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Ecological dynamics of a native and a nonindigenous clam species: implications for conservation and shellfishery management

Bidegain Cancer, Gorka 08 March 2013 (has links)
El objetivo de esta tesis es avanzar en el conocimiento de la dinámica ecológica de la almeja fina nativa de Europa, Ruditapes decussatus, y la almeja japonesa introducida, Ruditapes philippinarum. Se estudian aspectos relevantes de la dinámica ecológica que requerían ser investigados, tales como la expansión de almeja japonesa, la interacción competitiva, la dispersión larvaria y reclutamiento o la estimación de la talla mínima de captura. A la vez se explora la idoneidad de una metodología de muestreo para la evaluación continua de estas poblaciones en estuarios de gran extensión. Para el desarrollo de estos estudios se realizaron muestreos y experimentos de las especies objetivo en el ámbito de estudio y se llevaron a cabo los análisis de laboratorio asociados a los mismos. Además, se desarrollaron y se aplicaron modelos ecológicos predictivos. Los resultados de la tesis proveen información y herramientas para apoyar los modelos de gestión del marisqueo de las especies estudiadas tanto, en general, para los estuarios donde están presentes y son explotadas como, en particular, para la Bahía de Santander. / The objective of the thesis is to advance in the understanding of ecological dynamics of the European native grooved carpet shell clam Ruditapes decussatus and the introduced Manila clam Ruditapes philippinarum. Ecologically relevant aspects requiring investigation, such as the expansion of the Manila clam, competitive interaction, larval dispersal and recruitment or suitable specific catch size have been investigated. Moreover, the suitability of a sampling methodology for the assessment of these clam populations in large estuaries have been evaluated. For this purpose, field surveys, laboratory procedures and field experiments have been conducted, together with the development and application of ecological predictive models. The results of this thesis provide information and tools to support the studied species fishery management models both in general, for the estuaries where these species dwell and exploited and, in particular, for the Bay of Santander.
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Biología de Gambusia holbrooki Girard en sistemas salinos epicontinentales (SE Península Ibérica): aspectos básicos y aplicados a su gestión

Ruiz Navarro, Ana 08 July 2011 (has links)
El Poecílido Gambusia holbrooki, mundialmente introducido en sistemas acuáticos epicontinentales, presenta una alta capacidad invasora y supone una seria amenaza para las comunidades nativas. En la Península Ibérica, destaca su impacto sobre los Ciprinodóntidos nativos, aunque también supone una amenaza para los sistemas salinos, principalmente en regiones áridas. Para contribuir al establecimiento de criterios científicos para el manejo de esta especie, la presente tesis doctoral aporta información básica sobre la estructura y parámetros de la biología de poblaciones habitantes de sistemas salinos del sureste peninsular. Se plantearon tres objetivos generales: (1) Ampliar el conocimiento sobre la biología y ecología de G. holbrooki en sistemas lóticos de carácter salino. (2) Estudiar la interacción trófica entre G. holbrooki y la especie nativa Aphanius iberus en un sistema salino. (3) Realizar y analizar una experiencia de control sostenido sobre una población de G. holbrooki aislada en la cabecera de un arroyo salino. / The Poeciliid Gambusia holbrooki, globally widespread in freshwater aquatic systems, is highly invasive and represents a serious threat to native communities. In the Iberian Peninsula, its impact on the native Cyprinodontids has been emphasized, although it also poses a threat to arid saline systems. To contribute to the establishment of scientific criteria in management plans of its invasive populations, the present PhD thesis aims to provide basic information about population structure and biological traits of G. holbrooki populations inhabiting saline systems in the southeastern Iberian Peninsula, with three general objectives: (1) To increase knowledge of the biology and ecology of G. holbrooki in saline lotic systems. (2) To analyse trophic interaction between G. holbrooki and the native Aphanius iberus in a saline system. (3) To conduct and examine the results of an experience of sustained control of a population of G. holbrooki isolated in the headwaters of a saline stream.
