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Descoberta de ligantes do receptor de melanocortina-5 (MC5R) como candidatos a moduladores da sebogênese: estudos de modelagem por homologia, triagem virtual e ensaio celular / Discovery of ligands for the melanocortin-5 receptor (MC5R) as candidates of modulators of sebogenesis: homology modeling studies, virtual screening and cellular assayKatekawa, Edson 20 November 2018 (has links)
A acne é uma condição da pele multifatorial com implicações socioeconômicas importantes. Um dos principais fatores que contribuem com a sua etiologia é a superprodução de sebo. Até o momento, há poucos tratamentos seguros e eficazes disponíveis. O receptor de melanocortina-5 (MC5R), um receptor acoplado à proteína G da família das rodopsinas, é uma das proteínas responsáveis pela diferenciação de sebócitos e consequente produção de sebo, mas não há opções de tratamento através do antagonismo deste receptor. Neste trabalho, investigamos a melanocortina-5 como alvo molecular para a descoberta de ligantes como moduladores da sebogênese. Para tanto, empregamos estudos de modelagem por homologia e triagem virtual baseada em estrutura do alvo para construir um modelo 3D da MC5R e identificar de candidatos a ligantes da proteína, respectivamente. Em seguida, avaliamos o potencial de inibição da sebogênese em sebócitos SEBO662AR em meio lipogênico. Os resultados obtidos indicaram a descoberta de peptídeos e flavonoides com características inibidoras e estimuladoras da produção de sebo. Novos esqueletos moleculares foram identificados como promissores para a modulação da sebogênese. Os estudos realizados permitirão o desenvolvimento de novos ativos dermatológicos e cosméticos com potencial de modular a oleosidade da pele, de modo a contribuir com a mitigação dos efeitos da acne, psoríase, alopecia e seborreia, entre outras doenças. / Acne is a multifactorial skin condition with important socioeconomic implications. One of the main factors that contribute with its etiology is sebum overproduction. Until now, there are few safe, effective treatments available. Melanocortin-5 receptor (MC5R), a G protein-coupled receptor of the rhodopsin family, is one of the proteins responsible for sebocyte differentiation and consequent sebum production, but there are no options for treatment by antagonism of this receptor. In this work, we investigated MC5R as molecular target for the discovery of ligands as sebogenesis modulators. For that, we used homology modeling studies, and structure-based virtual screening in order to, respectively, build a MC5R 3D model and identify ligand candidates for this protein. Then, we evaluated their sebogenesis inhibition potential on SEBO662AR sebocytes in lipogenic conditions. The obtained results indicated the discovery of peptides and flavonoids with inhibitory and stimulatory sebum production characteristics. New scaffolds were identified as promising for sebogenesis modulation. The performed studies will allow the development of novel dermatologic and cosmetic actives with the potential to modulate skin oiliness in order to contribute to the mitigation of the effects of acne, psoriasis, alopecia and seborrhea, among other diseases.
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Programa municipal de coleta seletiva de resíduos sólidos urbanos em Santo André - SP: um estudo a partir do ciclo da política (policy cycle) / Municipal program of selective waste collection in Santo André SP: a policy cycle studyCornieri, Marina Gonzalbo 12 December 2011 (has links)
Garantir tratamento e disposição final adequada para os resíduos sólidos urbanos é um desafio para as administrações municipais, principalmente porque a geração de resíduos tem aumentado à taxa maior do que a de aumento da população e as grandes áreas para construção de aterros sanitários são escassas nas grandes cidades. Assim, desde o final da década de 1980, no Brasil, alguns municípios têm implementado programas de coleta seletiva de resíduos sólidos urbanos em parceria com organizações de catadores, que desviam resíduos da disposição em aterros sanitários, aumentando sua vida útil. Torna-se importante olhar para os programas de coleta seletiva como parte de políticas públicas, enfatizando sua continuidade administrativa e seus objetivos. Nesse sentido, buscou-se estudar o programa de coleta seletiva de Santo André SP, entre os anos de 1998 e 2011. O objetivo é estudar como se deram a elaboração e a implementação do programa de coleta seletiva do município de Santo André, em 1998, e como vem sendo feito seu monitoramento e avaliação nos anos posteriores, até o ano de 2011. Para isso foi utilizada a abordagem de policy cycle, que considera a política pública como um ciclo deliberativo, constituído por vários estágios, formando um processo dinâmico e de aprendizagem. Foi realizada pesquisa bibliográfica e documental, bem como entrevistas qualitativas semi-estruturadas com: representantes do Serviço Municipal de Saneamento Ambiental de Santo André (Semasa); os coordenadores administrativos das duas cooperativas parceiras do programa (Coopcicla e Coop Cidade Limpa) e uma amostra randômica de seis cooperados de cada uma das cooperativas parceiras do programa. Após as entrevistas, houve aplicação de questionários a todos os catadores da Coopcicla e Coop Cidade Limpa, totalizando 79 cooperados. Além disso, foram realizadas visitas técnicas com registros escritos e fotográficos aos equipamentos públicos: estação de coleta, usina de triagem e reciclagem de papel, centrais de triagem de materiais recicláveis, usina de reciclagem de madeira. Foi possível constatar que o programa de coleta seletiva foi elaborado com objetivo de atender toda a população urbana do município; em seguida, foi implementado, colocando-se em prática as ações planejadas, mas até o momento não há ações de monitoramento e avaliação do programa, que poderiam produzir aprendizagem administrativa. Em relação às cooperativas, a parceria com o Semasa é instável, o número de catadores vem diminuindo e não há ações para enfrentar coletas paralelas de materiais