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Processos pedogenéticos e biogeoquímica de Fe e S em solos de manguezais / Pedogenic processes and biogeochemistry of Fe and S in mangrove soils

Tiago Osorio Ferreira 21 February 2006 (has links)
Em função de seu importante papel funcional e de sua posição de transição entre o ambiente marinho e terrestre, os ecossistemas estuarinos vêm sendo objeto de estudo das mais diversas áreas do conhecimento. Entretanto, poucos são os estudos destinados ao entendimento da biogeoquímica e gênese de seus solos. Os compostos de ferro e enxofre são tidos como de importância chave para os ciclos biogeoquímicos ativos nestes ambientes, principalmente pelo fato de a redução bacteriana do sulfato (RBS) ser considerada como a forma de respiração preponderante nestes locais. O ciclo biogeoquímico destes elementos se encontra, entretanto, governado pelas variações físico-químicas do meio devido a variações incessantes em função da freqüência de inundação pelas marés, das diferentes estações climáticas e da atividade da fauna e da flora presentes nestes ambientes. Diante do escasso número de informações sobre estes solos pretende-se, em um estudo biogeoquímico detalhado dos solos de mangue do Estado de São Paulo, gerar informações adicionais sobre a gênese destes solos e avaliar os efeitos das variações sazonais, da atividade biológica (plantas e macro-fauna) e das distintas posições fisiográficas dentro dos manguezais, sobre a biogeoquímica do Fe e S. Para isso, foram realizadas análises morfológicas, químicas, mineralógicas (DRX e MEV), determinações na água intersticial (pH, salinidade, concentrações de Mn2+, Fe2+, HS-, SO4 2-e Cl-) e na fase sólida (COT, Fe total, S total, Mn total, AVS, C biomassa microbiana, densidade de raízes vivas e mortas, porcentagem de areia e extração seqüencial das diferentes formas de Fe) em diferentes perfis sob vegetação de mangue do Estado de São Paulo (Guarujá e Cananéia). Com base nas evidências obtidas neste estudo fica evidente a ação de processos pedogenéticos nos substratos de mangue (adição de matéria orgânica, translocação de Fe2+ e de partículas minerais e a transformação de elementos como Fe e S) os quais devem, portanto, ser denominados, entendidos e estudados como solos e não como sedimentos. Os resultados sugerem a oxidação das frações pirítica e AVS pela ação do sistema radicular das plantas e pela atividade da macro-fauna, principalmente caranguejos, evidenciando ainda a presença de um ciclo sazonal na biogeoquímica do Fe e S o qual se mostra, em grande parte, governado pela ação das plantas e da macro-fauna. Foram encontradas diferenças drásticas entre as condições geoquímicas da água intersticial dos solos e sedimentos de mangue estudados, sendo estas devidas a um maior dinamismo dos processos biogeoquímicos atuantes nos solos, ocasionado pelo efeito das plantas (oxidação, liberação de exudatos pelas raízes). Os resultados obtidos apontam que a participação e a intensidade de cada um dos processos ligados à decomposição da matéria orgânica nos solos de mangue podem variar em função das distintas posições fisiográficas, devido a seus efeitos sobre a freqüência e duração de inundação e composição granulométrica dos solos. Os resultados indicam também, que a ocorrência ou a dominância de um processo sobre os demais afeta de forma significativa a composição das fases sólida e líquida dos solos de mangue, no que se refere ao Fe e S. / Due to the important functional role of mangrove forest communities and their transitional position between marine and terrestrial environments, these ecosystems have been the object of study by a variety of scientific disciplines; however, there are only a few published studies on the genesis and biogeochemistry of its soils. Iron and sulfur compounds play a key role on the active biogeochemical cycles in these environments, mainly because sulfate reduction is considered the preponderant respiration process in these sites. The biogeochemical cycles of these elements are, however, ruled by physicochemical variations constantly generated by tide flooding, different climatic seasons and fauna and flora activity. Considering the scarce information about these soils, a detailed biogeochemical study of mangrove sites located in the State of São Paulo was undertaken to generate additional information on the genesis of these soils and also to evaluate the effects of seasonal variations, biological activity (plants and macrofauna) and physiographic positions on Fe and S biogeochemistry. Morphological, chemical and mineralogical data (XRD and SEM) were examined for evidence of pedogenic processes; interstitial water (pH, salinity, concentrations of Mn2+, Fe2+, HS-, SO4 2-e Cl-) and solid phase (TOC, total Fe, total S, total Mn, AVS, microbial biomass C, density of living and dead roots, sand percentage and sequential extraction of Fe) analysis were undertaken in different soil profiles under mangrove vegetation from São Paulo State (Guarujá and Cananéia) to