sendo ancestral ao grupo leste. Ademais, tanto os resultados das análises genéticas quanto da paleomodelagem são compatíveis com uma história de populações de tamanho constante. Os dados apresentados nesta tese poderão ser utilizados para nortear estratégias de conservação e manejo da espécie, bem como dos biomas Caatinga e Cerrado; ampliam o conhecimento acerca da biologia e da genética das abelhas sem ferrão, podendo ser úteis na criação racional destas abelhas e reforça-se a necessidade de novas e mais detalhadas investigações sobre as mudanças climáticas Pleistocênicas e seus efeitos na diversificação da biota endêmica das florestas secas da região Neotropical, principalmente, novos estudos envolvendo a grande diversidade de abelhas existente nesta região.

Submitted by MARÍLIA FREITAS DE VASCONCELOS MELO null (mariliafvm@yahoo.com.br) on 2017-01-30T15:23:39Z No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_novas_normas_Marília.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-03T11:57:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 melo_mfv_dr_bot.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-03T11:57:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 melo_mfv_dr_bot.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) Previous issue date: 2016-12-15 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Estudos sobre ecologia e genética de populações são fundamentais para entender os efeitos da fragmentação sobre espécies florestais. Um estudo baseado em genética quantitativa e marcadores microssatélites foi realizado para investigar a diversidade genética, estrutura genética espacial, sistema de reprodução e a dispersão de pólen em uma população natural e em um teste de progênies de Genipa americana L. para fins de conservação e melhoramento genético. As coletas foram realizadas em duas populações: a primeira localizada no nordeste do Brasil, em uma área de transição entre a Mata Atlântica e a Caatinga (POP-SE) e a segunda no sudeste, em um Banco Ativo de Germoplasma estabelecido em área de transição entre a Mata Atlântica representada pela Florestal Estacional Semidecidual e o Cerrado (POP-SP). Foram coletados tecidos foliares de 30 árvores matrizes e 20 plantas/progênie em cada uma das populações. As análises do sistema de reprodução foram realizadas com base no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. Como esperado em espécies dióicas, todas as progênies foram originadas de cruzamento (tm = 1). A taxa de cruzamento entre parentes (tm – ts) e a correlação de paternidade (rp) foram variáveis entre famílias (tm – ts= 0,03-0,19; rp= 0,04-0,40). O índice de fixação (F) foi significativamente menor em adultos que em progênies, indicando seleção contra indivíduos endogâmicos. A correlação de paternidade dentro de frutos (0,40) foi maior que entre frutos (0,26), indicando um menor número efetivo de doadores de pólen (Nep) dentro de frutos (2,5) que entre frutos (3,8). Devido a maior rp na POP-SE, o tamanho efetivo dentro de famílias nesta população foi menor (2,69) que na POP-SP (3,27). O coeficiente de correlação de Spearman mostrou que o aumento no Nep aumenta a diversidade genética e o Ne dentro de famílias. O padrão de dispersão de pólen foi fortemente leptocúrtico, sugerindo dispersão de pólen a longa distância (média = 179 m). Os resultados evidenciam a variabilidade genética entre os indivíduos e indicam a potencialidade dos mesmos para a conservação in situ, coleta de sementes para formação de bancos de germoplasma, bem como para a recuperação de áreas degradadas e futuros programas de melhoramento genético em áreas de transição entre diferentes biomas. / Studies about ecology and population genetics are essential to understand the effects of fragmentation on forest species. A study based on quantitative genetics and microsatellite markers was conducted to investigate the genetic diversity, spatial genetic structure, mating system and pollen dispersal in a natural population and onan progenies test of Genipa americana L. aiming conservation and breeding. Samples were collected in two populations: the first located in the northeast of Brazil, in a transition area between the Atlantic Forest and Caatinga (POP-SE) and the second in the southeast, in an Active Germplasm Bank established in area transition between