Orientadores: Adriana Franco Paes Leme, Jaime Aparecido Cury / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-15T11:01:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moi_GiselePedroso_D.pdf: 2006152 bytes, checksum: 72847b022c4acfc83ace6ff86cc98e37 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A cárie dental é uma doença biofilme-dependente e os carboidratos fermentáveis presentes na dieta são considerados os fatores ambientais chaves envolvidos em sua iniciação e desenvolvimento. Algumas hipóteses baseadas na estrutura, composição e cinética dos íons no biofilme têm sido sugeridas para explicar a maior cariogenicidade do biofilme dental formado na presença de sacarose. Dentre estas, a expressão diferencial de proteínas bacterianas e presença ou ausência de proteínas salivares no biofilme formado na presença e ausência de sacarose tem sido sugerida. A sacarose promove alterações na composição protéica da matriz extracelular (MEC) do biofilme dental e não foram detectadas proteínas ligadoras de cálcio pela eletroforese bidimensional (2-DE) no biofilme formado em sua presença. A ausência destas proteínas na matriz do biofilme poderia ajudar explicar a sua cariogenicidade. Para avaliar se as alterações no perfil de proteínas da MEC são sacarose-dependentes ou ainda, se a presença de seus monossacarídeos poderia interferir similarmente neste perfil, um estudo in situ, boca-dividida foi realizado em duas fases de 14 dias. Este modelo experimental possibilitou que as proteínas salivares e bacterianas estivessem presentes no mesmo ambiente, simulando a condição natural da formação do biofilme dental. Cada fase experimental foi realizada em triplicata pelo mesmo voluntário. Assim, um voluntário utilizou um dispositivo palatino contendo 16 blocos de esmalte, sendo oito de cada lado, para acúmulo de biofilme. Foi gotejada extra-oralmente uma solução da sacarose 20% (0,58 M), água destilada e deionizada (H2Odd) e uma mistura de uma solução de glicose 10,45% (0,29 M) com frutose 10,45% (0,29 M) sobre 8 blocos de esmalte dental 8 vezes/dia. No 14º dia, o biofilme dental foi coletado, as proteínas da MEC do biofilme dental foram extraídas e analisadas por duas abordagens diferentes: (1) 2-DE seguidos pela cromatografia líquida acoplada com a espectrometria de massas em tandem (LC-MS/MS) e (2) a mistura complexa das proteínas extraídas da MEC do biofilme foram analisadas por LC-MS/MS. Entre as proteínas diferencialmente expressas (p<0,05) estavam às proteínas ligadoras de cálcio e as proteínas indutoras de prolactina. Estas proteínas possuem um papel peculiar no potencial cariogênico do biofilme, uma vez que são responsáveis pela manutenção da saturação iônica do biofilme e agregação, respectivamente. Os resultados sugerem que as mudanças do perfil protéico da ECM do biofilme dental não são atribuídas exclusivamente à sacarose, uma vez que seus monossacarídeos são capazes de promover alterações na composição protéica do biofilme, sugerindo que este perfil seja dependente dos carboidratos fermentáveis presentes na dieta. / Abstract: Dental caries is a biofilm-dependent oral disease, and fermentable dietary carbohydrates are the key environmental factors involved with its initiation and development. Some hypotheses based on the structure, composition and ion kinetic aspects of biofilm have been suggested to explain the cariogenicity of biofilm formed in the presence of sucrose. Among them, the differential expression of bacteria proteins and the presence and absence of salivary proteins in biofilm formed in the presence and absence of sucrose has been suggested. Sucrose promotes changes in the extracellular matrix protein (ECM) of dental biofilm composition and the undetectable levels of calcium-binding proteins by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) in biofilm formed in its presence provide further insight into the unique cariogenic properties of this dietary carbohydrate. To evaluate whether these changes are sucrose-dependent, an in situ and split-mouth study was conducted during 2 phases of 14 days. Under these conditions, salivary and bacterial proteins are in the same environment, which is able to mimic natural condition of biofilm formation. Each experimental phase was performed in three distinct times with the same volunteer. A volunteer wore a palatal appliance containing 16 enamel blocks, being 8 in each side for dental biofilm accumulation. 20% (0.58 M) sucrose solution, distilled and deionized water (H2Odd) and mixture containing 10.45% (0.29 M) glucose and 10.45% (0.29 M) fructose solution were extraorally dripped onto 8 blocks 8 times/day. On the 14th day, dental biofilms were collected, ECM proteins were extracted and analyzed by two different approaches: (1) 2-DE followed by liquid chromatography coupled with mass spectrometry in tandem (LC-MS/MS) and (2) whole extract proteins were also analyzed by LC-MS/MS. Among the differential expressed proteins (p<0.05) were the calcium-binding and prolactin-induced proteins. Particularly, these proteins have a unique role in the cariogenic potential of biofilm considering their properties of keep biofilm saturation and bacterial aggregation, respectively. Data show that protein profile changes in ECM of dental biofilm are not exclusively attributed to sucrose, since its monosaccharides are able to modify biofilm protein composition, suggesting that the biofilm proteomic profile is dietary carbohydrate-dependent. / Doutorado / Cariologia / Doutor em Odontologia

