431 |
Diversidade de isolados brasileiros de Ralstonia solanacearum raça 2ALBUQUERQUE, Greecy Mirian Rodrigues 28 February 2013 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-10T16:48:11Z
No. of bitstreams: 1
Greecy Mirian Rodrigues Albuquerque.pdf: 828829 bytes, checksum: 4690da6e6d48e1f023da0f805aeef2bb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-10T16:48:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Greecy Mirian Rodrigues Albuquerque.pdf: 828829 bytes, checksum: 4690da6e6d48e1f023da0f805aeef2bb (MD5)
Previous issue date: 2013-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Moko of banana and heliconia caused by Ralstonia solanacearum race 2 biovar 1 is a major disease of these crops, depending on the economic risks posed to the Brazilian regions, especially the Northeast, the largest producer of banana in Brazil. R. solanacearum is a quarantine pest present (A2) restricted to the states of Amapá, Amazonas, Pará, Pernambuco, Rondônia, Roraima and Sergipe. The objective of this study was to analyze the diversity of 38 isolates of banana and heliconia, to characterize their phenotypic, pathogenic, genetic diversity, and phylogenetic position. All isolates clustered in phylotype II. Phylogenetic analysis of egl gene revealed the presence of sequevars IIA-6 and IIA-24 already described for Moko and two sequevars (IIA-41 and IIB-25) not related to Moko till now but to solanaceas. A new sequevar for the R. solanacearum complex related to Moko was also proposed, IIA-53. All isolates were pathogenic to banana plants and 12 isolates were also able to cause wilt in tomato plants. The analysis of BOX-PCR showed high variability within the population, with formation of 19 groups, 13 of them consisting of a single isolated. The biochemical profiles obtained by Biolog® Gen III system also confirmed the high variability among isolates. / O Moko da bananeira e helicônia causado por Ralstonia solanacearum raça 2, biovar 1, é uma das principais doenças dessas culturas, em função dos riscos econômicos que representam para as regiões brasileiras, sobretudo para o Nordeste, principal produtor de banana do Brasil. R. solanacearum é uma praga quarentenária presente (A2) restrita aos estados do Amapá, Amazonas, Pará, Rondônia, Roraima, Pernambuco e Sergipe. O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade de 38 isolados de bananeira e helicônias relacionados ao Moko, para caracterização de sua diversidade fenotípica, patogênica e genética e posicionamento filogenético. Todos os isolados foram caracterizados como filotipo II. A análise filogenética do gene egl revelou a presença das sequevares IIA-6 e IIA-24, já descritas para o Moko e de duas sequevares (IIA-41 e IIB-25) até então não relacionadas a esta doença, além de uma nova sequevar para o complexo R. solanacearum relacionada ao Moko, sendo proposta a denominação IIA-53. Todos os isolados foram patogênicos a bananeira e 12 também foram patogênicos ao tomateiro. A análise de BOX-PCR indicou alta diversidade na população, com a formação de 19 grupos sendo 13 constituídos, cada um por um único isolado. O perfil bioquímico obtido através do sistema Biolog® Gen III, também confirmou a alta diversidade entre os isolados.
|
432 |
Espécies de lasiodiplodia associadas à podridão peduncular em mamão no nordeste do BrasilBRITO NETTO, Mariote dos Santos 31 July 2012 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-22T12:38:56Z
No. of bitstreams: 1
Mariote dos Santos Brito Netto.pdf: 2798345 bytes, checksum: 06d5992ae421bc76a692bd417a393470 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T12:38:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Mariote dos Santos Brito Netto.pdf: 2798345 bytes, checksum: 06d5992ae421bc76a692bd417a393470 (MD5)
Previous issue date: 2012-07-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The identity of Lasiodiplodia species in causing stem-end rot papaya is reveal. In the current study the Lasiodiplodia species isolated from papaya in Northeastern Brazil are described, as well as their distribution in seven different populations. Lasiodiplodia isolates are characterized through cultural, morphological, patogenicity and virulence data, and from phylogenetic analyses based on the complete sequence of the ITS region and partial sequence of the translation elongation factor-1α gene. Based on sequence data, three previously described species were identified (Lasiodiplodia theobromae, L. pseudotheobromae, L. hormozganensis) together with one unknown species. L. theobromae was the most prevalent species in all populations. All Lasiodiplodia species were pathogenic. / A identidade das espécies de Lasiodiplodia causando podridão peduncular em mamão é revelada. No presente estudo espécies de Lasiodiplodia isoladas de mamão no Nordeste do Brasil são descritas, bem como, a sua distribuição em sete diferentes populações. Os isolados de Lasiodiplodia foram caracterizados por inferência filogenética baseada na sequência completa da região ITS e na sequencia parcial do gene fator de alongamento, pelas características culturais e morfológicas, bem como pela patogenicidade e virulência. Três espécies previamente descritas foram identificadas (L. theobromae, L. pseudotheobromae, L. hormozganensis) juntamente com uma espécie desconhecida. Lasiodiplodia theobromae foi a espécie mais prevalente em todas as populações. Todas as espécies de Lasiodiplodia foram patogênicas.