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Comportamento e utilização do habitat em grupos de Callithrix sp. (Primates, Callithrichidae) no Instituto de Pesquisas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro / Behavior and habitat use in groups of Callithrix sp. (Primates, Callithrichidae) at the Research Institute of the Botanical Garden of Rio de Janeiro

Marina Trancoso Zaluar 21 February 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As populações introduzidas de saguis preocupam biólogos e conservacionistas, por causa do seu potencial de ocupação de hábitat, hibridação com congêneres nativos, predação de representantes da fauna local, transmissão de doenças e competição com outras espécies. É necessário entendermos o que favorece essa flexibilidade na utilização do suporte e no padrão comportamental que possibilita que os saguis sobrevivam em ambientes florestais tão diversos e até mesmo em regiões muito alteradas e antropizadas, como as grandes metrópoles. Foram acompanhados indivíduos de Callithrix sp. no arboreto do JBRJ. O trabalho de campo foi feito entre agosto de 2012 e agosto de 2013 e acumulou 205 horas de observações e 400 horas de esforço amostral. O método de amostragem utilizado foi o Animal Focal, no qual apenas um indivíduo do grupo foi analisado por sessão amostral, de 3 minutos com 7 minutos de intervalo. A cada dez minutos, em uma nova sessão amostral, o foco era mudado para outro indivíduo do grupo. Adultos, subadultos e jovens foram observados. Os indivíduos de Callithrix sp. no JBRJ utilizam de forma diferenciada as categorias de utilização de habitat, com maior frequência a estratificação vertical inferior (entre 0 e 4,9m), suportes de diâmetro fino (até aproximadamente 14 cm de diâmetro), superfície média e inclinação horizontal (0 a 30), corroborando a outros estudos realizados que também verificaram estes padrões. Houve diferenças comportamentais dos indivíduos de Callithrix sp. no JBRJ entre as classes de machos e fêmeas adultos, subadultos e jovens. Os indivíduos machos realizaram com maior frequência todos os comportamentos. Resultados que contribuem para o conhecimento aprofundado sobre o comportamento desses primatas, no qual até então não tinham sido feitas comparações diretas entre as classes consideradas. Principalmente o resultado encontrado de que os machos são mais ativos que as demais classes, o que não é mencionado na literatura até o presente e favorece para compreendermos mais sobre essas espécies / Introduced populations of marmosets concern biologists and conservationists because of its potential occupancy of habitat, hybridization with native congeners, predation on representatives of the local fauna, disease transmission and competition with other species. It is necessary to understand which favors this flexible use of habitat and behavioral pattern which enables marmosets to survive in such diverse forest environments and even much altered and disturbed areas, such as large cities. Individuals of Callithrix sp.were followed at the Arboretum JBRJ. The fieldwork was done between August 2012 and August 2013 and accumulated a total of 205 hours of observations and 400 hours of sampling effort. The sampling method used was the " Focal Animal ", in which only one individual in the group was analyzed at a three minutes sampling session with 7 minutes apart. Every ten minutes, in a new sampling session, the animal focus was shifted to another individual in the group. Adults, sub-adults and young were observed. Individuals of Callithrix sp. in JBRJ use the categories of habitat differently, most often the lower vertical stratification (between 0 and 4.9 m), thinner supports (to about 14 cm diameter), with an average surface and a horizontal tilt (0 to 30 ), corroborating other studies that also found these patterns. There were also behavioral differences of individuals of Callithrix sp. in JBRJ between classes of male and female adults, sub-adults and youth. Male individuals used more frequently all behaviors. Results that contribute to the knowledge about the behavior of these primates, which had not been direct comparisons made between the classes considered. Mainly the result found that males are more active than the other classes, which is not mentioned in the literature to date and helps to understand more about these species.