Orientadores: Marcos Silveira Buckeridge, Michel Georges Albert Vincentz / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T04:13:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Brandao_AlineDias_D.pdf: 19907287 bytes, checksum: dc16cfd53b17ed55d8ab52957dcdadae (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Os jatobás (espécies pertencentes ao gênero Hymenaea, família Leguminosae) apresentam grande plasticidade fisiológica. Diferentes espécies e variedades de jatobás se adaptaram a praticamente todos os biomas tropicais brasileiros, incluindo a Floresta Amazônica, e o complexo de ecossistemas que é formado pela Mata Atlântica, Cerrado e Caatinga. Espécies do gênero possuem como principal reserva de carbono do embrião o xiloglucano, um polissacarídeo similar à celulose, mas solúvel em água devido a ramificações com xilose e galactose. Após a germinação, o xiloglucano dos cotilédones é completamente degradado, produzindo monossacarídeos livres que são rapidamente metabolizados à sacarose. A produção das enzimas de hidrólise do xiloglucano nos cotilédones é controlada pela auxina proveniente da parte aérea da planta, porém, não se sabe exatamente como esse mecanismo é controlado. O objetivo deste trabalho foi isolar cDNAs (DNA complementar) parciais dos genes da bgalactosidase - BGAL e xiloglucano endotransglicosilase ou endo-b-1,4-glucanase ¿ XET, relacionados com a degradação do xiloglucano e duas enzimas envolvidas no metabolismo da sacarose, a invertase neutra/alcalina - IN/IA e a sacarose sintase ¿ SUS, para tentar avaliar possíveis formas de controle da expressão gênica envolvidas nos mecanismos do catabolismo do xiloglucano em cotilédones de plântulas de Hymenaea courbaril. Primeiramente, foram desenhados primers com base em seqüências de espécies da família Leguminosae existentes em banco de dados para os respectivos genes. A partir daí foi possível clonar seqüências parciais de todos os genes. Utilizando a técnica de RT-PCR semi-quantitativa (semi-quantitative reverse transcription-polimerase chain reaction) foram realizadas análises da expressão nos cotilédones, folhas, hipocótilos e raízes no 45º dia após a embebição (quando ocorre a taxa máxima de mobilização do xiloglucano) a cada 6 horas em um período de 24 horas. As plântulas foram analisadas sob as seguintes condições: I) plântulas crescidas em condições naturais; II) excisão da parte aérea; III) aplicação do inibidor do transporte polar de auxina (NPA ¿ ácido naftil ftalâmico); IV) crescimento em luz contínua e V) crescimento em escuro contínuo. Observou-se que existem, basicamente, três formas de controle em resposta a auxina. Nos cotilédones, os genes responsáveis pela degradação do xiloglucano BGAL1 e XTH1, possivelmente são regulados em resposta a auxina endógena e a variação de luz, enquanto que os genes responsáveis pelo metabolismo da sacarose, AlkIN1 e SUS1 possivelmente são regulados pela disponibilidade de carbono. Nas folhas, hipocótilos e raízes o padrão de expressão variou de acordo com a disponibilidade de carbono proveniente da degradação do xiloglucano de reserva nos cotilédones. Os resultados apresentados relatam a primeira descrição do isolamento dos cDNAs, permitiram a caracterização do padrão de expressão de genes chave, envolvidos no estabelecimento de uma espécie arbórea nativa do Brasil e em conjuto com os dados de atividade enzimática possibilitaram observar que a mobilização de reserva no jatobá ocorre a nível transcricional. Através do seqüênciamento, também foi possível observar que a invertase neutra clonada da raiz do jatobá apresentou resíduos de aminoácidos que a caracterizam como invertase alcalina (AlkIN1). Diante do padrão de expressão observado para a ß-galactosidase, XTH, invertase alcalina e sacarose sintase no presente trabalho, é possível sugerir um modelo para o controle da degradação e mobilização do xiloglucano de reserva nos cotilédones sob influência da auxina endógena e da variação de luz, durante o desenvolvimento inicial nas plântulas de Hymenaea courbaril / Abstract: The jatobas (species belonging to the genus Hymenaea, family Leguminosae) display large physiological plasticity and as a consequence they have great adaptive capacity to several habitats. Different species and varieties of jatobas have adapted practically to all Brazilian tropical biomes, including the Amazon Forest and the complex of ecosystems that is formed by the Atlantic Forest, the Savannah and the Caatinga. Species of this genus contain xyloglucan as the main storage of carbon in their seeds. Xyloglucan is a polysaccharide similar to cellulose, but water soluble due to the branching with xylose and galactose. After germination, xyloglucan is completely degraded, producing