Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-10-18Bitstream added on 2014-06-13T18:29:25Z : No. of bitstreams: 1 tomazella_im_me_jabo.pdf: 1956408 bytes, checksum: e74110eecf03b6849e3577dfb0d203f0 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O processo de evolução cariotípica dos cervídeos a partir de um ancestral comum e hipotético, que possuía cariótipo com número diplóide e fundamental igual a 70, foi marcado por complexos rearranjos cromossômicos. Este cariótipo foi retido e pode ser encontrado na espécie Neotropical Mazama gouazoubira, que apresenta variação cromossômica e esta por sua vez, pode ser explicada pela fragilidade cromossômica. Este trabalho teve como finalidade identificar os cromossomos portadores de aberrações cromossômicas induzidas pela doxorrubicina, e localizar as regiões de quebras desses cromossomos. Foram analisados citogeneticamente 6 animais por meio da coloração convencional para a identificação e quantificação de 9 diferentes tipos de aberrações cromossômicas (anel, dicêntrico, gap cromatídico, gap cromossômico, quebra cromatídica, quebra cromossômica, forma trirradial, forma quadrirradial e rearranjo) e pelo bandamento G para a identificação precisa dos cromossomos portadores das aberrações e localização das regiões de quebras desses cromossomos. Os pares cromossômicos 1, 2, 4, 5, 6, 7, 15, 16 e o cromossomo sexual X apresentaram aberrações cromossômicas em todos os animais analisados. Entre os cromossomos que apresentaram aberrações cromossômicas, as regiões em que estas se concentraram com maior frequência foram as regiões mediana e distal em relação ao centrômero. Tais dados sugerem que estas regiões dos cromossomos podem estar mais suscetíveis à fragilidade cromossômica e consequentemente, poderiam estar envolvidas com a diferenciação cariotípica das espécies / The process of karyotype evolution of deer from a hypothetical common ancestor with diploid and fundamental numbers equal to 70 was characterized by complex chromosomal rearrangements. This ancestral karyotype was retained and it is considered to be standard for the current Neotropical species, Mazama gouazoubira. Several animals of this species, analyzed in different studies, showed karyotype variation that can be explained by chromosomal fragility. This study aimed to identify the chromosomes carrying doxorubicin-induced aberrations and to locate the regions of chromosome breaks (proximal, middle or distal). Six animals were analyzed by conventional staining for the identification and quantification of nine different types of chromosomal aberrations (ring, dicentric, chromatid gap, chromosomal gap, chromatid break, chromosomal break, triradials form, quadriradials form and rearrangements) and by G-banding for the precise identification of the chromosomes that carry aberrations and the regions where the breaks occur. The 1, 2, 4, 5, 6, 7, 15 and 16 chromosome pairs and the X sex chromosome showed chromosomal aberrations in all analyzed animals. Among all chromosomes that presented chromosomal aberrations, most of them were located in the middle and distal regions. These data suggest that the middle and distal regions of the chromosome may be more susceptible to chromosomal fragility and, consequently, could be involved in the karyotype differentiation of Mazama species

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-12-19Bitstream added on 2014-06-13T19:34:00Z : No. of bitstreams: 1 gradiski_ak_me_mar.pdf: 522560 bytes, checksum: 91c332bfb87e4d2bd4b4f7f427ca59b6 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Com o conceito de intersubjetividade linguística Habermas busca compreender como a interação entre os vários sujeitos num discurso os fazem pertencer a um espaço de vivência e de experiências compartilhadas, o que para ele constitui o mundo da vida não apreendido pelas ciências positivas e nem colonizado pelo sistema. Paralelo à sua crítica à apreensão positivista do conceito de mundo da vida, ele apresenta uma reconstrução evolutiva da racionalidade, cuja base está na epistemologia genética de Piaget e na teoria do desenvolvimento do juízo moral de Kohlberg, e que concebe o entendimento intersubjetivo como resultado da aprendizagem no processo