Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-27T16:38:17Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1862693 bytes, checksum: 55859873780bd6411394ca24d7cc0f14 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-27T16:38:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1862693 bytes, checksum: 55859873780bd6411394ca24d7cc0f14 (MD5) Previous issue date: 2005-02-21 / O objetivo deste trabalho foi definir as rotas tecnológicas para o desenvolvimento de processos de produção de probióticos contendo células de Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20, bem como o de analisar a viabilidade técnica dos processos identificados, considerando a otimização do conjunto das etapas de cada processo. A produção de concentrado de células de L. delbrueckii UFV H2b20, a ser usado em todos os produtos, foi estabelecida em soro de queijo Minas Frescal esterilizado por calor. As condições ótimas para a esterilização foram determinadas. O rendimento em células foi da ordem de 10 9 UFC/mL. Os probióticos produzidos foram leite fermentado com L. delbrueckii UFV H2b20, leite em pó e sorvete contendo células viáveis dessa bactéria; foram produzidos também leite UHT, leite pasteurizado e leite em pó contendo células inativadas pelo calor. O leite fermentado apresentou valores de pH entre 4,0 a 4,5 e aproximadamente 10 8 UFC/g, e, estocado a 5oC, manteve-se nestas condições por até 30 dias; após 45 dias, a contagem foi de 10 7 UFC/g, valor ainda em conformidade com o estabelecido pela Resolução 47/97 de GMC para probióticos. O sorvete apresentou contagem na ordem de 10 8 UFC/g até 45 dias a -20oC. Após 60 dias nessa temperatura, houve redução para 10 7 UFC/g, contagem estável até 90 dias. O leite em pó probiótico foi produzido com células pré-tratadas para melhor sobrevivência ao processo em spray dryer, rendendo 10 8 UFC/g de L. delbrueckii UFV H2b20. Este número reduziu- se 10 7 UFC/g em 90 dias de estocagem a -20oC e a 10 6 e 10 5 à temperatura ambiente após 60 e 90 dias, respectivamente. A adição de células inativadas no leite pasteurizado não causou alterações no pH e na acidez do produto. No leite contendo células inativadas, houve desenvolvimento de proteólise e a conseqüente coagulação das proteínas após 30 dias de estocagem do produto, tornando seu processo inviável. As rotas tecnológicas definidas, o estudo de viabilidade técnica e a análise dos processos levaram a conclusões que recomendam a submissão de pedido de patente em função de três pontos demonstrados como inovações em processos. / The objective of this work was to define the technological routes for development of processes of production of probiotics which have cells of Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20, as well as to analyze the viability technique of the identified processes, considering the optimization set of stages of each process. The production of concentrated cells of L. delbrueckii UFV H2b20, to be used in all the products, was established in cheese whey Minas Frescal sterilized by heat. The excellent conditions for the sterilization had been determined. The income of cells was in order of 10 9 UFC/mL. The produced probiotics had been fermented milk with L. delbrueckii UFV H2b20, powdered milk and ice cream having viable cells of this bacterium. There have also been produced UHT milk, pasteurized milk and powdered milk with inactivated cells by heat. Fermented milk presented values of pH between 4,0 to 4,5 and approximately 10 8 UFC/g, and, stored at 5oC, was remained in these conditions for up to 30 days; after 45 days, the counting was of 10 7 UFC/g, value still in compliance with the established Resolution 47/97 of GMC for probiotics. The ice cream presented counting in order of 10 8 UFC/g up to 45 days at -20oC. After 60 days in this temperature, it had been reduced to 10 7 UFC/g, steady counting up to 90 days. The probiotic powdered Milk was produced with cells pre-treated for better survival to the process in spray dryer, generating 10 8 UFC/g de L. delbrueckii UFV H2b20. This number was reduced to 10 7 UFC/g in 90 days of storage at -20oC and 10 6 and 10 5 at environment temperature after 60 and 90 days, respectively. The addition of inactivated cells in pasteurized milk did not cause modifications in pH and acidity of the product. Proteolyse have developed in milk with inactivated cells and a consequent coagulation of proteins after 30 days of storage of the product, becoming this process impracticable. The defined technological routes, the viability study techniques and the process analysis had taken the conclusions which advise a patent order in three points functions showed as innovations in processes. / Dissertação antiga

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-28T10:52:56Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 763129 bytes, checksum: 3ac0dfda7a6d9889b2b5e8a638958d85 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-28T10:52:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 763129 bytes, checksum: 3ac0dfda7a6d9889b2b5e8a638958d85 (MD5) Previous issue date: 2009-06-02 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / No Brasil, os derivados do petróleo, como óleo diesel e gasolina, possuem grande importância econômica, sendo produzidos e distribuídos em larga escala. Vazamentos acidentais desses combustíveis de tanques de armazenamento subterrâneos são causa comum de contaminação do solo e de águas subterrâneas no país. Nesse tipo de acidente, a remediação do solo é muito importante, uma vez que previne a contaminação do lençol freático. Neste trabalho, foram desenvolvidos inoculantes microbianos para a biorremediação de solo contaminado com óleo diesel ou gasolina comercial. Para isso, composto de resíduos sólidos urbanos foi enriquecido em populações microbianas com potencial de degradação de hidrocarbonetos, por meio de adições freqüentes de óleo diesel ou gasolina. Durante esse processo, verificou-se que as populações de bactérias cultiváveis se adaptaram mais rapidamente ao óleo diesel, havendo inicialmente efeito tóxico da gasolina