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Proposta de automatização do sistema de contagem de bacterias em leite

Teixeira, Andre Mauricio 31 August 1999 (has links)
Orientadores: Elnatan Chagas Ferreira, Pilar Rodriguez de Massaguer / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-07-25T02:40:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Teixeira_AndreMauricio_M.pdf: 4863179 bytes, checksum: 7a9f0c9e3b894735e3c332f4a56ab7ab (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Os aparatos de laboratórios para análise que são usados para suprir as necessidades do Brasil na avaliação da qualidade do leite, são em sua maioria importados. O Departamento de Microeletrônica da Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação e a Faculdade de Engenharia de Alimentos da UNICAMP estão trabalhando com uma proposta de avaliação da contagem microbiológica no leite através de um método de contagem confiável, rápido e de forma automatizada. Hoje no Brasil utiliza-se o método de contagem em placas como padrão para a contagem microbiológica no leite e, com o tipo mais simples destes testes, leva-se pelo menos 48 horas para se obter os resultados. Este trabalho apresenta um método e uma futura proposta de automatização no mínimo noventa vezes mais rápido que o de contagem em placas chamado DEFT - Direct Epifluorescent Filter Technique, o que significa a possibilidade deste tipo de análise passar de análise de controle para análise de seleção. Foi feita uma detalhada descrição de cada método para a comparação em termos de tempo e custo de cada um e também um teste de correlação entre ambos com resultados acima do esperado. O domínio das técnicas foi imprescindível para criação da proposta do projeto inicial de automação. A fase de domínio da técnica DEFT trouxe uma inovação no procedimento que produziu uma melhora significativa nos resultados finais, além do uso de um sistema de filtração projetado pela equipe de pesquisadores e técnicos envolvidos no projeto. Com este projeto conseguiu-se resultados equivalentes e em alguns casos até melhores do que os de pesquisadores internacionais da área e com custos 75% menores. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The laboratory wares which are used for analysis and which supply the needs of Brazil in the evaluation of the quality of milk are, in most of the cases, imported. The Department of Microelectronics at School of Electrical Engineering, together with Faculty of Food Engineering (both at UNICAMP) are working with a proposal for evaluation of microbiological count in milk using a reliable and fast count method in an automated form. The plate count method is used currently in Brazil as a standard for the microbiological count in milk, and the most simple type of these tests takes at least 48 hours to obtain the results. This work presents a method and a future automation proposal at least ninety times faster than the plate count called DEFT - Direct Epifluorescent Filter Technique, which means that this type of analysis can change from control analysis to selection analysis. It was made a detailed description of each method for the comparison in terms of time and cost and also a correlation test between both of them, and the results obtained were better than the expected. The domain of the techniques was indispensable the creation of the proposal of the initial project of automation. The phase of domain for the DEFT techinique brought not only an innovation for the procedure that produced a significative improvement for the final results but also the use of a filtration system projected by the researchers and technicians involved in the project. With this project, results equivalent to those achieved by foreign researches of the area have been obtained, and in some cases these results were even better and 75% less expensive. ... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica
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Calculo dos parametros de crescimento microbiano por computador

Dall'Oca, Sergio Roberto, 1948- 14 July 2018 (has links)
Orientador : Fumio Yokoya / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-14T13:16:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dall'Oca_SergioRoberto_M.pdf: 11236354 bytes, checksum: d94be7c1dd3035464483c507d712d9ff (MD5) Previous issue date: 2018-07-14T10:16:28Z / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos
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Biodegradación de alquilbenceno sulfonato lineal por un consorcio microbiano aislado del río Rímac y su estuario

Manrique Guzmán, Yessenia Cristhel January 2016 (has links)
Verifica la presencia de consorcios microbianos en el río Rímac, así como su aislamiento y caracterización, y cuantifica su capacidad degradativa sobre los detergentes del tipo alquilbenceno sulfonato lineal (LAS). / Tesis
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Comparação entre acidform gel e metronidazol gel para o tratamento da vaginose bacteriana : ensaio clinico piloto fase II

