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Regressão aleatória na detecção de QTL para características de crescimento de suínos / Random regression to detect QTL for growth traits in swine

Pinheiro, Valéria Rosado 24 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1865501 bytes, checksum: 1ea217f4e435634fb653ba16ecac4ac4 (MD5) Previous issue date: 2012-02-24 / Many studies are focused on the search for QTL(quantitative trait loci) that affects growth traits in swine, and almost all studies have found QTL with significant effects. However, most of these studies use information related to the body weight on specific ages or average weight gain. Thus, it becomes interesting to evaluate all the growth information with the focus on longitudinal data simultaneously. This study aims to use random regression models (RRM) in order to detect QTL (quantitative trait loci) for growth traits in swine from a population F2 Piau x Commercial. To this end, it was considered a RRM with random polygenic effects, permanent environment and QTL, being the covariance matrix associated with the latter known as IBD (identical-by-descent). The presence of a significant QTL was found by likelihood ratio test considering the model described above as being the complete and this same without the QTL effect as null model. Comparisons between these models were made at the positions of the markers (6 microsatellite markers) and at positions between markers. In the position with greater evidence of QTL effect was calculated the heritability and the genetic polygenic and QTL values for body weight throughout the growth period studied. The results showed a significant effect of QTL at position 65 of chromosome 7. / Muitos estudos são voltados para a busca de QTL (locos de características quantitativas) que afetam características de crescimento em suínos, sendo que a quase totalidade tem encontrado QTL com efeitos significativos. No entanto, a maioria destes estudos utiliza informações referentes a peso corporal em idades específicas ou ganho de peso médio. Dessa forma, torna-se interessante avaliar simultaneamente todas as informações de crescimento sob o enfoque de dados longitudinais. O presente trabalho tem como objetivo utilizar modelos de regressão aleatória (MRA) com o intuito de detectar QTL para características de crescimento em suínos de uma população F2 Piau x Comercial. Para tanto, considerou-se MRAs com efeitos aleatórios poligênico, de ambiente permanente e de QTL, sendo a matriz de covariância associada a este último denominada de IBD (identical-by-descent). A presença de um QTL com efeito significativo foi verificada mediante teste de razão de verossimilhanças considerando o modelo descrito como sendo o completo e o mesmo sem o efeito de QTL como sendo o modelo nulo. As comparações entre estes modelos foram realizadas nas posições dos marcadores (6 marcadores microssatélites) e nas posições entre marcadores. Na posição com maior evidência de efeito de QTL foi calculada a herdabilidade e os valores genéMany studies are focused on the search for QTL(quantitative trait loci) that affects growth traits in swine, and almost all studies have found QTL with significant effects. However, most of these studies use information related to the body weight on specific ages or average weight gain. Thus, it becomes interesting to evaluate all the growth information with the focus on longitudinal data simultaneously. This study aims to use random regression models (RRM) in order to detect QTL (quantitative trait loci) for growth traits in swine from a population F2 Piau x Commercial. To this end, it was considered a RRM with random polygenic effects, permanent environment and QTL, being the covariance matrix associated with the latter known as IBD (identical-by-descent). The presence of a significant QTL was found by likelihood ratio test considering the model described above as being the complete and this same without the QTL effect as null model. Comparisons between these models were made at the positions of the markers (6 microsatellite markers) and at positions between markers. In the position with greater evidence of QTL effect was calculated the heritability and the genetic polygenic and QTL values for body weight throughout the growth period studied. The results showed a significant effect of QTL at position 65 of chromosome 7.ticos poligênicos e de QTL para peso em todo o período de crescimento estudado. Os resultados mostraram um efeito significativo de QTL na posição 65 do cromossomo 7.