the Atlantic represented by Forest Semideciduous and the Cerrado (POPSP). Leaf tissues were collected from 30 seed-trees and 20 plants/progeny in each of the populations. The analysis of the mating system were performed based on the mixed mating model and correlated crosses model. As expected in dioecious species, all offspring were originated from outcrossing ( m t = 1). The mating among relatives rate ( m s t t ) and paternity correlation ( p r ) were variable among families ( m s t t = 0.03-0.19; p r = 0.04-0.40), especially in NP. Fixation index ( F ) was generally significant lower in the adults than offspring, indicating selection against inbreed individuals. The paternity correlation within fruits (0.40) was higher than among fruits (0.26), indicating that lower effective number of pollen donors ( ep N ) within fruit (2.5) than among fruits (3.8). Due to the highest p r in NP, the effective size within families ( e N ) was lower in NP (2.69) than PT (3.27). The Spearman ranking correlation showed that the increase in ep N increase the genetic diversity and e N within families. The pollen dispersal pattern was strongly leptokurtic, suggesting long pollen dispersal distance (mean= 179 m). The results show the genetic variability among individuals and indicate the suitability of the same for conservation in-situ, seed collection for genebanks in training, as well as the recovery of degraded areas and future programs of breeding in transition areas between different biomes. / FAPESP: 13/19444-6

Submitted by João De Deus Vidal Júnior (jd.vidal27@gmail.com) on 2018-05-09T20:11:53Z No. of bitstreams: 1 Tese_Rauvolfia_fevereiro.docx: 18767443 bytes, checksum: fc0f2b02da8b3988cbb195215ad93e3c (MD5) / Rejected by Sulamita Selma C Colnago null (sulamita@btu.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 1: Seu arquivo está em Word. O arquivo deve estar obrigatoriamente em formato PDF para submissão no Repositório. Assim que efetuar essa correção, submeta o arquivo em PDF novamente. Agradecemos a compreensão. on 2018-05-11T17:00:35Z (GMT) / Submitted by João De Deus Vidal Júnior (jd.vidal27@gmail.com) on 2018-05-11T18:26:13Z No. of bitstreams: 1 Tese_JVidal.pdf: 12476337 bytes, checksum: b4bd90a360a05a2358c8c188653a9128 (MD5) / Approved for entry into archive by Sulamita Selma C Colnago null (sulamita@btu.unesp.br) on 2018-05-11T19:39:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vidaljr_jd_dr_bot.pdf: 12476337 bytes, checksum: b4bd90a360a05a2358c8c188653a9128 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-11T19:39:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vidaljr_jd_dr_bot.pdf: 12476337 bytes, checksum: b4bd90a360a05a2358c8c188653a9128 (MD5) Previous issue date: 2018-03-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Neste estudo, nós desenvolvemos marcadores moleculares e aplicamos abordagens integrativas em filogeografia e ecologia para investigar e descrever a história biogeográfica das chapadas da região oeste do Cerrado brasileiro. Utilizando como modelo duas espécies do gênero Rauvolfia L. (Apocynaceae, Rauvolfioideae), Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. e Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv., típicas destes ambientes, nós desenvolvemos um conjunto de marcadores nucleares microssatélites e sequenciamos espaçadores de cloroplasto, com os quais estimamos métricas de diversidade genética e estruturação populacional. A partir destes dados, nós reconstruímos relações filogenéticas entre as linhagens, estimamos tempos de divergência e realizamos simulações demográficas e modelos de distribuição, com o intuito de testar possíveis cenários biogeográficos. Em sequência, nós desenvolvemos modelos de distribuição potencial em escala de comunidade e análises espaciais, para estimar o impacto relativo das flutuações climáticas do Pleistoceno sobre o endemismo no Cerrado, quando comparadas a outros processos. Os resultados estão apresentados em três capítulos. No primeiro, intitulado “Development and cross-validation of microsatellite markers for Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. (Apocynaceae) species complex”, nós descrevemos o desenvolvimento de uma biblioteca de microssatélites específica para R. weddelliana e testamos sua transferabilidade para a espécie R. gracilis. Nós