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Divergência genética em acessos de amendoim com base em descritores fenotípicos

Ramos, Jean Pierre Cordeiro 12 February 2015 (has links)
Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2016-03-09T14:02:43Z No. of bitstreams: 1 PDF - Jean Pierre Cordeiro Ramos.pdf: 743229 bytes, checksum: e79f51445e4907b6849b1bc46cf35e46 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-07-21T21:01:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Jean Pierre Cordeiro Ramos.pdf: 743229 bytes, checksum: e79f51445e4907b6849b1bc46cf35e46 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-07-21T21:01:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Jean Pierre Cordeiro Ramos.pdf: 743229 bytes, checksum: e79f51445e4907b6849b1bc46cf35e46 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-21T21:01:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Jean Pierre Cordeiro Ramos.pdf: 743229 bytes, checksum: e79f51445e4907b6849b1bc46cf35e46 (MD5) Previous issue date: 2015-02-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The peanut breeding programs are based on introducing or disponibilization of genetic variability by crossing, with further selection of lines showing robust descriptors as to agronomical, nutritional and physiological aspects. The multivariate analysis methodologies have been often used to estimating the inter-relationship between genotypes, based in several descriptors in order to indicate group of promising materials for further use in breeding programs. The objective of this study was to estimate the genetic diversity among peanut genotypes based on three clustering methodology, in order to selecting parents for oil and food markets. A germplasm collection containing 77 genotypes of peanut (var. fastigiata and vulgaris) was planted in field, using plots consisted of 5m-rows, in a spacing 0.7 m X 0.2 m. The following variables were evaluated: height of main stem, total dry weight of plant, weight of pods/plant, seed weight/plant, number of pods/ plant, number of seeds/pod, weight of 100 pods, weight of 100 seeds, percent of oil in seeds, pod length, harvest index, hairiness, color of the main stem, growth habit, color seed, color of leaves, inflorescence on the main stem, early flowering and Full maturation of pods. Three clustering methods were selected for divergence analysis: Tocher, UPGMA and principal components.. It was found that the three methodologies, when used together, were consistent in group establishing, revealing interesting combinations for further use in breeding programs, aiming generation of drought tolerant lines and indicated to food market. / Os programas de melhoramento do amendoim se baseiam na introdução ou disponibilização de variabilidade genética, seguidos de seleção de linhagens que apresentem descritores responsivos pelo desempenho das plantas nos aspectos nutricionais, fisiológicos e agronômicos. Técnicas de análise multivariada têm sido frequentemente utilizadas para estimar as interrelações entre genótipos, baseando-se em vários descritores com intuito de indicar quais genótipos são mais promissores para serem inseridos em programas de melhoramento. Objetivou-se, com este trabalho, proceder a uma análise da diversidade genética entre genótipos de amendoim baseando-se em diferentes métodos de agrupamento, visando seleção de genitores para os mercados de óleo e alimento. Foram utilizados 77 genótipos na fase de pré-melhoramento de amendoim da subespécie fastigiata, contendo as variedades fastigiata e vulgaris, da coleção de amendoim da Embrapa Algodão. A unidade experimental foi constituída por uma fileira de 5 m contendo 50 plantas, num espaçamento 0,7 m X 0,2 m. Foram avaliadas as seguintes variáveis: peso das vagens/planta, peso das sementes/planta, número de vagens/planta, número de sementes/vagem, peso de 100 vagens, peso de 100 sementes, teor de óleo nas sementes, comprimento da vagem, índice de colheita, peso seco total da planta, altura da haste principal, pilosidade, cor da haste principal, hábito de crescimento, cor das sementes, cor dos folíolos, inflorescência na haste principal, início da floração e Maturação completa da vagem. Três métodos de agrupamentos foram selecionados para analise da divergência: Tocher, UPGMA e componentes principais. As três metodologias usadas, em conjunto, mostraram-se concordantes na formação dos grupos estabelecidos, revelando combinações interessantes para serem usadas em programas de melhoramento visando obtenção de linhagens com tolerância ao ambiente semiárido e com padrão de sementes voltados para o mercado de alimentos.