sobre as mesmas. A adição de gasolina ao composto promoveu alterações no perfil de ácidos graxos da comunidade microbiana, sendo observado aumento dos ácidos graxos marcadores de bactérias gram-positivas e diminuição dos marcadores de gram-negativas e de actinomicetos. A aplicação dos inoculantes microbianos ao solo contaminado com gasolina aumentou a degradação desse contaminante, fato atribuído ao estabelecimento de populações microbianas mais resistentes aos efeitos tóxicos dos hidrocarbonetos leves contidos nesse combustível. No solo contaminado com óleo diesel, o efeito da aplicação dos inoculantes foi menos expressivo, em virtude da elevada eficiência de degradação dos microrganismos autóctones do solo. A temperatura de refrigeração foi a mais adequada para o armazenamento dos inoculantes. Nessa condição, houve maior viabilidade das populações bacterianas cultiváveis dos inoculantes e maior eficiência de degradação de hidrocarbonetos no solo. O método desenvolvido neste estudo mostrou-se simples e eficiente para a produção de inoculantes aplicáveis à biorremediação de solos contaminados com hidrocarbonetos. / In Brazil, the petroleum derivatives, such as diesel and gasoline, have great economic importance, being produced and distributed on a large scale. Accidental leakages of these fuels from underground storage tanks are a common cause of contamination of soil and groundwater. The prompt remediation of soils contaminated with diesel or gasoline is very important, in order to prevent the contamination of groundwater. In this work, microbial inoculants for bioremediation of soil contaminated with diesel or gasoline were developed. For this, compost of municipal solid waste was enriched in microbial populations with hydrocarbon-degrading potential, by frequent additions of diesel or gasoline. Populations of culturable bacteria adapted rapidly to the hydrocarbons present in diesel. On the other hand, hydrocarbons in gasoline caused a transient toxic effect on these populations. The addition of gasoline to the compost caused changes in the fatty acid profile of the microbial community; an increase of fatty acid markers of gram-positive bacteria and the reduction of gram-negative and actinomycetes fatty acids were observed. The application of microbial inoculants to soil contaminated with gasoline increased the degradation of this contaminant. This is due to the establishment of microbial populations more resistant to the toxic effects of soft hydrocarbons which are into this fuel. In the soil contaminated with diesel, the effect of inoculants was less significant, due to the high efficiency of degradation of indigenous soil microorganisms. The temperature of refrigeration was the most suitable for the storage of inoculants. Under this condition, higher counts of cultivable bacterial populations and increased efficiency of degradation of hydrocarbons in soil were obtained. The method developed in this study proved to be simple and efficient for the production of microbial inoculants used for the bioremediation of hydrocarbons-contaminated soils. / Dissertação antiga

MONTEIRO, Denise Terezinha Lippmann. Comparação da qualidade bacteriológica da água marinha e da areia seca e molhada de duas praias do litoral leste do Ceará. 2013. 71f. Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Instituto de Ciências do Mar, Fortaleza-CE, 2013 . / Submitted by Solange Gomes (solagom@yahoo.com.br) on 2013-11-01T19:12:18Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_dtlmonteiro-1.pdf: 1014462 bytes, checksum: 91b77c85111b5d4ccd845f2fd279d4da (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2013-11-07T15:50:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_dtlmonteiro-1.pdf: 1014462 bytes, checksum: 91b77c85111b5d4ccd845f2fd279d4da (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-07T15:50:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_dtlmonteiro-1.pdf: 1014462 bytes, checksum: 91b77c85111b5d4ccd845f2fd279d4da (MD5) Previous issue date: 2013 / A qualidade microbiológica das águas e areias das praias, principalmente das localizadas em áreas de grande desenvolvimento econômico social e turístico, caso de Aquiraz, deveria ser uma preocupação constante dos órgãos públicos, uma vez que muitas doenças são veiculadas por esses microcosmos, sobretudo às pessoas com deficiência no sistema imunológico, caso dos idosos e crianças. No período de Fevereiro a Maio/2012, semanalmente, foi realizado o monitoramento das águas e das areias (seca e molhada) das praias do Iguape e do Presídio, ambas em Aquiraz, Ceará. Os objetivos da pesquisa foram comparar quantitativamente a microbiota bacteriana presente nas águas do mar e na areia dessas duas praias. Foram avaliados para a água e areia: o NMP de Coliformes Termotolerantes (CT), de Escherichia coli (E.coli), de Enterococcus spp. (ENT) e a contagem de leveduras (somente no sedimento). A técnica usada para estimar a população de CT, E.coli e Enterococcus spp., tanto nas águas como nas areias (seca e molhada) foi a dos tubos múltiplos e o método de Contagem Padrão em Placas (CPP) utilizado para estimar a população das leveduras. Os resultados obtidos para as amostras de água do mar foram comparados com a Resolução do Conselho Nacional do Meio Ambiente nº 274/2000. Os dados obtidos para areia seca e molhada foram comparados à Legislação de Portugal devido à ausência de legislação no Brasil. De acordo com os resultados obtidos, a água da praia do Iguape apresentou uma situação de risco maior do que a praia do Presídio. As areias secas e molhadas apresentaram uma maior contaminação na praia do Iguape. As amostras de areia seca do Iguape e do Presídio apresentaram uma contaminação superior às de areia molhada. Foi observada uma maior contaminação de levedura na praia do Iguape. A areia seca do Iguape está mais contaminada com Enterococcus e leveduras do que a areia seca da Praia do Presidio. Recomenda-se uma ação eficaz de monitoramento pelas autoridades sanitárias no sentido de eliminar as fontes de contaminação por bactérias patogênicas ao homem.