isolamos dez marcadores transferíveis, com alto conteúdo de polimorfismos que podem agora ser aplicados em estudos genéticos para o grupo, e também demonstramos a diploidia das espécies através do padrão de bandas de cada lócus. No segundo capítulo, intitulado “Phylogeography and paleodistribution of Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv. (Apocynaceae)”, nós aplicamos estes marcadores em conjunto com espaçadores de cloroplasto para testar, através de análises demográficas e modelos de nicho, os impactos das flutuações climáticas nas populações de R. weddelliana e R. gracilis. Nossas análises recuperaram duas linhagens com origem anterior ao Pleistoceno, coincidindo com o soerguimento do Planalto Central Brasileiro, que sofreram retração interglacial durante o Pleistoceno. Apesar de nossos modelos de distribuição terem apresentado resultado contrário a retração interglacial, eles recuperaram a mesma divergência norte-sul, também anterior ao último eventos de glaciação. Estes resultados sugerem que as savanas dos planaltos do oeste do Cerrado provavelmente configuram refúgios interglaciais. No terceiro capítulo, nós testamos este padrão, descrevendo a estabilidade relativa de chapadas e vales e modelando as distribuições potenciais de espécies típicas destes ambientes. Este trabalho contribui para a discussão sobre os impactos do clima do Pleistoceno e dos processos geológicos do Mioceno na diversificação do complexo domínio dos Cerrados. / In this study, we developed molecular markers and applied integrative approaches in phylogeography and ecology to investigate and describe the biogeographic history of the plateaus of the west region of the Cerrado in Brazil. Using as models two species of the genus Rauvolfia L. (Apocynaceae, Rauvolfioideae), Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv., typical from these habits, we developed a set of nuclear microsatellite markers and sequenced chloroplast spacers, which we used to estimate metrics of genetic diversity and population structure. From this data, we reconstructed phylogenetic relationships between lineages, estimated divergence times and conducted demographic simulations and distribution models, intending to test possible biogeographic scenarios. In sequence, we also developed community wise models of potential distribution and conducted spatial analysis to estimate the relative impact of climatic shifts of the Pleistocene on the endemism of the Cerrado, when compared to other processes. Our results are presented in three chapters. In the first, entitled “Development and cross-validation of microsatellite markers for Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. (Apocynaceae) species complex”, we describe the development of a specific microsatellite library to R. weddelliana and tested its transferability to the species R. gracilis . We isolated ten transferable markers with high polymorphism content that may now be applied to genetics studies on the group, and also demonstrated the diploidy for these species though the patterns of bands for each locus. In the second chapter, entitled “Phylogeography and paleodistribution of Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv. (Apocynaceae)”, we applied these markers, along with sequences of chloroplast spacers to test, with demographic analysis and niche models, the impacts of the climatic fluctuations on the populations of R. weddelliana and R. gracilis . Our analysis recovered two lineages with origin prior to Pleistocene, coinciding with the Brazilian Central Plateau uplift. These lineages underwent interglacial retractions along the Pleistocene. Despite distribution models presented results that are contrary to the interglacial retraction, they recovered the same north-south divergence, also predating the Last Glacial Maximum. These results suggest that the savannas in the plateaus of the western Cerrado are potentially configuring interglacial refugia. In the third chapter, we tested this pattern, by describing the relative stability of plateaus and valleys and modelling the potential distributions of species typical from these environments. This study contributes to the discussions about the impacts of the Pleistocene climate and the geological processes of the Miocene on the diversification the complex Cerrado domain.

