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Mathematical modelling of metabolism and acidity in cancer

McGillen, Jessica Buono January 2014 (has links)
Human cancers exhibit the common phenotype of elevated glycolytic metabolism, which causes acidification of the tissue microenvironment and may facilitate tumour invasion. In this thesis, we use mathematical models to address a series of open problems underlying the glycolytic tumour phenotype and its attendant acidity. We first explore tissue-scale consequences of metabolically-derived acid. Incorporating more biological detail into a canonical model of acidity at the tumour-host interface, we extend the range of tumour behaviours captured by the modelling framework. We then carry out an asymptotic travelling wave analysis to express invasive tumour properties in terms of fundamental parameters, and find that interstitial gaps between an advancing tumour and retreating healthy tissue, characteristic of aggressive invasion and comprising a controversial feature of the original model, are less significant under our generalised formulation. Subsequently, we evaluate a potential role of lactate---historically assumed to be a passive byproduct of glycolytic metabolism---in a perfusion-dependent metabolic symbiosis that was recently proposed as a beneficial tumour behaviour. Upon developing a minimal model of dual glucose-lactate consumption in vivo and employing a multidimensional sensitivity analysis, we find that symbiosis may not be straightforwardly beneficial for our model tumour. Moreover, new in vitro experiments, carried out by an experimental collaborator, place U87 glioblastoma tumours in a weakly symbiotic parameter regime despite their clinical malignancy. These results suggest that intratumoural metabolic cooperation is unlikely to be an important role for lactate. Finally, we examine the complex pH regulation system that governs expulsion of metabolically derived acid loads across tumour cell membranes. This system differs from the healthy system by expression of only a few key proteins, yet its dynamics are non-intuitive in the crowded and poorly perfused in vivo environment. We systematically develop a model of tumour pH regulation, beginning with a single-cell scenario and progressing to a spheroid, within a Bayesian framework that incorporates information from in vitro data contributed by a second experimental collaborator. We predict that a net effect of pH regulation is a straightforward transmembrane pH gradient, but also that existing treatments are unable to disrupt the system strongly enough to cause tumour cell death. Taken together, our models help to elucidate previously unresolved features of glycolytic tumour metabolism, and illustrate the utility of a combined mathematical, statistical, and experimental approach for testing biological hypotheses. Opportunities for further investigation are discussed.
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South Africa’s intervention in Angola: Before Cuito Cuanavale and thereafter

Labuschagne, Bernice 12 1900 (has links)
Thesis (MA (Political Science. International Studies))--University of Stellenbosch, 2009. / ENGLISH ABSTRACT: Since South Africa’s military intervention in the Angolan conflict twenty years ago, many scholars have written various conflicting accounts on the subject. Why did South Africa become involved in the first place, what made the SADF withdraw, and why did the country decide to become involved once again in a conflict that seemingly did not concern them? What happened at Cuito Cuanavale? These are the questions this study aims to address by drawing on the work of several influential authors. But why the differing narratives? Internal factors such as South Africa’s regional policies during apartheid as well as external factors such as pressure on the Nationalist government from the international arena, all played significant roles in the decision to become more deeply involved in Angola. South African regional policies during apartheid have been regarded in very different ways by various authors which this study will explore. SA’s policies during apartheid were characterised by anti-communism and influenced mainly by the thought that if SA supported a Western ideal, SA would be able to regain some international credit from Western powers. In addition, pressure from international actors increased on SA to protect the southern African region from communist domination. As a result, SA’s second intervention in Angola became prolonged as the clashes between the SADF/UNITA and