asses Fe and S biogeochemistry. The evidences presented in this study indicate that pedogenic processes (addition of organic material; translocation of Fe2+ and mineral particles; transformation of elements such as Fe and S) have occurred in mangrove substrates and that these substrates are more properly referred to, understood and studied as soils and not sediments. Results also evidence that pyrite and AVS oxidation is taking place in response to plants and macro-fauna activity and that the seasonal cycle of Fe and S biogeochemistry is mostly ruled by plants and macro-fauna. Results indicate important differences between physicochemical conditions of the pore water in the vegetated (soils) and non-vegetated (sediment) zones, which are related to the faster dynamics of the biogeochemical soil processes caused by the effect of plants (oxidation, liberation of the exudates by the roots). Our data also show that the contribution and intensity of each process coupled to organic matter mineralization in mangrove soils may vary significantly between the distinct physiographic positions. These variations are generated by physiographic positions effects on frequency and duration of tidal flooding and grain size composition of soils. In this context, the occurrence, or dominance, of one process over the others, affects, in a significant way, pore water and solid phases chemistry.
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Estudo fitoquímico de Dalbergia ecastophyllum (L.) Taub. (Fabaceae) / Phytochemical Studies of Dalbergia ecastophyllum (L.) Taub. (Fabaceae).

Soares, Rafaela dos Santos 09 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-05-14T12:59:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ArquivoTotal.pdf: 5455916 bytes, checksum: ae9a50d359b6e994167f8e2b4e7150db (MD5) Previous issue date: 2012-02-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Dalbergia ecastophyllum (L.) Taub. (Fabaceae), popularly known as "rabo-de-bugio" or marmelo-do-mangue", it is a scandentia or semi-prostrate species, commonly found in estuaries, mangroves and dunes. It was observed that the bees collected a red exudate from the surface of the parts area of this species suggesting that this is the botanical origin of the red propolis. This study aimed to contribute to the chemotaxonomical knowledge of the genus Dalbergia and of the family Fabaceae through the phytochemical study of the species D. ecastophyllum. The plant material was collected in Rio Tinto - Paraíba and a voucher specimen was deposited in the Herbarium of the Department of Systematics and Ecology - UFPB with the code 45738 (JPB). For the phytochemical study, the plant material, after drying and pulverization, was subjected to extraction processes, and partition chromatography to isolate the chemical constituents. The chemical structures were determined by spectroscopic methods, such as IR and 1H NMR and 13C one and two-D, and comparisons with models of literature. From the hexane phase, the triterpene friedelin, two mixtures of steroids, non-glycosylated and glycosylated (β-sitosterol and stigmasterol) and a mixture of three triterpenes (lupeol, β-amyrin and germanicol) were obtained. From the dichloromethane phase two isoflavones, biochanin A and 2' - hydroxy - 5' - metoxibiochanin A were isolated and identified , this latter substance is being reported for the first time in the genus, thus contributing to the chemotaxonomy of the genus Dalbergia and family Fabaceae. / Dalbergia ecastophyllum (L.) Taub. (Fabaceae), popularmente conhecida como rabo-de-bugio ou marmelo-do-mangue, é uma espécie escandente ou semi-prostrada, encontrada associada a estuários, mangues e dunas. Foi observado que as abelhas coletavam o exsudato vermelho da superfície dessa espécie sugerindo ser essa é a origem botânica da própolis vermelha. Este trabalho objetivou contribuir para o conhecimento quimiotaxonômico do gênero Dalbergia e da família Fabaceae através do estudo fitoquímico da espécie D. ecastophyllum. Logo, o material vegetal foi coletado em Rio Tinto Paraíba e depositado no Herbário do Departamento de Sistemática e Ecologia UFPB com o código 45738 (JPB). Para o estudo fitoquímico, o vegetal, após secagem e pulverização, foi submetido a processos de extração, partição e cromatografia para isolamento dos constituintes químicos. A estrutura química dos mesmos foi determinada por métodos espectroscópicos, como: Infravermelho e Ressonância Magnética Nuclear de 1H e 13C uni e bidimensionais, além de comparações com modelos da literatura. Da fase hexânica obteve-se o triterpeno friedelina, duas misturas de esteroides não glicosilado e glicosilado (β-sitosterol e estigmasterol) e uma mistura com três triterpenos (lupeol, β-amirina e germanicol). Da fase diclorometano foi isolado e identificado dois isoflavonoides, o biochanin A e 2 -hidroxi-5 -metoxibiochanin A, sendo essa última substância relatada pela primeira vez no gênerol, contribuindo, portanto para a quimiotaxonomia do gênero Dalbergia e da família Fabaceae.