CAPES / Para traçar estratégias visando a conservação e uso dos recursos genéticos de espécies arbóreas, como a jaboticabeira, é essencial se fazer a caracterização. Na região Sudoeste do Paraná existem fragmentos florestais contendo jaboticabeiras nativas (Plinia cauliflora), com variabilidade e potencialidade para pomares comerciais ou programas de melhoramento genético. Como a diversidade genética representa o potencial de uma população para produzir diferentes genótipos, poder-se-ia iniciar tal caracterização em um destes fragmentos. O objetivo foi caracterizar frutos de jaboticabeiras (P. caulifora) de fragmento florestal mantido em Clevelândia-PR, quanto a presença de variabilidade fenotípica, buscando-se identificar aquelas denominadas superiores para seleção como futuro cultivar ou genitor masculino, bem como, estimar a divergência genética entre eles, como ferramenta complementar. Além disso, verificar a regeneração e os padrões de distribuição espacial da espécie. Para a realização do estudo foi delimitada parcela de um hectare (10.000 m²), com todos os indivíduos identificados, mapeados, com sistema local de coordenadas, e mensurada altura e diâmetro. Foram caracterizados frutos quanto as características sensoriais e bioquímicas, em dois anos, 70 genótipos em 2013 e 56 em 2014; destes, 33 genótipos nos dois anos. Como critério de pre-seleção foi adotada a escolha de 20% dos genótipos que apresentaram a maior frequência de superioridade nas características avaliadas dos frutos. Foi analisada a divergência genética entre 33 genótipos por ano. O padrão de distribuição e associação espacial foi avaliado pela função K de Ripley. Pela primeira vez classificou-se os estágios ontogenéticos de jaboticabeira, segundo a altura da planta em: plântulas (0,01 a 0,99 m), juvenis (1,0 a 4,99 m), imaturos (> 5,0 m, não reprodutivos), adultos (reprodutivos) em ambiente florestal. Também foi descrita pela primeira vez a ocorrência natural de plântulas justapostas, indicando a poliembrionia. O número de regenerantes identificados na população (plântulas: n = 2163; juvenis: n = 330; imaturos: n = 59) foi muito maior que o número de adultos (n = 132). A espécie apresentou estrutura de tamanho em padrão J-invertido, com alta concentração de regenerantes. A distribuição da regeneração ocorre por padrão agregado e há dependência das plântulas em relação aos adultos, devido dispersão das sementes à curtas distâncias e emergência de plântulas próximo às matrizes. A regeneração de jaboticabeira é suficiente para manter a espécie em longo prazo nesta população, a qual pode servir como referência do sucesso de regeneração para outros estudos desta importante espécie frutífera da Floresta Ombrófila Mista. Foram préselecionadas as jaboticabeiras 7, 42, 43, 47, 54, 91, 97, 104, 105, 118, 134, 153, 154, 157, 163, 169, 177, 186, 212, J7-01 e J7-02, sendo a 16 e 194 as únicas que já podem ser selecionadas pelas características de superioridade entre ambos ciclos. Recomenda-se a realização de hibridação entre os genótipos 79 e 119 e, 96 com 148. A qualidade das frutas analisadas demonstrou potencialidade para uso como dupla finalidade servindo tanto para mercado in natura ou processamento. / To design strategies for the conservation and use of genetic resources of tree species such as jaboticaba tree, it is essential to make the characterization. In southwestern Paraná region, there are several forest fragments containing native jaboticaba tree (Plinia cauliflora), whose materials have broad potential for commercial orchards or breeding programs. As is the potential genetic diversity of a population to produce different genotypes, it would be able to start in such a characterization one of these fragments. The aim was to characterize fruits of jaboticaba tree (P. caulifora) of forest fragment kept in Clevelândia - PR for the presence of phenotypic variability, seeking to identify those superiors named for future selection as farming or male parent, as well as estimate genetic divergence between them, as a complementary tool for this purpose. Also, verify the regeneration and spatial distribution of the species. For the study was defined portion of a hectare (10.000 m²), with all individuals identified, mapped, with local coordinate system, and measured height and diameter. Fruits were characterized by sensory and biochemical characteristics in two years, 70 genotypes at 2013 and 56 at 2014, and of these 33 genotypes