Made available in DSpace on 2012-05-07T15:02:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 000001.pdf: 738482 bytes, checksum: 667de0856e030e189a750c7b2df0e974 (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / O gênero Enterococcus inclui aproximadamente 30 espécies, algumas das quais muito freqüentemente envolvidas com alimentos e ambientes relacionados, e cuja diferenciação com identificação precisa torna-se muitas vezes problemático, quando estas questões baseiam-se apenas em características fenotípicas que, mesmo assim, permitem separar estes microrganismos em cinco grupos fisiologicamente diferentes. A dificuldade para categorizar inequivocamente as espécies dos enterococos com base somente nas características bioquímicas pode estar relacionado com uma heterogeneidade bastante alta dos aspectos fenotípicos, independentemente da origem dos isolados, devendo ainda ser considerado o fato de haver bastante similaridade das exigências nutricionais entre os enterococos e outras bactérias ácido lácticas. Por estas razões as técnicas moleculares tornaram-se um importante instrumento para caracterização destes microrganismos. Dentre estas, aquelas que se baseiam no uso do 16S rRNA como molécula alvo têm sido consideradas como excelentes opções com propósitos de identificação. A técnica PCR/RFLP fundamenta-se em uma metodologia baseada na amplificação por PCR e nos perfis de restrição obtidos após o uso de enzimas selecionadas com base na sua habilidade de revelar polimorfismo nos fragmentos de DNA ou RNA analisados. Este trabalho tem como objetivo implantar a técnica da PCR/RFLP com as enzimas DdeI, HaeIII e HinfI associada a alguns testes bioquímicos para uma identificação de Enterococcus spp. isolados de amostras de queijo Minas tipo frescal. / The genus Enterococcus includes about 30 species, some of them very often involved with food and related environments, and whose differentiation with precise identification often becomes problematic when based only on phenotypic characteristics. Anyway this techniques allow to separate these microorganisms in five groups physiologically different. Enterococci are often difficult to clearly categorize in species based only on these phenotypic characteristics. In addition to having a very high diversity of phenotypic aspects, regardless of the origin of the isolates, it must to be considered that there are enough similarities between the nutritional requirements of enterococci and other lactic acid bacteria. For these reasons the molecular techniques have become important tools for characterizing these microorganisms. Among these, those that are based on the use of 16S rRNA as a target molecule have been considered as excellent options for any identification. PCR/RFLP is a method based on the PCR amplification and on the restriction profiles obtained by using restriction enzymes selected based on their ability to reveal polymorphism in fragments of DNA or RNA analysed. This work aims to introduce the technique of PCR/RFLP with the enzymes DdeI, HaeIII and HinfI associated with certain biochemical tests for identification of Enterococcus spp. isolated from samples of fresh Minas cheese. Twenty-one reference strains of the genus Enterococcus were used to establish the restriction profiles. Fifty-four isolates from milk and chicken that had phenotypic profiles typical, atypical and without some identification, stocked in our laboratory, were used to test the technique developed, and 21 isolates from the fresh Minas cheese were used to confirm the usefulness of the technique. By using the PCR/RFLP we obtained 5 different restriction profiles and, when associated with some biochemical tests, it was possible to obtain a rapid and accurate identification of most species of Enterococcus.

Made available in DSpace on 2015-02-20T12:56:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 65.pdf: 798759 bytes, checksum: 0340b33fb91b688bb55db1893f628f46 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / No Brasil é restrita a oferta de ensaios de proficiência (EP) na área de microbiologia de alimentos. Além disso, os altos custos diminuem a participação regular de laboratórios públicos e privados nesses ensaios. É de grande importância o incentivo da participação de laboratórios brasileiros em EP. Os materiais de referência (MR)utilizados para essa proposta devem apresentar características de homogeneidade e estabilidade que assegurem a distribuição de unidades com propriedades semelhantes, próximas a um valor padrão. A produção de MR destinados a ensaios microbiológicos é dificultada pela instabilidade natural dos microrganismos. O presente estudo avaliou a técnica de liofilização no preparo de MR para EP nos ensaios de detecção de Salmonella sp. e enumeração de B. cereus em leite. Foram preparados lotes de materiais contendo apenas um microrganismo e lotes mistos contendo Salmonella sp. e B. cereus em uma mesma matriz. Foram determinadas as concentrações de inóculo utilizadas no preparo dos diferentes lotes de MR e padronizados os procedimentos de contaminação da matriz. Para monitorar a qualidade dos materiais produzidos foram estabelecidos ensaios de controle, dentre eles o teste da homogeneidade e da estabilidade em longo e curto prazo. A técnica de liofilização se mostrou adequada como processo de dessecação para os MR produzidos. Os microrganismos se mantiveram estáveis à temperatura de estoque de -20ºC, no entanto, apresentaram perdas de viabilidade, quando estocados a temperaturas de 25ºC e 35ºC. Das bactérias estudadas B. cereus apresentou, em média, maior resistência às condições de dessecação. A padronização da técnica de produção desses MR propiciará a geração de materiais na área de microbiologia de alimentos, que poderão ser utilizados em futuros EP, com custos de participação mais acessíveis aos laboratórios nacionais. / No Brasil é restrita a oferta de ensaios de proficiência (EP) na área de microbiologiade alimentos. Além disso, os altos custos diminuem a participação regular delaboratórios públicos e privados nesses ensaios. É de grande importância o incentivoda participação de laboratórios brasileiros em EP. Os materiais de referência (MR)utilizados para essa proposta devem apresentar características de homogeneidade eestabilidade que assegurem a distribuição de unidades com propriedadessemelhantes, próximas a um valor padrão. A produção de MR destinados a ensaiosmicrobiológicos é dificultada pela instabilidade natural dos microrganismos. Opresente estudo avaliou a técnica de liofilização no preparo de MR para EP nosensaios de “detecção de Salmonella sp.” e “enumeração de B. cereus” em leite.Foram preparados lotes de materiais contendo apenas um microrganismo e lotesmistos contendo Salmonella sp. e B. cereus em uma mesma matriz. Foramdeterminadas as concentrações de inóculo utilizadas no preparo dos diferentes lotesde MR e padronizados os procedimentos de contaminação da matriz. Para monitorara qualidade dos materiais produzidos foram estabelecidos ensaios de controle, dentreeles o teste da homogeneidade e da estabilidade em longo e curto prazo. A técnica deliofilização se mostrou adequada como processo de dessecação para os MRproduzidos. Os microrganismos se mantiveram estáveis à temperatura de estoque de-20ºC, no entanto, apresentaram perdas de viabilidade, quando estocados atemperaturas de 25ºC e 35ºC. Das bactérias estudadas B. cereus apresentou, emmédia, maior resistência às condições de dessecação. A padronização da técnica deprodução desses MR propiciará a geração de materiais na área de microbiologia dealimentos, que poderão ser utilizados em futuros EP, com custos de participação maisacessíveis aos laboratórios nacionais.

