Cette thèse propose une étude des partenariats pour le développement en prenant pour exemple le cas du partenariat entre l’Inde et le Sénégal. La revendication de bénéficies mutuelles se trouve au cœur de ce partenariat. L’Inde et le Sénégal étant deux démocraties vibrantes, nous pouvons supposer que les dits bénéfices ont pour finalité d’augmenter le bien-être des citoyens de ces deux pays. Ainsi, cette thèse se fonde sur l’étude du développement dans la mesure où il contribue à l’augmentation des capacités, de la liberté et des perspectives du peuple dans les deux pays étudiés (comme le définit Amartya Sen 1999, 2002). Basée sur ces hypothèses, la thèse pose la question suivante : « Un partenariat revendiquant des bénéfices mutuels peut-il conduire à un développement mutuel ?». Le corollaire induit par cette problématique questionne l’équité dans la distribution des bénéfices aux partenaires, c’est-à-dire, est ce que le partenariat est équitable et juste comme il se revendique ? L’étude des acteurs, des motivations, des moyens, des instruments, des méthodes, de la nature et des finalités de ce partenariat feront objet de cette thèse. La thèse conclue en indiquant que les divergences, erreurs, l’ignorance, la malhonnêteté et même l’identification peuvent créer des désaccords en contradiction avec le comportement juste en faveur du développement. Néanmoins, en s’appuyant sur le travail de Froese (2001), Nussbaum (2011), Rawls (1999), Rousseau (2012) et Tocqueville (1981) la thèse soutient que le développement mutuel et juste est en faveur de la poursuite du partenariat. / Taking cue from Rawls’s (2012) work on distributive justice, the thesis studies development partnership through the case study of India and Senegal. Mutual benefits have been asserted time and again as the core element of this partnership. Being two thriving democracies, it shall be assumed that the ultimate beneficiaries of the ‘intended benefits’ are to be the people of India and Senegal. Hence, in this thesis we choose to see development as it should enhance capability, freedom and opportunity (as put forward by Sen 1999, 2002) for the citizens of the two countries being studied. With such beliefs, the thesis is naturally centred on the question, “Can a relationship based on mutual benefits lead to mutual development?” An important corollary to the problematic is the equity in the distribution of benefits adhering to the partners’ i.e. whether at all the partnership is equal and faire as it is claimed to be? It is hence, worth studying the ‘who’, the ‘why’, the ‘how’ and the ‘what’ of this partnership through the actors, the motivations, the means, the methods, the nature and the ‘ends’ of it. The thesis argues strongly in favour of equity for fair and sustainable development. The thesis argues that discrepancies, errors, identification, unawareness and unethical behaviour might lead to distortions from just behaviour expected in favour of development. However, drawing on the works of Froese (2001), Nussbaum (2011), Rawls (1999), Rousseau (2012) and Tocqueville (1981) the thesis concludes that fair, mutual development would be in the favour of the partnership.

Dans le cortex cérébelleux, au premier chef impliqué dans l’apprentissage moteur, chaque neurone de Purkinje reçoit des centaines de milliers d'entrées provenant de cellules granulaires. Etonnement, il a été suggéré qu'une grande majorité de ces connexions (synapses) sont silencieuses, c’est-à-dire qu’elles ne transmettent pas d’information détectable. Les propriétés et le rôle de ces synapses silencieuses restent mystérieux. Jouent-elles le rôle d’une réserve ou sont-elles le produit de l’apprentissage cérébelleux ? En combinant l’enregistrement électrique de la transmission synaptique et la cartographie des entrées synaptiques dans des tranches aigües de cervelet de souris, nous avons étudié l'évolution du pourcentage des synapses qui sont silencieuses entre deux âges : avant le sevrage et une fois que l’agilité d’adulte est acquise. Nous avons observé que le pourcentage de synapses qui sont silencieuses reste remarquablement stable malgré l’augmentation du nombre total de synapses. / In the cerebellar cortex, primarily involved in motor learning, any Purkinje neuron receives hundreds of thousands of inputs from granule cells. Disturbingly, it has been suggested that the vast majority of these connections (synapses) are silent, that is to say they do not transmit any detectable information. The properties and the role of these silent synapses remains mysterious. Do they serve as a reserve pool for additional information storage or are they a byproduct of cerebellar learning? Combining the electrical recording of synaptic transmission and the mapping of synaptic inputs in acute cerebellar slices from mice, we have studied how the percentage of synapses which are silent changes between two postnatal ages: before weaning and once adult agility is acquired. Our main finding is that the percentage of synapses which are silent remains remarkably stable despite the increase in the total number of synapses.