free monosaccharides that are quickly metabolized to sucrose. The production of xyloglucan hydrolytic enzymes in the cotyledons is known to be controlled by auxin that comes from the shoot. However, it is not known how the mecanism is controlled. The aim of the present work was isolate partial cDNAs of the genes b-galactosidase (BGAL) and xyloglucan endo-transglycosylase or endo-b-1,4-glucanase (XET) xyloglucan degradation genes and two other genes related to sucrose metabolism (neutral/alkaline invertase - NI/AI and sucrose synthase - SUS) in order to try to evaluate possible forms of control of gene expression involved in the catabolism of xyloglucan in cotyledons of Hymenaea courbaril . Primers were designed on the basis of extant sequences obtained from databases for all genes. We guided the search by sequences obtained from species of the Leguminosae. We cloned partial sequences of genes coding BGAL, XTH, NI and SUS. Semi-quantitative RT-PCR (semi-quantitative reverse transcription-polimerase chain reaction) was used to analyze expression at the 45th day after imbibition (when the rate of mobilization is maximal) in cotyledons, leaves, hypocotyls and roots every 6 hours during 24 hours. The experimental treatments were 1) seedlings grown under natural conditions; II) seedlings with top shoot excised; III) seedlings treated with auxin transport inhibitor (NPA ¿ naphtyl phtalamic acid); IV) seedilings grown in continous light and V) seedilings grown in darkness. We observed that there are three mechanisms of response to auxin. In cotyledons the genes related to xyloglucan degradation, BGAL1 and XTH1, showed responses by auxin and light in the plant. The genes related to sucrose metabolism, AlkIN1 and SUS1, have shown responses to carbon flux. In leaves, hypocotyls and roots the gene pattern change according carbon source comes from product of storage xyloglucan degradation in cotyledons. Our results revealed the first description of cDNA isolation and allow characterize pattern of genes involved native Brazilian tree species establishment. Our results and enzymatic data obtained by other researchers suggest a transcriptional control of storage mobilization in jatoba. From the sequencing data, it was also possible to observe that neutral invertase (NI) gene cloned from roots of jatoba contains aminoacid residues that characterise the NI as an alkaline invertase (AlkIN1) instead. Based in degradation and mobilization of xyloglucan storage in cotyledons we propose an expression control model for ß-galactosidase, XTH, alkaline invertase and sucrose synthase in all analyzed tissues during early development in seedilings of Hymenaea courbaril by endogenous auxin influence and light alternance / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Objetivou-se com o presente estudo caracterizar as fraÃÃes de carboidratos e proteÃna e estimar o valor energÃtico e a digestibilidade intestinal da proteÃna nÃo-degradada no rÃmen de alimentos por intermÃdio da tÃcnica de trÃs estÃgios da algaroba (Prosopis juliflora), da canafÃstula (Pithecellobium multiflorum), da flor-de-seda (Calotropis procera), da jitirana (Ipomea sp.), do juazeiro (Zizyphus joazeiro), do mata-pasto (Senna obtusifolia), do sabià (Mimosa caesalpiniaefolia), da palma gigante (Opuntia fÃcus indica) e do xique-xique (Cereus gounellei) e dos subprodutos do abacaxi (Ananas comosus), da acerola (Malpighia emarginata), do caju (Anacardium occidentale), do coco (Cocos nucifera), do melÃo (Cucumis melo), do maracujà (Passiflora eduli), da uva (Vitis labrusca) e do urucum (Bixa orellana). Para obtenÃÃo do fracionamento dos carboidratos, de acordo com o sistema CNCPS, foram calculados os carboidratos totais, as suas fraÃÃes B2, C e os componentes solÃveis em detergente neutro. Foram determinadas as fraÃÃes potencialmente degradÃvel (B2) e nÃo-degradÃvel (C) da fibra em detergente neutro, corrigida para cinzas e proteÃna. Para determinaÃÃo das fraÃÃes nitrogenadas, foram analisados os compostos nitrogenados nÃo-protÃicos, nitrogÃnio solÃvel e insolÃvel em tampÃo borato-fosfato e nitrogÃnio protÃico insolÃvel em detergente neutro e em detergente Ãcido. Para a estimaÃÃo dos Nutrientes DigestÃveis Totais (NDT) foram utilizadas as equaÃÃes propostas pelo NRC (2001). Para a determinaÃÃo da digestibilidade intestinal da proteÃna nÃo-degradada no rÃmen, os alimentos foram inicialmente incubados no rÃmen de fÃmea bovina fistulada, por 16 horas para determinaÃÃo da ProteÃna nÃo-degradada no rÃmen (PNDR), sendo o resÃduo submetido à digestÃo com soluÃÃo de pepsina durante 1 hora, e soluÃÃo de pancreatina a 38ÂC durante 24 horas, cujos resÃduos foram analisados para nitrogÃnio total. Acerola e melÃo apresentaram substancial conteÃdo nitrogenado na fraÃÃo C o que reduziria a disponibilidade de N tanto para microrganismos do rÃmen quanto para o hospedeiro. As forrageiras estudadas apresentaram maiores proporÃÃes do nitrogÃnio nas fraÃÃes A e B2, consequentemente disponibilizando nitrogÃnio para bactÃrias fermentadoras de carboidratos fibrosos. O percentual de fraÃÃo C na acerola e no melÃo em detrimento