in both years. As a pre-selection criteria was adopted the choice of 20% of the genotypes that showed the highest frequency of superiority in the evaluated characteristics of the fruit. Genetic divergence among 33 genotypes per year was analyzed. The distribution pattern and spatial association was evaluated by Ripley's K function. It was classified for the first time the following ontogenetic stages of jaboticaba tree, by plant height, seedling (from 0.01 to 0.99 m), juvenile (1.0 to 4.99 m), immature (> 5.0 m, non-reproductive), adult (reproductive). It was also have been describe for the first time the naturally occurring juxtaposed seedlings, indicating polyembryony. The number of regenerating identified in the population (seedlings: n = 2163; juveniles: n = 330; immature: n = 59) was much larger than the number of adults (n = 132). The species showed reverse J-shaped size structure standard, with high concentration of regenerating. The regeneration distribution occurs in aggregate pattern and there is seedling-adult dependence, due seed dispersal and seedling emergence closest to mothers. The jaboticaba tree regeneration is sufficient to maintain the species for long term in this population, which should serve as reference to regeneration success for other studies of this important fruiting species from Ombrofile Mixed Forests. Has been pre-selected the jaboticaba trees 7, 42, 43, 47, 54, 91, 97, 104, 105, 118, 134, 153, 154, 157, 163, 169, 177, 186, 212, J7-01 and J7- 02, and 16 and 194 the ones that can now be selected by the superior characteristics of both cycles. It was recommended to carry out hybridization between genotypes 79 and 119, and 96 to 148. The quality of fruit analyzed showed potential for use as a dual purpose serving both in natura market or processing.

CAPES / Para traçar estratégias visando a conservação e uso dos recursos genéticos de espécies arbóreas, como a jaboticabeira, é essencial se fazer a caracterização. Na região Sudoeste do Paraná existem fragmentos florestais contendo jaboticabeiras nativas (Plinia cauliflora), com variabilidade e potencialidade para pomares comerciais ou programas de melhoramento genético. Como a diversidade genética representa o potencial de uma população para produzir diferentes genótipos, poder-se-ia iniciar tal caracterização em um destes fragmentos. O objetivo foi caracterizar frutos de jaboticabeiras (P. caulifora) de fragmento florestal mantido em Clevelândia-PR, quanto a presença de variabilidade fenotípica, buscando-se identificar aquelas denominadas superiores para seleção como futuro cultivar ou genitor masculino, bem como, estimar a divergência genética entre eles, como ferramenta complementar. Além disso, verificar a regeneração e os padrões de distribuição espacial da espécie. Para a realização do estudo foi delimitada parcela de um hectare (10.000 m²), com todos os indivíduos identificados, mapeados, com sistema local de coordenadas, e mensurada altura e diâmetro. Foram caracterizados frutos quanto as características sensoriais e bioquímicas, em dois anos, 70 genótipos em 2013 e 56 em 2014; destes, 33 genótipos nos dois anos. Como critério de pre-seleção foi adotada a escolha de 20% dos genótipos que apresentaram a maior frequência de superioridade nas características avaliadas dos frutos. Foi analisada a divergência genética entre 33 genótipos por ano. O padrão de distribuição e associação espacial foi avaliado pela função K de Ripley. Pela primeira vez classificou-se os estágios ontogenéticos de jaboticabeira, segundo a altura da planta em: plântulas (0,01 a 0,99 m), juvenis (1,0 a 4,99 m), imaturos (> 5,0 m, não reprodutivos), adultos (reprodutivos) em ambiente florestal. Também foi descrita pela primeira vez a ocorrência natural de plântulas justapostas, indicando a poliembrionia. O número de regenerantes identificados na população (plântulas: n = 2163; juvenis: n = 330; imaturos: n = 59) foi muito maior que o número de adultos (n = 132). A espécie apresentou estrutura de tamanho em padrão J-invertido, com alta concentração de regenerantes. A distribuição da regeneração ocorre por padrão agregado e há dependência das plântulas em relação aos adultos, devido dispersão das sementes à curtas distâncias e emergência de plântulas próximo às matrizes. A regeneração de jaboticabeira é suficiente para manter a espécie em longo prazo nesta população, a qual pode servir como referência do sucesso de regeneração para outros