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Divergencia de loci microsatélites entre papas silvestres y cultivadas (familia Solanaceae, género Solanum, sección Petota)

Merino Méndez, Carlos Gonzalo January 2006 (has links)
Un set de 18 marcadores microsatélite (SSR, del inglés “simple sequence repeat”, repetición de secuencia simple) identificados en Solanum tuberosum (papa cultivada) y que cubren sus 12 cromosomas fue desarrollado previamente para genotipificar el germoplasma de la papa cultivada. Hemos evaluado su utilidad a diferentes distancias filogenéticas de su especie originaria, la papa cultivada S. tuberosum, en una muestra de 50 especies de papa silvestre y otras 2 especies del mismo género. Los marcadores SSR produjeron amplicones en 27% a 100% de las 52 especies, dependiendo del marcador. Se comprobó mediante secuenciación de una muestra de amplicones que los motivos repetitivos estuvieron presentes en la mayoría de los fragmentos secuenciados. Además, se observó un alto grado de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP, del inglés “single nucleotide polymorphism”, polimorfismo de un solo nucleótido) e inserciones / supresiones (indel, del inglés insertion / deletion) entre los motivos repetitivos y la secuencia de los iniciadores (primers). Estos resultados indican, en primer lugar, que los 18 loci microsatélites producen amplicones en loci homólogos. En segundo lugar el alto grado de polimorfismo fuera del motivo repetitivo indica que existe un considerable grado de homoplasia que reducirá extensamente la utilidad del set de SSR para papa cultivada en estudios filogenéticos en especies de papa silvestre distanciadas de la base de germoplasma de la papa cultivada. A pesar de esto, el análisis de distancia genética usando el índice de similitud de Jaccard y el método de agrupamiento Neighbor Joining, produjo dendrogramas que coinciden con hipótesis de relaciones cladísticas basadas en recientes filogenias moleculares, pero no así con relaciones anteriores basadas en series. / A kit of 18 microsatellite markers, also referred to as simple sequence repeats (SSR), covering all 12 chromosomes of the potato was previously developed for genotyping the cultivated potato. We have assessed its utility on a sample of 50 wild potato species and 2 other species of the same genus at varying phylogenetic distances from its source, the cultivated potato Solanum tuberosum. The SSR markers produced amplicons in 27% to 100% of the 52 species. A sample of them was sequenced. Although repeat motifs were present in most of the amplicons sequenced, a high degree of single nucleotide polymorphism (SNP) and insertion / deletion events (indel) was observed between the repeat motifs and the primer sequence. These results indicate that: firstly, the 18 microsatellite loci produce amplicons in homologous loci; and secondly, homoplasy will be relatively frequent and hence reduce largely the utility of the cultivated potato SSR kit for phylogenetic studies in wild potato species distant from the cultivated potato germplasm base. Despite this, genetic distance analyses using Jaccard similarity index and Neighbor Joining clustering method produced trees roughly matching hypotheses of cladistic relationships based on recent molecular phylogenies, but not on prior series relationships.
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Análisis de la diversidad genética de papa nativa (Solanum spp.) de los departamentos de Ayacucho, Cajamarca, Cuzco, Huancavelica y Puno-Perú, mediante el uso de marcadores moleculares microsatélites

Soto Torres, Julián Vicente January 2006 (has links)
La papa (Solanum spp.) tiene una gran importancia alimenticia y es de gran utilidad en el mejoramiento genético, esta representado por 8 especies cultivadas y alrededor de 200 especies silvestres con gran diversidad de caracteres. El “Proyecto de Conservación In Situ de los cultivos nativos y sus parientes silvestres” se viene desarrollando como respuesta a la amenaza latente de perdida de la diversidad genética y busca fortalecer la conservación de las especies nativas más importantes en las chacras de los campesinos. Una de las primeras acciones ha sido inventariar y caracterizar la diversidad y variabilidad de los cultivos priorizados. Para el caso de la papa, los inventarios y el uso de marcadores morfológicos han demostrado un alto grado de diversidad genética mantenida por los agricultores andinos, sin embargo, debido a que estas características morfológicas son afectadas por el ambiente se hace necesario corroborar los resultados obtenidos mediante otras técnicas que no se encuentren bajo la presión ambiental. Por tal motivo, se decidió analizar el grado de diversidad genética presentada en una muestra aleatoria de 79 variedades nominales de papa nativa (Solanum spp.) procedente de cinco zonas del Perú (Ayacucho, Cajamarca, Cuzco, Huancavelica y Puno) cultivadas en las chacras de los agricultores que forman parte del Proyecto de “Conservación In situ de los cultivos nativos y sus parientes silvestres”, mediante el uso de 18 marcadores moleculares microsatélites-SSR Los microsatélites son secuencia cortas de di, tri o tetranucleótidos que están distribuidas en tandem a lo largo del genoma, siguen una herencia mendeliana, no son afectados por factores ambientales, son de carácter codominante y tienen un alta tasa polimórfica. Las secuencias son detectadas mediante PCR con el uso de iniciadores específicos, separación en geles de poliacrilamida y tinción con plata. Los análisis de agrupamiento, riqueza alélica y análisis de diversidad genética realizados a partir de los datos obtenidos de 19 locus microsatélites registrados, demostraron el alto grado de diversidad genética que presenta la muestra colectada y corrobora los resultados obtenidos en el proyecto In situ. Además la comparación de la riqueza alélica mantenida por cada región de colecta hace presumir que existe un flujo génico constante entre estos lugares.