Camargo, Rodrigo Pauperio Soares de 26 November 2004 (has links)
Orientador: Jose Antonio Simões / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T01:21:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Camargo_RodrigoPauperioSoaresde_D.pdf: 459473 bytes, checksum: ffbdc002a0d713fadd1c6d9780989133 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: OBJETIVO: Determinar a segurança do ACIDFORM gel intravaginal por cinco dias consecutivos e comparar os índices de cura com o mesmo regime de metronidazol gel para o tratamento de vaginose bacteriana (VB). METODOLOGIA: O estudo foi um ensaio clínico piloto, Fase II, duplo-cego, randomizado com 30 mulheres avaliadas em 3 consultas (admissão, uma semana e um mês após o tratamento). O diagnóstico de VB foi realizado utilizando-se os critérios de Amsel e Nugent. Outras infecções cervicovaginais concomitantes foram afastadas através de culturas e exames específicos. A formulação testada foi o ACIDFORM gel, um novo microbicida vaginal com formulação bioadesiva e tampão-ácida e o controle ativo foi o metronidazol gel. As variáveis estudadas foram: cura objetiva, cura subjetiva, aceitabilidade geral, irritação vulvovaginal, cultura positiva para andida sp. e eventos adversos (EA) após o uso dos produtos Testes não-paramétricos foram usados para as comparações estatísticas que aplicou o teste qui-quadrado com correção de continuidade, o teste exato de Fisher e o teste de Mann-Whitney. O nível de significância estatística ré-estabelecido foi de 5%. RESULTADOS: Após uma semana do final do tratamento o índice de cura objetiva do ACIDFORM foi de 23% e do metronidazol foi de 88% e (p<0,001). Após um mês do tratamento o índice de cura objetiva do ACIDFORM foi de 8% e do metronidazol foi de 53% (p<0,01). A cura subjetiva foi referida por todas as mulheres que relataram cura parcial ou total após o tratamento e, portanto, não se correlacionou bem com a cura objetiva. A aceitabilidade geral do tratamento foi de 92% para o ACIDFORM e de 100% para o metronidazol (p=0,433). Durante o uso dos produtos, 31% das mulheres tratadas com ACIDFORM e 6% das tratadas com metronidazol perceberam alguma irritação vulvovaginal (p=0,138). A cultura para Candida sp. positiva foi semelhante entre os grupos, após o tratamento da VB. A ocorrência de EA foi de 4 casos para o grupo ACIDFORM e 4 casos para o grupo metronidazol, sendo que não ocorreu nenhum EA sério nos dois grupos. CONCLUSÃO: O ACIDFORM gel intravaginal teve um índice de cura para VB significativamente inferior ao metronidazol tanto a curto-prazo (uma semana) quanto a longo-prazo (um mês após o tratamento) e mostrou-se ineficaz como tratamento alternativo para a VB. Entretanto, o ACIDFORM gel intravaginal por cinco dias consecutivos mostrou-se seguro e com boa aceitabilidade geral neste estudo piloto / Abstract: OBJECTIVE: To determine the security of ACIDFORM gel intravaginaly for five consecutive days and to compare the cure rates of the same regime of metronidazole gel for the treatment of bacterial vaginosis (BV). METHODS: This study was a Phase II pilot clinical trial, double-blinded and randomized study with 30 women evaluated in 3 visits (admission, one week and one month after treatment). The diagnosis of BV was based on the Amsel's and the Nugent's criteria. Other cervicovaginal infections were also ruled out through specific cultures and tests. The test product was ACIDFORM gel, a new bioadesive acid-buffer vaginal microbicide. The active control was metronidazole gel. The following variables were evaluated: objective cure rates, subjective cure rates, overall acceptability, vulvovaginal irritation, presence of a positive culture Candida sp. and adverse events (AE) after product use. Non-parametric tests were applied for statistical comparison as the Qui-Square test, the Fisher¿s exact test and the Mann- Whitney test. The statistical significant level was established as 0.05. RESULTS: After one week of treatment the cure rates for the ACIDFORM group was 23% and for the metronidazole group was 88% (p<0.001). After one month, the cure rates for the ACIDFORM group was 8% and for the etronidazole group was 53% (p<0.01). The subjective cure was reported by all women whom related partially or totally cured. However, there was no correlation between the subjective and the objective cure rates. The overall acceptability was 92% for the ACIDFORM group and 100% for the metronidazole group (p=0.433). During the product use, 31% of women treated with ACIDFORM and 6% treated with metronidazole reported some vulvovaginal irritation (p=0.138). The positive culture of Candida sp. was quite similar in both groups after treatment. AE occurred in four women of ACIDFORM group and in four women of the metronidazole group. There was no serious AE in either of both groups. CONCLUSION: Intravaginal ACIDFORM gel had a significantly lower cure rate when compared to metronidazol cure rate for one week and one month after treatment. Nevertheless, ACIDFORM gel intravaginally for five consecutive days had showed to be safe and with a good overall acceptability in this pilot study / Doutorado / Tocoginecologia / Doutor em Tocoginecologia
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Produção, purificação e estudos das propriedades da isoamilase de Flavobacterium sp

