Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-25T13:08:11Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 580358 bytes, checksum: a0c8dadd8e551b397a84b1273307e0d5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-25T13:08:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 580358 bytes, checksum: a0c8dadd8e551b397a84b1273307e0d5 (MD5) Previous issue date: 2012-07-24 / Objetivou – se com este estudo verificar se a antocianina tem efeito sobre a integridade da membrana plasmática dos espermatozoides de caprinos e investigar o potencial desse antioxidantes no uso de meios diluidores de criopreservação de sêmen caprino. Dez ejaculados de cada reprodutor foram obtidos e denominados partidas, onde no final do experimento foram congeladas 10 palhetas de 0,25mL de cada partida totalizando 400 palhetas congeladas de cada tratamento e controle, sendo após a diluição na proporção de 1:1 (sêmen x Bovimix) determinou-se a concentração espermática. Em seguida, o sêmen fresco foi diluído com o diluidor Bovimix® (controle); Bovimix® + 2,5% de antocinina (tratamento 1); Bovimix® +2,5% antocianina + 2,5% de ciclodextrina (tratamento 2); Bovimix® +2,5% antocianina + 2,5% de ciclodextrina (atomizado) (tratamento 3). Após as diluições finais, o sêmen foi envasado, resfriado e congelado. Após sete dias, as partidas foram descongeladas em banho - Maria a 37oC para avaliação do sêmen pós – descongelamento (motilidade espermática progressiva retilínea, vigor espermático, teste supra vital, fluorescência, e morfologia espermática). Foi verificado diferença (p<0,05) nas médias da motilidade espermática, entre os tratamento 1 (49,8±10,6%), tratamento 2 (50,2±12,1%) e o controle (40,7±12,4%), enquanto que não houve diferença (p>0,05) nos valores médios do vigor, entre os tratamentos 1 (3,5±0,4), 2 (3,5±0,4) e o controle (3,4±0,5); houve diferença (p<0,5) dos valores médios entre os tratamentos 1 (3,5±0,4) e 2 (3,5±0,4), onde o tratamento 2 apresentou um vigor espermático melhor. No teste supra vital observou–se diferença nos valores médios da porcentagem de espermatozóides vivos entre os tratamentos 1 (44,8±10,7%), 2 (45,8±13,1%) e o controle (36,9±13,3%). Em relação ao teste hiposmótico os tratamentos 1 (51,3±10,3%) e tratamento 2 (49,2±12,01%), não apresentaram diferença (p>0,05), porém diferem (p<0,05) do controle (42,4±12,1%). Nos defeitos espermáticos todos os tratamentos se mantiveram dentro dos parâmetros aceitáveis para defeitos maiores, menores e defeitos totais. Já no teste de fluorescência o controle apresentou a maior porcentagem de espermatozóides com baixa atividade mitocondrial e membrana integra (BAMI) ou membrana lesada (BAML), respectivamente (25,2±14,9%) e (50,2±16,0%) do que os tratamentos; 1 (11,3±11,2; 33,8±13,9%), 2 (15,3±11,5; 35,1±12,9%), 3 (17,6±11,7; 50,1±18,8%). Quanto aos padrões de alta atividade mitocondrial membrana integra (AAMI), o grupo controle (23,2±13,6%) obteve médias inferiores aos tratamentos 1 (51,3±18,6; 3,2±4,5%) e 2 (47,3±16,3; 2,3±4,3). Porém nos padrões de alta atividade mitocôndria e membrana lesada (AAML) não houve diferença (p>0,05) entre o controle (1,5±2,0%) e os tratamentos; 1 (3,2±4,5%), 2 (2,3±4,3%) e 3 (1,8±3,9%). A adição de antocianina proveniente do açaí ao diluente contribuiu para melhorar a preservação da integridade das membranas na congelação do sêmen Caprino. / The aim of the study was to verify whether the anthocyanin has an effect on the plasma membrane integrity of goats spermatozoa and investigate the potential use of antioxidants in diluents goats semen cryopreservation. The semen from each collection was named after player game, where at the end of the experiment were 10 frozen straws of 0.25 mL of each game totaling 400 frozen straws of each treatment and control. After dilution 1:1 (sperm x diluent ) determined sperm concentration. Then, the fresh semen was diluted with tinner Bovimix® (control); Bovimix® + 2.5% de antocinina (treatment 1); Bovimix® +2.5% antocianina + 2.5% de ciclodextrina (treatment 2 ); Bovimix® +2.5% antocianina + 2.5% de ciclodextrina (atomizado) (treatment 3). After the final dilution, the semen was submitted to the filling, cooling and freezing. After seven days, the matches were thawed in a water bath - Maria at 37 ° C for semen evaluation post - thawing (total sperm motility, progressive straight, sperm vigor, supra vital test, fluorescence, and morphology). has shown a significant difference (p<0.05) between treatment 1 (49.8±10.6%), treatment 2 (50.2±12.1%) and control (40.7±12.4%), while there was no statistical difference (p>0.05) between the force of group 1 (3.2±0.4), 2 (3.4±0.4), and control (3.3±0.5); there was a difference between treatments (3.2±0.4) and 2 (3.4±0.4), where treatment 2 showed a better effect. In the test above was vital - difference in the percentage of live sperm between treatment 1 (44.8±10.7%), 2 (45.8±13.1%) and control (36.9±13.3%). Regarding testing a hypoosmotic treatment (51.3±10.3) and treatment 2 (49.2±12.1%), not different (p<0.05), but differ (p>0.05) from control (42,4±12.1%), in sperm defects All treatments were maintained within acceptable parameters for defects and total defects, since the fluorescent assay control had the highest percentage of sperm with low mitochondrial activity and membrane includes (Bami) or damaged membrane (BAML), respectively (14.9±25.2%) and (50.2±16.1%) of the treatments: 1 (11.3±11.2; 33.8±13.9%) , 2 (15.3±11.5; 35.1±12.9%), 3 (17.6±11.7; 50.1±18.8%). The standards mitochondrial membrane integrates high activity (AAMI), the control group (23.2±13.6%) averaged less than the first treatment (51.3±18.6; 3.2±4.5%) and 2 (47.3±16.3; 2.3±4.3%). But the standards high activity and mitochondrial membrane damaged (AAML) was not different (p>0.05) between control (1.5±2,0%) and treatments; 1 (3.2±4.5%), 2 (2.3±4.3%) and 3 (1.8±3.