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Seleção de famílias de cana-de-açúcar via árvores de decisão / Families selection through decision trees

Bernardes, Diego Paiva 15 March 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 677917 bytes, checksum: fe42f6008c42e03314bd889ebb94ea29 (MD5) Previous issue date: 2013-03-15 / The process of selection of clones to be used as new commercial varieties is lacking in statistical methods and phytotechnical that increase the genetic gains in crop improvement programs of cane sugar. Out of five stages of the selection program to improve the RIDESA, the first one, T1, is endowed with great importance. First because it develops the remaining phases of the crop breeding program. And second because the volume of information to be analyzed is huge. Thus, if the data is not properly analyzed, good clones can be ruled out in the early stages, reducing the excellence of the program. The common strategies of selection, BLUP and BLUPIS, have the disadvantage of the necessity of weighing the whole plot. One way around this is to categorize the components of production; stalk height, stalk diameter and number of stalks, by decision trees. Through these trees, you can generate the combinations of these yield components and their production values. Using data from commercial varieties to generate the trees, it would not be necessary to weigh the entire plot, saving time and money. The aim of this study was to evaluate the categorization of yield components as selection strategy between and within families by comparing their performance with the usual methods, BLUP and BLUPIS. The algorithm used was the CART. Nonparametric by nature, it`s capable of producing binary divisions combining the explanatory variables and associating them with different response values. Data were collected from 5 experiments, installed in May 2007 in a randomized block design, with each experiment consisting of 5 blocks, 22 families and two commercial varieties. CART algorithm was effective in defining classes of yield components followed by selection of the best families with mean accuracy of 73% when compared with BLUPIS and BLUP. / O processo de seleção de clones de cana-de-açúcar é carente de métodos fitotécnicos e estatísticos que elevem os ganhos genéticos nos programas de melhoramento da cultura da cana-de-açúcar. De cinco fases de seleção do programa de melhoramento da RIDESA, a primeira é dotada de grande importância porque dela se desenvolvem as demais fases do programa e porque o volume de informações a ser analisados é enorme. Assim, caso os dados não forem corretamente analisados, pode-se descartar bons materiais logo nas primeiras fases, diminuindo a excelência do programa. As estratégias usuais de seleção, BLUP e BLUPIS, têm a desvantagem de exigir a de pesagem de toda a parcela. Uma maneira de se contornar isso é categorizar os componentes de produção; altura de colmos, diâmetro de colmos e número de colmos, via árvores de decisão. Através dessas árvores, é possível gerar as combinações desses componentes de produção e os respectivos valores de produção. Utilizando dados de testemunhas para gerar as árvores, não seria necessária a pesagem de toda a parcela, economizando tempo e recursos financeiros. O objetivo desse trabalho foi avaliar a categorização dos componentes de produção como estratégia de seleção entre e dentro de famílias através da comparação de seu desempenho com os métodos usuais, BLUP e BLUPIS. O algoritmo de árvore utilizado foi o CART. De natureza não paramétrica, esse é capaz de produzir divisões binárias combinando as variáveis explicativas e associando-as com distintos valores de resposta. Os dados foram coletados de 5 experimentos, instalados em maio de 2007, no delineamento em blocos casualizados, sendo cada experimento constituído de 5 blocos, 22 famílias e 2 testemunhas. O algoritmo CART foi eficiente em definir as classes dos componentes de produção seguido da seleção das melhores famílias no campo com acurácia média próxima de 73% quando comparado com o BLUPIS e BLUP.
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Modelo preditivo para o sucesso do desmame da ventilação mecânica invasiva

Carvalho, Camila Patrícia Galvão Patrício 29 August 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-05-14T12:47:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 3269699 bytes, checksum: af9285a2857f32a228efc8a34c2c80c4 (MD5) Previous issue date: 2014-08-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Of critically ill patients in intensive care units (ICUs), about 40% develop acute respiratory failure (ARF) requiring invasive mechanical ventilation (IMV), which should be conducted as soon as possible for weaning, which may be defined as the process of transition from mechanical ventilation to spontaneous in patients who remain at MVI for more than 24 hours time. To consider that they had successfully weaned, the patient must maintain spontaneous ventilation for at least 48 hours after discontinuation of artificial ventilation. However, if the return to ventilatory support is needed in this period of 48 hours after extubation, called unsuccessful weaning. In clinical practice, patients are subjected to interruption of MVI, the passage through the spontaneous breathing trial (SBT) is recommended, achieving tolerate 30 minutes disconnected from ventilatory support without important clinical changes. The SBT is recommended as a diagnostic test to bring greater security to taking the patient off the machine decision. Although recommended, it is important to note that in studies, this test has not been shown to be accurate, not identified approximately 15% of weaning failure. The aim of this study is to propose a model to predict the success of weaning from mechanical ventilation to assist decision making for weaning in patients admitted to the Intensive Care Unit. This is an observational, longitudinal, prospective, quantitative and descriptive. 24 hours after the institution of MVI at the time prior to the SBT and the team after the withdrawal of MVI until the occurrence of the outcome of weaning success or failure: an instrument for data collection, divided into four periods was used. The statistical method of logistic regression was used to support decision making from clinical variables collected in the study. The clinical variables that were statistically significant (p-value <0.05) were: Tobin index between 51 and 105 (OR = 79.3); Sodium levels between 135 and 14 (OR = 20.3) and balances the Hydraulic balanced (OR = 9.6). The findings of this study present a valid logistic model, revealing the clinical variables that correlate with the success of weaning from invasive mechanical ventilation, thereby guiding decision making in this context. / Dos pacientes graves internados em unidades de terapia intensiva (UTI s), cerca de 40%, desenvolvem insuficiência respiratória aguda (IRpA), necessitando de ventilação mecânica invasiva (VMI), a qual deve ser conduzida tão logo seja possível para o desmame, definido como o processo de transição da ventilação artificial para a espontânea nos pacientes que permanecem em VMI por tempo superior a 24 horas. Para considerar que houve sucesso no desmame, o paciente deve manter a ventilação espontânea durante pelo menos 48 horas após a interrupção da ventilação artificial. No entanto, se o retorno ao suporte ventilatório for necessário neste período de 48hs pós-extubação, denomina-se insucesso do desmame. Na prática clínica, para que os pacientes sejam submetidos à interrupção da VMI, recomenda-se a passagem pelo teste de respiração espontânea (TRE), conseguindo tolerar 30 minutos desconectados do suporte ventilatório, sem apresentar alterações clínicas importantes. O TRE é recomendado como um teste diagnóstico para trazer maior segurança à tomada de decisão da desconexão do paciente à máquina. Embora recomendado, é importante ressaltar que, nos estudos, esse teste não tem se mostrado acurado, não identificando aproximadamente 15% das falhas de desmame. O objetivo deste estudo foi propor um modelo para predizer o sucesso do desmame da ventilação mecânica invasiva, para auxiliar a tomada de decisão para o desmame em pacientes internados na unidade de terapia intensiva. Trata-se de um estudo observacional, longitudinal, prospectivo, quantitativo e descritivo. Foi utilizado um instrumento de coleta de dados, dividido em quatro momentos: apos 24 horas da instituição da VMI, no momento antes da realização do TRE pela equipe e após a retirada da VMI ate a ocorrência do desfecho sucesso ou insucesso do desmame. O método estatístico de regressão logística foi usado para subsidiar a tomada de decisão a partir das variáveis clínicas coletadas no estudo. As variáveis que apresentaram significância estatística (p-valor < 0,05) foram: índice de Tobin entre 50 e 105 irpm/L (OR= 79,3); nível de sódio entre 135 e 145 mEq/L (OR=20,3) e balanço hídrico equilibrado (OR = 9,6). Os achados deste estudo possibilitaram a construção de um modelo logístico válido, revelando as variáveis clínicas que se correlacionaram com o sucesso do desmame da ventilação mecânica invasiva, orientando, assim, a tomada de decisão neste contexto.