|
433 |
Análise filogenética das espécies de Hemigrammus Gill, 1858 (Characiformes, Characidae)Serra, Jane Piton [UNESP] 08 April 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2010-04-08Bitstream added on 2014-06-13T20:01:05Z : No. of bitstreams: 1
serra_jp_dr_sjrp.pdf: 3153770 bytes, checksum: 728398b4424d8a7553192af8e41e3af7 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Hemigrammus Gill, (1858) é um dos gêneros mais especiosos dentro da família Characidae, com 51 espécies distribuídas nas Américas do Sul e Central; porém, pouco se sabia sobre suas relações com outros táxons de Characidae, sendo considerado por muitos autores como um grupo não natural (Ellis in Eigenmann,1918; Böhlke, 1955; Weitzman & Palmer, 1997a; Marinho et al., 2008; Britski & Lima, 2008; Lima & Souza, 2009; Lima et al., 2009). As poucas propostas disponíveis de relacionamento para o gênero, apresentavam Hemigrammus como mais proximamente relacionado à Hyphessobrycon, Parapristella, Bryconella, Thayeria e Hasemania (Géry, 1977; Serra, 2003; Benine, 2004; Mirande, 2009), porém, a maioria desses trabalhos analisaram poucas (1-3) espécies do gênero e nenhum deles teve como objetivo principal testar o monofiletismo de Hemigrammus. Sendo assim, os objetivos do presente trabalho foram: redescrever e descrever osteologicamente H. unilineatus, espécie-tipo do gênero, avaliar o monofiletismo de Hemigrammus com a utilização do maior número possível de suas espécies válidas e avaliar o relacionamento de suas espécies entre si e com outras de Characidae. Foram analisados 95 táxons e 165 caracteres osteológicos, de morfologia externa e de colorido; a matriz de caracteres foi analisada pelo programa PAUP (4.0b 10 2001), com busca heurística, algoritmo tree-bisection-reconnection para o branch-swapping, random taxon addition sequence, 1000 réplicas e otimização acctran, com repesagens sucessivas. A análise filogenética resultou em seis árvores igualmente parcimoniosas; após repesagens uma única árvore mais parcimoniosa foi gerada, com IC. 0,35 e IR. 0,61. Hemigrammus em seu sensu atual não aparece formando um grupo monofilético. De acordo com os resultados obtidos o gênero fica restrito a sua espécie-tipo e espécies de outros gêneros de Characidae... / Hemigrammus Gill, (1858) is one of the most specious genera within the family Characidae, with 51 valid species distributed in South and Central America. The phylogenetic relationships of the genus with other Characidae are poorly known, and many authors consider that Hemigrammus does not constitute a monophyletic assemblage (Ellis in Eigenmann, 1918, Böhlke, 1955; Weitzman & Palmer, 1997a; Marinho et al., 2008; Britski & Lima, 2008, Souza & Lima, 2009, Lima et al., 2009). The few hypotheses available concerning relationships of Hemigrammus, presented the genus as closely related to Hyphessobrycon, Parapristella, Bryconella, Thayeria, and Hasemania (Géry, 1977; Serra, 2003, Benine, 2004; Mirande, 2009), however, all these studies analyzed only few species (1-3) of the genus, and none aimed to test the monophyly of Hemigrammus. Therefore, the objectives of this study were: redefining and describing osteologically H. unilineatus, type species of the genus; evaluate the monophyly of Hemigrammus using the largest possible number of its valid species; and assess the relationships of its species among themselves and with other Characidae. Were analyzed 95 taxa and 165 characters concerning osteology, external morphology and color pattern. Phylogenetic analysis was performed using PAUP (4.0b 10 2001) with heuristic search algorithm, tree-bisection-reconnection for branch-swapping, random taxon addition sequence, 1000 replicates and optimization acctran, with successive reweighting. The phylogenetic analysis resulted in six most parsimonious trees; after reweighting, resulted in a single most parsimonious tree, with IC. 0.35 and IR. 0.61. Hemigrammus in its current sense does not form a monophyletic group. According to the results, the genus Hemigrammus is restricted to its type species and species of other genera of Characidae (Hyphessobrycon, Moenkhausia and Pristella)... (Complete abstract click electronic access below)
|
434 |
