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O perfil de expressão dos MiRNAs reguladores de CD44 e das sintases do ácido hialurônico no câncer de próstata / The expression profile of miRNAs regulatory of CD44 and hyaluronic acid synthases in prostate cancer

Moura, Caio Martins 27 October 2017 (has links)
Introdução: O Câncer de próstata (CaP) é o tumor sólido mais comum e a segunda causa de óbito por câncer no homem em países ocidentais. Caracteristicamente tem comportamento heterogêneo e os fatores prognósticos falham na previsão de sua agressividade. Assim, existe a necessidade da busca de novos marcadores moleculares que melhorem a definição prognóstica. Em estudo prévio demonstramos que a perda de expressão da molécula de adesão CD44 padrão (CD44s) e superexpressão das variantes do CD44 (CD44v) são características do CaP localizado. O CD44 tem como principal ligante o ácido hialurônico (AH), principal componente da matriz extracelular, sintetizado pelos genes has2 e has3. Talvez microRNAs (miRNA) regulem a expressão destes genes no CaP. Objetivo: Nosso objetivo foi analisar o perfil de expressão dos miRNAs que possam regular os genes has2, has3 e CD44 e correlacioná-los com os principais fatores prognósticos do CaP e com a recidiva bioquímica pós-prostatectomia radical. Materiais e métodos: Analisamos retrospectivamente os espécimes cirúrgicos de 53 pacientes submetidos a prostatectomia radical (PR) entre outubro de 1998 e abril 2006. A expressão dos genes e de seus miRNAs reguladores foram analisadas através da reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real (qRT-PCR). O grupo controle foi constituído pelos espécimes cirúrgicos de 6 pacientes com hiperplasia prostática benigna (HPB). Correlacionamos o perfil de expressão dos 3 genes e 9 MiRNAs com o escore de Gleason, graduação ISUP, estadiamento patológico, nível de PSA pré-operatório e recidiva bioquímica definida por níveis de PSA acima de 0,2ng/mL. Resultados: Encontramos superexpressão dos genes has2 e has3 e subexpressão do CD44s no CaP localizado em comparação a HPB. Observamos subexpressão da maioria dos miRNAs no CaP com exceção do miR-511 que se encontrou superexpresso. Os miR-10a e 708 apresentaram expressão heterogênea. Adicionalmente demonstramos que menor expressão dos miR-200c e 33a está correlacionada com PSA >= 10 ng/mL, p=0,024 e p=0,002 respectivamente. A menor expressão de miR 200c também apresentou correlação com o score de Gleason >= 7 (p=0,026) e com recidiva bioquímcia (p=0,041). Conclusão: Os genes has2, has3 estão superexpressos, e o CD44s subexpresso no CaP localizado. A maioria dos miRNAs, reguladores destes genes estão subexpressos. A menor expressão dos miR-200c e 33a que regulam os genes has2 e has3 estão correlacionados com características anátomo-patológicas de pior prognóstico e com maiores taxas de recidiva bioquímica / Introduction: Prostate cancer (PCa) is the most common solid tumor and the second cause of cancer death in men in Western countries. It characteristically has heterogeneous behavior and the prognostic factors fail in predicting its aggressiveness. Thus, there is a need to search for new molecular markers to improve prognostic definition. In a previous study we showed that the loss of the standard CD44 (CD44s) adhesion molecule expression and overexpression of CD44 variants (CD44v) are characteristic of PCa. CD44 is the main binder of hyaluronic acid (HA), which is a major component of the extracellular matrix that is synthesized by the genes has2 and has3. We believe that micro RNAs (miRNA) regulate the expression of these genes in PCa. Objective: Our objective was to analyze the miRNA expression profile that probably regulate gene has2, has3 and CD44 and correlate the results with the main prognostic factors for PCa and biochemical recurrence after radical prostatectomy (RP). Materials and Methods: We retrospectively analyzed the surgical specimens of 53 patients who underwent RP between October 1998 and April 2006. The expression of genes and their regulatory miRNAs were analyzed by quantitative, real time polymerase chain reaction (qRT-PCR). The control group was represented by surgical specimens of 6 patients with benign prostatic hyperplasia (BPH). We correlate the expression profile of 3 genes and 9 miRNAs with Gleason score, ISUP graduation, pathological staging, preoperative PSA and biochemical recurrence defined by PSA levels above 0,2ng /ml. Results: We found overexpression of genes has2 and has3 and under expression of CD44s in PCa compared to HPB. We observed an under expression of most miRNAs in PCa with the exception of miR-511 that was found overexpressed. The miR-10a and 708 showed heterogeneous expressionprofile. Additionally we demonstrated that lower expression of miR-200c and 33a was correlated with PSA >= 10 ng/mL, p=0.024 and p = 0.002 respectively. The lower expression of miR 200c was also correlated with Gleason score >= 7 (p=0.026) and biochemical recurrence (p=0.041). Conclusion: The has2 and has3 were overexpressed while the CD44s was underexpressed in localized PCa. Most of miRNAs that regulate these genes were underexpressed. The expression of miR-200c and 33a, regulators of has2 and has3 genes, were correlated with unfavorable characteristics of PCa and with biochemical recurrence
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Perfil de expressão de microRNAs circulantes após uma sessão aguda de exercício em indivíduos com doença arterial periférica: papel da N-acetilcisteína / Profile microRNAs expression of current after an acute exercise session in individuals with peripheral artery disease: role of n-acetylcysteine.