Angolan/Cuban/Soviet forces grew in intensity. The battle/siege of Cuito Cuanavale is still considered to be the watershed moment that ended the Angolan conflict. The outcome of this battle, however, is still a very controversial subject to this day as some authors claim Cuba won, while others claim the SADF won. At the time there was no surrender. However, establishing exactly who the winner was is very difficult as every party to the conflict has its own ideas about what really happened. The military outcome and political consequences may have influenced this debate. For that reason it is imperative to remember all important influence that various schools of thoughts have on different observers and therefore accounts of the conflict as many of them were written in a time when Cold War and liberation sentiments thrived. Twenty years later is a good time for better informed hindsight. iv / AFRIKAANSE OPSOMMING: Sedert Suid-Afrika se militêre betrokkenheid in Angola twintig jaar gelede, het verskeie kontrasterende verhale van dié konflik die lig gesien. Hoekom het SA in die eerste plek betrokke geraak, waarom het die SAW die eerste keer onttrek en hoekom het die land besluit om weer ’n keer betrokke te raak by ’n konflik wat op die oog af niks met hulle te doen gehad het nie? Wat het by Cuito Cuanavale gebeur? Dit is die vrae wat hierdie studie sal probeer antwoord deur gebruik te maak van verskeie invloedryke outeurs. Maar hoekom die uiteenlopende stories? Interne faktore soos SA se streeksbeleide tesame met eksterne faktore soos internasionale druk op die NP regering, het almal deurslaggewende rolle gespeel in die besluit om dieper betrokke te raak in Angola. Suid-Afrikaanse streeksbeleide gedurende apartheid word anders geïnterpreteer deur verskillende outeurs afhangende uit watter oogpunt hulle skryf, hetsy liberaal of realisties. Streeksbeleide gedurende apartheid was gekenmerk deur anti-kommunistiese sentimente en is hoofsaaklik beïnvloed deur die denke dat indien SA hierdie Westerse ideaal ondersteun het, die land dalk ’n mate van sy reeds kwynende internasionale aansien sou herwin. Hoe dit ook al sy, die druk op SA om Suider Afrika te beskerm teen die kommunistiese aanslag, het geleidelik vergroot vanuit die internasionale arena. Dit is dan ook die rede waarom SA se tweede inval in Angola ‘n meesleurende en uitgerekte saga geword het aangesien botsings tussen die SAW/UNITA alliansie en die Angolese/Kubaanse/Russiese alliansies meer intens en op ’n meer gereelde basis voorgekom het. Die laaste offensief by Cuito Cuanavale word dus steeds gesien as die oomblik wat die einde van die Angolese oorlog ingelui het. Die uitkoms van hierdie geveg/beleg word egter steeds in kontroversie gehul aangesien daar steeds nie konsensus bereik kan word oor wie die eintlike wenners was nie. Sekere outeurs voer aan dat die Kubane sonder twyfel gewen het, terwyl ander beweer dat die SAW gewen het. Op daardie punt was daar egter geen militêre oorgawe nie. Juis om daardie rede is dit baie moeilik om vas te stel wie die eintlike wenner was, aangesien elke betrokke party sy eie idees gevorm het oor wat eintlik gebeur het. Dit is waarom dit belangrik is om te let op die invloed wat verskeie outeurs kan hê op dié onderwerp aangesien baie daarvan geskryf is gedurende ’n tyd toe die Koue Oorlog en bevrydingsoorloë aan die orde van die dag was. Twintig jare later is dalk ’n goeie tyd vir ’n terugblik.
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The Effects of Serum from Obese Patients and Adipocyte-derived Cytokines on Growth of Prostate Cancer Cells In Vitro

Mora, Benjamin 03 July 2014 (has links)
Obesity has been related to a greater incidence of more aggressive, advanced stage prostate cancer. It is expected that serum adipokines related to obesity will promote a more aggressive phenotype in PC cells in vitro. Patient serum (n = 80) was obtained for analysis and divided into four patient groups based on obesity and prostate cancer status. Characteristics of serum-treated PC cells in vitro were measured. In a separate set of analyses, LNCaP and PC3 cells were treated with adiponectin and resistin in vitro, and cell characteristics were analyzed. Serum from obese PC patients induces greater amounts of cell migration and lower amounts of cell proliferation and invasion in vitro. Exogenous treatment of adiponectin on PC cells in vitro does not affect cell migration or invasion. However, adiponectin modulates cytosolic protein levels of soluble β-catenin and GSK-3β, indicating that its mechanism of action may be through the Wnt signalling pathway.