cognitivo de aquisição de competências operatórias, no qual se dá o desenvolvimento das relações interativas. Tanto numa interpretação filogenética quanto na análise da evolução ontogenética da consciência moral, Habermas constata o mesmo processo que, passo a passo, segue em direção ao estabelecimento de princípios universalistas para a regulamentação de conflitos que obstam o entendimento intersubjetivo das comunidades lingüísticas – e isso tanto no âmbito do mundo da vida cotidiano quanto no âmbito da produção formal do conhecimento. Ora, metodologicamente, aqui estamos diante de uma perspectiva evolucionista da própria razão. O que cabe é questionar se tal perspectiva não pode servir de pano de fundo a uma filosofia da história. Se sim, como então compreender essa nova racionalidade diante da história visto que, segundo a própria crítica de Habermas, a filosofia da história é aliada secreta do positivismo, e, em decorrência, por ceder ao objetivismo cientificista, anula o sujeito cognoscente da própria constituição das estruturas sociais? / With the concept of linguistic intersubjectivity Habermas seeks to understand how the interaction between the various actors in a speech makes them belong to space of the shared experiences, which for him represents the world of life does not seized by positive sciences and not colonized by the system . In parallel with the his critique of the positivist apprehension of the concept of the world of life, he presents a evolutionary reconstruction of rationality, whose base is in the genetic epistemology of Piaget and in the development theory of the moral judgments Kohlberg's , and that conceives the intersubjective understanding as a result of learning in the cognitive process of acquiring skills operative, in which development takes in interactive relations. Both a phylogenetic interpretation as analysis of ontogenetic evolution of moral consciousness, Habermas notes the same process that, step by step, goes towards the establishment of universal principles for the regulation of conflicts that interrupts the intersubjective understanding of linguistics communities - and this both within of the world of everyday life as the formal production of knowledge. However, methodologically, here we are faced with an evolutionary perspective of reason itself. What it is questionable whether such a perspective can’t serve as the background the an philosophy of history. If yes, how then to understand this new rationality in the face of history which according to his own critique of Habermas the philosophy of history is secret ally of positivism and, consequently, by yield to scientific objectivism nullifies the actor knowledge of the constitution of social structures?

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-16Bitstream added on 2014-06-13T19:21:45Z : No. of bitstreams: 1 granzotto_a_dr_sjrp.pdf: 1610042 bytes, checksum: 27692bc1e2301a5aee3ec1445fded2d8 (MD5) / Os elementos de transposição (TEs) são sequências de DNA com a capacidade de catalisar seu próprio movimento e de se inserir em novas regiões do genoma. Desde que TEs são fonte de variação genética, os estudos da dinâmica dessas sequências permitem a compreensão da evolução do genoma do hospedeiro. Na presente Tese foi estudado o retroposon Helena, um LINE que se encontra em diferentes estágios do seu ciclo evolutivo e, portanto, um bom modelo para estudos da dinâmica evolutiva de TEs. Por meio de análises de Bioinformática de 12 espécies de Drosophila que têm o genoma sequenciado, verificou-se que Helena varia de estágios em que se encontra ao menos uma cópia completa e ativa (D. mojavensis), ou putativamente completas, mas inativas (D. simulans), a estados em que as cópias são altamente degeneradas (D. yakuba, D. erecta, D. ananassae e D. virilis) ou ausentes (D. pseudoobscura, D. persimilis, D. willistoni e D. grimshawi). As análises filogenéticas mostram que esse TE estava presente no ancestral comum do gênero Drosophila e tem sido transmitido verticalmente nas linhagens derivadas, e perdido em algumas. Desde que uma cópia completa, e altamente ativa, foi observada apenas no genoma de D. mojavensis, estudamos em detalhe a região 5’ dessa cópia e verificamos, por meio de