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Modelo de decisão sobre os fatores de risco para internação por pneumonia em lactentes: estudo caso-controle em um hospital de referência no município de João Pessoa / Model Decision on Risk Factors for Hospitalization due to Pneumonia in Infants: Case-Control Study in a Referral Hospital in the city of João Pessoa PB.

Soares, Maria Elma de Souza Maciel 24 February 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-05-14T12:47:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 750727 bytes, checksum: 1d1eb8f741a35fb035d4d1eaeb11c309 (MD5) Previous issue date: 2011-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Respiratory diseases in childhood, particularly pneumonia, are a serious public health problem, since they are directly related to morbidity and mortality of children in Brazil and worldwide. World Health Organization data show that the annual incidence of pneumonia is 156 million new cases, of which 151 million occur in developing countries. Of these, 20 million require hospitalization because of the gravity. This study aims to identify risk factors associated with hospitalization for pneumonia in children between 0 and 2 years old, as well as build a decision model that can explain the occurrence of pneumonia in this age group. This is a case-control study conducted in a referral hospital in João Pessoa PB. The study included 186 children 60 pneumonia cases and 126 controls. We used the chi-square test, and then multivariate analysis using logistic regression model. In the chi-square test, the following variables were considered significant: maternal age, type of delivery, birth weight, breastfeeding, parity, previous hospitalization, reason for hospitalization, vaccination, child care, overcrowding, access to sewage treatment, health unit, type of household and maternal education. In the final decision model, were considered significant the variables previous hospitalization and maternal education as risk factors, and access to vaccination and treatment of sewage as protective factors. These study results corroborate previous studies and provide information for health managers to develop intervention programs on these factors with the aim of reducing morbidity due to pneumonia in children. / As doenças respiratórias da infância, e em especial a pneumonia, constituem-se em um grave problema de saúde pública, pois estão diretamente relacionadas à morbidade e mortalidade de crianças, no Brasil e no mundo. Dados da organização mundial de saúde indicam que a incidência anual de pneumonia é de 156 milhões de casos novos, dos quais 151 milhões ocorrem nos países em desenvolvimento e destes, 20 milhões necessitam internação hospitalar devido à gravidade. Este estudo tem como objetivo identificar fatores de risco associados à internação de crianças com pneumonia na faixa etária entre 0 e 2 anos de idade, bem como construir um modelo de decisão capaz de explicar a ocorrência de pneumonia nesta faixa etária. Trata-se de um estudo caso-controle, realizado em um hospital de referência em João Pessoa-PB. Foram incluídos no estudo 186 crianças, sendo 60 casos de pneumonia e 126 controles. Para análise estatística foram utilizados o teste qui-quadrado e o modelo de regressão logística. O teste qui-quadrado apontou como significativas as variáveis: idade materna, tipo de parto, peso ao nascer, amamentação, paridade, internação anterior, motivo de internação, vacinação, creche, aglomeração, acesso a tratamento de esgoto, unidade de saúde, tipo de domicílio, e escolaridade materna. No modelo de decisão final foram consideradas significativas as variáveis: internação anterior e escolaridade materna como fatores de risco e vacinação e acesso a tratamento de esgoto, como fatores de proteção. Os resultados deste estudo corroboram com estudos anteriores e fornecem informações para que os gestores de saúde desenvolvam programas de intervenção sobre estes fatores com o objetivo de diminuir a morbidade por pneumonia em crianças.