Relação filogenètica entre sete espécies de Triatominae (Hemiptera, Reduviidae) da região Centro-Oeste do Brasil baseada no sequenciamento de genes mitocondriais /Gardim, Sueli. January 2010 (has links)
Orientador: João Aristeu da Rosa / Banca: João Aristeu da Rosa / Banca: Eunice Aparecida Bianchi Galati / Banca:Maria Tercilia Vilela de azeredo Oliveira / Resumo: A doença de Chagas tem como agente etiológico o protozoário Trypanosoma cruzi, cujos vetores pertencem à subfamília Triatominae. Os triatomíneos distribuem-se distribuídos por toda região Neotropical e epidemiologicamente se destacam as espécies dos gêneros Panstrongylus, Rhodnius e Triatoma. O gênero Triatoma é o mais numeroso e foi subdividido em complexos específicos de acordo com semelhanças morfológicas e distribuição geográfica de suas espécies. As sete espécies estudadas podem ser encontradas na região Centro-Oeste do Brasil, das quais seis pertencem ao subcomplexo matogrossensis (T. baratai, T. costalimai, T. guazu, T. matogrossensis, T. vandae e T. williami). A outra espécie, T. sordida pertence ao subcomplexo sordida. O objetivo deste estudo foi determinar a posição filogenética das sete espécies ocorrentes na região Centro-Oeste, por meio de comparação das sequências dos fragmentos citocromo b e 16S do DNA mitocondrial, visto que até o momento não foi determinada a posição de T. baratai e T. vandae com base em dados moleculares. Os exemplares avaliados são oriundos de colônias mantidas junto ao Insetário de Triatominae da Faculdade de Ciências Farmacêuticas/UNESP - Araraquara. Após a extração do DNA genômico e da amplificação dos fragmentos 16S e Cytb, procedeu-se o sequenciamento do DNA em sqüenciador automático, modelo ABI 377. As sequências obtidas juntamente com outras sequências (do mesmo fragmento) já disponíveis no GenBank, foram alinhadas com auxílio do programa Clustal W do BioEdit e as inferências filogenéticas foram conduzidas utilizando-se análises de parcimônia e de distância com o programa MEGA 3.1. De acordo com os resultados encontrados, T. costalimai mostrou-se mais distante das demais espécies e foi posicionada como grupo externo. As outras espécies distribuíram-se em dois grupos:.. (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The protozoan Trypanosoma cruzi, the etiologic agent of Chagas' disease, is transmitted by vectors that belong to the subfamily Triatominae. The triatomines are distributed throughout the Neotropical region and species from Panstrongylus, Rhodnius and Triatoma genus stand out epidemiologically. The Triatoma genus is the largest and was divided in specific complexes according to morphological similarities and geographical distribution of its species. The seven species studied can be found in the Central West Region of Brazil, of which six belong to the matogrossensis subcomplex (T. baratai, T. costalimai, T. guazu, T. jurbergi, T. matogrossensis, T. vandae and T. williami). The other specie, T. sordida belong sordida subcomplex. The aim of this study was to determine the phylogenetic position of the seven species from Central West Region by comparing the 16S and Cytb fragments sequences of the mitochondrial DNA, since so far not been given the position of T. baratai and T. vandae based DNA sequences. The specimens evaluated came from colonies maintained at the Insectarium of Triatominae, Faculdade de Ciências Farmacêuticas / UNESP - Araraquara. After extraction of genomic DNA and amplification of the 16S and Cytb fragments, it was sequenced in an automatic DNA sequencer, model ABI 377. The sequences obtained and other sequences (of the same fragment) already available in GenBank were aligned using the Clustal W program of BioEdit and the phylogenetic inferences were conducted using the analysis of parsimony and distance with the MEGA 3.1 program. According to the results, T. costalimai was more distant from other species and was placed as an outside group. Other species are distributed in two groups, the first comprising the species T. vandae very close to T. matogrossensis and external of these, T. sordida. The second group includes T. guazu strongly related to T. williami... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
|
435 |
Biodiversity and phylogeny of coral-associated polychaetesSun, Yanan 01 January 2011 (has links)
No description available.
