Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-08-05T19:19:27Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Final ZAFIRA pdf.pdf: 692134 bytes, checksum: b4494b39d68a80325cc5987e4daa2f93 (MD5) / Approved for entry into archive by Vilma Conceição(vilmagc@ufba.br) on 2013-08-08T14:11:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Final ZAFIRA pdf.pdf: 692134 bytes, checksum: b4494b39d68a80325cc5987e4daa2f93 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-08T14:11:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Final ZAFIRA pdf.pdf: 692134 bytes, checksum: b4494b39d68a80325cc5987e4daa2f93 (MD5) / Fapesb, Plantações Michelin da Bahia / 1. As abelhas sem ferrão A tribo Meliponini pertence à família Apidae (Apoidea, Hymenoptera) que se destaca como a mais diversificada e com distribuição mais ampla no mundo (Silveira et al., 2002). Das 19 tribos da sub-família Apinae, Meliponini e Apini agrupam as abelhas com comportamento eusocial, o mais alto nível de organização social (Michener, 2000). As abelhas Meliponini apresentam ampla distribuição nos trópicos de todo o mundo (Michener, 2000). A região neotropical contém o maior número de espécies de meliponíneos apresentando 32 gêneros exclusivos (Camargo e Pedro, 2007) do total de 56 gêneros da tribo distribuídos no mundo (Costa et al., 2003). Essas abelhas são visitantes florais numericamente dominantes em várias formações vegetais, destacando-se particularmente nas florestas tropicais pluviais. Na Mata Atlântica, os meliponíneos aparecem associados especialmente às floradas maciças (mass-flowerings), desempenhando papel central na biologia reprodutiva de árvores do dossel (Ramalho, 2004; Monteiro e Ramalho, 2009). Nos meliponíneos, a reprodução e fundação de uma nova colônia perene são feitas por um conjunto de abelhas (rainha e operárias) e ocorre através de um processo de enxameagem progressiva, com longo período de contato entre colônia mãe e filha, ao contrário da ruptura abrupta observada em Apis (Nogueira-Neto, 1997; Velthuis et al., 1997). As operárias nascidas na colônia mãe passam vários dias abastecendo o novo ninho com materiais de construção (cerúmen) e alimento (Nogueira-Neto, 1997). Esta característica pode limitar a formação de novas colônias aos sítios de nidificação mais próximos ao ninho materno (Batista et al., 2003). Apesar dos meliponíneos apresentarem ampla diversidade de substrato de nidificação a maioria das espécies necessitam de cavidades pré-existentes em ocos de árvores (Roubik, 1989; Michener, 2000; Batista et al., 2003). Por isso, as espécies deste grupo de abelhas podem ser bastante suscetíveis à fragmentação da floresta. A manutenção das abelhas sociais sem ferrão para a conservação da Mata Atlântica se deve à importância dessas abelhas como agentes polinizadores de árvores nativas. A redução brusca dos meliponíneos ocasionadas por desmatamentos ou por ação predatória pode gerar redução na diversidade de espécies destes indivíduos e, consequentemente redução de espécies de plantas dependente destas abelhas (Roubik, 1993). 2. A espécie Tetragonisca angustula A espécie Tetragonisca angustula (Latreille, 1811) é uma das abelhas mais comuns com uma ampla distribuição geográfica na América Tropical (Moure, 2007), apresentando um importante papel na polinização da flora nativa (Oliveira et al., 2004). T. angustula é uma espécie generalista na ocupação dos habitats e também no uso de fontes florais e locais de nidificação (Batista et al., 2003). Adapta-se bem a diversos substratos de nidificação, ocupando cavidades pré existentes em troncos de árvores vivas ou mortas, construções humanas, solo, etc. Ao contrário de espécies de Meliponini mais estreitamente associadas à floresta, T. angustula comporta-se como generalista, ocupando vários hábitats em ambientes modificados, incluindo áreas urbanas (Batista et al., 2003; Ramalho e Batista 2005). 3. Fragmentação do habitat A fragmentação de habitats naturais tem sido uma das causas mais importantes para o decréscimo populacional local e perda de biodiversidade regional. Os fragmentos naturais geralmente formam paisagens em mosaico, onde a dinâmica das populações agora também em mosaico e os processos ecológicos podem estar sob forte pressão de fatores dependentes da escala espacial e das características das matrizes modificadas (Andren, 1994; Wiens, 1995). A Mata Atlântica foi reduzida em mais de 90% da sua extensão original e os fragmentos florestados remanescentes estão pulverizados na ampla área de distribuição (Guedes et al., 2005), de modo que a conectividade funcional se tornou uma variável chave para preservação da biodiversidade. Em áreas como o litoral da Bahia, na porção norte, a maioria dos remanescentes florestados tem menos de 100 ha, e a conectividade funcional é o problema central que atinge as populações de meliponíneos (Ramalho e Batista, 2005). A preservação da biodiversidade em longo prazo na região demanda medidas de maior escala espacial, como os corredores ecológicos (Zaú, 1998). Operacionalmente os corredores estão associados à idéia de conectividade física - ou melhor, da matriz interveniente entre os fragmentos - mas o aspecto relevante é o nível de conectividade funcional alcançada: ou seja, de que forma a estrutura de populações de organismos focais e processos ecológicos associados são afetados nestas escalas espaciais. 4. Marcadores Moleculares O estudo de polimorfismos até a década de 60 foi baseado em variações fenotípicas. Essas eram pouco perceptíveis e limitavam a percepção de diferenças significativas entre as populações (Futuyma, 1992) ou suas respostas sutis às variações espaciais. Ensaios subseqüentes com marcadores moleculares evidenciaram locos polimórficos que não seriam identificados com observações fenotípicas. A primeira técnica utilizada foi a eletroforese de proteínas, desenvolvida por Harris (1966) e Hubby e Lewotin (1966). Os marcadores isoenzimáticos foram muito usadas em estudos de dispersão de espécies e na análise de filogenia e sua difusão ocorreu a partir do desenvolvimento de métodos eficientes de visualização do produto enzimático (Ferreira e Gratapaglia, 1998). As isoenzimas foram utilizadas em estudos com abelhas inclusive com T. angustula (Castanheira e Contel (1995 e 2005). Em 1968 foram descobertas as enzimas de restrição houve um desenvolvimento