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Desenvolvimento de descritores de imagens para reconhecimento de padrões de plantas invasoras (folhas largas e folhas estreitas)

Santos, Ana Paula de Oliveira 05 June 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2578.pdf: 4936351 bytes, checksum: c3169360ab91e26c8efef7226a907cdf (MD5) Previous issue date: 2009-06-05 / Universidade Federal de Sao Carlos / In Brazil, the development of tools for weeds recognition, capable of aiding risk detection and decision making on the fieldwork is still embryonic. This master s thesis presents the development of a pattern recognition system that recognizes weeds and gives the occupation percentage of wide and narrow leaves in an agricultural production system, with digital image processing techniques. The development was based on considerations about image acquisition, pre-processing, texture based segmentation, descriptors for weeds recognition and occupation percentage of each kind of leaf. The validation has been developed considering geometric patterns generated in laboratory, as well as others obtained of a maize (Zea mays) production agricultural environment, i. e. two species of weeds, one with wide leaves (Euphorbia heterophylla L.) and other with narrow leaves (Digitaria sanguinalis Scop.). The results show recognition of about 84.24 percent for wide leaves and 80.17 percent for narrow leaves in agricultural environment and also the capability to spot weed on unreachable locations by natural vision. Besides, the method presents application in precision agriculture to improve the decision making in pulverization processes. / No Brasil é ainda embrionário o desenvolvimento de ferramentas de reconhecimento de plantas invasoras, capazes de auxiliar a tomada de decisão e indicar o seu risco no sistema de produção. Este trabalho apresenta o desenvolvimento de um sistema de reconhecimento de padrões de plantas invasoras e percentuais de ocupação de folhas largas e folhas estreitas, em sistemas de produção agrícola, utilizando técnicas de processamento digital de imagens. Para o desenvolvimento houve a consideração das etapas de aquisição das imagens, pré-processamento, segmentação baseada em textura, descritores para o reconhecimento das plantas invasoras e percentual de ocupação de cada tipo de planta. A validação foi desenvolvida considerando padrões geométricos gerados em laboratório, bem como o próprio ambiente de produção agrícola de milho (Zea mays), tomando por base duas espécies de plantas invasoras, sendo uma de folha larga (Euphorbia heterophylla L.), e outra de folha estreita (Digitaria sanguinalis Scop.). Resultados indicam uma taxa de acerto no reconhecimento em ambiente de campo da ordem de 84,24% para folhas largas e da ordem de 80,17% para folhas estreitas, além da capacidade de identificar plantas invasoras em locais restritos a visão natural. Adicionalmente, o resultado obtido apresenta potencial para a aplicação no manejo baseado em agricultura de precisão, o que auxilia na tomada de decisão em pulverização agrícola.
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Comportamento e utilização do habitat em grupos de Callithrix sp. (Primates, Callithrichidae) no Instituto de Pesquisas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro / Behavior and habitat use in groups of Callithrix sp. (Primates, Callithrichidae) at the Research Institute of the Botanical Garden of Rio de Janeiro