Contexte : Le développement de la fonction rénale immature des nouveau-nés prématurés est soumis à des facteurs environnementaux dont l'empreinte s'étend au-delà de la période néonatale. Objectifs : 1) déterminer les valeurs de référence du débit de filtration glomérulaire (DFG) chez des grands prématurés durant le premier mois de vie, 2) déterminer l'impact des facteurs périnatals sur leur fonction rénale, 3) déterminer l'effet de l'empreinte périnatale et de la croissance staturo-pondérale sur leur fonction rénale dans l'enfance. Echantillon : Cohorte multicentrique de nouveau-nés prématurés de 27-31 semaines d'aménorrhée, avec mesure de leur fonction rénale durant la période néonatale, et à 4 ans. Résultats : 1) 275 nouveau-nés inclus. La valeur de référence médiane de DFG (mL/min/1,73m²) s'étendait de : 7,9 à J7 à 37,9 à J28. 2) Le DFG était significativement diminué à J7 chez les enfants traités par ibuprofène : 12,8±6,2 vs. 18,1±12,1 ml/min/1,73 m² ; p < 0,001. Cette baisse persistait pendant le premier mois de vie, avec une atteinte de la fonction tubulaire. Parmi les médicaments administrés aux mères ou avant J7 chez les nouveau-nés, l'ibuprofène était le seul significativement associé à un DFG inférieur à la médiane pour l'âge gestationnel à J7. 3) Une taille >= -1 DS à quatre ans était un facteur de risque d'albuminurie élevée chez 119 enfants étudiés à quatre ans. Conclusion : i) Ces valeurs de référence de DFG sont disponibles pour recherche clinique, ii) L'environnement thérapeutique néonatal est un facteur de risque d'altération de la fonction rénale et de retard à la maturation rénale, iii) La taille à quatre ans est associée au taux d'albuminurie. / Background: Physiological development of renal may be altered in preterm infants by environmental factors. Their imprinting could persist beyond the neonatal period. Objectives: 1) to determine reference values of glomerular filtration rate (GFR) during the first month of life in preterm newborns, 2) to determine the impact of perinatal factors and of the drugs often prescribed on their renal function, 3) to determine the effect of the perinatal imprinting, and of the growth and height catch-up, on their renal function in early childhood. Sample: Multicentre cohort of children born very preterm at 27-31 weeks of gestation, with a measure of their renal function during the neonatal period, and at 4 years of age. Results: 1) 275 infants included. Median reference GFR value (mL/min/1.73m²) was: 7.9 on day7 to 37.9 on day 28. 2) GFR was significantly reduced on day 7 in ibuprofen-infused infants in comparison to Controls: 12.8±6.2 vs. 18.1±12.1 ml/min/1.73 m², p < 0.001. This decrease persisted throughout the first month of life, and tubular function was also altered. Among all antenatal drugs and drugs administered during the first week of life, alone ibuprofen was significantly associated with a GFR < median reference value on day 7. 3) Height >= -1 SD in early childhood was associated with a high albuminuria in 119 four year-old preterm-born children. Conclusion: i) These GFR reference values are to be used in clinical research, ii) Neonatal therapeutic environment impairs renal function and delays its maturation, iii) The height at age four is an independent risk factor of high albuminuria in preterm-born children.