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Variabilitat de la mongeta Ganxet ("Phaseolus vulgaris" L.): determinació de tipologies i selecció de línies comercials

Sánchez Bell, Esther 27 January 2004 (has links)
En el context europeu actual l'ampliació en l'oferta de cultius i tipus varietals és una eina important per a l'agricultor. Les varietats tradicionals bé poden ocupar un lloc significatiu dins del panorama agrícola actual si són correctament avaluades i sotmeses a un procés de selecció i millora genètica que permeti el seu millor cultiu i comercialització. A més, els consumidors demanen cada cop més qualitat front a quantitat, variació i valor organolèptic als productes alimentaris. A Catalunya persisteixen una desena de tipus varietals tradicionals de mongeta per a consum en gra d'entre les quals la mongeta Ganxet és la que té una importància econòmica més significativa. Pertany a l'espècie Phaseolus vulgaris L. i és fàcilment reconeixible per la forma ganxuda de la llavor fins i tot després de ser cuinada, ja que es consumeix com a llegum gra, sec i cuit. L'objectiu general de la tesi era definir els límits com a possible nova classe comercial i seleccionar línies pures prototípiques del tipus varietal mongeta Ganxet, com a cultivars homogenis i estables. S'ha constituït una col·lecció de 69 entrades de germoplasma cultivat i comercialitzat sota la denominació Ganxet, presentant un ventall considerable de morfologies, amb llavors que van de lleugerament a molt ganxudes. Les entrades inequívocament reconeixibles com a Ganxet presenten plantes tardanes, amb hàbit de creixement indeterminat enfiladís de tipus IV, entrenusos llargs, fulles i tavelles verd fosc i flors blanques. Presenten tavelles de 13,9 a 17 cm de longitud amb 3,7 a 5,8 llavors per tavella i produccions de 36,3 a 51,9 g/planta. Les llavors són de mida mitjana-gran (38,8 a 61,9 g/100 llavors), aplanades i ronyonades (grau de ganxo entre 1,5 i 2,8 sobre 3) amb un 23,26% a 27,63% de proteïna, 1,48% a 2,10% de greix i 7,45% a 8,90% d'episperma. Les llavors absorbeixen entre un 42,73% a 48,12% d'aigua durant el remull. S'han seleccionat set línies pures prototípiques del tipus varietal Ganxet amb produccions acceptables, excel·lents característiques organolèptiques i nutricionals, i fàcilment identificables com a classe comercial. El nivell de polimorfisme entre les línies és equivalent al que es troba dins de classe comercial. Presenten tavelles de 14,7 a 15,7 cm de longitud amb 4 a 4,6 llavors per tavella i produccions de 57,7 a 65,9 g/planta. Les llavors són de mida gran (50,3 a 52,3 g/100 llavors), aplanades i ronyonades (grau de ganxo entre 2,1 i 2,9 sobre 3) amb un 27,14% a 29,32% de proteïna, 21,77% a 23,41% de fibra dietètica, 0,067% a 0,082% de glucosa, 24,72% a 27,50% de midó i 8,9% a 9,6% d'episperma. La línia pura seleccionada L67 ha estat posada a disposició dels agricultors i es troba en fase de registre sota el nom de Montcau. El germoplasma Ganxet, avaluat mitjançant marcadors RAPD, probablement és d'origen mesoamericà de la raça Mesoamèrica amb introgressions, almenys, de la raça Durango.