Marina Trancoso Zaluar 21 February 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As populações introduzidas de saguis preocupam biólogos e conservacionistas, por causa do seu potencial de ocupação de hábitat, hibridação com congêneres nativos, predação de representantes da fauna local, transmissão de doenças e competição com outras espécies. É necessário entendermos o que favorece essa flexibilidade na utilização do suporte e no padrão comportamental que possibilita que os saguis sobrevivam em ambientes florestais tão diversos e até mesmo em regiões muito alteradas e antropizadas, como as grandes metrópoles. Foram acompanhados indivíduos de Callithrix sp. no arboreto do JBRJ. O trabalho de campo foi feito entre agosto de 2012 e agosto de 2013 e acumulou 205 horas de observações e 400 horas de esforço amostral. O método de amostragem utilizado foi o Animal Focal, no qual apenas um indivíduo do grupo foi analisado por sessão amostral, de 3 minutos com 7 minutos de intervalo. A cada dez minutos, em uma nova sessão amostral, o foco era mudado para outro indivíduo do grupo. Adultos, subadultos e jovens foram observados. Os indivíduos de Callithrix sp. no JBRJ utilizam de forma diferenciada as categorias de utilização de habitat, com maior frequência a estratificação vertical inferior (entre 0 e 4,9m), suportes de diâmetro fino (até aproximadamente 14 cm de diâmetro), superfície média e inclinação horizontal (0 a 30), corroborando a outros estudos realizados que também verificaram estes padrões. Houve diferenças comportamentais dos indivíduos de Callithrix sp. no JBRJ entre as classes de machos e fêmeas adultos, subadultos e jovens. Os indivíduos machos realizaram com maior frequência todos os comportamentos. Resultados que contribuem para o conhecimento aprofundado sobre o comportamento desses primatas, no qual até então não tinham sido feitas comparações diretas entre as classes consideradas. Principalmente o resultado encontrado de que os machos são mais ativos que as demais classes, o que não é mencionado na literatura até o presente e favorece para compreendermos mais sobre essas espécies / Introduced populations of marmosets concern biologists and conservationists because of its potential occupancy of habitat, hybridization with native congeners, predation on representatives of the local fauna, disease transmission and competition with other species. It is necessary to understand which favors this flexible use of habitat and behavioral pattern which enables marmosets to survive in such diverse forest environments and even much altered and disturbed areas, such as large cities. Individuals of Callithrix sp.were followed at the Arboretum JBRJ. The fieldwork was done between August 2012 and August 2013 and accumulated a total of 205 hours of observations and 400 hours of sampling effort. The sampling method used was the " Focal Animal ", in which only one individual in the group was analyzed at a three minutes sampling session with 7 minutes apart. Every ten minutes, in a new sampling session, the animal focus was shifted to another individual in the group. Adults, sub-adults and young were observed. Individuals of Callithrix sp. in JBRJ use the categories of habitat differently, most often the lower vertical stratification (between 0 and 4.9 m), thinner supports (to about 14 cm diameter), with an average surface and a horizontal tilt (0 to 30 ), corroborating other studies that also found these patterns. There were also behavioral differences of individuals of Callithrix sp. in JBRJ between classes of male and female adults, sub-adults and youth. Male individuals used more frequently all behaviors. Results that contribute to the knowledge about the behavior of these primates, which had not been direct comparisons made between the classes considered. Mainly the result found that males are more active than the other classes, which is not mentioned in the literature to date and helps to understand more about these species.
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Expressão de pequenos proteoglicanos ricos em leucina: decorim e biglicam, em placentas humanas a termo normais e com alterações da invasividade trofoblástica. / Expression of small leucine-rich proteoglycans: decorin and biglycan, in human normal term placenta and with invasiveness-changed trophoblast pathologies.