CARVALHO, F. C. T. de. Influências exôgenas na qualidade bacteriológica da água, solo e camarão (Litopenaeus vannamei), em quatro fazendas de camarão do Estado do Ceará. 2006. 87 f.: Dissertação (mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2006. / Submitted by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2015-04-08T18:16:06Z No. of bitstreams: 1 2012_tese_fctdecarvalho.pdf: 1519340 bytes, checksum: a87e88da8c7a3c5c3ab337f3a4eebbb4 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2015-04-08T18:16:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_tese_fctdecarvalho.pdf: 1519340 bytes, checksum: a87e88da8c7a3c5c3ab337f3a4eebbb4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-08T18:16:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_tese_fctdecarvalho.pdf: 1519340 bytes, checksum: a87e88da8c7a3c5c3ab337f3a4eebbb4 (MD5) Previous issue date: 2012 / Bacteria of fecal origin, such as Escherichia coli and Salmonella, are frequently isolated from freshwater or marine waters, originating economic problems to the cultivation of aquatic organisms for human consumption. Another concerning factor is the growing resistance to antibiotics in the aquatic environment, due to its indiscriminate use for both human and animal prophylaxis. This considered, the following research aims at monitoring the presence of enteric bacteria (E. coli and Salmonella spp.) in areas of two freshwater acclimated shrimp (Litopenaeus vannamei) cultivation farms in Jaguaruana-CE, establishing antimicrobials resistance patterns. Sediment and water samples were gathered from ponds and nearby water streams from each farm. The estimated number of E. coli from both the pond and the main river samples were similar in all sources. Two hundred sixty-five (265) strains suspected of E. coli were isolated, 50 (18.87%) of those suspicions were confirmed by biochemical tests. Among the 186 strains suspected of Salmonella, 30 (16.13%) belong to the genus, with five different serovars: S. ser. Saintpaul, S. ser. Infantis, S. ser. Panama, S. ser. Madelia, S. ser. Braenderup, S. enterica subsp. Houtenae and S. enterica subsp. enterica. Physicochemical parameters (temperature, pH and salinity) did not have any influence on the isolation of E. coli or Salmonella strains. There was no relation between the E. coli MPN and Salmonella isolation among the analyzed samples. Resistance to TET, AMP and OTC was observed in 32% of the E. coli strains, where half of this percentage presented a plasmid-related phenotype. Resistance to TET, OTC, AMP and NIT was observed in 16.67% of the Salmonella strains. Only NIT resistance was considered of plasmid origin. Concerning TET and OTC, the E. coli isolates presented a MIC of 32 µg mL-1 and MBC of >128 µg mL-1; whereas the MIC and MBC for TET, OTC and NIT in the Salmonella strains were 64 µg mL-1 and >12,800 µg mL-1, respectively. According to the analysis of the genotypic profiles from the Salmonella isolates, it was not possible to determine the dispersion pattern of its serovars in the environment. The presence of pefA and invA genes was independent from both the serovar and environmental origin of the isolates. / Bactérias de origem fecal como Escherichia coli e Salmonella são frequentemente isoladas de corpos aquáticos dulcícolas e ou marinhos o que acarreta problemas econômicos para cultivos de organismos aquáticos destinados a alimentação humana, pois estão diretamente relacionados à qualidade dos produtos e à saúde dos consumidores. Outra preocupação é com a crescente resistência destas bactérias a antibióticos no ambiente aquático resultante, principalmente, do uso indiscriminado dessas drogas na profilaxia humana e animal. Considerando o exposto, o objetivo da pesquisa foi monitorar a presença de bactérias entéricas (E. coli e Salmonella spp.) em áreas de cultivo de camarão (Litopenaeus vannamei) aclimatado a água doce em duas fazendas situadas em Jaguaruana-CE, analizando os padrões de resistência a antimicrobianos. De cada fazenda foram coletadas amostras de sedimento e água dos viveiros além do afluente próximo. A estimativa do número de E. coli nas amostras de água e sedimentos dos viveiros e do rio abastecedor foram semelhantes para as duas fazendas. Foram isoladas 265 cepas suspeitas de E. coli sendo confirmadas 50 (18,87%) através de testes bioquímicos. Entre 186 cepas suspeitas de Salmonella, 30 (16,13%) foram confirmadas como pertencentes ao gênero, sendo cinco diferentes sorovares: S. sor. Saintpaul, S. sor. Infantis, S. sor. Panama, S. sor. Madelia, S. sor. Braenderup, S. enterica subsp. houtenae e S. enterica subsp. enterica. Os parâmetros físico-químicos (temperatura, pH e salinidade) não influenciaram no isolamento das cepas de E. coli ou Salmonella. Não houve relação entre o NMP de E. coli e o isolamento de Salmonella entre as amostras analisadas. Foi observada resistência à TET, AMP e OTC em 32% das cepas de E. coli com 50% desses apresentando fenótipo relacionado a plasmídeo. Entre as estirpes de Salmonella, 16,67% se mostraram resistentes à TET, OTC, AMP e NIT. Apenas a resistência à NIT foi estabelecida como de origem plasmidial. Para TET e OTC, os isolados de E. coli apresentaram CIM de 32 µg mL-1 e CBM de >128 µg mL-1. Por outro lado, a CIM e CBM para TET, OTC e NIT nas Salmonella foram de 64 µg mL-1 e >12.800 µg mL-1, respectivamente. Através da análise dos perfis genotípicos dos isolados de Salmonella não foi possível estabelecer padrões de dispersão dos sorovares no ambiente. A presença dos genes pefA e invA que codificam fatores de virulência nas culturas de Salmonella foi independente do sorovar e da origem ambiental dos isolados.