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Efeitos da exposição materna a poluentes do ar e baixo peso ao nascer, segundo sexo /

Santos, Djalma Antonio Almeida dos. January 2017 (has links)
Orientador: Luiz Fernando Costa Nascimento / Coorientadora: Andrea Paula Peneluppi de Medeiros / Banca: João Andrade de Carvalho Junior / Banca: Gregório Lorenzo Acácio / Resumo: Este trabalho tem por objetivo avaliar a exposição da gestante aos poluentes do ar em sua somatória de 30, 60 e 90 dias anteriores ao parto, e analisar o efeito desses poluentes sobre o baixo peso ao nascer. Trata-se de estudo longitudinal, com dados todos os nascidos vivos de mulheres residentes no município de São José dos Campos no ano de 2013, excluindo os com peso menor de 500 gramas, os partos ocorridos até 36 semanas e 6/7 de gestação, os partos gemelares e trigemelares, bem como os fetos com mal-formação congênita. A variável dependente, peso ao nascer, foi categorizada como desfavorável ≤ 2500 g e favorável > 2500 g, e as independentes foram idade materna, estado civil, escolaridade, número de consultas e mês do início do pré-natal. Os poluentes do ar analisados foram SO2, PM10, CO, NO2 e O3 com dados acumulados de 30, 60 e 90 dias anteriores ao parto. A análise utilizada foi o modelo de regressão logística hierarquizada em três níveis: distal, intermediário e proximal. Foram 9336 nascidos vivos, sendo incluídos 8028 (86,0%) que atenderam aos critérios de inclusão. As variáveis significativas do nível distal foram idade materna e estado civil, do nível intermediário o número de consultas e no proximal a exposição materna ao O3 com 60 dias (OR= 1,10) e 90 dias (OR= 1,12) anteriores ao parto, sendo para o sexo feminino a associação ao O3 se deu no segundo quartil (OR = 1,61) e no quarto quartil (OR = 1,16) e para o sexo masculino com 90 dias no terceiro quartil (OR = 1... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The purpose of this study is to evaluate the exposure of pregnant women to air pollutants in their sum of 30, 60 and 90 days prior to birth, and to analyze the effect of these pollutants on low birth weight. This is a longitudinal study, with data on all live births of women living in the São José dos Campos City in 2013, excluding newborns under 22 complete weeks of gestation and those weighing less than 500 g, births under to 36 weeks and 6/7, twin and trigeminal gestations, and fetuses with congenital malformation. The dependent variable was birth weight and was categorized as unfavorable ≤ 2500 g and favorable> 2500 g, and the independent variables were maternal age, marital status, schooling, number of prenatal visits and month of prenatal initiation. The air pollutants analyzed were SO2, PM10, CO, NO2 and O3 with cumulative data of 30, 60 and 90 days prior to labor. The analysis used was the hierarchical logistic regression model at three levels: distal, intermediate and proximal. There were 9336 live births and 8028 (86.0%) that filed the inclusion criteria. The significant variables of the distal level were maternal age and marital status, at the intermediate level the number of prenatal visits. In the proximal level the maternal exposure to O3 with 60 days (OR = 1.10) and 90 days (OR = 1.12) prior to delivery, being to females sex the association of the O3 was in the second quartile (OR = 1.61) and in the fourth quartile (OR = 1.16) and for males sex with 90 days in the third quartile (OR = 1, 35). This study allowed the identification of the association only with the exposure of the pregnant woman to the O3 for the accumulated 60 and 90 days before delivery with low birth weight, and for the other pollutants there was no statistical significance / Mestre
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Modelagem univariada e regressão múltipla na análise da oferta e do preço do boi gordo no mercado brasileiro

Alves, Lêda Soares 26 February 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronegócios, 2016. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2016-04-27T13:39:30Z No. of bitstreams: 1 2016_LedaSoaresAlves.pdf: 2639819 bytes, checksum: 11e5d74b0c416ef57c586b199ec0dd08 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2016-05-28T11:08:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_LedaSoaresAlves.pdf: 2639819 bytes, checksum: 11e5d74b0c416ef57c586b199ec0dd08 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-28T11:08:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_LedaSoaresAlves.pdf: 2639819 bytes, checksum: 11e5d74b0c416ef57c586b199ec0dd08 (MD5) / A dinâmica do mercado do boi gordo no Brasil vem apresentando nas últimas décadas novos desafios para pecuaristas e para a indústria frigorífica, principais agentes da cadeia da carne bovina brasileira que passou a exercer importante papel no cenário internacional. O aumento da oferta de animais em conformidade com os requisitos de padrões internacionais de sanidade, qualidade e rastreabilidade e novos hábitos dos consumidores, aliados à internacionalização das maiores empresas frigoríficas brasileiras tem exigido dos diversos atores novas posturas na gestão das firmas, especialmente, na comercialização da principal matéria-prima da cadeia, o boi gordo. Este trabalho objetivou analisar a oferta e o preço do boi gordo no mercado brasileiro e propor instrumentos que possam ser adotados