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Modelagem matemático-computacional da resposta imune à vacina de febre amarelaBonin, Carla Rezende Barbosa 26 February 2015 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-03-06T17:46:11Z
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Previous issue date: 2015-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Desde 1937 está disponível uma vacina eficaz contra febre amarela. Ainda assim,
questões relativas a seu uso permanecem pouco entendidas, como, por exemplo, a
necessidade da dose reforço a cada dez anos. O objetivo deste trabalho é demonstrar
que ferramentas matemático-computacionais podem ser utilizadas para simular diferentes
cenários referentes à vacinação e aos indivíduos a fim de auxiliar a busca pelas respostas de
algumas destas questões em aberto. Neste contexto, este trabalho apresenta um modelo
matemático-computacional da resposta imune humana à vacinação contra febre amarela.
O modelo leva em conta importantes células dos sistemas inato e adaptativo, como
células apresentadoras de antígeno, anticorpos, células B e células T (CD4+ e CD8+).
Também são consideradas populações de células de memória, importantes na aquisição
da imunidade conferida pela vacina. O modelo foi capaz de gerar curvas de anticorpos
que estão de acordo com dados experimentais, além de representar o comportamento
de diversas populações importantes do sistema imune de acordo com o que é esperado
pela literatura. Este é o início de um caminho que, em um cenário ideal, permitirá
simular diferentes situações relacionadas ao emprego da vacina contra febre amarela, como
sua aplicação em indivíduos com imunodeficiências, diferentes estratégias de vacinação,
duração da imunidade e necessidade de dose reforço. / An effective vaccine against yellow fever is available since 1937, but some issues regarding
its use remain poorly understood, for example, the need for a booster dose every ten years.
The objective of this study is to demonstrate that mathematical-computational tools can
be used to simulate distinct scenarios related both to vaccination and individuals in order
to assist the search for the answers to some of these open issues. In this context, this
study presents a mathematical-computational model of the human immune response to
vaccination against yellow fever. The model takes into account important cells of the
innate and adaptive systems, such as antigen presenting cells, antibodies, B cells and
T cells (CD4 + and CD8 +). Memory cell populations, important on the immunity
induced by a vaccine, were also considered in the model. The model was able to generate
antibodies curves which are in accordance with experimental data as well as to represent
the behavior of several important populations of the immune system according to the
results of the literature surveyed. This is the first step towards an ideal scenario where it
will be possible to simulate distinct situations related to the use of yellow fever vaccine, as
its application in immunodeficient individuals, different vaccination strategies, duration
of immunity and the need for a booster dose.
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Les facteurs de risque de sévérité liés à l'hôte et au traitement au cours de la fièvre boutonneuse méditerranéenneBotelho-Nevers, Elisabeth 08 September 2011 (has links)
La fièvre boutonneuse Méditerranéenne (FBM) est due à Rickettsia conorii subsp. conorii, bactérie intracellulaire stricte. Cette maladie, initialement décrite comme bénigne, présente actuellement un taux de sévérité de l’ordre de 10% avec une augmentation de cette sévérité décrite dernièrement. Au cours d’une étude clinique rétrospective portant sur 161 cas de FBM, nous avons observé que le traitement par fluoroquinolones était associé à une évolution défavorable, ce qui à ce jour n’avait jamais été rapporté, alors que la doxycycline semble être protectrice. Nous avons également observé cet effet délétère des fluoroquinolones sur un modèle in vitro d’infection cellulaire à R. conorii, effet qui n’a pas été observé avec la doxycycline. Une des hypothèses pouvant expliquer cet effet est l’induction du module toxine-antitoxine par les fluoroquinolones. Ainsi nous avons montré que la ciprofloxacine modulait l’expression des gènes du couple toxine-antitoxine. Nous avons également montré que les statines pouvaient avoir un effet prophylactique au cours de l’infection par R. conorii. Enfin nous avons étudié la réponse de l’hôte au sein de l’escarre d’inoculation par une approche transcriptomique.Cette thèse a mis en évidence que les traitements reçus au cours de la FBM peuvent modifier le pronostic de cette maladie. Le choix des antibiotiques est donc crucial et doit faire l’objet d’études complémentaires. / Mediterranean spotted fever (MSF) is caused by Rickettsia conorii subsp. conorii, a strict intracellular bacterium. The disease initially described as benign presents currently rates of severity around 10% with an increase described recently. In a retrospective clinical study of 161 cases of MSF, we observed that treatment with fluoroquinolones was associated with an unfavourable outcome whereas doxycycline appeared to be protective. We also observed this deleterious effect of fluoroquinolones in vitro in a cellular model of R. conorii infection, which was not observed with doxycycline. One hypothesis that could explain this effect is the induction of toxin-antitoxin module by fluoroquinolones. Thus we have shown that ciprofloxacin modulates the gene expression of toxin-antitoxin module. We have also shown that statins may have a prophylactic effect during infection by R. conorii. Finally, we have studied the host response within the inoculation eschar by a transcriptomic approach. This thesis has shown that the treatment received during the MSF can change the prognosis of this disease. The choice of antibiotics is crucial, and should be subject to further studies.