|
436 |
Revisão e filogenia de Bignonia L. (Bignonieae, Bignoniaceae) / Taxonomic revision and phylogeny of Bignonia L. (Bignonieae, Bignoniaceae)Alexandre Rizzo Zuntini 09 January 2015 (has links)
Bignonia, o quinto maior gênero da tribo Bignonieae (Bignoniaceae), é caracterizado por apresentar ramos com cunhas de floema em múltiplo de quatro, folhas 2-folioladas, gavinhas geralmente simples, flores com corola achatada e sem disco nectarífero, e sementes com alas opacas. A atual circunscrição é baseada num recente estudo filogenético que congregou 28 espécies anteriormente posicionadas em oito diferentes gêneros. Esta união tornou Bignonia um grupo complexo, com ampla variação morfológica, criando um grande desafio taxonômico. Assim, os objetivos foram revisar a taxonomia do gênero e reconstruir sua filogenia baseada em caracteres moleculares, incluindo sequenciamento em larga escala, para melhor compreender o grupo. Com o tratamento taxonômico apresentado aqui, são reconhecidas 30 espécies, duas das quais descritas como novas, uma reestabelecida e outra sinonimizada. Foram encontrados dez clados, todos suportados por sinapomorfias morfológicas, que são a base da classificação subgenérica proposta. Os resultados gerados aqui fornecerão subsídios para um futuro estudo evolutivo e biogeográfico / Bignonia, the fifth largest genus in the tribe Bignonieae (Bignoniaceae), is characterized by stems with phloem wedges in multiple of four, leaves 2-foliolated, tendrils usually simple, flowers with dorso-ventrally flattened corolla and absent nectariferous disk, and seed with opaque wings. The current circumscription is based on a recent phylogenetic study that congregated 28 species previously placed in eight different genera. This unification made Bignonia a complex group, with a wide morphological range, which created a big taxonomic challenge. In this manner, the objectives were to review the taxonomy of the genus and to reconstruct its phylogeny using molecular characters, including high throughput sequencing, to better understand this group. With the taxonomic treatment presented here, 30 species are recognized, two of these described as new, one reestablished and another synonymized. Ten clades were obtained, all supported by morphological characters, are the base for the subgeneric classification proposed. The results presented here will provide the base for future evolutionary and biogeographic study
|
437 |
Biogeografia e diversificação do gênero Stizophyllum (Bignoniaceae) / Biogeography and diversification of genus Stizophyllum (Bignoniaceae)Maila Beyer 02 May 2018 (has links)
A região Neotropical é uma das regiões com maior biodiversidade no planeta. Essa região apresenta uma complexa história geológica que iniciou-se com a quebra da Gondwana, separando os continentes sul-americano e africano, durante o Mesozóico, há ca. de 150 milhões. Todas as mudanças geológicas que seguiram influenciaram a diversificação da fauna e flora dessa região. No entanto, ainda não sabemos quais processos levaram à alta diversidade encontrada nesta região. Esse estudo, foca em Stizophyllum, (Bignonieae, Bignoniaceae), um pequeno gênero de lianas Netropicais, que ocorre desde o México até o sul do Brasil. Apesar da cirscunscrição de Stizophyllum ser clara, limites específicos permanecem complicados neste grupo e pouco se sabe sobre sua história evolutiva. Este estudo visa: (i) reconstruir a filogenia do gênero e utilizá-la como base para inferir a história biogeográfica do grupo, e (ii) desenvolver marcadores de microssatélites (SSRs) nucleares e plastidiais, para futuros estudos filogeográficos e de genética de populações. Para tal, reconstruímos a filogenia do gênero com base em três marcadores moleculares (ndhF, rpl32-trn,L e pepC) e uma ampla amostragem de indivíduos, utilizando inferências bayesiana e de máxima verossimilhança. Em seguida estimamos as idades de divergência das diversas linhagens e reconstruímos a história biogeográfica do grupo. Por fim, desenvolvemos marcadores de microssatélite nucleares (nSSRs) e de cloroplasto (cpSSRs) para o grupo. Ao todo, desenvolvemos trinta e sete SSRs, nove nucleares e