da técnica de RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism). Esta técnica oferecia vantagens em relação à anterior e podia ser utilizada em estudos populacionais. Atualmente existem vários tipos descritos de marcadores moleculares que podem ser utilizados em estudos populacionais comportamentais e filogenéticos. O marcador é escolhido de acordo com o problema a ser analisado e com a disponibilidade de recursos (Avise, 1989). Os marcadores co-dominantes são mais indicados para estudos populacionais, pois, nesses casos, oferece maior precisão e vantagens técnicas do que os marcadores dominantes (Sunnucks, 2000; Arias et al., 2006). Entre as características que tornam os marcadores co-dominantes mais versáteis e precisos, destacam-se: i) grande abundância e distribuição uniforme por todo o genoma; ii) são multi-alélicos e, portanto, maior conteúdo informativo por loco (Ferreira e Gratapaglia, 1998). Os microssatélites são marcadores moleculares, que permitem acessar uma ampla gama de diferenciações e abordar os processos ecológicos e evolutivos subjacentes, sendo por isso adequados para estudos populacionais (Arias et at., 2006). 3.1 Microssatélites Os marcadores microssatélites também são denominados SSRs (Simple Sequence Repeats) ou STRs (Short Tandem Repeats). Inicialmente, o termo microssatélite foi utilizado apenas para designar repetições CA (ou CG) (Brito 2005 apud Litt; Luty, 1989) e os termos “Simple Sequence Repeats” ou “Short Tandem Reapeats” eram utilizados para as outras repetições. Atualmente o termo microssatélite é utilizado para quaisquer repetições que envolvam um pequeno número de pares de bases (Oliveira et al., 2006). Assim, os microssatélites constituem uma curta seqüência repetida em tandem (em “fila”), com um tamanho de 1-6 nucleotídeos, distribuídos aleatoriamente pelo genoma da maioria dos organismos. Essas seqüências podem se repetir por até algumas dezenas de vezes e, freqüentemente, exibem polimorfismo multi-alélico (Ferreira e Gratapaglia 1998). Para visualizar o polimorfismo nos microssatélites é realizada a amplificação das sequências repetidas pela reação em cadeia da polimerase (PCR), que utiliza pequenas seqüências de nucleotídeos como primers (Farah, 2000). Para isso, é mais indicado a seleção de primers específicos ou a transferência de primers heterólogos previamente testados (Francisco et al. 2006). 20 Os microssatélites podem ser separados em quatro classes: (i) perfeito, quando as seqüências são repetidas sem interrupção (GTGTGTGTGT); (ii) imperfeito, quando uma ou outra repetição apresenta uma base que não pertence à repetição (GTGTCGTGT); (iii) interrompido, quando há a inserção de um pequeno número de pares de bases entre as seqüências repetidas (GTGTGTAAAGTGT); e (iv) composto: quando dois ou mais microssatélites estão justapostos (CACACAGTGTGT) (Oliveira et al., 2006). Estas interrupções do tipo “ii, iii e iv” parecem estabilizar os microssatélites, visto que se observa menor incidência de erros durante a replicação nesses casos (Weber, 1990). Os microssatélites têm sido extremamente úteis em estudos populacionais, principalmente no que se refere às análises de relações de parentesco, variações espaciais intra-específicas e filogeografia (Sunnucks, 2000; Moritriz e Hills, 1996; Avise, 1989). A transferência de primers heterólogos de microssatélites é uma alternativa para a redução de tempo e de custos de seleção de primers específicos. Esta transferência se torna possível pela conservação de regiões que flanqueiam os microssatélites em espécies taxonomicamente próximas (Ferreira e Grattapaglia, 1998), mas há riscos de insucesso, sobretudo na detecção de alelos polimórficos. Atualmente há um grande número de estudos com microssatélites, incluindo vários com abelhas Meliponini (Chung et al., 1993; Butcher et al., 2001; Paxton et al., 2003; Peters, 2003; Jean-Chistophe et al., 2005; Francisco et al., 2006; Carvalho-Zilse e Kerr, 2006; Steiner et al., 2006; Thorén et al., 2007; Souza et al., 2007). Em muitos casos a transferência de primers entre espécies gerou resultados satisfatórios. Chung et al.(1993) transferiu com sucesso primers de bovinos para caprinos; Francisco et al. (2006) ressaltou que a transferência de primers heterólogos para Plebeia remota foi eficiente, apesar de revelar poucos alelos por loco; Carvalho-Zilse e Kerr (2006) utilizaram primers heterólogos entre espécies do gênero Melipona e o resultado foi satisfatório. 3.2 Estudos Populacionais Envolvendo Microssatélites Recentemente, a utilização dos microssatélites como marcadores moleculares em estudos populacionais e evolutivos tem sido bem sucedida em diversos organismos (Simonsen et al., 1998, Haavi et al., 2000, Clémencet et al., 2005). Arias et al. (2006) descreveram vários exemplos em que microssatélites e DNA mitocondrial (DNAmt) foram aplicados ao estudo de espécies de abelhas sociais. Os resultados obtidos já permitem formular hipóteses a cerca da filogenia, dinâmica populacional e evolução dos grupos de abelhas. Widmer et al. (1998) puderam constatar que populações de abelhas Bombus (Bombini) das ilhas Canárias (Bombus canariensis) e Madeira (Bombus maderensis) apresentavam grandes diferenças de afinidade com populações do continente próximo (Bombus terrestres), usando microssatélites e um loco do DNA mitocondrial do citocromo b. Com uso de microsatélites. Widmer e Schmid-Hempel (1999) detectaram diferenças consistentes entre 16 populações de Bombus pascuorum, que sustentavam o argumento de isolamento por processo de vicariância, causado pelo soerguimento dos Alpes. Em Meliponini, Francisco (2002) fez análises de DNAmt e microssatélites em Plebeia remota para estudos populacionais. O trabalho identificou diferenças genéticas entre amostras de populações de diferentes estados brasileiros (São Paulo, Paraná e Santa Catarina). Entretanto, mostrou que houve um baixo polimorfirmo na transferência de primers entre espécies. Werneck (2008) avaliou a influência de alelos nulos no sucesso sobre a transferência de sete primers para Melipona mandacaia, desenvolvidos para Melipona bicolor. Em estudos de populações de Partamona mulata e Partamona helleri (Meliponini), Brito (2005) observou baixa variabilidade genética nos locos de microssatélites de ambas as espécies e discreta estruturação genética dentro das populações locais. Segundo a autora, este último aspecto poderia ser conseqüência da fragmentação dos habitats de floresta ou de cerrados, áreas de distribuição das espécies. Em síntese, os microssatélites são muito úteis no estudo de diferenciações nas populações em grande escala ou escala geográfica e, provavelmente, também podem ser aplicados com sucesso na análise de estrutura de populações em menor escala espacial (populações locais ou em mosaico). No entanto, nos estudos com abelhas Meliponini tem sido observado baixo polimorfismo com a utilização de primers heterólogos, o que pode demandar maior esforço de caracterização de marcadores específicos em número adequado para análises robustas de estrutura espacial de populações. / Salvador, Bahia

