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Verossimilhança hierárquica em modelos de fragilidade / Hierarchical likelihood in frailty modelsAmorim, William Nilson de 12 February 2015 (has links)
Os métodos de estimação para modelos de fragilidade vêm sendo bastante discutidos na literatura estatística devido a sua grande utilização em estudos de Análise de Sobrevivência. Vários métodos de estimação de parâmetros dos modelos foram desenvolvidos: procedimentos de estimação baseados no algoritmo EM, cadeias de Markov de Monte Carlo, processos de estimação usando verossimilhança parcial, verossimilhança penalizada, quasi-verossimilhança, entro outros. Uma alternativa que vem sendo utilizada atualmente é a utilização da verossimilhança hierárquica. O objetivo principal deste trabalho foi estudar as vantagens e desvantagens da verossimilhança hierárquica para a inferência em modelos de fragilidade em relação a verossimilhança penalizada, método atualmente mais utilizado. Nós aplicamos as duas metodologias a um banco de dados real, utilizando os pacotes estatísticos disponíveis no software R, e fizemos um estudo de simulação, visando comparar o viés e o erro quadrático médio das estimativas de cada abordagem. Pelos resultados encontrados, as duas metodologias apresentaram estimativas muito próximas, principalmente para os termos fixos. Do ponto de vista prático, a maior diferença encontrada foi o tempo de execução do algoritmo de estimação, muito maior na abordagem hierárquica. / Estimation procedures for frailty models have been widely discussed in the statistical literature due its widespread use in survival studies. Several estimation methods were developed: procedures based on the EM algorithm, Monte Carlo Markov chains, estimation processes based on parcial likelihood, penalized likelihood and quasi-likelihood etc. An alternative currently used is the hierarchical likelihood. The main objective of this work was to study the hierarchical likelihood advantages and disadvantages for inference in frailty models when compared with the penalized likelihood method, which is the most used one. We applied both approaches to a real data set, using R packages available. Besides, we performed a simulation study in order to compare the methods through out the bias and the mean square error of the estimators. Both methodologies presented very similar estimates, mainly for the fixed effects. In practice, the great difference was the computational cost, much higher in the hierarchical approach.
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Travessias do beco: a educação pelas quebradas / Crossings of the alley: education through the gulliesTorres, Fabiano Ramos 14 October 2016 (has links)
Este ensaio propõe o rolê pelas periferias como experiência de pensamento. Periferias da cidade, da escola, do desejo e do saber. Compreendido como prática de se deslocar, dar uma volta, um passeio descompromissado pela cidade, o rolê é prática aberta aos riscos e perigos do caminho. O que se propôs neste trabalho foi uma travessia dos signos e acontecimentos de uma outra aprendizagem presente nas periferias da cidade, onde o aprendizado da sobrevivência diz respeito a uma espécie de pedagogia da crueldade que relaciona o sofrimento e a alegria na resistência das invenções cotidianas. Nessa travessia, a experiência do rolê é desdobrada também no interior da escola, considerando que esta possui seus becos e vielas, suas periferias de onde emergem os restos, as sobras, o que ficou de fora, o torto, o estranho, o esquisito, o sem sentido, o ilógico, o monstro e a aberração pedagógica. A travessia do beco, apresenta-se, deste modo, como alegoria da sobrevivência e é compreendida como a via periculosa em que o corpo é convocado a explorar suas potências. Para tanto, foram elaborados para essa pesquisa, dispositivos de escuta do acontecimento e da produção aberrante - esta, compreendida como materiais e matérias infames, elementos desprezados seja no cotidiano da escola ou da cidade. Assim, os signos e acontecimentos, presentes na vida dos jovens e adolescentes das periferias, como as jornadas de junho, o rolezinho, o fluxo do funk e ocupações de escola, bem como as pichações escolares, os blocos sonoros inarticulados, os desenhos, as frases, assinalam saberes insurrectos e instituintes que relacionam, agonisticamente, as periferias da cidade e a escola formal. A ficção pedagógica produzida na experiência de pensamento do rolê figura, então, como fabulação operante na elaboração das produções aberrantes, possibilitando capturar o indizível no dizível, o invisível naquilo que é visto e o