vinte oito de cloroplasto. Todos marcadores foram polimórficos em S. riparium e apresentaram sucesso de transferabilidade para S. inaequilaterum e S. perforatum. Cinco clados principais foram reconstruídos na filogenia molecular do gênero, os quais são caracterizados por bons caracteres morfológicos e aqui reconhecidos como espécies em uma nova sinopse apresentada para o grupo: (i) S. inaequilaterum Bureau & K. Schum., distribuído pela Amazônia e América Central; (ii) S. perforatum (Cham.) Miers, distribuído pela Mata Atlântica e Áreas Secas do Brasil Central, (iii) S. riparium (Kunth) Sandwith, distribuído por toda Bacia Amazônia; (iv) S. flos-ardeae (Pitter) Beyer & L.G. Lohmann, distribuído pela América Central, e (v) S. coriaceum Beyer & L.G. Lohmann, restrito ao Estado do Pará, na Amazônia Oriental. O estudo biogeográfico indicou que o ancestral de Stizophyllum e seu grupo-irmão Martinella, estava distribuído pela Amazônia. A divergência destas linhagens ocorreu durante o Eoceno, enquanto a diversificação das espécies de Stizophyllum ocorreu durante o Mioceno, a partir de um ancestral amplamente distribuído pela região Neotropical. Essa dissertação traz novos dados para um melhor entendimento dos processos que levaram à estruturação da biota Neotropical e contribui dados importantes para um projeto multidisciplinar amplo neste tópico (FAPESP 2012/50260-6) / The Neotropics is one of the most biodiverse regions in the planet. This region has a complex geological history that began during the break of Gondwana, which separated the South American and African continents in the Mesozoic, at ca. 150 million years ago. All the geological changes that followed greatly impacted the diversification of the fauna and flora of this region. However, it is still not clear what processes led to the high diversity found in this region. This study focuses on Stizophyllum (Bignonieae, Bignoniaceae), a small genus of Neotropical lianas, distributed from Mexico to southern Brazil. Although Stizophyllum is well circumscribed, species limits remain complicated in this group and little is known about its evolutionary history. This study aims to: (i) reconstruct the phylogeny of the genus and use it as a basis to infer the biogeographical history of this group, and (ii) develop nuclear and plastid microsatellite markers (SSRs) for future studies on the phylogeography and population genetics of this group. To this end, we reconstructed the phylogeny of the genus based on three molecular markers (ndhF, rpl32-trnL and pepC) and a broad sample of individuals, using Bayesian and Maximum Likelihood approaches. We then estimated divergence times of the various lineages and recontructed the biogeographical history of the group. Lastly, we developed nuclear microsatellite markers (nSSRs) and chloroplast microsatellite markers (cpSSRs) for the group. In total, we developed thirty-seven SSRs, nine from the nucleus and twenty-eight from the chloroplast. All markers amplified successfully in S. riparium and transferability was sucessful to S. inaequilaterum and S. perforatum. Five main clades were reconstructed in the molecular phylogeny of the group, all of which are characterized by good morphological markers and here recognized as species in an updated synopsis of the group: (i) S. inaequilaterum Bureau & K. Schum., distributed through the Amazon and Central America; (ii) S. perforatum (Cham.) Miers, distributed through the Atlantic Forest and the Dry Areas from Central Brasil; (iii) S. riparium (Kunth) Sandwith, distributed throughout the Amazon Basin; (iv) S. flos-ardeae (Pitter) Beyer & L.G. Lohmann, distributed through Central America; and, (v) S. coriaceum Beyer & L.G. Lohmann, restricted to the state of Pará, in Eastern Amazonia. The biogeographic study indicated that the ancestor of Stizophyllum and its sister-group Martinella was broadly distributed through Amazônia. These lineages dievrsified during the Eocene, while the diversification of Stizophyllum species occurred during the Miocene, from an ancestor that was broadly distributed through the Neotropics. This dissertation brings new information for the assembly of the Neotropical biota and contributes important data for a broader multidisciplinary project on this topic (FAPESP 2012 / 50260-6)