pelos agentes da cadeia da carne bovina para estimar a oferta de boi gordo no Brasil. Utilizou-se modelagem univariada e regressão múltipla nas séries temporais do abate e do preço do boi gordo a fim de descrever o comportamento da oferta e do preço no mercado brasileiro. Os resultados obtidos por meio do método de Decomposição Clássica de Séries Temporais evidenciaram a redução das influencias de fatores climáticos sazonais e ciclo plurianual produtivo sobre a quantidade ofertada do boi gordo para o abate no país que passou a apresentar maior estabilidade entre as quantidades de bovinos abatidos entre os meses do ano. Os intervalos que compõem o ciclo plurianual do abate total de bovinos tiveram redução de 18 meses na duração, o último ciclo observado teve duração de 9,5 anos. Os modelos SARIMA foram capazes de descrever o comportamento e podem ser considerados adequados para previsões dados os valores dos coeficientes apresentados, abate de bovinos fêmeas (R² = 0,981, = 0,981), abate de bovinos machos (R² = 0,90, =0,90), abate total de bovinos (R² de 0,974, =0,973) os três modelos apresentaram baixos valores nas medidas de estatística de erro. O risco dos retornos dos preços do boi gordo (DP = 0,0379) e da cotação do dólar (DP = 0,0389) foram similares entre os anos de 2000 e 2014. Os modelos ARCH/GARCH mostraram-se os retornos do preço do boi gordo apresentaram maiores picos de volatilidade que os retornos do preço do bezerro e da cotação do dólar. Os modelos de regressão linear múltipla permitiram explicar as variáveis determinantes dos abates de bovinos e dos preços do boi gordo e do bezerro no mercado brasileiro. A oferta de boi gordo no mercado nacional relacionou-se com os custos de produção, quantidade de exportações de carne brasileira e cotação do dólar. A equação do modelo de regressão linear múltipla do abate de bovinos totais no Brasil apresentou R² = 0,996 e =0,996. O preço do boi gordo no Brasil foi explicado pelas variáveis abate de fêmeas, preço do bezerro, índice estacional do boi e do bezerro e pela variável econômica da cotação do dólar em Real. A equação do preço do boi gordo apresentou R² = 0,998 e =0,998. Os modelos propostos podem ser considerados adequados como modelos preditivos e poderão contribuir para planejamento dos agentes e proporcionar maior competitividade da cadeia da carne bovina. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The dynamics of the cattle market in Brazil has shown in recent decades new challenges for farmers and the meatpacking industry, key players in the Brazilian beef chain began to play an important role in the international arena. The increased supply of animals in accordance with international standards requirements of health, quality and traceability and new consumer habits, combined with the internationalization of the largest Brazilian slaughterhouses has required the various actors new positions in the management of firms, especially in marketing the main raw material of the chain, the cattle. This study aimed to analyze the supply and the price of cattle in the Brazilian market and provide instruments that can be adopted by the beef chain agents to estimate the beef cattle supply in Brazil. We used univariate and multiple regression modeling in the time series of slaughter and the price of cattle in order to describe the behavior of supply and price in the Brazilian market. The results obtained by the classical decomposition method of time series showed the reduction of influences of seasonal weather factors and productive multi-year cycle on the quantity supplied of live cattle for slaughter in the country, which now has greater stability between the quantities of cattle slaughtered between the months of the year. The ranges that make up the multi-years cycle of total slaughter cattle were slaughtered had reduction of 18 months, duration and last cycle was observed duration of 9,5 years. The SARIMA models were able to describe the behavior and may be appropriate for forecasting data values presented coefficients slaughter of female cattle (R² = 0.981, = 0.981), slaughter of male animals (R² = 0.90, = 0.90), the total slaughter of cattle (R² 0.974, = 0.973) three models showed low values in error statistical measures. The risk of live cattle prices of returns (SD = 0.0379) and the dollar exchange rate (SD = 0.0389) were similar between the years 2000 and 2014. The ARCH / GARCH models showed that the price returns cattle showed higher volatility spikes that the calf price returns and the dollar rate. The multiple linear regression models allowed to explain the determinants of cattle slaughtering and prices of cattle and calves in the Brazilian market. The cattle supply in the domestic market was related to the costs of production, amount of Brazilian beef exports and the US dollar. The equation of multiple linear regression model slaughter of total cattle in Brazil presented R² = 0.996 and = 0.996. The price of live cattle in Brazil was explained by the variables slaughter females, calf price, seasonal index of the ox and the calf and the economic variable of the dollar in Real. The equation of the price of cattle presented R² = 0.998 and = 0.998. The proposed models can be considered suitable as predictive models and may contribute to planning agents and provide greater competitiveness of the beef chain.
