Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 458917.pdf: 1917825 bytes, checksum: 2ca6f58d7f644c84a939a28ad578855d (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / The Uruguayan savanna ecoregion has been affected by land use changes, particularly livestock production and monocultures, such as soybean. As consequence, the habitat quality and the avian assemblages in the region are also being affected, and if we are to protect this habitat and its bird species, studies that generate information that can be used for conservation interventions in the region are essential. We sampled bird species in semi-natural grassland and soybean sites with grassland patches, in Rio Grande do Sul and Uruguay, between 2010 and 2012. In two chapters we evaluated (1) the differences in species richness, density and composition of the avian assemblage in semi-natural grasslands and soybean fields, and (2) the patterns of habitat use by grassland birds, through assessment of species richness and abundance. In the first chapter, we found that soybean fields have the lower species richness. Moreover, species considered as grassland specialists had the greatest value of density in semi-natural grassland sites, and species that are common and habitat generalists were more abundant in the soybean fields. Turning to species composition, our results demonstrated that the types of land use were clearly separated. Among the species recorded, five are classified as threatened or near-threatened according to global and/or regional red lists: Rhea americana, Athene cunicularia and Xolmis dominicanus were recorded in both soya and semi-natural grassland sites, whereas Cistothorus platensis and Xanthopsar flavus were recorded only in semi-natural grassland sites. In the second chapter we analyzed the habitat use of grassland birds by establishing a buffer of 100 meters in each of the 160 points sampled. We calculated the percentage of each land use type in each buffer and found that most of the grassland s bird species analyzed occurred preferentially in sites with large percentage of natural grasslands and/or wet grasslands, and none of them used the soybean fields preferentially. Moreover, more than 60% of the records occurred in the buffers composed by over 90% of natural grassland, and the same pattern was found for the total number of individuals of all bird species. Based on our results, we can conclude that the natural grassland sites are important for the maintenance of the avian assemblage in the region. For the conservation of the grasslands in the region, some important measures are needed, such as 1) control on agricultural management practices (e.g. maintain patches of grasslands in the soybean fields), and 2) development of policies combining agriculture production and conservation of biodiversity. / A ecoregi?o da Savana Uruguaia vem sendo constantemente alterada, principalmente quanto ao uso do solo para implanta??o de pastagens e agricultura intensiva. Consequentemente, a qualidade dos habitats e as popula??es de aves tamb?m s?o afetadas. Estudos que gerem informa??es sobre como a densidade das esp?cies varia em ambientes alterados, e que possam proporcionar a??es de conserva??o das ?reas naturais s?o necess?rios. Entre 2010 e 2012 amostramos as esp?cies de aves, atrav?s de pontos de contagem, em ?reas de campos semi-naturais e de cultivos de soja com manchas de campos, no Rio Grande do Sul e no Uruguai. Avaliamos, em dois cap?tulos, (1) as diferen?as na riqueza, densidade e composi??o das assembleias de aves nestes dois tipos de uso do solo e (2) os padr?es de uso do habitat pelas aves campestres atrav?s da avalia??o da riqueza e abund?ncia das mesmas nestes diferentes ambientes. Com refer?ncia ao primeiro cap?tulo, os cultivos de soja apresentaram menor riqueza de esp?cies do que os campos semi-naturais. O mesmo ocorreu com a densidade das esp?cies, sendo que esp?cies consideradas mais especialistas apresentaram os maiores valores de densidade em ?reas de campo semi-natural e esp?cies mais comuns e generalistas foram abundantes na soja. Quanto ? composi??o de esp?cies, os tipos de uso do solo foram claramente separados. Cinco das esp?cies registradas s?o consideradas amea?adas ou quase amea?adas global e/ou regionalmente - Rhea americana, Athene cunicularia e Xolmis dominicanus foram registradas tanto nas ?reas de soja quanto nas de campos semi-naturais, j? Cistothorus platensis e Xanthopsar flavus foram registradas apenas nos campos semi-naturais). Quanto ao segundo cap?tulo, estabelecemos um buffer de 100 metros para cada um dos 160 pontos amostrados, e calculamos a porcentagem de cada tipo de uso do solo nos tamp?es, em cada ponto. Dentre as esp?cies de aves campestres analisadas, a maioria delas ocorreu preferencialmente em campos naturais e/ou campos naturais ?midos, e nenhuma usou primeiramente as ?reas de soja. Al?m disso, mais de 60% dos registros de ocorr?ncia e do n?mero total de indiv?duos destas aves foram registrados nos buffers compostos por mais de 90% de campo natural. A partir destes resultados, conclu?mos o qu?o importantes s?o as ?reas de campo natural para a manuten??o da assembleia de aves. Para a conserva??o dessas esp?cies, por?m, s?o necess?rias algumas medidas importantes dentre as quais podemos destacar: 1) pr?ticas de manejo (por exemplo, a manuten??o de manchas de campo entre os cultivos de soja) e 2) pol?ticas que aliem a produ??o da agricultura e a conserva??o da biodiversidade. Al?m disso, ? importante entender a resposta das diferentes esp?cies de aves frente ?s altera??es do habitat que est?o acontecendo na regi?o.