impensado nisso tudo que nos atravessa na travessia dos becos. Isso nos permite escutar uma outra história da educação escolar e da cidade, entendendo a relação entre o insignificante, o inexplicável, o absurdo e outras tensões muitas vezes insuportáveis, tanto para o corpo escolar como para a cidade. A cartografia desta produção é uma cartografia do processo desejante que abre janelas para o devir das instituições escolares e dos estratos da cidade, estabelecendo vias de comunicação com o fora, colocando a subjetividade em questão e mostrando como é possível a invenção de novos processos de constituição de si e do viver-junto. Tal como os errantes das cidades recusam a submissão ao controle total dos planos urbanísticos, assim também os alunos recusam os planejamentos da arquitetura do saber: o que se identificou durante o rolê pelas periferias da escola, foi que junto ao não constantemente proferido pelo jovem e ao jovem, está presente o sim e a afirmação da vida marcada pela agonística das sobrevivências: de um lado, a falta, de outro, a produção. O aprendizado que o rolê pelas periferias proporcionou enquanto experiência de pensamento foi o da invenção conceitual necessária à construção de uma lógica do aberrante. / This essay proposes the rolê (jaunt, ramble, wandering) through the peripheries as a thought experiment. Peripheries of the city, of the school, of desire and of knowledge. Perceived as a practice of moving, walking around, a casual outing through the city, the rolê is the practice subject to the risks and dangers of the pathway. What has been proposed in this work is a crossing of the signs and happenings of another learning, present in the edges of the city, where the learning of survival refers to a kind of pedagogy of cruelty, which relates the suffering to the joy in the resistance of everyday inventions.In this crossing, the experience of the rolê also unfolds within the school, considering that the school has its alleys and lanes, its peripheries from where the remainders, the leftovers, what was left aside, the astray, the weird, the strange, the nonsense, the illogical, the monster and the pedagogical aberration emerge. Thus, the alleys crossing appears as an allegory of survival and is understood as the via periculosa (perilous road) in which the body is convoked to explore its potencies. For the purpose of this research, listening devices have been elaborated to give ear to the happening and to the aberrant production which is comprehended as infamous materials and matters, elements that were despised whether in the citys or the schools daily life.Therefore, the signs and happenings present in the life of peripheral youngsters and teenagers, such as the massive protests of June 2013, the rolezinho, the flow of Brazilian funk and the occupations of public schools, as well as the graffiti writings inside the schools, the indistinct sound blocks, the drawings, the sentences indicate insurrect, instituting knowledges that link, agonistically, the citys peripheries and formal schooling. Consequently, the pedagogic fiction produced in the rolês thought experiment appears as a fable-making that operates on the elaboration of aberrant productions, making it possible to capture the unspeakable within the speakable, the invisible within the visible and the unthought within all this which runs us through in the alleys crossings. This enables us to listen to another story of the scholar and the urban education, understanding the relation between the insignificant, the inexplicable, the absurd and other often unbearable tensions, both to the scholar body and to the city.This productions cartography is a cartography of the desirous process that opens windows to the becoming of scholar institutions and of the city strata, establishing communication channels with the outside, calling into question subjectivity and showing how the invention of new processes of constitution of oneself and of the living-together is possible.Just as the wanderers of the cities refuse to submit to the total control of the urbanistic plans, also the students refuse the plannings of the architecture of knowledge: what has been identified during the rolê through the peripheries of the school was that, along with the no constantly enunciated by the yougster and to the youngster, the yes and the affirmation of life are present, marked by the agonistic of survivals: on one hand, the lack; on the other, production. The learning provided by the rolê through the peripheries, as a thought experiment, was one of the conceptual invention, necessary to the construction of an aberrant logic.