Silva Júnior, Natan Daniel da 24 June 2016 (has links)
Introdução: A Doença arterial periférica (DAP) é uma manifestação clínica da aterosclerose, quando esta afeta principalmente as artérias que irrigam os membros inferiores. O exercício aeróbico provoca nos membros afetados pela doença um ciclo de reperfusão-isquemia que desencadeia uma resposta sistêmica aguda caracterizada por aumento do estresse oxidativo, inflamação e disfunção endotelial. Assim, uma terapia antioxidante pode ser uma terapia alternativa para esses pacientes. Os microRNAs (miRNAs) foram recentemente reconhecidos como reguladores pós-transcricionais, e a identificação desses pode elucidar mecanismos gênicos adicionais pelos quais o exercício é atuante, levando a identificação de genes que são modulados, abrindo perspectivas de abordagens de terapia gênica que podem levar à reversão do quadro da doença arterial periférica. Objetivo: Verificar o efeito de uma sessão aguda de exercício aeróbico máxima com e sem uso do antioxidante Nacetilcisteína (NAC) sobre a expressão de microRNAs e marcadores inflamatórios e de estresse oxidativo circulantes em pacientes com DAP. Métodos: Foram recrutados pacientes com DAP estágio II do Ambulatório da Disciplina de Cirurgia Vascular do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Os pacientes foram submetidos a duas sessões experimentais após a suplementação de NAC ou Placebo. Foi analisado o perfil de expressão de microRNAs circulantes dos indivíduos em repouso e após o exercício máximo, e confirmado a expressão gênica dos miRNAs alterados após o exercício e de seus alvos; e dos níveis plasmáticos de endotelina-1 (ET-1), proteína quimiotática de monócitos-1 (MCP-1), molécula de adesão intercelular-1 (ICAM-1), molécula de adesão celular vascular-1 (VCAM-1), substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico, 8- isoprostano e glutationa. Resultados: O tratamento com NAC não alterou o xvii tempo de caminhada, as respostas hemodinâmicas e cardiopulmonar dos pacientes com DAP. O fluxo sanguíneo em repouso da perna desses pacientes foi maior após a realização do exercício e o tratamento com NAC não alterou essa resposta. Após o exercício houve aumento plasmático de MCP-1, ET-1, VCAM-1 e TBARS, mas o tratamento com NAC não alterou essa resposta. Porém, o tratamento com NAC aumentou os níveis plasmáticos de glutationa durante toda a sessão experimental. Houve alteração da expressão dos cmiRNAs -126, -100 e -92a após a realização do exercício e o tratamento com NAC aboliu essas respostas. Encontramos ainda alteração da expressão gênica circulante de alguns alvos desses miRNAS: PI3KR2, mTOR, ITGA5; e de alguns genes relacionados com angiogênese: VEGF, eNOS, HIF-1?. Conclusão: O exercício aeróbico máximo foi um estímulo capaz de alterar a expressão gênica de marcadores angiogênicos circulantes em pacientes com DAP e os c-miRNAs parecem estar envolvidos nesse processo. Por outro lado, a NAC alterou o balanço redox dos pacientes com DAP. Entretanto, o tratamento com NAC aboliu essa resposta angiogênica sistêmica mediada por c-miRNAs ao exercício aeróbico máximo / Introduction: Peripheral arterial disease (PAD) is a clinical manifestation of atherosclerosis, when it mainly affects the arteries supplying the lower limbs. Aerobic exercise causes the member affected by the disease cycle of reperfusion-ischemia triggers an acute systemic response characterized by increased oxidative stress, inflammation and endothelial dysfunction. Thus, an antioxidant therapy is an alternative therapy for these patients. MicroRNAs (miRNAs) have been recognized as posttranscriptional regulators, and identifying these may elucidate additional gene mechanisms by which the exercise is active, leading to identification of genes that are modulated, opening prospects of gene therapy approaches that can lead to picture reversal of peripheral arterial disease. Aim: To determine the effect of an acute bout of maximal aerobic exercise with and without the antioxidant N-acetylcysteine (NAC) on the expression of microRNAs and inflammatory markers and circulating oxidative stress in patients with PAD. Methods: We recruited patients with PAD stage II Clinic of Vascular Surgery of Hospital das Clinicas, Faculty of Medicine, University of São Paulo. The patients underwent two experimental sessions after supplementation of NAC or placebo. the expression profile of circulating microRNAs of individuals at rest and after maximal exercise was analyzed and confirmed the gene expression of miRNAs changed after exercise and its targets; and plasma levels of endothelin-1 (ET-1), monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1), intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1) cell vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1) , reactive substances to thiobarbituric acid, 8-isoprostane and glutathione. Results: Treatment with NAC did not change the walking time, and cardiopulmonary hemodynamic responses of patients with PAD. The rest blood flow in the leg of these patients was higher after the completion of the exercise and treatment with NAC did not change this response. After the exercise was increased plasma MCP-1, ET-1, VCAM-1 and TBARS, but the treatment with NAC did not change this response. However, treatment with NAC increased plasma glutathione levels xix throughout the experimental session. There were change in the expression of c-miRNAs - 126, -100 and -92a after the exercise and treatment with NAC abolished those answers. We find still change in current gene expression of some targets of these miRNAs: PI3KR2, mTOR, ITGA5; and some angiogenesis-related genes: VEGF, eNOS, HIF-1?. Conclusion: The maximum aerobic exercise was a able to change gene expression of circulating angiogenic markers in patients with PAD and c-miRNAs stimulus seem to be involved in this process. Moreover, NAC change the redox balance of patients with PAD. However, treatment with NAC abolished the systemic angiogenic response mediated by c-miRNAs the maximum aerobic exercise
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Estudo temporal integrado de redes de co-expressão gênica e microRNAs em um modelo experimental de convulsão febril induzida por hipertermia / Integrated temporal study of gene co-expression networks and microRNAs in an experimental model of febrile seizure induced by hyperthermia

Nathália Amato Khaled 26 November 2018 (has links)