%). The anthocyanins additions from acai to the diluent improved the membrane integrity preservation in Caprino semen freezing.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:49:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1523_1.pdf: 1857150 bytes, checksum: a14e48a77fbb5925257d7f1d2ffb6e8c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O estudo da diversidade genética entre acessos de bancos de germoplasma fornece importantes subsídios aos programas de melhoramento vegetal. Com a finalidade de caracterizar a diversidade genética inter e intra-específica do gênero Vigna, as técnicas de DAF (DNA Amplification Fingerprinting), ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) e SSR (Simple Sequence Repeat) foram aplicadas no presente estudo. Vinte e nove acessos de Vigna foram selecionados para a análise, incluindo um acesso de cada uma das quatro espécies V. aconitifolia, V. angularis, V. mungo e V. radiata, bem como 23 acessos cultivados de V. unguiculata (feijão-caupi) e duas subespécies nativas (V. unguiculata ssp. cylindrica e V. unguiculata ssp. sesquipedalis) usando-se como grupo externo duas cultivares de Phaseolus vulgaris ssp. vulgaris (cv. Neckarkönigin e cv. Delinel ). No total foram geradas 1065 bandas polimórficas para a montagem da matriz de dados a partir de 46 primers, sendo quatro DAF, 22 ISSR e 20 pares SSR. Os resultados obtidos foram analisados pelos métodos de neighbor-joining (programa MEGA) e de UPGMA (programa NTSYs 2.1). Nos dendrogramas gerados, o feijão-caupi mostrou-se mais proximamente relacionado com as duas subespécies silvestres de V. unguiculata. As espécies do subgênero Ceratotropis agruparam-se em um clado distinto no qual a espécie V. aconitifolia (considerada primitiva no grupo) aparece em uma posição basal da qual emergem dois subclados incluindo as espécies V. radiata e V. mungo no primeiro e a espécie V. angularis no segundo. Os genótipos de feijão-caupi permaneceram unidos com altos valores de bootstrap (99%), formando dois subclados principais e subgrupos, vários compreendendo acessos com características agronômicas similares. Cultivares com características fenotípicas contrastantes, tais como imunidade (BR14 Mulato e TVU 382) e suscetibilidade (IT 85F-2687) a viroses; resistência (BR17-Gurguéia) e suscetibilidade (CE31) ao nematóide de galhas (Meloidogyne incognita); resistência (IT81D-1053) e suscetibilidade (CNC 0434) ao caruncho (Callosobruchus malucatus); resistência (Pitiúba) e suscetibilidade (Canapu Amarelo) a seca/salinidade, foram agrupados em clusters distintos, demonstrando desta forma haver suficiente divergência genética para seu uso como parentais em cruzamentos de mapeamento. As implicações dos resultados obtidos, especialmente no que se refere ao melhoramento do feijão-caupi são discutidas no presente trabalho

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:22:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lucifrancy Vilagelim Costa.pdf: 2348102 bytes, checksum: 1b6decf454525c5bf05fd0c336e86cc9 (MD5) Previous issue date: 2012-06-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Capsicum peppers are used in different ways by many cultures throughout the world. In Brazil it is found wide variability of this genus and Amazon is an important center of diversity, there is wide genetic variability expressed on several characteristics of plants, flowers and fruits. Information about the diversity in germplasm collection serve to increase the efficiency of improvement works of cultivated species, through morphological characterization is possible to describe accesses that exists in collections, this is important to organize the information and let it available for use in breeding programs. To study the genetic variability of Capsicum spp. It was stablished a collection of its kind in the Faculty of Agrarian Sciences, Federal University of Amazonas, UFAM. The objective of this study was to characterize morphologically 40 accesses collected in the Amazonas. Were analyzed, with small modifications, 61 morphological descriptors recommended by the International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI) for the genus Capsicum, including characteristics of the seedling, plant, flowers and fruits. The accesses were grown in the sector of Olericulture in the Faculty of Agrarian Sciences, Federal University of Amazonas. Using 17 descriptors, identified as essential by IPGRI, we calculated the genetic similarity among accesses using the general similarity coefficient of Gower. The accesses were grouped by the hierarchical method of distances average (UPGMA - Unweighted Pair-Group Method using an Arithmetic Average) and the graphical representation of the similarity between them was made by the method of Principal Coordinates Analysis (PCO). Of the 61 descriptors evaluated only 10 (color, hypocotyl, leaf shape, corolla length, calyx pigmentation, spots or streaks with nodal anthocyanin, peduncle length, appendix at the end of the fruit, surface of the seed, seed size and seed color) showed no variation. According to the analyzed characteristics, especially the flowers, the most important for the differentiation of species, among the 40 accesses of the collection, three species were identified, 35 of C. chinenseJacq, a genotype C. baccatum and four C. frutescens. The characteristics of the fruit showed a great variation of classes; it was identified six colors of