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 459622.pdf: 7068084 bytes, checksum: 30b184abdf871f7ee7438f18072e7ddb (MD5) Previous issue date: 2014-03-06 / Mitochondrial genomes (mitogenomes) are usually obtained through DNA sequencing produced by a set of conserved PCR primers that are designed to generate overlapping segments, thus completing the whole mitochondrial DNA. This may be a good strategy for some organisms. However, the translocation of cytoplasmic mitochondrial DNA (cymtDNA) into the nuclear genome (numt) is known to be a frequent phenomenon in many taxa, including the felid genus Panthera. Some strategies have been developed to avoid the unwanted amplification of numt, such as mitochondrial isolation followed by PCR or long-PCR. Recently, next-generation sequencing (NGS) approaches have begun to be extensively used in this field. Among these, RNA sequencing (RNAseq) seems to be extremely useful to generate mitogenomes and to avoid numts, as it allows the efficient capture at high coverage of mtDNA transcripts, avoiding pseudogenized nuclear copies. When we initiated this study, mitochondrial genomes of all species of the Panthera genus except the jaguar (P. onca) were available in public databases such as GenBank. Given the importance of this molecular marker for jaguar population studies and for phylogenetic analyses within the Panthera genus, the goals of this project were to (i) characterize the Panthera onca mitogenome, eliminating the possibility of erroneous amplification of numt; and (ii) to conduct the first mitogenomic analysis of the Panthera genus. We have characterized the mitochondrial genome of the jaguar employing RNA-seq data. The transcripts covered about 95% of the mitogenome, with the remaining gaps being complemented by PCR-based DNA sequencing, using specific primers designed for this purpose. All mitogenomic phylogenetic analyses (Maximum Likelihood, Maximum Parsimony, Neighbor-Joining and Bayesian Inference) supported a congruent topology (((N. nebulosa ((P. tigris (P. onca (P. uncia, (P. leo, P. pardus))))). This topology is unprecedented for the genus, but our results indicate that it correctly reflects the evolutionary history of mitochondrial DNA in this group. This study demonstrated that, with RNA-seq approach, almost the entire mitochondrial genome from an individual can be quickly characterized. Furthermore, this approach holds great promise especially in the case of groups plagued by the presence of large and recent numts, as is the case of Panthera species. / Genomas mitocondriais (mitogenomas) geralmente s?o obtidos atrav?s do sequenciamento de DNA realizado com uma s?rie de primers conservados desenhados de maneira a se sobreporem, completando assim todo o DNA mitocondrial. Esta estrat?gia ? bastante eficaz para alguns organismos. Entretanto, a transloca??o de segmentos do DNA mitocondrial citoplasm?tico (cymtDNA) para o genoma nuclear (numt) ? um fen?meno conhecido para muitos t?xons, incluindo os felinos pertencentes ao g?nero Panthera. Algumas estrat?gias foram desenvolvidas para evitar a amplifica??o indesejada do numt, como por exemplo o isolamento de DNA mitocondrial seguido de PCR ou de PCR longo. Recentemente, as t?cnicas de sequenciamento de alto desempenho v?m sendo amplamente utilizadas. Dentre estas, o sequenciamento de RNA (RNA-seq) parece ser extremamente ?til para gerar mitogenomas e evitar numts, uma vez que captura com alta cobertura apenas DNA mitocondrial transcrito, evitando as c?pias nucleares pseudogenizadas. Quando este estudo foi iniciado, genomas mitocondriais de todas as esp?cies do g?nero Panthera exceto P. onca estavam dispon?veis em bases de dados como o GenBank. Tendo em vista a import?ncia deste marcador molecular para estudos populacionais de on?a-pintada (Panthera onca) e para estudos filogen?ticos entre as esp?cies do g?nero Panthera, os objetivos deste trabalho foram (i) caracterizar o mitogenoma de Panthera onca de forma a eliminar a possibilidade de amplifica??o err?nea de numt e (ii) realizar a primeira an?lise mitogen?mica do g?nero Panthera. O genoma mitocondrial da on?a-pintada foi caracterizado utilizando dados de RNA-seq. Os transcritos cobriram cerca de 95% do mitogenoma, sendo os demais segmentos cobertos por sequenciamento de DNA baseado em PCR, atrav?s da utiliza??o de primers espec?ficos desenhados para esta finalidade. Todos os quatro tipos principais de an?lises filogen?ticas do mitogenoma (Maximum Likelihood, M?xima Parcim?nia, Neighbor- Joining e Infer?ncia Bayesiana) suportaram uma topologia congruente (((N. nebulosa ((P. tigris (P. onca (P. uncia, (P. leo, P. pardus))))). Esta topologia ? in?dita para o g?nero, por?m os resultados indicam ser esta a verdadeira hist?ria evolutiva do DNA mitocondrial dentro deste grupo. Neste trabalho, demonstrou-se que atrav?s de RNA-seq ? poss?vel obter-se praticamente todo o genoma mitocondrial de um indiv?duo. Al?m disso, esta abordagem parece ser bastante promissora especialmente em casos onde grandes e recentes numts ocorrem, como ? o caso das esp?cies pertencentes ao g?nero Panthera.