As convulsões febris complexas durante a infância representam um fator de risco relevante para o desenvolvimento da epilepsia. Apesar desse fato, as alterações moleculares induzidas por essas crises febris, que tornam o cérebro susceptível ao processo de epileptogênese, ainda são pouco conhecidas. Nesse contexto, a utilização de modelos animais de crises febris induzidas por hipertermia (HS) permite o estudo das alterações moleculares a partir de uma análise temporal desse processo. Assim, neste trabalho foram investigadas as alterações temporais nos perfis de microRNAs e de expressão gênica em explantes da região CA3 hipocampal de ratos Wistar obtidas em quatro intervalos de tempo após o insulto hipertérmico no décimo primeiro dia pós-natal (P11). Os intervalos temporais foram selecionados para avaliar as fases aguda (P12), latente (P30 e P60) e crônica (P120). A análise transcriptômica consistiu na construção de redes de co-expressão gênica, permitindo a identificação de módulos de genes e sua relação com os grupos experimentais e intervalos de tempo selecionados. Os genes também foram caracterizados hierarquicamente, identificando-se genes que conferem robustez às redes de co-expressão gênica (hubs). Além disso, foram avaliados o perfil de expressão diferencial de microRNAs e feita a análise integrada da expressão de microRNAs e expressão gênica dos hubs. Os resultados deste trabalho mostraram que: i) o insulto hipertérmico leva a alterações importantes no desenvolvimento e funcionamento cerebral ii) essas alterações estão associadas a uma assinatura temporal, presumivelmente da epileptogênese à readaptação do cérebro frente ao insulto precipitante inicial; iii) isso envolve um mecanismo de regulação das redes de co-expressão gênica por microRNAs. Esses resultados sugerem que as alterações transcricionais desencadeadas pelo insulto febril podem levar à reprogramação neuronal e ao remodelamento da cromatina, tornando o cérebro susceptível ao processo epiléptico crônico. Como nas epilepsias humanas por insulto febril, o modelo em rato reflete um processo que vai da epileptogênese à cronificação na fase adulta. Como muitos dos casos de epilepsia por insulto febril são refratários a drogas anticonvulsivantes, o entendimento temporal dos mecanismos moleculares envolvidos nesse tipo de epilepsia é relevante para se identificar alvos terapêuticos e desenvolver drogas anti-epileptogênicas / Complex febrile seizures during childhood represent a relevant risk factor for the development of epilepsy. Despite this fact, the molecular alterations induced by febrile seizures that make the brain susceptible to the process of epileptogenesis are still poorly understood. In this context, the animal models of febrile seizures induced by hyperthermia (HS) allow the study of the molecular alterations from a temporal perspective. Thus, we investigated the temporal alterations in the profiles of gene expression and microRNAs in explants of the hippocampal CA3 region of Wistar rats, here obtained at four-time intervals after the hyperthermal insult on the eleventh postnatal day (P11). Time intervals were selected to evaluate the acute (P12), latent (P30 and P60) and chronic (P120) phases. Transcriptomic analysis consisted of constructing gene co-expression networks, allowing the identification of gene modules related to selected time intervals. Genes were also characterized hierarchically identifying those that control the robustness of gene co-expression networks (hubs). In addition, the differential expression profile of microRNA and the integrated analysis of microRNA expression and hub\'s gene expression were evaluated. The results of this work showed that: i) hyperthermic insults lead to important changes in cerebral development and functioning related to febrile seizures; ii) each time interval shows a transcriptomic signature, probably reflecting the process from epileptogenesis to brain readaptation after the initial precipitating insult; iii) this process involves a mechanism of regulation of gene co-expression networks by microRNAs. These results suggest that transcriptional changes triggered by febrile insults may lead to neuronal reprogramming and chromatin remodeling, making the brain susceptible to the chronic epileptic process. Human epilepsy triggered by febrile insults in childhood is related to resistance to antiepileptic drugs and no anti-epileptogenic drug was developed so far. Therefore, a better understanding of the temporal mechanisms involved in the development of chronic epilepsy is mandatory in order to discover new therapeutic targets and, eventually, anti-epileptogenic drugs
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Perfil de expressão de microRNAs e análise computacional de vias moleculares moduladas por microRNAs em tumor carcinoide de pulmão

Seneda, Ana Laura January 2019 (has links)
Orientador: Patricia Pintor dos Reis / Resumo: Introdução: O tumor carcinoide do pulmão pertence ao tipo neuroendócrino das neoplasias pulmonares. Devido à sua baixa incidência (~2%), pouco se conhece sobre suas alterações moleculares. Os microRNAs (miRNAs) têm importante papel na regulação gênica e têm sido associados ao câncer como biomarcadores diagnósticos, prognósticos e preditivos. Objetivos: Determinar o perfil global de expressão de miRNAs em tumores carcinoides do pulmão e identificar (in silico) vias moleculares envolvendo os miRNAs desregulados e genes-alvo preditos. Material e Métodos: Dois fragmentos de um tumor carcinoide típico e sua metástase correspondente foram obtidos, o RNA extraído de cada amostra e analisado na plataforma TaqMan Low Density Array (TLDA), a qual contém sondas para 384 miRNAs. Os dados foram analisados no Expression Suite software. Adicionalmente, 7 tumores (5 carcinoides típicos e 2 atípicos) foram utilizados para análise de expressão de 2,578 miRNAs na plataforma GeneChip™ miRNA 4.0 e os dados analisados utilizando o Transcriptome Analysis Console software. A análise estatística dos dados foi realizada para identificação dos miRNAs significativamente (p<0,05) alterados. Métodos de análise in silico incluíram a identificação de mRNAs-alvo dos miRNAs e vias moleculares de tumorigênese. Resultados e Discussão: No tumor carcinoide típico e metástase (TLDA), 15 miRNAs estavam com expressão comumente diminuída, os quais regulam genes associados a vias de resposta imune adaptativa. Adiciona... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Introduction: Lung carcinoid tumors are a type of neuroendocrine lung neoplasia. Due to its low incidence (~2%), little is known about the molecular alterations associated with these tumors. microRNAs (miRNAs) have an important role in gene regulation and have been associated with cancer as diagnostic, prognostic and predictive biomarkers. Objectives: To determine the global expression miRNA profiles of lung carcinoid tumors and to identify (in silico) molecular pathways including deregulated miRNAs and predicted target-genes. Material and Methods: Two fragments of a typical carcinoid tumor and its corresponding metastasis were obtained, the RNA extracted and analyzed using the TaqMan Low Density Array (TLDA) platform containing 384 miRNAs. Data were analyzed using Expression Suite software. Additionally, 7 tumors (5 typical and 2 atypical carcinoids) were used for expression analysis of 2,578 miRNAs in the GeneChip™ miRNA 4.0 platform and data were analyzed using the Transcriptome Analysis Console software. Statistical analysis was performed to identify the significantly (p<0,05) deregulated miRNAs. In silico analyses methods included the identification of miRNA target genes (and enriched pathways. Results and Discussion: In the typical carcinoid tumor and metastasis (TLDA data), 15 miRNAs were commonly down-regulated and these modulate genes associated with the adaptive immune system pathway. Additionally, the comparison of typical carcinoids or atypical vs. normal (GeneChi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Integrative analysis of microRNAs and mRNAs involved in regulation of intramuscular fat deposition in Nelore cattle / Análise de integração de dados de microRNAs e mRNAs envolvidos na regulação da deposição de gordura intramuscular em bovinos Nelore

Gabriella Borba de Oliveira 16 February 2017 (has links)
The amount of intramuscular fat can influence the sensory characteristics and nutritional value of beef, thus the selection of animals with adequate fat content for consumer becomes important. Intramuscular fat is a complex trait that is difficult to measure and there is growing knowledge about the genes and pathways that control the biological processes involved in fat deposition in muscle. MicroRNAs (miRNAs) are well conserved class of non-coding small RNAs that modulate gene expression of a range of functions in animal development and physiology. This study aimed to identify differentially expressed (DE) miRNAs, regulatory candidate genes and co-expression networks using mRNAs and miRNAs expression data from the Longissimus dorsi muscle of 30 Nelore steers with extreme genomic estimated breeding values (GEBV) for intramuscular fat (IMF) content. The differential expression analysis between the miRNA data from animals with extreme GEBV values for IMF identified six DE miRNAs. Functional annotation of target genes for these microRNAs indicates that PPARs signaling pathway is involved with IMF deposition. Regulatory candidate genes such as SDHAF4, FBXO17, ALDOA and PKM were identified by partial correlation with information theory (PCIT), phenotypic impact factor (PIF) and regulatory impact factor (RIF) approaches from integrated miRNAs-mRNAs expression data. Two DE miRNAs, bta-miR-143 and bta-miR-146b, upregulated in Low IMF group, were also correlated with regulatory candidate genes, which were functionally enriched for GO terms for fatty acids oxidation. Co-expression networks identified several modules related to immune system, protein metabolism, energy metabolism and glucose catabolism by weighted correlation network analysis (WGCNA), which showed possible interaction and regulation between mRNAs and miRNAs. This study contributes to our understanding of regulatory mechanisms of gene signaling networks involved in fat deposition process. Glucose metabolism and inflammation process were the main pathways found in integrative mRNAs-miRNAs analysis and showed to influence intramuscular fat content in beef cattle. / A quantidade de gordura intramuscular pode influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina, assim, a seleção de animais com conteúdo de gordura adequado para o consumidor torna-se importante. A gordura intramuscular é uma característica complexa, de difícil medição e há um conhecimento crescente sobre os genes e vias que controlam os processos biológicos envolvidos na deposição de gordura no músculo. MicroRNAs (miRNAs) são uma classe bem conservados de pequenos RNAs não-codificantes, que modulam a expressão gênica de uma gama de funções no desenvolvimento e fisiologia animal. Este estudo objetivou identificar miRNAs diferencialmente expressos (DE), genes reguladores candidatos e redes de co-expressão usando dados de expressão de mRNAs e miRNAs do músculo Longissimus dorsi de 30 novilhos Nelore com valores genéticos genômicos estimados (GEBV) extremos para conteúdo de gordura intramuscular (IMF). A análise de expressão diferencial entre os dados de miRNA de animais com valores extremos de GEBV para o IMF identificou seis miRNAs DE. A anotação funcional de genes alvos destes microRNAs indica que a via de sinalização de PPAR está envolvida com a deposição de IMF. Os genes reguladores candidatos, tais como SDHAF4, FBXO17, ALDOA e PKM foram identificados pelas abordagens de correlação parcial com teoria da informação (PCIT), fator de impacto fenotípico (PIF) e fator de impacto regulatório (RIF) a partir de dados integrados de expressão de mRNAs-miRNAs. Dois miRNAs, bta-miR-143 e bta-miR-146b, com alta expressão no grupo de baixo conteúdo de IMF, também foram correlacionados com genes reguladores candidatos, os quais foram funcionalmente enriquecidos para termos GO relacionados a oxidação de ácidos graxos. As redes de co-expressão identificaram vários módulos relacionados ao sistema imunológico, ao metabolismo das proteínas, ao metabolismo energético e ao catabolismo da glicose através da análise ponderada da rede de correlação (WGCNA), que mostrou possível interação e regulação entre mRNAs e miRNAs. Este estudo contribui com a compreensão dos possíveis mecanismos reguladores das redes de sinalização genética envolvidas no processo de deposição de gordura. O metabolismo da glicose e o processo de inflamação foram as principais vias encontrados na análise integrada de mRNA-miRNA e mostraram estar associadas ao conteúdo de gordura intramuscular em bovinos de corte.