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Secreção de vasopressina e ocitocina após estímulo osmótico e hipovolêmico em animais sobreviventes à sepse / Vasopressin and oxytocin secretion after osmotic and hypovolemic stimuli in sepsis surviving animalsTazinafo, Lucas Favaretto 14 November 2014 (has links)
Vários estudos clínicos e experimentais relatam o aumento das concentrações plasmáticas de vasopressina (AVP) na fase inicial da sepse, como tentativa de restabelecer a pressão sanguínea que nesta fase começa a diminuir. Porém em uma fase mais tardia da doença, as concentrações do hormônio estão reduzidas mesmo sob um quadro de hipotensão progressiva, um dos principais estímulos para aumento da secreção deste hormônio. Este padrão de secreção hormonal alterada também parece ocorrer com o outro hormônio neurohipofisário, ocitocina (OT). O objetivo deste trabalho foi analisar a secreção dos hormônios AVP e OT, após estímulos osmótico e hipovolêmico em animais sobreviventes à sepse. A sepse foi induzida pelo método de ligação cecal e punção (CLP) (1 perfuração com agulha 14G) e os animais observados por 10 dias. Os sobreviventes foram submetidos à estímulo osmótico por desidratação (retirada de água para beber da gaiola) por dois dias, ou hipovolêmico por injeção intraperitoneal (i.p) de Polietileno glicol (PEG) (PEG-4000, 200mg/ml de PBS) por 90 minutos. Os animais controles foram hidratados ou receberam injeção intraperitoneal de PBS 0,01M. Após os estímulos, os animais foram decapitados para coleta de sangue e neurohipófise, para as análises de hematócrito, sódio sérico, osmolalidade plasmática, e dosagem hormonal de AVP e OT plasmática e neurohipofisária. Resultados: Os animais sobreviventes à sepse mantiveram a capacidade de responder aos estímulos com relação à secreção de AVP. Porém estes animais apresentaram uma secreção diminuída de OT após desidratação embora nenhuma alteração de secreção aparente ao estímulo volêmico. Conclusão: Animais sobreviventes à sepse apresentam alterações no padrão de resposta hormonal do eixo hipotálamoneurohipofisário ao estímulo osmótico sem aparente alteração quando o estímulo é volêmico, sugerindo que seus osmorreceptores encontram-se alterados / Many clinical and experimental studies reported the increase of plasma vasopressin (AVP) concentration in the early phase of sepsis, as an attempt to restore blood pressure that begins to decrease at this stage. However, in a later stage of the disease, the hormone concentrations are reduced even under a state of progressive hypotension, one of the major stimulus for the increase of secretion of this hormone. This pattern of impaired hormonal secretion during sepsis also seems to happen to the other pituitary hormone, oxytocin (OT). The aim of this study was to evaluate the secretion of the hormones AVP and OT after osmotic and hipovolemic stimuli in sepsis surviving animals. Sepsis was induced by cecal ligation and perforation (CLP) (1 perforation with 14G needle) and the animals observed for 10 days. The survivors were submited to osmotic stimulus by dehydration (privation of drinking water from the Cage) for two days, or hipovolemic by intraperitoneal (i.p) injection of polyethylene glycol (PEG) (PEG-4000, 200mg/ml of PBS) for 90 minutes. The control animals were hydrated or that received intraperitoneal injection of PBS 0,01M. After the stimuli, the animals were decapitated for the collection of blood and neurohypophysis, for the analysis of hematocrit, serum sodium, plasma osmolality and hormonal analysis of AVP and OT in the plasma and neurohypophysis. Results: Sepsis surviving animals maintained the capacity of answering the stimulus with AVP secretion. But these animals presented a lowered secretion of OT after dehydration, while they presented no alterations in secretion after volemic stimulus. Conclusion: Sepsis surviving animals presented alterations in the pattern of hormonal answer for the osmotic stimulus, with lowered secretion of OT, apparently there are no alterations in the pattern of a hormonal secretion after hypovolemia.
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O impacto das distâncias institucionais na sobrevivência de subsidiárias estrangeiras / The impact of institutional distances on the survival of foreign subsidiariesSouza, Fábio Cássio de 26 February 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-02-26 / The survival of the subsidiary is an important indicator of the success of foreign investments.
Several studies focus efforts on survival testing. The institutional approach
emerges as an alternative research topic. However, they are generally restricted to
few national institutional distances. This research is intended to contribute to the
literature examining the impact of nine institutional distances (ID) on the survival of
subsidiary in a different continent than the parent. In addition, it investigates the local experience and its
reducing national institutional distances. The hypotheses were
tested in 1,650 observations of subsidiaries in 36 countries, in a longitudinal study in the period
of 2007-2014. The hazard ratio was implemented with the Cox Regression for the
execution. The models indicated effectiveness with a high degree of significance. The results
suggest that national DIs have a significant impact on survival. Between the nine DI
examined, six evidence of survival risk related to administrative aspects,
demographic, political, knowledge, global and cultural. Local experience also
plays a relevant role for continuity, however, it is not able to moderate DI for
the survival of the subsidiary. It is hoped that this evidence can provide important
information for the strategic process and contribute to the success and survival of
international operations. / A sobrevivência da subsidiária é importante indicador de sucesso de investimentos estrangeiros.
