Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Kralove Department of Pharmacology & Toxicology Student: Gabriela Burianova Supervisor: RNDr. Jakub Hofman, Ph.D. Title of diploma thesis: Flow-cytometric analysis of inhibitory effect of novel targeted drugs on the activity of ABC drug efflux transporters Cancer is the second leading cause of death. Cancer treatment often combines conventional chemotherapy, radiation therapy and surgery. More recent approach to treatment is the use of targeted cancer therapy with a greater specificity towards cancer cells. Development of resistance is a major obstacle in the success of chemotherapy. Multidrug resistance (MDR) can be acquired through various mechanisms e.g. overexpression of efflux transporters. ATP binding cassette (ABC) transporters represents a large family of transmembrane proteins that use ATP to pump molecules across the membrane. The three main ABC proteins related to MDR are: P-glycoprotein (ABCB1), multidrug resistance-associated protein 1 (ABCC1) and breast cancer resistance protein (ABCG2). Use of ABC transporter inhibitors increases the amount of chemotherapeutical substrates accumulated within the cells. In this study we evaluated interactions of six synthetic small molecule inhibitors (alisertib, ensartinib, entrectinib, talazoparib,...

The resistance to tamoxifen, a drug used in the adjuvant therapy for hormone sensitive breast cancer, represents a major clinical obstacle. Although various mechanisms leading to tamoxifen resistance have been described and intensively studied, a significant number of patients still become resistant to the treatment and eventually relapse. Tamoxifen therapy has been shown to enrich tumors with cancer stem cells (CSCs), which are naturally resistant, and have self-renewal ability and the potential to form secondary tumors. Metabolic rewiring, altered iron metabolism and upregulation of ATP-binding cassette (ABC) transporters have been shown to be important in the maintenance of CSC phenotype. Therefore, we investigated these mechanisms as possible contributors to tamoxifen resistance in vitro in two tamoxifen resistant (Tam5R) cell lines that we established. We show that Tam5R cells have dramatically disassembled and less active mitochondrial supercomplexes (SCs) and higher level of mitochondrial superoxide, together with a fragmented mitochondrial network. Such dysfunction of mitochondria results in the AMP-activated protein kinase (AMPK) activation and metabolic rewiring towards glycolysis. Importantly, cells lacking functional mitochondria are significantly more resistant to tamoxifen, supporting...

Colorectal cancer is a serious malignant disease with an incidence of over 1.8 million new cases per year worldwide. There are about 8 000 patients diagnosed with CRC in the Czech Republic each year, and about half of them present with an advanced disease. Screening program identifies patients in the early stages of CRC resulting in overall better prognosis and survival. There is also a lack of biomarkers of early CRC detection and of response to treatment. The first aim of our project was to conduct a national multicentre prospective observational study to evaluate the impact of CRC screening within the framework of a Czech population screening programme. Between March 2013 and September 2015, a total of 265 patients were enrolled in 12 centres across the Czech Republic. Patients were divided into screening and control groups and compared for pathology status and clinical characteristics. Screening was defined as a primary screening colonoscopy or a colonoscopy after a positive FOBT in an average-risk population. The distribution of CRC stages was significantly favourable in the screening group compared with the control group (stages 0, I and II, 63% versus 43.3%; p <0.001). The presence of distant (M1) and local metastases (N1 and N2) was significantly less prevalent in the screening group (0%,...