Dans le cadre d’une action de prévention primaire en périnatalité, ce travail de thèse vise à démontrer les effets d’un accompagnement psychologique auprès du bébé et de sa famille. En France, dans le Lunévillois (département de Meurthe-et-Moselle), la fréquence des retards de langage chez les enfants de 4 ans est particulièrement élevée et reflète la réalité socioéconomique et culturelle qui caractérise ce territoire. En réponse aux besoins manifestes de ce secteur, la Pédopsychiatrie en lien avec la Protection Maternelle et Infantile a développé une recherche-action de prévention en périnatalité, dans le cadre du projet « Interrégional IV-A-Programme transfrontalier de Prévention et de Promotion de la Sante Mentale ». L’objectif était de mettre en place auprès des familles un accompagnement psychologique régulier, à domicile, pendant les deux premières années de vie du bébé et d’observer les effets de cette action dans trois domaines : le vécu de la parentalité, les interactions précoces et le développement de l’enfant. Le travail de thèse a permis d’analyser les observations recueillies dans le cadre de l’action de terrain auprès des familles. L’évaluation s’appuie sur un recueil de données longitudinales qualitatives et quantitatives (n=49) avec comparaison à une population témoin (n=42). Les résultats comparatifs montrent que les enfants qui ont bénéficié de la recherche-action ne présentent pas, à deux ans, le retard de langage observé dans la population témoin et d’une façon générale, ils font preuve d’un meilleur développement psychomoteur. L’accompagnement a permis de réduire l’impact de différents facteurs de risque sur le développement de l’enfant : la prématurité, l’absence de mode de garde extérieur et le manque d’investissement du père. Les résultats longitudinaux mettent en valeur les liens forts entre les interactions affectives, la construction progressive de la parentalité et le développement de l’enfant, entre la naissance et deux ans. Ils permettent de souligner les effets de l’accompagnement, de l’observation conjointe du bébé et de l’écoute empathique, sur l’ensemble de ce système, notamment dans les situations de dépression du post-partum, de vécu traumatique de la naissance ou de pathologie de la carence. L’adhésion forte au projet, le faible taux d’abandon et le vécu positif de l’accompagnement, indiquent la grande sensibilité des familles à cette forme d’action périnatale orientée vers le « prendre soin ». / As part of an early perinatal prevention action, this thesis aims to demonstrate the effects of counseling with the baby and its family. In France, in the Lunévillois (Meurthe-et-Moselle), the frequency of language delay in 4-year-old children is particularly high and reflects the socioeconomic and cultural reality thatcharacterizes this territory. In response to the obvious needs of this sector, the Child Psychiatry in connectionwith the Mother and Child Protection services has developed an action-research program of perinatal prevention,in the framework of the "Inter-regional IV A Programme for Prevention and Promotion of Mental health ".Theaim was to establish regular counseling with families at their home during the first two years of life of the baby,and to observe the effects of that action in three areas: the experience of parenting, early interactions anddevelopment of the child. The thesis has analyzed the observations collected during the field work with families.The evaluation is based on a collection of qualitative and quantitative longitudinal data (n = 49) compared with acontrol population (n = 42).The comparative results show that children who have benefited from the actionresearchdo not have, at the age of two, the language delay observed in the control population and in general theyshow a better psychomotor development. The support has made it possible to reduce the impact of various riskfactors on child development: prematurity, lack of outside care arrangements and lack of father investment. Thelongitudinal results highlight the strong links between the emotional interaction, the progressive construction ofparenting and child development, in infants up to two years of age. They serve to highlight the effects ofcounseling, of the joint observation of the baby and of empathic listening on the whole system, particularly in thepostpartum depression, situations of traumatic experience of birth or emotional deprivation. The strong supportfor the project, the low dropout rate and the positive experience of counseling, indicate the high sensitivity of thefamilies to this form of perinatal action aimed at "taking care".