Diversos estudos concentram esforços no exame da sobrevivência. A abordagem institucional
surge como uma alternativa de investigação do tema. No entanto, são geralmente restritos a
poucas distâncias institucionais nacionais. Esta investigação tem o intuito de contribuir para a
literatura ao examinar o impacto de nove distâncias institucionais (DI) na sobrevivência da
subsidiária em continente diferente da matriz. Além disto, investiga a experiência local e seu
efeito moderador na redução das distâncias institucionais nacionais. As hipóteses foram
testadas em 1.650 observações de subsidiárias em 36 países, em estudo longitudinal no período
de 2007-2014. A Taxa de Risco (hazard ratio) foi implementada com a Regressão Cox para a
execução. Os modelos indicaram efetividade com alto grau de significância. Os resultados
sugerem que as DI nacionais impactam significativamente na sobrevivência. Entre as nove DI
examinadas, seis evidenciam o risco à sobrevivência relacionados aos aspectos administrativos,
demográficos, políticos, conhecimento, global e cultural. A experiência local também
desempenha papel relevante para a continuidade, entretanto, não é capaz de moderar as DI para
a sobrevivência da subsidiária. Espera-se que estas evidências possam fornecer importantes
informações para o processo estratégico e contribuir para o sucesso e sobrevivência das
operações internacionais.
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Uso de métodos bayesianos na análise de dados de sobrevida para pacientes com câncer na mama na presença de censuras, fração de cura e covariáveis / Use of Bayesian methods in the analysis of survival data for pacients with breast cancer in presence of censoring, cure fraction and covariatesTatiana Reis Icuma 10 June 2016 (has links)
Introdução: A maior causa de mortes no mundo é devido ao câncer, cerca de 8,2 milhões em 2012 (World Cancer Report, 2014). O câncer de mama é a forma mais comum de câncer entre as mulheres e a segunda neoplasia mais frequente, seguida do câncer de pele não melanoma, representando cerca de 25% de todos os tipos de cânceres diagnosticados. Modelos estatísticos de análise sobrevivência podem ser úteis para a identificação e compreensão de fatores de risco, fatores de prognóstico, bem como na comparação de tratamentos. Métodos: Modelos estatísticos de análise de sobrevivência foram utilizados para evidenciar fatores que afetam os tempos de sobrevida livre da doença e total de um estudo retrospectivo realizado no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, referente a 54 pacientes com câncer de mama localmente avançado com superexpressão do Her-2 que iniciaram a quimioterapia neoadjuvante associada com o medicamento Herceptin® (Trastuzumabe) no período de 2008 a 2012. Utilizaram-se modelos univariados com distribuição Weibull sem e com a presença de fração de cura sob o enfoque frequentista e bayesiano. Utilizou-se modelos assumindo uma estrutura de dependência entre os tempos observados baseados na distribuição exponencial bivariada de Block Basu, na distribuição geométrica bivariada de Arnold e na distribuição geométrica bivariada de Basu-Dhar. Resultados: Resultados da análise univariada sem a presença de covariáveis, o modelo mais adequado às características dos dados foi o modelo Weibull com a presença de fração de cura sob o enfoque bayesiano. Ao incorporar nos modelos as covariáveis, observou-se melhor ajuste dos modelos com fração de cura, que evidenciaram o estágio da doença como um fator que afeta a sobrevida livre da doença e total. Resultados da análise bivariada sem a presença de covariáveis estimam médias de tempo de sobrevida livre da doença para os modelos Block e Basu, Arnold e Basu-Dhar de 108, 140 e 111 meses, respectivamente e de 232, 343, 296 meses para o tempo de sobrevida total. Ao incorporar as covariáveis, os modelos evidenciam que o estágio da doença afeta a sobrevida livre da doença e total. No modelo de Arnold a covariável tipo de cirurgia também se mostrou significativa. Conclusões: Os resultados do presente estudo apresentam alternativas para a análise de sobrevivência com tempos de sobrevida na presença de fração de cura, censuras e várias covariaveis. O modelo de riscos proporcionais de Cox nem sempre se adequa às características do banco de dados estudado, sendo necessária a busca de modelos estatísticos mais adequados que produzam inferências consistentes. / Introduction: The leading worldwide cause of deaths is due to cancer, about 8.2 million in 2012 (World Cancer Report, 2014). Breast cancer is the most common form of cancer among women and the second most common cancer, followed by non-melanoma skin cancer, accounting for about 25% of all diagnosed types of cancers. Statistical analysis of survival models may be useful for the identification and understanding of risk factors, prognostic factors, and the comparison treatments. Methods: Statistical lifetimes models were used to highlight the important factors affecting the disease-free