|
438 |
Filogenia de falconiformes (aves) baseada em comportamento de autolimpeza / Phylogeny of falconiformes based on self-grooming behaviorAlexandre Henrique de Quadros 30 April 2008 (has links)
Este estudo foi baseado em seqüências de autolimpeza e em métodos probabilísticos para compor as seqüências de comportamento. Foi testada a posição filogenética de membros da Ordem Falconiformes e Ciconiiformes. Sete táxons foram estudados: a garça-branca-grande, Ardea(=Casmerodius) alba, Família Ardeidae; harpia, Harpia harpjya, Família Accipitridae; gavião-do-rabo-branco, Buteo albicaudatus, Família Accipitridae; abutre-careca, Trigonoceps occipitalis, Família Accipitridae; abutre-do-coqueiro, Gypohierax angolensis, Família Accipitridae; gavião-pinhé, Milvago chimacima, Família Falconidae; urubu-comum, Coragyps atratus, Família Cathartidae. Para a análise das seqüências comportamentais foram adicionados outros sete táxons de outro estudo (Harpia foi contada apenas uma vez). As seqüências de autolimpeza para as treze espécies totalizaram 3.190, que foram usadas como caracteres filogenéticos. A análise filogenética das seqüências comportamentais resultou em uma única árvore mais parcimoniosa (CI= 0,51 e RI= 0,44). O cladograma obtido apresentou bons escores no teste Bootstrap, mas não apresentou um arranjo muito claro entre os ramos. É possível que dificuldades ao se registrar eventos comportamentais possam ter causado os problemas na topologia do cladograma. Baseando-se nessa hipótese foram excluídas três espécies que apresentaram maior incongruência na topologia. Um novo cladograma foi obtido (CI= 0,69 e RI= 0,47). A última análise propõe que Falconiformes não é um grupo monofilético; Cathartidae e Threskiornitidae são táxons estreitamente relacionados a Falconiformes. Ardea foi considerada como grupo externo e não relacionado a Threskiornitidae. Em suma, Falconiformes é apresentado como um táxon contido em Ciconiiformes; Cathartidae não é um grupo basal, ao contrário, é um grupo mais recente e grupo-irmão de Threskiornitidae. As duas espécies de abutres aparecem como grupos divergentes. / This study was based on self-grooming sequences, and probabilistic methods to compose sequences of behavior. The phylogenetic position of members of Orders Falconiformes and Ciconiiformes was inferred. Seven taxa were studied: the Great Egret, Ardea (= Casmerodius) alba, Family Ardeidae; Harpy Eagle, Harpia harpyja, Family Accipitridae; the White-tailed Hawk, Buteo albicaudatus, Family Accipitridae; the White-headed Vulture, Trigonoceps occipitalis, Family Accipitridae; the Palm-nut Vulture, Gypohierax angolensis, Family Accipitridae; Yellow-headed Caracara, Milvago chimachima, Family Falconidae; and American Black Vulture, Coragyps atratus, Family Cathartidae. For the analysis of behavioral sequences seven other taxa (Harpia was presented twice) of previous study were added. The total numbers of sequences of self-grooming for thirteen species arrive at 3,190, which were used as phylogenetic characteres. The sequences composed the behavioral characters for the phylogenetic analysis, and resulted in only one more parsimonious tree (CI= 0,51, RI= 0,44). The cladogram presents good scores in bootstrap analysis but displayed a not very clear arrangement among the branches. It is possible that the difficulties in acquiring behavioral acts caused the problems seen in the cladogram. Based on this hypothesis three species (more incongruent) were excluded and a new most parsimonious tree (CI= 0,69 and RI= 0,47) was got. The last analysis support that Falconiformes is not a monophyletic group; the Cathartidae and Threskiornitidae are closely related taxa of Falconiformes. Ardea was considered as out-group and are not included as close to Threskiornitidae. In addition, Falconiformes is presented as a Ciconiiformes taxon; Cathartidae is not a basal group, on the contrary, is the most recent group and also the sister group to Threskiornitidae. The two species of Old World Vultures appear as divergent groups.