análises in vitro com o uso de um gene reporter, a presença de promotor interno para a Pol II que se encontra associado com modificações epigenéticas de histonas tanto permissivas, típicas de eucromatina, onde a transcrição pode ocorrer (H3K4me2), como repressivas, típicas de heterocromatina facultativa (H3K27me3). Esses “domínios bivalentes”, juntamente com a baixa associação de H3K9me2 (típica de heterocromatina constitutiva) indicam que Helena pode ser expresso em resposta a estímulos adequados. Análises preliminares do estudo da atividade transposicional... / The transposable elements (TEs) are DNA sequences capable of catalyze its own movement and to enter into new regions of the genome. Since TEs are source of genetic variation, studies on their dynamics allow the understanding of the genome evolution. In the present study we studied Helena, a LINE element that is at different stages of its evolutionary cycle and therefore, it is a good model for studies of TEs evolutionary dynamics. Through bioinformatics analysis of 12 Drosophila species which have their genomes sequenced, we found Helena in different stages of its evolutionary cycle, that varies of at least one full active copy (D. mojavensis) an putatively complete copy, but inactive (D. simulans) to highly degenerate (D. yakuba, D. erecta, D. ananassae and D. virilis) or absent (D. pseudoobscura, D. persimilis, D. willistoni and D. grimshawi) sequences. Phylogenetic analysis showed that Helena was present in the common ancestor of the Drosophila genus and has been vertically transmitted in derived lineages, but lost on some of them. Since a complete highly active copy was observed only in D. mojavensis, we studied in more detail its 5' end region. Through in vitro assays using a reporter gene we verified the presence of internal promoter for Pol II that is associated with epigenetic histone modifications for permissive (could induce transcription (H3K4me2)) and repressive heterochromatin (facultative heterochromatin (H3K27me3)). These “bivalent marks” and poor association to H3K9me2 (constitutive heterochromatin) indicate that Helena can be expressed in response to specific stimulus. The preliminary analysis of Helena transposicional activity in vivo (by injection of complete copy in D. melanogaster) showed integration and activity of this TE in the transgenic lines. A study of BS element, a TE closely related to Helena, showed that the evolutionary dynamics of both... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-24Bitstream added on 2014-06-13T20:43:06Z : No. of bitstreams: 1 abril_vv_dr_jabo.pdf: 1648950 bytes, checksum: a989c1942e3dd9ac9da5d7078193a943 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estudos com veado-mateiro (Mazama americana) mostram que há muitas controvérsias quanto ao número de subespécies ou até quanto ao desdobramento destas em espécies. Em estudo citotaxonômico foram encontradas variações cromossômicas intra e interpopulacionais em populações de M. americana geograficamente distantes, com número diplóide de 48 a 53 e número fundamental de 46 a 57. Com base nisto, o presente estudo visou compreender como ocorreu a reorganização cromossômica dentro das variantes encontradas durante a evolução do grupo. Para isto, estrutura e organização dos cromossomos de M. americana foram analisadas para identificar os rearranjos que originaram a variação intraespecífica através das técnicas de bandamento cromossômico (bandas G, C, Ag-NOR), hibridação in situ (FISH) com sondas teloméricas e pintura cromossômica com o uso de sondas cromossômicas da espécie Mazama gouazoubira. Foram identificados seis citótipos distribrídos em 12 cariótipos diferentes: Rondônia (2n=42 ou 43 e NF=46; 2n=42 e NF=49), Juína (2n= 43, 44 ou 45 e NF=48; 2n=44 e NF=46), Jarí (2n=49; NF=56, Carajás (2n=50 e NF=54), Santarém (2n=51 e NF=56) e Paraná (2n=51,52 ou 53 e NF=56). O cariótipo básico do citótipo Paraná foi utilizado como base comparativa para os demais. Os rearranjos que originaram essas diferenças foram fusões cêntricas, em tandem e inversões pericêntricas. A análise de complexo sinaptonêmico confirmou a existência de um sistema sexual múltiplo do tipo XX/XY1Y2 através da detecção de uma trivalente