Sato, Helia Harumi, 1952- 17 July 2018 (has links)
Orientador : Yong Kun Park / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-17T05:52:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sato_HeliaHarumi_M.pdf: 2876572 bytes, checksum: bd18e28ff6600fc553957299a08fc40d (MD5) Previous issue date: 1979 / Resumo: Duas mil quatrocentas e sessenta linhagens de microrganismos foram isoladas do solo e testadas quanto à capacidade de desramificar a amilopectina. Foram encontradas três linhagens de bactérias produtoras de enzima amilolítica desramificante. Uma das linhagens, classificada como Flavobacterium sp produziu maior quantidade de enzima. A enzima desramificante de Flavobacterium sp hidrolizou as ligações a-1,6 glicosídicas da amilopectina e glicogênio, formando cadeias curtas de amilose mas não hidrolisou as ligações a-1,6 glicosídicas do pululano (polímero de maltotriose unidas pela extremidade por ligações a-1,6 glicosídicas). Portanto, a enzima desramificante de Flavobacterium sp é similar à outras isoamilases (glicogênio glucanohidrolase EC 3. 2.1.68). Estudou-se a produção e a purificação de isoamilase de Flavobacterium sp e determinou-se as características da enzima purificada. A eletroforese em gel de poliacrilamida da enzima purificada indicou uma única banda de atividade. O peso molecular foi estimado em 126.000 através do método de filtração em gel. O pH ótimo e temperatura ótima da enzima foram 6,3 e 40°C respectiva mente. A atividade enzimática foi ligeiramente inibida por NiSO4, CoCl2, Fe2(SO4)3, ZnSO4, CuSO4, MnSO4 e fortemente inibida por HgCl2 e AgNO3. Sais minerais como CaCl2, MgCl2, NaCl, BaCl2 e Li2O2 não inibiram a atividade enzimática. dietilditiocarbamato de sódio (10 mM), ázida de sódio (10 mM), sodium bisulfite (10 mM), iodoacetato (10 mM), p-hidroximercuribenzoate (10 mM), mercaptoetanol (10 mM) não inibiram a atividade enzimática. Por isto,grupos sulfidrilas da molécula da enzima não estão envolvidos na atividade catalítica. A ação simultânea da isoamilase de Flavobactevium e (B-amilase de soja hidrolizou quase completamente o amido de batata, amilo pectina de milho ceroso e glicogênio de ostra para maltose / Abstract: Two thousand four hundred sixty strains of microorganisms were isolated from soil and examined for their capacity to debranch amylopectin. Three strains of bacteria were found to be producers of debranching enzyme. One strain, which is classified as Flavobacterium sp produced large amounts of the enzyme. The debranching enzyme from Flavobacterium sp hydrolyzed a-1,6 glucosidic linkage of amylopectin and glycogen, forming short chain amylose, but did not hydrolyze a-1,6 glucosidic linkage of pululan (polymer of a-1,6 maltotriose joined endwise). Therefore, the debranching enzyme of Flavobacterium sp is similar to other isoamylases (glucogen glucanohydrolase EC 3.2.1.68). Production and purification of the Flavobacterium. isoamylase - were attempted and characterization of the purified enzyme was performed. Polyacrylamide gel electrophoresis of the purified enzyme showed a single band of activity. The molecular weight was 126.000 as estimated by gel filtration method. Optimum pH and temperatura of the purified enzyme were 6,3 and 40°C, respectively. The enzyme activity was inhibited slightly by NiSO4, MnSO4, CoCl2, Fe2(SO4)3, ZnSO4 and CuSO4 and strongly by HgCl2 and AgNO3. Metal ions such as CaCl2, MgCl2, NaCl, BaCl2 and Li2SO4 did not inhibit the enzyme activity. Sodium diethildithio carbamate (10 mM), sodium azide (10 mM), sodium bisulfite (10 mM), iodoacetate (10 mM) , p-hydroxymercuribenzoate (10 mM), mercaptoethanol (10 mM) did not inhibit enzyme activity. Thus sulfydryl groups of the molecule are not involved in the catalytic activity. The simultaneous action of Flavobacterium isoamylase and soy bean B-amylase hydrolyzes almost completely potato starch, waxy maize amylopectin and oyster glycogen to maltose / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos
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Contribuição ao estudo da produção de dextrana-sacarase por Leuconostoc mesenteroides