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Febre maculosa brasileira no estado de São Paulo = aspectos clínicos e epidemiológicos / Brazilian spotted fever in São Paulo State : Clinical and epidemiological aspectsAngerami, Rodrigo Nogueira 18 August 2018 (has links)
Orientadores: Luiz Jacintho da Silva, Raquel Silveira Bello Stucchi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-18T15:04:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011 / Resumo: Causada pela bactéria Rickettsia rickettsii e transmitida pelos carrapatos Amblyomma cajennense e Amblyomma aureolatum, a febre maculosa brasileira (FMB), após décadas de aparente silêncio epidemiológico, desde sua reemergência nos anos 80, vem figurando como importante problema de saúde pública no estado de São Paulo, sobretudo, em decorrência da aparente expansão das áreas de transmissão e da elevada letalidade a ela associada. O objetivo principal do presente estudo foi descrever características clínicas e epidemiológicas da FMB a partir da análise retrospectiva de casos confirmados da doença em áreas endêmicas no estado de São Paulo. Foi observado que manifestações inespecíficas como febre, cefaléia, mialgia e exantema, foram os sinais clínicos mais freqüentes e precoces. Embora variáveis, elevadas frequências de fenômenos hemorrágicos (22,9%-77,6%), icterícia (16,7%-52%), alterações neurológicas (27,2%-51,7%) e insuficiência respiratória (17,5%-62%) foram observadas. A taxa de letalidade média no estado de São Paulo no período de 2003 a 2008 foi de 29,6%(21,9%-40%). Trombocitopenia e elevação de transaminases hepáticas foram as alterações laboratoriais mais frequentes, ocorrendo em até 100% dos casos. Na faixa etária pediátrica, a FMB também se apresentou como doença severa, associando-se, embora em menor freqüência, às complicações acima mencionadas e à elevada letalidade (28,4%). Entretanto, em estudo comparativo entre o perfil clínico da FMB nos estados de São Paulo e Santa Catarina, observou-se no estado do Sul uma doença com evolução benigna, pequena frequência de sinais de gravidade e ausência de óbitos. Entre pacientes com FMB, as síndromes febris hemorrágica, icterohemorrágica e exantemática foram as mais comumente observadas (37,1%, 33,9%, 11,3%, respectivamente). Dentre os principais diagnósticos diferenciais da FMB, leptospirose, dengue e doença meningocócica foram as mais prevalentes (28,5%, 17,2%, 5,4%, respectivamente). Em 31% dos casos descartados para FMB não foi possível a identificação do diagnóstico etiológico. A doença foi mais incidente no gênero masculino e entre indivíduos da faixa etária de 20 a 49 anos. Em áreas em que o A. cajennense é o principal vetor foi possível observar maior incidência da doença entre o período de Junho a Setembro. Surtos de FMB se associaram a elevadas taxas de letalidade e a diferentes determinantes ecoepidemiológicos. Atividades de lazer e ocupacionais em áreas de mata, pastagem, próximas a coleções hídricas e/ou com presença de animais (cavalos, capivaras e, eventualmente, cães) foram consideradas importantes exposições de risco para infecção. O presente estudo permitiu observar que a infecção pela R. rickettsii no estado de São Paulo se associa à elevada morbimortalidade, sendo, aparentemente, mais severa que a febre das Montanhas Rochosas nos Estados Unidos. Exantema, icterícia e hemorragias são importantes marcadores clínicos que devem ser considerados na suspeição da doença e seus diagnósticos diferencias. O conhecimento das características epidemiológicas e dos fatores de risco para infecção deve fundamentar as ações de prevenção e controle da FMB. A maior severidade da infecção pela R. rickettsii no estado de São Paulo, a ocorrência de casos atípicos em Santa Catarina e a ausência de elucidação diagnóstica em casos descartados para FMB sugerem que cepas de R. rickettsii com distintos padrões de virulência, bem como outras espécies de riquétsias e, eventualmente, outros microorganismos transmitidos por carrapatos devam estar ocorrendo no Brasil / Abstract: Brazilian spotted fever (BSF) is caused by Rickettsia rickettsii and transmited by Amblyomma cajennense and Amblyomma aureolatum ticks. After decades of an apparent epidemiological silence, BSF reemerged as an important public health problem in São Paulo State in the 1980's, mostly because the possible expansion of its transmission areas and the high BSF related fatality-rate. The main objective of the present study was to describe clinical and epidemiological features of BSF through a retrospective analysis of BSF confirmed cases in endemic areas. Non-specific clinical signs like fever, myalgia, headache, and exanthema were the earliest and most frequent clinical signs. A high frequency of hemorrhagic manifestations (22.9%-77.6%), icterus (16.7%-52%), neurological signs (27.2%-51.7%), and respiratory distress (17.5%-62%) was also observed. Case-fatality ratio in São Paulo State between 2003 and 2008 was 29.6% (21.9%-40%). Thrombocytopenia and elevated liver enzymes were the most