PEIXOTO, J. R. O. Diversidade e padrões de susceptilidade a antimicrobianos em bactérias isoladas de ostras (Crassostrea rhizophorae) e do ambiente aquático. 2012. 161 f. Dissertação (mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2015-04-17T15:48:21Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_jropeixoto.pdf: 1674371 bytes, checksum: 06f9b160dd42155fd8e919e0445c405d (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2015-04-17T15:48:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_jropeixoto.pdf: 1674371 bytes, checksum: 06f9b160dd42155fd8e919e0445c405d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-17T15:48:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_jropeixoto.pdf: 1674371 bytes, checksum: 06f9b160dd42155fd8e919e0445c405d (MD5) Previous issue date: 2012 / The main objective of the following research was to compare the bacterial microbiota present in the soft tissue (ST) and intravalvular liquid (IL) of oysters (Crassostrea hizophorae) and water surroundings from a cultivation structure, as well as from a natural bank, establishing antimicrobial resistance profiles among bacterial isolates. The material was collected at the rio Jaguaribe estuary in Fortim-CE, from October 2010 to March 2011. Temperature, salinity and pH levels from water samples ranged from 27 to 34 °C; 38 to 42, and from 8.13 to 8.42, respectively. Shell sizes, ST weight, IL volume, ST and IL pH ranged from 36.15 to 60.66 mm; 1.24 to 3.30 g; 0.65 to 3.26 mL; 6.11 to 6.64, and from 6.83 to 7.16, respectively. Concerning in-water CHB (culturable heterotrophic bacteria) counting, cultured oysters (CO) and wild oysters (WO) IL and ST, the average values for in colony forming units (CFU) were of 32 x 103 CFU/mL; 57 x 103 CFU/mL; 31.5 x 104 CFU/g; 17 x 103 CFU/mL; 31 x 103 CFU/mL, and 58.7 x 103 CFU/g, respectively. Average values for in-water Vibrio spp. counting, CO and SO of the IL and ST were of 33.7 CFU/mL; 113 CFU/mL; 40.5 x 103 CFU/g; 32.7 CFU/mL; 28.3 CFU/ml and 236 CFU/g, respectively. For environmental parameters, salinity only had influence (r> 0.9 and P = 0.02) on CHB countings in IL and ST collected during the rainy season. No relation was established between the environmental parameters and the culturable vibrios population. From the 118 CHB cultures isolated, 101 strains were identified and distributed in 14 genera. Aeromonas, Vibrio, and Bacillus were the most frequent. From the 68 strains of vibrios identified, the highest incidences were of V. ruber (25.0%) and V coralliilyticus (16.2%). Ampicillins (AMP), cefepime, cefotaxime were the antimicrobials to which isolates presented higher resistance rates (above 60%). Chloramphenicol (CLO) was the only drug 100% related to plasmid resistance among THB strains. Regarding the vibrios, the antibiotics were the following: Chloramphenicol, florfenicol, and gentamicin. The minimum inhibitory concentration ranged from 32 to > 128 µg/ml for penicillin G in Gram-positive THBs; 16 to > 128 µg/ml ampicillin in Gramnegative THBs; 16 to 128 µg/mL ampicillin for Vibrio spp. The results indicated the presence of antimicrobials multidrug-resistant strains and a significant share of mobile elements in these profiles. Besides the well-known microbiological hazards related to fresh clams’ intake, oysters may also play an important role as a resistance spreading site to several antimicrobial with potential use on both human and veterinary medicine. / Objetivou-se comparar a microbiota bacteriana presente no tecido mole (TM) e líquido intervalvar (LI) de ostras (Crassostrea rhizophorae) e das águas do entorno de uma estrutura de cultivo e de um banco natural estabelecendo os perfis de resistência a antimicrobianos entre os isolados bacterianos. O material foi coletado no estuário do rio Jaguaribe, Fortim-CE, de outubro de 2010 a março de 2011. A temperatura, salinidade e pH das amostras de água variaram de 27 a 34 ºC, 38 a 42, 8,13 a 8,42, respectivamente. Os tamanhos das conchas, peso do TM, volume do LI, pH do TM e LI variaram de 36,15 a 60,66 mm, 1,24 a 3,30 g, 0,65 a 3,26 mL, 6,11 a 6,64 e de 6,83 a 7,16, respetivamente. Nas contagens das BHC (bactérias heterotróficas cultiváveis) na água, LI e TM das ostras cultivadas (OC) e das ostras selvagens (OS), foram obtidos valores médios em unidades formadoras de colônias (UFC) de 32 x 103 UFC/mL, 57 x 103 UFC/mL, 31,5 x 104 UFC/g, 17 x 103 UFC/mL, 31 x 103 UFC/mL e 58,7 x 103 UFC/g, respectivamente. Nas contagens de Vibrio spp. na água, LI e TM das OC e das OS, os valores médios foram de 33,7 UFC/mL, 113 UFC/mL, 40,5 x 103 UFC/g, 32,7 UFC/mL, 28,3 UFC/mL e 236 UFC/g, respectivamente. Dentre os parâmetros ambientais, apenas a salinidade apresentou influência (r > 0,9 e P = 0,02) sobre as contagens das BHC presentes nos LI das OC coletadas durante a estação chuvosa. Para a população cultivável de víbrios, nenhuma correlação foi estabelecida com os parâmetros ambientais. Das 118 culturas de BHC isoladas, 101 cepas foram identificadas e se distribuíram em 14 gêneros, sendo Aeromonas, Vibrio e Bacillus, os mais frequentes. Das 68 cepas de víbrios identificadas, a maior