estudos desta importante espécie frutífera da Floresta Ombrófila Mista. Foram préselecionadas as jaboticabeiras 7, 42, 43, 47, 54, 91, 97, 104, 105, 118, 134, 153, 154, 157, 163, 169, 177, 186, 212, J7-01 e J7-02, sendo a 16 e 194 as únicas que já podem ser selecionadas pelas características de superioridade entre ambos ciclos. Recomenda-se a realização de hibridação entre os genótipos 79 e 119 e, 96 com 148. A qualidade das frutas analisadas demonstrou potencialidade para uso como dupla finalidade servindo tanto para mercado in natura ou processamento. / To design strategies for the conservation and use of genetic resources of tree species such as jaboticaba tree, it is essential to make the characterization. In southwestern Paraná region, there are several forest fragments containing native jaboticaba tree (Plinia cauliflora), whose materials have broad potential for commercial orchards or breeding programs. As is the potential genetic diversity of a population to produce different genotypes, it would be able to start in such a characterization one of these fragments. The aim was to characterize fruits of jaboticaba tree (P. caulifora) of forest fragment kept in Clevelândia - PR for the presence of phenotypic variability, seeking to identify those superiors named for future selection as farming or male parent, as well as estimate genetic divergence between them, as a complementary tool for this purpose. Also, verify the regeneration and spatial distribution of the species. For the study was defined portion of a hectare (10.000 m²), with all individuals identified, mapped, with local coordinate system, and measured height and diameter. Fruits were characterized by sensory and biochemical characteristics in two years, 70 genotypes at 2013 and 56 at 2014, and of these 33 genotypes in both years. As a pre-selection criteria was adopted the choice of 20% of the genotypes that showed the highest frequency of superiority in the evaluated characteristics of the fruit. Genetic divergence among 33 genotypes per year was analyzed. The distribution pattern and spatial association was evaluated by Ripley's K function. It was classified for the first time the following ontogenetic stages of jaboticaba tree, by plant height, seedling (from 0.01 to 0.99 m), juvenile (1.0 to 4.99 m), immature (> 5.0 m, non-reproductive), adult (reproductive). It was also have been describe for the first time the naturally occurring juxtaposed seedlings, indicating polyembryony. The number of regenerating identified in the population (seedlings: n = 2163; juveniles: n = 330; immature: n = 59) was much larger than the number of adults (n = 132). The species showed reverse J-shaped size structure standard, with high concentration of regenerating. The regeneration distribution occurs in aggregate pattern and there is seedling-adult dependence, due seed dispersal and seedling emergence closest to mothers. The jaboticaba tree regeneration is sufficient to maintain the species for long term in this population, which should serve as reference to regeneration success for other studies of this important fruiting species from Ombrofile Mixed Forests. Has been pre-selected the jaboticaba trees 7, 42, 43, 47, 54, 91, 97, 104, 105, 118, 134, 153, 154, 157, 163, 169, 177, 186, 212, J7-01 and J7- 02, and 16 and 194 the ones that can now be selected by the superior characteristics of both cycles. It was recommended to carry out hybridization between genotypes 79 and 119, and 96 to 148. The quality of fruit analyzed showed potential for use as a dual purpose serving both in natura market or processing.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Crassostrea (Sacco, 1897) é o gênero mais importante do mundo de ostras de cultivo e consiste de 34 espécies distribuídas pelas regiões tropicais e temperadas do globo. C. gasar e C. rhizophorae são as duas espécies nativas que estão distribuídas ao longo de toda a costa do Brasil até o Caribe. C. gasar também ocorre na costa da Africa. Ainda que sua distribuição seja extensa e com disponibilidade abundante, o cultivo de ostras nativas no Brasil ainda é incipiente e a delimitação correta dos estoques mantém-se incerta. O sucesso do desenvolvimento da malacocultura, que é recomendada internacionalmente como forma sustentável de aquicultura, depende da resolução desses problemas. Assim, com o objetivo de determinar geneticamente seus estoques no Atlântico como também estimar sua história