recicláveis. Por outro lado, as cooperativas garantem aos catadores renda maior que em suas ocupações anteriores, estabilidade e inclusão. Como conclusão, não pode ser considerado satisfatório que um programa municipal de coleta seletiva que existe há mais de 10 anos, dispõe de coleta porta a porta em 100% de sua área urbana, pontos de entrega voluntária, estações de coleta seletiva consiga desviar menos de 3% dos resíduos sólidos urbanos do aterro sanitário. Nesse sentido, faz-se necessário mudar o paradigma: ter coleta seletiva não significa só oferecer o serviço; é necessário coletar seletivamente, com a participação dos munícipes. / Guaranteeing treatment and appropriate disposal to municipal solid waste is a challenge to municipal administrations, mainly because waste generation has increased more than population and big areas to landfills are few in big cities. Thus, since last 1980, in Brazil, a few cities have implemented municipal programs of selective waste collection in partnership with waste pickers organizations, that remove waste from landfills, increasing your lifetime. It is important to look at programs of selective waste collection as part of policy, emphasizing your administrative continuity and objectives. Therein it was sought to study Santo Andrés program of selective waste collection, between 1998 and 2011. The objective is to study how were formulation and implementation of Santo Andrés program of selective waste collection, in 1998, and how it has been making your monitoring and evaluation in the following years, until 1998. For this reason it was used policy cycle approach, that considers policy as a deliberative cycle, formed by several steps, constituting a dynamic and learning process. It was made bibliographical and documental research, such as qualitative semi-structured interviews with: managers of Serviço Municipal de Saneamento Ambiental de Santo André (Semasa); managers of two partner cooperatives of program (Coopcicla and Coop Cidade Limpa) and a random sample of six members of each cooperative. After the interviews, it was made questionnaire application to all waste pickers of Coopcicla and Coop Cidade Limpa, totalizing 79 members. In addiction, it was made technical visits with written and photographic records to public equipment: collect station, paper selection and recycling plant, recyclables selection centers, wood recycling plant. It was possible to notice that program of selective waste collection was formulated with the objective to cover all urban population; it was implemented, putting planned actions into practice, but there are not monitoring and evaluation, that would produce administrative learning. Concerning cooperatives, the partnership with Semasa is not steady, members of cooperatives number has decreased and there are not actions to face parallels recyclables collects. In the other hand, the cooperatives guarantee to your members bigger income than in former occupations, stability and inclusion. As a conclusion, it is not satisfactory that a municipal program of selective waste collection that exists for more than 10 years, has door to door selective waste collection in 100% of urban area, collect stations is able to remove less than 3% of municipal solid waste from landfill. Therein it is necessary to change the paradigm: selective collection does not mean to offer the service; it is necessary to collect in a selective way, with people participation.
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Ranking ligands in structure-based virtual screening using siamese neural networksSantos, Alan Diego dos 29 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-29 / Triagem virtual de bancos de dados de ligantes ? amplamente utilizada nos est?gios iniciais
do processo de descoberta de f?rmacos. Abordagens computacionais ?docam? uma pequena mol?cula
dentro do s?tio ativo de um estrutura biol?gica alvo e avaliam a afinidade das intera??es entre
a mol?cula e a estrutura. Todavia, os custos envolvidos ao aplicar algoritmos de docagem molecular
em grandes bancos de ligantes s?o proibitivos, dado a quantidade de recursos computacionais
necess?rios para essa execu??o. Nesse contexto, estrat?gias de aprendizagem de m?quina podem
ser aplicadas para ranquear ligantes baseadas na afinidade com determinada estrutura biol?gica e,
dessa forma, reduzir o n?mero de compostos qu?micos a serem testados. Nesse trabalho, propomos
um modelo para ranquear ligantes baseados na arquitetura de redes neurais siamesas. Esse modelo
calcula a compatibilidade entre receptor e ligante usando grades de propriedades bioqu?micas. N?s
tamb?m mostramos que esse modelo pode aprender a identificar intera??es moleculares importantes
entre ligante e receptor. A compatibilidade ? calculada baseada em rela??o ? conforma??o do
ligante, independente de sua posi??o e orienta??o em rela??o ao receptor. O modelo proposto foi
treinado usando ligantes ativos previamente conhecidos e mol?culas chamarizes (decoys) em um
modelo de receptor totalmente flex?vel (Fully Flexible Receptor - FFR) do complexo InhA-NADH da
Mycobacterium tuberculosis, encontrando ?timos resultados. / Structure-based virtual screening (SBVS) on compounds databases has been widely applied
in early stage of the drug discovery on drug target with known 3D structure. In SBVS, computational approaches usually ?dock? small molecules into binding site of drug target and ?score? their binding affinity. However, the costs involved in applying docking algorithms into huge compounds databases are prohibitive, due to the computational resources required by this operation. In this context,different types of machine learning strategies can be applied to rank ligands, based on binding affinity,and to reduce the number of compounds to be tested. In this work, we propose a deep learning energy-based model using siamese neural networks to rank ligands. This model takes as inputs grids of biochemical properties of ligands and receptors and calculates their compatibility. We show that the model can learn to identify important biochemical interactions between ligands and receptors.