frequent laboratorial abnormalities, reaching 100% in some groups. In the pediatric age-group, BSF also presented as a severe disease with a slightly lower rate of clinical complications, but a similar high lethality rate (28.4%). Interestingly, when we compared the clinical profile of BSF cases between São Paulo state and Santa Catarina state, located in the southernmost part of Brazil, a milder disease, with a lower frequency of clinical signs of severity and no fatalities was observed in the latter. The most frequent clinical syndromes occurring in BSF patients were hemorrhagic, ictero-hemorrhagic, and exanthematic acute febrile syndromes (37.1%, 33.9% and 11.3% respectively). The most important differential diagnosis to BSF was leptospirosis, dengue fever, and meningococcal disease (28.5%, 17.2%, and 5.4%, respectively). In 31% of non-confirmed BSF cases, no etiological diagnosis was defined. A higher incidence of BSF was observed in males and in the 20-49 years age-group. In areas where A. cajennense is recognized as the most important vector, a higher BSF incidence was observed from June to September. Clusters of BSF were associated to elevated fatality rates and a wide number of ecoepidemiological determinants. Recreational and occupational activities in rural, periurban, and waterside areas, with presence of animals (mostly horses and capybaras, and eventually dogs) were considered the most important exposure risk factors to infection. The present study suggests a more severe pattern of R. rickettsii in São Paulo state when compared with Rocky Mountain spotted fever in United States. Exanthema, icterus, and hemorrhage are important clinical markers of BSF and should be considered in the suspicion of this disease and as a differential diagnosis. Knowledge of clinical, epidemiological, and risk factors for infection should be used to structure and improve the measures for control and prevention of BSF. Together, the higher severity of R. rickettsii infection in São Paulo state, the occurrence of atypical cases in Santa Catarina, and the unknown etiological diagnosis of a high percentage of post-tick exposure febrile patients suggest that more virulent R. rickettsii strains, other Rickttsiae species and, eventually, other tick-borne diseases could be occurring in Brazil / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica
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Fatores ambientais associados a transmissão e a distribuição espacial da febre maculosa brasileira na bacia dos rios Piracicaba, Capivari e Jundiaí, Estado de São Paulo, Brasil = Environmental factors associeatted with transmission and spatial distribution of brazilian spotted fever in the basin of the Piracicaba, Capivari, Jundiaí, São Paulo State, Brazil / Environmental factors associeatted with transmission and spatial distribution of brazilian spotted fever in the basin of the Piracicaba, Capivari, Jundiaí, São Paulo State, BrazilSouza, Celso Eduardo, 1963- 27 August 2018 (has links)
Orientador: Maria Rita Donalisio Cordeiro / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-27T05:43:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2015 / Resumo: A febre maculosa brasileira (FMB) é uma doença infecciosa aguda, cujo agente etiológico é a Rickettsia rickettsii, bactéria Gram negativa intracelular obrigatória e transmitida por meio da picada de carrapatos infectados. O objetivo deste estudo é descrever os fatores associados ao ciclo de transmissão e a distribuição espacial da FMB na Bacia do Rio Piracicaba, região de maior registro de casos da doença no estado de São Paulo. Realizou-se um estudo retrospectivo das fichas de investigação dos LPI da FMB realizadas pela equipe da Superintendência de Controle de Endemias (SUCEN) e de dados das investigações epidemiológicas do Sistema de Informações sobre Agravos de Notificação (SINAN) no período de 2003 a 2013. Foram analisados os casos confirmados pelos critérios laboratoriais e os descartados. Foi ajustado um modelo de regressão logística múltipla utilizando-se como variável resposta, os LPI dos casos confirmados de FMB e como variáveis explicativas, os fatores demográficos, ambientais, presença das espécies de vetores e de animais hospedeiros nos LPI. Para os estimadores Odds Ratio foi considerado intervalo de confiança de 95%. Após a identificação das coordenadas geográficas (X,Y) coletadas em campo, foram incorporadas superfícies no mapa da bacia contendo informações sobre índice de vegetação (Normalized Difference Vegetation Index), altitude, índice topográfico, declividade do terreno e hidrografia. As variáveis associadas à confirmação da FMB no modelo logístico múltiplo foram: idade (OR = 1,025 IC: 1,015-1,035), ocorrência em área urbana (OR = 1.515 IC: 1,036¿2.231), existência de pasto degradado (OR= 1,759 IC: 1,028¿3.003), presença de Amblyomma sculptum no ambiente (OR = 1,629 IC: 1,097¿2.439), coleta de carrapatos em equinos (OR = 1,939 IC: 0,999¿3, 764), presença de capivaras (OR= 1,467 IC: 1,009-2,138). Foram