times and the total lifetime about a retrospective study conducted at the Hospital das Clinicas, Faculty of Medicine, University of São Paulo, Ribeirão Preto, referring to 54 patients with locally advanced breast cancer with Her-2 overexpression who started neoadjuvant chemotherapy associated with the drug Herceptin® (Trastuzumab) in the time period ranging from years 2008 to 2012. It was used univariate models assuming Weibull distribution with and without the presence of cure fraction under the frequentist and Bayesian approaches. It was also assumed models assuming a dependence structure between the observed times based on the bivariate Block-Basu exponential distribution, on the bivariate Arnold geometric distribution and on the bivariate Basu-Dhar geometric distribution. Results: From the results of the univariate analysis without the presence of covariates, the most appropriate model for the data was the Weibull model in presence of cure rate under a Bayesian approach. By incorporating the covariates in the models, there was best fit of models with cure fraction, which showed that the stage of the disease was a factor affecting disease-free survival and overall survival. From the bivariate analysis results without the presence of covariates, the estimated means for free survival time of the disease assuming the Block- Basu, Arnold and Basu-Dhar models were respectively given by 108, 140 and 111; for the overall survival times the means were given respectively by, 232, 343, 296 months. In presence of covariates, the models showed that the stage of the disease affects the disease-free survivals and the overall survival times. Assuming the Arnold model, the covariate type of surgery also was significant. Conclusions: The results of this study present alternatives for the analysis of survival times in the presence of cure fraction, censoring and covariates. The Cox proportional hazards model not always is apropriate to the database characteristics studied, which requires the search for more suitable statistical models that produce consistent inferences.
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Proposta de programa de survivability de aeronaves para a aviação de segurança pública brasileira, com ênfase em aspectos jurídicosHérlon Conceição Santos Lima 27 April 2012 (has links)
A Survivability de aeronaves é uma forma de pensar a operação, estabelecendo requisitos que aumentem primordialmente a perspectiva de sobrevivência de aeronaves e de suas tripulações. Existem vários caminhos a serem perseguidos por essa forma peculiar de pensar e respeitar a operação, com vistas a que se atinja o mesmo objetivo. A Survivability pode ser pensada desde a fase de definição conceptual até a escolha de emprego operacional a ser utilizada, passando pela configuração dos equipamentos trazidos a bordo e o tipo de missão, dentre outros. No ambiente de guerra, mais comumente, esse conceito vem sendo empregado, partindo de bases sólidas e estudos consistentes como os realizados pelo Professor Robert Ball, na Naval Postgraduate School. No ambiente de Segurança Pública, essa forma de pensar e respeitar a operação ainda não foi introduzida, embora exista grande similaridade entre o ambiente hostil de guerra e as condições extremas de operação da Segurança Pública. A Filosofia de Survivability de Aeronaves na Segurança Pública surge como uma alternativa para o aumento da probabilidade de sucesso da missão, compreendida como o cumprimento da mesma, da forma mais efetiva, com a mitigação de danos para a aeronave e o menor risco para a tripulação. Sob a óptica da Survivability, é fomentada a discussão sobre alguns aspectos relevantes atrelados, principalmente, a projetos, aquisição, operação e manutenção de aeronaves que atendam a missão de Segurança Pública no Brasil, sem desconsiderar os aspectos de segurança operacional aeronáutica atrelados. A Aviação de Segurança Pública no Brasil está passando por um momento importante na sua história; ações que modificam positivamente a sua fisionomia estão sendo implementadas. Esforços institucionais, no âmbito federal e no estadual, estão sendo adotados para que a Aviação de Segurança Pública solidifique ainda mais as suas bases, tornando-se mais efetiva, mais segura em observância do atendimento do cumprimento da necessidade da missão. Desta forma, este trabalho propõe a aderência à Filosofia de Survivability, através da implementação de um programa específico, como alternativa viável para a Aviação de Segurança Pública, na medida em que o seu ambiente de operação ocorre em condições extremas e há a necessidade de se promover medidas seguras que garantam a incolumidade do patrimônio público, ou seja, da aeronave, e a incolumidade das tripulações envolvidas, ou seja, dos agentes a serviço do poder público. Ao final, apresentam-se as linhas gerais de um programa de Survivability de Aeronaves, bem como uma proposta de legislação específica que atenda às necessidades do setor de Segurança Pública.