sexual. Sítios teloméricos intersticiais evidenciam que a ocorrência de eventos de fusões em tandem foi essencial para a evolução cariotípica desta espécie e a homologia de sondas cromossomo-específicas de M. gouazoubira corroboram que o caminho da reorganização cromossômica entre estas espécies foi principalmente através de fusões. / Studies with the red brocket deer (Mazama americana) shown that there are a lot of controversies about the number of subspecies or about the unfolding of these in new species. Citotaxonomic studies found intra and interpopulational chromosomal variations, with diploid number varing from 48 to 53 and fundamental number from 46 to 57. Based on these studies, the aim of the present study was understood how the chromosomal reorganization occurred between this variants during the evolution process. For that, we analyzed the chromosomal structure and organization of M. americana, identifying the rearrangements responsible for the intraspecific variation through chromosome banding (G and C-banding, Ag-NOR), in situ hybridization of telomeric probes and chromosome painting using probes of M. gouazoubira species. It were found six different variants: Rondônia (2n=42 or 43 and FN=46; 2n=42 and FN=49), Juína (2n= 43, 44 or 45 and FN=48; 2n=44 and FN=46), Jarí (2n=49 and FN=56), Carajás (2n=50 and FN=54), Santarém (2n=51 and FN=56) and Paraná (2n=51,52 or 53 and FN=56). The basic karyotype of Paraná variant was choosing for comparative analysis. The rearrangements responsible for these chromosomal differences were centric and tandem fusions and pericentric inversions. The synaptonemal analysis sustained the existence of a multiple sexual system (XX/XY1Y2) with detection of a sexual trivalent. Intersticial telomeric sites shown the occurrence of tandem fusions was essential for the karyotype evolution of this species and the homology with the probes of M. gouazoubira corroborated that the way of chromosomal reorganization between these species was mainly through chromosome fusions.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseMRV.pdf: 3701923 bytes, checksum: d40873dfb2b0089df5c80f139959adb5 (MD5) Previous issue date: 2006-11-10 / Universidade Federal de Minas Gerais / This study presented cytogenetic analysis of small fishes species collected in the headwaters of Jaguariaíva, Ribeira and, Tibagi rivers. Some of these species have had a comparative cytogenetic population analysis among different basins, while in the others were observed inherent specific problems only in one population. In this work we boarded cytogenetic, cytotoxonomy, biogeographic and evolutive biology aspects of these populations: Corydoras paleatus, Corydoras ehrhardti, Apareiodon sp., Geophagus brasiliensis, Cichlasoma facetum, Astyanax scabripinnis species complex, Astyanax janeiroensis, and Characidium sp. cf. C. gomesi. Here we discussed and presented (a) the sympatric occurrence of C. paleatus and C. ehrhardti from Dourada lagoon, Tibagi basin; (b) a ZZ/ZW sex chromosome system in an undescribed species of the genus Apareiodon in the Verde river, Tibagi basin (c) the karyotypic conservadorism visualized in species and populations of Perciformes, G. brasiliensis and C. facetum, in the Jaguariaíva, Ribeira and Tibagi basins, showing the dispersion of fish species hypotheses among these basins; (d) a comparative cytogenetic analysis of A. scabripinnis species complex, among Jaguariaíva, Ribeira, and Tibagi basins, all of them shared karyotypes with 2n=50 chromosomes but minors differences among them were observed, and we also showed a sympatric cytotype with 2n=48 chromosomes only in the Jaguariaíva basin; (e) the composition, location and nature of heterochromatic sites present in the A. janeiroensis karyotype of Ribeira basin and; (f) a possible sinapomorphic condition in the Characidium species with heteromorphic sex chromosome system. We also discussed the possible faunes interchange in the headwaters regions of Ribeira de Iguape and Tibagi rivers in the Ponta Grossa arc region, beside to the supposed endemic ictiofaune of Jaguariaíva basin. Thus, this study associated cytogenetic data, biogeographic aspects, and evolutive biology of fishes species located in the headwaters