incidência foi de V. ruber (25,0%) e V. coralliilyticus (16,2%). Ampicilina (AMP), cefepima, cefotaxima, foram os antimicrobianos aos quais os isolados apresentaram os maiores percentuais de resistência (acima de 60%). Cloranfenicol (CLO) foi a única droga que teve 100% de resistência relacionada a plasmidio entre as cepas de BHC, e para os víbrios foram: cloranfenicol, florfenicol e gentamicina. A concentração inibitória mínima variou de 32 a >128 mcg/mL para a Penicilina G nas BHC Gram-positivas, 16 a >128 mcg/mL de ampicilina nas BHC Gram-negativas, e de 16 a 128 mcg/mL de ampicilina para Vibrio spp. Os resultados indicaram a presença de cepas multirresistentes a antimicrobianos e uma significativa participação de elementos móveis nesses perfis. Além dos conhecidos riscos microbiológicos relacionados a ingestão de moluscos in natura, as ostras também podem desempenhar um importante papel como sítio de disseminação de resistência a vários antimicrobianos tanto de uso na clínica médica humana como veterinária.

REBOUÇAS, Ricardo Albuquerque. Monitoramento da microbiota bacteriana da água em um sistema fechado de cultivo em uma estação de piscicultura marinha. 2010. 79 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará. Fortaleza, 2010. / Submitted by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2012-02-01T18:21:04Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_rareboucas.pdf: 2255644 bytes, checksum: 95d0f6b8a96a5410ed5ff11b737358df (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2012-02-02T16:38:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_rareboucas.pdf: 2255644 bytes, checksum: 95d0f6b8a96a5410ed5ff11b737358df (MD5) / Made available in DSpace on 2012-02-02T16:38:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_rareboucas.pdf: 2255644 bytes, checksum: 95d0f6b8a96a5410ed5ff11b737358df (MD5) Previous issue date: 2010 / This research aimed to quantify, identify and perform antibiotic bacterial groups of the genus Vibrio in the water recirculation to the growing of a marine fish experimental station. Water samples were collected from the cultivation system in the period between September 2007 and May 2008, a total of eight collections involving the rainy and dry seasons. Environmental parameters were within the standards established by Brazilian legislation. The most probable number (MPN) of total coliforms and thermotolerant vary in P1 and P6, respectively: (P1) <1.8 to 3.4 per 10 sqm and standard plate (CCP) of colony forming units (CFU) per milliliter of heterotrophic bacteria between points ranged from <10 to 2.5 x 10 (7) CFU / mL. The number of colonies of Vibrio P1, P2 and P6 ranged from 10 to 2.37 X 10 (4) CFU / mL. Form identified 40 strains isolated from 51 amsotras water between heterotrophic bacteria. These proved to belong to 13 distinct genres, and Aeromonas, Vibrio, and Leuconostoc, the most frequent. Cultures with nitrification capacity coming from water samples were distributed in eight different genera, being found more frequently Arthorbacter, Alcaligenes, and Paracoccus Vibrios. Bili agar Thiosulfate citrate-sucrose (TCBS) were isolated and identified species of the family Vibrionaceae. Of the 28 water samples isolated from 20 strains were identified. The strains identified belonged to 10 different species V. coralliitycus, V. metschnikovii and V. orientalis, had a higher frequency. The isolates identified were subjected to sensitivity. All strains were sensitive to sulfazotrim, chloramphenicol, streptomycin, oxytetracycline and nitrofurantoin. The profile over freqeunte resistance of isolates was CTX-NAL (44.5%) (4 / 9). Of the total isolates, nine (45%) (9 / 20) is shown with a profile of multiple resistance to six different classes of antimicrobials. Was observed in this study antimicrobial resistance: cefotaxime, nalidixic acid, gentamicin, cephalothin, ciprofloxacin, ampicillin, tetracycline, and florfenicol, and may be related to the characteristic plasmid. / O desenvolvimento de cultivos eficientes utilizando sistemas fechados de cultivo com recirculação de água é necessário para uma aquicultura sustentável. Esta pesquisa visou quantificar, identificar grupos bacterianos e realizar antibiograma das espécies do gênero Vibrio presentes na água de recirculação usada para cultivo de uma estação de piscicultura marinha experimental. As amostras de água foram coletadas do sistema de cultivo no período entre setembro de 2007 e maio de 2008, perfazendo um total de 8 coletas envolvendo o período de chuva e estiagem. Os parâmetros ambientais ficaram dentro dos padrões estabelecidos pela legislação brasileira. Os números mais prováveis (NMP) de coliformes totais e termotolerantes variam em P1 e P6 respectivamente: (P1) de < 1,8 a 3,4 por 10² e de padrão em placa (CCP) das Unidades Formadoras de Colônias (UFC) por mililitro das bactérias heterotrôficas entre os pontos oscilaram de < 10 a 2,5X10 (7) UFC/mL. O número de colônias de Vibrio em P1, P2 e P6 oscilou de 10 a 2,37 X 10 (4) UFC/mL. Forma identificadas 40 cepas das 51 isoladas de amsotras de água entre as bactérias heterotróficas. Estas se mostraram