demográfica, dois diferentes marcadores moleculares foram empregados: sequências de DNA da região controle mitocondrial e loci de microssatélites espécie-especifícos, desenvolvidos no presente estudo. Foram sequenciados fragmentos da região controle de um total de 930 indivíduos de C. gasar e C. rhizophorae coletados em 32 localidades que incluíram o Caribe, a Guiana Francesa, a costa brasileira e a África. Também foram realizadas genotipagens de 1178 indivíduos, e ambas as espécies, com 9 e 11 loci de microssatélites para C. gasar e C. rhizophorae, respectivamente. Os dados genéticos foram analisados através de diferentes abordagens (índices de estruturação (FST) e de (Jost D), análise molecular de variância (AMOVA), análise espacial molecular de variância (SAMOVA), Bayesian Skyline Plots (BSP), análise fatorial de correspondência (AFC) e análise de atribuição Bayesiana (STRUCTURE)). Os resultados indicaram um padrão geral de estruturação, onde dois diferentes estoques foram detectados para ambas as espécies: grupos do norte e do sul, onde o Rio de Janeiro seria a região limitante entre os dois estoques. Os maiores valores dos índices de estruturação foram encontrados para C. gasar, indicando que esta espécie estaria mais estruturada do que C. rhizophorae. As análises demográficas indicaram uma provável expansão das populações durante o ultimo período glacial e uma possível origem americana das populações africanas. Todos os resultados sugeriram a existência de uma barreira geográfica próxima ao Rio de Janeiro, que poderia ser a cadeia de Vitória-Trindade e o fenômeno de ressurgência que ocorre em Cabo Frio (RJ). Esses resultados serão de grande utilidade para estabelecer critérios para seleção de sementes para cultivo ao longo da costa do Brasil que permitirá o manejo adequado dos estoques ostreícolas, prevenindo seu desaparecimento como já ocorrido em outros recifes no mundo. / Crassostrea (Sacco, 1897) is the most important genus of cultivated oysters in the world and consisting of 34 species distributed by tropical and temperate regions of the globe. C. gasar and C. rhizophorae are the two native species which have wide distribution along the entire Brazilian coast up to the Caribbean. C. gasar also occurs on coast of Africa. Despite its extensive distribution and abundant availability, cultivation of those oysters in Brazil is incipient, and the correct delimitation of the existing stocks is still uncertain. The successful development of malacoculture which is recommended internationally as an environmentally sustainable form of aquaculture depends on the resolution of these issues. Thus, in order to genetically determinate their stocks in the Atlantic and to estimate their demographic history, two different molecular markers were employed: sequences of the mitochondrial DNA control region and species-specific microsatellite loci, developed in the present study. We have sequenced a fragment of the mitochondrial control region from a total of 930 individuals of C. gasar and C. rhizophorae collected in 32 localities including the Caribbean, French Guyana, Brazilian coast and Africa. We have also genotyped 1178 individuals of both species with 9 and 11 loci of microsatellites for C. gasar and C. rhizophorae, respectively. Genetic data were analyzed with different approaches (fixation (FST) and differentiation (Jost D) indices, analysis of molecular variance (AMOVA), spatial analysis of molecular variance (SAMOVA), Bayesian Skyline Plots (BSP), factorial correspondence analysis (AFC) and Bayesian attribution analysis (STRUCTURE)). The results indicated a general structure pattern, where two different stocks were detected for both species: north and south groups, where Rio de Janeiro would be the limited region between them. Higher values of fixation indices were found for C. gasar, indicating that this species would be more structured than C. rhizophorae. Demographic analyses showed a probable expansion of populations during the last glacial period and a probable American origin of African populations. All results suggested the existence of a barrier next to Rio de Janeiro, which could be Vitoria-Trindade chain and the upwelling in the region of Cabo Frio (RJ). These results will be useful to establish criteria for the selection of seeds for cultivation along the Brazilian coast which will allow proper management of stocks of oysters preventing its disappearance as in other reefs around the world.