immature fruits and six in mature stage, four shapes of fruit and great variation in size and weight of fruits. The most part of the accesses showed high pungency. It was identified two morphotypesmurupi pepper, two finger-girl, four chillies, seven eye-of-fish, thirteen sweet and twelve curabiá. The similarity coefficient ranged from 0.42 to 1.0, indicates that there are in the collection accesses totally similar and different, indicating that despite the existence of duplicates is important the maintenance of the accesses. The collection presents a high genetic variability for characteristics of plants, flowers and fruits mainly for the specie C. chinense native to the Amazon region / As pimentas do gênero Capsicum são utilizadas de diferentes formas por muitas culturas no mundo. No Brasil é encontrada ampla variabilidade desse gênero sendo a Amazônia um importante centro de diversidade, existindo uma ampla variabilidade genética expressa em diversas características de plantas, flores e frutos. Informações a respeito da diversidade em coleção de germoplasma servem para aumentar a eficiência de trabalhos de melhoramento de espécies cultivadas, por meio da caracterização morfológica é possível descrever acessos existentes nas coleções, para que as informações sejam organizadas e disponibilizadas para uso em programas de melhoramento. Para estudar a variabilidade genética de Capsicum spp. foi estabelecida uma coleção do gênero na Faculdade de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Amazonas/UFAM. O objetivo desse trabalho foi caracterizar morfologicamente 40 acessos coletados no Amazonas. Foram analisados, com pequenas modificações, 61 descritores morfológicos recomendados pelo International Plant Genetic Resources Institute/ IPGRI para o gênero Capsicum, incluindo características da plântula, planta, flores e frutos. Os acessos foram cultivados no setor de Olericultura FCA, da UFAM. Utilizando-se 17 descritores, identificados como essenciais pelo IPGRI, foi calculada a similaridade genética entre os acessos usando o coeficiente de similaridade geral de Gower. Os acessos foram agrupados pelo método hierárquico das médias das distâncias (UPGMA Unweighted Pair Group Method Using na Arithmetic Average) e a representação gráfica da similaridade entre eles realizada pelo método da Análise de Coordenadas Principais (PCO). Dos 61 descritores avaliados apenas 10 (cor do hipocótilo, forma da folha, comprimento da corola, pigmentação do cálice, manchas ou estrias com antocianina nodal, comprimento do pedúnculo, apêndice na ponta do fruto, superfície da semente, tamanho da semente e cor da semente) não apresentaram variação. De acordo com as características analisadas, principalmente das flores, as mais importantes para a diferenciação de espécies, dentre os 40 acessos da coleção, foram identificadas três espécies, sendo 35 de C. chinense Jacq, um genótipo de C. baccatum L. e quatro de C. frutescens L. As características de fruto apresentaram grande variação de classes: foram identificadas seis cores de frutos imaturos e seis no estágio maduro, quatro formas de fruto e grande variação no tamanho e peso. A maioria dos acessos apresentou pungência alta. Foram identificadas duas pimenteiras do morfotipos murupi, duas dedo-de-moça, quatro malagueta, sete olho-de-peixe, treze de cheiro e doze curabiá. O coeficiente de similaridade variou de 0,42 a 1,0, indica que na coleção existem acessos totalmente similares e diferentes, indicando que apesar da existência de duplicatas é importante a manutenção dos acessos avaliados. A coleção apresentou uma alta variabilidade genética para características da planta, flores e de frutos principalmente para a espécie C. chinense nativas da região Amazônica

Este estudo teve como objetivo selecionar os descritores botânico-agronômicos que melhor se prestam para caracterizar acessos das espécies paspalum guenoarum e paspalum plicatulum. Através de componentes principais, baseando-se nos artigos de Jolliffe (1972 e 1973). Foram avaliados 15 descritores reprodutivos, 22 vegetativos e 21 agronômicos, sendo que os agronômicos compreenderam 7 descritores para a avaliação anual, 7 descritores para a avaliação de inverno e 7 descritores para a avaliação de verão. Após a seleção de descritores reprodutivos, vegetativos e agronômicos separadamente, foi realizada uma análise de componentes principais considerando estes caracteres conjuntamente. A fim de se proceder a uma nova seleção. O método utilizado permitiu uma redução de 53%, 68% e 43%. Dos descritores reprodutivos, vegetativos e agronômicos, respectivamente, do conjunto inicialmente considerado. Como descritores importantes destacaram-se: PR, CE, EFL (reprodutivos), DIPB, CMB, LMBBASE (vegetativos) e PORMSANO, DIVERAO (agronômicos), o que representa um descarte de 86% do total de descritores utilizados na caracterização dos acessos. Verificou-se também que os descritores agronômicos por serem mais influenciados por fatores ambientais tiveram uma menor participação nesta caracterização, uma vez que dos oito descritores selecionados, seis foram reprodutivos e vegetativos. Para os descritores vegetativos o método de descarte não foi tão satisfatório quanto para os demais, devendo-se ressaltar que suas estimativas podem não ter refletido com boa exatidão as associações existentes entre os mesmos tendo em vista o pequeno número de acessos (26) e a quantidade elevada de descritores (22) considerados. O método de componentes principais mostrou-se útil para selecionar os descritores mais importantes na descrição da variabilidade presente na coleção de acessos do germoplasma estudado / not available