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 459709.pdf: 3714065 bytes, checksum: 4fcd0f5d0579f7b7f442276742c97b5f (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Previous phylogenetic analyses and the discovery of five new taxa of Hypoptotopomatini raised doubts concerning the relationships of the tribe. Therefore, in order to elucidate the phylogenetic relationships and to test the monophyly of Hypoptopoma and Nannoptopoma, and to test the position of Niobichthys and Otocinclus, the present study aims to provide an encompassing hypothesis of relationships among the Hypoptopomatini, comprising most species of Hypoptopoma, five new taxa and the other genera of the tribe. We analyzed a data matrix of 101 morphological characters, 82 of which from the literature and 19 new characters are suggested, with the inclusion of 65 terminals. The analyses were conducted using the heuristic searching algorithm of multiple Random Addition Sequence (RAS) followed by branch swapping with the algorithm Tree Bissection and Reconnection (TBR) . The analysis resulted in 64 maximally parsimonious trees of 443 steps, consistency index of 0.34 and retention index of 0.81. The 64 primary cladograms were then summarized in a strict consensus tree. The result confirms the monophyly of Hypoptopomatinae and Hypoptopomatini. The tribe comprises six known genera: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus and Oxyropsis and two new taxa. Additionally, Otocinclus is found to be the most basal member of the tribe; Acestridium and Niobichthys are sister to each other and closely related to a group formed by Nannoptopoma + New Taxa A , and New Taxa B + Oxyropsis + Hypoptopoma. Based on this framework on, changes to the classification and the taxonomy of the Hypoptopomatini are suggested / A partir das diferentes an?lises filogen?ticas previamente propostas e do conhecimento de cinco novos t?xons pertencentes ? Hypoptopomatini, surgiram questionamentos a respeito das rela??es de parentesco dentro da tribo. Assim, a fim de esclarecer as rela??es filogen?ticas e testar o monofiletismo de Hypoptopoma, testar a hip?tese de sinon?mia de Nannoptopoma e Hypoptopoma, e testar as posi??es de Niobichthys e de Otocinclus, o estudo tem como objetivo apresentar uma hip?tese de rela??es para Hypoptopomatini, incluindo a maioria das esp?cies de Hypoptopoma, cinco poss?veis novos t?xons e os demais g?neros da tribo. Foi constru?da uma matriz de 101 caracteres morfol?gicos, do quais 82 foram retirados da literatura e 19 novos propostos, analisados em 65 t?xons terminais. Foram realizadas buscas heur?sticas com o programa TNT atrav?s de m?ltiplos Random Addition Sequences seguida de rearranjos dos ramos Tree Bissection and Reconnection. Ao encontrar 64 ?rvores maximamente parcimoniosas com 443 passos, ?ndice de consist?ncia 0.34 e ?ndice de reten??o 0.81, essas ?rvores foram sumarizadas em um cladograma de consenso estrito. Os resultados encontrados corroboram a monofilia de Hypoptopomatinae e de Hypoptopomatini. A tribo ? formada por seis g?neros j? descritos: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus e Oxyropsis; e por dois g?neros novos. Adicionalmente, demonstra-se que Otocinclus ? o g?nero mais basal da tribo; Acestridium e Niobichthys s?o grupos-irm?os, mais relacionados com um clado formado por dois grupos monofil?ticos: Nannoptopoma + Novo T?xon A, e Novo T?xon B + Oxyropsis + Hypoptopoma. O conhecimento acerca das rela??es filogen?ticas, da classifica??o e da taxonomia de Hypoptopomatini muda, sendo feitas sugest?es para futuras mudan?as nomenclaturais.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 460186.pdf: 4588179 bytes, checksum: 4532da491a69ae539a460cd8e0108839 (MD5) Previous issue date: 2014-03-11 / The genus Rineloricaria Bleeker (1862) currently comprises 65 valid species that are distributed from Panama in Central America to northern Argentina. Three Rineloricaria species are currently recorded from Peru: Rineloricaria lanceolata, with type locality in the district of "Xeberos" in the department of Loreto, R. morrowi and R. wolfei both species with type locality in the r?o Ucayali basin in the district Contamana. Peruvian Rineloricaria species are reviewed based on external morphology, osteological features and color pattern. Six species are recognized. The three species were validated and Rineloricaria morrowi and R. wolfei were redescribed. Rineloricaria lanceolata is differentiated by having irregular dark blotches on on all fins and two parallel bands on dorsum of head, by having a higher number of post-rostral plates and the anterior ventral margin of pectoral girdle straight; its distribution mainly comprises r?o Madre de Dios, r?o Amazonas and r?o Ucayali basins and their tributaries. Rineloricaria morrowi is distinguished by having five longitudinal lateral plate series, a dark line along both sides on ventral area of caudal peduncle, a dark spot at anal-fin unbranched ray base and a dark band at the distal region of the caudal; its distribution is restricted to the r?o Amazonas basin and tributaries. Rineloricaria wolfei, has four longitudinal lateral plate series, triangular head profile and wide dark brown stripe covering the first half of the caudal fin, fifth ceratobranchial pharyngeal tooth plate wider with globular shape (vs. fifth ceratobranchial pharyngeal tooth plate narrow with triangular shape), a set of plates between insertions of pelvic fins anterior to the posterior complex irregularly arranged in more than one row (vs. arranged in one row). Additionally, three new species were described: Rineloricaria sp. "Loreto ", distinguished by a strongly convex snout profile with naked snout tip area reduced to a narrow line and type locality at r?o Morona basin in Loreto State. Rineloricaria sp. "Madre de Dios" is differentiated from all congeners except from R. fallax by having a conspicuous dar brown spot on nuchal plate (vs. nuchal plate without dark brown spot); it differs from R. fallax by having four longitudinal lateral plate series (vs. five longitudinal lateral plate series), having type locality in the quebrada Wiratkentsa in Loreto State. Rineloricaria sp. "Pasco" is distinguished by having the naked area of snout tip as a globular protuberance and a narrow body, with type locality in Puerto Bermudez at Pasco State. Illustrations of species and osteological characters are presented. The diagnostic characters of the genus are discussed, as well as geographical distribution of Rineloricaria species occurring in Peru and its relationship with highly diverse areas in the Neotropics. / O g?nero Rineloricaria