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Les routes d’invasion du criocère du lis (Lilioceris lilii) en Amérique du Nord

Dieni, Alessandro 11 1900 (has links)
Le criocère du lis, Lilioceris lilii (Coleoptera : Chrysomelidae), un ravageur de lis et de fritillaires d’origine eurasienne, a été observé pour la première fois en Amérique du Nord en 1943 sur l’Ile de Montréal au Canada. Après y avoir été confiné pendant environ 25 années, ce coléoptère a par la suite progressé rapidement sur le territoire nord-américain. Actuellement, on l’observe dans huit provinces canadiennes et huit états américains. Cette étude a investigué les routes d’invasion utilisées par le criocère du lis au Canada et aux États- Unis avec l’aide de marqueurs génétiques AFLP. Pour ce faire, 516 individus parmi 34 sites en Amérique du Nord et en Europe ont été échantillonnés et analysés. Le premier objectif était de déterminer, en analysant la structure génétique des populations nord-américains, s’il y avait eu une ou plusieurs introductions en provenance d’Europe. Le deuxième objectif était d’identifier l’origine de la ou des populations introduites en Amérique du Nord. Finalement, le troisième objectif consistait à proposer un scénario d’invasion de L. lilii en Amérique du Nord basé sur les données de première mention et de structure génétique des populations échantillonnées. Les résultats démontrent une signature génétique distincte entre les criocères du lis du Canada et ceux des États-Unis, suggérant ainsi deux sources d’introductions indépendantes en Amérique du Nord, soit une première introduction à Montréal, Québec, dans les années 1940 et une seconde aux États-Unis au début des années 1990 à Cambridge, Massachusetts. De plus, les deux populations nord-américaines semblent provenir de différentes régions du nord de l’Europe, ce qui est conséquent avec le scénario suggérant deux sources d’introductions indépendantes. Chacune des populations aurait par la suite progressé respectivement dans leur pays d’introduction selon une dispersion de type stratifiée. En effet, la progression continue de L. lilii dans certaines régions suggère une dispersion naturelle de l’espèce sur le territoire nord-américain, alors que la progression rapide sur de longues distances semble être causée par le transport anthropique de lis contaminés. / The lily leaf beetle, Lilioceris lilii (Coleoptera : Chrysomelidae), a Eurasian pest of lilies and fritillaries, was first observed in North America in 1943 on the Island of Montréal, Canada. After being confined to Montréal for approximately 25 years, the beetle quickly progressed in North America, and is currently present in eight Canadian provinces and eight American states. During this study, we have investigated the routes of invasion followed by L. lilii in North America, using AFLP markers. We sampled and analysed 516 individuals from 34 sites across North America and Europe. Our first objective was to characterize the genetic structure of North American L. lilii populations to determine if they originated from a single or form multiple introductions from Europe. The second objective was to identify the geographical origin of the invasive population(s). Finally, the third objective was to trace back the geographical routes of invasion of L. lilii in North America, using information from both the dates of first observations and the genetic structure of sampled populations. Our results showed clear genetic difference between individuals from Canada and the USA, suggesting at least two different sources of introductions of L. lilii in North America. A first episode of introduction took place in Montréal, Canada in the 1940’s while a second introduction occurred in Cambridge, Massachusetts, around 1990. Also, both North American populations seem to originate from different populations in northern Europe, which support the hypothesis of two distinct sources of introduction. Each population next progressed in its respective country following a stratified dispersal. Indeed, continuous progression of the beetle in some regions of North America suggests a pattern of natural dispersion, while human-mediated carrying of infected lilies seemed to be responsible for the long-range movement of the beetle.