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Análise da estrutura genética do banco de germoplasma do programa CANA - IAC por meio de marcadores moleculares /

Manechini, João Ricardo Vieira January 2017 (has links)
Orientador: Luciana Rossini Pinto / Coorientador: Marcos Guimarães de Andrade Landell / Banca: Ana Lilia Alzate Marin / Banca: Dilermando Perecin / Resumo: A cana-de-açúcar figura mundialmente como uma importante cultura econômica, com grande participação no suprimento da demanda global por energia e açúcar. Bancos ativos de germoplasma são repositórios in vivo de variabilidade genética para os programas de melhoramento, estando diretamente relacionados ao sucesso do programa. Para uma gestão adequada e eficiente do banco é necessário conhecer a magnitude e distribuição da variabilidade genética dentro e entre os grupos de acessos das respectivas espécies que o compõe bem como identificar os acessos duplicados ou erroneamente identificados. Marcadores moleculares microssatélites são adequados para tal finalidade. O presente trabalho teve como objetivo principal avaliar a estrutura genética de um grupo de 593 genótipos, constituído por germoplasma básico e melhorado, disponíveis no banco de germoplasma do Programa Cana - IAC. Além disso, a magnitude da diferenciação genética entre as principais cultivares brasileiras e o germoplasma básico de cana-de-açúcar também foi investigada. Para tanto, 12 pares de primers SSR de alto poder discriminatório foram utilizados. A análise da estrutura genética separou os genótipos em dois grupos principais, um constituído por germoplasma básico e o outro por genótipos melhorados. A partição da variabilidade genética mostrou que 14,44% (P<0,001) da variabilidade total detectada pelos marcadores encontra-se entre estes dois grupos. Resultados semelhantes foram observados entre as principais cultiv... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugarcane is a crop with worldwide economic importance due to its large participation in supplying the global demand for energy and sugar. Active germplasm banks are in vivo repositories of genetic variability for breeding programs, being directly related to their success. For its adequate management, a constant routine of surveillance and control over the accessions is required. Microsatellite (SSRs) molecular markers are suitable for this purpose. The present work aims to evaluate the genetic structure of a group of 593 individuals, composed by basic germplasm accessions and breeding genotypes, available within the germplasm bank of the Campinas Agronomic Institute (IAC) Sugarcane Genetic Breeding Program, based on these markers, with a focus on the comparison between the genetic diversity of Brazilian clones and cultivars (IAC, CTC, SP and RB) with accessions of diverse species, genera and exotic hybrids. In addition, the magnitude of the genetic differentiation between the main Brazilian cultivars and the basic sugarcane germplasm was also investigated. For this purpose, 12 pairs of SSR primers with high discriminatory power were used. The genetic variability present in the group is structured in a way where breeding materials differ from wild accessions, constituting two groups of individuals. Genetic variability among them is 14.44%, while 85.56% is present within them (P<0.001). Similar results were observed between the main Brazilian cultivars and the basic germplasm,... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Relações de cruzabilidade entre espécies e acessos de germoplasma do gênero Arachis associados ao genoma B do amendoim (Arachis hypogaea L.)