Bleeker (1862) atualmente inclui 65 esp?cies v?lidas distribu?das desde o Panam? na Am?rica Central at? o norte da Argentina. O Peru atualmente registra tr?s esp?cies deste g?nero: Rineloricaria lanceolata, com localidade tipo no distrito de Xeberos no departamento de Loreto, R. morrowi e R. wolfei ambas com localidade tipo na bacia do r?o Ucayali no distrito de Contamana. As esp?cies de Rineloricaria que ocorrem no Peru foram revisadas com base em caracter?sticas morfol?gicas externasassim como tamb?m osteol?gicas e o padr?o de colorido, sendo reconhecidas seis esp?cies. As tr?s esp?cies registradas foram validadas e Rineloricaria morrowi e R. wolfei foram redescritas. Rineloricaria lanceolata ? diferenciada por possuir manchas escuras irregulares em todas as nadadeiras e duas faixas paralelas na regi?o dorsal da cabe?a, um maior numero de placas p?s-rostrais e pela margem anterior do cleitro reta; sua distribui??o compreende principalmente as bacias do r?o Madre de Dios, r?o Amazonas e r?o Ucayali e seus tribut?rios. Rineloricaria morrowi se diferencia de seus cong?neres por ter cinco series longitudinais de placas laterais e colora??o ventral lateral do ped?nculo caudal, uma mancha escura na base do raio indiviso da nadadeira anal e uma banda escura na regi?o distal da nadadeira caudal; sua distribui??o est? restrita a bacia do r?o Amazonas e tribut?rios. Rineloricaria wolfei, possui quatro series longitudinais de placas laterais, perfil triangular da cabe?a e uma barra marrom escura que cobre a primeira metade da nadadeira caudal, placas que se contatam com a margem anterior do complexo posterior de placas abdominais, entre a inser??o das nadadeiras p?lvicas, dispostas irregularmente ocupando mais de uma fileira (vs. placas organizadas em uma ?nica fileira entre a inser??o das nadadeiras p?lvicas) e por possuir a placa dent?gera ventral do quinto ceratobranquial expandida e com forma globular (vs. placa dent?gera ventral do quinto ceratobranquial estreita e triangular). Adicionalmente foram descritas tr?s novas esp?cies: Rineloricaria sp. Loreto, diferenciada pelo focinho fortemente convexo com regi?o nua reduzida a uma linha e com localidade tipo na bacia do r?o Morona no departamento de Loreto; Rineloricaria sp. Madre de Dios diferenciada de todos os seus cong?neres exeto de R. fallax por possuir uma mancha marrom escura na placa nucal (vs. aus?ncia de mancha na placa nucal) e com localidade tipo na quebrada Wiratkentsa no r?o Mara??n no departamento de Loreto; e Rineloricaria sp. Pasco diferenciada por possuir a ponta do focinho com regi?o nua em forma de protuber?ncia globular e corpo estreito, com localidade tipo na quebrada Ataz em Puerto Bermudez no departamento de Pasco. Ilustra??es de todas as esp?cies e caracteres osteol?gicos analisados s?o apresentadas. Os caracteres diagn?sticos do g?nero s?o discutidos, como tamb?m a distribui??o das esp?cies de Rineloricaria que ocorrem no Peru e sua rela??o com ?reas de grande diversidade Neotropical.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 462157.pdf: 2932621 bytes, checksum: df35aa42aa9e48a0e2ee46ce77f834dc (MD5) Previous issue date: 2014-08-28 / We studied the breeding biology of the Lesser Grass-finch (Emberizoides ypiranganus), a bird little known regarding your life history, in upland grassland of Mata Atl?ntica Biome in southern Brazil. We collected data over two breeding seasons (from October to March of 2012-2013 and 2013-2014) in the Parque Estadual do Tainhas (29? 5 58 S, 50? 21 50 W), in northeastern of Rio Grande do Sul State, Brazil. We monitored 93 nests and assessed several aspects related to reproduction of the species such as territoriality, breeding chronology, characteristics of nests, eggs and nestlings, clutch size, incubation, hatching rate, parental care, reproductive success and habitat features (structure and floristic composition) important in the nest site selection. Breeding begins at the first week of October, peaks in late November, and lasts until early March. The average size of reproductive territories was 1.1 ? 0.5 ha. Burned areas had smaller territories and a smaller density of reproductive pairs in comparison with unburned areas. Nests were built in transition zones between dry and wet habitats (49.5%) or in dry grasslands (48.4%). Only 2.1% of nests were built in dense marshes. The structure and floristic composition of nest sites analysis showed that the species selects sites to build nests with higher abundance of grass clumps such as Andropogon lateralis, Schizachyrium tenerum e Sorghastrum setosum. Nests are cup-shape and are built only by female in 3-7 days, at 36.2 ? 11.6 cm above the ground. The clutch size is three (67.3%) or two eggs. The incubation, which is performed by the female, lasts 13 to 14 days and is synchronic. The hatching rate was 93.5%. Nestlings remain in the nest between nine and 12 days. In most nests the nestlings are feed by both male and female (biparental care). The frequency visits to the nest to feed young did not differ with the nestling ages, but the length of visits was longer when nestlings were one to five days old. The apparent nest success was 41.9%, while the Mayfield success was 39.3% and MARK 35%. Predation was the main cause of loss clutches, affecting 76% of the unsuccessful nests. The best model to nest survival includes time-specific factors (nest age and year) and nest site features (nest height and habitat). The daily survival rates decrease through the nest cycle, falling sharply after hatch, on nestling stage. In successful nests the nestling survival was 0.83 ? 0.24 and the average productivity 2 ? 0.76 fledglings/nests. Considering successful and unsuccessful nests, the productivity was 0.84 ? 