observados aglomerados de maior densidade na região mais central da bacia e em regiões de baixa altitude (valores entre 448 a 590 metros) e em ambientes com baixos níveis de NDVI, próximos a área urbana e periurbana e à coleções hídricas. Foram confirmados 119 (59%) casos em LPI na área delimitada pelo raio de 1 km dos rios da bacia e 87 (41%) se o raio for de 500 metros. Fatores ambientais associados à transmissão da FMB podem dirigir as investigações em campo, identificar área de maior risco de transmissão da FMB e facilitar a priorização de investimentos das medidas preventivas e de controle / Abstract: Brazilian spotted fever (BSF) is an acute infectious disease whose etiologic agent is Rickettsia rickettsii, obligate intracellular Gram negative bacteria and transmitted through the bite of infected ticks. The objective of this study is to describe the factors associated with the transmission cycle and the spatial distribution of FMB in Piracicaba River Basin, the largest region reported cases of the disease in the state of São Paulo. We conducted a retrospective study of the investigation forms of FMB of the IPL undertaken by staff of the Superintendency of Endemic Disease Control (SUCEN) and data from epidemiological investigations of the Information System of Notifiable Diseases (SINAN) in the 2003-2013 period. cases confirmed by laboratory criteria and discarded were analyzed. We adjusted a multiple logistic regression model using as dependent variable, the LPI of confirmed cases of FMB and as explanatory variables, demographic, environmental, presence of species of vectors and animal hosts in LPI. For estimators odds ratio was considered 95% confidence interval. After identifying the geographic coordinates (X, Y) collected in the field, surfaces were incorporated into the basin map containing information about vegetation index (Normalized Difference Vegetation Index), altitude, topographic index, land slope and hydrography. The variables associated with confirmation of FMB in multiple logistic regression were age (OR = 1.025 CI: 1.015 to 1.035), occurring in urban areas (OR = 1.515 CI: 1.036 to 2231), existence of degraded pasture (OR = 1.759 CI: 1.028 to 3003), the presence of Amblyomma sculptum the environment (OR = 1.629 CI: 1.097 to 2439), collection of ticks on horses (OR = 1.939 CI: 0.999 to 3, 764), presence of capybaras (OR = 1.467 CI: 1.009 -2.138). Higher density clusters were observed in the most central part of the basin and in low-lying regions (values between 448-590 meters) and in environments with low levels of NDVI, near urban and peri-urban and basins. 119 were confirmed (59%) cases in the area bounded by LPI 1 km radius of the basin's rivers and 87 (41%) if the radius is 500 meters. Environmental factors associated with the BSF transmission may conduct investigations in the field, identify area of greatest risk of transmission of FMB and facilitate the prioritization of investments of preventive and control measures / Doutorado / Epidemiologia / Doutor em Saude Coletiva
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Biodiversidade de potenciais vetores de rickettsias em áreas de vulnerabilidade para febre maculosa no município de Juiz de Fora, Minas Gerais, BrasilDurães, Liliane Silva 27 February 2015 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2015-12-01T10:18:13Z
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Previous issue date: 2015-02-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O município mineiro de Juiz de Fora se destaca no contexto epidemiológico por possuir indicadores de vulnerabilidade, como alto número de notificações do estado, com casos ocorrentes no perímetro urbano, que detém elevada densidade populacional, ocupação de áreas limítrofes com fragmento de mata, as quais margeiam áreas confirmadamente endêmicas, possibilitando o intercâmbio de artrópodes vetores com mamíferos hospedeiros. Tais áreas propiciam o desenvolvimento e a manutenção dos ciclos enzoótico e epidêmico para Febre Maculosa. Mediante ao exposto, o objetivo geral deste projeto foi investigar e mapear a relação natural entre espécies de Rickettsia sp. e seus potenciais vetores em cinco regiões de vulnerabilidade do município. Especificamente, objetivaram-se: a determinação da composição da fauna de ectoparasitos potencialmente vetores coletados sobre hospedeiros vertebrados, bem como livres no ambiente; análise do ciclo enzoótico através da detecção de rickettsias por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR); a caracterização dos agentes rickettsias por sequenciamento e análises filogenéticas e a avaliação dos aspectos epidemiológicos da rickettsias circulantes, dos vetores e seus hospedeiros vertebrados. Os ectoparasitos foram coletados no período de 2013-2014 em localidades que carecem de informações sobre a manutenção do ciclo de transmissão de rickettsias: Caetés, Igrejinha, Paula Lima, Torreões e Valadares. No total foram coletados e identificados 12.692 ectoparasitos, entre pulgas do gênero Ctenocephalides e