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Une invasion dans la discrétion : répartition, origines et expansion des limaces européennes du complexe d'Arion subfuscus s.l. au Québec

L'Heureux, Érik 09 1900 (has links)
Une identification précise des espèces exotiques est essentielle afin de déterminer la nature et l’ampleur des impacts que ces espèces auront sur leurs nouveaux habitats. Le complexe d’Arion subfuscus s. l., originaire d’Europe, fait partie des limaces les plus abondantes dans le nord-est de l’Amérique du Nord et plusieurs impacts dus à leur présence ont été rapportés. Cependant, l’identité des espèces introduites demeure inconnue dans la plupart des régions. L’objectif de ce projet est donc de déterminer la répartition récente, la diversité taxonomique et l’origine des membres du complexe d’A. subfuscus s. l. au Québec en se basant sur leur identité mitochondriale (16S rDNA). Un total de 526 spécimens provenant de 68 sites à travers le Québec et un site en Nouvelle-Écosse ont été analysés à l’aide de la technique des SSCP et leurs séquences ont été déterminées. Huit haplotypes de deux espèces allopatriques, A fuscus et A. subfuscus s. s. (lignées S1 et S2) ont été détectés. Les résultats confirment que des limaces provenant de régions distinctes d’Europe ont été introduites à de multiples reprises. Une comparaison avec des données historiques de répartition a révélé une expansion fulgurante de la répartition depuis les 50 dernières années. Arion fuscus est la principale espèce envahissante qui a été détectée dans toutes les régions échantillonnées, ce qui contraste avec les études antérieures réalisées ailleurs en Amérique du Nord. Le rôle potentiel des échanges commerciaux internationaux dans l’histoire d’introduction des espèces exotiques est discuté. / Accurate identification of exotic species is required to assess the magnitude and nature of consequences on their new habitats. The Arion subfuscus s. l. species complex comprised slugs of European origins that are amongst the most abundant slug species in northeastern North America and various impacts of their presence are reported. However, the identities of the species introduced remain unknown in most regions. This study aims at determining the current distribution, taxonomic identity and the origins of the members of the A. subfuscus s. l. complex in Quebec (Canada) based on mitochondrial 16S rDNA. A total of 526 specimens from 68 locations throughout Quebec and one site in Nova Scotia were SSCP analysed and their sequences were determined. Eight haplotypes of the allopatric A. fuscus and A. subfuscus s. s. (lineages S1 and S2) were detected. Results confirmed that slugs from distinct European regions were introduced multiple times. Comparison with previous survey revealed an impressive expansion of the distribution during the last 50 years. Arion fuscus is the major invasive species found throughout Quebec, contrasting with previous North American studies. The potential role of international trade in the introduction history of exotic species is discussed.
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Adolf Hitler's Decision to Invade the Soviet Union

Fraley, James R. 12 1900 (has links)
This study makes use not only of German documents captured during the Second World War but of personal accounts of major figures of the Third Reich and their testimony at the Nuremberg Trials. Organized into five chapters, this study surveys Nazi- Soviet relations from 1939 to 1941, from the German viewpoint, with emphasis on Adolf Hitler's assessment of Russian policies and Germany's wartime situation, both of which factors shaped his decision to invade the USSR. The conclusion is that Hitler saw his attack on the Soviet Union as a preventive war, carried out to destroy a growing threat to the Reich. He interpreted Russian activities during the period 1939-1941 as designed to strengthen the USSR strategically against Germany in preparation for intervention in the ongoing conflict with Britain.