Submitted by Ana Paula Macedo (ensino@ioc.fiocruz.br) on 2013-10-01T00:42:06Z No. of bitstreams: 1 Karla Bitencourth Garcia.pdf: 2108170 bytes, checksum: dc08fd06fd5448e7cada7447c8cb384a (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-01T00:42:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Karla Bitencourth Garcia.pdf: 2108170 bytes, checksum: dc08fd06fd5448e7cada7447c8cb384a (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / No Brasil, a principal doença em humanos na qual o carrapato atua como vetor é a Febre Maculosa Brasileira (FMB). No Rio de Janeiro (RJ), Amblyomma cajennense é uma das principais espécies vetoras de um dos bioagentes da FMB, e responsável pelo ciclo epidêmico da doença. A baixa especificidade parasitária de A. cajennense, resistência às adversidades climáticas, ampla distribuição geográfica, variação intra-específica, comportamento trioxêno e antropofílico enfatizam o importante papel dessa espécie na transmissão de patógenos para animais, estabelecendo ou mantendo ciclos enzoóticos, epizoóticos e epidêmicos. Apesar do seu impacto na saúde pública, é incipiente o conhecimento sobre os fatores que influenciam seu potencial patogênico e de transmissão de micro-organismos. Os objetivos foram: a) determinar sequências de DNA dos genes mitocondriais Dloop, Citocromo Oxidase II e 12SrDNA de A. cajennense de diferentes regiões do RJ; b) realizar análises filogeográficas e de estrutura de populações das sequências obtidas de cada gene; c) analisar, estatisticamente, se há associação entre a diversidade genética de A. cajennense e os casos de FMB no RJ. Foram processadas 314 amostras de A. cajennense, provenientes de 19 municípios de sete regiões fisiográficas do RJ. Todas as amostras foram submetidas à extração de DNA e amplificação, por PCR, dos três genes. Amostras positivas na PCR foram sequenciadas. As sequências de cada gene foram submetidas a análises filogeográficas e de estrutura de populações. Para verificar a associação entre os haplótipos de A. cajennense, sequências genéticas e a influência sobre o número de casos confirmados de FMB no RJ, foram realizados os cálculos do coeficiente de correlação por postos de Kendall e coeficiente de correlação parcial por postos de Kendall. As análises revelaram que há expressiva diversidade de A. cajennense no RJ, com o foco da diversidade genética nas regiões Serrana e Centro Sul. Entretanto, não há estruturação populacional dessa espécie de acordo com cada região do Estado. Porém, há indícios de estruturação populacional de A. cajennense entre grupos de regiões do RJ. As análises estatísticas revelaram que há associação entre o número de sequências analisadas e diversidade intra-específica. E ainda, quanto maior a diversidade dessa espécie, maior é a probabilidade de ocorrência de casos confirmados de FMB no RJ. / In Brazil, the most important tick-borne disease is Brazilian Spotted Fever (BSF). In Rio de Janeiro (RJ), Amblyomma cajennense is the major vector species of one of BSF bioagents, and responsible for the disease epidemic cycle. The A. cajennense low host specificity, resistance to adverse weather, wide geographic distribution, intraspecific variation, anthropophilic behavior and being a three host tick emphasizes the important role of these species in pathogens transmission to animals, establishing or maintaining enzootic, epizootic and epidemic cycles. Despite its impact on public health, the knowledge about factors that influence its pathogenic potential and transmission of micro-organisms are incipient. The objectives were: a) determine DNA sequences of mitochondrial genes Dloop, Cytochrome Oxidase II and 12SrDNA of A. cajennense from differents regions of RJ; b) perform phylogeographics and population’s structure analysis of sequences obtained for each gene; c) analyze, statistically, if there is an association between A. cajennense genetic diversity and cases of BSF in RJ. 314 samples of A. cajennense, coming from 19 municipalities of seven RJ physiographics regions, were processed. All samples were subjected to DNA extraction and amplification, by PCR, of the three genes. PCR positive samples were sequenced. The sequences of each gene were submitted to phylogeographics and population’s structure analysis. To investigate the association between A. cajennense haplotypes, genetic sequences and the influence on BSF confirmed cases in RJ, were performed calculation of the Kendall posts correlation coefficient and Kendall posts partial correlation coefficient. The analysis revealed that there is substantial diversity of A. cajennense in RJ, with the focus of genetic diversity in South Center and Highland regions. However, there is no population structure of these species according to each region of the State. But, there is evidence of A. cajennense population structure when analyzes are performed considering groups of RJ regions. Statistical analyzes revealed that there is association between the number of sequences analyzed and intraspecific diversity. Also, the greater is the diversity of these species, higher is the probability of BSF confirmed cases occurrence in RJ.

Tese (doutorado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2012 / Inclui bibliografias / O presente estudo caracterizou a variabilidade genética de uma amostra da população do Paraná utilizando dois sistemas genéticos distintos: A) um total de 820 indivíduos, não aparentados, foi analisado por marcadores autossômicos, empregando a amplificaçã / This study characterized the genetie variabihty of a sampie of the Paraná popuiation using two different genetic systems: A) a total of 820 individuais, riot related, were analyze through autosomal markers by employing the simultaneous amplification of 15