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Identificação de biomarcadores lipídicos em amostras de sedimentos no manguezal do Itacorubi, Ilha de Santa Catarina

Silva, Cesar Alexandro da 22 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2006. / Made available in DSpace on 2012-10-22T14:18:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 275836.pdf: 3059049 bytes, checksum: 904254085fb41b43b1570f4468963ae2 (MD5) / Neste estudo análises qualitativas e semi-quantitativas foram realizadas a fim de identificar biomarcadores lipídicos em diferentes frações (livres, "OH lábeis" e "H lábeis) que foram extraídos de amostras de sedimentos e folhas de plantas do manguezal do Itacorubi, Ilha de Santa Catarina. A realização do estudo geoquímico da matéria orgânica sedimentar em concomitância com a avaliação lipídica das folhas de mangue nos forneceu conhecimento para a distinção entre as possíveis fontes naturais (biogênicas) e/ou antropogênicas, responsáveis pela contaminação do meio. A interpretação dos resultados foi feita através do Índice Preferencial de Carbono (CPI) e composição elementar (C, H, N) que revelaram a contribuição mista de aporte terrestre e aquático. Os baixos valores do potencial redox (Eh) encontrados nas amostras de sedimentos, entre - 250 mV a - 444 mV, são característicos de ambiente redutor, induzido pela ação da comunidade microbiana do ambiente. O uso de razões a partir das concentrações dos esteróis C27 e C29, tais como colesterol/ß-sitosterol, coprostanol/epicoprostanol, coprostanol + epicoprostanol/esteróis totais evidenciaram a contaminação do manguezal por esgoto doméstico.
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Ecossistema manguezal e licenciamento ambiental da ponte sobre o Rio Cocó no bairro Sabiaguaba, Fortaleza/Ceará / Mangrove ecosystem and environmental licensing of the bridge over the Rio Coco in Sabiaguaba neighborhood , Fortaleza / Ceará

Rocha, Davi Aragão January 2011 (has links)
ROCHA, Davi Aragão. Ecossistema manguezal e licenciamento ambiental da ponte sobre o Rio Cocó no bairro Sabiaguaba, Fortaleza/Ceará. 2011. 140 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação, Programa Regional de Pós-Graduação em Desenvolvimento e Meio Ambiente - PRODEMA. Fortaleza-Ce, 2011. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-05T14:05:22Z No. of bitstreams: 1 2011_dis_darocha.pdf: 3371820 bytes, checksum: 6ec63106965664215b5f49b3e7813a3e (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-05T14:06:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_dis_darocha.pdf: 3371820 bytes, checksum: 6ec63106965664215b5f49b3e7813a3e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-05T14:06:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_dis_darocha.pdf: 3371820 bytes, checksum: 6ec63106965664215b5f49b3e7813a3e (MD5) Previous issue date: 2011 / his study investigates and analyzes the environmental licensing of the bridge over the River Coco at Sabiaguaba, Fortaleza – Ceará -Brazil. The licensing was initiated in 2001, being stopped a few times and being completed just in 2010. Through literature, and observation in the field, the public and private interests related to this building were checked. It was examined how is the lifestyles and cultural heritage of Sabiaguaba population, including their relationship with ecosystems, especially mangrove. It was analyzed howthe impacts on the natural environment were observed by the justifications given by the licensing documents and the government intitutes. For this, we examined the aspects ecodynamics and environmental services of mangrove ecosystems, including an investigation about the importance of mangrove ecosystem of the River Coco, the relationship of population of Sabiaguaba with ecosystems and environmental that exist in that area; and an analysis of the current legislation and legal doctrine that focuses on environmental licensing / Este estudo investiga e analisa o licenciamento ambiental da ponte sobre o rio Cocó, no bairro Sabiaguaba, em Fortaleza – Ceará. O licenciamento foi iniciado em 2001, sofrendo a obra paralisações e sendo finalizada apenas em 2010. Através de pesquisa bibliográfica, documental e observação em campo, foram verificados os interesses públicos e privados relacionados a essa construção e examinado como o modo de vida e o patrimônio cultural da população de Sabiaguaba, incluindo-se a sua relação com os ecossistemas, principalmente o manguezal, e como os impactos sobre o meio ambiente natural foram observados pelas justificativas apresentadas pelos documentos do licenciamento e pelos órgãos envolvidos em torno da obra. Para isso, examinou-se os aspectos ecodinâmicos e os serviços ambientais dos ecossistemas manguezais, investigando-se a importância do ecossistema manguezal do rio Cocó; a relação da população de Sabiaguaba com os ecossistemas e os fluxos ambientais existentes naquela área; além de uma análise da legislação vigente e da doutrina jurídica que versa sobre licenciamento ambiental.