Besides, we demonstrate that the compatibility score is computed based only on conformation of small molecule, independent of its position and orientation in relation to the receptor. The proposed model was trained using known ligands and decoys in a Fully Flexible Receptor model of InhA-NADH complex (PDB ID: 1ENY), having achieved outstanding results.
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Caracteriza??o qu?mica e atividades biol?gicas in vitro e in silico de Asemeia ovata (Polygalaceae)Rocha, Jos? Luiz Carneiro da 26 August 2016 (has links)
Submitted by Luis Ricardo Andrade da Silva (lrasilva@uefs.br) on 2017-01-11T21:46:05Z
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Previous issue date: 2016-08-26 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB / Polygalaceae family species are traditionally used in many regions of the world and because of this, research is being conducted to evaluate the biological activities, as well as phytochemicals aspects of these plants. In this way, the present study was to carry out the proposed chemical characterization and evaluation of biological activity in vitro of the extract and prediction of new biological activities in silico of the substances identified in Asemeia ovata (Polyagalaceae). The chemical characterization was made through previous phytochemical screening tests and fingerprint by HPLC-DAD. The isolation and identification of compounds was performed by classical chromatography techniques, HPLC-DAD and 1H and 13C NMR. The evaluation of the antioxidant activity in vitro was taken by Scavenging of DPPH free radical method, acetylcholinesterase activity by adapting the method of Ellman and Artemia salina lethality. The prediction of activity was made by tools for in silico target fishing, followed by docking the DOCK 6.7 program and evaluation of interaction profiles by Protein-Ligand Interaction server profiler. The chemical characterization showed that the extracts are rich in flavonoids and phenolic acids. It was possible to identify and quantify using HPLC-DAD substances: rutin, luteolin-7-O-glucoside, caffeic acid, p-coumaric acid and trans-ferulic acid. Moreover, it was possible to isolate the rutin substance, poligalen and a possible new alkaloid. The ethyl acetate extract was superior in the evaluation of in vitro activity with EC50 = 5.46 mg/mL for antioxidant activity, and LC50 = 71.91 mg/mL A. salina lethality. Acetylcholinesterase activity did not yield significant results (AChEIs% <20%). Tools for in silico target fishing allowed, through the ChemProt 2.0 and DRAR- CPI-servers, to select the molecular targets carbonic anhydrase 12 and epidermal growth factor receptor for routine; for luteolin-7-O-glucoside targets cotransporter 2 sodium / glucose and CDC42-activated protein kinase 1; poligalen to the target protein tyrosine kinase JAK2; and for caffeic acid, p-coumaric acid and trans-ferulic the best targets were epidermal growth factor receptor and Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1, carbonic anhydrase 12 and Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial. This work provides new results for the species, both from a chemical and biological point of view, there is good prospects of study with interesting potential to be discovered. / Esp?cies da fam?lia Polygalaceae s?o utilizadas tradicionalmente em muitas regi?es do mundo e, devido a isso, pesquisas est?o sendo realizadas para avaliar as atividades biol?gicas, como tamb?m os aspectos fitoqu?micos desses vegetais. Desta forma, o presente trabalho teve como proposta realizar a caracteriza??o qu?mica e avalia??o de atividades biol?gicas in vitro de extratos da planta inteira e predi??o in silico de novas atividades biol?gicas das subst?ncias identificadas de Asemeia ovata (Polyagalaceae). A caracteriza??o qu?mica foi feita atrav?s de testes de triagem fitoqu?mica pr?via e fingerprint por CLAE-DAD. O isolamento e identifica??o de subst?ncias foi realizado por t?cnicas de cromatografia cl?ssica, CLAE-DAD e RMN de 1H e 13C. A avalia??o da atividade antioxidante in vitro foi feita pelo m?todo de sequestro de radical livre DPPH, atividade anticolinester?sica pela adapta??o do m?todo de Ellman e letalidade frente Artemia salina. A predi??o de atividades in silico foi feita por m?todos de Triagem Virtual Inversa (TVI), seguido de reacoplamento pelo programa DOCK 6.7 e avalia??o dos perfis de intera??o pelo servidor Protein-Ligand Interaction Profiler. A caracteriza??o qu?mica mostrou que os extratos s?o ricos em ?cidos fen?licos e flavonoides. Foi poss?vel identificar e quantificar, atrav?s de CLAE-DAD, as subst?ncias: rutina, luteolina-7-O-glicos?deo, ?cido cafeico, ?cido p-cum?rico e ?cido trans-fer?lico. Al?m disso, foi poss?vel isolar as subst?ncias rutina, poligaleno e um poss?vel novo alcaloide. O extrato acetato de etila mostrou-se superior na avali??o das atividades in vitro, com CE50 = 5,46 mg/mL para atividade antioxidante, e CL50 = 71,91 ?g/mL para letalidade frente a A. salina. Para a atividade anticolinester?sica n?o obteve-se resultados significativos (%IAChE < 20%). A TVI permitiu selecionar, atrav?s dos servidores ChemProt 2.0 e DRAR-CPI, os alvos moleculares Anidrase carb?nica 12 e Receptor de fator de crescimento epid?rmico para a rutina; para a luteolina-7-O-glicos?deo os alvos Cotransportador 2 de s?dio/glicose e Prote?na quinase CDC42 ativada 1; para o poligaleno o alvo Prote?na tirosina quinase JAK2; e para os ?cidos cafeico, p-cum?rico e trans-fer?lico os melhores alvos foram Receptor de fator de crescimento epid?rmico e Ras-relacionada ao substrato C3 da Toxina botul?nica 1, Anidrase carb?nica 12 e Ornitina carbamoiltransferase, mitocondrial. Esse trabalho fornece resultados in?ditos para a esp?cie, tanto do ponto de vista qu?mico, como biol?gico, apresentando boas perspectivas de estudo, com interessante potencial a ser descoberto.