Bakgrund: För att företag ska kunna tillgodose kundernas efterfrågan har de oftast ett färdigvarulager med produkter för att snabbt kunna leverera till kunder. Det blir därmed viktigt för företagen att maximera lagret och dess utformning. Användningen av lagret bör ske på ett sådant sätt att lagerhållningskostnaderna och lagerhanteringskostnaderna minimeras.  Syfte: Syftet med detta examensarbete är att göra en nulägesbeskrivning på Beds by Scapa över hur färdigvarulagret för bäddmadrasser och huvudgavlar är uppbyggt samt identifiera utmaningar och se om det finns möjligheter till förbättringar kring lagerhantering. Metod: Denna studie utgår från en kvalitativ och kvantitativ forskningsmetod. Då studien utgår från teoretisk förförståelse kommer kritisk realism tillämpas. Studien är en fallstudie där empirisk material är inhämtat från observationer och intervjuer som har varit både ostrukturerade och semistrukturerade. När det gäller kvantitativa forskningsmetoden har data från affärssystemet inhämtats och mätningar utförts.  Slutsats: Studien har genom en nulägesanalys identifierat utmaningar och förbättringsförslag som existerar för sektionerna bäddmadrasser och huvudgavlar. Två olika alternativ har presenterats och det första innebär att använda ABC-kategorisering och det andra innebär att förbättra familjegruppsindelningen som redan används. / Background: In order for companies to meet customer demand, they usually have a finished goods inventory of products to quickly deliver to customers. It thus becomes important for companies to maximize the stock and its design layout. The use of the warehouse should be done in such a way that the storage costs and handling costs are minimized. Purpose: The purpose of this thesis is to present a current status report of how Beds by Scapas finished inventory of bed mattresses and headboards is constructed within the warehouse, and to identify if there are any challenges and see if there are opportunities for improvements in inventory management. Method: This study is based on a qualitative and quantitative research method. Since the study is based on theoretical understanding, critical realism will be applied. The study is a case study in which empirical material is obtained from observations and interviews that have been both unstructured and semi-structured. When it comes to the quantitative method, data has been collected from the ERP system and measurements has been carried out.  Conclusion: The study has identified a challenge and improvement suggestions that exist for the bed mattresses and headboard sections through a current situation analysis. Two different alternatives have been presented where the first alternative is to use ABC-categorization and the second alternative is to improve the family grouping that is already in place.

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology & Toxicology Student: Lucia Dziaková Supervisor: RNDr. Jakub Hofman, Ph.D. Title of diploma thesis: Study on interactions of PARP inhibitors with ABC drug efflux transporters. ATP-binding cassette (ABC) transporters are integral membrane proteins that use the energy obtained from ATP to carry transport of numerous endogenous substrances out of the cells, but attention is drawn primarily to the fact that they transfer also xenobiotics. Their overexpression in tumor tissue contributes to multidrug resistance (MDR), which in most cases leads to therapy failure. Poly(ADP-ribose)polymerase inhibitors (PARPi) represent a promising therapeutic approach in the treatment of cancers that exhibit defects in homologous recombination (HR). This work focuses on four selected PARPi (olaparib, rucaparib, niraparib, veliparib) and their interaction potential towards ABC drug efflux transporters (ABCB, ABCC1, ABCG2). In our work, we worked with MDCKII cells (parent, transduced by the transporters of interest) and utilized the principle of accumulation studies based on the measurement of fluorescence intensity of specific model substrates (hoechst33342, calcein AM, daunorubicin, mitoxantrone). We used established inhibitors of studied...