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:02:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo893_1.pdf: 4194750 bytes, checksum: db25c32a6384a62bbed9cd11a9087dcb (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Com o objetivo de estudar a variabilidade genética entre os acessos de melancia do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas para o Nordeste Brasileiro (Petrolina PE, Brasil), um levantamento no acervo resultou na localização de 753 acessos (agricultura tradicional, espécies do centro de origem e variedades comerciais) e 300 linhagens (produtos do melhoramento) com dados de passaporte. Destes, 291 foram avaliados quanto à variabilidade genética, com 16 primers DAF e 11 primers ISSR, incluindo dois acessos de melão (Cucumis melo) como grupo externo. Os dados foram analisados no programa NTSYS para a estimativa do coeficiente de similaridade de Jaccard e na obtenção dos dendrogramas pelo método UPGMA. As análises dos dados dos marcadores DAF e ISSR revelaram altos índices de polimorfismo (65,3% e 76,9%, respectivamente). Os marcadores DAF foram pouco informativos na separação dos acessos em grupos, não correspondendo com a taxonomia do gênero Cucumis e Citrullus, porém indicam que há variabilidade expressiva entre os acessos coletados na agricultura tradicional do Nordeste brasileiro, inclusive, mostrando divergência entre os grupos de linhagens analisadas. Os marcadores ISSR revelaram boa precisão na separação das diferentes espécies, sendo determinantes na identificação de polimorfismo e agrupamento dos acessos e linhagens de melancia. Constatou-se grande porcentagem de variação dentro dos quatro conjuntos de germoplasma do banco (76,7%), inclusive identificando que os produtos do melhoramento apresentaram 87,4% de variação dentro dos três grupos de linhagens. Esses resultados indicam que o banco agrega germoplasma muito promissor para dar suporte a programas de melhoramento de melancia no Nordeste Brasileiro. Espacialmente, a maior porcentagem de variação foi encontrada nos acessos coletados dentro de cada Estado (86,1%) e de municípios (76,2%) ou grupos de municípios próximos (73,1%) indicando que há necessidade imperiosa de continuar o resgate de germoplasma de melancia da agricultura tradicional nos Estados e municípios ou grupos de municípios não contemplados nesta pesquisa

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T12:08:57Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 459359 bytes, checksum: 33b2ffa38434f74a7e7b0705153c1a1f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T12:08:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 459359 bytes, checksum: 33b2ffa38434f74a7e7b0705153c1a1f (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A espécie Coffea arabica é autógama com base genética estreita e originada no sudoeste da Etiópia. As variedades botânicas de cafeeiros introduzidas no Brasil mais representativas foram a Típica e o Bourbon, as quais deram origem a outras variedades. A variedade Bourbon é a reconhecida internacionalmente por apresentar elevado potencial de bebida. E é, por isso, valorizada nos mercados de cafés especiais. Dessa forma é essencial para programas de melhoramento que essa espécie seja conservada em Bancos de Germoplasma. O Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de café da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (Epamig), situado no município de Patrocínio, Minas Gerais, dá suporte aos programas de melhoramento e conta com 1596 acessos de café, destes, 140 foram registradas como Bourbon. O BAG de café da Epamig recebe o apoio do BAG de café da Universidade Federal de Viçosa (UFV), situado na Área Experimental do Fundão, no munícipio de Viçosa. Apesar de apresentarem uma ampla disponibilidade de características, esses bancos ainda não foram devidamente caracterizados, como é o caso do Bourbon, que ainda se tem muitas dúvidas sobre seus acessos, o que dificulta o uso no melhoramento e na comercialização. Para auxiliar a caracterização desses acessos, uma ferramenta útil é a utilização de marcadores moleculares, e os microssatélites são indicados para esse tipo de estudo. Diante disso, objetivou-se avaliar a diversidade genética por meio de marcadores moleculares SSR de acessos de Bourbon, além de variedades antigas e cultivadas, da coleção do BAG de café da Epamig. Esses acessos e variedades antigas e cultivadas foram denominados de populações, totalizado 14. Para as análises de variância molecular (AMOVA), discriminantes e de redes de correlação foram utilizados seis primers microssatélites (SSR), por apresentarem polimorfismo. Com base na AMOVA, observou-se maior variação genética dentro da população (64,88%) do que entre as populações (35,12%). Esses resultados sugerem que pode ter ocorrido polinização cruzada no local de coleta. Quanto à classificação das populações por análise discriminante observou-se que as populações tiveram similaridade com mais de uma população e algumas não tiveram similaridade com sua própria população. As populações caracterizadas pelo BAG como Bourbons foram analisados e, por similaridade, nenhum foi identificado como Bourbon, e sim como Sumatra, Catuaí Amarelo e alguns não foram bem distintos. Além disso, foram comparadas três características morfoagronômicas das quatro populações de possíveis Bourbons com as populações já identificadas como Bourbon Vermelho e Bourbon Amarelo. Observou-se variação para cor de broto nos indivíduos para as três populações caracterizadas como Bourbon Vermelho, e variação de porte na população caracterizada como Bourbon Amarelo. Pelos resultados obtidos, concluiu-se que existe uma