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Fenologia, ecologia da polinização e reprodução de espécies de manguezal, no município de Goiana - PE

Correia de Lima Nadia, Tarcila 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4343_1.pdf: 5467353 bytes, checksum: 9c8ea9ec1f9b661dd0e5052f75bc12f6 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O manguezal é um ecossistema tropical das regiões litorâneas e estuarinas, importante como abrigo e local de reprodução de animais marinhos e para o aumento da produtividade de comunidades vizinhas. Sua vegetação, o mangue, é composta por poucas espécies com características peculiares, tais como viviparidade e raízes relacionadas às trocas gasosas. Há poucos estudos que abordam os padrões fenológicos e os sistemas de polinização e reprodução das espécies de mangue, sendo fundamentais para manejo e conservação desse ecossistema. Portanto, nesta Tese, análises sobre esses aspectos foram feitas em uma área de manguezal em Pernambuco, Nordeste do Brasil, para melhor compreensão da dinâmica de comunidade. A fenologia reprodutiva das quatro espécies de mangue ocorrentes na área, Avicennia schuaeriana (Acanthaceae), Conocarpus erectus, Laguncularia racemosa (Combretaceae) e Rhizophora mangle (Rhizophoraceae) foi acompanhada mensalmente durante quatro anos. Os sistemas de polinização e reprodução também foram investigados para cada espécie. A floração na comunidade seguiu um padrão contínuo bimodal, com picos nas duas estações, seca e chuvosa. A frutificação também foi contínua, porém sazonal unimodal, com pico na estação chuvosa. Rhizophora mangle é anemófila, apresentando padrões de floração e de frutificação contínuos. As outras três espécies possuem sistema de polinização generalista, sendo visitadas pelos mesmos grupos de polinizadores, abelhas, borboletas, moscas e vespas, sendo a mosca Palpada albifrons a principal polinizadora das três espécies entomófilas. A floração dessas espécies é seqüenciada ao longo do ano, havendo sobreposição, porém, com picos em épocas distintas, possibilitando a permanência dos polinizadores na comunidade e favorecendo o sucesso reprodutivo por meio da facilitação. Todas as espécies de mangue foram autocompatíveis, sendo a maioria autógama, com exceção de A. schaueriana. Contudo, a maior formação de frutos ocorreu sob condições naturais em todas as espécies de mangue, mostrando a importância dos vetores de polinização, seja abiótico ou biótico. Apesar da autocompatibilidade, cada espécie apresentou uma estratégia reprodutiva que favorece a polinização cruzada e conseqüentemente a manutenção da variabilidade genética na população, tais como protandria em A. schaueriana e R. mangle, ginodioicia em L. racemosa e andromonoicia associada à protoginia em C. erectus
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Interação dos atributos climáticos nos manguezais do litoral sul de São Paulo e sua relação com os controles climáticos / Interaction of climatic attributes in the mangroves of the southern coast of São Paulo and its relationship with climate controls

Nádia Gilma Beserra de Lima 22 October 2014 (has links)
Os manguezais estão entre os ecossistemas, biologicamente, mais produtivos e importantes do mundo, fornecendo bens e serviços exclusivos para as sociedades e os sistemas costeiros. Entre suas funções destacam-se a estabilização da linha de costa e a redução do impacto de fenômenos extremos, como em casos de tempestades e furacão. No entanto, esse ecossistema têm apresentado alterações significativas oriundas da influência antrópica no ambiente, que modificam a cobertura vegetal e que, por sua vez, influenciam todo o ecossistema, inclusive nas interações microclimáticas. A pesquisa tem como objetivo avaliar a relação