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The role of the microRNA156/SPL pathway during the primary root growth of Arabidopsis thaliana

Rojas, Carlos Barrera January 2019 (has links)
Orientador: Fábio Silveira Nogueira / Resumo: O sistema radicular (SR) é importante pela ancoragem e obtenção de água e nutrientes. Em eudicotiledôneas, como Arabidopsis, o crescimento da raiz primária (RP) é afetado por fitormônios, especialmente pelo balanço entre auxina que controla a divisão celular, e citocinina que modula a diferenciação celular; também, os microRNAs (miRNAs), um sub-conjunto de pequenos RNAs que regulam pós-transcricionalmente seus alvos, regulam o crescimento da RP. O microRNA156 (miR156) e seus alvos, membros da família SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL), constituem uma via genética que regula vários processos do desenvolvimento, incluindo desenvolvimento da raíz; porém, durante o crescimento da RP, não foi observado o efeito da via miR156/SPL, e da interação com auxina e citocinina; assim, foi avaliada essa interação durante o crescimento da PR regulado pelo tamanho do meristema da raiz (TMR) em Arabidopsis. Usando ferramentas genéticas e moleculares foi analizada a expressão de genes MIR156 e SPLs, o comprimento da RP, o TMR, as taxas de divisão celular, e as respostas de auxina e citocinina durante o crescimento da RP. Os genes MIR156 e SPLs possuem padrões de expressão opostos. Níveis altos do miR156 (nas plântulas p35S :: MIR156A), leva a menor comprimento da RP, TMR reduzido, menores taxas de divisão celular, respostas mais baixas e altas à auxina e citocinina respectivamente; em contraste, níveis severamente reduzidos do miR156 maduro disponível (nas plantas MIM156) conducem a e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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Células-tronco provenientes de cordão umbilical humano atenuam a senescência renal induzida por injúria renal aguda secundária à lesão de isquemia e reperfusão em ratos / Human umbilical cord derived stem cells attenuate ischemic acute kidney injury-induced premature senescence in rats

Rodrigues, Camila Eleuterio 28 April 2015 (has links)
A injúria renal aguda representa um estado de senescência precoce induzida por estresse, e as células-tronco mesenquimais podem ser uma alternativa para seu tratamento. Células-tronco jovens reduzem o fenótipo de envelhecimento em rins quando comparadas a células idosas. O objetivo deste estudo foi avaliar se o tratamento com jovens células-tronco mesenquimais derivadas de cordão umbilical humano podem interferir na senescência renal induzida por lesão de isquemia-reperfusão em ratos. Ratos machos foram submetidos ao modelo de isquemia de artérias renais bilateralmente por 45 minutos, com reperfusão após, e alguns animais receberam 1 X 106 células por via intraperitoneal após 6 horas da indução da lesão. Os animais foram eutanasiados no segundo ou no sétimo dia pós-isquêmico. No segundo dia após a lesão de isquemia-reperfusão, o tratamento com as células melhorou a filtração glomerular e a função tubular, melhorou a expressão renal de aquaporina-2 e reduziu a infiltração de macrófagos nos rins. Proteínas relacionadas à senescência (-galactosidase, p21, p16 e fator de transformação do crescimento ) e microRNAs (mir-29a e miR-34a) estiveram com a expressão aumentada após a isquemia-reperfusão, e houve redução nesses parâmetros com o tratamento. A redução na expressão de Klotho e o estado pró-oxidativo gerados pela isquemia-reperfusão também foram revertidos pelo tratamento. A senescência induzida pela injúria renal aguda é um processo independente de telômeros. Ao sétimo dia pós-lesão, os ratos isquêmicos mantinham defeito de concentração urinária, que foi revertido nos animais tratados. Além disso, o tratamento reduziu o índice de necrose tubular aguda em tecido renal e reduziu o infiltrado macrofágico túbulo-intersticial. O marcador pró-senescência p16 foi completamente restabelecido nos animais tratados. Nossos dados demonstram que o tratamento com jovens células-tronco mesenquimais derivadas de cordão umbilical humano atenua a resposta inflamatória e de estresse oxidativo que ocorre na injúria renal aguda, e reduz a expressão de proteínas e microRNAs relacionados à senescência. Nossos achados expandem as perspecivas para o tratamento da injúria renal aguda / Acute kidney injury represents a status of premature stress-induced senescence, and mesenchymal stem cells are an alternative for treatment. Young stem cells reduce aging phenotype in kidneys when compared to old cells. The objective of this study was to evaluate if treatment with young human umbilical cord mesenchymal stem cells could interfere in kidney senescence induced by renal ischemia-reperfusion in rats. Male rats were induced to ischemia-reperfusion injury by 45-minutes clamping of both renal arteries; some rats received 1X106 cells intraperitonally six hours later. Rats were euthanatized on post-renal ischemia reperfusion days two and seven. At day 2 after ischemia-reperfusion injury, treatment with cells improved glomerular filtration, tubular function, improved renal expression of aquaporin 2 and decreased macrophage kidney infiltration. Senescence-related proteins (?