da fraÃÃo B2 acarretaria maior efeito de repleÃÃo ruminal e diminuiÃÃo da disponibilidade energÃtica, por sua caracterÃstica de indigestibilidade ao longo do trato gastrointestinal, quando submetidos a ensaios de alimentaÃÃo para animais. Nas forrageiras nativas e nas adaptadas ao clima da regiÃo Nordeste foram observados valores de fraÃÃo A + B1 de 35,26 a 73,37%, para fraÃÃo B2, de 3,87% a 28,45% e para fraÃÃo C de 17,34 e 40,63%. As fraÃÃes A, B1, B2, B3 e C dos compostos nitrogenados apresentaram variaÃÃo de 9,84 a 42,33 %; 1,58 a 11,47%; 48,63 a 80,10%; 0,70 a 6,13% e 0,43 a 2,86%, respectivamente. As fraÃÃes de carboidratos dos subprodutos analisados variaram de 19,35 a 58,52%; 9,95 a 61,44% e 15,35 a 70,06 para A+B1, B2 e C, respectivamente; enquanto para os compostos nitrogenados variaram de 5,01 a 33,02%; 1,69 a 15,23%; 2,26 a 75,60%; 1,53 a 40,26% e 0,08 a 43,84% para fraÃÃes A, B1 B2, B3 e C, respectivamente. O NDT estimado das forrageiras variou de 48,30 a 65,42%, enquanto o dos subprodutos variou de 31,41 a 128,90%. A estimativa da PNDR das forragens variou de 13,37 a 83,6%, e dos subprodutos variou de 39,14 a 89,06%. A digestibilidade intestinal da PNDR das forragens variou de 26,09 a 80,68%, enquanto para os subprodutos variou de 22,26 a 76,82%. O sabià foi a forrageira que apresentou a maior DI e o maior teor de PNDRd, e a flor-de-seda os menores valores; enquanto para os subprodutos, o melÃo apresentou o maior valor para DI, entretanto o caju forneceu maior teor de PNDRd, enquanto o coco apresentou os mais baixos valores para DI e PNDRd / The objective of this research was to characterize the protein and carbohydrate fractions,estimate energy values and evaluate the intestinal digestibility protein of algaroba (Prosopis juliflora), canafÃstula (Pithecellobium multiflorum), flor-de-seda (Calotropis procera), jitirana (Ipomea sp.), juazeiro (Ziziphus joazeiro), mata-pasto (Senna obtusifolia) and sabià (Mimosa caesalpiniaefolia Benth), palma gigante (Opuntia ficus indica) and xique-xique (Cereus gounellei) and the agroindustry byproducts from pineapple (Ananas comosus L.), barbados cherry (Malpighia emarginata), cashew (Anacardium occidentale), coconut (Cocos nucifera L.), melon (Cucumis melo), passion fruit (Passiflora eduli), grape (Vitis labrusca) and anatto seeds (Bixa orellana L.). To obtain the carbohydrates fractions, according with Cornell Net Carbohydrate and Protein System (CNCPS) system, were calculated the total carbohydrates, their fractions B2, C and the soluble components in neutral detergent. It was determinated the potentially degradable (B2) and undegradable (C)fractions of the neutral detergent fiber, corrected for ashes and protein. The non-protein nitrogenous compounds, soluble and insoluble nitrogen in borate-phosphate buffer, nitrogenous protein insoluble in neutral and acid detergent were analyzed for the determination of the nitrogen fractions. To estimate Total Digestible Nutrients (TDN) had been used the equations proposals by National Research Council - NRC (2001). The feeds were incubated in rumen during 16 hours to determine the rumen-undegradable protein (RUDP), then the residue was incubated with pepsin solution during 1 hour, and pancreatic solution during 24 hours at 38ÂC, whose residues were analyzed for total nitrogen. The Malpighia emarginata and Cucumis melo showed substantial nitrogen content in fraction C which would reduce the disponibility of nitrogen for the rumen microorganisms and its host. The evaluated forages showed higher proportions of nitrogen in fractions A and B2, providing nitrogen for the rumen microorganisms. The percentage of fraction C in Malpighia emarginata and Cucumis melo at the expense of the B2 fraction would entail greater effect of ruminal fill and decreased availability of energy, for its characteristic of indigestibility along the gastrointestinal tract, when being tested for feeding animals. In the evaluated forages had been observed values of A+B1 fraction from 35.26 to 73.37%, for B2 fraction, from 3.87% to 28.45% and for C fraction from 17.34 to 40.63%. The fractions, A, B1, B2, B3 and C of nitrogenous compounds had presented variation from 9.84 to 42.33%; 1.58 to 11.47%; 48.63 to 80.10%; 0.70 to 6.13% and 0.43 to 2.86%, respectively. The byproducts carbohydrate fractions analyzed varied from 19.35 to 58.52%; 9.95 to 61.44% and 15.35 to 70.06, for A+B1, B2 and C, respectively. In turn, the nitrogenous compounds varied from 5.01 to 33.02%; from 1.69 to 15.23%; from 2.26 to 75.60%; from 1.53 to 40.26% and from 0.08 to 43.84% for fractions, A, B1 B2, B3 and C, respectively. The forages TDN values varied from 48.30 to 65.42%, while of by-products it varied from 31.41 to 128.9%. The estimate of RUDP in the forages ranged from 13.37% to 83.6%, and the byproducts RUDP ranged from 39,14 to 89.06%. The intestinal digestion of RUDP ranged from 26.09 to 80.68%, %, while for byproducts varied of 22,26 76.82%. The Mimosa caesalpiniaefolia Benth was the forage that presented better ID and better RUDPd, and the Calotropis procera, presented lowest values for these variables. For byproducts, the Cucumis melo presented the biggest value for DI, while the Cocos nucifera L. presented the lowest values for DI and RUDPd