|
439 |
Revisão taxonômica e filogenia do gênero Megalobrachium Stimpson, 1858 (Crustacea: Decapoda: Anomura: Porcellanidae) / Taxonomic review and phylogeny of genus Megalobrachium Stimpson, 1858 (Crustacea: Decapoda: Anomura: Porcellanidae)Luciane Augusto de Azevedo Ferreira 03 November 2015 (has links)
O presente trabalho trata do gênero de porcelanídeos Megalolobrachium Stimpson, 1858 e está organizado em três partes: (1) uma revisão taxonômica das espécies atualmente atribuídas a Megalobrachium Stimpson, 1858; (2) uma revisão da diversidade morfológica do gênero em um contexto maior dentro de Porcellanidae; e (3) uma análise cladística a partir de dados morfológicos com o intuito de testar o monofiletismo de Megalobrachium e propor a primeira hipótese filogenética para o gênero. A revisão taxonômica se baseou no estudo de material abundante de diferentes localidades do Pacífico oriental e Atlântico ocidental. Uma nova espécie de Megalobrachium é descrita com base no material das costas pacíficas do Panamá e Colômbia, totalizando 13 espécies em Megalobrachium. Para a análise filogenética, foram obtidos 151 caracteres; o grupo-externo foi composto por quatro espécies de três gêneros: Pachycheles Stimpson, 1858, Pisidia Leach, 1820, e Porcellana Lamarck, 1801. Uma única árvore (314 passos; IC: 64; IR: 80) foi obtida, com dois clados. O primeiro clado inclui espécies com lobos da fronte marcadamente flexionados, flagelo da antena curto, com artículos longos, patas ambulatórias curtas e robustas, abdome subtriangular em machos, pleópodo feminino iv com três segmentos, e urópodos curtos. O segundo clado contém espécies com lobos da fronte não flexionados, flagelo da antena longo, com artículos curtos, patas ambulatórias longas e delgadas, abdome sub-retangular, pleópodo feminino iv com dois segmentos, urópodos longos. O primeiro clado corresponde a Porcellanopsis Rathbun, 1910 (espécie-tipo P. festae (Nobili, 1901)), previamente tratado como sinônimo de Megalobrachium. Contudo, a combinação de diferenças morfológicas entre Megalobrachium e Porcellanopsis justifica a revalidação de Porcellanopsis. Três espécies foram erroneamente registradas no Pacífico oriental (M. mortenseni Haig, 1962, P. rosea (Rathbun, 1900) e P. soriata (Say, 1818)); essas espécies são exclusivamente distribuídas no Atlântico ocidental. / The present study deals with the porcelain crab genus Megalolobrachium Stimpson, 1858 and is organized in three parts: (1) a taxonomic revision of species hitherto attributed to Megalobrachium; (2) a review of morphological diversity of the genus in the broader context of the Porcellanidae; and (3) a cladistic analysis of morphological data, to test the monophyly of Megalobrachium and propose a first phylogenetic hypothesis for the genus. The taxonomic revision was based on abundant material from different localities in the tropical eastern Pacific and western Atlantic. A new species of Megalobrachium is described based on material from the Pacific coast of Panama and Colombia, bringing the total number of species in Megalobrachium to 13. In the phylogenetic analysis, 151 characters were used; the outgroup included four species from three genera, Pachycheles Stimpson, 1858, Pisidia Leach, 1820, and Porcellana Lamarck, 1801. One single tree (314 steps; CI: 64; RI: 80) was obtained, with two major clades. The first clade includes species with markedly deflexed frontal lobes, short antennal flagellum, latter with elongate joints, short and robust ambulatory legs, subtriangular abdomen in males, female fourth pleopod with three segments, and short uropods. The second clade contains species with straight frontal lobes, long antennal flagellum, latter with short joints, long and slender ambulatory legs, subrectangular abdomen in males, female fourth pleopod with two segments, and long uropods. The first clade thus corresponds to Porcellanopsis Rathbun, 1910 (type-species P. festae (Nobili, 1901)), previously treated as a synonym of Megalobrachium. However, the above-listed morphological differences between Megalobrachium and Porcellanopsis justify the revalidation of Porcellanopsis. Three species were erroneously recorded from the eastern Pacific, namely M. mortenseni Haig, 1962, P. rosea (Rathbun, 1900) and P. soriata (Say, 1818); their distribution range is restricted to the western Atlantic.