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Rôles de la protéine tyrosine phosphatase DEP-1 dans l'angiogenèse, la perméabilité vasculaire et la progression tumorale

Fournier, Patrick 09 1900 (has links)
L’angiogenèse et l’augmentation de la perméabilité vasculaire sont des éléments clés pour la croissance et la progression tumorale. Par conséquent, de nombreux efforts sont déployés à comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans la formation et le remodelage des vaisseaux sanguins de manière à identifier de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles. De cette optique, les travaux de cette thèse se sont concentrés sur la protéine tyrosine phosphatase DEP-1, initialement identifiée comme un régulateur négatif de la prolifération et de la phosphorylation du VEGFR2 lorsque fortement exprimée dans les cellules endothéliales. Toutefois, en utilisant une approche d’ARNi, il a été démontré que via sa capacité à déphosphoryler la tyrosine inhibitrice de Src (Y529), DEP-1 était également un régulateur positif de l’activation de Src dans les cellules endothéliales stimulées au VEGF. Puisque Src joue un rôle central dans la promotion de l’angiogenèse et la perméabilité vasculaire, nous avons en plus démontré que DEP-1 était un promoteur de ces fonctions in vitro et que la tyrosine phosphorylation de sa queue C-terminale, permettant l’interaction et l’activation de Src, était requise. Les travaux de recherche présentés dans cette thèse démontrent dans un premier temps à partir d’une souris Dep1 KO, dont le développement ne présente aucun phénotype apparent, que la perte de l’expression de DEP-1 se traduit en une inhibition de l’activation de Src et de l’un de ses substrats, la VE-Cadherine, en réponse au VEGF chez la souris adulte. Nos résultats démontrent donc, pour la première fois, le rôle primordial de DEP-1 dans l’induction de la perméabilité vasculaire et de la formation de capillaires in vivo. Conséquemment, la croissance tumorale et la formation de métastases aux poumons sont réduites due à une inhibition de leur vascularisation ce qui se traduit par une diminution de la prolifération et une augmentation de l’apoptose des cellules cancéreuses. De façon intéressante, l’expression élevée de DEP-1 dans les vaisseaux sanguins tumoraux de patientes atteintes du cancer du sein corrèle avec une vascularisation accrue de la tumeur. En plus du rôle de DEP-1 dans la réponse angiogénqiue à l’âge adulte, nos travaux ont également démontré le rôle important de DEP-1 lors de la vascularisation de la rétine, un modèle in vivo d’angiogenèse développementale. Dans ce contexte, DEP-1 inhibe la prolifération des cellules endothéliales et limite leur bourgeonnement et la complexification du réseau vasculaire rétinien en permettant l’expression adéquate du Dll4, un régulateur crucial de l’organisation de la vascularisation développementale. Cette expression du Dll4 découlerait de la stabilisation de la β-caténine par l’inactivation de la GSK3β, un régulateur important de la dégradation de la β-caténine, en réponse au VEGF selon la voie de signalisation VEGFR2-Src-PI3K-Akt-GSK3β. Ainsi, ces travaux identifient DEP-1 comme un régulateur important de l’organisation vasculaire rétinienne. Les rôles positifs de DEP-1 dans les cellules endothéliales découlent principalement de sa capacité à lier et activer la kinase Src. En plus de contribuer à la réponse angiogénique, Src est également un oncogène bien caractérisé notamment pour sa contribution au programme invasif des cellules cancéreuses mammaires. Les travaux de cette thèse illustrent que DEP-1 est préférentiellement exprimée dans les cellules cancéreuses mammaires invasives et qu’il régule l’activation de Src, de voies de signalisation invasives et, par le fait même, de l’invasivité de ces cellules in vitro et in vivo. De façon intéressante, ces observations corrèlent avec des données cliniques où l’expression modérée de DEP-1 est associée à un mauvais pronostic de survie et de rechute. Ces résultats démontrent donc, pour la première fois, le rôle positif de DEP-1 dans l’activation de Src au niveau des cellules endothéliales et des cellules cancéreuses mammaires ce qui permet la régulation du bourgeonnement endothélial, de la perméabilité vasculaire, de l’angiogenèse normale et pathologique en plus de l’invasion tumorale. / Angiogenesis and increased vascular permeability are key component of tumor growth and progression. Consequently, numberous efforts are currently deployed to illucidate the molecular mecanisms contributing to the formation and remodelling of blood vessels in oder to identify new potential therapeutic targets. In that thought, the work of this thesis was focused on the protein tyrosine phosphatase DEP-1, initially identified as a