of three Paraná State rivers. / O estudo apresentou uma análise citogenética de espécies de peixes de pequeno porte coletadas nas cabeceiras das bacias dos rios Jaguariaíva, Ribeira e Tibagi. Algumas espécies tiveram uma análise citogenética populacional comparativa entre essas diferentes bacias, enquanto em outras foram abordados problemas específicos inerentes apenas à uma população. Foram abordados aspectos de citogenética, citotaxonomia, biogeografia e de biologia evolutiva das populações de Corydoras paleatus, Corydoras ehrhardti, Apareiodon sp., Geophagus brasiliensis, Cichlasoma facetum, complexo Astyanax scabripinnis, Astyanax janeiroensis e Characidium sp. cf. C. gomesi. Foram apresentados e discutidos (a) a ocorrência simpátrica de C. paleatus e C. ehrhardti para a Lagoa Dourada, bacia do rio Tibagi (b) um sistema de cromossomos sexuais ZZ/ZW em uma espécie não descrita do gênero Apareiodon do rio Verde, bacia do rio Tibagi (c) o conservadorismo cariotípico apresentado para as espécies e populações de Perciformes, G. brasiliensis e C. facetum, das bacias dos rios Jaguariaíva, Ribeira e Tibagi, aliado à uma hipótese de dispersão das espécies de peixes entre essas bacias (d) a análise citogenética comparativa do complexo de espécies A. scabripinnis para as bacias dos rios Jaguariaíva, Ribeira e Tibagi, todas mostrando cariótipos similares com 2n=50 cromossomos, porém não idênticos, aliada a um novo citótipo simpátrico apresentando 2n=48 cromossomos somente na população da bacia do rio Jaguariaíva (e) a localização, composição e natureza dos domínios heterocromáticos presentes no cariótipo de A. janeiroensis da bacia do rio Ribeira e; (f) uma possível condição sinapomórfica para as espécies de Characidium que apresentam sistema de cromossomos sexuais heteromórficos. Foi também discutido o possível intercâmbio de faunas nas regiões de cabeceiras dos rios Ribeira de Iguape e Tibagi na região do arco de Ponta Grossa, ao lado de uma ictiofauna aparentemente mais endêmica para a bacia do rio Jaguariaíva. Assim, esse estudo procurou associar dados citogenéticos, questões de biogeografia e biologia evolutiva das espécies de peixes presentes nas cabeceiras destes três rios paranaenses.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseLTGS.pdf: 4761977 bytes, checksum: fd63c5cb5025f3d28cda158a969b6afd (MD5) Previous issue date: 2001-06-21 / Financiadora de Estudos e Projetos / The parasitic Trypanosoma brucei is the causative agent of African Trypanosomiasis (sleeping sickness) in humans, and nagana in animals and is responsible for heavy socioeconomic losses in most countries of sub-Saharan Africa. Therapy against sleeping sickness is unsatisfactory because the toxicity and arising of the drug resistant parasites. Trypanosomatids contain a single mitochondrion, the kinetoplast, whose genetic code deviates from the universal code where a UGA stop codon is used as a Trp codon. A single nuclear-encoded tRNATrp(CCA), that can decode the canonical Trp codon, is used by both the nucleus and mitochondria genes. A C to U editing event at position 34 of tRNATrp(CCA) changes the anticodon from CCA to UCA allowing the decoding of the UGA stop codon to Trp from the mitochondrial genes. We have identified two different nuclear-encoded tryptophanyl-tRNA-synthetase (WARSs) genes (one cytoplasmic (WARS1) and the other to the kinetoplast (WARS2)) in both Leishmania and Trypanosoma cells. With the purpose to validate the mitochondrial WARS enzymes of trypanosomatids, as potential drug targets, we performed gene silencing (RNAi) experiments with both WARSs forms from T. brucei. In the conditions tested, the expression of dsRNA from a dual promoter system generated potent RNA silencing, leading to clear phenotypes characterized by morphologic alterations, severe growth inhibition, reduction in the levels of oxygen consumed (only TbWARS2) and cellular death. The efficiency and specificity of silencing were estimated by quantitative PCR and significant modifications of the specific amount of TbWARSs mRNA were evidenced. / O parasita Trypanosoma brucei é o agente causal da Tripanossomíases Africana (doença do sono) em humanos e nagana em animais, cujo impacto socioeconômico é devastador