Syfte – Syftet med detta projekt att kartlägga och skapa förslag på förbättring av lagerläggningen vid torrvarulagret på företaget för att minska kostnader och öka effektiviteten. 1. Hur kan artiklar prioriteras för optimal lagerhållning? 2. Hur kan företaget upprätthålla god lagerhållning på lång sikt? 3. Hur kan en förbättrad lagerhållning bidra till företagets lönsamhet Metod – Undersökningen har baserats på kombination av personliga observationer, en dokumentstudie för att samla information gällande företagets omsättning, marginaler och svinn för de olika varugrupperna samt en enkätstudie som syftar till att samla information angående personalens syn på lagerhanteringen och vilket framtida läge som bör uppnås. Resultat – Observationerna visar att personalen inte fullt ut följer de instruktioner som finns angående var varor skall ställas på lagret. Det visar sig att på grund av mängden varor på lagret är detta inte möjligt. Observationerna visar även att många produkter som lagras inte direkt skapar värde i form av försäljning och tar upp värdefullt lagerutrymme som skulle kunna användas till andra produkter. Varor tenderar att placeras i hörnet av lagret vilket blockerar framkomligheten för två ställageplatser. Av enkätsvaren visar det sig att personalen på arbetsplatsen har delade uppfattningar om hur arbetet på lagret fungerar. Det visar sig att många i personalen håller med om att pallar ofta behöver flyttas för att komma åt bakomliggande varor. Resultatet från enkäterna visar att många medarbetare anser att varor inte ställs på rätt plats. Det visar sig att en stor del av medarbetarna inte vet att det finns nedskrivna bestämmelser om hur lagerarbetet skall skötas. Slutsatser – Produkter kan delvis prioriteras baserat på ABC-analysen men inte fullt ut enligt den teoretiska modellen. Företaget bör behålla principerna för ställagelagring eftersom denna metod anpassas bra för den typen av lager som företaget har men faller på grund av att dessa principer inte följs. Familjegruppsprincipen kan användas för att prioritera varor i större volymer på enhetliga pallar vid de angivna ställageplatserna. 5S kan hjälpa företaget att få koll på onödiga produkter på lagret genom att sortera ut och strukturera var sak på sin plats. Genom att göra detta med kontinuitet kan företaget hålla en bättre lagernivå och därmed hålla lagret under kontroll under tider då lagret blir pressat. Strukturerade rutiner och visuell styrning kan hjälpa erfarna och nya medarbetare att lätt förstå vad som behöver göras och hur detta skall genomföras. PDSA-cykeln kan användas för att kontinuerligt utveckla och förbättra processerna för lagerhållningen vid arbetsplatsen. Genom att skapa struktur, en städad arbetsplats och tydliga rutiner kan företaget skapa en bättre överblick av lagret. Denna överblick skapar möjlighet att se varugrupper eller produkter som är i riskzonen för att gå sönder eller passera utgångsdatum. Detta bidrar till att minska svinnet på arbetsplatsen vilket i sin tur leder till potentiell ekonomisk vinning under lång sikt. Långa ledtider är något företaget drabbas av på grund av den bristande framkomligheten på lagret. Med ett strukturerat lager minskar ledtider vilket ger personalen mer tid att lägga på värdeskapande aktiviteter. Onödiga rörelser för personalen är vanligt förkommande då varor flyttas och omplaceras på lagret för att komma åt andra varor. Detta agerar som ett slöseri av personalens tid. Väntan förekommer som ett resultat av den bristande framkomligheten vilket påverkar ledtider och effektiviteten på arbetsplatsen. / Purpose - The purpose of this project is to map and make suggestions for quality improvements for warehousing at the company with focus on increasing effectiveness and lowering the cost. 1.How can articles get prioritized for optimal warehousing? 2.How can the company maintain optimal warehousing in the long run? 3.How can optimized warehousing contribute to the company's profitability? Method - The study is based on a combination of personal observation, a document study used to gather information regarding the company's revenue, margins and waste for the different article groups. An inquiry was made with the purpose to gather information regarding the staff´s view of present warehouse logistics and future goals. Results - The observations show that the staff doesn't follow the guidelines regarding positioning of the articles in the warehouse. This is not possible with the amount of products in stock. The observations show that there are some products in the warehouse that do not directly contribute to the revenue of the company and therefore taking up space from products that do contribute to the revenue. Some articles are placed in the corner of the warehouse which limits access to two parts of the shelving system at the same time. The results from the inquiry show that the staff have mixed opinions regarding how well the warehouse runs. Most of the staff recognize the problem of having to move articles before reaching the wanted item. The inquiry show that a lot of the staff members does not follow the rules regarding placement of articles in the warehouse and most don't know if there are any written rules regarding this. Conclusions - Products can partially be prioritized based on the ABC-model but not to the full extent. The company should follow the principles of the shelving system since this is already implemented but is not used to the full extent. The family group principle can be used to prioritize products and sort them in different groups based on their attributes. 5S can help the company to identify unnecessary products and sort and mark everything in the warehouse. This identification leads to the possibility to lower and keep reasonable stock volume and keep control even though a big delivery is due. Structured routines and visual leadership may help both veteran and new workers in the work with the warehouse. The PDSA-cycle can be used to continuously improve and perfect processes for stock management at the store. Through designing a structure, a clean workplace and clear routines is it possible for the company to maintain a clear overview of the warehouse. This overview makes it possible to spot product groups that are in the danger zone for breaking or passing the expiration date. This will contribute to lowering the waste for the company which leads towards a potential financial gain over a longer period of time. With a more organized warehouse does the staff get more time to focus on value gaining tasks. Unnecessary movement for the staff is common due to the need to move products before work can be done. This is recognized as a waste of the staff's time and therefore a waste of resources. Waiting i common which is present due to products blocking the passage ways, this does lengthen lead times and decreases the effectiveness at the warehouse.