negative regulator of proliferation and VEGFR2 phosphorylation when highly expressed in endothelial cells. However, using RNAi, it was shown that through its capacity to dephosphorylate the inhibitory tyrosine of Src (Y529), DEP-1 could also positively regulate Src activation in endothelial cells in response to VEGF. As Src is a central promoter of angiogenesis and vascular permeability, we showed that DEP-1 was a promoter of these vascular functions in vitro and that the tyrosine phosphorylation of its C-terminal tail, allowing interaction and activation of Src, was required. Interestingly, the catalytic inactivation of DEP-1 in mice resulted in increased proliferation in endothelial cells, but also in desorganization of vascular structures which contrast the absence of phenotype in DEP-1 complete knock-out mice (KO). The work of this thesis demonstrates for the first time that DEP-1 deletion causes inhibition of Src and one of its substrate, VE-Cadherin, activation in response to VEGF in Dep-1 KO mice, which develop normally. Our results show the crucial role of DEP-1 in VEGF-induced vascular permeability and capillary formation in vivo. Consequently, tumor growth and lung metastases formation were inhibited due to reduced tumor vascularisation causing reduced proliferation and increased apoptosis of tumor cells. Accordingly, high expression of DEP-1 in tumor-associated blood vessels of breast cancer patients correlates with greater tumor vascularisation. In addition to DEP-1 role in post-natal angiogenic response, our work also demonstrates the important role of DEP-1 during retinal vascularisation, an in vivo developmental angiogenesis model. In this context, DEP-1 inhibits proliferation of endothelial cells and limits their sprouting by allowing adequate β-catenin-dependant expression of Dll4, a Notch ligand regulating developmental vascularisation organisation. DEP-1 allows β-catenin stabilisation via inactivation of GSK3β, an important regulator of β-catenin degradation, in response to VEGF through VEGFR2-Src-PI3K-Akt-GSK3β signaling pathway. Thus, this work identifies DEP-1 as an important regulator of retinal vascular sprouting. The positive roles of DEP-1 in endothelial cells depend on it ability to bind and activate the kinase Src. In addition to its contribution to angiogenic response, Src is also a well-characterized oncogene notably for its contribution to invasive program of mammary cancer cells. This work illustrates that DEP-1 is preferentially expressed in invasive mammary cancer cells and that it regulates Src activation, pro-invasive signaling pathways and, consenquetly, cell invasiveness in vitro and in vivo. All these activities are dependant on DEP-1 catalytic activity and ability to bind Src. Interestingly, these results correlate with clinical data where moderate expression of DEP-1 is associated with poor pornostic of survival and relapse. Collectively, the results presented here demonstrate, for the first time, the crucial role of DEP-1 in Src activation in endothelial and breast cancer cells, leading to endothelial sprouting, vascular permeability, normal or pathological angiogenesis, and breast cancer invasiveness and metastases formation.
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Programová nabídka Československé televize od roku 1968 do jara 1970 / The TV program of the Czechoslovak television from the year 1968 till April of 1970

Pecáková, Andrea January 2016 (has links)
The thesis titled "The TV program of the Czechoslovak television from the year 1968 till April of 1970" deals with the program offer from the period of so-called Prague Spring until the end of April 1970 when the second transmitter circuit was ready to start. I chose this time period because of frequent changes in politics and society, which was reflected in the media content, and thus in the TV content. This time segment is divided into four time periods in which I monitor the program offer of the TV. The first period is the period of Prague Spring, the second one is from September 1969 to April 1970 when Gustáv Husák became the first secretary of the ÚV KSČ, the third one is from May 1969 to August 1970 when Jan Zelenka became the director of Czechoslovak television (he was considered as the first normalization director) and the fourth period is from September 1969 to April 1970, when the second transmitter circuit was ready to start. The main aims of this thesis are detailed description and comparison of TV offers in these four periods. To achieve the objectives a comparative analysis is used. I analyze mostly weekly magazines Československá televize of the years 1968, 1969 and 1970. The information gained from these magazines is accompanied by other written sources, pictorial records programs...