Alexandre Urban Borbely 10 September 2009 (has links)
O decorim e o biglicam são membros da família dos pequenos proteoglicanos ricos em leucina e possuem importantes funções no controle da proliferação, migração e invasão do citotrofoblasto extraviloso (TEV). O objetivo deste trabalho foi de caracterizar a expressão diferencial e a imunolocalização de decorim e biglicam em placentas humanas normais a termo (PNT), na placenta acreta (PA), na mola invasora (MI) e no coriocarcinoma (CO). Na PNT, as células deciduais apresentaram positividade para o decorim, enquanto o TEV foi negativo. O decorim foi fracamente expresso na matriz endometrial, mas negativo no fibrinoide do tipo matriz, enquanto foi positivo para biglicam. Na PA e na MI, o TEV mostrou positividade para decorim e biglicam. No CO, somente o citotrofoblasto foi positivo para ambos proteoglicanos. Portanto, o decorim e o biglicam são expressos diferencialmente em placentas normais e patológicas, sugerindo que os padrões de expressão desses proteoglicanos nas patologias estudadas indicam um papel na modulação da migração e da invasão do trofoblasto. / Decorin and biglycan are family members of the small leucine-rich proteoglycans family, and they have many functions as controlling proliferation, migration and invasion of extravillous trophoblast cells (EVT). The aim of this study was to characterize decorin and biglycan differential expression and immunolocalization in human normal term placenta (NTP), in placenta accreta (PA), in invasive mole (IM), and in choriocarcinoma (CH) samples. In PNT, deciduas cells were positive to decorin whereas EVT was negative. Decorin was faintly stained at endometrial matrix, but negative at matrix-type fibrinoid, although it was positive for biglycan. In PA and IM, the EVT was positive for decorin and biglycan. In CH, only cytotrophoblast cells were positive for both proteoglycans. Therefore, decorin and biglycan are differentially expressed in normal placenta and in placenta pathologies, suggesting that the expression patterns of the proteoglycans in studied pathologies indicate a role in modulating trophoblast migration and invasion.
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Flora alòctona de les Illes Balears. Ecología de dos especies invasoras: Carpobrotus edules y Carpobrotus aff. acinaciformis

Moragues Botey, Eva 24 March 2006 (has links)
La llegada de plantas exóticas fuera de su rango de distribución original y su posterior asentamiento en ecosistemas naturales no es una excepción en las Islas Baleares. En la actualidad tenemos 308 especies no nativas naturalizadas y subespontáneas que representan el 16% del total de la flora Balear. En esta tesis se ha evaluado el estado de la cuestión a nivel global y local. Se ha confeccionado el primer catálogo de flora introducida y se ha analizado cuales de ellas son más abundantes y peligrosas; así como también qué ecosistemas son más vulnerables a la introducción de éstas. También se ha profundizado en el conocimiento de dos de las especies exóticas más peligrosas en el litoral Balear: Carpobrotus edulis y C. affine acinaciformis. Se ha evaluado su influencia sobre la polinización, su tasa de crecimiento bajo diferentes escenarios ambientales, se ha confeccionado un modelo de crecimiento y se ha evaluado su impacto sobre la composición y estructura de las comunidades nativas. / L'arribada de plantes exòtiques fora del seu rang de distribució original i el seu posterior assentament a ecosistemes naturals no és una excepció a les Illes Balears. A l'actualitat tenim 308 espècies no natives naturalitzades i subespontànies que representen el 16% del total de la flora Balear. En aquesta tesi s'ha avaluat l'estat de la qüestió a nivell global i local. S'ha confeccionat el primer catàleg de flora introduïda i s'han analitzat quines d'elles són més abundants i perilloses; així com també quins ecosistemes són més vulnerables a la introducció d'aquestes. També s'ha profunditzat en el coneixement de dues de les espècies exòtiques més perilloses del litoral Balear: Carpobrotus edulis y C. affine acinaciformis. S'ha avaluat la seva influència damunt els vectors de pol·linització, la taxa de creixement a diferents escenaris ambiental, s'ha confeccionat un model de creixement, i s'ha avaluat el seu impacte damunt la composició i estructura de les comunitats natives. / The constant arrival of exotic plants into areas outside their original distribution range and further settlement in natural ecosystems is not an exception in the Spanish Balearic archipelago. At the moment we have 308 non native species (naturalized and casual), the 16% from the total Balearic flora. This thesis has evaluated the exotic plant problematic at global and local level. We have elaborated the first exotic plants list, its distribution and abundance, as well as its degree of impact on the more vulnerable environments. We went deeply into the knowledge of two very invasive plants along the coast of the Balearic islands: Carpobrotus edulis y C. affine acinaciformis. We have evaluated its influence over pollen transmission, its growth rate at different environmental conditions, we have too elaborated a non liner growth model and its impact on composition and structure in natural communities

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