Custodio, Adriana Regina 24 October 2012 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T14:11:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278939.pdf: 5854561 bytes, checksum: 155cace8ba488d9bd568d8dbb4469431 (MD5) / Foram realizadas 1368 polinizações envolvendo 39 combinações híbridas. A espécie genitora foi Arachis gregoryi, acesso V 14957, que foi cruzada com diferentes espécies do genoma A, B, D, com espécies com 2n=2x=18, 2n=2x=40 e com a Secção Erectoides. Para todos os genitores e para os híbridos que produziram flores foi estimada a porcentagem de viabilidade do pólen. O conjunto de dados obtidos permite inferir que existe cruzabilidade entre A. gregoryi e várias espécies da secção Arachis associadas, em maior ou menor grau ao genoma B de A. hypogaea. Isto mostra o potencial para a inclusão em trabalhos de pré-melhoramento destinados à formação de linhagens a incorporar ao melhoramento genético do amendoim. Houve a formação de híbridos com espécies associadas ao genoma A de A. hypogaea, o que permite a produção de anfidiplóides sintéticos. Com A. hypogaea houve a formação de híbridos triplóides e, assim como com A. monticola, em alguns casos ocorreu aborto do embrião nos estágios iniciais de desenvolvimento. Devido do pouco desenvolvimento das plantas ainda não foi possível confirmar a hibridação com a espécie de 2n=2x=18. Foi estimada a diversidade alélica por marcadores moleculares microssatélites, com o objetivo de conhecer as relações de afinidade de 96 acessos pertencentes a 35 diferentes espécies. Houve a formação de nove grupos principais, ficando evidente a coesão dos acessos de A. gregoryi, e sua estreita associação com A. ipaënsis e A. valida, e, em menor grau, com A. magna, cujos acessos mostraram-se heterogêneos. O conjunto de espécies diplóides com 2n=20 e sem o par de cromossomos A, A. williamsii, A. batizocoi, A. krapovickasii, A. glandulifera, A. cruziana, A. benensis e A. vallsii situaram-se mais distantes do conjunto de acessos de A. gregoryi. Na hibridização in situ por fluorescência (FISH) foram analisados 12 acessos brasileiros de cinco espécies. Os acessos de A. gregoryi mostraram maior similaridade do que a espécie simpátrica A. magna que se mostrou mais heterogênea e, também a sua proximidade com A. ipaënsis, A. valida e A. williamsii. / In germplasm collections undertaken in Southern Brazil, accessions of Paspalum have been characterized and compared, according to distinct groups, that suggest the occurrence of distinct hybridizations in the origin of materials with distinct ploidy levels. Morphological features were surveyed for pentaploids supposed originated from interspecific natural crosses, which locate the accessions V14285, V14289 e V14860 closer to the Paspalum dilatatum #Torres# biotype (V14401) or to P. urvillei (V14392), with some features presenting intermediate values, such as the number of shoots, and the height of the first visible node. Unstained and dimorphic pollen grains were observed in all pentaploids of this group. As concerns pentaploid accessions supposedly originated from intraspecific natural hybridizations, intermediate values were found for morphological features. Concerning cytogenetic aspects, unbalanced cell division, dimorphic pollen, and low pollen viability estimates were observed in pentaploids. A heptaploid accession, for the first time reported from Brazil, has shown variable and abnormal meiotic behavior, forming diads, polyads, and normal tetrads. However, normal seed was developed, with germination above 50%.
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Desenvolvimento de painéis multiplex de marcadores microssatélites e mapeamento de QTLs de tolerância à seca e ao frio em linhagens puras recombinantes de arroz (Oryza sativa L.)

Schmidt, Andréa Branco 24 October 2012 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T16:24:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 274882.pdf: 23089749 bytes, checksum: 0959cb7ca9be8b973afd78ca21331a4a (MD5) / A análise de polimorfismo de sequência de DNA em regiões hipervariáveis do genoma foi utilizada na caracterização de acessos conservados em Banco de Germoplasma e no mapeamento de regiões genômicas que controlam tolerância à seca e ao frio em arroz. Inicialmente foram selecionados 441 marcadores microssatélites distribuídos no genoma de arroz (Oryza sativa L.) para análise em painéis de amplificação alélica simultânea. A estimativa de parâmetros genéticos de cada marcador microssatélite possibilitou a seleção de 41 marcadores para o desenvolvimento dos painéis. A análise de PCR simultâneo de grupos de marcadores amostrados entre os 41 selecionados possibilitou o desenvolvimento de oito novos painéis multiplex de microssatélites, que permitem a amplificação simultânea de alelos em diferentes locos em uma única reação de polimerase em