Il s agit d un travail de recherche sur la (re)constrution de l (des) identité(s) ethnique(s) chez les Wassu-Cocal, peuple indigène de l intérieur de l État d Alagoas (municipalité de Joaquim Gomes) qui a obtenu récemment (en 1986) la légitimité de son droit à la terre qu il occupait. Pour y arriver, ont été réalisées des études bibliographiques et documentales, auxquelles s ajoute la recherche sur le terrain réalisée chez les Wassu, où l on a pu faire des interviews et recueillir des récits oraux des genres les plus divers. Les Wassu-Cocal ont été mené à réinventer leur identité et leurs frontières ethniques (pour utiliser l expression de Barth) au cours du temps : changer pour survivre et rester. Soit dans le contact avec les blancs, avec les noirs, soit avec les autres peuples indigènes, les Wassu-Cocal ont dû lutter pour garder leurs éléments ethniques propres tout en participant activement de la société régionale et nationale. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este é um trabalho de pesquisa sobre a (re)construção da(s) identidade(s) étnica(s) entre os Wassu - Cocal, povo indígena do interior de Alagoas (município de Joaquim Gomes) que teve (1986) recentemente o direito à terra reconhecido. Para realizar tal intento, foram levados a efeito estudos bibliográficos e documentais a que se acrescenta o trabalho de campo junto aos Wassu, entre os quais foram colhidos entrevistas e relatos orais dos mais diferentes tipos. Os Wassu - Cocal têm reinventado sua identidade e suas fronteiras étnicas (para usar essa expressão de Barth) ao longo do tempo, mudando para permanecer. Seja no contato com os brancos, com os negros, seja com os outros povos indígenas, os Wassu - Cocal têm lutado para manter elementos étnicos distintivos mesmo participando ativamente da sociedade regional e nacional.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-20T17:50:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5909162 bytes, checksum: 9f05edecf504ec636d6e7854c86e097d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T17:50:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5909162 bytes, checksum: 9f05edecf504ec636d6e7854c86e097d (MD5) Previous issue date: 2007-09-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste estudo for desenvolver procedimentos para quantificar o volume de árvores e para estratificar as florestas, visando a classificação da capacidade produtiva e a modelagem do crescimento e da produção de plantios clonais de eucalipto não-desbastados. Para quantificar o volume de árvores foram utilizados dados de 2.036 árvores de clones comerciais de eucalipto pertencentes à empresa CAF Santa Bárbara, tendo sido ajustadas equações de volume para cada estrato (clone e região). Para cada árvore foi ajustado um modelo de taper. Posteriormente, foram realizados abates de três árvores de clones novos, que não possuíam equação de volume específica, sendo uma árvore pequena , uma média e uma grande em termos de dap e altura total. Com as três árvores cubadas foi ajustado o modelo de taper. De posse das estimativas dos parâmetros foi calculada uma medida de similaridade com os parâmetros dos modelos ajustados para as 2.036 árvores dos clones comerciais. A árvore do clone comercial que apresentou o menor valor de distância euclidiana, quando comparada com o clone novo, foi considerada a mais similar, portanto a equação de volume desse clone comercial foi usada para estimar o volume de árvores do novo clone. Este procedimento foi denominado método da similaridade de perfis. Para estratificação da floresta para fins de capacidade produtiva e modelagem do crescimento e da produção, foram utilizados dados de uma empresa do Estado da Bahia. O procedimento foi agrupar clones com características semelhantes em termos de crescimento em: volume, área basal, altura dominante e diâmetro médio, utilizando o método de agrupamento de Tocher, com a finalidade de obter estimativas de índice de local por grupos de clones. O procedimento mostrou-se eficiente e evidenciou a necessidade de estratificar florestas de eucalipto para estudos de capacidade produtiva. O estudo do crescimento e da produção mostrou −1 que o modelo V2 = V1 + β0 ⎛1 + β1e−β2I2 ⎞ − β0 ⎛1 + β1e−β2I1 ⎞ ⎜ ⎜ ⎟ ⎟ ⎝ ⎠ ⎝ −1 ⎠ ajustado por estrato de modelagem foi mais eficiente do que o modelo de Clutter, para fins de prognose de estoques volumétricos. Foi possível concluir que estimativas de crescimento e produção para clones que possuam menos de três medições podem ser realizadas por meio de modelos específicos por estrato ou de um modelo geral, porém esta decisão deve ser avaliada pelo modelador e pelo usuário. Para estudos de modelagem do crescimento e da produção é necessário grande interação entre modelador e usuário, para que se tenham estimativas volumétricas precisas e livres de tendência. / The objective of this study was to develop procedures to quantify the volume of trees and stratify forests aiming to classify the productive capacity and growth and yield modeling of clonal plantings of non-thinned eucalyptus. To quantify tree volume data from 2.036 trees from commercial eucalyptus clones were used, owned by CAF Santa Bárbara Company, with volume equations being adjusted for each stratum (clone and region). For each tree, a taper model was adjusted. Three trees from new clones without specific volume equation were then felled, classified as small , medium and large in terms of dap and total height. The taper model was adjusted to the three cubed trees. Based on the parameter estimates, a measurement of similarity with the parameters of the adjusted models was calculated for the 2.036 commercial clone trees. The commercial clone tree presenting the lowest Euclidian distance value when compared with the new clone was considered the most similar, thus the volume equation of this clone was used to estimate the tree volume of the new clone. This procedure was denominated profile similarity method. For forest stratification for purposes of productive capacity and growth and yield modeling, data from a company in the state of Bahia were used. The procedure consisted of grouping clones with similar traits in terms of growth in volume, basal area, dominant height, and mean diameter, applying the Tocher grouping method to obtain site index estimates per groups of clones. The procedure was found to be efficient, evidencing the need to stratify eucalyptus forests for yielding capacity studies. The growth and yield ⎛ −β I ⎞ V2 = V1 + β0 ⎜1 + β1e 2 2 ⎟ ⎝ ⎠ study −1 showed ⎛ −β I ⎞ − β0 ⎜1 + β1e 2 1 ⎟ ⎝ ⎠ −1 that the model adjusted by modeling stratum was more efficient than the Clutter model, for purposes of volumetric stocking prognosis. It could be concluded that growth and yield estimates for clones with less than three measurements can be carried out by means of specific models by stratum or applying a general model. However, this decision must be evaluated by the modeling agent and by the user. For growth and yield modeling studies, a great interaction between modeling agent and user is necessary to obtain precise and bias-free volumetric estimates.