Depuis plus de 40 ans, des Projets ont été conçus et mis en œuvre au Niger pour assurer le développement socio-économique mais force et de constater que les résultats atteints n’ont pas été à la hauteur des espoirs. Quinze années durant, le doctorant a travaillé au sein de Projets et programmes en qualité d'agent de développement. Le doctorant voulait à travers cette thèse comprendre les raisons de la prédominance et des limites de l’approche projet/programme à pérenniser les actions qu’ils initient et à avoir des impacts durables sur la pauvreté. A partir de l’analyse de la littérature et des expériences de projet auquel il a participé, il a exploré le concept de pauvreté en l’appliquant au Niger et a caractérisé la notion de projet et programme. Il a illustré ses propos à travers l’analyse de l’évolution sur quarante ans du village de M’Bida, en terme de pauvreté. La recherche engagée a permis d’aboutir à un certain nombre de résultats. Au Niger, la pauvreté est un phénomène dynamique, complexe, multidimensionnelle avec interactions entre facteurs. Toutefois, c’est la dimension socio-culturelle qui est déterminante dans la lutte contre la pauvreté. Les projets constituent un univers d’acteurs et de pratiques sociales. Les agents des projets et programmes manquent d’outils pour intégrer dans leurs modes d’intervention les stratégies des individus et groupes sociaux, localement dominants d’une part et extrêmement vulnérables d’autre part. Le manque d’évaluation post-projet ne permet pas d’appréhender les impacts durables, et de capitaliser les « bonnes pratiques ». Face à ces différentes contraintes, le doctorant propose la généralisation de l’approche territoriale pour contribuer à lever les blocages des approches projets et programmes. / Since more than forty years, projects have been elaborated and implemented in Niger to insure the socioeconomical development. But unfortunately the expected results have not been satisfactory.For fifteen years, the doctorand has been working with programs and projects as an agent of development. Through this Thesis, he wanted to understand the reasons of the predominance and limits of the program|project approach to perpetuate actions that they initiated so as to have sustainable impacts on poverty. Through an analysis of literature and experiences of the projects in which he participated, he explored the concept of poverty by applying it in Niger and has characterized the concept of program and project. He has justified his words through the analysis of the evolution of the village of M’BIDA within a period of forty years as regards to poverty. The research that has been implemented helped in achieving some results. In Niger, poverty is a multidimensional, complicated and dynamic phenomenon with interactions among factors. However, the socio-cultural dimension is a determining factor in the fight against poverty Projects constitute a world of actors and social practices. Projects and programs agents do not have means to integrate in their methods of intervention strategies of population and social groups that are locally important on one hand and those of extremely vulnerable population on the other hand. The lack of post project evaluation does not help in evaluating the sustainable impacts and to capitalize the good practices. Considering the various contrasts the doctorand suggests the generalization of the territorial approach to contribute in solving difficulties related to the approaches of projects and programs.

L'objectif de mon travail est de montrer l'action des pouvoirs publics camerounais dans le développement économique et social à l'Est-Cameroun de 1960 à 2010. De son accession à l'indépendance en 1960, le jeune État du Cameroun devait se réaliser, s'affirmer, se prendre en main, devenir maître de son destin. Sur le plan politique, l'instabilité politique régnait dans plusieurs régions du pays. Au niveau économique, les autorités camerounaises se sont mobilisées pour développer le pays et en faire un havre de prospérité. Ceci s'est traduit par la mise sur pied d'une politique de développement économique, social et culturel à travers une planification de type indicatif. Cette planification politique camerounaise de développement s'avérait un instrument d'organisation, d'orientation, d'impulsion et d'animation du développement économique et social. L'Est-Cameroun, parent pauvre en matière de développement, avait bénéficié de quelques projets de développement qui contrastaient avec les potentialités de la région. Pour les pouvoirs publics, les défis et les enjeux étaient énormes à relever pour sortir cette région du sous développement et réduire la pauvreté. A cet effet, les axes de réflexion retenus n'étaient possibles que s'ils restaient en phase avec les aspirations des pouvoirs publics construits dans l'optique d'atteindre des objectifs du développement. Les résultats obtenus ont été contrastés à plusieurs niveaux. Le développement envisagé à l'Est-Cameroun est mitigé au regard de la participation de la région à la croissance économique. / The goal of my work was to show the actions of Cameroonian government in the economic and social development in East Cameroon from 1960 to 2010. This said, from her accession to independence in 1960, the young state of Cameroon had to be accomplished, affirmed and became master of her destiny. On the political domain, political instability reigned in several regions of the country. At the economic level, the Cameroonian authorities mobilized themselves to develop the country and to make it an environment of prosperity. This came about by the putting in place a policy of an economic, social and cultural development through an indicative type of planification. This Cameroonian political planification of development was an instrument of organization, of orientation and the animation of economic and social development. East Cameroon, a poor parent in matters of development had benefited from some developmental projects which were in contrast with the potentialities of the region. As for the government, the challengers were many to overcome so as to bring out the region from under development to reduce poverty. To this effect, the idea of reflection that was received was possible only it they remained in line with aspirations of the government constructed to attain the objectives of development. The results obtained were contrasted at different levels. The development envisaged in the East of Cameroon is in accordance to the participation of the region to the economic growth.