carrapatos dos gêneros Amblyomma, Rhipicephalus e Dermacentor, com posterior processamento de 2.379 espécimes de maneira individual ou reunidos em lotes de acordo com localidade, sexo, estádio de desenvolvimento, constituindo 249 amostras. O DNA genômico destas amostras foi extraído e submetido à pesquisa de genes rickettsiais gltA (gênero Rickettsia) e ompA (Grupo da Febre Maculosa-GFM). Foram obtidas 29 amostras positivas, exceto para Caetés; sendo 16 para o gene gltA, com 11 amostras sequenciáveis, e 13 amostras para o gene ompA, com sete sequenciáveis; com destaque para Amblyomma cajennense sendo a espécie mais prevalente e com 4,29% de taxa de infecção mínima. Sequências com 99 e 100% de identidade com a espécie patogênica Rickettsia felis foram diagnosticadas em Ctenocephalides canis e Ctenocephalides felis. E de forma inédita o registro de Rickettsia bellii em Amblyomma dubitatum na Microrregião de Juiz de Fora, apresentando sequências com 97% de homologia. O presente trabalho revela uma maior distribuição geográfica de rickettsias do GFM, incluindo R. felis causadora da rickettsiose felis, na Microrregião de Juiz de Fora. / The city of Juiz de Fora, in the Brazilian state of Minas Gerais, stands out in the epidemiologic context for possessing vulnerability indicators, such as a high number of this state´s notifications, with cases occurring in the urban perimeter, which contains an elevated population density, and the occupation of limit areas with forests´ fragments, which have a frontier with confirmed endemic areas, making possible the interchange of arthropod vectors with mammal hosts. Such areas propitiate the development and the maintenance of the enzootic and the epidemic cycles for the Spotted Fever. By the above, the general objective of this project was to investigate and to map the natural relation between Rickettsia sp. Species and its potential vectors in five regions of vulnerability in the city. Specifically, here are the objectives: the determination of the fauna composition for ectoparasites potentially vectors, collected on vertebrate hosts, as well as loose in the environment; analysis of the enzootic cycle through the detection of rickettsias by Polymerase Chain Reaction (PCR); the rickettsias agents characterization through sequencing and phylogenetic analyses and the evaluation of the epidemiologic aspects of the circulating rickettsias, of the vectors and their vertebrate hosts. The ectoparasites were collected in the period of 2013-2014 in places that need information on the maintenance of rickettsias transmission cycle: Caetés, Igrejinha, Paula Lima, Torreões e Valadares. As a total, there were collected and identified 12,692 ectoparasites, among fleas from the gender Ctenocephalides and ticks from the genders Amblyomma, Rhipicephalus and Dermacentor, with a posterior processing of 2,379 specimens in an individual way or gathered in lots according to place, sex, development state, constituting 249 samples. The genomic DNA from these samples was extracted and submitted to research of rickettsiais gltA (gênero Rickettsia) e ompA (Grupo da Febre Maculosa-GFM) genes. There were obtained 29 positive samples, except for Caetés; from which 16 for the gltA gene, with 11 sequenced samples, and 13 samples for the ompA gene, with seven sequenced; especially Amblyomma cajennense as the most prevalent species and with 4.29% of minimal infection rate. Sequences with 99 and 100% of identity with the pathogenic species Rickettsia felis were diagnosed in Ctenocephalides canis and Ctenocephalides felis. And in a surprising way the register of Rickettsia bellii in Amblyomma dubitatum in Juiz de Fora´s Micro-region, presenting sequences with 97% of homology. This paper reveals a bigger geographic distribution of rickettsias from GFM, including R. felis that causes rickettsiosis felis, in Juiz de Fora´s Micro-region.
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Biodiversidade de potenciais vetores de Rickettsias em áreas de vulnerabilidade para febre maculosa no município de Juiz de Fora, Minas Gerais, BrasilDurães, Liliane Silva 27 February 2015 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2015-12-03T09:53:31Z
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Palavras-chave: primeira letra de cada palavra em maiúsculo. Acrescentar uma em cada linha (não precisa colocar ponto e nem vírgula no final) on 2015-12-03T11:59:21Z (GMT) / Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2015-12-03T12:48:28Z