-galactosidase, p21, p16 and transforming growth factor ?) and microRNAs (miR-29a and miRNA-34a) were overexpressed after ischemia-reperfusion, and reversed by the treatment. The Klotho reduced expression and the pro-oxidative status induced by ischemia-reperfusion were reversed by the treatment. Senescence induced acute kidney injury is a telomere-independent process. At day 7, ischemic rats maintained urinary concentrating defect, which is reversed in treated animals. Moreover, treatment decreased the index of acute tubular necrosis in kidney tissue and decreased macrophage kidney infiltration. Senescence marker p16 was completely restored in treated animals. Our data demonstrate that young human umbilical mesenchymal stem cells treatment attenuates the inflammatory and oxidative stress response occurring in acute kidney injury, and reduces the protein and microRNA expression related to senescence. Our findings broaden the perspectives for the treatment of AKI
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Expressão e regulação do gene VEGFA por microRNAs em cirrose hepática e carcinoma hepatocelular.

Oliveira, André Rodrigueiro Clavisio Pereira 27 November 2015 (has links)
Submitted by Fabíola Silva (fabiola.silva@famerp.br) on 2017-08-03T12:25:59Z No. of bitstreams: 1 andrerodrigueirocpdeoliveira_tese.pdf: 1590220 bytes, checksum: c85526dbe8e00ebf97a87b9215d49485 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-03T12:25:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 andrerodrigueirocpdeoliveira_tese.pdf: 1590220 bytes, checksum: c85526dbe8e00ebf97a87b9215d49485 (MD5) Previous issue date: 2015-11-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP / Introduction: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a primary liver tumor and the sixth most common type of cancer. Liver cirrhosis (LC) and viral hepatitis are their main risk factors. Injured tissues and development process tissues need new blood vessels, i. e., angiogenic process, that initiates by means of vascular endothelial growth factors secretion, that is translated by VEGFA gene and regulated by non-coding RNA, miRNA, that consists of a single strand of approximately 22 nucleotides and has the function of binding to mRNA strand, to inhibit protein translation. Objectives: To quantify VEGFA gene expression and 17 miRNAs predicted as its regulator in HCC and liver cirrhosis; to assess VEGFA gene expression in relation to miRNAs expression and quantify VEGFA protein expression in HCC and liver cirrhosis tissues. Patients and methods: Sixteen samples of HCC tissue, 23 samples of liver cirrhosis tissue and 12 samples of normal liver tissue were collected. Total RNA and proteins were isolated by mirVana PARIS kit. VEGFA gene mRNA quantification and 17 miRNAs predicted as regulators expression was performed by real time quantitative PCR. Customized plates, TaqMan miRNA custom plate, were used for miRNAs. Statistical analysis was performed by one sample t test, Wilcoxon tests and Mann-Whitney test. Results: VEGFA gene expression was found downregulated in HCC and there is negative correlation between gene expression and tumor extension. MicroRNA hsa-miR-637 has showed significance and was down-regulated on samples (mean 0.2003, p=0.0004) in LC, whereas miRNAs hsa-miR-15b (median 0.04015; p=0.0005), hsa-miR-125b (median 0.01876; p=0.0005), hsa-miR-423 (median 0.02650; p=0.0005), hsa-miR-424 (median 0.00462; p=0.0156), hsa-miR-494 (median 0.00877; p=0.0010), hsa-miR-497 (median 0.04487; p=0.0005), hsa-miR-612 (median 0.00679; p=0.0039) and hsamiR-637 (median 0.00166; p=0.0039) are down-regulated in HCC. Conclusions: VEGFA gene expression is down-regulated in HCC. MicroRNA hsa-miR-637 is down-regulated in LC. MicroRNAs hsa-miR-15b, hsa-miR-125b, hsa-miR-423, hsa-miR-424, hsa-miR-494, hsa-miR-497, hsa-miR-612 e hsa-miR-637 are down-regulated in HCC. VEGFA protein expression is low in HCC, corroborating to gene expression found in HCC. / Introdução: O Carcinoma hepatocelular (CHC) é o tipo de tumor primário do fígado e o quinto tipo de câncer mais comum. A cirrose hepática (CH) e as hepatites virais são seus principais fatores de risco. Tecidos lesionados e em processo de crescimento necessitam de novos vasos sanguíneos, ou seja, processo angiogênico, que é iniciado por meio da secreção de fatores de crescimento endoteliais vasculares. Este é produzido a partir do gene VEGFA e regulado por RNA não codificante, o microRNA, que é constituído por uma fita simples de aproximadamente 22 nucleotídeos e tem a função de ligação ao mRNA, para inibição da tradução de proteínas. Objetivos: Quantificar a expressão do gene VEGFA e 17 miRNAs preditos como seus reguladores em CHC e cirrose hepática; avaliar a expressão do gene VEGFA em relação à expressão dos miRNAs e quantificar a expressão das proteínas VEGFA em CHC e cirrose