Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-31T00:21:11Z No. of bitstreams: 1 414889.pdf: 21061835 bytes, checksum: 77e06718f5511f8c501937d012e9df6e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-31T00:21:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 414889.pdf: 21061835 bytes, checksum: 77e06718f5511f8c501937d012e9df6e (MD5) Previous issue date: 1999-12-03 / CAPES / Em uma área de 2,0 ha de Cerrado às margens do reservatório AHE Serra da Mesa, GO, observou-se a influência do fenômeno de inundação sobre parâmetros ecológicos como a riqueza específica, abundância, densidade, seleção de hábitats e padrões de deslocamento de algumas espécies de pequenos mamíferos da região. As espécies apresentaram grande fidelidade aos hábitats ocupados, mesmo frente à inundação. A maioria dos indivíduos amostrados não modificou o tamanho de suas áreas de vida nem a distância percorrida ao longo do período de estudo, evidenciando ausência de dispersão. Também não apresentaram uma direção preferencial de deslocamento. Os resultados sincrônicos obtidos em relação à redução drástica no sucesso de captura, riqueza específica, abundância e densidade populacional ao longo do estudo evidenciam que o alagamento da região foi responsável, em grande parte, pela queda nesses parâmetros, culminando com a extinção local dos pequenos mamíferos da área de estudo. A comunidade apresentou uma riqueza específica elevada quando comparada a outras áreas de Cerrado e a ambientes florestais. Os valores da abundância relativa, por outro lado, indicaram ser a raridade um fenômeno marcante nesta comunidade. / The influence of flooding in a community of small mammals from the Central Brazilian Cerrado, state of Goiás, was studied in an area of 2,0 ha near the hydroelectric dam of Serra da Mesa. The community studied showed a high value of species richness when compared to other areas of Cerrado and rainforest sites. The relative abundance of species, on the other hand, indicated that rarity is a very important feature of this community. The species showed great fidelity to their habitats, even though the effect of flooding diminished their preferred areas. Most individuals haven't changed their home range or the mean distance moved between successive captures throughout the study, suggesting virtually no dispersal. The analysis of the movements of individuals and populations didn't show any preference of direction. The synchronous results obtained in relation to the drastic reduction of the parameters analyzed (capture success, species richness, abundance and population density) revealed that the flooding was responsible to a great extent for such reductions, leading to the extinction of the small mammals in the study area.

Para o Brasil foram reportadas 53 espécies de ácaros trombiculídeos. Destas, 5 espécies parasitam anfíbios, 6 espécies parasitam aves, 4 espécies parasitam répteis, 25 espécies parasitam roedores, 8 espécies parasitam marsupiais e 12 espécies parasitam outros mamíferos (incluindo humanos). Assim que os primeiros casos de Febre Maculosa Brasileira (FMB) foram diagnosticados em São Paulo nos anos 30, os ácaros hematófagos, como os trombiculídeos, foram sugeridos como potenciais vetores. No entanto, o papel desses ácaros na epidemiologia da riquetsiose não foi confirmado. Dessa forma, a situação fragmentária dos registros de ocorrência dos trombiculídeos, sua complexidade taxonômica e a escassez de informações sobre sua participação na epidemiologia de riquétsias, foram os principais motivos que levaram à proposição do presente estudo. Com isso, os ácaros que estão depositados nas coleções acarológicas do Instituto Butantan (IBSP), do Museu de Zoologia da USP (MZUSP) e da FIOCRUZ (CAVAIS-IOC), foram examinados e identificados. Igualmente, aqueles obtidos de roedores e marsupiais coletados em algumas localidades do estado de São Paulo e Paraná foram também identificados, bem como, investigados para a presença de Rickettsia spp. No total, foram identificadas as espécies Arisocerus hertigi, Eutrombicula sp. n., Kymocta brasiliensis, Quadraseta azulae, Q. brasiliensis, Q. mackenziei, Q. mirandae e Trombewingia bakeri. Além do encontro da nova espécie de Eutrombicula sp. n., foi ainda constatado que E. butantanensis e E. alfreddugesi são espécies distintas. As espécies Q. azulae, Q mackenziei e Q. mirandae, são assinaladas pela primeira vez no país. Com excessão de Q. brasiliensis em M. americana, todos os hospedeiros são novos registros para as espécies de ácaros examinados, bem como todas as localidades são novos registros de ocorrência. Assim, o número de espécies de trombiculídeos no Brasil aumentou para 59. Os ácaros investigados para Rickettia foram também preservados em lâminas, como testemunhos. Entretanto, nos espécimes analisados, a presença da bactéria não foi detectada. / For Brazil were reported 53 species of chigger mites. Of these, 5 species parasitize amphibians, 6 species parasitize birds, 4 species parasitize reptiles, 25 species parasitize rodents, 8 species occur on marsupials, and 12 species parasitize other wild mammals (including humans). In the 30s, as soon as the first cases of Brazilian Spotted Fever (BSF) in São Paulo were diagnosed, the haematophagous mites, such as chiggers, were suggested as potential vectors. However, the role of these mites in the epidemiology of the rickettsiosis was not confirmed. Thus, the fragmentary situation of the records of the chigger mites' occurrence, their taxonomic complexity, and the lack of information about their participation in the BSF epidemiology, were the main reasons that led to the present study proposition. So, the mites deposited in the collections of the Instituto Butantan (IBSP), Museu de Zoologia of USP (MZUSP) and FIOCRUZ (CAVAIS-IOC), were identified. Also, those obtained from rodents and marsupials collected in some localities of the state of São Paulo and Paraná were identified and investigated for the presence of Rickettsia spp. In total, the species Arisocerus hertigi, Eutrombicula n. sp., Kymocta brasiliensis, Quadraseta azulae, Quadraseta brasiliensis, Quadraseta mackenziei, Quadraseta mirandae, and Trombewingia bakeri, were identified. Besides of the new specie of Eutrombicula sp. n., the mites E. alfreddugesi and E. butantanensis were found to be distinct species. The species Q. azulae, Q. mackenziei, and Q. mirandae, are highlighted for the first time in the country. Except for Q. brasiliensis in M. americana, all other hosts are new records for the species of examined mites, as well as all locaties are also new occurences. Thus, the number of chigger mite species in Brazil increased to 59. The mites investigated to Rickettsia were also preserved in slides, as voucher. However, in the analyzed specimens, the bacteria could not be detected.