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Modelagem comparativa e triagem virtual hier?rquica para identifica??o de moduladores das OBPs de Lutzomyia LongipalpisSantana, Isis Bugia 11 March 2016 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2017-02-14T00:41:33Z
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Previous issue date: 2016-03-11 / The Visceral Leishmaniasis (VL) is the second most important vector-borne disease in the world, transmitted in the Americas by Lutzomyia longipalpis, vector control is essential for the prevention of the disease. But since it is not possible to identify the oviposition sites, the fight is directed to adult insects, using traps impregnated with chemical attractants. Whereas the Odorant Binding Proteins (OBPs) act in the first level of odor selection, this work used in silico methodology to identify putative vector olfactory chemical modulators based on the structure of OBPs and known ligands. For this, tridimensional (3D) structure of L. longipalpis OBPs were predicted by three comparative modeling methods. The best model, predicted by I-Tasser, was refined by Molecular Dynamics on Gromacs. Then, in a hierarchical virtual screening approach, natural compounds of ZINC12 closer to the typical OBP ligands in global chemical space, provided by ChemGPS-NP, were evaluated and staggered concerning affinity with the orthosteric site from the OBP, by molecular docking on DOCK6. The compounds were scored by GRIDSCORE, then the 100 best classified were submitted to AMBERSCORE, which took into account the flexibility from both OBP and the docked ligands. The lowest energy conformations interacted with a hydrophobic pocket through residues Met6, Gly10, Glu11, Ala9 Arg14, Leu74, Met53, Phe118, Phe119, Pro120, amino groups and formed ionic interaction with carboxyl of Glu11, Furthermore, Phe119, Asn29 and Gln69 formed hydrogen bonds, this last formed donor and acceptor H-bonds. / A Leishmaniose Visceral (LV) ? a segunda doen?a vetorial mais importante do mundo, transmitida nas Am?ricas por Lutzomyia longipalpis, o controle do vetor ? indispens?vel ? preven??o da doen?a. Mas como n?o ? poss?vel identificar onde ocorre a oviposi??o, o combate ? direcionado aos insetos adultos, utilizando armadilhas impregnadas com atrativos qu?micos. Considerando que as Prote?nas Ligadoras de Odor (OBPs) atuam no primeiro n?vel de sele??o dos odores, este trabalho utilizou uma metodologia in silico para identificar potenciais moduladores qu?micos olfativos do vetor baseando-se na estrutura das OBPs e de ligantes conhecidos. Para isso, foram preditas as estruturas tridimensionais (3D) de OBPs de L. longipalpis por tr?s m?todos de modelagem comparativa. O melhor modelo, predito pelo I-Tasser, foi refinado por Din?mica Molecular no Gromacs. Ent?o, numa abordagem hier?rquica da triagem virtual, os compostos naturais do ZINC12 mais pr?ximos dos t?picos ligantes de OBPs no espa?o qu?mico global, fornecido pelo ChemGPS-NP, foram avaliados e escalonados quanto ? afinidade com o s?tio ortost?rico da OBP, pelo acoplamento molecular no DOCK6. Os compostos foram pontuados pelo Gridscore, em seguida, os cem melhores classificados foram submetidos ? pontua??o pelo Amberscore, que levou em conta a flexibilidade tanto da OBP como dos ligantes acoplados. As conforma??es de menor energia interagiram com um bols?o hidrof?bico atrav?s dos res?duos Met6, Ala9, Gly10, Glu11, Arg14, Met53, Leu74, Phe118, Phe119, Pro120; grupamentos amino formaram pontes salinas com a carboxila do Glu11. Al?m disso, os res?duos Phe119, Asn29 e Gln69 formaram liga??es hidrog?nio, sendo que, este ?ltimo res?duo formou liga??es-H aceptoras e doadoras.