maior variabilidade genética dentro das populações, e as quatro com classificação duvidosa de Bourbon apresentam similaridade com outras variedades. / Coffea arabica species is an autogamous with a narrow genetic base originating in southwestern Ethiopia. The most representative botanical varieties of coffee trees introduced in Brazil were Tipica and Bourbon, which gave rise to other cultivars. The Bourbon variety is internationally renowned for its high cup quality. Therefore, it is valued in the specialty coffee market. As a result, it is essential for breeding programs that this species be conserved in Germplasm Banks. The Agricultural Germplasm Bank (BAG) of the Agricultural Research Organization of Minas Gerais (EPAMIG), located in the municipality of Patrocínio, Minas Gerais, supports coffee breeding programs and has 1596 coffee accessions, of which 140 (like Bourbon) have been registered. The Epamig coffee BAG receives the support of the BAG of the Universidade Federal de Viçosa (UFV), located in the experimental area of the UFV, no municipality of Viçosa, Minas Gerais. Although they have a wide availability of characteristics, these banks have not yet been adequately characterized, as is the case of the Bourbon group, in which still there are many doubts about their accesses, which makes difficult to use in breeding and marketing. To help characterize these accesses, a useful tool is the use of molecular markers among which microsatellites are indicated for this type of study. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity through SSR molecular markers of Bourbon accesses, as well as old and cultivated varieties, from EPAMIG's coffee BAG collection. These ancient and cultivated accesses and varieties were called populations, totaling 14 polymorphisms. For analysis of molecular variance (AMOVA), discriminant and correlation networks, six microsatellite primers (SSR) were used. Based on AMOVA, there was greater genetic variation within the population (64.88%) than among populations (35.12%). These results suggest that cross-pollination may have occurred at the collection site. As for the classification of populations by discriminant analysis, it was observed that the populations had similarity with more than one population and some did not have similarity with their own population. Populations characterized by BAG as Bourbons were analyzed and, by similarity, none were identified as Bourbon, but as Sumatra, Catuaí Amarelo and some were not very distinct. In addition, three morphoagronomic characteristics of the four populations of possible Bourbons were compared to populations already identified as Red Bourbon and Yellow Bourbon. Variation to bud color was observed in the individuals for the three populations characterized as Red Bourbon and variation of size in the population characterized as Yellow Bourbon. From the results obtained, it was concluded that there is a greater genetic variability within the populations and the four with uncertain classification of Bourbon presented similarity with other varieties.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-20T09:24:41Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 348341 bytes, checksum: e5935dcff9982767e3e1ad5f3c43353b (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-20T09:24:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 348341 bytes, checksum: e5935dcff9982767e3e1ad5f3c43353b (MD5) Previous issue date: 2015-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O germoplasma comercial de milho é oriundo de apenas sete linhagens endogâmicas, o que pode levar a vulnerabilidade genética deste a estresses abióticos e bióticos, e limitar os ganhos com a seleção no Brasil. A vulnerabilidade genética ocorre em culturas melhoradas de baixa variabilidade genética, presentes em grandes áreas. Por exemplo, a infestação de helmintosporiose em 1970 causou preocupação entre os melhoristas Norte- Americanos com a diversidade genética de seus híbridos. No Brasil, o mercado de sementes é dominado por poucas empresas: Monsanto® (35%), DuPont Pioneer® (30%), Dow Agrosciences® (15%), Syngenta® (10%) e Helix Sementes (4%). Assim é importante o monitoramento da diversidade genética que está sendo utilizada, pois as práticas de melhoramento, registro e marketing de novos cultivares podem conduzir a vulnerabilidade genética. Diante do exposto, o objetivo foi avaliar o risco de vulnerabilidade genética e as relações entre os germoplasmas comerciais brasileiros de milho e destes com os genitores da população Nested Association Mapping (NAM). Visando atender a esses objetivos foram utilizados os genótipos dos híbridos elite das empresas de maiores market-share no Brasil e os genitores da população NAM. Os híbridos foram genotipados para 700 marcadores do tipo SNP, por meio da plataforma Illumina GoldenGate®. Já os dados genômicos dos genitores da NAM foram obtidos no banco de dados do Panzea, os quais foram genotipados para 1536 SNP’s. Os dados dos marcadores para os genótipos foram submetidos às análises de correlação entre as frequências alélicas, estruturação populacional e diversidade genotípica. Pelo tamanho efetivo populacional evidenciou-se baixo risco de vulnerabilidade genética para o germoplasma comercial brasileiro. A distância genética entre o germoplasma comercial brasileiro é menor que a encontrada na NAM, sendo menor ainda entre os híbridos de mesma empresa. O germoplasma comercial brasileiro não apresentou relações estreitas com as linhagens genitoras da população NAM, com exceção da linhagem Norte-Americana B73, esta que pertenceu a mesma população pela estruturação populacional. Isto