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-03-17T17:57:14Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 145268 bytes, checksum: 8cd1881bbadc0025cb67425dbdeaed7f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T17:57:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 145268 bytes, checksum: 8cd1881bbadc0025cb67425dbdeaed7f (MD5) Previous issue date: 2002-08-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste estudo foi avaliar o mecanismo de ação da cobertura morta sobre as populações de Brevicoryne brassicae (Linnaeus 1758) (Homoptera, Aphididae) e de Myzus persicae (Sulzer 1776) (Homoptera, Aphididae), em couve comum “Manteiga da Fazenda” (Brassica oleraceae var. acephala). Foram instalados três experimentos de campo na Horta Velha da Universidade Federal de Viçosa, Minas Gerais, Brasil, com delineamento de cinco blocos ao acaso com dois tratamentos. O primeiro experimento consistiu de dezesseis plantas em cada parcela e os dados foram coletados nas quatro plantas centrais de cada parcela. Cinco folhas/planta foram amostradas, assim como no segundo experimento. No segundo e terceiro experimentos usaram-se quatro plantas, cada uma plantada em vaso de polietileno de quatorze litros. O espaçamento foi de 0,80m x 0,80m entre plantas e 1,20m entre parcelas. Os tratamentos foram: A - cobertura de palha de arroz (1,056Kg Mseca/m2 com uma camada de 10cm) e B – testemunha. No primeiro experimento, as avaliações foram realizadas diariamente no período de 18 de outubro a 1o de novembro de 2001, eliminando-se diariamente os pulgões que chegavam às folhas. A temperatura máxima diária foi medida utilizando-se termômetros max-min. No segundo experimento, as avaliações foram realizadas entre 30 de maio e 13 de junho de 2002. Após os primeiros sete dias foram coletadas duas folhas de cada parcela para análise do teor de nutrientes, tendo os vasos de cada tratamento suas posições trocadas, eliminando-se os afídeos diariamente. No terceiro experimento, utilizou-se uma folha/planta do segundo experimento por parcela, na qual foi inoculado um alado de M. persicae, utilizando-se tela anti-afídica para garantir a permanência do alado inoculado e evitar a chegada de novos alados. A inoculação ocorreu no dia 12 de junho de 2002, permanecendo por um período de 15 dias, para então, efetuar-se a contagem final de alados, ninfas, adultos e colônias. Os resultados mostraram que a cobertura morta atrasou a chegada dos alados de B. brassicae e de M. persicae, aumentou a temperatura nas parcelas e, conseqüentemente, obtiveram-se menores populações de alados dos afídeos. Com a troca de ambiente, ocorreu uma interação significativa com o tratamento e a troca de posição dos vasos, o que implicou em alteração no número de pulgões. A taxa de crescimento da população de M. persicae aumentou significativamente nas parcelas testemunhas se comparada com o tratamento. / The objective of this study was to evaluate the mechanism of the action of rice- straw mulch on the populations of Brevicoryne brassicae (Linnaeus 1758) (Homoptera, Aphididae) and Myzus persicae (Sulzer 1776) (Homoptera, Aphididae), in common kale “Manteiga da Fazenda” (Brassica oleraceae var. acephala). Three field experiments were conducted in the Old Vegetable-Garden of the Federal University of Viçosa, Minas Gerais in a five randomized blocks with two treatments each. The first experiment consisted of sixteen plants in each plot and data were colleted from the four central plants of each plot, sampling five leaves per plant as in the second experiment. The second and third experiments used four plants, each one in a fourteen-liter polyethylene vase. In all experiments the plants were spaced by 0.80 m x 0.80 m between plants and 1.20 m between plots. The treatments were: A – rice- straw mulch (1.056Kg dryM/10 cm layer) and B – control. The first experiment was sampled every day from October 18 to November 1st in 2001 and the aphids were eliminated after each check. The daily maximum temperature was evaluated using a max-min thermometer. The second experiment was sampled from May 30 to June 12 and after first seven days of sampling two leaves of each plot were collected for nutrient content analysis and the vases of both treatments had their position exchanged. The landed aphids were eliminated every day. In the third experiment, one plant of each plot of the second experiment was inoculated with an alate aphid and in order to guarantee its permanence and avoid the landing of other aphids, an anti-aphid gauze was applied on the leaves. The inoculation occurred on June 12 in 2002 and the aphid was left there for fifteen days. After that time, alates, nymphs, adults and colonies were counted. The results showed that the mulch delayed the landing of alates of B. brassicae e M. persicae, elevated the temperature in the plots and consequently, fewer aphid populations occurred. An effective interaction with the treatment occurred when the vases had their position changed, as the number of aphids was also altered. The population growth rate of M. persicae was quite larger in control plots than in mulched plots.