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Hybridation et goulots d'étranglements induits par l'activité humaine : génétique des populations, morphométrie et parasitologie appliquées au tilapia envahi et envahissant Oreochromis mossambicus (Teleostei, Cichlidae) / Human-induced hybridization and population bottleneck : population genetics, morphometrics and parasitology applied to the invaded and invasive tilapia Oreochromis mossambicus (Teleostei, Cichlidae)

Firmat, Cyril 04 November 2011 (has links)
Les invasions biologiques sont reconnues comme un facteur évolutif important sur une échelle de temps courte. Elles affectent notamment la structure génétique des populations, les patrons d’évolution phénotypique et la richesse des faunes de parasites associées aux populations envahissantes. Cette étude se propose de quantifier les conséquences d’une invasion biologique suivant ces trois niveaux (génétique, phénotypique et parasitologique) en prenant pour exemple le cas du tilapia du Mozambique Oreochromis mossambicus. Ce cichlidé africain présente un statut remarquable en biologie de la conservation puisqu’il est à la fois (i) l’une des espèces les plus envahissantes au monde car dispersée à l’échelle globale au cours du XXème siècle et (ii) une espèce « quasi-menacée » (UICN) sur son aire native (partie du sud-est de l’Afrique) du fait de son hybridation massive avec d’autres Oreochromis sp. introduits. La démarche générale employée ici est de décrire l’histoire récente des populations à l’aide de marqueurs nucléaires (AFLP) et des séquences de l’ADN mitochondrial (ADNmt), puis de mettre en relation ces résultats génétiques avec la diversité morphologique et la parasitologie des populations. Deux systèmes différents ont été étudiés : Au sein de l’aire native, l’étude se focalise sur le Limpopo inférieur et le sous-bassin de la Changane (Mozambique). Des patrons d’introgression incluant trois espèces en présence sont détectés, mais les hybrides sont peu fréquents et leur expansion limitée. Ces résultats sont de plutôt bonne augure pour la conservation d’O. mossambicus et ils permettent d’identifier deux zones de conservation prioritaires. L’étude des parasites indique une plus grande diversité parasitaire mais de faibles prévalences dans les sites de moindre valeur en conservation, ce qui pourrait favoriser le succès des espèces introduites et de leurs hybrides. Parmi les territoires envahis, les AFLP et l’ADNmt soutiennent une homogénéité générale et une diversité génétique faible, qui sont interprétées comme le résultat d’un fort goulot d’étranglement précédant l’expansion à l’échelle mondiale. Une structure des populations en lien avec la géographie à large échelle (Nouvelle-Calédonie, Guadeloupe, Jamaïque) est cependant détectée. La variation de la forme du corps est également structurée à large échelle géographique, ce en dépit des fortes variations environnementales enregistrées à l’échelle locale. Cela suggère un effet des contraintes génétiques sur la diversification morphologique contemporaine. L’absence de parasites monogènes sur les populations introduites en Nouvelle-Calédonie peut être mise en relation avec un évènement fondateur, et est proposé comme l’un des facteurs ayant pu favoriser le succès de l’espèce. En conclusion, une faible diversité génétique ne contraint vraisemblablement pas un potentiel envahissant élevé et une diversification rapide chez les tilapias. / Biological invasions are recognized as a significant evolutionary factor over short time scales. In particular, their effect is well recorded on the genetic structure of populations, the patterns of phenotypic evolution and the richness of parasite fauna associated to invasive populations. This study aims at quantifying the consequences of a biological invasion according to these three levels (genetical, phenotypical and parasitological) taking as example the Mozambique tilapia Oreochromis mossambicus. This African cichlid is characterized by an unusual conservation status since it is both (i) ranked among the world’s worst invasive species due to its global dispersion during the 20th century and (ii) sorted as “near-threatened” (IUCN) over its native range (a part of south-east Africa) because of massive hybridization with alien introduced Oreochromis species. The approach used in this study imply to describe the recent history of populations using nuclear (AFLP) and mitochondrial DNA (mtDNA) markers, and then to compare this genetic background to results describing the morphological and parasitological diversity of populations. Two different biological systems were studied: 1) Within the native range, the study focuses on the Lower Limpopo and the Changane sub-drainage (Mozambique). Introgression patterns involving the three co-occurring species were detected, but the frequency of hybrid is low and their geographic expansion is limited. These results provided rather good auspices for the conservation of O. mossambicus, and they allowed to identify two zones of high conservation priorities. The parasitological survey reveals high parasite richness and low prevalences among sites of low conservation values. This last pattern could favour the success of alien introduced species and their hybrids. 2) Among the invasive range of O. mossambicus, both AFLP and mtDNA support a strong genetic homogeneity and a low genetic diversity, a pattern interpreted as resulting from a strong population bottleneck preceding the events of global dispersion. A pattern of population structure related to large scale geography (New Caledonia, Guadeloupe, Jamaica) is nevertheless detected. Body shape variation is also primarily structured at large geographical scale, suggesting a role for genetic constrains on contemporary morphological diversification. The total absence of monogenean parasites in the populations of New Caledonia could result from a founding event and is suggested as a potential factor that could have favoured the O. mossambicus’ success. In conclusion, a low genetic diversity does not likely constraint a strong invasive potential and a rapid phenotypic diversification in tilapias.