Bakgrund: Funktionsförsäljning är en affärsmodell som vuxit sig stark på senare år som följd av ett ökat intresse kring cirkulär ekonomi. Trots detta finns det ingen kalkyl utformad för att spegla den nya verklighet som funktionsförsäljning medför. Många företag förstår sig inte på de förändrade processer och kostnader som en övergång från en linjär affärsmodell till funktions-försäljning innebär. Då en kalkyl ligger till grund för beslutsfattande som avser att bidra till lönsamhet, är det ett problem att det inte finns en kalkyl som avspeglar den nya verkligheten vid funktionsförsäljning på ett rättvist sätt.  Syfte: Syftet med denna studie är att undersöka hur och varför kostnader förändras i olika processer i tillverkande företag som övergår från en linjär affärsmodell till funktionsförsäljning. Vidare syftar denna studie till att undersöka hur dessa kostnadsförändringar påverkar vad som bör beaktas vid utformandet av en kalkyl. Metod: Denna studie har genomförts med pragmatismen som vetenskaplig utgångspunkt. Ett iterativt angreppssätt har använts för studien. Vidare har en kvalitativ forskningsdesign använts, där två enkla fallstudier genomförts. Fallföretagen valdes ut genom målstyrt urval samt bekvämlighetsurval. För datainsamling har semistrukturerade intervjuer genomförts. Respondenterna valdes ut genom ett snöbollsurval. Den valda analysmetoden är en cross-caseanalys i kombination med en tematisk analys.  Slutsats: Resultatet av denna studie visar att funktionsförsäljning, trots dess stora initiala investeringar, har potential att leda till kostnadsbesparingar på lång sikt. I syfte att rättvist återspegla det förlänga ansvar som funktionsförsäljning medför, bör tidsperspektivet för kalkylen förlängas. Resultatet visar att flertalet processer påverkas vid en övergång till funktionsförsäljning. Det har framkommit att betydelsen av design har utvidgats i kontexten av funktionsförsäljning, då denna process har stor inverkan på efterföljande processer. Vidare har det framkommit att ett övervakande system innehar en central roll vid funktionsförsäljning då det innebär en större kontroll av kostnaderna, däribland reparation och underhåll samt kostnader för omvänd logistik. Slutligen har det konstaterats att processerna försäljning och relationer blir viktigare. Dessa kostnadsförändringar bör således återspeglas i kalkylen. / Background: Functional sales is a business model that has grown strongly in recent years as a result of increased interest in the circular economy. However, there is no costing model designed to reflect the new reality that functional sales bring. Many companies do not understand how a transition from a linear business model to functional sales affect processes and costs. Since a costing model is the basis for decision-making that aims to contribute to profitability, it is a problem that a costing model which reflects the new reality in functional sales in a fair way does not exist.  Purpose: The purpose of this study is to investigate how and why costs change in different processes in manufacturing companies that transition from a linear business model to functional sales. Furthermore, this study aims to investigate how these cost changes affect what should be taken into consideration when designing a costing model.  