As espécies do gênero Trypanosoma parasitam vertebrados de todas as classes (peixes, anfíbios, répteis, aves e mamíferos) e possuem ciclos de vida com alternância entre vertebrados e invertebrados. A maioria das espécies se desenvolve em artrópodes hematófagos, que podem pertencer a diversas ordens e famílias. A maioria das espécies não é patogênica, T. cruzi é a única espécie patogênica para o homem nas Américas. Estudos realizados com algumas espécies de tripanossomas apontam uma grande complexidade do ciclo silvestre. Ressalta-se o fato que existam poucos trabalhos realizados no estado de Minas Gerais em animais silvestres. Até o momento, poucos estudos avaliaram os pequenos mamíferos terrestres e morcegos como reservatórios silvestres destes parasitas neste estado, com ausência de estudos com outros grupos de vertebrados. O presente projeto tem por objetivo principal, o conhecimento da diversidade de parasitas do gênero Trypanosoma em animais silvestres da ilha pluvial e Estação ecológica de Pirapitinga, Minas Gerais através do isolamento, caracterização molecular e estudos filogenéticos com marcadores tradicionais. Foram realizadas duas campanhas de captura nos meses de outubro de 2013 e março de 2014 totalizando 183 pequenos mamíferos terrestres, de 12 espécies pertencentes, a três diferentes Ordens (Calomys callosus, Cerradomys subflavus, Rhipidomys sp., Akodon sp., Hylaemys megacephalus, Delomys sp., Oligoryzomys sp., Didelphis albiventris, Micoreus sp., Gracilinanus agilis, Monodelphis domestica e Cabassous unicinctus, a espécie mais abundante foi Calomys sp, capturados com pitfalls e Shermann. Foram capturados 57 indivíduos de morcegos, com o auxilio de redes de neblina, de seis diferentes espécies (Glossophaga soricina, Artibeus sp., Platyrrhinus sp., Noctilio albiventris, Myotis sp., Choeronicus minor), a espécie mais abundante foi Glossophaga soricina. Todos os quirópteros foram negativos para tripanossomatídeos e dentre os pequenos mamíferos somente oito exemplares da espécie Monodelphis domestica foram positivas para o parasita, porém foram estabelecidas nove culturas (um dos animais estava parasitado por duas espécies de tripanossomas). Os isolados de M. domestica foram identificados como T. cruzi e uma nova espécie com morfologia distinta, mas agrupada nas filogenias com SSU rDNA e gGAPDH no Clado Lagartos/ Cobras. Esta nova espécie foi denominada T. gennarii. Os anuros e répteis foram capturados através de busca ativa e foram capturados 14 indivíduos de repteis pertencentes a 6 espécies e 88 indivíduos de anuros pertencentes a 4 espécies. Do total de anuros capturados 7 (7,95%) apresentaram hemocultura positivas e 2 (2,27%) de Leptodactylus latrans foram estabelecidas e criopreservadas com morfologia compatível a parasitas do gênero Trypanosoma. Filogenias baseadas em SSU rDNA segregou os isolados do Cerrado em um novo grupo denominado AN05 e a inclusão destes isolados evidenciaram um outro grupo, AN06 compostos de isolados obtidos de flebotomíneos. / The species of the genus Trypanosoma parasites of all vertebrate classes (Fish, amphibians, reptiles, birds and mammals) and have life cycles alternating between vertebrates and invertebrates. Most species develops in blood-sucking arthropods, which may belong to different orders and families. Most species are not pathogenic, T. cruzi is the only species pathogenic to humans in the Americas. Studies with some species of trypanosomes indicate a great complexity of the sylvatic cycle in biomes. We highlight the fact that there are few studies in the state of Minas Gerais in wild animals. To date, few studies have evaluated small terrestrial mammals and bats as wild reservoirs of these parasites in this state, with no studies with other groups of vertebrates. This project\'s main objective, knowledge of Trypanosoma parasites of the genus diversity in wild animals of the rain Island and Ecological Pirapitinga Station, Minas Gerais through isolation, molecular characterization and phylogenetic studies with traditional markers. Two arrest campaigns were conducted between October 2013 and March 2014 totaling 184 small terrestrial mammals, 12 species belonging to three different Orders (Calomys callosus, Cerradomys subflavus, Rhipidomys sp., Akodon sp., Hylaemys megacephalus, Delomys sp., Oligoryzomys sp., Didelphis albiventris, Micoreus sp., Gracilinanus agilis, Monodelphis domestica e Cabassous unicinctus, the most abundant species was Calomys callosus, captured with pitfalls and Shermann. The bats were captured with mist net and caught 57 individuals from six different species (Glossophaga soricina, Artibeus sp., Platyrrhinus sp., Noctilio albiventris, Myotis sp., Choeronicus minor), the most abundant species was Glossophaga soricina. All were negative for trypanosomatids bats and small mammals among only eight copies of Monodelphis domestica species were positive for the parasite, but nine cultures were established (one animal was infested by two species of trypanosomes). Isolates of M. domestica were identified T. cruzi and a new species with distinct morphology, but grouped in phylogenies with SSU rDNA and gGAPDH in Clade Lizards/ Snakes. This new species was named T.gennarii. Frogs and reptiles were captured through active search and were captured 14 individuals of reptiles belonging to 6 species of frogs and 88 individuals belonging to four species. Of the total of frogs captured 7 (7,95%) had positive blood culture and 2 (2.27%) of Leptodactylus latrans were established and cryopreserved with morphology compatible with the parasites of the genus Trypanosoma. Phylogenies based on SSU rDNA segregated the Cerrado isolated in a new group called AN05 and the inclusion of these isolates showed another group of compounds AN06 isolates from sand flies.