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Avaliação do Programa de Triagem Neonatal em Pelotas, RS: contribuições à Política de Saúde InfantilMaciel, Ana Alice Martins 19 December 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-12-19 / Assessment of Municipal Neonatal Screening Program of Pelotas focused on the year 2011
because of the ease in obtaining the data, contribute to the choice of social indicators useful in
the evaluation of Municipal Neonatal Screening Program also known as test Guthrie, focusing
particularly on the processes that influence decision-making in society and social policy,
drawing a parallel between these issues. In addition to analyzing the relationship between
assessment and indicators, considering the importance of this combination for social issues.
There was obtained a sample of 3,138 tests. From the instrument developed for the
assessment shows that the timely collection is not yet consolidated, as there was heterogeneity
between units regarding collections of tests being conducted over seven days. Occurs with a
proportionality indices equal to nationals among the pathologies hypothyroidism,
phenylketonuria and hemoglobinopathies. Sickle cell trait in the region presents a bit high, at
a ratio of 50/3138. In the evaluation among professionals responsible for Newborn Screening
in Health Units there are many problems that need to be resolved to achieve a satisfactory
performance because there are problems with the delivery flow of collections and the return
of results across the sector in Newborn Screening Specialties Center, an agency responsible
for managing issues relating to the test in the city, and the Health Units urban and rural. There
are gaps in the training of professionals that are being incorporated into the health care system
and those who are already part of the teams in the Units and inadequate material resources to
perform the test in a timely manner. The results indicate that the Guthrie Test is being
conducted in all health units of the municipality beyond the Program meet surrounding
regions, because testing is performed in children from other cities of the state. Most units have
physical and human conditions of performing the screening test and can achieve a satisfactory
performance, but it appears that there is a need to unify and enhance the Neonatal Screening
Program in the entire network of the municipality which is a broad framework and collect
complex where the test is just one step so it is necessary to contribute to a classification of the
service providing a better quality of life for the whole society / A avaliação do Programa Municipal de Triagem Neonatal do município de Pelotas teve como
foco o ano 2011 em virtude da facilidade em dispor dos dados, contribuir para a escolha de
indicadores sociais úteis no processo de avaliação do Programa Municipal de Triagem
Neonatal também conhecido como teste do pezinho, concentrando particularmente nos
processos que influenciam as tomadas de decisão na sociedade e na Política Social, traçando
um paralelo entre essas questões. Além disso, buscou-se analisar a relação entre a avaliação e
indicadores, considerando a importância dessa combinação para as questões sociais. Obtevese
uma amostra de 3.138 testes. A partir do instrumento desenvolvido para avaliação
observa-se que a coleta oportuna ainda não está consolidada, pois há uma heterogeneidade
entre as Unidades quanto às coletas dos testes sendo realizadas acima dos sete dias. Entre as
patologias ocorre uma proporcionalidade com índices igual aos nacionais entre
hipotireoidismo, fenilcetonúria e hemoglobinopatias. Das hemopatias analisadas a que
prevaleceu foi o traço falciforme que para o município de Pelotas se apresenta, em uma
relação de 50/3138. Na avaliação realizada entre os profissionais responsáveis pela Triagem
Neonatal nas Unidades de Saúde há muitos problemas que precisam ser resolvidas para
alcançar um desempenho satisfatório, pois ocorrem problemas com o fluxo de entrega das
coletas bem como na devolução dos resultados entre o setor de Triagem Neonatal no Centro
de Especialidades, órgão responsável por gerir as questões referentes ao teste no município, e
as Unidades de Saúde urbana e rural. Há falhas nas capacitações dos profissionais que estão
sendo incorporados ao sistema de saúde e entre os que já fazem parte das equipes nas
Unidades e insuficiência dos recursos materiais para realização em tempo adequado do teste.