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Uma nova aplicação para o método Lasso : index tracking no mercado brasileiro

Monteiro, Lucas da Silva January 2017 (has links)
Diante das evidências registradas na literatura de que, de forma geral, os fundos ativos não têm sido bem-sucedidos na tarefa de bater seus benchmarks, os fundos passivos – que buscam reproduzir as características de risco e retorno de um índice de mercado definido – vem ganhando espaço como alternativa de investimento na carteira dos investidores. A estratégia de reproduzir um índice é chamada de index tracking. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho consiste em introduzir a técnica LASSO como método endógeno de seleção e otimização de ativos para a execução de um index tracking no mercado brasileiro e compara-lo com a execução de um index tracking pela técnica de seleção por participação dos ativos no índice de referência (otimizado por cointegração). A utilização da técnica LASSO, tal como proposta, constitui uma novidade na aplicação para o mercado financeiro brasileiro. Os testes comparativos foram realizados com as ações do índice Ibovespa entre os anos de 2010 e 2016. Sabendo das limitações relativas ao período de análise, os resultados sugerem, entre outros pontos, que o método LASSO gera tracking errors mais voláteis do que o método ad hoc tradicional e, dessa forma, gera menor aderência da carteira de réplica ao benchmark ao longo do tempo. / Given the evidence in the literature that, in general, the active funds have not been successful in the task of hitting their benchmarks, the passive funds - which seek to reproduce the risk and return characteristics of a defined market index - come gaining space as an investment alternative in the investor portfolio. The strategy of reproducing an index is called index tracking. In this sense, the objective of this study is to introduce the LASSO technique as an endogenous method of selection and optimization of assets for the execution of an index tracking in the Brazilian market and to compare it with the performance of an index tracking by the technique of selection by participation in benchmark index (optimized by cointegration). The LASSO technique, as proposed, is innovative as application to the Brazilian financial market. The comparative tests were carried out with the stocks of the Ibovespa index between 2010 and 2016. Regarding the limitations related to the analysis period, the results suggest, among others, that the LASSO method generates more volatile tracking than the traditional ad hoc proceding, and thus, generates a portfolio that is less adhered to the benchmark over time.
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Estudo da cinética das reações de hidrodesnitrogenação.

FERNANDES, Thalita Cristine Ribeiro Lucas. 16 October 2018 (has links)
Submitted by Maria Medeiros (maria.dilva1@ufcg.edu.br) on 2018-10-16T12:44:41Z No. of bitstreams: 1 THALITA CRISTINE RIBEIRO LUCAS FERNANDES - DISSERTAÇÃO (PPGEQ) 2017.pdf: 3155230 bytes, checksum: 29997db242a362fb2a65ffda6fcf8ba0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-16T12:44:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 THALITA CRISTINE RIBEIRO LUCAS FERNANDES - DISSERTAÇÃO (PPGEQ) 2017.pdf: 3155230 bytes, checksum: 29997db242a362fb2a65ffda6fcf8ba0 (MD5) Previous issue date: 2017-09-27 / CNPq / A hidrodesnitrogenação catalítica é um processo utilizado para remover impurezas de nitrogênio em produtos derivados de petróleo e ocorre mediante o tratamento da carga com hidrogênio a temperatura e pressão elevadas em um reator do tipo tricled-bed. Para otimizar as operações nestes reatores, é necessário que se tenha informações sobre a cinética das várias reações de hidrodesnitrogenação. Entretanto, as equações das taxas das reações não estão disponíveis na literatura. Assim, o objetivo deste trabalho consiste em obter as equações das taxas das reações e os parâmetros cinéticos para a rede reacional dos compostos nitrogenados utilizando o modelo rigoroso de hidrodesnitrogenação do Aspen Hysys como base numérica para as simulações. Experimentos numéricos foram realizados em um reator diferencial no software Aspen Hysys para obter dados de concentração de reagentes e produtos a diferentes alimentações. Diferentes métodos foram utilizados, um método de regressão linear multivariável para obtenção dos coeficientes de regressão, um método de metamodelagem interpoladora estocástica, o Kriging e a otimização do metamodelo Kriging utilizando o método dos mínimos quadrados. Para testar as metodologias propostas, todas as etapas foram aplicadas para um sistema de duas reações simples, uma reversível e outra irreversível, em um reator PFR. Os resultados referentes ao método de regressão linear mostraram que a metodologia pode ser utilizada para estimar parâmetros cinéticos desde que se conheça a equação da taxa correspondente. A comparação entre os dois métodos do tipo Kriging propostos (convencional e otimizado) foi feita a partir de técnicas de análise estatísticas, como o coeficiente de determinação R² e análise de variância (ANOVA). O kriging otimizado mostrou uma melhor aderência aos dados quando comparado com o kriging convencional. / Catalytic hydrodenitrogenation is one process used to remove nitrogen impurities from refinery streams, and it occurs by reacting a given charge with hydrogen at high temperature and pressure in a trickled-bed reactor. In order to optimize the operation of such reactors one needs information about the kinetics of the various hydrodenitrogenation reactions. However, reaction rate expressions are not available in the open literature. Therefore, this work aims at obtaining the reaction rate expressions and parameters for the reaction network of nitrogen compounds using the rigorous hydrodenitrogenation model in Aspen Hysys as the numerical basis for simulations. A differential reactor to simulate the process for different feed streams generated data to estimate of concentration of reagent and products at different feed loads. Three different methods were used, a multivariable linear regression model to obtain the regression coefficients, a stochastic interpolator metamodeling, Kriging and an optimized Kriging with least square method. In a first step, two simple reactions rates were used to test the methodologies in a reactor PFR in Hysys, a reversible and an irreversible. The results showed that linear regression might be use to estimate parameters satisfactory only if you know the reaction rate expression. By using statistical analysis as determination coefficient R² and analyze of variance, ANOVA, it was possible to compare both Krigings (conventional and optimized). Optimized Kriging showed a better adherence to the data when compared to conventional kriging.