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-05T19:38:44Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 733129 bytes, checksum: 8bbca758a91929a69cd59c9b99926b7f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T19:38:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 733129 bytes, checksum: 8bbca758a91929a69cd59c9b99926b7f (MD5) Previous issue date: 2005-12-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cromossomos B são cromossomos extras ao complemento normal, que seguem suas próprias vias evolutivas, ou seja, têm um padrão de herança distinto do usual (mendeliano) entre os indivíduos que os carreiam. Na espécie Partamona helleri (Hymenoptera, Apidae) foram encontrados até quatro desses cromossomos. Esse trabalho apresentou como objetivos gerais investigar a origem molecular e os efeitos no "fitness" dos cromossomos B de P. helleri. Para facilitar a obtenção dos objetivos gerais, um marcador RAPD (Random Amplified Polimorfic DNA) associado a cromossomos B em P. helleri foi satisfatoriamente convertido em um marcador SCAR (Sequence Characterized Amplified Region), que se mostrou também associado a tais cromossomos. As análises evidenciaram que os cromossomos B de P. helleri se originaram de uma forma independente em relação aos cromossomos do complemento normal A da espécie. O processo de origem deve ter ocorrido no contexto evolutivo do gênero Partamona, em especial, no contexto evolutivo de um clado monofilético no qual se encontram, além de P. helleri, as espécies P. criptica, P. Cupira, P. rustica e P. mulata. A origem independente dos cromossomos B em relação ao complemento cromossômico normal A deve ter ocorrido por hibridização interespecífica, mas não fica descartada a possibilidade de elementos transponíveis participarem desse processo. Por fim, o trabalho não apontou efeito dos cromossomos B na assimetria dos indivíduos de P. helleri, permitindo concluir que indivíduos que apresentam cromossomos B não são mais assimétricos do que os indivíduos que não possuem tais cromossomos em P. helleri considerando o caráter asa anterior. Apesar de sugerirem uma origem interespecífica para os cromossomos B de P. helleri, os resultados apontam a necessidade de um maior número de estudos de citogenética e genética molecular das espécies do gênero Partamona para se ter maior clareza sobre a origem desses cromossomos. Apontam também, a necessidade de análises de outros caracteres morfológicos externos de P. helleri; bem como caracteres fenotípicos internos (fisiológicos) para se obter conclusões sobre os efeitos dos cromossomos B no "fitness" dos indivíduos e populações dessa espécie. / B chromosomes are additional chromosomes in relation to normal complement (A chromosomes) that presents your own evolutionary pathways and do not obey Mendelian laws of inheritance among individuals present them. In species Partamona helleri (Hymenoptera, Apidae) had been found until four B chromosomes. This work presents like general objectives obtain a better comprehension of molecular origin and fitness effects of P. helleri B chromosomes. In order to make easier general objectives an RAPD (Random Amplified Polimorfic DNA) marker associated with P. helleri B chromosomes was successful transformed in SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) marker, which also showed association with P. helleri B chromosomes. Analyses showed that P. helleri B chromosomes arise independently from A normal chromosomes. Origin process should be happen on Partamona genus evolutionary context, in special, on evolutionary context of an monophyletic clade where besides P. helleri, were found the species P. criptica, P. Cupira, P. rustica and P. mulata. B chromosomes independently origin in relation to normal xiiA chromosomes could be happen because interspecific hybridization, but there are possibility of transposable elements integrate the process. At last, this work did not point B chromosomes effects on asymmetry of P. helleri individuals; so it is possible conclude that individuals with B chromosomes are not more asymmetric than individuals without B chromosomes considering the character anterior wing. Despite results showed an interspecific origin to P. helleri B chromosomes, it pointed the necessity to do more citogenetics and molecular studies of Partamona species in order to clarify B chromosomes origin in evolutionary context of Partamona genus. The results pointed too the necessity of analyze others morphological and physiological characters of P. helleri in order to obtain conclusions about B chromosomes fitness effects in individuals and populations of this species.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-22T15:52:55Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 499099 bytes, checksum: 5bb06b169f3dc2aa0c73544a0257c612 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-22T15:52:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 499099 bytes, checksum: 5bb06b169f3dc2aa0c73544a0257c612 (MD5) Previous issue date: 2015-11-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho teve como objetivo estudar a associação entre os parâmetros que descrevem o potencial de populações e de suas combinações híbridas por meio da abordagem de genética de populações, baseada em dados de marcadores moleculares, com os obtidos por meio da abordagem de genética quantitativa, baseados em dados fenotípicos. Para isso, foram simuladas dez populações genitoras, com 200 indivíduos cada, em equilíbrio de Hardy- Weinberg, para 50 locos independentes e dois alelos codominantes por loco, e obtidas 45 populações híbridas a partir da combinação, aos pares, das dez populações genitoras. Os dados fenotípicos foram obtidos a partir da simulação de 12 variáveis quantitativas pela ação de alelos de 20 locos, selecionados ao acaso entre os 50 previamente simulados, com diferentes graus de herdabilidade, combinados com um efeito aditivo diferencial, de acordo com a importância do loco. As populações foram avaliadas quanto às medidas descritivas da estrutura genética da população e do grau de diferenciação entre pares de populações genitoras, a partir da abordagem de genética de populações, e quanto à complementação gênica, por abordagem de genética quantitativa, considerando aspectos da capacidade geral e específica de combinação. Houve, de modo geral, concordância de indicação de combinações híbridas mais e menos divergentes pelas medidas de dissimilaridade abordadas pela teoria de genética de populações e pode-se afirmar que é possível predizer a diversidade genética de combinações híbridas a partir da avaliação da diversidade genética