hepática. Casuística e métodos: Foram coletadas 16 amostras de tecido de CHC, 23 amostras de tecido cirrose hepática e 12 amostras de tecido hepático normal para controle. A extração de RNA e proteínas totais foi realizada por meio do kit mirVana PARIS. A quantificação do mRNA do gene VEGFA e dos 17 miRNAs selecionados preditos como reguladores do gene foi realizada por meio da técnica de PCR quantitativa em tempo real. Para os miRNAs foram utilizadas placas customizadas TaqMan miRNA custom plates. A análise estatística foi realizada por teste t de uma amostra, teste de Wilcoxon e teste de Mann-Whitney. Resultados: O gene VEGFA foi encontrado em expressão diminuída em CHC e há correlação negativa entre a expressão e a extensão do tumor. O miRNA hsa-miR-637 mostrou significância e sua expressão foi encontrada diminuída nas amostras (média=0,2003, p=0,0004) em CH, enquanto que os miRNAs hsa-miR-15b (mediana 0,04015; p=0,0005), hsa-miR- 125b (mediana 0,01876; p=0,0005), hsa-miR-423 (mediana 0,02650; p=0,0005), hsa-miR-424 (mediana 0,00462; p=0,0156), hsa-miR-494 (mediana 0,00877; p=0,0010), hsa-miR-497 (mediana 0,04487; p=0,0005), hsa-miR-612 (mediana 0,00679; p=0,0039) e hsa-miR-637 (mediana 0,00166; p=0,0039) estão em expressão diminuída em CHC. Conclusão: A expressão do gene VEGFA encontra-se diminuída em CHC. O microRNA hsa-miR-637 encontra-se em expressão diminuída em CH. Os miRNAs hsa-miR-15b, hsa-miR-125b, hsa-miR- 423, hsa-miR-424, hsa-miR-494, hsa-miR-497, hsa-miR-612 e hsa-miR-637 encontram-se em expressão diminuída em CHC. A expressão das proteínas VEGFA está diminuída em carcinoma hepatocelular, corroborando com o encontrado para a expressão gênica em CHC.
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MicroRNAs circulantes como preditores do resultado cirúrgico da epilepsia do lobo temporal mesial com esclerose hipocampal / Circulating microRNAs as surgical outcome predictors of mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis

Serguey Malaquias de Almeida 15 April 2016 (has links)
Alta prevalência, farmacorresistência e bom prognóstico cirúrgico são algumas das características clínicas que tornam a epilepsia do lobo temporal mesial com esclerose hipocampal (ELTM-EH) uma das mais importantes formas de epilepsia. Ela é o modelo da epilepsia cirurgicamente curável. Infelizmente, cerca de 10% dos pacientes evoluem com resultado cirúrgico insatisfatório. A ELTM-EH está associada a alterações amplas do perfil de expressão dos microRNAs (miRNAs) do hipocampo. Recentemente, constatou-se a existência de miRNAs estáveis no sangue periférico e em outros fluidos corporais, comprovadamente aplicáveis como biomarcadores, cuja abrangência vai do diagnóstico à resposta terapêutica. Tendo isso em vista, a pesquisa partiu do seguinte questionamento: é possível a identificação, no sangue periférico, de assinaturas moleculares por miRNAs que predigam o resultado do tratamento cirúrgico da ELTM-EH? Por meio de técnicas de biologia molecular, avaliaram-se amostras de sangue e hipocampo de pacientes submetidos à lobectomia temporal anterior em consequência de ELTMEH farmacorresistente. As amostras eram representativas de indivíduos com resultado cirúrgico favorável (Engel IA) e desfavorável (Engel III e IV). Com a técnica de microarray obteve-se o perfil de expressão de miRNAs das amostras triadas e chegou-se a um conjunto de seis miRNAs candidatos a biomarcadores de prognóstico cirúrgico: miR-92b-3p; miR-1238-3p; miR-1181; miR-636; miR- 1229-3p e miR-486-5p. Em seguida, com a técnica de PCR em tempo real, quantificou-se a expressão destes seis miRNAs e, a partir da otimização de um ponto de corte na escala de expressão, cada miRNA circulante foi apreciado como preditor de resultado cirúrgico. Assim, constatou-se hiperexpressão sanguínea dos seis miRNAs, sem distinção estatística entre os grupos Engel IA e Engel III-IV, hiperexpressão hipocampal do miR-486-5p no grupo Engel IA e hipoexpressão hipocampal do miR-636 nos grupos Engel IA e Engel III-IV. Na análise dos miRNAs circulantes como preditores de sucesso cirúrgico, o miR- 1238-3p exibiu uma sensibilidade de 40,00%, especificidade de 92,86% e acurácia de 65,52%. O conjunto miR-1238/miR1181 mostrou sensibilidade de 46,67%, especificidade de 85,71% e acurácia de 65,52%. O único miRNA circulante sondado como preditor de insucesso cirúrgico, o miR-636, revelou sensibilidade de 21,43%, especificidade de 93,33% e acurácia de 58,62% / A high prevalence, drug resistance and good surgical prognosis are some of the clinical characteristics that cause mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis (MTLE-HS) to be one of the most important forms of epilepsy. This condition is the model of surgically curable epilepsy, although unfortunately about 10% of the patients exhibit an unsatisfactory surgical outcome. MTLE-HS is associated with extensive changes in the expression profile of hippocampal microRNAs (miRNAs). It has been recently observed that stable miRNAs exist in peripheral blood and in other body fluids which have been proved to be