evidencia que a linhagem B73 ou seu grupo grupo heterótico (Iowa Stiff Stalk Synthetic) tiveram grande influência na formação do germoplasma comercial brasileiro. / The limited genetic variability of the Brazilian commercial maize germplasm, originated from only seven inbreed lines, could result in genetic vulnerability to abiotic and biotic stress, and also to limited selection gain. The genetic vulnerability happens to situations with low genetic variability, in large areas. The infection of Southern corn leaf blight in 70’s, concerned the North-American breeders about their hybrids genetic diversity. In Brazil, Monsanto®, DuPont Pioneer®, Dow Agrosciences® and Syngenta® have the largest seed market share. Therefore, it’s important to monitor the genetic diversity available in the country, because breeding practices, registration and marketing of new varieties could result in genetic vulnerability. Thus, the objectives of this study were to evaluate the risk of genetic vulnerability and the relationships between the Brazilian commercial maize germplasm and the Nested Association Mapping (NAM) genitors. Aiming to achieve these objectives, it was include in this work the elite hybrids of the largest market share companies in Brazil and the NAM genitors. The hybrids were genotyped by Illumina GoldenGate® platform, while the genomic data of NAM genitors were obtained in Panzea. The genotypes were subjected to linear correlation analysis, population structure and genetic diversity analysis. It was shown lower risk of genetic vulnerability with the Brazilian commercial germplasm. There is a narrow relationship within the Brazilian commercial germplasm, being closer between the hybrids of same company. The Brazilian commercial germplasm did not show close relationship with the NAM genitors, with exception of North-American line B73, which belonged to the same population of the population structure analysis. This showed that the line B73 or its heterotic group (Iowa Stiff Stalk Synthetic) had great influence at the Brazilian commercial germplasm formation.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-27T13:12:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2209787 bytes, checksum: 3979328b83150d607ad68ec8c4f1d534 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-27T13:12:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2209787 bytes, checksum: 3979328b83150d607ad68ec8c4f1d534 (MD5) Previous issue date: 2015-03-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com a crescente demanda do mercado mundial de cafés especiais, os produtores brasileiros têm demonstrado interesse em retomar o cultivo do Bourbon, principalmente devido a seu potencial para produzir cafés de qualidade superior de bebida. Dessa forma, os melhoristas têm buscado incorporar acessos de Bourbon nos programas de melhoramento, a fim de obter cultivares para a produção de cafés especiais. Visando dar suporte aos programas de melhoramento da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (Epamig), foi instalado em Patrocínio, MG, um Banco Ativo de Germoplasma (BAG) com 1594 acessos, destes, 140 correspondem a Bourbon. Entretanto, a coleção de germoplasma de Bourbon ainda não foi devidamente caracterizada, fato que interfere no seu aproveitamento para fins comerciais e uso no melhoramento. Deste modo, a caracterização molecular desses genótipos é essencial para ampliar o conhecimento dos materiais genéticos disponíveis e, assim, incorporar os mais adequados nos programas de melhoramento genético do cafeeiro. Nesse sentido, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar, por meio de marcadores SSR e AFLP, a coleção de Bourbon da Epamig, como uma ferramenta auxiliar na identificação dos acessos, avaliação da diversidade genética e do perfil molecular (Fingerprinting) dos genótipos. Na identificação dos acessos, apresentado no capítulo 1, os marcadores SSR foram utilizados para discriminar os genótipos de Bourbon juntamente com as técnicas de analise discriminante e redes neurais artificiais. Os locos SSR analisados foram adequados para diferenciar os acessos. Observou-se que as redes neurais artificiais apresentaram maior eficiência na classificação dos acessos de Bourbon do que a análise discriminante e foi possível identificar acessos que apresentaram misturas ou problemas na identificação inicial. Na avaliação da diversidade genética e do perfil molecular (Fingerprinting) dos acessos, apresentados no capítulo 2, os marcadores SSR e AFLP utilizados permitiram separar a maioria dos indivíduos analisados. Esses dados moleculares sugerem que, apesar da reconhecida base genética estreita de C. arabica, o germoplasma de Bourbon pertencente a Epamig apresenta variabilidade genética que pode ser explorada nos programas de melhoramento. A análise de fingerprinting permitiu identificar os perfis moleculares de cada acesso de Bourbon avaliado, os quais podem ser utilizados na identificação dos cafeeiros no banco. Dessa forma, os resultados obtidos nesse estudo fornecem subsídios para a manutenção e conservação da coleção de germoplasma de Bourbon. Além disso, deve auxiliar os melhoristas na escolha de genitores para possíveis hibridações em programas de melhoramento que buscam o desenvolvimento de cultivares com potencial para qualidade de bebida. / With the increasing demand of specialty coffee in the world, the Brazilian coffee producer have demonstrated interest to retake cultivating Bourbon due to its potential of producing high cup quality. So, the breeders are working to incorporate the Bourbon in the breeding programs to develop coffee cultivars with special cup quality. To