nos paises sub-Saharianos da África. Atualmente, as terapias existentes contra esta doença são insatisfatórias, devido a sua toxicidade e ao surgimento de linhagens resistentes. Tripanosomatídeos contem uma simples mitocôndria, o kinetoplasto, cujo código genético desvia do código universal, onde o códon de parada UGA é usado como códon para Trp. Um simples tRNATrp(CCA) codificado no núcleo, decodifica o códon canônico Trp, usado para a tradução dos genes nucleares e mitocondriais. O evento de editoramento C por U na posição 34 do tRNATrp(CCA) muda o anticódon de CCA para UCA, permitindo a decodificação do códon de parada UGA para Trp, nos genes mitocondriais. No genoma de Leishmania e Trypanosoma, foram identificados dois genes nucleares para Triptofanil-tRNA sintetases (WARSs), uma citoplasmática (WARS1) e outra mitocondrial (WARS2). Com o propósito de validar a WARS mitocondrial de tripanosomatídeos, como um potencial alvo farmacológico, foi realizado o silenciamento gênico (RNAi) de ambos genes WARSs de T. brucei. Nas condições testadas, a expressão do dsRNA gerou um potente silenciamento, levando ao desenvolvimento de um fenótipo caracterizado por alterações morfológicas, drástica inibição do crescimento, redução nos níveis de oxigênio consumido (somente na TbWARS2) e morte celular. A eficiência e especificidade do silenciamento foram estimadas por PCR quantitativo e foram evidenciadas significativas modificações na quantidade de mRNA específico para as TbWARSs.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6253.pdf: 5729447 bytes, checksum: f2e05373166926e6816bed92f8f5d53f (MD5) Previous issue date: 2014-10-01 / Universidade Federal de Minas Gerais / The origin and evolution of Elateridae bioluminescence is uncertain, especially the evolution of the luciferases of different phases and lanterns of Elateridae, the relationship between structure and bioluminescence spectra and the phylogeny of neotropical species. In this study, the cDNA containing the genes of Fulgeochlisus bruchi and Pyrophorus angustus luciferases, which presente different kinetic characteristics, such as high pH optimum and a high affinity for ATP and Luciferin, were cloned. Analyses of Elateridae luciferases suggest that, regardless of the stage of life or organ (dorsal or ventral lanterns), these luciferases displayed a higher identity degree to the luciferases that present closer bioluminescence spectra, probably, due to intergenetic recombination effects. The luciferase primary sequences alignments and site-directed mutagenesis studies suggested important residues to modulate color in Elateridae, such as S247. Our phylogenetic analyzes indicated a closer relationship between Elateridae and Phengodidae, however there are diverngence between the markers used. The sequencing of mitochondrial genomes showed that the Phengodidae genomes displayed several rearrangements and gene duplication, indicating the need for further studies on this family. Our data also suggest that bioluminescence arised at least three times independently in Elateoridea from ancestors similar enzymes. / A origem e evolução da bioluminescência em Elateridae é incerta, especialmente a evolução das luciferases das diferentes fases e lanternas de elaterídeos, a relação entre estrutura e espectros de bioluminescência e a filogenia de espécies neotropicais. Neste trabalho os cDNA contendo os genes das luciferases de Fulgeochlisus bruchi e de Pyrophorus angustus, as quais possuem características cinéticas distintas, como elevado pH ótimo e alta afinidade com ATP e Luciferina, foram clonados. Comparando as luciferases de Elateridae sugerimos que, independentemente da fase de vida ou órgão (lanterna dorsal ou ventral), essas luciferases apresentam maior grau de identidade quanto mais próximos forem os espectros de bioluminescência, provavelmente, devido a efeitos de recombinação gênica. Os alinhamentos das sequências primárias das luciferases e de estudos de mutagênse sítiodirigida sugerem possíveis resíduos importantes para a modulação de cor em Elateridae, como o resíduo S247. Nossas análises filogenéticas indicaram uma maior proximidade entre as famílias Elateridae e Phengodidae, porém existem divergências entre os marcadores utilizados. O sequenciamento dos genomas mitocondriais mostrou que os genomas dos Phengodidae possuem diversos rearranjos e duplicações gênicas, indicando a necessidade de mais estudos sobre essa família. Nossos dados também sugerem que a bioluminescência se originou pelo menos três vezes independentemente em Elateoridea, a partir de enzimas ancestrais similares.