cadeia. Os painéis desenvolvidos foram testados para estimar relações de vínculo genético entre acessos do Banco de Germoplasma de Arroz. Testes de identidade genética para a detecção de acessos duplicados na Coleção de Base de Arroz indicam um nível de duplicação acima de 64% em acessos com a mesma denominação na coleção. Os painéis mostraram-se eficientes para uso em estudos genéticos diversos, como em programas de conversão linhagens. Uma análise do percentual de conversão do genoma em programa de retrocruzamento para resistência a herbicida possibilitou a identificação de linhagens com conversão genotípica variando de 91,86 a 97,67% em RC3. As estimativas de diversidade genética entre os acessos foram ainda utilizadas para selecionar cultivares de arroz para uso em estudos de mapeamento de regiões do genoma associadas ao controle de tolerância à seca e ao frio. As cultivares Chorinho e Amaroo (subespécie japonica) foram cruzadas para a obtenção de linhagens puras recombinantes (RILs - Recombinant Inbred Lines) para mapeamento genético de QTLs de tolerância ao frio. Um mapa genético foi construído para a população RIL Chorinho x Amaroo. Os ensaios fenotípicos para tolerância ao frio foram desenvolvidos em campo e em condições controladas. Na análise de dados coletados no campo foram detectadas oito QTLs de tolerância ao frio nas avaliações de parâmetros de produtividade e quatro QTLs nas análises de viabilidade de pólen. Em condições controladas foi possível detectar quatro QTLs associados ao controle de tolerância ao frio durante a germinação. Um dos QTLs identificados em condições controladas corresponde ao intervalo em que foi detectada uma região genômica associada à característica Viabilidade de Pólen avaliada em condições de campo. As cultivares Chorinho e Puteca (subespécie japonica tropical) foram cruzadas para a obtenção de linhagens puras recombinantes para mapeamento genético de QTLs de tolerância à seca. Um mapa genético baseado nos marcadores microssatélites foi construído para a população RIL Chorinho x Puteca. Os ensaios fenotípicos para tolerância à seca foram desenvolvidos em campo em local de estiagem prolongada com o uso de irrigação controlada e estresse hídrico durante o desenvolvimento das plantas. Para este estudo foram avaliados parâmetros de desenvolvimento radicular em duas profundidades de solo. Baseado nos dados genotípicos e fenotípicos foi possível detectar cinco QTLs associados ao controle de tolerância à seca, distribuídos nos cromossomos 1, 2, 3 e 5. Vários QTLs de tolerância à seca e ao frio detectados neste trabalho encontram-se na mesma região genômica de QTLs detectados em outros experimentos, desenvolvidos em diferentes locais com a utilização de diferentes populações de arroz. A complementação dessas informações deve auxiliar a validação de QTLs associados ao controle destas características. Os dados obtidos possibilitam o emprego de painéis multiplex de microssatélites na caracterização e uso de acessos do Banco de Germoplasma, bem como o desenvolvimento e teste de estratégia de seleção assistida por marcadores para tolerância à seca e ao frio em arroz.
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Inovações em sistemas de micropropagação in vitro do abacaxizeiro (Ananas comosus var. comosus) e caracterização genética de variedades crioulas do estado de Santa Catarina

Scherer, Ramon Felipe 26 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T04:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 291237.pdf: 5528836 bytes, checksum: 89b2d27edaf5442e5fe4329b22f651f9 (MD5) / O abacaxizeiro (Ananas comosus var. comosus) é uma espécie domesticada no norte da América do Sul, a partir da espécie selvagem A. comosus var. ananassoides. No período anterior a conquista a espécie já estava dispersa por toda América Tropical e parte da Subtropical, configurando uma planta de grande importância social para os grupos humanos. Após o contato com os europeus o abacaxizeiro foi disperso pelo globo, e hoje se configura como uma das frutas tropicais de maior importância econômica mundial. O Brasil é um dos maiores produtores mundiais de abacaxi, tendo como principal consumidor o próprio mercado interno, mesmo apresentando um baixo consumo per capita da espécie. Isto configura um potencial de crescimento da exploração comercial da fruta, tanto no mercado interno como no externo. Em Santa Catarina a baixa produção de abacaxi, aliada ao consumo médio per capita da espécie maior que o nacional, tornam a revitalização do cultivo uma potencial oportunidade para a agricultura catarinense. Porém, para revitalizar o cultivo, os agricultores devem ter acesso a mudas de alto valor genético e isentas de pragas e doenças. A presente dissertação objetivou a caracterização genética de 29 genótipos presentes na coleção de germoplasma do CCA/UFSC, através de 7 