Os resultados indicam que o Teste do Pezinho está sendo realizado em todas as Unidades de
Saúde e hospitais do município além do Programa atender regiões circunvizinhas, pois é
realizado teste em crianças de outras cidades do Estado. A maioria das Unidades possui
condições físicas e humanas de realizar o teste do pezinho e conseguem alcançar um
desempenho satisfatório, mas conclui-se que há necessidade de unificar e incrementar o
Programa de Triagem neonatal em toda a rede do município que é uma estrutura ampla e
complexa onde coletar o teste é apenas uma das etapas e por isso é necessário contribuir para
uma qualificação do serviço proporcionando uma qualidade de vida melhor para toda
sociedade
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Ensaio enzimático on-line baseado em enzimas imobilizadas e cromatografia zonal para identificação e caracterização de inibidores da enzima Nucleosídeo Difosfato Quinase B / Enzymatic on-line assay based on immobilized enzyme coupled to zonal chromatography to identify and characterize inhibitors for Nucleoside Diphosphate Kinase BLima, Juliana Maria de 11 May 2018 (has links)
As enzimas desempenham papel fisiológico fundamental nos organismos, seja em condições normais e patológicas, o que as tornam atrativos alvos para intervenções terapêuticas. Pequenas moléculas capazes de inibir enzimas alvos são utilizadas para o tratamento de diversas doenças inflamatórias, câncer, AIDS, entre outras. Contudo, a identificação de pequenas moléculas inibidores ainda é uma etapa limitante no desenvolvimento de fármacos. Nesse contexto, o aprimoramento e novos ensaios robustos e confiáveis para acelerar a descoberta e a caracterização de novos inibidores é de extrema relevância. Nesta tese apresentamos o desenvolvimento de apropriados métodos para a quantificação direta da atividade das enzimas alvos Nucleosídeo Difosfato Quinase B (NDKb), humana (NME2) e de Leishmania major (LmNDKb), livres em solução ou imobilizadas em colunas capilares (ICER). A separação dos produtos e substratos da reação foi realizada por cromatografia de par iônico, que possibilitou a quantificação direta da atividade enzimática da NDKb livre em solução, método 1D-LC-UV. Já para a quantificação da atividade das enzimas imobilizadas foi elaborado um método on-line ICER-LC-UV, no qual a reação enzimática do ICER foi transferida à coluna analítica, permitindo a separação e quantificação da atividade de fosfotransferência. Utilizando esses métodos foi possível determinar o pH ótimo e os parâmetros cinéticos das enzimas livres e imobilizadas. Inibidores de NDKb de diferentes potências e mecanismos de ação foram utilizados para modulação do sistema ICER-LC-UV como ensaio de triagem de inibidores. O (-)-Epicatequina galato (ECG) foi utilizado como prova de conceito, para validar a aplicação do método on-line ICER-LC-UV na identificação e caracterização de inibidores para as enzimas alvo NME2 e LmNDKb. Em suma, a quantificação direta associada ao uso de enzimas imobilizadas representa um grande avanço aos métodos consolidados para o monitoramento da atividade enzimática e triagem de inibidores das enzimas alvo. / Enzymes play a key physiological role in organisms, either under normal and pathological conditions, which make them attractive targets for therapeutic interventions. Small molecules capable to inhibit specific target enzymes are used for the treatment of several inflammatory diseases, cancer, AIDS, among others. However, to identify small inhibitory molecules is still a limiting step in drugs discovery. In this context, the improvement and development of robust and reliable novel assays to accelerate the discovery and characterization of new inhibitors have become extremely relevant. This study describes an appropriate direct method to quantify the enzymatic activity of Nucleoside Diphosphate Kinase B (NDKb) from human (NME2) and Leishmania major (LmNDKb). It can be applied to free enzyme in solution or immobilized enzyme into silica capillary (ICER). The separation of both the substrates and products was achieved using ion-pair chromatography, it can be applied to direct quantification of free NDKb activity, method 1D-LC-UV. In order to quantify the activity of the immobilized enzymes, an on-line ICER-LC-UV method was developed. Initially, the enzymatic catalysis occurred into the ICER. Sequentially, the reaction mixture was transferred to an analytical column, where analytes were separated. From this method, it was possible to determine the optimum pH and kinetic parameters for the immobilized enzymes. Well stablished NDKb inhibitors with different strenght and mechanisms of action were used to modulate the on-line ICER-LC-UV method as an inhibitor screening assay. (-)-Epicatechin gallate was used as proof of concept in order to validate the application of the on-line ICER-LC-UV method to identify and characterize the target\'s enzymes NME2 and LmNDKb inhibitors. In summary, the direct quantification method coupled to the immobilized enzymes increases the likelihood of identifying the enzymatic activity and screening of inhibitors of the target enzymes when compared methods well described in the literature.
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Acompanhamento do desenvolvimento infantil em creches. / Follow-up of the child development in day care centers.Beteli, Vivian Cesar 29 March 2006 (has links)
O período da vida em que as crianças freqüentam instituições de educação infantil (creches e pré-escolas) corresponde a uma fase crítica para o desenvolvimento. Dentre as áreas do desenvolvimento, a linguagem é uma das mais vulneráveis uma vez que necessita intensamente da intervenção de outrem. Devido à importância do desenvolvimento acredita-se que acompanhá-lo é uma ação básica de saúde, bem como um importante cuidado de enfermagem. Os objetivos desta pesquisa foram: descrever perfil de desenvolvimento, especialmente no que diz respeito às habilidades de linguagem, de crianças hígidas de 0 a 6 anos de idade incompletos que freqüentam instituição de educação infantil. Trata-se de um estudo quantitativo, descritivo e longitudinal (coorte) com amostra não probabilística. Utilizou-se o Teste de Triagem de Desenvolvimento de Denver II (TTDD II). No período de 2001 a 2004 foram realizadas 150 aplicações do TTDD II em crianças de 4 meses e 23 dias até 5 anos 7 meses e 11 dias. Tais crianças freqüentavam instituições de educação infantil consideradas de boa qualidade localizadas na cidade de São Paulo. Os critérios de inclusão foram: idade gestacional conhecida (para menores de 2 anos), ausência de mal formação congênita, não ser estrangeira (devido à área de linguagem), e nunca ter freqüentado outra creche. A condição sócio-econômica das famílias era homogênea, sendo a renda média de 7,60 salários mínimos, portanto, superior à renda média per capita na região metropolitana de São Paulo no mesmo período, que era 4,28 salários mínimos. Os resultados foram estatisticamente iguais nas 3 creches, tanto para o resultado global do TTDD II, quanto para a área de