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Estresse térmico e a qualidade do leite em vacas da raça Holandesa: uma abordagem genômica / Heat stress and milk quality in Holtein cows: a genomic approach

Eula Regina Carrara 04 April 2018 (has links)
O estresse térmico causa prejuízos para a atividade leiteira. É possível selecionar animais para tolerância ao calor, uma vez que existe variação genética de características produtivas quando avaliadas em diferentes ambientes climáticos. Para uma correta avaliação genética em função de diferentes ambientes, a utilização de modelos que se ajustem aos dados é fundamental. Ao mesmo tempo, ferramentas genômicas podem auxiliar nos processos de avaliação e seleção genética para tolerância ao calor. Nesse contexto, foram desenvolvidos dois estudos. No primeiro, objetivou-se estudar as funções de variância de características de produção e qualidade do leite em relação a um índice de temperatura e umidade (THI), ajustadas por polinômios de Legendre de ordens dois a sete, avaliar qual função melhor se ajusta aos dados e compreender como os componentes de variância e os coeficientes de herdabilidade se comportam em função do THI. Para isso, foram utilizadas 74.470 informações de produção de leite (PROD, kg/dia), escore de células somáticas (ECS), porcentagens de gordura (GOR), proteína (PROT), lactose (LACT), caseína (CAS) e perfil de ácidos graxos (saturados - SAT; insaturados - INSAT; monoinsaturados - MONO; poli-insaturados - POLI; ácido palmítico - C16:0; ácido esteárico - C18:0; e ácido oléico - C18:1) de 5.224 vacas da raça Holandesa avaliadas por meio de modelos de regressão aleatória em 167 valores distintos do THI. À exceção de POLI, houve variação em todos os componentes de variância ao longo do THI para todas as características. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,07 a 0,43. Para PROD, GOR, LACT, ECS, SAT e C16:0, as estimativas de herdabilidade diminuíram com o aumento do THI e para CAS, MONO, INSAT e C18:1, aumentaram. Para PROT e C18:0 as estimativas de herdabilidade foram maiores em valores intermediários do THI e menores nos extremos. No segundo estudo, objetivou-se estimar o efeito de marcadores SNP (polimorfismos de nucleotídeo único) sobre as características PROD, CAS, ECS, SAT e INSAT e estimar o valor genético genômico (GEBV) considerando dois valores de THI, um representando o conforto térmico e outro o estresse térmico. Os valores genéticos dos animais para os dois ambientes foram usados como fenótipos nos estudos de associação genômica (GWAS). Foram utilizados genótipos de 1.157 vacas para 60.671 marcadores SNP. Para as análises genômicas, foram utilizadas somente vacas com fenótipo e genótipo. Foi utilizado o método GBLUP (melhor predição linear não-viesada genômica) sob abordagem bicaracterística para realizar o GWAS. Com objetivo de comparar os ambientes, foram considerados os 55 SNP de maior variância aditiva explicada para cada situação e 10% dos animais com maiores valores genéticos genômicos. Em geral, os SNP apresentaram poucas diferenças em suas variâncias aditivas explicadas quando comparados em ambiente de conforto e estresse térmico. Com relação aos valores genéticos genômicos, houve reclassificação dos animais para PROD (correlações 0,90 e 0,90), CAS (correlações 0,88 e 0,86), SAT (correlações 0,88 e 0,87) e INSAT (correlações 0,97 e 0,97). Para ECS, apenas um animal foi reclassificado entre os ambientes (correlações 1,00). O primeiro estudo permitiu avaliar os componentes de variância ao longo de todo o gradiente ambiental. Por sua vez, o segundo estudo permitiu avaliar a variância individual dos marcadores moleculares, complementando o estudo genético das características. Mesmo que pequenas, foi possível verificar diferenças genéticas entre os animais entre os ambientes considerados. / Heat stress causes damage to dairy farming activities. It is possible to select animals for heat tolerance, because there is genetic variation of productive traits when evaluated in different climatic environments. For a correct genetic evaluation according to different environments, the use of models that fit to the data is fundamental. At the same time, genomic tools can aid in the evaluation and genetic selection processes for heat tolerance. In this context, two studies were developed. In the first, the aim was to study the variance functions of milk production and quality traits in relation to a temperature and humidity index (THI), adjusted by Legendre polynomials of orders two to seven, to evaluate which function best fits the data and understand how the variance components and heritability coefficients behave as a function of THI. For this, records of milk yield (MY), somatic cell score (SCS), percentage of fat (FP), protein (PP), lactose (LP), casein (CP) and acid fatty acids (saturated - SAT, unsaturated - UNSAT, monounsaturated - MONO, polyunsaturated - POLY, palmitic acid - C16:0, stearic acid - C18:0; and oleic acid - C18:1) from 5,224 Holstein cows and evaluated using random regression models in 167 different levels of THI were used. With the exception of POLY, there was variation in all variance components along the THI for all traits. Estimates of heritability ranged from 0.07 to 0.43. For MY, FP, LP, SCS, SAT and C16:0, estimates of heritability decreased with increasing THI and for CP, MONO, UNSAT and C18:1 increased. For PP and C18:0, heritability estimates were higher in intermediate THI values and lower at the extremes. In the second study, the objective was to estimate the effect of SNP markers on traits