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Distribuição Inversa Weighted Lindley: propriedades, estimadores e uma aplicação em dados de tempo de falha / The Inverse Weighted Lindley Distribution: properties, estimation and an application on a failure time dataLuiz, Aline Oliva 04 May 2018 (has links)
Quando considerado o funcionamento de uma aeronave em operação de voo para transporte de passageiros civis, há a ocorrência de falhas que podem afetar a aeronavegabilidade ou não e, dentro das falhas que não afetam,encontram-se,por exemplo,as falhas de recursos utilizados durante o voo pelos passageiros, como poltronas ou sistema de entretenimento de bordo. É notória a importância de uma análise em relação ao diagnóstico de falhas que possuem maior impacto na satisfação do cliente, assim como de uma tomada de medidas de manutenção preventiva para que tais ocorrências sejam minimizadas. Como resultado, entre as 16 principais falhas que ocorrem, apenas 4 falhas caracterizam-se como sendo de maior impacto. É nesse sentido que o principal objetivo deste trabalho é descrever o tempo de falha desses principais componentes. Para tanto, ajustamos diferentes distribuições de probabilidade que descrevem o comportamento dessas falhas.Levando-se em conta que em um tipo de falha os principais modelos utilizados na literatura como Weibull, Gamae Log-normal não são os mais adequados para descrever tal característica, propomos um novo modelo de confiabilidade intitulado Inversa Lindley Ponderada. As propriedades matemáticas e os métodos de estimação dos parâmetros dessa nova distribuição são exploradas ao longo dessa dissertação. O modelo é utilizado para descrever o tempo de vida de um tipo de falha, retornando melhores ajustes que as principais distribuições de confiabilidade. Com base nesses novos resultados, propomos uma política de manutenção preventiva para os principais componentes. / During the operation of anaircraft for comercial flight of passengers, there are occurrences of failures that can compromise the satisfaction of passengers. For instance, the malfunction of seats or the entertainment system. This problem is very important for the operation in order to maintain customer satisfaction and customer loyalty. Indeed, it is ofmain interesting analysis for diagnosis of failures, which have greater impact on customer satisfaction. The results of such analysis can be used to propose preventive maintenance schemes in order to minimize costs. Based on our analysis, among the 16 major types of failures that occur, 4 types showed to have greatest impacts in the role system. In this sense,the main objective of this work is to describe the failure time of these main components. To achieve that, we set different probability distributions to describe the random behavior of these failures. For one type of failure we showed that there is space for improvement of its probability distribution as the Weibull,Gamma and Log-normal are not the most adequate to describe the random behaviour of such characteristic. Therefore, we propose a new reliability distribution, the so called inverse Weighted Lindley distribution. The mathematical properties and the parameter estimation of the parameters for the proposed distribution are discussed. The new distribution is used to describe the lifetime of one of types of failure. Based on these new results, we propose a preventive maintenance policy to maintain the quality of the main components.
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Avaliação do desempenho de modelos preditivos no contexto de análise de sobrevivência / Evaluation of predictive models in survival analysis.Santos, Tiago Mendonça dos 17 May 2013 (has links)
Modelos estatísticos com objetivos preditivos são frequentemente aplicados como ferramentas no processo de tomadas de decisão em diversas áreas. Uma classe importante de modelos estatísticos é composta por modelos de análise de sobrevivência. Duas quantidades são de interesse nessa classe: o tempo até o instante do evento de interesse ou o status para um determinado instante de tempo fixado. Aplicações importantes desses modelos incluem a identificação de novos marcadores para certas doenças e definição de qual terapia será mais adequada de acordo com o paciente. Os marcadores utilizados podem ser dados por biomarcadores, assim como por marcadores baseados em modelos de regressão. Um exemplo de marcador baseado em modelos de regressão é dado pelo preditor linear. Ainda que a utilização de modelos de sobrevivência com objetivos preditivos seja de suma importância, a literatura nesse assunto é muito esparsa e não há consenso na forma de se avaliar o desempenho preditivo desses. Esse trabalho pretende reunir e comparar diferentes abordagens de se avaliar o desempenho preditivo de modelos de sobrevivência. Essa avaliação é feita principalmente utilizando-se funções de perda para o tempo de sobrevivência e quantidades associadas a diferentes definições de curva ROC para o status. Para a comparação dessas diferentes metodologias foi feito um estudo de simulação e no final aplicou-se essas técnicas em um conjunto de dados de um estudo do Instituto do Câncer de São Paulo. / In many fields, predictive models are often applied as a helpful tool in the decision making process. An important class of predictive models is composed by survival models. Two quantities of special interest in these class are: time until the occurrence of a specified event and survival status for a fixed moment of time. Important applications of these models include new