Method: This study has been conducted with pragmatism as a scientific starting point. An iterative approach has been used for the study. A qualitative research design has been used, where two simple case studies have been carried out. The case companies were selected through a targeted selection and convenience sampling. For data collection, semi-structured interviews have been conducted. The respondents were selected through a snowball sampling. The selected method of analysis is a cross-case analysis in combination with a thematic analysis. Results: The results of this study show that functional sales, despite their large initial investments, have the potential to lead to cost savings in the long term. In order to fairly reflect the extended responsibilities that function sales entail, the time perspective for the costing model should be extended. The study has shown that several processes are affected by a transition from a linear business model to functional sales. It has emerged that the importance of design has expanded in the context of functional sales, as this process has a major impact on subsequent processes. Furthermore, it has emerged that a monitoring system has a central role in functional sales as it involves greater control of costs, including repair and maintenance and reverse logistics costs. Lastly, it has been found that the processes of sales and relationships become more important. These changes in costs should thereof be reflected in the costing model. / Mistra REES

Produktplacering har växt i popularitet över åren och används i allt fler typer av medier. Det har gjorts flera studier om konsumenters attityder till produktplacering men endast ett fåtal av dem har gjort en distinktion mellan konsumenters attityder till produktplacering i olika slags medier. Genom att använda fokusgrupper ska denna studie därmed undersöka studenters attityder till produktplacering i de fyra följande medierna; filmer, musikvideor, datorspel samt bloggar. För att ta reda på detta användes ABC-modellen av attityder och studenternas attityder delades upp under de tre olika kategorierna inverkan, beteende och kognition. Resultaten visar att studenter överlag är positiva till produktplacering i filmer och anser att det ofta är en naturlig del av filmer. Produktplacering i musikvideor anses lämplig så länge det inte är för mycket fokus på produkten. Angående datorspel tycker studenter att datorspel ibland är bättre när de använder produktplacering för att det gör dem mer realistiska. Emellertid är vissa produkter mer passande än andra att produktplacera i datorspel när det handlar om sannolikhet att de påverkar konsumenters till köp i verkligheten. Bloggar ses som den mest trovärdiga typen av medium för produktplacering då studenter anser att de är mer trovärdiga och pålitliga än andra typer av medier. Likväl är det svårt att uppskatta huruvida produkter i bloggar är produktplacering eller inte. / Product placement has grown in popularity over the years and is current in more and more types of media. While there have been several studies made about people’s attitudes towards product placement, only a few of them have made a distinction been people’s attitudes towards product placement in different types of media. Thus, by using focus groups this study seeks to study students’ attitudes towards product placement in the following four types of media; movies, music videos, video games and blogs. In order to achieve this purpose the ABC-model of attitudes was used and the students’ attitudes were divided into the three different categories affect, behavior and cognition. Findings suggest that students overall are positive towards product placement in movies and believe that it is often a natural part of movies. Product placement in music videos is deemed adequate as long as there is not too much focus on the product itself. Regarding video games students find that video games are sometimes better when they use product placement because it makes them more realistic. However, some products that are placed in video games are more suited than others in terms of likelihood of affecting people to buy the products in real life. Blogs are seen as the most realistic media for product placement because students feel that they are more trustworthy and reliable than other forms of media. Nevertheless, it is difficult to estimate whether products in blogs are in fact product placement or not.