support the breeding programs, the Agricultural Research Company of Minas Gerais (Epamig) established the active germplasm bank in Patrocínio, MG. This germplasm comprises of 1594 coffee accessions, among these 140 are Bourbons. However, the collection of Bourbon is not well characterized, which interferes with its efficient use for commercial purpose and genetic improvement. This shows the importance of molecular characterization of these genotypes to increase the knowledge about the genetic materials available and incorporated adequately in the genetic improvement of coffee. Thus, the present work was done with the objective of characterizing the Bourbon collections of Epamig using SSR and AFLP molecular markers as a tool to identify the accessions, genetic diversity study and Fingerprinting of the genotypes. In chapter 1, SSR molecular marker combined with discriminant analysis and artificial neural network were used to discriminate the genotypes of Bourbon. The result showed that the artificial neural network is more efficient to classify the accessions of Bourbon than discriminant analysis. It was possible to identify accessions with mixture or with identification problem. In the genetic diversity and fingerprinting analysis presented in chapter 2, SSR and AFLP markers used permitted to separate most of the individuals analyzed. These data suggested that despite the known narrow genetic base of C. arabica, the Bourbon germplasm belonging to Epamig has enough genetic variability that can be exploited in breeding programs. The fingerprinting analysis allowed identifying molecular profile for each accession of Bourbon evaluated that can be used in identification of coffee plants of the germoplasm. Besides this, it can aid the breeders to select the parents for possible hybridization in the breeding programs to develop cultivars with high cup quality potential.

The bromeliad family comprises about 3,000 species distributed in 58 genera and 3 subfamilies: Pitcarnioideae, Bromelioideae and Tillandsioideae. The increasing demand of the market has been responsible for increasing the production and sale of bromeliads. However the illegal extraction is still dramatically reducing existing species. This fact, coupled with the devastation of Brazilian ecosystems, has caused irreparable losses in diversity. Considering this fact, have a basis with stored genetic material for future studies is very important. The main reason for the establishment and maintenance of a germplasm bank is to store and make available germplasm and provide information regarding certain accessions. The aim of the work was to perform the molecular characterization of accessions of native bromeliads prospected in Sergipe State, using tools such as RAPD and ISSR molecular markers and flow cytometry. The collections were performed in four counties of the Sergipe state (Itabaiana, Frei Paulo, Simão Dias e Poço Redondo), whose locations were mapped with the use of a GPS and the individuals were kept in a greenhouse, composing a Active Germplasm Bank (AGB). For molecular analyzes young leaves were collected and used for DNA extraction. Eleven ISSR primers and 13 RAPD primers were used to characterize the prospected accessions. Analyses by flow cytometry were performed for the determination of DNA content, using young leaves and extraction of nuclei was performed following the method of Dolezel. ISSR and RAPD markers detected large genetic variability among the accessions of the AGB. The estimation of the DNA content obtained by flow cytometry of the bromeliad accessions collected in four municipalities of Sergipe State allowed the distinction of two groups (group 1 = 1,59 pg and group 2 = 1,057 pg). / A família bromeliácea compreende aproximadamente 3.000 especies, distribuídas em 58 gêneros e 3 subfamílias: Pitcarnioideae, Bromelioideae e Tillandsioideae. A crescente demanda de mercado tem sido responsável pelo aumento da produção e comercialização das bromélias. No entanto o extrativismo ilegal ainda existente está reduzindo drasticamente as espécies. Esse fato, somado à devastação dos ecossistemas brasileiros, tem causado perdas irreparáveis na diversidade. Diante desse fato, ter uma base com material genético guardado para futuros estudos é muito importante. A principal razão para o estabelecimento e a manutenção de um banco de germoplasma é armazenar e disponibilizar germoplasma e prover informações a respeito de determinado acesso. O objetivo do trabalho foi realizar a caracterização molecular dos acessos de bromélias nativas prospectadas no Estado de Sergipe, empregando ferramentas como marcadores moleculares RAPD, ISSR e citometria de fluxo. As coletas foram realizadas em quatro municípios do Estado de Sergipe (Itabaiana, Frei Paulo, Simão Dias e Poço Redondo), cujos locais foram mapeados com o auxílio de GPS e os indivíduos foram conservados em casa de vegetação, compondo um Banco Ativo de Germoplasma (BAG). Para as análises moleculares folhas jovens foram coletadas e utilizadas para a extração do DNA. Onze iniciadores ISSR e 13 iniciadores RAPD foram utilizados para a caracterização dos acessos prospectados. As análises por citometria de fluxo foram realizadas para a determinação do conteúdo de DNA, usando folhas jovens e as extrações dos núcleos foram realizadas seguindo o método de Dolezel. Os marcadores ISSR e RAPD detectaram ampla variabilidade genética entre os acessos do BAG. A estimativa do conteúdo de DNA obtido pela citometria de fluxo dos acessos de bromélias coletados nos quatro municípios de Sergipe possibilitou a distinção de dois grupos (grupo 1 = 1,59 pg e grupo 2 = 1,057 pg).