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:22:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Sonia.pdf: 1055370 bytes, checksum: 3e991b5884a4ccba6d3975a926b8a86a (MD5) Previous issue date: 2011-10-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Although guarana (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a culture of great interest to the Amazon region, its productivity is still low. The availability of plant material that is genetically uniform, precocious and productive is the key for expanding and improving the culture in the region. To achieve this, it is recommended to do vegetative propagation, although some cultivars have rooting problems. This study aimed to evaluate the rooting of guarana from fertilized and unfertilized plants submitted to increasing levels of irradiance, with and without application of IBA. It also aimed to correlate the reserves of the branches and cuttings with rooting characteristics. The design was completely randomized in factorial arrangement of 6x4x2x2. The factors studied were the following: (i) five cultivars and one genotype of guarana, (ii) four levels of irradiance, (iii) with and without fertilization and (iv) application of IBA or not. The experimental unit contained 10 cuttings with four repetitions. The mother plants received or did not received fertilizer in the field for ten years and were subjected to increasing levels of irradiance for 60 days. The cuttings were taken from these plants and remained in the nursery for 120 days for rooting. After this period we evaluated the number of rooted cuttings with calluses and dead, root number, volume, length and dry weight of roots. The carbohydrate content was determined from the branches and rooted cuttings at the time of the dismantling of the research. The rooting of cuttings was higher for the fertilization treatment for BRS-Maues, CMU-CG 381 and BRS 882. The reduction of irradiance on the mother plant favored rooting. The highest percentage of rooting and lower mortality were obtained from cuttings without IBA treatment, independently of cultivar. The cv. BRS-Maués showed the highest rooting potential, while BRS-CG882 had the lowest rooting. BRS-Maués was more efficient in accumulating starch than the BRS- 882 CG and the rooting potential of both cultivars was positively correlated with the starch accumulated in each one. Regarding the total soluble sugars in the branches, there was no correlation for BRS-882 CG. For BRS-Maués the correlation was negative in relation to rooting of these twocultivars. / guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma cultura de grande interesse para a região Amazônica, mas sua produtividade é ainda baixa. A disponibilidade de material vegetal geneticamente uniforme, precoce e produtivo é fundamental para a expansão e melhoria da cultura na região. Para isso, recomenda-se a propagação vegetativa, no entanto algumas cultivares apresentam problemas de enraizamento. Esse trabalho teve como objetivo avaliar o enraizamento de estacas de guaranazeiro provenientes de plantas adubadas e não adubadas, submetidas à níveis crescentes de irradiância, com e sem aplicação de AIB e, correlacionar as reservas dos ramos e das estacas com as características de enraizamento. O delineamento adotado foi inteiramente casualizado, em arranjo fatorial de 6x4x2x2. Os fatores estudados foram: cinco cultivares e um genótipo de guaranazeiro, quatro níveis de irradiância, presença e ausência de adubação e aplicação ou não de AIB. A unidade experimental continha 10 estacas com 4 repetições. As plantas matrizes receberam ou não adubação, no campo, durante dez anos e foram submetidas a níveis crescentes de irradiância por 60 dias. As estacas foram retiradas dessas plantas e permaneceram em viveiro por 120 dias para enraizamento. Após este período foram avaliados o número de estacas enraizadas, com calos e mortas, número de raiz, volume, comprimento e peso da matéria seca das raízes. Os teores de carboidratos foram determinados nos ramos e nas estacas enraizadas no momento do desmonte da pesquisa. O enraizamento das estacas foi maior no tratamento com adubação para as cultivares BRS-Maués, CMU 381 e BRS-CG 882. A redução da irradiância sobre as plantas matrizes favoreceu o enraizamento. O maior percentual de enraizamento e o menor de mortalidade das estacas foram obtidos no tratamento sem AIB, independente, da cultivar. A cv. BRS-Maués expressou o maior potencial de enraizamento, enquanto BRS-CG882 apresentou o menor enraizamento de estacas. BRS-Maués foi mais eficiente em acumular amido que a BRS-CG 882 e o potencial de enraizamento das duas cultivares apresentou correlação positiva com o teor de amido acumulado em cada uma. Quanto aos açúcares solúveis totais nos ramos, para BRS-CG 882 não houve correlação e para BRS-Maués foi negativa em relação ao enraizamento dessas duas cultivares. Palavras-chave: Propagação vegetativa, estaquia, sombreamento, fitohormônio, carboidratos.