applicable as biomarkers from diagnosis to therapeutic response. On this basis, the present investigation was based on the following question: is it possible to identify molecular signatures by peripheral blood miRNAS that predict the outcome of surgical treatment of MTLE-HS? Molecular biology techniques were used to evaluate blood and hippocampal samples of patients submitted to anterior temporal lobectomy as a consequence of drug-resistant MTLE-HS. The samples were representative of patients with a favorable (Engel IA) and unfavorable (Engel III and IV) surgical outcome. The microarray technique was used to obtain the expression profile of miRNAs in the samples, with a set of six miRNAs being reached as candidate biomarkers for surgical prognosis: miR-92b-3p, miR-1238- 3p, miR-1181, miR-636, miR-1229-3p, and miR-486-5p. Next, real-time PCR was used to quantitate the expression of these six miRNAs and, based on the optimization of a cut-off point on the expression scale, each circulating miRNA was evaluated as surgical outcome predictor. We observed blood hyperexpression of the six miRNAs with no significant difference between the Engel IA and Engel IIIIV groups, hippocampal hyperexpression of miR-486-5p in the Engel IA group, and hippocampal hypoexpression of miR-636 in the Engel IA and Engel III-IV groups. Analysis of circulating miRNAs as predictors of surgical success revealed that miR-1238-3p exhibited 40.00% sensitivity, 92.86% specificity and 65.52% accuracy. The miR-1238/miR1181 set showed 46.67% sensitivity, 85.71% specificity and 65.52% accuracy. The only circulating miRNA evaluated as a predictor of surgical failure, miR-636, showed 21.43% sensitiviy, 93.33% specificity, and 58.62% accuracy
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Resistência à insulina na caquexia associada ao câncer e na síndrome metabólica: papel dos macrófagos ativados pela insulina e do miRNA-21-5p. / Insulin resistance in cancer cachexia and metabolic syndrome: role of insulin activated macrophages and miRNA-21-5p.

Camargo, Rodolfo Gonzalez 15 July 2016 (has links)
A Caquexia associada ao câncer (CC) e a Síndrome Metabólica (MetS) apresentam características comuns como inflamação e resistência à insulina. Na MetS, a resistência à insulina é compensada pela hiperinsulinemia, que pode contribuir para a resistência à insulina através do aumento da inflamação, em particular, no fígado, onde a concentração de insulina é mais elevada. Esta hipótese foi testada neste estudo. Células da linhagem humanas U937 foram diferenciadas em macrófagos e expostas à insulina, LPS e PGE2. A insulina induziu a expressão gênica de IL-1&#946; e IL-8 e potencializou a indução provocada por LPS, além de aumentar a indução de IL-1&#946; provocada por PGE2 e atenuar a inibição de TNF-&#945; causada por PGE2. Sobrenadantes de macrófagos tratados com insulina reduziram em hepatócitos a indução da glucoquinase dependente de insulina. Isso foi causado por citocinas contidas nos sobrenadantes, que ativaram ERK 1/2 e STAT3, resultando na fosforilação inibitória do substrato do receptor da insulina e a indução de SOCS3, respectivamente. MicroRNAs são protagonistas em doenças inflamatórias. Pacientes caquéticos exibiram níveis circulantes elevados dos mediadores pró-inflamatórios IL-6 e IL-8 e reduzidos do microRNA-21-5p em relação à pacientes não-caquéticos; a expressão do microRNA-21-5p correlaciona-se negativamente com níveis de IL-6. Isto indica que a hiperinsulinemia e a expressão do microRNA-21-5p diminuída podem contribuir para a inflamação e a resistência à insulina. / Cancer Cachexia (CC) and Metabolic Syndrome (MetS) share common issues as inflammation and insulin resistance. In MetS insulin resistance is compensated by hyperinsulinemia, which might contribute to insulin resistance by enhancing inflammation in particular in liver where insulin concentration is higher. This hypothesis was tested in this study. Cells of the human cell line U937 were differentiated into macrophages and exposed to insulin, LPS and PGE2. Insulin induced the gene expression of pro-inflammatory mediators like IL-1&#946; and IL-8 and enhanced the induction provoked by LPS. Insulin enhanced the induction of IL-1&#946; by PGE2 and attenuated the inhibition of TNF&#945; by PGE2. Supernatants of insulin-treated macrophages reduced insulin-dependent glucokinase induction in hepatocytes. This insulin resistance was caused by cytokines contained in the supernatants, which activated ERK1/2 and STAT3, resulting in inhibitory phosphorylation of insulin receptor substrate and induction of SOCS3, respectively. MicroRNAs are active players in inflammatory disorders. In cachectic cancer patients circulating levels of the pro-inflammatory mediators IL-6 and IL-8 were higher and microRNA-21-5p lower than in non-cachectic patients; microRNA-21-5p negatively correlated with IL-6. This indicates that hyperinsulinemia and diminished microRNA-21-5p expression might contribute to inflammation and insulin resistance.

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