existente entre os controles (estrutura da vegetação, variação da maré e sistemas atmosféricos) e atributos climáticos (temperatura do ar, umidade absoluta do ar, radiação solar global, vento e precipitação) no manguezal localizado na Barra do Ribeira-Iguape/SP. Para isso, instalou-se uma torre microclimática contendo duas estações meteorológicas de forma a obter uma análise da variação dos atributos climáticos acima e abaixo do dossel de manguezal. Além disso, analisaram-se ainda as características estruturais da vegetação do manguezal. Constatou-se um aumento na transmissividade da radiação solar no dossel do manguezal, uma redução no albedo e uma diminuição na interceptação vegetal, que está associada a degradação do bosque, que não possui indivíduos novos que prosperam no ambiente, portanto sem renovação do ecossistema, resultado da presença de macrófitas ao longo da área de estudo. Comprovou-se o importante papel da maré no manguezal, contribuindo com entrada e saída de energia, favorecendo o resfriamento/aquecimento relativo do ambiente. Concluiu-se que, do ponto de vista microclimático, há diferenças significativas entre o que acontece acima e abaixo do dossel no manguezal, com diferenças superiores a 5°C, como no caso da temperatura máxima ou ainda entre a temperatura do solo e do ar com diferenças que ultrapassaram 10°C. É perceptível, nesse nível escalar, o acoplamento entre as escalas climáticas superiores com o nível microclimático. Observou-se como os atributos climáticos se conectam e como as diferenças entre os atributos climáticos ficam evidentes em escalas temporais inferiores. / Biologically, the mangrove ecosystems are among the most productive and important in the world, providing resources and services exclusive to societies and coastal systems. Its functions include the stabilization of the shoreline and reduction the impact of extreme weather events such as in cases of storms and hurricane. However, this ecosystem have been presenting significant changes arising from anthropogenic influence on the environment, modifying the vegetation and that, in turn, influence the entire ecosystem, including the microclimatic interactions. The research aims to assess the relation between controls (vegetation structure, tide variations and atmospheric systems) and climatic attributes (air temperature, absolute humidity, solar radiation, wind and rainfall) in the mangrove on the bar the Ribeira-Iguape/SP. To this end, was installed one microclimatic tower containing two weather stations to obtain an analysis of climatic attribute variations above and below the canopy of mangrove. Moreover, was analyzed the structural features of the mangrove vegetation. It was found an increase in transmissivity of solar radiation in the mangrove canopy, a reduction in albedo and a decrease in vegetable interception. These changes are associated with the degradation of the forest, who do not have new individuals who thrive in the environment, there is no renewal of the ecosystem as a result of the presence of macrophytes in the study area. It was proven the important role of tidal in mangrove areas, contributing with input and output power, favoring the cooling / heating relative on the environment. It was concluded that, from the microclimatic point of view, there are significant differences above and below the mangrove canopy. In the case of the maximum temperature, the differences were greater than 5 ° C and exceed 10 ° C between the air and soil temperature. It is noticeable in this scalar level, the coupling between the upper climatic scales with the microclimate level. Was observed how the climatic attributes are connected and how the differences between the climatic attributes are evident in inferior temporal scales.