markers identification for certain diseases, as well as defining which therapy is the most appropriated for a patient. Markers can be given by biomarkers, but they can also be derived from regression models. An example of regression models based markers is the linear predictor. Despite the importance of survival models applications with predictive goals, literature is this subject is very sparse and there is no agreement on the best methodology to evaluate predictive performance of these models. In this work we intend to assemble and to compare different methodologies for assessing the predictive performance of survival models. This assessment is made mainly with loss functions for the survival time and ROC curve associated quantities for status. An simulation study was done in order to compare these different methodologies, which were also applied to a study about survival of patients at ICU of ICESP (Instituto do Câncer de São Paulo)
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Eficiência do uso de medidor de atividade eletrônico na detecção de cio de vacas leiteiras de alta produção / Efficiency of use of an electronic activity meter tag in the detection of estrous of high producing dairy cowsGuarín Montoya, Jose Fernando 16 January 2008 (has links)
Grandes avanços tem sido feitos para melhorar a produção de leite, mas estes avanços têm resultado numa queda geral da eficiência reprodutiva. Para se combater esta queda, tem sido seguidos principalmente três caminhos: um relacionado com a vaca, outro com as gametas e outro com o ambiente. Os problemas associados à vaca compreendem os problemas relacionados com a detecção de cio e os problemas hormonais que resultam em baixas taxas de concepção e aumento das mortes embrionárias precoces. Alternativas para melhorar a detecção de cio tem sido procuradas, dentre estas, os medidores de atividade são uma alternativa promissória, porém ainda em desenvolvimento. Com o fim de avaliar a eficiência do uso de medidor de atividade na detecção de cio de vacas leiteiras de alta produção, foram desenvolvidos três experimentos. O primeiro avaliou a eficiência do uso de medidor de atividade na detecção de cio após o período de espera voluntario (PEV), o segundo avaliou a eficiência do uso de medidor de atividade na detecção do cio de retorno após o uso de um protocolo de inseminação artificial a tempo fixo (IATF), o terceiro avaliou a relação custo-benefício da aquisição do aparelho. Na detecção do primeiro cio efetivo após o PEV o medidor de atividade apresentou maior taxa de detecção de cio, comparado com a observação visual de cio. O aparelho mostrou especial avantaja sobre a observação visual de cio na detecção de vacas multíparas de alta produção. No experimento de detecção de cio de retorno após o uso de IATF, o medidor de atividade detectou maior número de animais em menor tempo, porém, as mudanças no padrão de comportamento animal causadas pelos hormônios próprios da sincronização de cio, diminuíram a confiabilidade do sistema automatizado de detecção, ainda assim o numero de animais detectados em cio verdadeiro do sistema automatizado foi superior. Na análise de custo-benefício, a taxa interna de retorno obtida, demonstrou que o medidor de atividade é um investimento rentável o que possibilita sua aquisição. Enquanto aos falsos positivos gerados pelo sistema, sugere-se integrar as indicações feitas pelo sistema automatizado com a experiência dos funcionários das fazendas. / Huge progress has been made to improve the milk yield, but these advances have resulted in a general decrease of reproductive efficiency. Three main ways have been taken to combat this decrease: one related to the cow, another with the gametes and the lasts related with the environment. The problems associated with cow comprehend the estrous detection problems and the hormonal disorders that results in low conception rates and increases the early embryonic deaths. Alternatives to improve the heat detection has been developed. Among them, the activity meters are a promissory alternative, but still in development. Three experiments were developed in order to assess the efficiency of use of an activity meter in the estrous detection of high producing dairy cows. The first assessed the efficiency of the use of activity meter detecting estrous after the voluntary waiting period (VWP), the second assessed the efficiency of use of activity meter in the detection of the return estrous after use of a fixed-time artificial insemination (TAI) protocol, the third assessed the cost-benefit of acquisition of the system. In the first estrous after the VWP, the activity meter presented higher estrous detection rate, compared with the visual observation. The system has special vantage in the detection of multiparous high producing cows, if compared with visual observation. In the experiment of detecting return estrous after use of TAI, the activity meter detected greater number of animals in less time, however, changes in the pattern of animal behavior caused by hormones during the synchronization, decreased the accuracy of the automated system. On the other hand, the number of animals detected in real estrous of the automated system was superior than in visual observation. In the cost-benefit analysis, the internal rate of return obtained, showed that the activity meter is a profitable investment. Referent to the false positives generated by the system, it is suggested to integrate the indications made by the automated system with the experience of the functionaries of the dairy farms.