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2707.pdf: 1210470 bytes, checksum: b1969a78fcafd5db746d0bfe14a82770 (MD5) Previous issue date: 2009-07-07 / Universidade Federal de Sao Carlos / A tribo Euglossini possui cerca de 200 especies de abelhas descritas, distribuidas em cinco generos considerados monofileticos. Os generos Exaerete e Aglae apresentam comportamento cleptoparasita, atacando outras especies de Euglossini. Para a especie Exaerete smaragdina, os unicos relatos na literatura referem-se ao parasitismo de Eulaema nigrita. Porem, ha indicios de que esta nao seja sua unica hospedeira. Desta forma, a filogeografia destas duas especies foi comparada, com o intuito de analisar se ha concordancia entre as suas historias evolutivas, pois, quanto maior a obrigatoriedade da relacao parasitahospedeiro, mais congruente espera-se que sejam suas filogeografias. Para Ex. smaragdina, foram observadas populacoes estruturadas geograficamente e os testes de neutralidade nao foram significantes. Para El. nigrita, nao foi observada estruturacao populacional, havendo uma baixa variabilidade genetica e a maioria das populacoes compartilhando um mesmo haplotipo. Estes dados, associados a testes de neutralidade estatisticamente significantes, indicam que as populacoes desta especie sofreram uma expansao populacional recente. A comparacao dos padroes filogeograficos indica ainda que El. nigrita nao deva ser a unica hospedeira de Ex. smaragdina. Tambem foi analisado o status de especie da Exaerete lepeletieri, considerada recentemente uma sinonimia de Ex. frontalis. Os resultados indicam que Ex. lepeletieri apresenta monofilia para o loco 16S, enquanto dois clados foram observados para o loco Citocromo B (CytB).

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3272.pdf: 1459537 bytes, checksum: 78eeb30fb7d9022c1a6c97b55c565d47 (MD5) Previous issue date: 2010-08-02 / Financiadora de Estudos e Projetos / The genus Anastrepha is the largest in the family Tephritidae (Trypetinae, Toxotrypanini). The construction of cDNA libraries is important for identifying new genes and establishing genetic markers on non-models organisms such as the genus Anastrepha. Among the proteins involved in reproduction, we can cite those belonging cascade sexual and those responsible for forming the eggshell. The purpose of this study was to build a cDNA library from a pool of female reproductive tissues Anastrepha obliqua to breed ESTs, to search for genes with a high evolutionary rate, focusing on chorionic and vitelline proteins. We were sequenced 2304 clones obtained from the reproductive tissues of female flies Anastrepha obliqua. In total, 310 contigs and 506 singlets were generated wich were classified into different proteins classes. The chorionic proteins and Sxl revealed to be under selection positive as well as the vitelline Vm 26Aa ', which was possibly generated by a gene duplication of Vm 26aa, while Tra2 seems under purifying selection. The inference of the secondary structure of proteins studied revealed that the sites under positive selection were present on outside membrane. The population analysis of genes chorionic, vitelline, Sxl and Tra2 revealed no separation between the 3 species, although in some situations have occurred separation between some of the haplotypes for a single specie. With these results, it was possible to identify new genes, make the full sequencing for some vitelline and chorionic genes on pools of other species of Anastrepha, and we also identified that some of these genes are under positive selection pressure. / O gênero Anastrepha é o maior dentro da família Tephritidae (Trypetinae, Toxotrypanini). A construção de bibliotecas de cDNA é importante para a identificação de novos genes e no estabelecimento de marcadores genéticos em organismos não-modelos como do gênero Anastrepha. Dentre as proteínas