de suas populações genitoras. Observou-se que, em características de efeito aditivo, a escolha de genitores com maior frequência de alelos favoráveis pode ser feita com base em suas médias fenotípicas apenas, sem a necessidade de realização de cruzamentos dialélicos. Além disso, pela abordagem de genética de populações, houve coincidência de 75% na recomendação das populações genitoras potenciais ao melhoramento genético. Nesse sentido, pode-se concluir que a associação da abordagem de genética de populações às informações quantitativas pode incrementar o ganho no melhoramento genético. / This work aimed to study the association between the parameters describing the potential of people and their hybrid combinations by means of population genetics approach, based on molecular marker data, with those obtained through quantitative genetic approach, based on phenotypic data. For this, ten progenitors populations were simulated, with 200 individuals each, in Hardy-Weinberg to 50 independent loci and two codominant alleles per locus, and obtained 45 hybrid populations from the combination, in pairs, of ten progenitors populations. Phenotypic data were obtained from the simulation of 12 quantitative variables by the action of alleles from 20 loci, selected randomly among the 50 previously simulated, with different degrees of heritability, combined with a differential additive effect, according to the importance of the locus. The populations were evaluated for descriptive measures of the genetic structure of the population and the degree of differentiation between pairs of progenitors populations from the population genetics approach, and on the genetic complementation, by approach of quantitative genetics, considering aspects of general and specific combining ability. There was, in general, agree indication of more and less divergent hybrids by dissimilarity measures addressed by the theory of population genetics and it can be affirmed that it is possible to predict the genetic diversity of hybrids from the evaluation of their progenitor populations genetic diversity. It was observed that for the additive effect characteristics, the choice of progenitors with highest frequency of favorable alleles can be made based on their phenotypic medium only, without the need of performing diallel. In addition, by the population genetic approach, there was agreement on the recommendation of 75% of the population potential progenitors to genetic improvement. In this sense, it can be concluded that the association of population genetics approach to quantitative information can increase the gain in plant breeding.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-09T11:38:42Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1366815 bytes, checksum: e55dd0e75111b9659cea0ea9e06c81fc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-09T11:38:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1366815 bytes, checksum: e55dd0e75111b9659cea0ea9e06c81fc (MD5) Previous issue date: 2010-09-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Neste estudo foi investigado como a sazonalidade e o impacto ambiental afetam a composição e a estrutura de comunidades de Odonata, testando as seguintes hipóteses: 1) a modelagem de distribuição potencial de espécies pode ser útil como uma ferramenta para prever alteração ambiental; 2) mudanças na paisagem decorrentes do processo de antropização afetam a distribuição e o padrão de diversidade beta de Odonata; 3) a sazonalidade afeta a distribuição e o padrão de riqueza em Odonata. O estudo foi realizado em riachos da Bacia do Rio Pindaíba, Mato Grosso, com coletas no período de seca e chuva entre 2005 e 2009. A amostragem de Odonata foi feita pelo método de varredura com áreas fixas. Os resultados mostraram que: 1) o modelo de distribuição predisse uma maior quantidade de famílias e de espécies para todos os locais, em relação aos dados de validação, o que foi atribuído a restrições de hábito e horário de atividades das espécies e esforço amostral. O uso de modelos pode ser uma estratégia importante para análises de biodiversidade em sistemas com poucas informações históricas de distribuição biogeográfica; 2) o padrão de substituição foi dominante para Anisoptera e Zygoptera mesmo em áreas com menor integridade do habitat. O aumento do aninhamento no grupo Anisoptera e o padrão inverso para Zygoptera poderia resultar de níveis diferentes de especialização desses grupos, gerando um padrão diferente de espécies únicas nos dois sistemas; 3) a maior riqueza de Odonata na estação chuvosa, mostra padrão inverso de estudos na Mata Atlântica, sugerindo que Odonata em rios de Cerrado foram menos controlados por restrições de temperatura. A variação na temperatura da água atua como um fator de estresse na dinâmica da comunidade e diminui o número de espécies não adaptadas a condições ambientais severas ao favorecer a sincronização das demais devido à similaridade ecológica. / In this study, I investigated how seasonality and environmental impacts affect the composition and structure of Odonata communities, testing the following hypotheses: 1) the potential species distribution modeling can be useful as a tool to predict environmental changes; 2) changes in the landscape deriving from anthropization affect the distribution and pattern of beta diversity of Odonata; 3) seasonality causes effect in the distribution and richness pattern of Odonata. The study was carried out in streams of river Pindaíba basin, Mato Grosso, with samplings in the dry and rainy seasons, between 2005 and 2009. Sampling of Odonata was done by fixed-areas scan method. Results showed that 1) the distribution model predicted a greater quantity of families and species at all sites in relation to validation data. This result was attributed to habit and species activity hour constraints and sampling effort. However, the use of models can be an important strategy for biodiversity analyses in systems with few historic information about biogeographic distribution; 2) the turnover pattern was dominant for Anisoptera and for Zygoptera, even in areas with smaller integrity. Increase of nestedness in Anisoptera, and the inverse pattern in Zygoptera, can be the result of different levels of specialisation of these groups, producing an unbalanced pattern of unique species in the two systems; 3) the greater richness of Odonata was found in the rainy season, which is an inverse pattern in relation to previous studies in Atlantic Forest, suggesting that Odonata in Cerrado rivers were less controlled by temperature constraints. Finally, it was showed that variation in water temperature acts as a stressing factor in community dynamics, decreasing the number of species that are not adapted to severe environmental conditions, favouring the synchrony of the remaining species due to ecological similarity.