MY, CP, SCS, SAT and UNSAT and to predict the genomic breeding values (GEBV) using these effects, considering two levels of THI: a thermal comfort and an heat stress. The breeding values of the animals for the two environments were used as phenotypes for the genomic wide association studies (GWAS). Genotypes of 1,157 cows to 60,671 SNP markers were used. The GBLUP method (genomic best linear unbiased prediction) was used under a bitrait approach to perform GWAS. With the aim of comparing the environments, the 55 SNP with the greater variance explained for each situation and the 10% animals with the greater GEBV were used. Differences were observed in the variance explained by SNP between the comfort and heat stress environment. There was a re-rankink of animals considering the GEBV for MY (correlations 0.90 and 0.90), CP (correlations 0.88 and 0.86), SAT (correlations 0.88 and 0.87) and UNSAT (correlations 0.97 and 0.97). For SCS, only one animal was reclassified between the environments (correlations 1.00). The first study allowed to evaluate the components of variance along the entire environmental gradient. In turn, the second study allowed to evaluate the individual variance of the molecular markers, complementing the genetic study of the traits. Although small, it was possible to verify genetic differences among the animals among the considered environments.
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Adaptabilidade e estabilidade de híbridos de milho para produção de grãos na segunda safra brasileira / Adaptability and stability of corn hybrids for grain production in the second brazilian crop

Carvalho, Ricardo Lozano Teixeira de 18 June 2018 (has links)
Submitted by Ricardo Lozano Teixeira de Carvalho (rlcarvalho@dow.com) on 2018-08-04T19:38:47Z No. of bitstreams: 1 REPOSITÓRIO_Dissertacao_Ricardo_Carvalho.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-06T18:12:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carvalho_rlt_me_jabo.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-06T18:12:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carvalho_rlt_me_jabo.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) Previous issue date: 2018-06-18 / Genótipos superiores têm alta capacidade de produção e resistência às principais doenças, porém o efeito do ambiente pode alterar essas características. Quando plantados em várias localidades, os genótipos podem se comportar de maneira diferente devido a sua adaptabilidade a cada região e a interação destes com o ambiente. O uso de sementes não adaptadas a região e o manejo inadequado são as principais causas de baixo rendimento nas lavouras de milho. Genótipos que respondem ao manejo utilizado, e que se comportam de maneira estável são fundamentais para obtenção de boa produtividade. Com base nisso este trabalho teve como objetivo avaliar a adaptabilidade, estabilidade e produtividade de grãos de híbridos experimentais e comerciais de milho para a segunda safra brasileira. Foram avaliados 33 híbridos, na segunda safra de 2016, em 39 locais, divididos em três macrorregiões (Tropical Sul, Tropical Centro Oeste e Tropical Centro Leste). Com as médias de produtividade de grãos obtidas após a realização da análise de variância, foram estimados os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade através de regressão linear bissegmentada. Os genótipos foram discriminados de acordo com sua adaptabilidade e estabilidade para cada região. Na região Tropical Sul o híbrido HC04 e HE16 são recomendados para ambientes favoráveis, pois respondem as melhorias de ambiente. Na região Tropical Centro Oeste o genótipo experimental HE16 também foi classificado como responsivo. E na tropical Centro Leste 85% dos genótipos foram estáveis. O genótipo HC07 é de adaptabilidade a ambientes desfavoráveis em todas as regiões. Os genótipos HC09 e HC10 são estáveis, de adaptabilidade ampla e com boa produtividade de grãos em todas as regiões. / Superior genotypes have a high production capacity and resistance to major diseases, but environment effect can alter these traits. When planted in multiple locations, genotypes may behave differently due to their adaptability to each region and interaction with the environment. The planting of seeds not adapted to a region and the management used is one of the main causes of low yields in corn crops. Genotypes that respond to the management and behave in a stable way are essential to obtain a good yield. Thus, the aim of this study was to assess the adaptability, stability, and grain yield of experimental and commercial corn hybrids in the second Brazilian crop. Thirty-three hybrids were assessed in the second crop of 2016 in 39 sites divided into three macro-regions (Tropical South, Tropical Central West, and Tropical Central East). Adaptability and stability parameters were estimated by means of bissegmented linear regression with the average grain yield obtained after performing the analysis of variance. Genotypes were discriminated considering their adaptability and stability for each region. In the Tropical South region, the hybrids HC04 and HE16 are recommended for favorable environments since they respond to environmental improvements. The genotype HE16 was also recommended for favorable environments in the Tropical Central West. In the Tropical Center East 85% of hybrids were stable. The genotype HC07 is adaptable to unfavorable environments in all regions. The genotypes HC09 and HC10 are stable, with broad adaptability and good grain yield in all regions.

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