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology & Toxicology Student: Júlia Jurčáková Supervisor: RNDr. Jakub Hofman PhD. Title of diploma thesis: The assessment of inhibitory effects of selected targeted anticancer drugs on the activity of ABC drug eflux trasporters. Lung cancer is the leading cause of death within oncological diseases. Non-small cell lung carcinoma (NSCLC) accounts for about 85% of all lung cancer, and its major subtypes include adenocarcinoma and squamous cell carcinoma. In addition to surgery, radiotherapy and chemotherapy, the use of targeted low-molecular substances, which target tumor cells with higher specificity, has recently been used in treatment. The two main causes of death in cancer patients are the formation of metastases and the development of multidrug resistance (MDR). This may also be caused by overexpression of the efflux transporters. ATP-binding cassette (ABC) transporters are groups of transmembrane pumps that use energy in the form of ATP to transfer a wide range of substrates. In particular, P-glycoprotein (ABCB1), breast cancer-resistance protein (ABCG2) and multidrug resistance-associated protein 1 (ABCC1) are associated with MDR. Inhibition of these transporters increases the amount of cytostatic substrate within the...

Elon saknar ett effektivt system vad gäller artikelplacering på lagret. Inkommande artiklar placeras på de platser där möjligheten finns att ta emot hela den inkommande volymen. Syftet med examensarbetet har två delar. En del är att ta fram en tydlig metod för Elon att använda vid en frekvensläggning samt att genomföra den valda metoden för 12 månader. Den andra delen är att simulera den totala körsträckan för truckförarna före och efter en frekvensläggning för det första kvartalet år 2021 med målet att uppnå en minskad körsträcka på 10 %. Arbetet ska även resultera i en färdig programmeringskod i Python som Elon ska kunna använda vid framtida simuleringar. Arbetet inleddes med en litteratursökning av relevanta metoder och tekniker som ska vara till grund för den frekvensläggning som genomförs i arbetet. De forskningsmetoder som identifierades och valdes var Design Research Methodology samt datainsamlingsteknikerna Litteraturstudie, Dokumentstudie, Intervju och Observation. Efter att en litteraturstudie genomförts valdes metoden ABC-analys som metod för frekvensläggning. Arbetet resulterade i en metod för frekvensläggning som innehåller fem steg som företaget bör följa och som beskrivs djupare i rapporten. ABC-analysen resulterade i att samtliga artiklar på lagret klassificerades i A-, B- eller C-klass efter uttagsfrekvens och ett platsbehov för varje klass beräknades. Den simulerade plockningen efter en frekvensläggning resulterade i en minskad körsträcka på 21,09 %. Arbetet kan utvecklas ytterligare genom att ta hänsyn till vilka portar det körs mer frekvent till, identifiera artiklar som ofta körs tillsammans och placera nära varandra, anpassa lagret efter kampanjvaror och dess tidsperioder samt om möjligt kunna torrköra plockning efter genomförd frekvensläggning i lagrets WMS som då resulterar i en noggrannare simulering. / The company Elon Group AB lacks an effective method when it comes to product placement within the warehouse. As of now incoming products are placed where storage space is available. The purpose of this work can be divided into two parts. One part is to create a method that Elon can use when placing their products using picking frequency, this method will be used in practice during this thesis when placing products using picking frequency for a period of 12 months. The second part of this thesis is to simulate the accumulated distance forklift drivers have driven before and after slotting by picking frequency for a period of 3 months. The goal is to accomplish a 10% decrease in driving distance after slotting has been made. The simulation requires a code in the programming language Python which is part of the thesis. The work started with a literature review to help choose the right methods. The methods that were identified and used were Design Research Methodology, literature study, document study, interviews and observations. After the literature study was made an ABC-analysis was chosen specifically as the method for conducting the slotting. The work resulted in a five step-method. The ABC-analysis resulted in all of the products being given a class (A, B or C) and the required number of storage bins for the different classes were calculated. The simulation showed a decreased driving distance of 21,09 %. The work can develop by taking into account that the exit-ports in practice do not ship out an equal amount of goods, identifying which products that are often picked together and placing them near each other, taking into account campaign products and if possible dryrun the warehouse WMS after slotting to obtain more accurate data.