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Dinâmica populacional de pequenos mamíferos no Planalto Atlântico Paulista / Small mammal population dynamics at the Atlantic Plateau of Sao PauloBarros, Camila dos Santos de 19 July 2013 (has links)
A compreensão da dinâmica populacional é fundamental para a conservação da biodiversidade, uma vez que as espécies são perdidas através de processos que ameaçam suas populações. Portanto, compreender como as condições ambientais determinam a dinâmica populacional é essencial, especialmente tendo em conta o cenário de mudanças climáticas. Um parâmetro populacional importante é a reprodução, que não só contribui para o tamanho da população, mas também pode afetar a condição corporal e a probabilidade de sobrevivência. Devido aos altos custos energéticos, a reprodução é freqüentemente associada com a disponibilidade de alimentos em ambientes tropicais, que por sua vez é altamente correlacionada com as condições climáticas, especialmente a precipitação. Além disso, o estudo de processos de populações ou comunidades requer dados de boa qualidade, que para vários grupos de animais depende da compreensão das interações entre os métodos de captura, condições climáticas e as características morfológicas e comportamentais de indivíduos e espécies. Através de um conjunto de dados de captura e recaptura de pequenos mamíferos em uma reserva de Mata Atlântica, compreendendo três grades de 2ha amostrados por quase dois anos, esta tese tem como objetivos contribuir com o entendimento: (1) de como as condições ambientais afetam a dinâmica de populações, especialmente a sobrevivência e reprodução, mais especificamente, como as condições climáticas afetam a demanda conflitante (trade-off) entre a sobrevivência e reprodução e quais são as gatilhos ambientais do início da reprodução, (2) de como o tipo de armadilha, características individuais e as condições climáticas interagem para determinar o sucesso de captura, visando a definição de diretrizes de protocolos de captura eficientes para a amostragem de pequenos mamíferos. No primeiro capítulo, mostramos que a precipitação afetou negativamente as taxas de sobrevivência, positivamente a freqüência de fêmeas reprodutivas e não afetou a condição corporal, o que sugere a existência de uma demanda conflitante entre sobrevivência e reprodução em populações de roedores. No segundo capítulo, corroboramos que a reprodução de marsupiais da Mata Atlântica é sazonal e sincrônica, ocorrendo no período quente e úmido, e seu gatilho é o fotoperíodo. Também apresentamos evidências de semelparidade em marsupiais de pequeno porte. No terceiro capítulo, mostramos que a eficiência de diferentes métodos de captura foi influenciada pelas condições climáticas, dependeu da idade e do sexo dos indivíduos e foi condicionada às variáveis quantificadas (número de espécies, de indivíduos ou de recapturas). Os resultados destacam a importância de armadilhas de queda para os estudos de comunidades e a utilização conjunta de armadilhas de queda e Sherman para estudos populacionais. / The understanding of population dynamics is central for biodiversity conservation, since species are lost through processes that threat their populations. Understanding how environmental conditions determine population dynamics is thus essential, especially given the climate change scenario. One important population parameter is reproduction, which not only contributes to population size, but can also affect body condition and survival probability. Given its high energetic costs, reproduction is frequently associated with food availability in tropical environments, which in turn is highly correlated to weather conditions, especially rainfall. However, studying population or community processes requires good-quality data, which for several animal groups depends on understanding the interactions among trapping methods, weather conditions and morphological and behavioral characteristics of individuals and species. Through a capture-recapture dataset on small mammals in an Atlantic Forest reserve, comprising three 2ha grids sampled for almost two years, this thesis aim at understanding: (1) how environmental conditions affect population dynamics, especially survival and reproduction; more specifically, how weather conditions affect the trade-off between survival and reproduction, and which are the environmental triggers for reproduction; (2) how the type of trap, individual traits and weather conditions interacts to determine capture success, aiming at defining guidelines for efficient protocols for small mammal sampling. In the first chapter, we show that rainfall negatively affected survival rates, positively affected the frequency of reproductive females and did not affect body condition, suggesting the existence of a trade-off between survival and reproduction in rodent populations. In the second chapter, we corroborated that reproduction of Atlantic Forest marsupials is seasonal and synchronous, occurring in the warm-wet season, and triggered by photoperiod cues. We also bring evidence for semelparity in small-sized marsupials. In the third chapter, we show that the efficiency of different trap methods was influenced by weather condition, depended on the age and sex of individuals, and was contingent on the quantified variables (number of species, of individuals or of recaptures). Results highlight the importance of Pitfalls for community studies and the joint use of Pitfall and Sherman traps for population studies.
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