pertencentes a 13 gêneros distintos, sendo Aeromonas, Leuconostoc e Vibrio, as mais frequentes. As culturas com capacidade de nitrificação provindas de amostras de água se distribuiram em 8 gêneros diferentes, sendo encontrados com maior freqüência Arthorbacter, Alcaligenes Paracoccus e Vibrios. Em Agar Tiossulfato Citrato Bili-Sacarose (TCBS) foram isoladas e identificadas espécias da família Vibrionaceae. Dos 28 isolados das amostras de água foram identificadas 20 estirpes. As estirpes identificadas pertenciam a 10 diferentes espécies V. coralliitycus, V. metschnikovii e V. orientalis, tiveram maior freqüência. Os isolados identificados foram submetidos a antibiograma. Todas as cepas foram sensíveis ao sulfazotrim, ao cloranfenicol, a estreptomicina, oxitetraciclina, e a nitrofurantoina. Entre a microbiota de vibrios da água no sistema forma encontrados 40% das estirpes sendo resistentes ao ácido nalidíxico, 30% a cefotaxina e a ampicilina, 5% ao florfenicol, a tetraciclina, a cefalotina e agentamicina. O perfil mais freqeunte de resistência dos isolados foi o CTX-NAL (44,5%) (4/9). Do total de estirpes isoladas, nove (45%) (9/20) se mostraram com um perfil de resistência múltipla a seis classes diferentes de antimicrobianos. Foi observada nessa pesquisa a resistência aos antimicrobianos: cefotaxima, ácido nalidíxico, gentamicina, cefalotina, ciprofloxacino, ampicilina, tetraciclina e florfenicol, podendo estar relacionada à característica plasmidial. Estudos sobre a diversidade da microbiota com particular às populações de Vibrio nesses ambientes são de extrema importância para a avaliação da extensão da gravidade em eventos de doenças bacterianas. Pesquisas sobre bactérias nitrificantes entre a população de bactérias heterotróficas dentro do sistema de cultivo de organismos marinhos são importantes para estabelecer os parâmetros biológicos e garantir a sustentabilidade do cultivo

MENEZES, Silvana Magalhaes Siqueira. Avaliação da eficácia antimicrobiana do extrato hidroalcoólico dos frutos de punica granatum L. (romã) na placa bacteriana. 2004. 82 f. Dissertação (Mestrado em Farmacologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2004. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-05-15T14:12:36Z No. of bitstreams: 1 2004_dis_smsmenezes.pdf: 1499490 bytes, checksum: 7db1dff21cf08f5ba5e8632fba5284c4 (MD5) / Approved for entry into archive by Eliene Nascimento(elienegvn@hotmail.com) on 2012-05-15T16:29:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2004_dis_smsmenezes.pdf: 1499490 bytes, checksum: 7db1dff21cf08f5ba5e8632fba5284c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-15T16:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2004_dis_smsmenezes.pdf: 1499490 bytes, checksum: 7db1dff21cf08f5ba5e8632fba5284c4 (MD5) Previous issue date: 2004 / The in vivo, evaluation, of the effect of the hydroalcoholic extract from Punica granatum L. (HAE) in the inhibition of the supragengival dental plaque, was carried with 60 voluntaries using fixed orthodontic appliance. The material was collected in the morning after 24h without oral hygiene, from 23 men and 37 women (age ranging from 9 to 25 years) at the city of Crato (Ceará), Brasil. The voluntaries were randomly distributed in to 3 groups of 20 subjects. Group 1: HAE; group 2: 0.12% Chlorhexidine gluconate (CLX); group 3 (control): distilled water. Each group received, under the form of a mouth-rinse for 1 minute, 15 ml of either HAE; CLX or distilled water. The dental plaque was collected before and after the mouth-rinse with one of these three substances. The bacteria colonies were counted and results expressed as colony forming unities (CFU). The minimum inhibitory concentration (MIC) and duration of the antimicrobial effect of HAE on the dental plaque were determined. The bacterial susceptibility tests in vitro to HAE and chlorhexidine on 14 pathogenic bacterial strains of the FMJ Bank, were assessed and MIC values for each bacterial strain susceptible to HAE were also determined. The statistics analysis (Mann-Whitney U) showed no difference between HAE and CLX groups (p = 0, 7251), but a significant difference was observed in the HAE group (p<0.0001) as compared against control. The percentages of inhibitions of the order of 83.5% and 79% after mounth-rinse with the HAE and CLX respectively. The MIC of the HAE on the microorganisms of the dental plaque was of 15 mg/ml. The antibacterial effect of the HAE lasted for at least 1h and the percentage of inhibition of the CFU was 72.2% after the mounth-rinse and 63.8%, 1h later. The HAE presents an antimicrobial efficacy similar to that shown by CLX, both being actives against S. aureus, S. β-hemoliticus, S. β-hemoliticus, P. aeruginosa, K. pneumoniae, P. vulgaris and E. coli. The HAE was also effective against C. albicans. The MICs of HAE on the strains of S. β-hemoliticus, S. aureus, P. aeruginosa and C. albicans were 1.87, 3.75, 7.5 and 15 mg/ml, respectively. The HAE presents a significant activity against microorganisms present in the dental plaque. / A avaliação, in vivo, do efeito do Extrato hidroalcóolico dos frutos da Punica