1.11 fledgling/nests. Up to four nest attempts, performed by the same female, were observed in a breeding season. The renesting interval after nest failure was 2.7 ? 1.3 days and the average distance among consecutive attempts was 104.2 ? 60.2 m. Although there is few available information in literature about the reproduction of Lesser Grass-finch, some basic parameters found are similar to those described. However, many results of this study are unpublished for the species such as territoriality, reproductive success and nest site selection. / Estudamos a reprodu??o do can?rio-do-brejo (Emberizoides ypiranganus), uma ave com uma hist?ria de vida pouco conhecida, nos campos de altitude do Bioma Mata Atl?ntica, no sul do Brasil. Coletamos dados durante duas temporadas reprodutivas (de outubro a mar?o de 2012-2013 e 2013-2014) no Parque Estadual do Tainhas (29? 5 58 S, 50? 21 50 O), no nordeste do Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Monitoramos 93 ninhos e avaliamos diversos aspectos ligados ? reprodu??o da esp?cie, tais como territorialidade, cronologia da nidifica??o, caracter?sticas dos ninhos, ovos e ninhegos, tamanho das ninhadas, incuba??o, taxa de eclos?o, cuidado parental, sucesso reprodutivo e caracter?sticas dos habitats (estrutura e composi??o flor?stica) importantes na sele??o dos s?tios de nidifica??o. A reprodu??o come?a na primeira semana de outubro, tem um pico de ninhos ativos na segunda quinzena de novembro, e dura at? o in?cio de mar?o. Os territ?rios reprodutivos t?m um tamanho m?dio de 1,1 ? 0,5 ha. ?rea onde ocorrem queimadas possuem territ?rios menores e uma menor densidade de pares reprodutivos em compara??o a ?reas sem fogo. Ninhos foram constru?dos em ?reas de transi??o entre ambientes secos e ?midos (49,5%) ou em ?reas de campo seco (48,4%). Apenas 2,1% dos ninhos foram constru?dos em ?reas de banhado denso. A an?lise da estrutura e composi??o flor?stica dos s?tios de nidifica??o mostrou que a esp?cie seleciona locais para constru??o dos ninhos onde h? grande abund?ncia de touceiras de gram?neas como Andropogon lateralis, Schizachyrium tenerum e Sorghastrum setosum. Os ninhos t?m formato de ta?a e s?o constru?dos apenas pela f?mea em 3-7 dias, a uma altura m?dia 36,2 ? 11,6 cm do solo. A ninhada ? de tr?s (67,3%) ou dois ovos. A incuba??o, que ? realizada apenas pela f?mea, dura de 13 a 14 dias e ? sincr?nica. A taxa de eclos?o dos ovos foi 93,5%. Os ninhegos permanecem no ninho entre nove e 12 dias. Na maioria dos ninhos os ninhegos s?o alimentados pelo macho e pela f?mea (cuidado biparental). A frequ?ncia de visitas ao ninho para alimentar os ninhegos n?o diferiu com suas idades, mas a dura??o das visitas foi maior no in?cio (ninhegos de 1-5 dias de vida). O sucesso aparente dos ninhos foi 41,9%, enquanto o sucesso calculado pela estimativa de Mayfield foi 39,3% e pelo programa MARK foi 35%. A preda??o foi a principal causa de perda das ninhadas, afetando 76% dos ninhos insucesso. O melhor modelo para a sobreviv?ncia dos ninhos inclui fatores tempo-espec?ficos (idade do ninho e temporada reprodutiva) e caracter?sticas do local do ninho (altura e habitat). As taxas de sobreviv?ncia di?ria diminuem ao longo do ciclo de nidifica??o, caindo bruscamente ap?s a eclos?o, na fase de ninhego. Em ninhos sucesso a sobreviv?ncia de ninhegos foi 0,83 ? 0,24 e a produtividade m?dia 2 ? 0,76 filhotes/ninho. Considerarmos ninhos sucesso e insucesso, a produ??o anual de filhotes foi 0,84 ? 1,11 filhote/ninho. At? quatro tentativas de nidifica??o foram realizadas por uma f?mea na mesma temporada reprodutiva. O intervalo m?dio entre a perda de um ninho e uma nova tentativa foi 2,7 ? 1,3 dias e a dist?ncia m?dia entre ninhos subsequentes em um territ?rio foi 104,2 ? 60,2 m. Embora haja pouca informa??o dispon?vel na literatura sobre a reprodu??o de E. ypiranganus, alguns par?metros b?sicos encontrados s?o semelhantes aos j? descritos. No entanto, muitos resultados deste estudo s?o in?ditos para a esp?cie, a exemplo da territorialidade, sucesso reprodutivo e sele??o dos s?tios de nidifica??o.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 462153.pdf: 3775224 bytes, checksum: 53f7039427c81f58bb25468b8bd55521 (MD5) Previous issue date: 2014-08-20 / Grapevines are attacked by pests and diseases. Under humid conditions, fungal and bacterial diseases are predominant, while in arid regions, the main pests consist of insects and mites. Among the latter, the phytophagous mites are very important. The present work aimed to assess the diversity of mites in vineyards of Cabernet Sauvignon and Pinot Noir varietals in the municipalities of Bento Gon?alves and Candiota, located in the state of Rio Grande do Sul, Brazil; to identify all the stigmaeids at species level and, if necessary, describe unknown species; to know Panonychus ulmi biology in grapevine leaves in the laboratory and the biology of Agistemus floridanus and Neoseiulus californicus feeding on P. ulmi; to evaluate the predators feeding preference and the interactions among the three species; and to build an identification pictorial key for the phytophagous and predatory mites living on grapevines. To evaluate the mite diversity, leaves, buds and non-cultivated plants were sampled between October 2006 and September 2007. In the laboratory, the mites were taken from the leaves, mounted in slides using Hoyer medium and identified with the help of dichotomous keys. All stigmaeids collected were measured and compared to the species already described. Those that presented distinct measures or characteristics were considered new species. Biology of P. ulmi was initiated with 30 eggs kept on Cabernet Sauvignon leaves and 30 eggs kept on Pinot Noir leaves. The immature phases were observed three times per day, and the adult phase only once a day. The biology of the predators was initiated