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-08-11T13:11:35Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2693728 bytes, checksum: 8cb30fc8b072b2c0a7df5fe9cea6a054 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-11T13:11:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2693728 bytes, checksum: 8cb30fc8b072b2c0a7df5fe9cea6a054 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O gênero Metarhizium é amplamente conhecido por sua capacidade entomopatogênica. No entanto, recentemente também foi reconhecido como simbionte de planta, capaz de transferir nitrogênio de cadáveres de insetos para plantas, atuar como antagonista de fitopatógenos e promover o crescimento vegetal. Essas funções podem ser consideradas como serviços de ecossistema que podem ser fornecidos por esses fungos para plantas em sistemas de cultivos sustentáveis. Todavia, esses fungos são pouco considerados no contexto ecológico e dados sobre sua diversidade em solos agrícolas e na rizosfera são muito escassos, especialmente em ecossistemas tropicais. Além disso, nenhum método molecular para detectar e quantificar especificamente Metarhizium em associação com sistema radicular está disponível. Dessa forma, nesta tese nós focamos no estabelecimento de um método para detectar e quantificar Metarhizium em raízes de plantas e na investigação de sua diversidade em cultivos de café agroflorestal e pleno sol. Nós estabelecemos um método baseado na reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) confiável e reprodutível para detectar e quantificar Metarhizium em raízes de plantas. Tal método foi verificado por meio de detecção via método dependente de cultivo e microscopia confocal. Considerando a diversidade de Metarhizium em solos agroflorestais e pleno sol, nós encontramos três espécies, sendo que M. robertsii foi a espécie mais frequente em ambos sistemas. Ao comparar a diversidade entre os sistemas agroflorestais e pleno sol, duas das três agroflorestas amostradas apresentaram maior diversidade de Metarhizium e a diversidade total, considerando as seis áreas, também foi maior nas agroflorestas. A população de M. robertsii foi dividida em três diferentes clados, porém nenhum padrão de distribuição ou recombinação foi observado em relação aos mesmos. Com a relação à diversidade de Metarhizium na rizosfera, M. robertsii também foi a espécie mais abundante, sendo encontrada em todos os grupos de plantas amostrados. Metarhizium pemphigi foi a mais frequente na rizosfera de plantas de café, indicando a possibilidade de sua especialização ecológica em relação às raízes de café. Nós fornecemos resultados importantes sobre a associação de Metarhizium no solo e em associação com plantas, incluindo: (i) um método de laboratório pra estudar associação Metarhizium-raiz, (ii) a diversidade de Metarhizium no solo em dois sistemas de cultivo e (iii) a diversidade de Metarhizium na rizosfera de plantas presentes em sistema de cultivo diversificado. / The Metarhizium genus is widely recognized for its entomopathogenic capacity, but more recently was recognized as a plant symbiont, being able to transfer nitrogen from insect cadavers to plants, act as plant pathogen antagonist and plant growth promoter. All those functions could be valuable as ecosystem services provided by these fungi to plants in sustainable agricultural schemes. However, these fungi are poorly considered in an ecological context and data about their diversity and abundance in agricultural soils and in association with plant rhizosphere are very sparse, especially in tropical ecosystems. Also, considering the ability to form mutualistic association with plants, no Metarhizium’s specific molecular method is available to detect and quantify association in plant root systems. Given this, in this thesis we focused in the establishment of a method to detect and quantify Metarhizium in plant roots and investigate its diversity in coffee based agroforestry and full sun systems. In doing so, we aimed to provide a better understanding of Metarhizium ́s association with plants, to get a better insight of how its inter- and intraspecific diversity is distributed in soils of coffee agroforestry and full sun soils and to understand how Metarhizium species are distributed in the rhizosphere of coffee plants and non-crop plants in a coffee agroforestry system. We established a reliable and reproducible real-time polymerase chain reaction (qPCR) method to quantify and detect Metarhizium in plant roots and also detect the association through cultivation methods and confocal microscopy. In the surveys from the diversity of Metarhizium in soils from agroforestry and full sun coffee systems, we found three Metarhizium species, M. robertsii being the most prevalent of these. Comparing the diversity between agroforestry and full-sun systems we found higher diversity in agroforestry systems in two of the three sampled fields, and overall diversity was also higher in agroforestry. The M. robertsii population exhibited presented three clades and no specific distribution pattern and recombination was observed in the clades. Regarding Metarhizium diversity in the rhizosphere, M. robertsii was also the most abundant species and was present in all groups of surveyed plants, M. pemphigi presented the highest levels in the coffee rhizosphere indicating a possible ecological specialization of this species to coffee roots. We provided important findings regarding the association of the insect pathogen Metarhizium when in association with plants, including: (i) a laboratory method to study the Metarhizium-plant association, (ii) the diversity of Metarhizium in soil and its comparison between agricultural systems and (iii) the Metarhizium diversity in the rhizosphere of crop and non-crop plants in a biodiverse agroecosystem.