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-08-02T19:34:54Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO - EDSON RODRIGUES COSTA -- PPG-ZOOL.pdf: 2118975 bytes, checksum: b9c9f5cbb00a306e3137c47f77f86c36 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-08-02T19:35:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO - EDSON RODRIGUES COSTA -- PPG-ZOOL.pdf: 2118975 bytes, checksum: b9c9f5cbb00a306e3137c47f77f86c36 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-02T19:35:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO - EDSON RODRIGUES COSTA -- PPG-ZOOL.pdf: 2118975 bytes, checksum: b9c9f5cbb00a306e3137c47f77f86c36 (MD5) Previous issue date: 2018-06-05 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The construction of highways is important for the economic, social and political development of a region, but they threaten biodiversity in promoting impacts, such as roadkills. With the fragmentation of the habitats, the arboreal animals are among the most hit vertebrates, among them are the Neotropical marsupials, mainly on highways that cut the Amazon forest. Roadkills are attributed to several factors, and such collisions may occur in a non-random manner. Our objectives were to investigate the effects of rainfall and vehicle flow on marsupial roadkills and to identify sites with roadkills hotspots on a stretch of the road BR-174 in the Waimiri Atroari Indigenous Land, between Amazonas and Roraima. Data collected over six years of monitoring were used. These were used in multiple regression analyzes to see the possible relation of roadkills with local rainfall data and overnight vehicle flows, as well as spatial analysis of roadkills. The individuals collected in the last year were identified. The multiple regression analysis showed that roadkills tended to increase in the period with less rainfall and in the period with more vehicles traveling at night. The locations where the hotspots of roadkills occurred, were identified, and these appeared in different places between the analyzed years. As measures that may mitigate roadkills of arboreal animals in the study area, on both sides of the highway it is necessary the maintenance and plantations of native trees with potential for forming natural walkways with their canopy. In addition, the installation of artificial bridges and speed reducers in specific locations as the natural passages form. However, landscape studies and populations of marsupials and other groups, are needed to better understand the causes and to assist in decision-making and conservation of local biodiversity. / A construção de rodovias é importante para o desenvolvimento econômico, social e político de uma região, porém, ameaçam a biodiversidade com diferentes impactos, como os atropelamentos. Com a fragmentação dos habitats, os animais arborícolas estão entre os vertebrados mais atropelados, dentre estes estão os marsupiais neotropicais, principalmente nas rodovias que cortam a floresta amazônica. Os atropelamentos são atribuídos a vários fatores e as colisões podem ocorrer de forma não-aleatória. Nossos objetivos foram investigar o efeito da pluviosidade e do fluxo de veículos para os atropelamentos de marsupiais e identificar locais com hotspots de atropelamentos num trecho da BR-174, na Terra Indígena Waimiri Atroari, entre os estados de Amazonas e Roraima. Foram usados dados georreferenciados coletados em seis anos de monitoramento. Estes foram usados nas análises de regressão múltipla confrontando-os com dados de pluviosidade local e de fluxo de veículos do período noturno, assim como nas análises espaciais dos atropelamentos. Foram identificados os indivíduos coletados no último ano de coleta. A análise de regressão múltipla mostrou que os atropelamentos tendem a aumentar em período com menos chuvas e em período com mais veículos trafegando à noite. Foram identificados os hotspots de atropelamentos, sendo que esses surgiram em locais diferentes entre os anos analisados. Como medidas que mitiguem atropelamentos de animais arborícolas na área de estudo, em ambas as margens da rodovia é necessário a manutenção e plantação de árvores nativas com potencial para formação de passarelas naturais. Além disso, sugerimos a instalação de pontes artificiais e redutores de velocidade em locais específicos enquanto as passagens naturais se formem. Contudo, estudos de paisagem e de populações de marsupiais e de outros grupos são necessários, para melhor compreensão das causas dos atropelamentos, para que possam auxiliar nas tomadas de decisões e de conservação da biodiversidade local.