Cette thèse de doctorat effectuée à l’Université Paris-Sorbonne est le résultat de quatre années de recherches sur le rôle des Organisations de la Société Civile (OSC) camerounaises dans la réalisation des Objectifs du Millénaire pour le Développement (OMD). Fondée sur une expérience participative de 18 mois dans le milieu du développement au Cameroun, sur plusieurs dizaines d’entretiens avec des OSC camerounaises, des ONG internationales et les principaux partenaires techniques et financiers du Cameroun ainsi que sur l’analyse statistique de plus de 300 OSC camerounaises travaillant dans le domaine des OMD, cette thèse cherche à mesurer l’impact des OSC sur les indicateurs de développement et à déterminer les facteurs susceptibles d’optimiser cet impact. Alors que l’initiative des OMD, lancée par les Nations Unies en 2000, arrive à son terme en 2015, le bilan tiré par les différents acteurs du développement appelle à une participation accrue des OSC dans les pays bénéficiaires de l’aide internationale. Ce travail confirme l’intérêt que peuvent avoir les acteurs institutionnels du développement à collaborer avec la société civile pour améliorer les conditions de vie des populations et l’efficience des ressources allouées au développement. / This doctorate thesis undertaken at Paris-Sorbonne University results from four years of research on the role of Cameroonian Civil Society Organizations (CSOs) in the achievementof the Millennium Development Goals (MDGs). Based on an 18-month participatory experience in development in Cameroon, on several dozens of interviews with Cameroonian CSOs, international NGOs and the key technical and financial partners of Cameroon as well as on the statistical analysis of over 300 Cameroonian CSOs operating in MDG-related fields,this thesis intends to measure the impact of CSOs in development indicators and to determine the factors which can optimize this impact. As the MDG initiative, launched by the United Nations in 2000, reaches its term in 2015, its final assessment by different developments takeholders calls for a stronger participation of CSOs in countries benefiting from international aid. This research confirms the interest institutional stakeholders can find incollaborating with civil society to improve the living conditions of populations and the efficiency of the resources allocated to development.

Le marché mondial des fruits représente des centaines de milliards d’euro par an et l’amélioration de la qualité organoleptique et nutritionnelle des fruits est l’un des principaux objectifs de ces dernières années. Le métabolisme primaire est une cible toute trouvée pour tenter de répondre à ces exigences. En effet c’est lui qui va fournir les briques nécessaires à la croissance et au développement, mais également les composés qui confèrent les valeurs gustatives tels que les sucres et les acides organiques. C’est pourquoi la compréhension de son fonctionnement au cours du développement des fruits est nécessaire. Pour cela le métabolisme primaire a été étudié chez huit espèces de fruits charnus qui diffèrent en termes de durée de développement, de taille de fruit, de famille botanique, de qualité gustative (sucrosité, acidité…), et sujettes ou non à une crise respiratoire au début de la maturation. Des données physiologiques et biochimiques ont été collectées tout au long du développement du fruit, de l’anthèse à la maturité physiologique. La modélisation de la croissance des fruits a permis de standardiser les stades de développement et ainsi d’améliorer la comparaison entre espèces. La composition de la biomasse a ensuite été caractérisée qualitativement et quantitativement par des approches analytiques ciblées et non ciblées mettant en évidence les similitudes et les différences de composition et d’évolution au cours du développement. Des modèles linéaires généralisés combinant la composition et les données de croissance ont été utilisés pour comparer différentes phases de développement du fruit et une analyse discriminante par régression des moindres carrés partiels (PLS-DA) a permis de séparer les fruits climactériques des non climactériques. Dans les deux cas, les composés des parois cellulaires, les protéines et les lipides interviennent dans la différentiation des groupes. Enfin, une étude détaillée du métabolome et de l’activome du fruit a été réalisée chez trois espèces de Solanacées. Elle montre qu’au sein d’une même famille botanique la régulation diffère au cours du développement, notamment au niveau du métabolisme des sucres et de la glycolyse. Ces travaux revisitent le caractère climactérique des fruits, le positionnant bien en amont du déclenchement de la crise respiratoire, et, plus généralement, permettent de mieux comprendre le métabolisme primaire au cours du développement du fruit. / The world fruit market represents hundreds of billions of euros per year and improving the organoleptic and nutritional quality of fruit has been one of the main objectives in recent years. Primary metabolism is a target that can be used to try and meet these requirements. Indeed, it provides the bricks necessary for growth and development but also the compounds that contribute to taste such as sugars and organic acids. Therefore, it is necessary to understand how it operates during fruit development. For this purpose, primary metabolism has been studied in eight species of fleshy fruits that differ in terms of development duration, fruit size, botanical family, taste quality (sweetness, acidity, etc.), and are subject or not to a respiratory crisis at the initiation of ripening. Physiological and biochemical data have been collected throughout the fruit development from anthesis to physiological maturity. Fruit growth modelling allowed standardizing the stages of development and thus improved comparison between species. The composition of biomass was then characterized qualitatively and quantitatively by targeted and non-targeted analytical approaches highlighting similarities and differences in composition and changes during development. Generalized linear models combining composition and growth data were used to compare different phases of fruit development and a discriminant partial least square regression analysis (PLS-DA) was used to separate climacteric and non-climacteric fruits. In both cases, cell wall compounds, proteins and lipids were involved in group differentiation. Finally, a detailed study of the fruit metabolome and activome was performed in three species of Solanaceae. It revealed that within the same botanical family, regulation differs during development, particularly for sugar metabolism and glycolysis. This work revisits the climacteric character of fruits, positioning it long before the onset of the respiratory crisis, and, more generally, provides a better understanding of primary metabolism during fruit development.