with 30 N. californicus eggs and 30 A. floridanus eggs, and the same observation method was used. The data generated was used to build fertility life tables. Agistemus floridanus and N. californicus feeding preference was assessed by offering them P. ulmi eggs, immature individuals and adults. In order to evaluate their behavior in the presence of P. ulmi and of conspecific and heterospecific odors, each predatory species was given two choices with different odor sources, and their populations were observed after N. californicus was liberated in the field. To make the pictorial key, the diagnostic characteristics were used to distinguish the families and the species, with representative illustrations. The results indicate that species richness and abundance are higher in Bento Gon?alves than in Candiota. Seven Stigmaeidae species live in vineyards in Rio Grande do Sul state: Agistemus brasiliensis, A. floridanus, Agistemus mendozensis, Agistemus riograndensis, Zetzellia agistzellia, Zetzellia malvinae and Zetzellia ampelae. Panonychus ulmi presents an adequate development on grapevine leaves, although its oviposition period and female longevity were both shorter than expected. The Cabernet Sauvignon variety seems to be more adequate than Pinot Noir. Agistemus floridanus and N. californicus completed their development cycle feeding on P. ulmi on grapevines, and presented different life table parameters. Neoseiulus californicus liberation test resulted in a decrease in the number of P. ulmi eggs and mobile forms and in an increase of Agistemus sp. populations, while the number of N. californicus remained stable. The two predators preferred to feed on P. ulmi eggs and responded positively to its presence, and recognized the odor of heterospecific predators. The pictorial key elaborated includes Tetranychidae, Eriophyidae, Tarsonemidae, Tydeidae, Tenuipalpidae, Phytoseiidae, Stigmaeidae and Iolinidae and will be very useful for professionals and researchers who wish to identify mites in the grapevine culture. / As videiras s?o atacadas por doen?as e pragas. Sob condi??es ?midas, doen?as f?ngicas e bact?rias s?o predominantes, enquanto que em regi?es ?ridas, insetos e ?caros s?o as principais pragas. Dentre estas, os ?caros fit?fagos apresentam grande import?ncia. Objetivou-se avaliar a diversidade de ?caros em parreirais das variedades Cabernet Sauvignon e Pinot Noir nos munic?pios de Bento Gon?alves e Candiota, Estado do Rio Grande do Sul, Brasil; identificar a n?vel espec?fico todos os estigme?deos coletados e descrever, quando o caso, esp?cies desconhecidas para ci?ncia; conhecer a biologia de Panonychus ulmi em folhas de videiras em laborat?rio, assim como a biologia dos predadores Agistemus floridanus e Neoseiulus californicus alimentando-se de P. ulmi; avaliar a prefer?ncia alimentar dos predadores e a rela??o que se estabelece entre as tr?s esp?cies; e, construir uma chave pict?rica de identifica??o dos ?caros fit?fagos e predadores presentes em videiras. Para avalia??o da diversidade, folhas, gemas e plantas n?o cultivadas foram amostradas de outubro de 2006 a setembro de 2007. Em laborat?rio, os ?caros foram retirados das folhas, montados em l?minas com meio de Hoyer e identificados com aux?lio de chaves dicot?micas. Todos os estigme?deos coletados foram medidos e comparados com as esp?cies j? descritas. Aqueles que possu?am medidas ou caracter?sticas distintas foram considerados como esp?cies novas. A biologia de P. ulmi foi iniciada com 30 ovos mantidos em folhas de Cabernet Sauvignon e 30 em Pinot Noir. As fases imaturas foram observadas tr?s vezes ao dia, e a fase adulta uma vez ao dia. A biologia dos predadores foi iniciada com 30 ovos de N. californicus e 30 de A. floridanus, com o mesmo m?todo de observa??o citado anteriormente. Os dados gerados foram utilizados para constru??o de tabelas de vida de fertilidade. A prefer?ncia alimentar de A. floridanus e N. californicus foi avaliada oferecendo ovos, imaturos e adultos de P. ulmi. Para avalia??o do comportamento dos predadores na presen?a de P. ulmi e de odores de coespec?ficos e heteroespec?ficos foram dadas duas op??es, com fontes diferentes de odor, para cada esp?cie de predador, al?m da observa??o das popula??es ap?s a libera??o de N. californicus em campo. Para elabora??o da chave pict?rica, caracter?sticas diagn?sticas foram levantadas e utilizadas para diferencia??o das fam?lias e esp?cies, com ilustra??es representativas. Os resultados indicam que a riqueza de esp?cies e a abund?ncia s?o maiores em Bento Gon?alves do que em Candiota. Sete esp?cies de Stigmaeidae est?o presentes em videiras no Rio Grande do Sul: Agistemus brasiliensis, A. floridanus, Agistemus mendozensis, Agistemus riograndensis, Zetzellia agistzellia, Zetzellia malvinae e Zetzellia ampelae. Panonychus ulmi apresenta desenvolvimento adequado em folhas de videiras, no entanto o per?odo de oviposi??o e a longevidade das f?meas foram abaixo do esperado, e a variedade Cabernet Sauvignon parece ser mais adequada do que Pinot Noir. Agistemus floridanus e N. californicus completaram seu ciclo de desenvolvimento alimentando-se de P. ulmi em videiras, com par?metros da tabela de vida diferentes. O teste de libera??o de N. californicus revelou uma redu??o no n?mero de ovos e formas m?veis de P. ulmi, um aumento das popula??es de Agistemus sp., e estabilidade no n?mero de N. californicus. Os dois predadores preferiram alimentar-se de ovos de P. ulmi, respondendo positivamente a presen?a do ?caro fit?fago e reconhecendo o odor de predadores heteroespec?ficos. A chave pict?rica elaborada contempla Tetranychidae, Eriophyidae, Tarsonemidae, Tydeidae, Tenuipalpidae, Phytoseiidae, Stigmaeidae e Iolinidae, e ser? de grande utilidade para profissionais e extensionistas na r?pida identifica??o de ?caros na cultura da videira.