Studies in agricultural landscapes have shown that anthropogenic environments may be relevant to wildlife species. Given the extent of these areas efficient research methods are needed to assess its ecological value in terms of local diversity, such as the use of biological indicators. The main goal here was to evaluate the possible relationship between the native vegetation biomass and diversity of small mammals in a silvicultural landscape of São Paulo. The study was developed at Fazenda Três Lagoas, which is part of the \"Programa de Pesquisa em Biodiversidade\" (PPBio), at Angatuba municipality, State of São Paulo, and lasted nine months. From May 2015 to March 2016 nine sampling campaigns were carried over a grid of 15 pitfall traps, five in Eucalyptus plantations, five in native vegetation and five in abandoned pastures. In the Chapter 1 the distribution and abundance patterns of small mammals on a silvicultural landcape during the early second cycle of Eucalyptus plantation in Southeastern Brazil was evaluated. A total of 672 individuals from 15 species of the orders Rodentia (9 spp.) and Didelphimorphia (6 spp.) were captured and five new species were detected in the study area in comparison to the first cycle. Although these species are predominantly generalists, there were differences in the abundance of small mammals in the three environments. The presence of native vegetation patches associated with riparian areas and abandoned pastures and the role of small mammals as a food resource for predators on a trophic structure, gives a certain conservation value to silvicultural landscapes in southeastern Brazil. In the Chapter 2 the relationship between landscape metrics and patterns of diversity, distribution and abundance of small mammals in a silvicultural landscape were evaluated. The species richness and family diversity of small mammals have been predominantly determined by the percentage of native vegetation. However, the abundance of small mammals can be determined by an indirect estimate of the native vegetation biomass (i.e., NDVI), which can be considered a 3D landscape metric as it is related to volume. Therefore, to succeed in assessing the value of agricultural landscape, future studies should consider landscape context, as well as the landscape metrics associated with geospatial data analysis and the distinct responses of species. / Estudos em paisagens agrícolas têm mostrado que ambientes antrópicos podem ser relevantes para muitas espécies selvagens. Dada a extensão destas áreas, são necessários métodos eficientes de pesquisa para avaliar seu valor ecológico em termos de diversidade local, tais como o uso de indicadores biológicos. O presente estudo teve como objetivo geral avaliar a possível relação entre a biomassa de vegetação nativa e a diversidade de mamíferos de pequeno porte em uma paisagem silvicultural do estado de São Paulo. O estudo foi desenvolvido na Fazenda Três Lagoas, que é parte do Núcleo Angatuba do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio), no município de Angatuba, Estado de São Paulo e teve a duração de nove meses. De maio de 2015 a março de 2016, foram realizadas campanhas mensais de amostragem em uma grade amostral com 15 conjuntos de armadilhas de interceptação e queda (pitfall), sendo cinco nas plantações de Eucalyptus spp., cinco em vegetação nativa e cinco em pasto abandonado. No Capítulo 1 foram avaliados os padrões de distribuição e abundância de pequenos mamíferos em uma paisagem silvicultural ao início do segundo ciclo de plantações de Eucalyptus no Sudeste do Brasil. Um total de 672 indivíduos de 15 espécies das ordens Rodentia (9 spp.) e Didelphimorphia (6 spp.) foram capturados e cinco novas espécies foram detectadas na área de estudo em relação ao primeiro ciclo. Embora as espécies presentes sejam predominantemente generalistas, houve diferença na abundância de pequenos mamíferos nos três ambientes. A presença de fragmentos de vegetação nativa associados a áreas ripícolas e pasto abandonado e o papel dos pequenos mamíferos como recurso alimentar para predadores em uma estrutura trófica, atribui um valor de conservação às paisagens silviculturais no sudeste do Brasil. No Capítulo 2, o objetivo foi avaliar a relação entre métricas da paisagem e padrões de diversidade, distribuição e abundância de pequenos mamíferos em uma paisagem silvícultural. A riqueza de espécies e a diversidade de famílias dos pequenos mamíferos tem sido predominantemente determinada pela área porcentual de vegetação nativa. No entanto, a abundância de pequenos mamíferos pode ser determinada por uma estimativa indireta da biomassa da vegetação nativa (e.g., NDVI), que pode ser considerada uma métrica de paisagem 3D, pois está relacionada ao volume. Portanto, para ter sucesso na avaliação do valor da paisagem agrícola, os estudos futuros devem considerar o contexto da paisagem, bem como as métricas da paisagem associadas à análise dos dados geoespaciais e as distintas respostas das espécies.

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:56:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Heloiza Helena de Oliveira Morelli Amaral.pdf: 1392333 bytes, checksum: e9a8a156b5bb7fbc58a31fe201039311 (MD5) Previous issue date: 2008-11-28 / From October 2005 to October 2007, rodents and marsupials were captured at Pedra Branca State Park, Rio de Janeiro, RJ. This research aimed to characterize the vegetation concerning the study area; to check the existence of a correlation between mesoclimate and microclimate in relation to the presence of parasites and hosts; to identify the dynamics of the hosts and parasites population throughout the seasons and verify the stratification of the small rodents and marsupials fauna as well as the ectoparasitarian fauna. Six spaces of capture were highlighted, in different levels of height. Three types of traps were used, Sherman, Tomahowk and Francesinha, with different baits distributed in five transects. A hundred and sixty mammals