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Diversidade de Bacteria e Archaea em solos de mangue e marisma / Bacterial and Archaeal diversity in mangrove and marisma soils

Juliano de Carvalho Cury 13 September 2006 (has links)
Estudos sobre a diversidade de Bacteria em solos de mangue (Brasil) e marisma (Espanha) são escassos. A vegetação de mangue, composta por espécies como Spartina alterniflora, Rhizophora mangle, Avicennia schaueriana e Laguncularia racemosa, pode ser um dos fatores que determinam a estruturação das comunidades de procariotos. Determinações das estruturas das comunidades e de diversidade de Bacteria podem ocorrer em função das diferentes condições físico-químicas dos solos, refletindo na configuração dos processos biogeoquímicos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variação das estruturas das comunidades de Bacteria e Archaea, bem como a diversidade, em solos de mangue e marisma utilizando DGGE e sequenciamento parcial do rDNA 16S. As estruturas das comunidades de procariotos apresentaram variações em função de condições de vegetação. Proteobacteria e Bacteroidetes estão presentes em todos os solos estudados. A comunidade de Bacteria destes ambientes é dominada por Proteobacteria. Vários dos táxons detectados estão relacionados com ciclos biogeoquímicos importantes para os ambientes estudados. As estimativas não-paramétricas de riqueza de espécies (ACE e Chao1) mostram que solos de mangue e marisma podem conter milhares de espécies de bactérias. As comunidades de Bacteria dos solos de mangue e marisma são significativamene diferentes. Na camada mais superficial do sedimento de mangue predomina Euryarchaeota metanogênicas enquanto que na camada mais profunda predomina Crenarchaeota. Bactérias das ordens Desulfobacterales, Desulfovibrionales e Desulfuromonales podem estar relacionadas com a atividade de sulfato-redução e formação de pirita na camada anaeróbia do perfil de solo de marisma. De uma maneira geral, pode-se concluir que a diversidade e estrutura das comunidades de procariotos de ambientes estuarinos pode variar em função da vegetação estabelecida e do tipo de ambiente. Adicionalmente, solos de mangue e marisma possuem grande diversidade de procariotos, grande parte da qual é desconhecida, podendo representar elevado potencial genético para utilização biotecnológica. / The bacterial diversity in mangrove (Brazil) and marisma (Espanha) soils are largely unknown. Bacterial communities participate in biogeochemicals processes that occurs in soils of estuarine ecosystems. Determinations of the bacterial communities structures and diversity can occur in function of different physico-chemical conditions, reflecting in the biogeochemical processes. The aim of this work was to evaluate the variation of bacterial an archaeal communities structures utilizing DGGE and partial sequencing of 16S rDNA. Bacterial community structures showed more similarity between repetitions samples than the areas under different vegetation. Phylogenetic afiliation shows that several sequences were not clamped into known phyla. Proteobacteria prevails in bacterial communities of mangrove and marisma soils. Several taxa detected are associated to important biogeochemical cycles that occur in estuarine ecosystems. Analysis of species richness showed that mangrove and marisma soils can contain 200 to 6000 species of bacteria. Methanogenic Euryarchaeota was found specially in the upper sample of mangrove sediment analysed whereas the Crenarchaeota was found specially in the lower. Based on the data obtained, it can be concluded that the vegetation is one of the factors affecting the structure of bacterial and archaeal communities in mangrove soils. Additionaly, the effects of edafic factors and seasonal variations have to be considered as determining the prokaryotic community sctuctures, and bacterial and archaeal communities can respond independently to the factors that determine their community structures. Bacterial diversity can vary with the studied estuarine ecosystem. Studies are necessary concerning to diversity of Bacteria, it variation and correlation with biogeochemical process in the mangrove and marisma soils. These soils show a great diversity of bacteria, much of than unknown, which represent a great genetic potential to the biotechnology.