Queiroz, Jose Humberto de 05 October 1987 (has links)
Orientador: Francisco Maugeri Filho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-18T02:17:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Queiroz_JoseHumbertode_M.pdf: 4196465 bytes, checksum: 529b826d83699307ea049ccd311aea8e (MD5) Previous issue date: 1987 / Resumo: A produção de dextrana-sacarase, pelo Leuconostoc mesenteroides NRRL B-512(F), foi estudada para fermentações em frascos agitados e mini-fermentadores em batelada e batelada alimentada. Foram testados meios de cultura utilizando melaço, água de maceração de milho, extrato de levedura e sacarose. Na fermentação em frascos agitados, verificou-se uma baixa produção de enzima, não havendo diferenças significativas para os meios com melaço ou sacarose pura. Em mini-fermentadores o controle de pH promoveu um aumento de aproximadamente 60% para o meio padrão e 40% para os meios com melaço. Com fermentações em batelada alimentada produção de dextrana-sacarase foi aumentada de 3-4 vezes. Ds melhores resultados foram conseguidos em meio padrão, chegando no final de 10 horas com 35 UDS/ ml. Nos meios com melaço e água de maceração de milho (AMM) os melhores resultados foram conseguidos com alimentação contínua de melaço. Nessas condições a atividade máxima ficou em torno de 80 UDS/ ml / Abstract: The production of dextransucrase by Leuconostoc mesenteroides in batch and feed batch fermentation was studied. A culture medium containing molasses, corn steep water, yeast-extract and sucrose was tested. In the batch fermentation system the enzyme production was low, and was not significantly affected by the culturel medium. The pH control in the mini-ferm increased the dextransucrase production by c. 60% for the standard medium and 40% for the molasses medium. With feed batch fermentation, the enzyme production increased 3-4 fold. The best results were obtained when the standard medium was used and the maximum enzyme activity was 95 DSU/ml after 10 hs. Of fermentation. When the medium with molasses and corn steep liquor medium was used, the best result was c. 80 DSU/ml with continous feeding with molasses / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos
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Estudo comparativo da acção dos microorganismos mesófilos e termófilos na biolixiviação de um minério de cobre sulfuretado

Fernandes, Márcia Cristina da Fonseca January 2009 (has links)
Tese de mestrado. Engenharia de Minas e Geo-Ambiente. Universidade do Porto. Faculdade de Engenharia. 2009
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Caracterización de las regiones determinantes de resistencia a antimicrobianos de cepas de Bartonella bacilliformis aisladas de zonas endémicas del Perú

Espinoza Culupú, Abraham Omar January 2014 (has links)
Bartonella bacilliformis, agente causal de la Enfermedad de Carrión transmitida por insectos flebotominos del género Lutzomyia y otros, es una endemia ancestral que afecta especialmente a la población más pobre de nuestros valles interandinos. En el Perú está presente en 12 de 25 departamentos. Es endémica en Ancash, Cajamarca, Amazonas, Cusco, La Libertad y Piura. Pocas son las investigaciones acerca de la susceptibilidad in vitro a antimicrobianos de Bartonella bacilliformis, no se cuenta con una prueba estandarizada de antibiograma para esta bacteria, como tampoco se conocen los mecanismos de resistencia ni las secuencias de los genes asociados a dicha resistencia. Por consiguiente, se ha planteado evaluar la resistencia antimicrobiana in vitro de cepas de Bartonella bacilliformis aisladas de zonas endémicas, mediante métodos convencionales y métodos moleculares, con la finalidad de conocer la resistencia a drogas de las cepas circulantes en las zonas endémicas. En el presente trabajo se obtuvieron muestras sanguíneas de 47 pacientes procedentes de Piura, Cusco y Ancash las cuales se sembraron en placas de agar sangre e incubaron a 30°C con 5% CO2. Se ha estandarizado un método de difusión por disco (para el antibiograma) y la prueba de Épsilon (para determinar la concentración mínima inhibitoria) para el estudio in vitro de la susceptibilidad antimicrobiana de B. bacilliformis, empleando los aislados clínicos y una cepa del Instituto Pasteur de Francia. Luego se procedió a extraer el DNA genómico, amplificar los genes mencionados, secuenciarlos y analizarlos mediante herramientas bioinformáticas. Se obtuvieron 3 cultivos positivos. Las cepas fueron sensibles a la ciprofloxacina, gentamicina, rifampicina, eritromicina, cloranfenicol, ceftriaxona y amoxicilina y resistentes al ácido nalidíxico. Del análisis de las secuencias aminoacídicas de las proteínas de GyrA, GyrB, ParC y ParE de B. bacilliformis, asociados a la resistencia de las quinolonas (ciprofloxacina, ácido nalidíxico) se concluye que presentan diferencias aminoacídicas de Ser por Ala, en comparación con las secuencias de las proteínas respectivas de E. coli K12 MG1655. Esta diferencia probablemente confiera resistencia al ácido nalidíxico pero no a la ciprofloxacina en B. bacilliformis. Se determinó que las QRDR de las proteínas GyrA, GyrB, ParC y ParE de B. bacilliformis están comprendidas entre los aminoácidos 74 a 124, 428 a 426, 67 a 118, y 473 a 530, respectivamente. Para el antibiótico rifampicina se determinó la RRDR en el gen rpoB comprendida entre los aminoácidos 521 a 547, y para el gen rplD de la proteína L4 relacionado con resistencia a eritromicina reportamos la ERDR nunca antes mencionado y comprende los aminoácidos 60 a 79, siendo el primer reporte para este gen en Bartonella bacilliformis. Finalmente en el modelamiento de las estructuras terciarias de las regiones determinantes de resistencia se apreciaron cambios en las posiciones de Ser por Ala, y estos cambios permiten una débil interacción con la droga. Al evaluar los perfiles de hidrofobicidad de los aminoácidos pertenecientes a la región determinante de resistencia, nos permitió inferir que los cambios de aminoácidos con propiedades diferentes como Ser por Ala contribuyen a la resistencia.
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Biochar : caracterização estrutural e interações com nutrientes e microorganismos pedológicos /