habilidades de linguagem isoladamente. Não houve associação estatística dos resultados em relação aos sexos. Em termos de resultado global houve melhora estatisticamente significante ao longo das 5 avaliações (1ª x 3ª p=0,015). O desempenho da linguagem se manteve estatisticamente igual ao longo dos 5 momentos. Assim, é possível ventilar as seguintes possibilidades: as 3 instituições em questão não estão conseguindo otimizar as condições de molde a propiciar às crianças o pleno desenvolvimento de suas habilidades de linguagem, e/ou, o TTDD II não possibilitou a triagem adequada nesta área. A favor da primeira possibilidade há o fato que as habilidades de linguagem parecem declinar quando as crianças alcançam 3 anos de idade, melhorando mais tarde. Exatamente neste período o módulo educadora/crianças está abaixo no nível recomendado. Quanto à segunda possibilidade, tem-se que o TTDD II ainda não está validado para a língua portuguesa empregada no Brasil. Conclui-se que: freqüentar as creches pode ter sido benéfico para o desenvolvimento das crianças no que tange ao desenvolvimento global. No caso da das habilidades de linguagem há necessidade de outras pesquisas. / The period of life in which children are enrolled in institutions of child education (pre-school and day care centers) is a critical phase for the child development. Among the developmental areas, the language is the most susceptible since it strongly needs someone elses intervention. Due to the development importance child follow-up is a basic health care in nursing. The purpose of this study was to describe the development profile, specially regarding language abilities of healthy children with ages ranging from 0 to 6 incomplete years, who were enrolled in child day care centers. This is a quantitative, descriptive and longitudinal (cohort) study with a non-probabilistic sampling. The Denver II Developmental Screening Test (DDST II) was used. From 2001 to 2004, 150 DDST III were applied in children with ages varying from 4 months and 23 days up to 5 years, 7 months and 11 days. These children were enrolled in good quality Day Care Centers located in the city of São Paulo. The criteria of inclusion were as follows: identified gestational age (for those under the age of 2 years), lack of congenital malformation, born Brazilian (due to the language area) and never been enrolled in a day care center before. The socioeconomic condition of the families was homogeneous, average of 7.60 minimum wage, thus, above the mean income per capita in the metropolitan area of São Paulo, in the same period, which was 4.28 minimum wages. The results were statistically equal in three Day Care Centers, both for the global result of the DDST II and for the language ability areas alone. There was no statistical association of the results regarding gender. In terms of global results, a statistically significant improve was observed in the five evaluations performed (1a x 3a p=0.015). Language performance maintained statistically equal on these five moments. Consequently, it was possible to demonstrate the following likelihood features: the three institutions were not able to optimize the conditions needed to give the child full development of his/her language abilities and/or the DDST II did not allow an adequate screening in this area. In the first option, it seems that language abilities may decrease when the child reaches the age of three years and developing later. At this moment, the educator/child module is below the recommended level. Regarding the second option, the DDSTII is not yet validated for the Portuguese language in Brazil. It was concluded that to enroll children in day care centers seems to be effective for the global child development. Regarding language abilities further studies are still needed.
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Sistema de triagem de pericárdio bovino para manufatura de válvulas cardíacas por tomografia de impedância elétrica. / Control test of bovine pericardium with impedance electrical tomography.Santos, Talles Batista Rattis 13 February 2015 (has links)
Durante a triagem do pericárdio bovino, utilizado em válvulas cardíacas artificiais, procura-se determinar a direção das fibras de colágeno e identificar regiões mais homogêneas. Estas características influenciam o comportamento mecânico e a durabilidade destas válvulas. Neste contexto, a tomografia de impedância elétrica (TIE) poderia ser utilizada como ferramenta para avaliar o pericárdio, a partir da estimação da direção média das fibras e da identificação das regiões mais homogêneas. O objetivo deste trabalho é investigar a possibilidade de utilização da técnica de TIE para análise e seleção de pericárdios, melhorando os critérios de seleção deste tecido. Com este propósito, foi desenvolvido um reservatório, para acondicionamento do pericárdio e coleta de dados, e implementado um algoritmo de Gauss-Newton para estimar a distribuição de resistividade no tecido. Para regularização do problema inverso mal-posto foi desenvolvido e utilizado um prior baseado em amostras. E para avaliar o desempenho do reservatório e do algoritmo de imagem, fantomas e testes in vitro foram realizados. Detectou-se um furo de 2.0 mm de raio provocado no tecido. Portanto, os experimentos mostraram que é possível detectar imperfeições no pericárdio utilizando a técnica de TIE. No entanto, a necessidade de aperfeiçoamento dos eletrodos, fonte de corrente, reservatório e algoritmo (malhas e priors) esta clara se o objetivo final for a seleção de pericárdios para válvulas cardíaca artificiais. / During the selection of bovine pericardium for use in artificial heart valves, one of the goals is to determine the direction of the collagen fibers and to identify more homogeneous regions. These characteristics influence the mechanical behavior and the durability of these valves. In this context, the electrical impedance tomography (EIT) could be employed as a tool to evaluate the pericardium, from the estimation of the mean fiber direction and the identification of homogeneous regions. The objective of this work is to investigate the possibility of using EIT technique for analysis and selection of pericardium, improving the selection criteria of this tissue. With this purpose in mind, it was developed a test bench, to accommodate the pericardium and to collect data, and it was implemented a Gauss-Newton based algorithm to estimate the resistivity distribution map of this tissue. For regularizing this ill-posed problem, it was developed and applied a priormodels sample-based. And for quality evaluation of the test bench and of the image algorithm, phantom experiments and in vitro tests were performed. It was detected a hole of 2.0 mm radius at the tissue. Therefore, the experiments showed that it is possible to detect defects on pericardium using EIT technique. However, the need of improvements on electrodes, current source, test bench and algorithm (meshes and priors) is clear if the final aim is the selection of pericardium for artificial heart valves.