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Amélioration de la conservation des mangues 4ème gamme par application de traitements thermiques et utilisation d’une conservation sous atmosphère modifiée / Improving the storage of minimally processed mangoes (Mangifera indica L.) by hot water treatments and modified atmosphere packaging

Djioua, Tassadit 02 September 2010 (has links)
La conservation des mangues 4ème gamme est limitée par le brunissement enzymatique et la perte de fermeté dus aux différentes opérations de transformation. Cette thèse propose un nouvelle approche pour améliorer la conservation de mangues 4ème gamme : l’application de traitements thermiques par immersion et/ou la conservation sous atmosphère modifiée : passive ou active (5% O2 – 5 % CO2) ou des enrobages (chitosane). Ce travail a permis tout d’abord de déterminer un couple température / temps optimal: 50 °C / 30 min qui permet de maintenir la qualité de plusieurs variétés de mangue (Keitt, Kent, Tommy Atkins). Les effets du traitement thermique sur l’intensité respiratoire, la couleur, la fermeté, les teneurs en antioxydants : vitamine C, caroténoïdes et phénols totaux, et sur l’activité de plusieurs enzymes (pour la fermeté : PME, PG, b-GAL ; et pour la couleur : PPO et PAL) ont été étudiés. Ces travaux ont montré que durant 9 jours à 6 °C, le traitement thermique maintient principalement la couleur par réduction de l’activité de la PPO et réduit la perte en fermeté par réduction de l’activité des enzymes pectolytiques (PME et b-GAL). Par ailleurs, les atmosphères modifiées semblent moins efficaces pour le maintien de la couleur et de la fermeté des mangues 4ème gamme. L’association du traitement 50°C/ 30 min avec une conservation sous atmosphère modifiée apporte peu d’effets additionnels et a même parfois un effet inhibiteur / The storage of fresh-cut mangoes is limited by the enzymatic browning and the loss of firmness due to the various operations of process. This work proposes a new approache to improve the storage of fresh-cut mangoes by: application of heat treatments by dipping with, or not, a storage under modified atmosphere: passive or active (5% O2 - 5% CO2) or using coatings (chitosane). The first step of this work was to determine the traitement 50 °C/30 min as an optimal treatment which maintian the quality of several varieties of mango (Keitt, Kent, Tommy Atkins). Effects of the heat treatment on the respiratory intensity, the color, firmness, the contents antioxydants: vitamin C, carotenoids and phenols total, and on the activity of several enzymes (PME, PG, b-GAL: for firmness; and PPO and PAL for colour changes) were studied. This work showed that during 9 days at 6 °C, the heat treatment maintains mainly the color by reduction of the activity of PPO and reduces the loss in firmness by reduction of the activity of the pectolytic enzymes (PME et b-GAL). In addition, the modified atmospheres seem less effective for the maintenance of the color and the firmness of freshcut mangoes. Combination of heat treatment with a modified atmosphere storage and have less additional effects and has even sometimes an inhibiting effect
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Analyse expérimentale et modélisation de l’hétérogénéité de la qualité et de la maturité des mangues / Effects of environmental factors on the variability of mango quality and maturity, experimental and modelling approaches

Nordey, Thibault 09 December 2014 (has links)
La qualité du fruit regroupe un ensemble d’attributs, comme le calibre, la teneur en composés solubles, l’acidité et la couleur, qui varient en fonction des conditions de croissance rencontrées par le fruit pendant son développement et au cours de son murissement. Ce travail de thèse vise à déterminer, par des approches expérimentales et de modélisation, l’impact des conditions de croissance de la mangue sur les processus impliqués dans l’élaboration de sa qualité et de son murissement. Les approches expérimentales ont révélé d’importantes variations de calibre, masse sèche, et maturité entre les mangues selon leur position dans l’arbre et la charge en fruits. Nos mesures ont suggéré que la croissance des mangues est impactée par la diminution des flux de xylème causé par l’embolisation des vaisseaux conducteurs de sève. En plus des différences mesurées entre les fruits, nos résultats ont indiqué des variations de couleur de peau et de pulpe, d’acidité et de teneur en composés solubles au sein même des mangues qui s’expliquent en partie par les gradients de maturité. L’établissement d’un modèle thermodynamique a permis de montrer que les microclimats au sein de l’arbre génèrent un gradient de température au sein de la mangue qui varie en fonction de la position dans l’arbre. Il a été montré que ce gradient de température n’explique pas les variations d’acidité, de couleur de pulpe et de teneur en composés solubles au sein de la mangue. L’utilisation d’un modèle simulant la synthèse de l’éthylène dans la mangue a mis en évidence que les différences de maturité entre les mangues dans l’arbre s’expliquent davantage par les différences de disponibilité carbonée que par les différences de température. L’intégration des résultats expérimentaux dans un modèle de croissance en matière fraiche a permis