Submitted by Napoleana Barros Martins (napoleana_martins@hotmail.com) on 2016-08-08T14:31:39Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Fernanda Cardoso de Freitas.pdf: 1555586 bytes, checksum: f8768ffe8e726c40104ded747abbd2fd (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-26T14:13:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Fernanda Cardoso de Freitas.pdf: 1555586 bytes, checksum: f8768ffe8e726c40104ded747abbd2fd (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-26T14:17:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Fernanda Cardoso de Freitas.pdf: 1555586 bytes, checksum: f8768ffe8e726c40104ded747abbd2fd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-26T14:18:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Fernanda Cardoso de Freitas.pdf: 1555586 bytes, checksum: f8768ffe8e726c40104ded747abbd2fd (MD5) Previous issue date: 2015-11-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Before the plants remain completely submerged, the seasonal flooding occurs gradually in the várzea floodplain forests of the Amazon. The adaptive features developed by the plants to cope with the anaerobic conditions caused by the flooding period may vary according to the species, flooding duration, plant age and water column height. Therefore, we evaluated in Vitex cymosa 1-year follow-up seedlings if there are differences in the early development of morpho-physiological and biochemical features according to the influence of different levels of water column. The seedlings (n=15 per treatment) were submitted to three treatments over 45 days: no flooding (everyday watered), gradual flooding (daily 5 cm water column increase till the total plant submersion at the 10º day) and abrupt flooding (sudden totalsubmersion). After the flooding, the seedlings were monitored within 60 days. Non-destructive parameters were evaluated, which encopassed height and diameter growth, analysis of the chlorophyll a fluorescence, leaf loss and production and destructive parameters which encopassed biomass, relative growth rates, stalk and leaf anatomy, starch content and total soluble sugar amount. Based on morpho-physiological, anatomy and biochemical analysis, the gradual inundation allowed the V. cymosa seedlings to a short acclimatization period to face the total submersion, which was not observed in the abrupt flooding / Nas florestas de várzea da Amazônia a inundação geralmente ocorre de maneira gradativa até que as plantas permaneçam completamente submersas. As adaptações e respostas apresentadas pelas plantas devido à redução de oxigênio no período de inundação podem variar de acordo com a espécie, a idade da planta, a duração da inundação e a coluna de água. Assim, foi avaliado se as primeiras respostas morfofisiológicas e bioquímicas apresentadas por plântulas de Vitex cymosa com um ano de idade seriam diferentes de acordo com o nível da coluna de água imposta. Plântulas de V. cymosa (n = 15 / tratamento) foram submetidas a três tratamentos: sem inundação (rega diária), inundação gradativa (5 cm de água por dia até a total submersão no 10º dia) e inundação abrupta (submersão total súbita das plântulas) por um período de 45 dias. Após a inundação as plântulas foram monitoradas por um período de recuperação de 60 dias. Foram mensurados parâmetros não destrutivos, como crescimento em altura, diâmetro do caule, fluorescência da clorofila a, perda e produção de folhas e parâmetros destrutivos como biomassa, taxa de crescimento relativo, anatomia do caule e raiz, teor de amido e o açúcar solúvel total nas plântulas. Com base na análise conjunta das respostas morfofisiológicas e bioquímicas apresentadas, a inundação gradativa permitiu um curto período de aclimatação para as plântulas de V. cymosa enfrentarem a submersão completa, o que não se observou para a inundação abrupta.

O CO2 supercrítico (CO2-sc) é um bom solvente para substâncias apolares e pouco polares de baixa massa molecular. A fim de tornar este meio um melhor solvente para uma gama maior de substâncias, desenvolvemos 8 novos tensoativos, sendo seis derivados de açúcares (N-metil-D-glucamina, 2-D-Glucosamina e Sorbitano) e três derivados de óleos vegetais (linhaça e palma). Os tensoativos possuem como grupos CO2-fílicos, o acetato (peracetilados) ou o t-butil-glicidil-éter, e como grupo CO2-fóbico o dodecanoato, que pode proporcionar um ambiente \"apolar\" em eventuais agregados formados em CO2-sc. A solubilidade e o comportamento de fase destes novos tensoativos em CO2-sc foram investigados, mostrando-se bastante solúveis e apresentando pontos de névoa comparáveis a outros tensoativos fluorados (mais agressivos, do ponto de vista ambiental). A polaridade que estes tensoativos agregam ao meio foi verificada através de análises de solvatocromismo, utilizando o corante de Reichardt (Betaína-30) e fluorescência de pireno, as quais mostraram resultados bastante promissores, obtendo-se polaridades baixas e médias (similares a álcoois de cadeia média ou solventes clorados). / Supercritical CO2 (sc-CO2) is a good solvent for non-polar or almost non-polar substances with low molecular mass. In order to turn this medium into a better solvent for a wider range of substances, we developed 8 new surfactants, six of them sugar derivatives (N-methyl-D-glucamine, 2-D-Glucosamine and Sorbitan), and three of them vegetable oil derivatives (palm and linseed). The surfactants have either acetate (peracetylated) or t-butyl-glycidyl ether as CO2-philic groups, and as CO2-phobic group, dodecanoate, that can provide an \"apolar\" environment in aggregates that might be formed in sc-CO2. The solubility and phase behavior of these new surfactants in sc-CO2 were investigated, and they showed to be very soluble presenting low cloud pressures comparable to fluorinated surfactants (that are more aggressive from an environmental perspective). The polarity that these new surfactants brought to the medium was verified through the solvatochromic analysis, using the Reichardt\'s dye (Betaine-30) and pyrene fluorescence, which showed promising results, with polarities similar to medium chain alcohols or chlorinated solvents