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Previous issue date: 2015-02-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O município mineiro de Juiz de Fora se destaca no contexto epidemiológico por possuir indicadores de vulnerabilidade, como alto número de notificações do estado, com casos ocorrentes no perímetro urbano, que detém elevada densidade populacional, ocupação de áreas limítrofes com fragmento de mata, as quais margeiam áreas confirmadamente endêmicas, possibilitando o intercâmbio de artrópodes vetores com mamíferos hospedeiros. Tais áreas propiciam o desenvolvimento e a manutenção dos ciclos enzoótico e epidêmico para Febre Maculosa. Mediante ao exposto, o objetivo geral deste projeto foi investigar e mapear a relação natural entre espécies de Rickettsia sp. e seus potenciais vetores em cinco regiões de vulnerabilidade do município. Especificamente, objetivaram-se: a determinação da composição da fauna de ectoparasitos potencialmente vetores coletados sobre hospedeiros vertebrados, bem como livres no ambiente; análise do ciclo enzoótico através da detecção de rickettsias por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR); a caracterização dos agentes rickettsias por sequenciamento e análises filogenéticas e a avaliação dos aspectos epidemiológicos da rickettsias circulantes, dos vetores e seus hospedeiros vertebrados. Os ectoparasitos foram coletados no período de 2013-2014 em localidades que carecem de informações sobre a manutenção do ciclo de transmissão de rickettsias: Caetés, Igrejinha, Paula Lima, Torreões e Valadares. No total foram coletados e identificados 12.692 ectoparasitos, entre pulgas do gênero Ctenocephalides e carrapatos dos gêneros Amblyomma, Rhipicephalus e Dermacentor, com posterior processamento de 2.379 espécimes de maneira individual ou reunidos em lotes de acordo com localidade, sexo, estádio de desenvolvimento, constituindo 249 amostras. O DNA genômico destas amostras foi extraído e submetido à pesquisa de genes rickettsiais gltA (gênero Rickettsia) e ompA (Grupo da Febre Maculosa-GFM). Foram obtidas 29 amostras positivas, exceto para Caetés; sendo 16 para o gene gltA, com 11 amostras sequenciáveis, e 13 amostras para o gene ompA, com sete sequenciáveis; com destaque para Amblyomma cajennense sendo a espécie mais prevalente e com 4,29% de taxa de infecção mínima. Sequências com 99 e 100% de identidade com a espécie patogênica Rickettsia felis foram diagnosticadas em Ctenocephalides canis e Ctenocephalides felis. E de forma inédita o registro de Rickettsia bellii em Amblyomma dubitatum na Microrregião de Juiz de Fora, apresentando sequências com 97% de homologia. O presente trabalho revela uma maior distribuição geográfica de rickettsias do GFM, incluindo R. felis causadora da rickettsiose felis, na Microrregião de Juiz de Fora. / The city of Juiz de Fora, in the Brazilian state of Minas Gerais, stands out in the epidemiologic context for possessing vulnerability indicators, such as a high number of this state´s notifications, with cases occurring in the urban perimeter, which contains an elevated population density, and the occupation of limit areas with forests´ fragments, which have a frontier with confirmed endemic areas, making possible the interchange of arthropod vectors with mammal hosts. Such areas propitiate the development and the maintenance of the enzootic and the epidemic cycles for the Spotted Fever. By the above, the general objective of this project was to investigate and to map the natural relation between Rickettsia sp. Species and its potential vectors in five regions of vulnerability in the city. Specifically, here are the objectives: the determination of the fauna composition for ectoparasites potentially vectors, collected on vertebrate hosts, as well as loose in the environment; analysis of the enzootic cycle through the detection of rickettsias by Polymerase Chain Reaction (PCR); the rickettsias agents characterization through sequencing and phylogenetic analyses and the evaluation of the epidemiologic aspects of the circulating rickettsias, of the vectors and their vertebrate hosts. The ectoparasites were collected in the period of 2013-2014 in places that need information on the maintenance of rickettsias transmission cycle: Caetés, Igrejinha, Paula Lima, Torreões e Valadares. As a total, there were collected and identified 12,692 ectoparasites, among fleas from the gender Ctenocephalides and ticks from the genders Amblyomma, Rhipicephalus and Dermacentor, with a posterior processing of 2,379 specimens in an individual way or gathered in lots according to place, sex, development state, constituting 249 samples. The genomic DNA from these samples was extracted and submitted to research of rickettsiais gltA (gênero Rickettsia) e ompA (Grupo da Febre Maculosa-GFM) genes. There were obtained 29 positive samples, except for Caetés; from which 16 for the gltA gene, with 11 sequenced samples, and 13 samples for the ompA gene, with seven sequenced; especially Amblyomma cajennense as the most prevalent species and with 4.29% of minimal infection rate. Sequences with 99 and 100% of identity with the pathogenic species Rickettsia felis were diagnosed in Ctenocephalides canis and Ctenocephalides felis. And in a surprising way the register of Rickettsia bellii in Amblyomma dubitatum in Juiz de Fora´s Micro-region, presenting sequences with 97% of homology. This paper reveals a bigger geographic distribution of rickettsias from GFM, including R. felis that causes rickettsiosis felis, in Juiz de Fora´s Micro-region.