de confirmer que l’embolisation des vaisseaux conducteurs de sève est à l’origine du ralentissement de croissance de la mangue. Enfin, le couplage de tous ces modèles à un modèle de croissance en matière sèche a montré que les variations de calibre, teneur en matière sèche et maturité entre les mangues ne sont pas causées par les différences de température, mais par les différences de charge en fruits, de période de floraison, de masse sèche des fruits à la fin de la division cellulaire, et de transpiration.L’approche pluridisciplinaire, i.e., physique, écophysiologique et biochimique, utilisée dans ce travail de thèse a permis d’acquérir de nouvelles connaissances sur l’élaboration de la qualité du fruit et son murissement et ouvre de nouvelles perspectives de recherche. / One of the major difficulties involved in marketing fresh mango is to manage its quality. Mango quality includes several attributes such as size, total soluble solids content, acidity and color, all of which vary with growing conditions and during ripening. The aim of this thesis is to determine the impact of growing conditions on fruit quality and ripening through experimental and modeling approaches.Experimental studies have revealed that size, dry mass and maturity vary considerably between mangoes according to their position in the tree and fruit load. Measurements suggest that fruit growth is affected by the embolization of sap-conducting vessels. In addition to differences measured between mangoes, our results showed that quality attributes vary within fruits in relation to the maturity gradient.A physical model showed that climatic variations within the tree caused substantial temperature gradients within mangoes that change with the fruit position in the tree. These simulations revealed that quality differences within mangoes are not related to the temperature gradient, except for fruit color. Use of a model that simulates the biosynthetic pathway of ethylene indicated that maturity differences between mangoes are explained by differences in carbon supply and, to a much lesser extent, to differences in temperature. The integration of experimental results into a growth model revealed that the embolization of sap-conducting vessels caused the slowdown of fruit enlargement. Lastly, when all of these models were coupled to a model that simulates fruit growth in dry mass, it was demonstrated that variations in size, dry matter content and maturity between mangoes were caused by differences in fruit load, flowering time, fruit dry mass at the end of cell division and transpiration, rather than by differences in temperature.The multidisciplinary approach developed made it possible to better understand the processes involved in fruit quality and ripening and to open new areas of research.
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Aplicação de fungos de manguezais na obtenção de nanopartículas de prata com ação antimicrobiana. / Application of fungi isolated from mangroves in obtaining silver nanoparticles with antimicrobial activity.

Alexandre Gomes Rodrigues 05 February 2014 (has links)
Infecções hospitalares são um problema de saúde pública. Quatorze linhagens de fungos isolados de mangue foram avaliadas quanto ao potencial de síntese de nanopartículas de prata (NP Ag) por método biológico com atividade antimicrobiana, sendo dois fungos selecionados. A caracterização físico-química das NP foi realizada por espectrofotometria, microscopia eletrônica e espectroscopia de correlação de fótons. A banda de plasmon evidenciou a formação de NP entre 10-30 nm. A ação antimicrobiana foi avaliada em espécies de Candida e bactérias. As NP foram mais efetivas nas espécies de C. guilhermondi, C. parapsilosis, P. aeruginosa e S. aureus com concentrações inibitórias variando de 0,015 a 0,132 µg/mL. A ação antifúngica de tecidos impregnados com NP Ag foi testada em C. albicans, C. glabrata e C. parapsilosis com inibição do crescimento na faixa de 68,41 97,91 %. Em E. coli e S. aureus a inibição do crescimento foi de 100% na concentração de 2,2 µg/mL. Os fungos foram identificados como Bionectra ochroleuca e Aspergillus tubingensis, respectivamente. / Hospital infections are a public health problem. Fourteen strains of fungi isolated from the mangrove were evaluated regarded to their capacity to synthesize silver nanoparticles (Ag NP) by a biological method with antimicrobial activity and two fungi were selected. The physicochemical characterization was performed by spectrophotometry, electron microscopy and photon correlation spectroscopy. The plasmon band evidenced the formation of NP from 10-30 nm. The antimicrobial activity was evaluated against Candida species and bacteria. The NP were more effective against the C. guilhermondi, C. parapsilosis, P. aeruginosa e S. aureus especies with inhibitory concentrations from 0.015 to 0.132 µg/mL (1.3 a 12 µM). The antifungal activity of the fabrics impregnated with Ag NP was tested against C. albicans, C. glabrata and C. parapsilosis, presenting inhibition from 68.41 97.91 %. Against E. coli and S. aureus the growth inhibition was of 100% in the concentration of 2.2 µg/mL. The fungi were identified as Bionectra ochroleuca and Aspergillus tubingensis, respectively.

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