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:48:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joao_Arlindo_Gouveia_Goncalves.PDF: 982535 bytes, checksum: a6210885634c3fe9d61b3fd368e706b7 (MD5) Previous issue date: 2011-12-14 / The aim of this study was to evaluate the in vivo digestibility of the silage residue wet cassava starch (SRWCS) replacing corn in diets and quality during the ensiling process. The corn was replaced in the diet of sheep by SRWCS in proportions of 0%, 25%, 50%, 75% and 100%; and for the evaluation of SRWCS used two treatments, in natura and one with material pre dry. We used five castrated male sheep were cannulated distributed in a 5x5 Latin square design (five treatments and five replicates) within 14 days of adaptation and 7 days for data collection at 105 days of experimental period. For the assessment of SRWCS the material was ensiled in experimental silos of Chlorides Polyvinyl. The moist residue of cassava starch can be ensiled and fresh or pre-dried with no differences (P> 0.05) for crude protein (CP), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), hemicellulose, lignin and cellulose in the material fresh and pre-dried. There was no difference in the amounts of dry matter (DM), organic matter (OM), CP, NDF, lignin, ether extract (EE) during the days of ensiling. There was high correlation of pH with the growth of enterobacteria, lactobacilli, Clostridium, fungi and yeasts. The SRWCS can replace corn in the diet of sheep, not to change the digestibility of dry matter, organic matter, crude protein, ether extract, neutral detergent fiber, acid detergent fiber and total carbohydrates of the diet / O objetivo do presente estudo foi avaliar a digestibilidade in vivo da silagem do resíduo úmido de fecularia de mandioca (SRUFM) em substituição ao milho em dietas para ovinos e a sua qualidade durante o processo de ensilagem. O milho foi substituído na dieta dos ovinos pela SRUFM nas proporções de 0%, 25%, 50%, 75% e 100%; e para a avaliação da SRUFM utilizou dois tratamentos, sendo um in natura e outro com o material pré-seco. Foram utilizados cinco ovinos machos castrados canulados distribuídos em um quadrado latino 5x5 (cinco tratamentos e cinco repetições) em 14 dias de adaptação e 7 dias para coleta de dados, em 105 dias de período experimental. Para a avaliação da SRUFM o material foi ensilado em silos experimentais de Cloretos de Polivinila. O resíduo úmido de fécula de mandioca pode ser ensilado in natura e ou pré-seco sem apresentar diferenças (P>0,05) para proteína bruta (PB), fibra detergente neutro (FDN), fibra detergente ácida (FDA), hemicelulose, lignina e celulose no material in natura e pré-seco. Não foi observado diferença nas quantidades de matéria seca (MS), matéria orgânica (MO), PB, FDN, lignina e extrato etéreo (EE) durante os dias de ensilagem. Houve correlação alta de pH com o crescimento de enterobactérias, lactobacilos, Clostridium, fungo e leveduras. A SRUFM pode substituir o milho em dieta de ovinos, por não alterar a digestibilidade da matéria seca, matéria orgânica, proteína bruta, extrato etéreo, fibra detergente neutra, fibra detergente ácida e carboidratos totais da dieta utilizada

trans-Sialidase de Trypanosoma cruzi (TcTS) pertence à família de glicoproteínas de superfície do parasita e constitui um dos poucos exemplos naturais de glicosiltransferases superficiais encontradas em eucariotes. T. cruzi é incapaz de sintetizar ácido siálico e utiliza esta enzima para retirar este monossacarídeo de glicoconjugados do hospedeiro para sialilar moléculas aceptoras, como mucina-GPI (glicosilfosfatidilinositol), presentes na sua membrana plasmática. Esta enzima é específica em catalisar, preferencialmente, a transferência de ácido siálico para moléculas de mucina, originando ligações -2,3 com moléculas de galactose aceptoras na superfície do parasita. Considerando a heterogeneidade das moléculas de mucina de T. cruzi, é necessário que novas moléculas sejam sintetizadas a fim de que estas atuem como substratos glicopeptídicos, os quais podem levar ao melhor entendimento das interações entre enzima e substratos e permitir o planejamento racional de inibidores seletivos. Por isso, o trabalho foi divido em três rotas sintéticas: (i) preparação do doador de galactose, (ii) preparação dos aceptores-doadores e (iii) acoplamento dos dissacarídeos com aminoácidos aceptores para obtenção dos blocos de construção. Apesar dos objetivos propostos inicialmente não terem sido totalmente alcançados, o trabalho desenvolvido durante esse período permitiu a síntese do doador de galactose (3) em três etapas, aceptor de galactose (6) em cinco etapas, dissacarídeo (11) na glicosilação de 6 com 3, aminoácidos aceptores (13 e 14) e também dos blocos de construção (17 e 18) decorrente do acoplamento de 11 com os aminoácidos aceptores. Não obstante, é importante ressaltar que apesar da extensa rota planejada, porém necessária, a síntese dos blocos de construção é inédita. Portanto, pode-se concluir que o trabalho trouxe relevante contribuição no que diz respeito à química de carboidratos e à disponibilização de dados espectrométricos de compostos orgânicos para a literatura. / Trypanosoma cruzi trans-sialidase (TcTS) belongs to the family of glycoproteins expressed on the surface of the parasite and constitutes one of the few examples of natural surface glycosyltransferases found in eucariotes. T. cruzi can not synthesize sialic acid itself and uses this enzyme to scavenge this monosaccharide from host glycoconjugates to sialylate acceptors molecules, such as GPI (glycosylphosphatidylinositol) mucins, that are present in parasite plasma membrane. This enzyme is specific to catalyze, preferentially, the transference of sialic acid to mucin glycoproteins, generating -2,3-linkages with acceptor galactose molecules in the parasite surface. Considering the heterogeneity of T. cruzi mucin molecules, its necessary to synthesize new compounds that can act as glycopeptide substrates, leading to a better understanding concerning the enzyme and substrates and allow the rational design of some selective inhibitors. Thus, this work was developed in three synthetic routes: (i) the synthesis of galactose donor, (ii) synthesis of donor-acceptors and (iii) coupling between disaccharides and acceptors amino acids in order to obtain building blocks. Despite of some objectives initially proposed had not been accomplished, the developed work during this period allow the synthesis of the galactose donor (3) in three steps, donor-acceptor (6) in five steps, disaccharide (11), acceptors amino acids (13 and 14) and also the building blocks (17 and 18). However, its important highlight that the synthesis of the building blocks by this necessary, but extensive, synthetic route is unpublished. Therefore, it can be concluded that the present work brought rich contribution concerning the carbohydrate chemistry and the availability of spectrometric data of organic compounds to the literature.