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 391616-2.pdf: 307807 bytes, checksum: d730e3c284c219d504ea1a29f94f6ffc (MD5) Previous issue date: 2003-06-17 / No Oceano Atl?ntico Sul Ocidental as baleias jubarte migram a cada inverno para o banco dos Abrolhos (16?40 to 19?30 S; 37?25 to 38?57 W) para acasalamento e cria de filhotes. Entretanto, esta popula??o permanece geneticamente n?o caracterizada e suas ?reas de alimenta??o s?o ainda desconhecidas, uma vez que n?o h? pareamento fotogr?fico de indiv?duos entre Abrolhos e os s?tios de alimenta??o na Ant?rtida. A fim de examinar estas quest?es, sequenciamos um segmento de 450 pares de bases do DNA mitocondrial da regi?o controladora de baleias jubarte de Abrolhos (n=176) e das proximidades da Pen?nsula Ant?rtica (n=77). Um total de de 61, 17 e 13 hapl?tipos foram determinados respectivamente no Brasil e nas ?reas I e II da Ant?rtida. A variabilidade gen?tica da ?rea de reprodu??o brasileira foi alta, similar ? de outros s?tios reprodutivos do Hemisf?rio Sul. A propor??o de hapl?tipos compartilhados e a dist?ncia gen?tica demonstraram uma maior semelhan?a entre as duas regi?es ant?rticas que entre o Brasil e qualquer uma destas ?reas. Estes resultados indicam que as popula??es de baleias jubarte das ?reas I e II da Ant?rtida parecem n?o possuir uma clara diferencia??o e que os limites entre as ?reas I e II correntemente definidos pela Comiss?o Internacional da Baleia devem ser deslocados para leste. Sugerimos que a ?rea de alimenta??o da popula??o de baleias jubarte brasileiras n?o estaria na Pen?nsula Ant?rtica ou pr?ximo a ela, mas pode estar localizada na por??o leste da ?rea II, no mar de Weddell ou pr?ximo ?s ilhas Ge?rgias do Sul.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348620.pdf: 3321421 bytes, checksum: 7310e788944d70426c89ea68a3c5e468 (MD5) Previous issue date: 2006-03-31 / Foram investigados alguns aspectos da din?mica populacional do marisco branco Mesodesma mactroides Deshayes, 1854, como a abund?ncia, densidades populacional e relativa, freq??ncias de ocorr?ncia total e relativa, distribui??o espacial, distribui??o vertical, per?odo de recrutamento e biometria, al?m da estrutura e associa??o interespec?fica da comunidade infaunal em praias arenosas do litoral do Rio Grande do Sul. As coletas foram realizadas entre agosto (2004) e setembro (2005), a partir da praia de Pinhal (S30?15 35 W50?14 01,9 ) em dire??o ao sul do Estado, em seis transectos eq?idistantes 15 km. O primeiro transecto foi determinado mediante sorteio entre dez pontos eq?idistantes um quilometro (cinco para o norte e cinco para o sul), a partir de um local permanente e pr?-determinado, a fim de garantir a aleatoriedade na coleta dos dados. Em cada transecto procedeu-se o c?lculo de 30 ondas consecutivas para avaliar o seu ponto m?dio de amplitude (P0). A partir de P0 foram assinalados dois pontos em dire??o ao infralitoral (P-1 e P-2) e tr?s em dire??o ao supralitoral (P1, P2 e P3), distantes um desvio padr?o da m?dia de amplitude das ondas (P0). Enterrou-se um cilindro de 30 cm x 50 cm at? 40 cm de profundidade em cada ponto e tamisou-se o material em malha de 0,25 cm. Foram coletados 13104 esp?cimens, sendo que M. mactroides foi ? quarta esp?cie mais abundante, respons?vel por cerca de 9% da macroinfauna da comunidade com 1179 esp?cimes coletados. A densidade anual foi de 42,53 ind/m2, com m?xima de 77 ind/m2 (mar?o) e m?nima de 5,55 ind./m2 (julho). No que diz respeito ? influ?ncia da urbaniza??o sobre a popula??o de M. mactroides, observou-se que esta influi sobre os esp?cimes considerados adultos (acima de 43 mm de comprimento). Isso, provavelmente, decorre do processo de explora??o destinado ao consumo e ao abastecimento das in?meras iscarias existentes na regi?o. Os indiv?duos jovens (entre 10 e 43 mm) aparecem em maior propor??o nas ?reas urbanizadas, devido, provavelmente, ? aus?ncia de seu maior predador em potencial que ? muito abundante nas ?reas n?o urbanas, a ave Haematopus palliatus Temminck, 1820. M. mactroides foi ? segunda esp?cie mais capturada, sendo encontrada em cerca de 22% das unidades amostrais (87 pontos) em que ocorreu a presen?a de macroinfauna. O padr?o de distribui??o espacial encontrado para o marisco branco e para os demais organismos da comunidade foi o agregado. O padr?o de zona??o e da estrutura da comunidade encontrada foi similar ?queles observados em outras praias arenosas expostas, diferenciando-se na diversidade de esp?cies capturadas. Na distribui??o vertical a popula??o apresentou segrega??o por tamanho entre os indiv?duos recrutas (menores de 10 mm) e os adultos, com os recrutas ocupando as zonas acima do ponto m?dio da zona de varrido e os adultos deste ponto em dire??o ao mar. Constatou-se um leve movimento de migra??o vertical em dire??o aos pontos P-2 e P-1 durante o inverno e a primavera, principalmente por parte de indiv?duos jovens e adultos, fen?meno possivelmente associado ao per?odo de recrutamento da esp?cie, uma vez que os picos de recrutamento ocorreram no final do inverno (agosto) e no in?cio da primavera (setembro), tendo in?cio em julho e t?rmino em fevereiro. Nas rela??es biom?tricas entre o comprimento e a largura da concha, e destas com as mensura??es em peso (peso total, peso ?mido e seco das partes moles, peso da concha e diferen?a entre peso ?mido e seco), foi constatada uma congru?ncia entre as m?dias das classes de comprimento em que ocorre a altera??o na taxa de crescimento (~45,47 mm), relacionado, possivelmente, com os processos de matura??o das g?nadas, ou seja, na transi??o dos esp?cimes de jovens para adultos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 397522.pdf: 4907405 bytes, checksum: c89d7657afb6c02ee73ab2305340e111 (MD5) Previous