were captured, 96 specimens of marsupials and 64 of rodents from the following species: Akodon cursor, Oligoryzomys nigripes, Rattus norvergicus, Rattus rattus, Guerlinguetus ingrami, Sphigurus villosus, Didelphis aurita, Marmosops incanus, Micoureus paraguayanus, Metachirus nudicaudatus, Monodelphis americana and Philander frenatus. It was possible to observe that in hotter (July and August) and drier (December, January and February) months, the number of animals captured is much lower. The vegetation present in the collection areas (in the six levels researched) is composed by secondary vegetation in different stages of regeneration. The areas placed in levels 150, 200, 300 and 400 m can be classified as areas at initial and medium stage of regeneration, while, the areas situated in levels 500 and 600 m the classification is of areas at medium to advanced stage of regeneration. The correlation between the environment (relative humidity, temperature and pluviometric index) and the ectoparasites was only significant to the ticks, showing that, the higher the temperature, the higher is the number of ticks. The dominant species is D. aurita (35%). Three hundred and seventy specimens of ectoparasites were collected: 162 fleas, 105 ticks and 103 lice. The parasites found were: Siphonaptera: Adoratopsylla (Adoratopsylla) antiquorum ronnai, Adoratopsylla (Tritopsylla) intermedia intermedia, Polygenis (Polygenis) occidentalis occidentalis, Polygenis (Polygenis) rimatus, Polygenis (Polygenis) steganus, Polygenis (Neopolygenis) atopus, Ctenocephalidae felis felis, Acari (Ixodidae): Amblyomma geayi, Amblyomma longirostre, Amblyomma scutatum, Amblyomma spp., Ixodes amarali, Ixodes auritulus, Ixodes didelphidis, Ixodes loricatus, Ixodes luciae, Ixodes spp., Phthiraptera: Poliplax spinulosa, Hoplopleura sciuricola, Eutrichophilus minor and Eutrichophilus cercolabes. The siphonapterus obtained the highest prevalence coefficient (28,13%) and the highest abundance index (1,01 flea/host). The phthirapters presented the highest mean intensity of parasitism (17,17 lice/host). The correlation between the numbers of rodents captured and the levels was not significant (rs = 0,23, p = 0,6) and for the marsupials the correlation was negative and also not significant (rs = -0,6, p = 0,2). Polygenis (P.) occidentalis occidentalis was found at the highest frequency (20,8%) among the rodents and in relation to the marsupials, Adoratopsylla (T.) intermedia intermedia was the most frequent (77,7%). E. cercolabes presented the highest frequency (91,5%) among lice; among ticks the highest frequency was of Ixodes loricatus. / No per?odo de outubro de 2005 at? outubro de 2007, foram capturados roedores e marsupiais no Parque Estadual da Pedra Branca, Rio de Janeiro, RJ. Este trabalho objetivou caracterizar a vegeta??o da ?rea de estudo; verificar se existe correla??o entre mesoclima e microclima com rela??o ? presen?a de parasitos e hospedeiros; identificar a din?mica das popula??es de hospedeiros e parasitos ao longo das esta??es do ano e verificar a estratifica??o da fauna de pequenos roedores e marsupiais e da fauna ectoparasit?ria. Foram marcados seis pontos de captura, em diferentes cotas. Utilizou-se tr?s tipos de armadilhas, Sherman. Tomahowk e Francesinha, com diferentes iscas e dispostas em cinco transectos. Capturou-se 160 mam?feros, sendo 96 esp?cimes de marsupiais, das esp?cies: Didelphis aurita, Marmosops incanus, Micoureus paraguayanus, Metachirus nudicaudatus, Monodelphis americana e Philander frenatus, e 64 de roedores, das esp?cies: Akodon cursor, Oligoryzomys nigripes, Rattus norvergicus, Rattus rattus, Guerlinguetus ingrami, Sphigurus villosus,. A vegeta??o presente nas ?reas de coleta (nas seis cotas pesquisadas) ? composta por vegeta??o secund?ria em diferentes est?gios de regenera??o. As ?reas situadas nas cotas 150, 200, 300 e 400 metros podem ser classificadas como ?reas que est?o em est?gio de inicial a m?dio de regenera??o, enquanto, as ?reas situadas nas cotas 500 e 600 metros a classifica??o ? de ?reas em est?gio de m?dio a avan?ado de regenera??o. A correla??o entre o ambiente (umidade relativa do ar, temperatura e ?ndice pluviom?trico) e os ectoparasitas s? foi significativa para os carrapatos, demonstrando que, quanto maior a temperatura, maior ? o n?mero de carrapatos. Observou-se que nos meses de julho e agosto (meses mais secos) e nos meses de dezembro, janeiro e fevereiro (mais quentes) o n?mero de animais capturados ? muito baixo. A esp?cie dominante ? D. aurita (35%). Coletou-se 370 esp?cimes de ectoparasitas, sendo: 162 pulgas, 105 carrapatos e 103 piolhos. Os parasitos encontrados foram: Siphonaptera: Adoratopsylla (Adoratopsylla) antiquorum ronnai, Adoratopsylla (Tritopsylla) intermedia intermedia, Polygenis (Polygenis) occidentalis occidentalis, Polygenis (Polygenis) rimatus, Polygenis (Polygenis) steganus, Polygenis (Neopolygenis) atopus, Ctenocephalidae felis felis; Acari (Ixodidae): Amblyomma geayi, Amblyomma longirostre, Amblyomma scutatum, Amblyomma spp., Ixodes amarali, Ixodes auritulus, Ixodes didelphidis, Ixodes loricatus, Ixodes luciae, Ixodes spp.; Phthiraptera: Poliplax spinulosa, Hoplopleura sciuricola, Eutrichophilus minor e Eutrichophilus cercolabes. As pulgas obtiveram o maior coeficiente de preval?ncia (28,13%) e o maior ?ndice de abund?ncia (1,01 pulga/hospedeiro). Os piolhos apresentaram a maior intensidade m?dia de parasitismo (17,17 piolhos/hospedeiro). A correla??o entre o n?mero de roedores capturados e as cotas n?o foi significativa (rs = 0,23, p = 0,6) e para os marsupiais a correla??o foi negativa e tamb?m n?o significativa (rs = -0,6, p = 0,2). Polygenis (P.) occidentalis occidentalis foi encontrada com a maior freq??ncia (20,8%) entre os roedores e em rela??o aos marsupiais, Adoratopsylla (T.) intermedia intermedia foi a mais freq?ente (77,7%). E. cercolabes apresentou a maior freq??ncia (91,5%) entre os piolhos; entre os carrapatos a maior freq??ncia foi de Ixodes loricatus.

Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2017-03-27T15:32:23Z No. of bitstreams: 1 VivianeM_DISSERT.pdf: 2379104 bytes, checksum: 52e3047f467ee1b880b505c71e68f077 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T15:32:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VivianeM_DISSERT.pdf: 2379104 bytes, checksum: 52e3047f467ee1b880b505c71e68f077 (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Caatinga biome occurs in the states of the states of Maranhão, Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte, Pernambuco, Paraíba, Alagoas, Sergipe, Bahia and Minas Gerais, in Brazil. Despite being the only exclusively Brazilian ecosystem, few resources for research on biodiversity and conservation are devoted to this biome. The generation of knowledge on biodiversity of the Caatinga is essential for establishing effective strategies for management and conservation of species and habitats, particularly in a biome as sensitive and as threatened this one. The present work is divided into two chapters. The first one is an extensive literature review on the occurrence, distribution and chromosomal characteristics of species of small terrestrial mammals recorded in the Caatinga. The second chapter presents data on diversity, ecology and seasonality of a community of small terrestrial mammals (Didelphimorphia and Rodentia) using capture-marking-recapture methods throughout twelve successive months in a well-preserved native forest fragment of Caatinga located at the Experimental Farm Rafael Fernandes from the Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró-RN / O bioma Caatinga ocorre nos estados do Maranhão, Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte, Pernambuco, Paraíba, Alagoas, Sergipe, Bahia e Minas Gerais, no Brasil. Apesar de ser o único ecossistema exclusivamente brasileiro, poucos recursos para pesquisas sobre biodiversidade e conservação são voltados para este bioma. A geração de conhecimento sobre a diversidade biológica da Caatinga torna-se essencial para estabelecer estratégias eficazes de gestão e conservação de espécies e habitats, particularmente em um bioma tão sensível e ameaçado como esse. O presente trabalho se divide em dois capítulos e, o primeiro, consiste em uma extensa revisão bibliográfica sobre a ocorrência, distribuição e características cromossômicas das espécies de pequenos mamíferos terrestres que habitam a Caatinga. O segundo capítulo, apresenta dados sobre diversidade, ecologia e sazonalidade de uma comunidade de pequenos mamíferos terrestres (Didelphimorphia e Rodentia) através de um estudo usando o método de captura-marcação-recaptura ao longo de doze meses sucessivos de amostragem em um fragmento de mata nativa de Caatinga bem conservada situada na Fazenda Experimental Rafael Fernandes da Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró-RN / 2017-03-24

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A ordem Didelphimorphia, de marsupiais americanos, apresenta 19 gêneros e 96 espécies, todos membros da família Didelphidae, que é dividida em duas subfamílias, Caluromyinae e Didelphinae. A subfamília Didelphinae contém (não apenas) as tribos Didelphini e Metachirini. A tribo Didelphini compreende 15 espécies de quatro gêneros: Chironectes (1 espécie), Lutreolina (1), Didelphis (6) e Philander (7) e a tribo Metachirini é monotípica, com apenas uma espécie do gênero Metachirus. Estes cinco gêneros encontram-se distribuídos amplamente pelas Américas, desde o sul do Canadá até a região central da Argentina. O objetivo deste estudo foi buscar identificar e explicar, através de análise pan-biogeográfica, os padrões de distribuição das espécies destes cinco gêneros. Para tal, foi feito um levantamento em banco de dados, coleções científicas e artigos científicos para a obtenção de dados sobre as localidades de registro de cada espécie. Estas foram então marcadas em mapas e a partir destes, as localidades de ocorrência foram conectadas com linhas de menor distância para formação dos traços individuais. Pela sobreposição dos traços individuais chegou-se aos traços generalizados e do encontro destes, aos nós biogeográficos. Os pontos de ocorrência foram também plotados em mapas de biomas para análise. Encontramos três traços generalizados e dois nós biogeográficos, um no centro da Bolívia na província biogeográfica de Puna e outro na Argentina, na província de Misiones. Quatro espécies não participaram de nenhum dos traços generalizados, provavelmente devido à sua distribuição mais restrita (Philander deltae, P. andersoni, P. olrogi e P. mcilhennyi). Chironectes minimus e Metachirus nudicaudatus tiveram seus traços coincidentes com dois traços generalizados, o que está de acordo com suas divisões de subespécies. Identificamos os diferentes padrões existentes para o norte da América do Sul (Venezuela) já apontado por diversos autores, porém apenas quando analisadas as subespécies em separado. Alguns limites para a distribuição das espécies puderam ser identificados, como por exemplo o istmo de Tehuantepec, no México, para Chironectes minimus e Metachirus nudicaudatus e o limite da região neotropical para P. opossum e D. marsupialis. O limite de distribuição sul de Philander opossum e P. frenatus é provavelmente o rio Paraguai, que deve servir de barreira para o contato entre as duas espécies. A descaracterização dos ambientes naturais pelo desmatamento vem alterando os padrões naturais de distribuição das espécies, com o registro de espécies de áreas abertas em biomas de mata. Lutreolina crassicaudata apresenta distribuição disjunta, ocupando duas áreas de vegetação aberta, uma no noroeste e outra no centro e sudeste da América do Sul, padrão provavelmente gerado pelos períodos de retração e expansão de áreas de savana do Mioceno superior ao Holoceno, levando à captura destes enclaves de vegetação aberta, com seu isolamento por áreas de floresta. Os nós e traços generalizados aqui identificados coincidiram com os encontrados por outros autores. Apesar da pan-biogeografia poder ser usada para propor áreas de proteção ambiental, nos locais em que encontramos os nós biogeográficos já existem unidades de conservação, não havendo assim necessidade de propor novas áreas no caso desses marsupiais. Ainda existe uma grande necessidade de um melhor conhecimento da distribuição e taxonomia das espécies estudadas, o que promoveria um melhor entendimento dos padrões biogeográficos existentes / The order Didelphimorphia, family Didelphidae of American marsupials includes 19 genera and 96 species and is divided into