Os teredinídeos são bivalves perfuradores de madeira. Esses animais desenvolveram a capacidade de utilizar a madeira como fonte de nutrientes, mantendo a capacidade de alimentar-se de material em suspensão. A importância relativa da madeira na alimentação em relação aos hábitos suspensívoros, o local onde a digestão de celulose ocorre, e a origem da celulose envolvida no processo (endógena ou exógena), permanecem desconhecidos. O objetivo do trabalho, portanto, é investigar o processo digestivo nesses animais. Nausitora fusticula (Jeffreys, 1860) foi escolhida por ser uma espécie cuja anatomia é bem descrita e por ocorrer em grande abundância no litoral de São Paulo. Os troncos contendo os animais foram coletados no manguezal da Praia Dura, Ubatuba-SP. Testes enzimáticos foram realizados em diferentes órgãos do trato digestivo (glândula digestiva especializada e normal, apêndice armazenador de madeira, intestino, canal anal) e brânquias; sobre amido, laminarina, liquenana, carboximetilcelulose (CMC), celulose microcristalina (Avicel®), maltose e &#946;-glicosidase. A digestão de carboidratos ocorre em todos os órgãos analisados, exceto para celulose microcristalina (Avicel®). As maiores atividades foram encontradas no divertículo digestivo especializado e no apêndice. A presença de atividade enzimática nos ctenídeos aponta para a importância das bactérias da glândula de Deshayes. A digestão de carboximetilcelulose (CMC) ocorre em menor proporção que de outros carboidratos. A madeira é de importância significativa devido a digestão de hemiceluloses. Porém não foi possível determinar se a madeira é mais ou menos importante do que o material filtrado, nem precisamente a origem das enzimas que atuam nestes animais. / Teredinids are wood boring bivalves. They evolved to use wood as a source of nutrient, besides keeping the suspension-feeding habit. The role of wood and plankton in the diet of these animals, the structures in which digestion takes place and the origin of the cellulase (endogenous or exogenous) remain uncertain. Nausitora fusticula (Jeffreys, 1860) was chosen because the funcional anatomy of this species is well described and it’s common inhabitant of the mangroves of São Paulo state. The logs containg N. Fusticula were collected in the mangrove of Praia Dura, Ubatuba, São Paulo Enzymatic activities over starch, carboximetilcellulase (CMC), microcristalinecelulose (Avicel®), lichenan, laminarin, maltose and &#946;-glucosid in different organs of the digestive tract and ctenidia of this species were analyzed. The digestion of were detected in the organs analyzed, mainly on the appendix and the SDD, except for microcristaline cellulose (Avicel®). The enzymatic activities occur mainly in the appendix and the specialized digestive diverticule (SDD). The presence of enzymatic atctivity in the ctenidia suggests the importance of the glands of Deshayes in the digestive process. The digestion of CMC is less significant than of the other carbohydrates. The results suggest that wood plays a significant role in the nutrition of this species, mainly due to digestion of hemicelulloses. Still, it is not possible to know if the wood is more important than the plankton in the diet, or to precisely identify the origin of the cellulase.

Polihidroxialcanoatos (PHA) produzidos por Pseudomonas sp. LFM046 a partir de carboidratos e ácido propiônico contem monômeros com número ímpar e par de carbonos, representando um bom modelo para o estudo do metabolismo de propionato. Genes relacionados ao ciclo do 2-metilcitrato foram encontrados em todas as espécies de Pseudomonas compondo um operon prpRBCAcnMprpFD. Genes da via do metilmalonil-CoA não foram encontrados em Pseudomonas. Genes da <font face=\"Symbol\">a-oxidação de propionato foram encontrados apenas em P. aeruginosa. A análise de um mutante prp obtido por inserção de transposon revelou que estava mutado no gene prpB, relacionado ao ciclo do 2-metilcitrato. A análise de mutantes obtidos por radiação ultravioleta revelou que dois devem estar afetados em via menos relevante para o metabolismo de propionato e outros dois na ativação desse ácido orgânico. Experimentos com propionato marcado (1C13) demonstraram que as vias do oxobutirato, do metimalonil-CoA e do 2-hidroxiglutarato não devem contribuir para o metabolismo de propionato em Pseudomonas sp. LFM046. / Polyhydroxyalkanoates (PHA) produced by Pseudomonas sp. LFM046 from carbohydrates and propionic acid contains monomers with odd and even number of carbons, representing a good model to study the propionate metabolism. Genes related to 2-methycytrate cycle were found in all Pseudomonas species organized in an operon prpRCAAcnMprpFD. Genes related to the methylmalonyl-CoA pathway were not found in Pseudomonas. Genes related to the propionic <font face=\"Symbol\">a-oxidation were found only in P. aeruginosa. Analysis of a prp mutant obtained by transposon insertion revealead that it was mutated in prpB gene, related to the 2-methylcytrate cycle. The analysis of mutants obtained using ultraviolet radiation showed that two should be affected in less relevant propionate metabolism pathways and other two in the activation of this organic acid. Experiments with labeled propionate (113C) demonstrated that the oxobutyrate, methylmalonil-CoA and 2-hydroxyglutarate pathways should not contribute to the propionate metabolism in Pseudomonas sp. LFM046.