issue date: 2006-01-04 / Nas tr?s ?ltimas d?cadas, os estudos sobre comunidades progrediram muito, todavia existem poucos estudos sobre serpentes que envolvem mais de uma esp?cie em um mesmo local. Pampa ? um importante bioma na por??o subtropical de clima temperado da regi?o neotropical, com forma??es predominantemente abertas, com a presen?a de floresta semidecidual e mata ciliar ao longo dos cursos d ?gua. Apresenta grande relev?ncia quanto a sua biodiversidade, mas ? praticamente desconhecido quanto a composi??o e estrutura de comunidades. O objetivo do presente estudo foi conhecer a diversidade, hist?ria natural e alguns aspectos ecol?gicos das esp?cies de uma comunidade de serpentes da Serra do Sudeste do Rio Grande do Sul. Registrou-se a presen?a das esp?cies de serpentes entre janeiro de 2000 e junho de 2003, com o uso simult?neo de quatro m?todos amostrais: procura visual limitada por tempo (a p? e de carro); armadilhas de intercepta??o e queda; coletores residentes e consulta em cole??es cient?ficas. A ?rea de estudo caracteriza-se pela presen?a de floresta semidecidual e forma??es de campos entremeados por matas ciliares. A riqueza dentro da ?rea de coleta foi igual a 28 esp?cies, outras quatro foram identificadas na cole??o do MCPRS (Museu de Ci?ncias da Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul), totalizando 32 esp?cies. Os m?todos que apresentaram melhor desempenho em n?mero de esp?cies (riqueza) e indiv?duos (abund?ncia) foram coletores residentes (23/294) e armadilhas de intercepta??o e queda (16/140). A riqueza estimada (Jackknife 1 e 2, Chao 1 e 2) ficou entre 32 e 36 esp?cies. A composi??o das esp?cies de serpentes da Serra do Sudeste apresentou maior similaridade com outras taxocenoses que habitam ?reas com forma??es de campo (pampas), seguido por ?reas abertas com floresta semidecidual e de Mata Atl?ntica. As duas esp?cies mais abundantes foram Bothrops pubescens (21%) (Viperidae) e Philodryas patagoniensis (18%) (Colubridae). A riqueza de esp?cies obtida atrav?s das armadilhas instaladas na mata e no campo foram diferentes: a composi??o da mata apresentou riqueza (n=14), diversidade (H =2,46) e eq?itabilidade (E=79%) maiores que o campo (n=12, H =2,13, E=51%). Serpentes terrestres e diurnas foram as mais frequentemente encontradas. Locais onde houve maior n?mero de encontro com serpentes foram em estradas vicinais (n=60 em deslocamento) e ambientes peri-domiciliares (n=58). A atividade mensal das serpentes est? correlacionada ? temperatura (r2=0.52). As tr?s esp?cies mais abundantes apresentaram h?bito alimentar generalista. Os itens alimentares mais consumidos pelas esp?cies foram anf?bios anuros e lagartos, seguidos por moluscos, artr?podes e aves. A composi??o de esp?cies obedece ao padr?o conhecido e caracter?stico da coloniza??o e dispers?o das linhagens de serpentes que habitam a regi?o neotropical, refletindo assim influ?ncia de fatores hist?ricos, filogen?ticos e ecol?gicos.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-02-01T20:25:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_MetodosColetasMosquitos.pdf: 3989932 bytes, checksum: e2eb87c0013bd429a0c794c17179b3c6 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-02-04T14:07:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_MetodosColetasMosquitos.pdf: 3989932 bytes, checksum: e2eb87c0013bd429a0c794c17179b3c6 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-04T14:07:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_MetodosColetasMosquitos.pdf: 3989932 bytes, checksum: e2eb87c0013bd429a0c794c17179b3c6 (MD5) Previous issue date: 2007 / Vários métodos de captura de mosquitos foram desenvolvidos, demonstrando que houve uma evolução dos tipos de armadilhas ao longo do tempo, porém nenhum se comparou à coleta direta por Atração Humana (AH). Este trabalho teve por objetivo, testar métodos alternativos, desenvolvidos para coletar mosquitos, incluindo o desenvolvimento de novas técnicas, que podem substituir o método tradicional de captura direta em humanos. O estudo foi desenvolvido próximo ao Parque Ambiental de Belém, Pará, Brasil. Os métodos utilizados foram: armadilhas CDC, CDC UV, Shannon, armadilha desenvolvida por J. A. Rocha, armadilha desenvolvida por I. S. Gorayeb e coleta por AH. As armadilhas foram instaladas em seis pontos, por seis noites consecutivas. Foram capturados 13.099 espécimes de Culicidae distribuídas em sete gêneros e 27 espécies, sendo Anopheles trianulatus a mais abundante. Os dados foram tratados estatisticamente pelos métodos ANOVA, Análise multivariada – distâncias euclidianas. A coleta por AH direta foi o método que coletou maior diversidade e abundância de mosquitos, seguidos da armadilha de Shannon para abundância e armadilha de Gorayeb para diversidade. / Some methods capture of mosquitoes already had been developed, demonstrating that it had an evolution of the types of the trap to the long one of the time, however none has shown to be comparable to the direct human attraction (AH). This work had for objective, to test the methods alternative, developed to collect mosquitoes, including the development of new techniques, that can substitute the traditional method of direct human attraction. The study it was developed next to “Parque Ambiental de Belém”, Pará state, Brazil. The used methods were: traps CDC, CDC UV, Shannon, trap developed by Rocha, trap developed by Gorayeb and collect for AH direct. The traps were installed in six points, for six consecutive nights. Were captured 13,099 specimens of Culicidae of seven genera and 27 species, being Anopheles trianulatus the most abundant. The direct human attraction, what it collected greater diversity and abundance of mosquitoes, followed of the Shannon’s trap for abundance and Gorayeb’s trap for diversity.