|
440 |
Sobre os Tapiritae (Mammalia, Perissodactyla) do quaternário da América do SulHolanda, Elizete Celestino January 2011 (has links)
O gênero Tapirus (Perissodactyla, Tapiridae) é de origem holártica e entre o Mioceno e Plioceno final é amplamente distribuído na América do Norte, Europa e Ásia. Os tapires aparecem na América do Sul após a formação do Istmo de Panamá, durante o Grande Intercâmbio Biótico Americano, Pleistoceno inicial - médio. Neste trabalho, é revisado o material tipo das espécies atribuídas ao gênero na América do Sul; descrito material inédito proveniente da Venezuela e Brasil; realizado estudo comparativo morfológico e morfométrico; e proposto hipóteses quanto à origem e filogenia dos tapires na América do Sul. A partir da revisão das espécies de Tapirus do Quaternário da América do Sul, foi possível considerar válidas as espécies: T. greslebini, T. rioplatensis, e T. mesopotamicus (todas para a Argentina); T. oliverasi (Uruguai); T. tarijensis (Bolívia); T. cristatellus e T. rondoniensis (Brasil). A análise morfométrica permitiu estabelecer dois morfótipos para as espécies fósseis sulamericanas com base no tamanho do dentário. Um morfótipo que está dentro da variação de tamanho de T. terrestris, constituído pelas espécies T. rondoniensis e T. mesopotamicus, e outro, um morfótipo maior, com tamanho superior ao máximo de variação encontrado em T. terrestris, como T.tarijensis, T. rioplatensis, T. greslebini, e alguns espécimes de T. cristatellus. O gênero Tapirus apresentou-se como um clado monofilético, sendo Nexuotapirus marslandensis seu táxon-irmão. Os tapires sulamericanos não formam um clado monofilético, sendo T. pinchaque o grupo-irmão dos demais tapires sul-americanos atuais e fósseis, bem como das formas derivadas norte-americanas; e T. cristatellus seria o táxon irmão do clado T. indicus + T. bairdii +T. polkensis + T. lundeliusi + T. haysii + T. veroensis. O resultado da análise filogenética sugere uma relação próxima entre os tapires sul-americanos e T. webbi, o que corrobora a hipótese de um evento de dispersão da América do Norte para a América do Sul durante o Mioceno. Por outro lado, nossos dados indicam um segundo evento de dispersão da América do Sul para a América do Norte, possivelmente a partir de uma forma proximamente relacionada a T. cristatellus, que teria dado origem às formas derivadas do sudoeste da América do Norte. / The genus Tapirus (Perissodactyla, Tapiridae) is of Holarctic origin and between the Miocene and late Pliocene is widely distributed in North America, Europe and Asia. Tapirs appeared in South America after the formation of the Isthmus of Panama, during the Great American Biotic Interchange, early – middle Pleistocene. In this work is reviewed the type specimen of the species assigned to the genus in South America; described new material from Venezuela and Brazil; conducted comparative morphological and morphometric study; and proposed hypotheses regarding the origin and phylogeny of South American tapirs. Based on the review of the species of Tapirus of Quaternary from South America, could be considered as valid species: T. greslebini, T. rioplatensis, and T. mesopotamicus (all from Argentina); T. oliverasi (Uruguay); T. tarijensis (Bolivia); T. cristatellus and T. rondoniensis (Brazil). Morphometric analysis allowed us to establish two morphotypes for the South American fossil species based on the size of the teeth. A morphotype which is within the size variation of T. terrestris, comprising the species T. rondoniensis and T. mesopotamicus, and another, larger one morphotype, much larger than the maximum of variation found in T. terrestris, as T. tarijensis, T. rioplatensis, T. greslebini, and some specimens of T. cristatellus. The genus Tapirus appeared as a monophyletic clade and Nexuotapirus marslandensis as its sister taxon. The South American tapirs do not constitute a monophyletic clade, since T. pinchaque is the sister group of other extant and fossil South American tapirs, and of the forms derived from North American; and T. cristatellus would be the sister taxon of the clade T. indicus + T. bairdii +T. polkensis + T. lundeliusi + T. haysii + T. veroensis. The result from phylogenetic analysis suggests a close relationship between the South American tapirs and T. webbi, which supports the hypothesis of a dispersal event from North America to South America during the Miocene. Moreover, our data indicate a second dispersal event from South America to North America, possibly from a form closely related to T. cristatellus, which would have resulted to the derived forms of southeast North America.
|
Page generated in 0.0991 seconds