Les protéines du groupe Polybomb (PcG) sont conservées de la drosophile jusqu’à l’homme et assurent la « mémoire cellulaire » d’un état transcriptionnel réprimé au cours du développement. Un modèle a été proposé pour expliquer leur fonctionnement, qui propose que les deux principaux complexes, PRC1 et PRC2 (Polycomb Repressive Complexes 1 & 2), sont recrutés ensemble au niveau de séquences spécifiques appelés PREs (Polycomb Responsive Elements) où ils collaborent pour maintenir la chromatine dans un été réprimé.Au cours de ma thèse, j’ai voulu tester ce modèle en utilisant les disques imaginaux d’œil-antenne de drosophile, qui sont des structures larvaires préfigurant l’œil adulte. Étonnamment, alors que les mutants PRC1 et PRC2 présentent des phénotypes similaires dans l’embryon, seuls les clones mutants PRC1 présentent une transformation néoplasique et une surcroissance dans l’œil. Pour comprendre les mécanismes moléculaires qui sous-tendent ce découplage fonctionnel, nous avons réalisé des ChIP-Seq contre plusieurs marques d’histones actives et répressives, ainsi que contre des protéines du PcG. La comparaison de ces ChIP-Seq avec les profils embryonnaires a d’abord révélé un redéploiement majeur du PRC1 au stade larvaire, sur environ 1000 promoteurs actifs. Cette nouvelle classe de cibles, que nous avons appelée « Neo-PRC1 », se trouve au niveau de gènes actifs où la marque H3K27me3 normalement déposée par le PRC2 est remplacée par la marque active H3K27Ac. Ces gènes sont impliqués dans la régulation de la polarité, la prolifération ou encore la signalisation cellulaires, et un nombre substantiel d’entre eux est surexprimé dans les mutants PRC1, mais pas PRC2. Ces résultats suggèrent que l’activité suppresseur de tumeurs du PRC1 au stade larvaire découle de la régulation précise de gènes classiquement dérégulés dans les cancers, et ce en l’absence du PRC2En plus des sites situés sur des promoteurs actifs, nous avons détecté des sites PRC1 sans PRC2 au niveau de régions enrichies pour des marques de séquences amplificatrices (« Enhancers » en anglais) actives. Ces sites correspondent à des séquences amplificatrices spécifiquement actives au stade larvaire, et sont localisés à proximité de gènes codant pour des facteurs de transcription cruciaux pour le développement de l’œil, tels que les gènes du réseau de détermination de la rétine (RDGN). Pour mieux comprendre l’action du PRC1 sur ces cibles, j’ai réalisé des expériences de Hi-C (High-throughput Chromosome Conformation Capture) dans l’œil et l’embryon, révélant ainsi que ces séquences amplificatrices contactent les promoteurs proches spécifiquement au stade larvaire. De plus, la fréquence des contacts est positivement corrélée au niveau de PRC1 fixé. Étonnamment, ces gènes cibles sont sous-exprimés dans les mutants PRC1 mais pas dans les mutants PRC2, ce qui suggère que les contacts PRC1-dépendants entre ces séquences amplificatrices et leurs promoteurs cibles promeuvent la transcription. Pour vérifier cette hypothèse, j’ai étudié l’impact de la délétion via CRISPR de deux sites PRC1 impliqués dans une boucle régulatrice ; l’un situé au promoteur d’un gène du RDGN appelé dac et l’autre sur une séquence amplificatrice putative située en aval du gène. Des expériences de 3D-FISH révèlent que leur délétion entraîne la diminution des contacts entre la séquence amplificatrice et le promoteur, avec pour effet la sous-expression de dac. Ces résultats suggèrent que le PRC1 est impliqué dans la formation de boucles entre les séquences amplificatrices et leurs promoteurs cibles, et que cette topologie est nécessaire pour l’activation de ces gènes au cours du développement.Ma thèse a donc contribué à la découverte de nouvelles fonctions pour le PRC1, qui acquiert de nouvelles cibles au cours du développement et régule la transcription de gènes impliqués dans le cancer ou le développement indépendamment du PRC2, via des mécanismes dédiés. / Polycomb Group (PcG) are a set