granatum L. (EHA) na inibição da placa bacteriana supragengival, foi realizada em portadores de aparatologia ortodôntica fixa. O material foi coletado pela manhã, após 24 horas sem higiene oral, de 23 homens e 37 mulheres (com idade variando entre 9 e 25 anos), em consultório odontológico, na cidade de Crato (Ceará), Brasil. Após randomização, foram divididos em três grupos de vinte indivíduos cada. Grupo 1 - EHA; Grupo 2 - gluconato de clorhexidina a 0,12% (CLX); Grupo 3 (controle) – água destilada . Cada grupo recebeu, sob a forma de bochecho de 1 minuto, 15 ml do EHA (60mg/ml), do CLX e da água destilada. A placa dentária foi coletada antes e após o bochecho com uma destas três substâncias. As colônias bacterianas foram contadas para determinação de unidades formadoras de colônias (UFC/ml) e determinou-se a concentração inibitória mínima (CIM) e o tempo de duração do efeito do EHA sobre os microorganismos da placa dentária. Avaliou-se a atividade antimicrobiana in vitro do EHA e da CLX sobre 14 linhagens patogênicas do Banco de Microorganimos da Faculdade de Medicina de Juazeiro – FMJ. Foi determinada a CIM do EHA frente a quatro linhagens sensíveis (S. β-hemoliticus, S.aureus, P. aeruginosa e C. albicans). A análise estatística (Mann-Whitney U) não mostrou diferença entre os grupos EHA e CLX (p = 0.7251), mas uma diferença significante foi observada no EHA (p< 0.0001), quando comparado com o grupo controle. As porcentagens de inibição foram de 83.5% e 79%, após bochecho com EHA e CLX, respectivamente. A CIM do EHA sobre os microorganismos da placa dentária foi de 15 mg/ml. Houve uma redução em UFC/ml de 72.2% e de 63.8%, imediatamente após o bochecho com EHA e 1 hora depois, respectivamente. O EHA apresentou um efeito antibacteriano semelhante ao observado com a CLX, ambos mostraram-se ativos contra as linhagens de S. aureus, S. β-hemolyticus, S. β-hemolyticus, P. aeruginosa, E. coli, K. pneumoniae e P. vulgaris. O EHA foi efetivo contra C. albicans. A CIM do EHA sobre linhagens de S. β-hemolyticus, S. aureus, P. aeruginosa e C. albicans foram, respectivamente, 1.87, 3.75, 7.5 e 15 mg/ml. O EHA apresenta uma atividade significante contra microorganismos presentes na placa dentária.

A incidência de infecções microbianas relacionadas ao uso de cateteres vem aumentando. Uma característica importante dos microrganismos envolvidos é a capacidade de aderência à superfícies com conseguinte formação de colônia, produção de substâncias extracelulares, e subsequente formação de uma matriz compacta, amorfa, de múltiplas camadas, o biofilme. A atividade de bacteriocinas produzidas por Staphylococcus aureus e Staphylococcus epidermidis sobre microrganismos isolados de dispositivos intravasculares foi avaliada. As bacteriocinas Pep5 e Epidermina inibiram um maior número de isolados clínicos quando avaliadas in vitro por antagonismo direto, apresentando halos de inibição de 20 a 36 mm. A adição de Pep5 e Epidermina durante o crescimento de S. epidermidis e Corynebacterium sp resultou na redução do número de células viáveis. O efeito das bacteriocinas sobre a adesão bacteriana à cateteres de silicone foi avaliado através de três protocolos onde variou-se o momento de adição da bacteriocina: (A) simultaneamente, (B) previamente, e (C) posteriormente ao inóculo microbiano. As bacteriocinas Pep5 e Epidermina reduziram significativamente o número de células de S. epidermidis e Corynebacterium sp. aderidas aos cateteres após 6 h e 12 h de incubação. Não foram observadas diferenças importantes entre os três protocolos A, B, ou C. O efeito de Pep5 sobre Corynebacterium sp. foi verificado por microscopia eletrônica de varredura, podendo ser observadas áreas com resíduos celulares na superfície do cateter. / The in cidence of catheter-related microbial infections has been increasing. One important characteristic of related microorganisms is the adhesion to surfaces with colony formation, production of extracellular substances, and subsequent development of a compact, amorphous, multiple layer matrix, the biofilm. The activity of bacteriocins produced by Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis against microorganisms isolated from intravascular catheters was studied. The bacteriocins Pep5 and Epidermin inhibited a higher number of clinical isolates when evaluated by direct antagonism, showing inhibition zones of 20 to 36 mm. The addition of Pep5 and Epidermin during growth of S. epidermidis and Corynebacterium sp. resulted in a decrease of viable cell counts. The effect of bacteriocins on bacterial adhesion to silicon catheter was evaluated through three protocols differing in the time of bacteriocin addition: (A) simultaneously, (B) before, and (C) after the microbial inoculum. The bacteriocins Pep5 and Epidermin caused a significant reduction of the number of adhered cells of S. epidermidis and Corynebacterium sp. after 6 h and 12 h. No important differences among the protocols A, B or C were observed. The effe tions ct of Pep5 on Corynebacterium sp. was studied by scanning electron microscopy. Sec with cellular residues were observed on the catheter surface.