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Avaliação clínica e microbiológica periodontal em portadores de cardiopatia valvar na gestação / Clinical periodontal status in pregnant women with reumatic valvar diseaseLilia Timerman 01 August 2008 (has links)
Microorganismos da cavidade oral têm sido admitidos como causadores de doenças sistêmicas com reconhecido mecanismo de disseminação via corrente sangüínea. Diferentes fatores, incluindo a presença da doença periodontal, têm influência no risco de bacteremia oral, podendo ocasionar endocardite infecciosa por Streptococcus viridans. Sendo assim, a manutenção da saúde bucal adquire elevado grau de importância em gestantes portadoras de doença valvar reumática, em que o risco de endocardite infecciosa é eminente. A escassez científica fez deste tema o objetivo deste estudo: investigar a condição clínica periodontal de gestantes portadoras de cardiopatia valvar, identificando agentes periodontopatógenos nas amostras coletadas de saliva, sulco/bolsa periodontal, Para tanto, foram estudadas 52 gestantes cardiopatas (GC) e 70 gestantes não-cardiopatas (GNC). A condição periodontal foi avaliada empregando-se profundidade clínica de sondagem (PCS), nível clínico de inserção (NCI), linha esmalte cemento/margem gengival (LEC/MG), índice de sangramento (IS) e índice de placa bacteriana (IP). As seguintes médias foram obtidas para os parâmetros periodontais avaliados: PCS: 1.52 (GC) e 1.45 (GNC); NCI: 1.13 (GC) e 1.02 (GNC); LEC/MG: 0.41 (GC) e 0.40 (GNC); IS: 7.34 (GC) e 6.27 (GNC) e IP: 12.19 (GC) e 13.48 (GNC). Não houve diferença entre os grupos para o NCI (p= 0,612). A presença da Porphyromonas gingivalis na saliva foi maior (p= 0,007) no GNC, porém não houve diferença nas amostras de sulco/bolsa periodontal. / Microorganisms of the oral cavity are known to cause systemic diseases, spread through sanguine current. Different factors, including the presence of periodontal disease, influencing the risk of oral bacteremia could cause infectious endocarditis for Streptococcus viridans. Nevertheless, the maintenance of the oral health is extremely important in pregnant women with rheumatic valvar disease, in which the risk of infectious endocarditis is eminent. The aim of this study was to investigate the clinical periodontal condition of pregnant women with valvar disease and to identify the presence of Porphyromonas gingivalis in saliva and subgingival samples. For these purposes, we studied 52 pregnant with valvar disease (GC) and 70 healthy pregnant women (GNC). The following periodontal parameters were evaluated: probing depth (PCS), clinical attachment level (NCI), gingival margin location (LEC/MG), bleeding on probing (IS) and plaque index (IP). The following mean periodontal parameters were obtained: PCS: 1.52 (GC) e 1.45 (GNC); NCI: 1.13 (GC) e 1.02 (GNC); LEC/MG: 0.41 (GC) e 0.40 (GNC); IS: 7.34 (GC) e 6.27 (GNC) e IP: 12.19 (GC) e 13.48 (GNC). There was no statistical difference for NCI among the groups. There was no difference between periodontal clinical conditions in pregnant women with valvar disease and healthy pregnant women. The presence of the Porphyromonas gingivalis in saliva samples of healthy pregnant women is statistically higher than in pregnant woman with valvar disease; however, there was no difference in periodontal samples
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Avaliação da microbiota bucal em pacientes sob uso crônico de penicilina G benzatina / Evaluation of oral microbiota in patients on chronic use of benzathine penicillinAndré Andrade de Aguiar 02 July 2009 (has links)
A Febre Reumática, complicação tardia de uma infecção de orofaringe causada pelo Streptococcus pyogenes (estreptococo -hemolítico do grupo A de Lancefield), tem como conseqüência a Cardiopatia Reumática, explicada pelo mimetismo molecular entre proteínas cardíacas humanas e a associação de proteínas e carboidratos da membrana do S. pyogenes. A profilaxia secundária com a PGB 1.200.000 UI IM propõe-se a evitar novos surtos, sendo administrada em intervalos de vinte e um dias nos países com alto índice de estreptococcia. A lesão valvar predispõe à Endocardite Infecciosa, que resulta de bacteriemias causadas por focos infecciosos de origem bucal em cerca de 40% dos casos. Os Streptococcus Viridans constituem o grupo mais comumente encontrado nas Endocardites Infecciosas, em especial os Streptococcus sanguinis e Streptococcus oralis. O efeito do uso crônico da PGB não foi estudado com especificidade para essa microbiota. Assim, foi avaliada, qualitativa e quantitativamente, a microbiota bucal de 100 pacientes, aos 7 e 21 dias, após profilaxia secundária para a Febre Reumática com a PGB 1.200.000 UI IM e comparada com a de 100 pacientes portadores de doença arterial coronariana sem antecedentes de Febre Reumática. As espécies avaliadas foram divididas em S. sanguinis, S. oralis e outras espécies de Streptococcus Viridans Foram coletadas amostras de saliva pela mastigação de goma de parafina e transportadas em meio VMGA II S. As culturas foram semeadas em ágar Columbia CNA com 5% de sangue desfibrinado puro de carneiro com acréscimo de penicilina G. e incubadas a 35ºC em estufa de CO2 por 72 horas. As colônias sugestivas de Streptococcus foram submetidas a testes bioquímicos para confirmação de gênero e espécie. A concentração inibitória mínima foi determinada pelo método Etest e interpretada segundo os padrões do Clinical and Laboratory Standards Institute. Não houve diferença quanto à presença do S. sanguinis nos grupos estudados (P=0,40). O S. oralis prevaleceu aos 7 dias de PGB em relação ao grupo controle (P=0,01). Quanto à identificação de outras espécies, houve maior número de cepas nos pacientes do grupo controle quando comparados aos do grupo de estudo aos 7 e 21 dias de PGB (P<0,001). Os números de UFC/ml de S. sanguinis, S. oralis e de outras espécies foram comparados entre os grupos e não houve diferença entre eles (P=0,96; P=0,60 e P=0,77; respectivamente). Quanto às CIM do S. sanguinis e do S. oralis, não houve diferença entre os grupos (P=0,79 e