of highly conserved proteins implicated in cellular memory of transcriptional gene silencing throughout development. A classical model of PcG mode of action proposes that the two main Polycomb Repressive Complexes (PRC), PRC1 and PRC2, are co-recruited at specific DNA sequences called PREs (Polycomb Responsive Elements) where they collaborate to stably maintain a repressed chromatin state.My PhD work has challenged this collaborative model, by using as an experimental system the Drosophila larval Eye-Antennal imaginal Disc (EAD) that prefigures the adult eye. Surprisingly, while PRC1 and PRC2 mutants exhibit similar phenotypes in embryos, only PRC1 mutant clones show neoplastic transformation and massive overgrowth in EAD, while PRC2 mutant clones do not. To understand the molecular basis of this functional uncoupling, we generated ChIP-Seq directed against a large set of repressive and active Histone Marks (HTMs) as well as against core PcG proteins in EAD. A comparative analysis with Chip-Seq embryonic profiles firstly identified a massive de novo redeployment of PRC1 proteins at mostly 1000 active promoters that occurs only at larval stage. This new class of transcriptionally active PcG target genes, that we named “Neo-PRC1”, is devoid of the H3K27me3 epigenetic mark normally deposited by PRC2 and carry instead the active H3K27Ac mark. Moreover, this Neo-PRC1 category of PcG targets is enriched in ontologies linked to cell polarity, proliferation or signalling. A substantial subset of neo-PRC1 targets is up-regulated in PRC1 but not in PRC2 mutants, suggesting that the tumour-suppressor activity of PRC1 during Drosophila development might be exerted by fine-tuning the expression of cancer-related genes independently of PRC2.In addition to neo-PRC1 sites located at promoters, we next detected an enrichment of PRC1, but not PRC2, at regions enriched for active enhancer marks. These neo-sites which correspond to larval stage-specific enhancers are found in the vicinity of genes encoding for transcription factors playing a key role in EAD development, like genes implicated in the Retinal Determination Gene Network (RDGN). To understand the function of PRC1 at these enhancers, we performed comparative Hi-C (High-throughput Chromosome Conformation Capture) experiments between embryos and EADs, and discovered differential chromatin contacts occurring between the stage-specific neo-PRC1 enhancers and their closest promoters. The intensity of these 3D contacts is positively correlated with the PRC1-binding levels. Unexpectedly, in PRC1, but not in PRC2 mutants, these genes are down-regulated, suggesting that PRC1-dependent enhancer-promoter loops promote transcription. To study if larval 3D chromatin loops are PcG-dependent and functionally relevant, we analyzed the topological and transcriptional impact of two CRISPR-generated deletions affecting two PRC1 binding sites known to form a regulatory loop. These two PREs are respectively located close to the promoter and a putative 3’ enhancer of the dac locus encoding for a crucial member of the RDGN. 3D FISH experiments demonstrate that the removal of the dac endogenous PRC1 binding sites is sufficient to significantly decrease dac enhancer-promoter contacts as well as to trigger down-regulation of dac expression. Altogether, these results suggest that PRC1 might contribute to enhancer-promoter contacts at crucial developmental genes in EAD and that these PRC1-dependent long-range interactions could be necessary to allow a proper transcriptional induction during development.To summarize, my PhD project contributed in opening a new perspective, namely that in addition to conveying cellular memory, a main function of PcG correlates with a second wave of PRC1 recruitment during larval stage to subtly regulate and coordinate the expression of cancer-related and developmental genes through non-canonical molecular mechanisms.

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