marcadores microssatélites. Os acessos conservados na coleção são, em geral, genótipos locais do estado de Santa Catarina, configurando-se de grande importância genética regional. Nesta abordagem foi possível adaptar com sucesso um protocolo de extração de DNA genômico, extraído de partes de folhas basais de plantas adultas (aproximadamente 0,5g), obtendo-se em média 3750 ng de DNA genômico para cada acesso, concentrados em 75 µL de solução estoque. Porém, entre os lócus estudados o maior polimorfismo encontrado foi de 27,58%, o maior número de alelos foi 4, o máximo número efetivo de alelos foi de 1,597 e foi encontrado 3 alelos raros, sendo que dois deles em um mesmo lócus. Isto configura baixo poder de informação, impossibilitando a análise da distância genética e índices de variabilidade genética. A abordagem quanto a qualidade fitossanitária se deu por meio da elaboração de um protocolo de alta performance de micropropagação de abacaxizeiro baseado em culturas nodulares associadas a sistemas de imersão temporária. O protocolo foi dividido em indução e multiplicação de culturas nodulares, regeneração de microbrotos, crescimento à brotos e aclimatização. Os explantes utilizados foram bases foliares retiradas de brotos desenvolvidos in vitro. A melhor combinação de fitorreguladores para a indução de culturas nodulares foi 2 µM de ANA e 8 µM de 2-iP. Para a multiplicação de culturas nodulares a combinação que gerou os melhores resultados foi a de 2 µM de ANA e 2 µM de BAP em sistema de imersão temporária por meio de frascos duplos. Esta mesma combinação de fitorreguladores mostrou-se eficiente para a regeneração de microbrotos, porém, utilizando-se sistema de imersão temporária em frascos RITA®. Posteriormente, em sistema de imersão permanente, o crescimento de microbrotos foi mais adequado em meio de cultura contendo 10 µM de AG3. Brotos acima de 2 cm foram aclimatizados com sucesso em substrato composto por mistura (1:1) de casca de arroz carbonizada e Plantmax® HT, com uma porcentagem de sobrevivência superior a 92%.
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Divergência genética em acessos de melão utilizando redes neurais artificiais / Genetic divergence in melon using artificial neural networks

Melo, Stefeson Bezerra de 20 March 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 StefesonBM_TESE.pdf: 501527 bytes, checksum: 94d141004aa016dc604cc1543577c5ee (MD5) Previous issue date: 2015-03-20 / Melon (Cucumis melo L.) is a species economic importance to Brazilian northeast, especially in Mossoró-Assú agropolo. The study of genetic diversity allows in the preliminary selection of individuals with superior characteristics to produce hybrids with the high heterotic in breeding programs. The objective of this study was to evaluate the genetic divergence among 46 melon genotypes for 22 physicochemical and agronomic quantitative variables, evaluated by techniques artificial neural networks. Two experiments were conducted in Horta Experimental Department of Plant Sciences at the Universidade Federal Rural do Semi-Árido - UFERSA in the Mossoró, State of Rio Grande do Norte, in the periods 12/09/2006 to 05/12/2006 and 15/08/2007 to 17/10/2007. Through the techniques of artificial neural networks, was found four groups for both experiments, but also to average of two years. A discriminant analysis was used to check the consistency of groups formed and it was observed that considering the 22 variables, there was 100% hit, that is, for the discriminant function all genotypes were classified correctly. In addition was also observed distances between groups and group 1 was significantly distant from all other groups, more distant, genetically, Group 3. Group 2 are different with respect to group 3 and group similar to 4. The group 3 shows similarity to group 4. And so we suggest possible crosses between accessions 2, 13, 15, 16, 17, 27, 33, 36, 40, 43, 46 that would be most promising for new populations of work. Artificial neural networks have proved viable as a method of analysis of genetic divergence in melon and genetic divergence was found for all groups, and with that you can get new crossings in order to obtain improved populations / O meloeiro (Cucumis melo L.) é uma espécie de grande importância econômica para o nordeste brasileiro, em especial no agropólo Mossoró-Assú. O estudo da divergência genética possibilita uma seleção preliminar de indivíduos com características superiores para obtenção de híbridos com maior efeito heterótico para serem introduzidos em programas de melhoramento genético. O objetivo deste trabalho foi avaliar a divergência genética entre 46 acessos de meloeiro para 22 variáveis quantitativas físico-químicas e morfoagronômicas, avaliados por meio da aplicação das técnicas de Redes Neurais Artificiais. Foram conduzidos dois experimentos na Horta