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Impacts of global changes on biological invasions and interspecific hybridization within the Tetramorium caespitum ant species complex / Impacts des changements globaux sur les invasions biologiques et l'hybridation interspécifique au sein du complexe d'espèces de fourmis Tetramorium caespitum

Cordonnier, Marion 26 November 2018 (has links)
Changement climatique, urbanisation, invasions biologiques et hybridation interspécifique constituent des menaces majeures pour la biodiversité. L'objectif de cette thèse a été d'évaluer leurs effets interactifs sur les fourmis du genre Tetramorium de la vallée du Rhône, France. Près de 2000 colonies de 5 espèces de Tetramorium ont été étudiées. Les résultats démontrent que le climat et l'urbanisation limitent leurs aires de répartition et que l'urbanisation impacte leurs distributions simultanément à plusieurs échelles spatiales. Les probabilités d'occurrence de T. immigrans dépendent de l'interaction entre facteurs climatiques et urbains. Quatre populations génétiques de T. immigrans résultent de plusieurs introductions de sources externes, ce qui signifie que cette espèce n’est pas indigène dans les zones urbaines du nord. T. immigrans et T. caespitum produisent des hybrides dans les zones de sympatrie. La détection de rétrocroisements et de discordances entre ADN mitochondrial et nucléaire suggère que cette hybridation conduit à une descendance fertile, donc de l’introgression. Les profils d'hydrocarbures cuticulaires sont bien différenciés entre les deux espèces et sont corrélés à une agression forte contre les hétérospécifiques. Ces espèces présentent un système d'accouplement monogyne polyandre, dans lequel les reines hybrides mais pas les pères hybrides contribuent à la descendance hybride. Les études sur l'hybridation interspécifique n'ont qu'occasionnellement concerné les changements globaux ou invasions biologiques. Ces concepts eux-mêmes sont peu étudiés ensemble et leurs effets interactifs sont négligés dans la littérature actuelle. La prise en compte de ces interrelations et l'exploration de plusieurs échelles sont essentielles pour mieux comprendre les processus qui génèrent des modèles d'échange génétique / Climate change, urbanization, biological invasions and interspecific hybridization are major current threats to biodiversity. The objective of this thesis was to assess their interactive effects in Tetramorium ant species from the Rhône-Saône valley in France. Using a broad array of tools from several fields of biology, I worked on almost two thousand colonies from five Tetramorium species including T. immigrans and T. caespitum. Both climate and urbanization limited the ranges of these species, and urbanization impacted their distributions simultaneously at several spatial scales. The occurrence probabilities of T. immigrans depended on the interaction between climatic and urban factors. Several introductions from external sources seemed to have given rise to four genetically distinct populations of T. immigrans, making it likely that it is not native to the northernmost urban areas. Hybridization and introgression between T. immigrans and T. caespitum was frequent in zones of sympatry, and the detection of nuclear DNA backcrosses and mitochondrial-nuclear DNA discordance between the two species suggested that hybridization lead to fertile offspring (i.e. introgression). Cuticular hydrocarbon profiles were clearly differentiated between the two species and were correlated to heightened interspecific aggression against heterospecifics. Both species presented a monogyne polyandrous mating system, in which hybrid queens but no hybrid fathers contributed to hybrid offspring. Few studies on interspecific hybridization have addressed global change or biological invasions. These concepts are infrequently studied together, and their interactive effects are overlooked in the current literature. Taking these interrelationships into account and exploring multiple scales are essential to better understand the processes that generate patterns of genetic exchange

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