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Programa de avaliação externa para os testes de triagem sorológica de doadores de bancos de sangue dos centros de referência da América Latina: utilização de multipainel específico / Externai evaluation program for blood donors infectious screening tests at Latin America reference centers: specific Multipanel useOtani, Márcia Mitiko 04 September 2003 (has links)
Introdução: O risco de transmissão de agentes infeciosos por transfusão sangüínea é maior nos países em desenvolvimento. A hemoterapia na América Latina, embora tenha conquistado grandes avanços tecnológicos e políticos nos últimos anos, ainda apresenta diversos problemas que comprometem a qualidade dos resultados dos testes de triagem sorológica de doadores. A confiabilidade dos resultados emitidos pelos laboratórios que realizam testes de triagem sorológica de bancos de sangue pode ser determinada através de programas de avaliação externa, utilizando multipainéis específicos. Objetivos: Objetivou-se produzir multipainéis específicos para programas de avaliação externa em testes de triagem sorológica de bancos de sangue e determinar a qualidade dos resultados obtidos em 21 centros de referência da América Latina. Resultados: A seleção criteriosa da matéria-prima e a caracterização das amostras foram etapas importantes na determinação das características dos soros que constituíram os Multipainéis. Foram analisados os resultados de 5 programas, realizados no período de 1997 a 2000. A média da taxa de resultados falso-negativos (RFN) foi de 0,7% para anti-HIV, 2,89% para HBsAg, 4% para anti-H Bc, 10,7% para anti-HTLVI/II, 1,07% para anti-HCV, 3,22% para doença de Chagas e 6,25% para Sífilis. A média da taxa de resultados falsopositivos (RFP) variou de 0,73% para doença de Chagas a 5,28 % para antiHCV. Os resultados foram analisados sob diversos prismas, o desempenho de cada centro de referência, a concordância nos resultados das amostras, os \"kits\" utilizados e os parâmetros. Conclusão: Um programa sistemático como o aqui apresentado mostrou pontos importantes dentro do processo de triagem sorológica e auxiliou a elucidar algumas causas de erros. Houve uma melhora gradativa na qualidade dos resultados obtidos nos programas, do ano de 1997 para 1999. Quanto maior a proporção de amostras positivas, maior é a chance de laboratórios cometerem erros, como foi observado no multipainel do quinto programa, que teve aumento da taxa de RFN e RFP, evidenciando a existência de falhas no processo. A participação contínua nesses programas pareceu ser importante para o monitoramento das atividades realizadas no processo de triagem sorológica de doadores. / Background: In developing countries, the risk of acquiring infectious disease through blood transfusion is higher than developed countries. Although in the last 10 years, blood safety has improved in Latin America in terms of technology and politics, several problems remained unsolved that compromise the quality of the results obtained by the laboratories that perform infectious diseases screening tests. Externai evaluation program, using specific multipanel, may be an important tool to evaluate a laboratory that perform serological screening tests. Externai quality control program for blood bank serological test had not been previously performed in Latin America. Objectives: To develop the technology to produce panel of sera reactive to blood born infectious diseases and to determine the quality of the results of 21 reference centers of Latin America. Results: The criteria to select the raw material and to characterize the sample were important to determine the overall quality of the pane!. Using the Multipanel, tive Externai Quality Control programs were organized during 1997 to 2000 with 21 reference laboratories in 16 countries in Latin America. The mean rate of the false negative results was 0,7% for ant-HIV test, 2.89% for HBsAg, 4% for ant-HBc, 10.7% for ant-HTLVI/II, 1.07% for ant-HCV, 3.22% for Chagas diseases, and 6.25% for Syphilis. The mean rate of false positive results varied from 0.73% for Chagas diseases to 5.28% to ant-HCV. The results were also analyzed in terms of performance of each reference center and by the manufacture of the kits used. Conclusion: The program could provide clues about sources of common errors and was an important tool to validate the laboratory screening processo The quality of the results improved from the 1 st to the 4th programo The chance of doing errors was higher, when the proportion of positive samples were higher, as observed in the 5th program that registered elevated index of false positive and false negative results. The continuing participation in this kind of program seemed to be important to monitor the activities performed by the blood bank screening laboratory.
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