Experimental do Departamento de Ciências Vegetais da Universidade Federal Rural do Semi-árido - UFERSA, no município de Mossoró, Estado do Rio do Grande do Norte, nos períodos de 12/09/2006 a 5/12/2006 e de 15/08/2007 a 17/10/2007. Por meio das técnicas de Redes Neurais Artificiais, verificou-se a formação de quatro grupos para ambos os experimentos, como também para a média dos dois anos. Analisando os grupos constituídos das médias de 2006 e 2007. Em todos os grupos as variáveis do fruto foram as que obtiveram as maiores dispersões. Uma análise de discriminante foi utilizada para verificar a consistência dos grupos formados e observou-se que considerando as 22 variáveis houve 100% de acerto, isto é, para a função discriminante todos os acessos foram classificados corretamente. Adicionalmente também foi observada as distâncias entres os grupos, e o grupo 1 foi significativamente distante de todos os outros grupos, porém mais distante, geneticamente, do grupo 3. O grupo 2 é divergente em relação ao grupo 3 e similar ao grupo 4. O grupo 3 apresenta similaridade em relação ao grupo 4. E desta forma sugerimos possíveis cruzamentos entre os acessos 2, 13, 15, 16, 17, 27, 33, 36, 40, 43, 46 que seriam os mais promissores para novas populações de trabalho. As redes neurais artificiais se mostraram viáveis como método da análise da divergência genética no meloeiro e foi encontrada divergência genética para todos os grupos estudados, e com isso pode-se obter novos cruzamentos com o intuito de obter populações melhoradas
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Adaptabilidade, estabilidade e tolerância de acessos de meloeiro à salinidade / Adaptability, stability and tolerance toof melon accessions to salinity

Ferreira, Alex Rodrigues 26 February 2016 (has links)
Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2016-11-17T14:28:50Z No. of bitstreams: 1 AlexRF_DISSERT.pdf: 1133764 bytes, checksum: 8e61e6e8abd029e3d77b37b914fbc39a (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-02-15T15:00:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AlexRF_DISSERT.pdf: 1133764 bytes, checksum: 8e61e6e8abd029e3d77b37b914fbc39a (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-02-15T15:00:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AlexRF_DISSERT.pdf: 1133764 bytes, checksum: 8e61e6e8abd029e3d77b37b914fbc39a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:58:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AlexRF_DISSERT.pdf: 1133764 bytes, checksum: 8e61e6e8abd029e3d77b37b914fbc39a (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aim of this study was to evaluate the adaptability and stability of melon accessions to salinity. Thirteen accessions and three commercial hybrids in four saline conditions in a randomized complete block design with three replications and the plot of a row of eight plants spaced 2.0 x 0.4 m. The environments are differentiated as the electrical conductivity of irrigation water, and set four salt levels (S1: 0.91 dS m-1, S2: 2.14 dS m -1, S3: 2.90 dS m-1, and S4: 3.92 dS m-1). The variables analyzed were: average fruit weight, number of fruits, productivity, pulp thickness, firmness of soluble solids and pulp. We utilized the GGE Biplot methodology for identifying adaptability and stability genotypes. We used the production efficiency index to identify tolerant genotypes salinity. Accessions A-29, A-50, A-13, A-14, A-39, Najd I and A-7 are tolerant to salinity and have features such as prolificacy, pulp thickness and firmness pulp for use in breeding programs or as rootstock for cultivation in high salinity conditions / O objetivo desse estudo foi verificar a adaptabilidade e estabilidade de acessos de melão a salinidade. Foram avaliados 13 acessos e três híbridos comerciais em quatro condições salinas em blocos completos casualizados com três repetições sendo a parcela constituída por uma linha de oito plantas no espaçamento 2,0 x 0,4 m. Os ambientes se diferenciaram quanto à condutividade elétrica da água de irrigação, sendo definidos quatro níveis salinos (S1 = 0,91 dS m-1, 2,14 dS m -1, 2,90 dS m-1 e 3,92 dS m-1). As variáveis analisadas foram: peso médio do fruto, número de frutos, produtividade, espessura da polpa, firmeza da polpa e sólidos solúveis. Utilizou-se a metodologia GGE Biplot para identificar os genótipos adaptados e estáveis. Também se utilizou o índice de eficiência de produção para classificar os acessos quanto à tolerância à salinidade. Os acessos/cultivares A-29, A-50, A-13, A-14, A-39, Najd I e A-7 são tolerantes à salinidade e possuem características como prolificidade, espessura da polpa e firmeza da polpa para serem utilizados em programas de melhoramento genético ou como porta-enxertos para cultivo em condições de salinidade elevada / 2016-11-17

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