<i>Chenopodium quinoa</i> Willd. es una especie originaria de la región Andina de Sudamérica perteneciente a la familia Chenopodiacea. Sus semillas poseen un elevado nivel de proteínas de buena calidad ya que contiene altos niveles y un buen balance de aminoácidos esenciales como la lisina y metionina. Tiene la capacidad de adaptarse a condiciones ambientales extremas como déficit hídrico, bajas temperaturas y salinidad, haciendo posible su cultivo en un amplio rango de ambientes. Estudios de caracterización de colecciones de germoplasma de quínoa en los principales países actualmente productores de este cultivo como Bolivia y Perú, ha permitido generar información complementaria a la caracterización morfo-fenológica de gran utilidad en planes de mejoramiento genético. Respecto a esto, el germoplasma nativo de Argentina no se encuentra caracterizado, lo que limita su utilización en el mejoramiento y valorización. En este trabajo se planteó determinar la magnitud de la diversidad y la estructura genética de germoplasma de quínoa, para lo cual se caracterizaron 22 loci microsatélites en 80 accesiones de C. quinoa, describiendo la variabilidad alélica en forma separada para el germoplasma del NOA (36) y del resto de Sudamérica (44 - ExtraNOA). Para caracterizar cada accesión se determinó la riqueza alélica, Heterocigocidad (como medida de diversidad), el porcentaje de loci polimórficos (%P) y el número de alelos privados. Se calculó la distancia genética entre las accesiones y se analizaron las relaciones según el agrupamiento obtenido por UPGMA, además de analizar la varianza molecular en diferentes niveles jerárquicos. La diversidad genética promedio entre las accesiones de quínoa nativa fue ~0,30; se detectaron 360 alelos en total, 97 de los cuales fueron alelos únicos. El 18% del total de la varianza se debió a la diferenciación entre regiones (Frt = 0,18), el 39% entre poblaciones (Fst = 0,57), el 27% entre plantas individuales y el 16% restante intra-individuos. Los valores de Fis (0,63) y Fit (0,84) indicaron una deficiencia de genotipos heterocigotas. El germoplasma se estructuró longitudinalmente en la región del Noroeste, formando cuatro grandes grupos de poblaciones que corresponden a regiones agroecológicamente diferentes: Puna, valles secos, valles húmedos y una zona de transición de altura. De oeste a este, la magnitud de la diversidad genética a nivel de grupo presentó un gradiente decreciente hacia el este junto con la altitud, encontrando una correlación baja pero significativa con el régimen de precipitaciones de la región (que se incrementa hacia los valles orientales húmedos). El gradiente de diversidad genética molecular se refleja también en un gradiente en el síndrome de domesticación que presenta la especie (mayor diversidad en sitios de mayor antigüedad de uso), evidenciando un patrón característico de una especie que evolucionó como cultivo, post-domesticación. Veinticinco de las 36 accesiones de quínoa nativa fueron caracterizadas morfo-fenológicamente complementando la caracterización molecular. El análisis de caracterización conjunta sustentó el agrupamiento observado para la quínoa del NOA pudiendo determinar cómo caracteres fenotípicos más influyentes en la diferenciación de las poblaciones los relacionados con la fenología, la morfometría de hoja y el diámetro del tallo. Las accesiones provenientes del los valles interandinos (secos y húmedos) se caracterizaron por presentar mayor altura de planta, un ciclo de madurez intermedio o tardío, mayor diámetro de tallo y hojas de mayor superficie mientras que las accesiones del altiplano (Puna) presentaron menor altura, un ciclo más corto y hojas más pequeñas. Las accesiones de la zona de Transición presentaron un estado intermedio para los caracteres mencionados, pero se diferenciaron del resto por presentar menor diámetro de grano. Las accesiones de quínoa ExtraNOA se diferenciaron exitosamente a partir de la caracterización molecular, obteniéndose un alto valor de distancia genética promedio entre todas (~0,83). Se detectaron 553 alelos en total, de los cuales el 292 (52,8%) resultaron en común entre todas las entradas, 67 (12,1%) fueron exclusivos del germoplasma del NOA y 194 (35,1%) exclusivos de las entradas del resto de Sudamérica. La inclusión de germoplasma del NOA, el extremo sur de la distribución de la especie en la región Andina, en un análisis a nivel de Sudamérica evidenció un patrón de agrupamiento longitudinal de acuerdo a las características ambientales de los sitios de origen (ambiente seco y ambiente húmedo) y en un segundo orden, tierras altas y tierras bajas. Las accesiones de quínoa procedentes del centro-sur de Chile compusieron el grupo genético más diferenciado. Este agrupamiento sustenta la segunda hipótesis postulada acerca de que el origen del germoplasma en el NOA es ocurrencia de procesos de introducción independientes de zonas ecológicas similares en contraposición a un único evento de introducción y su posterior dispersión. Se discuten las relaciones genéticas en términos de la dinámica del cultivo y el contexto histórico del cual formó parte, considerando hallazgos arqueológicos que documentaron la presencia de la especie. Los resultados obtenidos a partir de este trabajo permitirán definir las relaciones entre las accesiones y el grado de influencia del ambiente en la estructura genética aportando criterios en conjunto para la elección de germoplasma en futuros programas de mejoramiento.