Bueno, Carolina de Castro. January 2017 (has links)
Orientador: André Henrique Rosa / Resumo: Todo produto agrícola interfere na situação termodinâmica de solos, afetando as interações entre solo-microorganismos-plantas. Biochar é definido como um material carbonáceo multifuncional que atua como condicionante/ fertilizante e eleva a qualidade de solos. Pode estar presente naturalmente em solos férteis ou produzido a partir da pirólise de resíduos agrícolas gerando produtos de maior valor agregado. A literatura destaca casos de sucesso de sua aplicação no solo e como material adsorvente de contaminantes orgânicos e inorgânicos. No entanto, poucas informações estão disponíveis sobre possíveis efeitos antagônicos do biochar aos microorganismos do solo e alterações diretas no desenvolvimento de plântulas. Visando entender interações do biochar no sistema solo-microorganismos-plantas, este trabalho objetivou identificar os efeitos de diferentes doses de biochar produzidos a partir de bagaço de cana-de-açúcar e palha de sabugo de milho na interação com nutrientes, desenvolvimento de fungos ligninolíticos, bactérias promotoras do crescimento de plantas e de plântulas de milho. Para tanto, as amostras de biochar foram produzidas por meio de pirólise em nove regimes de temperatura para compreender quais mudanças morfológicas e físico-químicas ocorrem na formação do biochar. Com o objetivo de preservar as interações multitróficas do solo, foram explorados os efeitos de diferentes doses de biochar no crescimento radial de micélios três diferentes espécies de fungos ligninolítico... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Any agricultural product that reaches the pedological system interferes in the thermodynamic situation of soil non-equilibrium, affecting the soil-microorganisms-plants set. In recent years, biochar has been identified as a conditioning / fertilizing material that helps raise the soil qualities. Biochar is a multifunctional carbonaceous material already existing naturally in fertile soils. However, the non-natural production of biochar has been considered as an alternative destination to agricultural waste that generates value-added products. The literature highlights successful cases of its application in the soil and as adsorbent material of organic and inorganic contaminants. However, little information is available on possible antagonistic effects of biochar on soil microorganisms and direct changes in seedling development. In order to understand possible points of bifurcations that biochar can generate in the soil-microorganisms-plants system, this work aimed to identify the effects of different doses of biochar produced from sugarcane bagasse and corn cob in the growth and development of ligninolytic fungi, plant growth promoting bacteria and maize seedlings. For this, the biochar samples were produced by means of pyrolysis in nine temperature regimes to understand which morphological and physicochemical changes occur in the formation of biochar. With the objective of preserving the soil multitrophic interactions, it was explored the effects of different doses of biochar on the radial growth of mycelium three different species of ligninolytic fungi: Bjerkandera adusta, Pleurotos ostreaus and Trametes versicolor. A species-dependent effect was found where the same biochar samples can cause acute toxicity and additive effect on the growth of these fungi... (Complete abstract electronic access below) / Doutor
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Implicaciones de la estructura del DNA en la regulación de la expresión génica en Archaea halófilas extremas

Soria Soria, Elena 21 July 2006 (has links)
El presente trabajo ha sido financiado por los proyectos BMC2000-0948-C02-02 y PB96-0330 del Ministerio de Ciencia y Tecnología y GV97-VS-25-82 de la Generalitat Valenciana.

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