P=0,13; respectivamente). Todos os testes estatísticos foram realizados em um nível de significância de 5%. Concluiu-se que o S. oralis prevaleceu aos 7 dias de PGB 1.200.000 UI IM; os Streptococcus Viridans de outras espécies prevaleceram no grupo controle; o número de UFC/mL de saliva não diferiu nos grupos estudados, a susceptibilidade dos S. sanguinis e S. oralis à penicilina G não foi alterada pela ação da PGB 1.200.000 UI IM a cada 21 dias e, por fim, a PGB não provocou reações de hipersensibilidade em nenhum paciente do estudo / Rheumatic fever is the result of a Streptococcus pyogenes (group A -hemolytic Streptococcus) infection of the upper respiratory tract. Rheumatic heart disease is a rheumatic fever consequence and is elucidated by the molecular mimicry between human cardiac proteins and group A streptococcal proteins and carbohydrates association. The secondary prophylaxis with 1,200,000 U BPG every three weeks is used for prevention of recurrent rheumatic fever in developing countries. Valvar defects are a risk for infective endocarditis which is resulted of bacteriemia caused for oral infectious focuses in 40% of cases. Viridans streptococci are the predominant group recovered in infective endocarditis, specially Streptococcus sanguinis and Streptococcus oralis. The effect of chronic BPG wasnt studied with specificity to these pathogens yet. Therefore, the oral microbiota was evaluated, qualitatively and quantitatively, at 7 and 21 days after secondary prophylaxis with BPG to rheumatic fever (study group), in a hundred patients and in comparison to another hundred patients with coronary heart disease who never acquired rheumatic fever (control group). The species evaluated were divided in S. sanguinis, S. oralis and another Streptococcus species. It was collected samples of chewing-stimulated saliva (1ml) and transported in VMGA II S medium. The samples were cultured in pure and with penicillin G 5% sheep blood Columbia ágar (CNA), incubated for 72 hours in an atmosphere containing 5% CO2 at 35ºC. The strains that were suggestive to Streptococcus were identified by biochemical tests to confirm bacteria species and genus. Minimal inhibitory concentration was determined by Etest method and interpreted in accordance to Clinical and Laboratory Standards Institute. The results showed that there was no difference in S. sanguinis presence in all groups (P=0.40). S. oralis prevailed in 7 days BPG group in comparison to control group (P=0.01). The control group showed the highest number of others species in comparison to 7 and 21 days BPG (P<0.001). CFU/ml numbers of S. sanguinis, S. oralis and other species strains were compared in 7 and 21 days BPG to control group and there was no difference among themselves (P=0.96, P=0.60 and P=0.77; respectively). There was no difference in S. sanguinis and S. oralis MICs among the study and control groups (P=0.79 and P=0.13). All statistic tests were done at 5% significance level. It was concluded that S. oralis prevailed in 7 days BPG group in comparison to control group; other species of Viridans streptococci prevailed in control group. The number of CFU/mL did not differ in both studied groups; the penicillin susceptibility of S. sanguinis and S. oralis did not change by BPG every three weeks and, by the end, it was not observed hypersensitivity reactions to penicillin in neither of the patients of this study
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Etude des déterminants climatiques et environnementaux de la dengue en Guyane française / Climatic and Environmental Drivers of Dengue Fever in French GuianaFlamand, Claude 18 December 2015 (has links)
Première des maladies infectieuses jugées comme prioritaire en Guyane, la dengue fait l’objet d’une forte mobilisation des pouvoirs publics. L’amélioration des connaissances relatives aux facteurs climatiques et environnementaux qui influencent la dengue est un préalable indispensable pour le développement de modèles de prédiction nécessaires pour anticiper et adapter les mesures de gestion aux différentes échelles du département. Cette thèse poursuit un double objectif : i) analyser aux différentes échelles de la Guyane (département, territoires, communes), l’effet des facteurs climatiques et environnementaux sur la dynamique des épidémies de dengue et ii) développer des modèles de prédiction des épidémies. A cet égard, des outils statistiques, de fouille de données et de modélisation complémentaires on été utilisés pour étudier l’influence des facteurs climatiques et environnementaux sur la dynamique de la dengue. Un modèle de prévision climatique des épidémies à l'échelle du départeent, présentant une bonne valeur prédictive a été développé. Ce modèle prédit une épidémie pour 2016. / Dengue is the most prioritized infectious disease in French Guiana with an intense mobilization of public health authorities. In this context, the improvement of knowledge on the climatic, environmental and demographic determinants of dengue transmission is a necessary condition to the development of epidemic prediction model for the planning of control activities at each level of organization of the territory. This thesis had two objectives: i) assess the effect of climatic and environmental factors on dengue spread; ii) develop prediction models of epidemic to anticipate and plan prevention and control activities. We used complementary statistical, data mining and modeling tools to show that climatic and environmental factors interplay with dengue incidence differently at different territory scales. A predictive model with a good performance was developped considering the whole territory of French Guiana. This model indicates that a dengue epidemic is likely to occur in 2016.
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Das Leben in der napoleonischen Armee - interdisziplinäre Untersuchung eines Massengrabs aus Kassel, Hessen / The life in the napoleonic army - interdisciplinary investigation of a mass grave from Kassel, Hessevon Grumbkow, Philipp 23 October 2013 (has links)
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