two subfamilies, Caluromyinae and Didelphinae. The subfamily Didelphinae contains (not exclusively) the tribes Didelphini and Metachirini. The tribe Didelphini comprises 15 species of four genera: Chironectes (1 species), Lutreolina (1), Didelphis (6) and Philander (7) and Metachirini tribe is monotypic, with only one species of the genus Metachirus. These five genera are widely distributed throughout the Americas, from southern Canada to central Argentina. The aim of this study was to identify and to explain the speciess distribution patterns trough pan-biogeographic analysis. So, a survey was carried on using databases, visiting scientific collections and searching for published records to obtain data on localities were species were registered. Localities, for each separate species were marked on maps and the most close localities were connected with lines (individual tracks). The overlapping of individual tracks are the generalized tracks and the intersection of two or more generalized tracks are called nodes. Localities were also plotted on biomes maps. We found three generalized tracks and two nodes, one in the center of Bolivia in the biogeographic province of Pune and the other in Argentina, in Misiones. Four species do not participated in any generalized tracks, probably due to its restricted distribution (Philander delta, P. andersoni, P. olrogi and P. mcilhennyi). Chironectes minimus and Metachirus nudicaudatus had their tracks overlapped with two generalized tracks, which is in accordance with their known subspecies geographic distribution. In those species which are divided in subspecies, a separate analysis was carried on. Different patterns on the northern South America (Venezuela) were identified, all already pointed out by authors. Some species distribution limits were identified, such as the Tehuantepec Isthmus in Mexico for C. minimus and M. nudicaudatus and the neotropical region north limit to P. opossum and D. marsupialis. The south limit of P. opossum and P. frenatus is the Paraguay river, which seems to be a barrier. The mischaracterization of natural environments by human activities is changing the natural distribution patterns, as we can see by the occurrence of open areas species in forest biomes. Lutreolina crassicaudata presents a disjunct distribution, occupying two open vegetation areas, in northwest and center-southeast South America, probably generated by periods of contraction and expansion of savanna areas during the later Miocene to Holocene, leading to open vegetation enclaves surrounded by forests. The generalized tracks that we identified coincided with those found by other authors. Despite the pan-biogeography methodology can be used to propose protected areas, our nodes are in areas where conservation units already exist. There still is a great need for a better data of the distribution and taxonomy of these species, which would promote a better understanding of their biogeographic patterns

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / As florestas tropicais brasileiras (Amazônia e a Mata Atlântica) possuem alta diversidade de espécies e atualmente estão separadas por um cinturão de vegetação aberta. Parte deste cinturão é ocupada pela Caatinga, onde se encontram os Brejos de Altitude, testemunhos das conexões históricas entre a Mata Atlântica e a Amazônia. O Centro de Endemismos Pernambuco (CEPE) é a unidade biogeográfica que compõe a Mata Atlântica ao norte do rio São Francisco e contém diversos táxons endêmicos. Esta região apresenta uma mastofauna compartilhada com a Amazônia, devido às conexões existentes durante o Cenozóico. A presença do rio São Francisco em seu limite sul pode atuar como barreira ao fluxo gênico e explicar os endemismos encontrados no CEPE. Contrastando com sua situação peculiar, a mastofauna do CEPE ainda carece de estudos aprofundados sobre a identificação de suas espécies, padrões geográficos e relações filogenéticas. Revisões recentes têm identificado espécies diferentes ao norte e ao sul do rio São Francisco, mas poucos trabalhos têm proposto hipóteses biogeográficas para o CEPE. Para ampliar o conhecimento sobre a identidade e distribuição geográfica dos pequenos mamíferos do CEPE e sua estrutura filogeográfica, foram realizados levantamentos de espécies e análises de diversidade genética e morfométrica para algumas espécies. Os levantamentos consistiram de visitas às coleções científicas a fim de identificar as espécies ocorrentes no CEPE e excursões de coleta com 5 a 17 noites consecutivas em 12 localidades ao longo do CEPE, que totalizaram 64691 armadilhas noites e resultaram na coleta de 476 exemplares de 31 espécies. As espécies foram identificadas com base na morfologia externa e craniana e por análises citogenéticas. Para investigar a biogeografia do CEPE, análises de genética de populações, filogeográficas e morfométricas foram realizadas para os marsupiais Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus e os roedores Akodon cursor, Oecomys catherinae e Rhipidomys mastacalis para avaliar a existência de diferenciação nas populações do CEPE e suas relações com as linhagens Amazônicas e Atlânticas. Estes resultados mostraram que a diversificação dos pequenos mamíferos do CEPE ocorreu tanto no Terciário quanto no Quaternário. Algumas populações, como em Caluromys philander e Oecomys catherinae, mostraram afinidades com linhagens amazônicas, enquanto outras, como em Metachirus nudicaudatus e Rhipidomys mastacalis, apresentaram afinidades com linhagens atlânticas. Os pequenos mamíferos do CEPE apresentaram diferenciação em relação às suas linhagens irmãs, com algumas linhagens podendo tratar-se de espécies ainda não descritas (e.g. Didelphis aff. aurita e Rhipidomys aff. mastacalis). Esta diferenciação provavelmente foi causada pelos eventos cíclicos de flutuações climáticas que provocaram elevações no nível do mar e retração das florestas tropicais, isolando as populações do CEPE. Por fim, para auxiliar na identificação das espécies em novas coletas, de suas distribuições geográficas e de suas características citogenéticas e ecológicas, foi elaborado um guia reunindo todas as informações disponíveis sobre as espécies de pequenos mamíferos do CEPE. / The Brazilian tropical rainforests (Amazon and Atlantic Forest) present high species diversity and are currently separated by a belt of open and dry vegetation. Part of this belt is occupied by the Caatinga, where are found the Brejos de Altitude, evidence of the historical connections between the Atlantic Forest and the Amazon. The