Dois estudos foram realizados com o objetivo de analisar a distribuição espacial de diferentes raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus no Brasil, relacionando sua ocorrência com variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas. O objetivo do primeiro estudo foi analisar a relação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição de raças bovinas. Neste estudo utilizou-se as informações município e estado das raças Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolês, Devon, Flamenga, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn e Simental. As raças foram classificadas conforme sua finalidade: carne, dupla aptidão e leite e posteriormente espacializadas no programa ArcGis 10.2. As raças leiteiras estudadas estavam localizadas nos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, as raças de duplo propósito em Minas Gerais e no Rio Grande do Sul e as raças de carne estão concentradas na região sul do país. As regressões logísticas demonstraram que as raças de corte e dupla aptidão tendem a ser criadas em regiões com menor temperatura máxima e média, menor amplitude térmica e ITU, porém em municípios com alta umidade e altitude, menor produto interno bruto, pouca orientação técnica, baixo controle de doenças e parasitas e pouca rotação de pastagens A análise de variância mostrou que as raças de carne, leite e dupla aptidão não variaram para as características climáticas, físicas e socioeconômicas. No segundo estudo objetivou-se analisar a associação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição dos valores genéticos para características de crescimento e perímetro escrotal de animais da raça Brangus. Foram utilizados registros de 84.703 animais da raça Brangus, nascidos entre 2000 e 2010 distribuídos em 65 fazendas do Brasil. Os animais localizaram-se nos estados RS, PR, SP, MG, GO, MG e MS. Á desmama, as maiores médias dos valores genéticos por fazenda estão agrupadas no cluster 1 e ao sobreano agruparam-se no cluster 2. Os maiores valores genéticos ficaram fortemente relacionadas com amplitude térmica e área municipal. Ter conhecimento da distribuição espacial de raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus pode auxiliar no desenvolvimento de índices ambientais, avaliações genéticas e escolha de animais para determinados ambientes. / Two studies were conducted in order to analyze the spatial distribution of different breeds and breeding values of Brangus animals in Brazil, relating their occurrence to climatic, physical and socioeconomic variables. The aim of the first study was to analyze the relationship of climatic, physical and socioeconomic variables with the distribution of bovine breeds. In this study we used the municipality and state information of the Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolais, Devon, Flemish, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn and Simmental breeds. Breeds were classified according to their purpose: beef, dual purpose and milk and spatialized using ArcGis 10.2. The dairy breeds studied were located in the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina, the dual purpose breeds in Minas Gerais and Rio Grande do Sul and the beef breeds are concentrated in the southern region of the country. Logistic regression showed that both beef and dual purpose cattle are more likely to be raised in municipalities with lower maximum and average temperatures, lower thermic amplitude and THI, although, with high humidity and altitude, with lower gross domestic product, where technical guidance, rotation of pastures and control of diseases and parasites were low Analysis of variance showed that beef, dairy and dual purpose breeds did not ranged for climatic, physical and socio-economic characteristics. The second study aimed to analyze the association of climate, physical and socio-economic characteristics with the distribution of breeding values of growths traits and scrotal perimeter of Brangus animals. Records of 84.703 Brangus animals, born between 2000 and 2010 distributed in 65 farms in Brazil were used. Cluster analysis formed three clusters of average breeding values per farm. Animals were located in the Brazilian states of RS, PR, SP, MG, GO, MG and MS. At weaning, the highest averages of breeding values per farm were grouped in cluster 1 and to yearling in cluster 2. The highest breeding values were strongly related to thermal amplitude and municipal area. knowledge the spatial distribution of cattle breeds and breeding values of Brangus animals can help in the development of environmental indices, genetic evaluations and in the choice of animals for certain environments.