Pernambuco Endemism Center (CEPE) is the biogeographic unit of the Atlantic Forest located north of the São Francisco River and contains several endemic taxa. Part of its mammal fauna is shared with the Amazon, due to former connections in the Cenozoic. The presence of the São Francisco river in its southern limit may act as a barrier to gene flow and explain the endemism found in CEPE. In contrast to their peculiar situation, the mammalian fauna from CEPE still lacks detailed studies on its taxonomic composition, geographic patterns and phylogenetic relationships. Recent reviews have identified different species in the north and south of the San Francisco river, but few studies have proposed biogeographical hypotheses for the CEPE. In order to increase knowledge on the identity and geographical distribution of the small mammals in the CEPE and their phylogeographic structure, species surveys were carried out and the genetic and morphometric diversity of some of the species found were assessed. The surveys consisted of visits to scientific collections to identify the species occurring in CEPE and trapping trips, with 5 to 17 consecutive nights, in 12 sites throughout the CEPE, totaling 64,691 trap-nights, resulting in the collection of 476 specimens of 31 species. The specimens were identified based on external and cranial morphology and cytogenetic analysis. To investigate the biogeography of CEPE, genetics, phylogeographic and morphometric analysis were performed with the marsupials Caluromys philander, Didelphis aurita, Marmosa murina, Metachirus nudicaudatus and the rodents Akodon cursor, Oecomys catherinae and Rhipidomys mastacalis to assess the existence of differentiation in CEPE populations and their relationships with the Amazon and Atlantic Forest lineages. These results showed that diversification of small mammals in CEPE occurred in both the Tertiary and Quaternary. Some populations, such as Caluromys philander and Oecomys catherinae showed affinities with amazonian lineages, while others, like Metachirus nudicaudatus and Rhipidomys mastacalis, showed affinities with atlantic lineages. The small mammals from CEPE showed differentiation from their sisters lineages, with some lineages probably being, in fact, undescribed species (eg Didelphis aff. aurita and Rhipidomys aff. mastacalis). This differentiation was probably caused by cyclical events of climate fluctuations that led to sea level rises and retractions of the tropical forests, thus isolating the populations in CEPE. Finally, to help identifying species in future field surveys, their geographic distributions and ecological and cytogenetic features, a guide was prepared by gathering all available information on the species of small mammals from CEPE.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The small-mammal community structure of two conservation unit (CUs), Taim Ecological Station (TES) and Espinilho State Park (ESP), of the Pampa biome in southern Brazil, was investigated and compared regarding species richness, composition and abundance. Additionally, a Deciduous forest area was compared with those ones. For this purpose, ten transects with live-traps pitfall traps were used. In addition, sixteen environmental variables were measured in the TES to verify the small-mammal micro-spatial distribution. During six field phases in each area, 11 species were capture at TES, while nine species were captured in the ESP. The two areas of the Pampa biome showed high species richness when compared to forested areas, since both are influenced by other biomes: TES by the Atlantic Forest, as it is close to the coastal region, and the ESP by the interior of the continent biomes, Chaco and Espinal. The abundance and composition were different due to environmental heterogeneity, biogeography effect, size areas and degree of disturbance. However, environmental heterogeneity allows both areas to have similar species richness. When compared with the Atlantic forest CU, they differ in species richness, composition and abundance of individuals due to greater homogeneity and complexity of the forested area. With respect to the microspatial distribution, species richness and abundance were associated with sites close to water, with greater availability of arthropods and herbs. Since there is great variability of environments at TES, the heterogeneity is primarily responsible for the variation in richness and abundance of small mammals among microhabitats. The analysis indicated a significant effect of environmental variables on species abundance, showing the selection of some environments more often than others. / A estrutura da comunidade de pequenos mamíferos de duas Unidades de Conservação (UCs), a Estação Ecológica do Taim (ESET) e o Parque Estadual do Espinilho (PEE), do bioma Pampa no sul do Brasil, foi investigada e comparada quanto à riqueza, composição e abundância de espécies. Adicionalmente, uma área de Floresta Estacional Decidual, foi comparada com essas duas. Para tanto, foram utilizadas transecções com armadilhas convencionais e de queda. Ainda, na ESET dezesseis variáveis ambientais foram mensuradas para verificar a distribuição micro-espacial de pequenos mamíferos. Durante seis fases de campo em cada área, 11 espécies foram capturadas na ESET, enquanto nove foram capturadas no PEE. As duas áreas do bioma Pampa apresentaram alta riqueza de espécies quando comparadas a áreas florestadas, já que ambas sofrem influência de outros biomas: a ESET da Mata Atlântica, por se situar na região costeira, e o PEE dos biomas do interior do continente, Chaco e Espinal. A abundância e a composição foram diferentes, devido à heterogeneidade ambiental, efeito biogeográfico, diferença no tamanho das áreas e grau de perturbação. Porém, a heterogeneidade ambiental permite que ambas as áreas possuam riqueza de espécies similar. Quando comparadas com a UC de Floresta Atlântica, diferem na riqueza, composição e abundância de espécies devido à maior homogeneidade e complexidade da área florestada. Com relação à distribuição micro-espacial, a riqueza e a abundância estiveram associadas a locais próximos à água, maior disponibilidade de artrópodes e herbáceas. Uma vez que existe uma grande variabilidade de ambientes na ESET, a heterogeneidade é a principal responsável pela variação na riqueza e abundância de pequenos mamíferos entre os microhabitats. As análises mostraram um efeito significativo das variáveis ambientais na abundância das espécies, evidenciando a seleção de alguns ambientes mais favoráveis em detrimento a outros.