envolvidas na reprodução podemos citar as pertencentes da cascata sexual e as que são responsáveis por formar a parede do ovo. Assim, este trabalho teve como objetivo construir uma biblioteca de cDNA a partir de um pool de tecidos reprodutivos femininos de Anastrepha obliqua para gerar ESTs, afim de buscar genes com alta taxa evolutiva, focando em proteínas coriônicas e vitelínicas. No Total foram seqüenciados 2304 clones obtidos a partir dos órgãos reprodutivos de fêmeas de moscas de Anastrepha obliqua. Ao todo foram gerados 310 contigs e 506 singlets que foram classificados em diferentes classes de proteínas. As proteínas coriônicas e o Sxl revelaram estar sob seleção positiva, assim como a vitelínica Vm 26Aa´ que possivelmente foi gerada por uma duplicação gênica do Vm 26Aa, enquanto que o Tra2 parece estar sob seleção purificadora. A inferência da estrutura secundária das proteínas estudadas revelou que os sítios sob seleção positiva estavam presentes do lado externo da membrana. As análises populacionais dos genes coriônicos, vitelínicos, Sxl e Tra2 não revelaram uma separação entre as 3 espécies, apesar de em algumas situações ter ocorrido uma separação entre alguns dos haplótipos para uma determinada espécie. Com resultados obtidos, foi possível identificar novos genes, fazer o seqüenciamento completo para alguns genes coriônicos e vitelínicos em pools de outras espécies de Anastrepha, e também foi possível identificar que alguns destes genes estão sob pressão de seleção positiva.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3375.pdf: 2411076 bytes, checksum: 13a92e8d3cf7c707f91a955cf5e6bd34 (MD5) Previous issue date: 2010-12-20 / Universidade Federal de Sao Carlos / Crabronid wasps of the genus Trypoxylon are characterized by being solitary and nest in preexisting cavities or in mud nests. The species Trypoxylon (Trypargilum) albitarse is included in the latter group, because builds its own mud nests. These nests are made by mud tubes with the lower portion open. Each tube is internally formed by a linear series of cells provisioned with captured spiders in which she oviposits an egg. After that, she starts closing the cell with a mud wall and begins to supply the next cell. Males of these wasps have an unusual behavior among the Hymenoptera. They assist the females during the construction and the provisioning of their nests, besides expelling parasites or other males who eventually approach the nest. This peculiarity of the male guard was always associated with his paternity of female offspring of the guarded nest. However, this hypothesis has not been tested until now, doing this the main objective of this work. The nesting behavior of the species Trypoxylon albitarse was monitored. For this, it took the observation of the nesting pairs and their collecting, as the collect of their offspring. The adults caught were frozen at -20°C for the genetic analysis. The offspring was collected after the construction of the cocoon and, after its emergence, it was weighted and frozen at -20°C for the same purpose. The monitoring of nesting allowed gathering data from this species, adding information to this gender, since most of that is gathered with trap nests. It was seen that that species have more nesting activity in cold and dry seasons, the emergence of adults is mainly concentrated in two moments, before and after the winter. Besides that, most of the larvae spend the winter in a quiescence state. A secondary sex ratio 1:1 was observed in two populations, São Carlos and Araras, however the resource allocation was higher for females, since they are 28% larger than males. To the paternity tests of the guard male, it was necessary to develop a genomic library for Trypoxylon albitarse, which allowed the development of eight microsatellite markers. Four of those were polymorphic and good enough to the purpose of these tests. These genetic tools were the first developed for this gender. They, together with the field observations, allowed assigning the female offspring of a nest to the male who guarded it. However, usurpation and extra-pair copulations were also found, contributing for greater understanding of mating system in this species and the understanding of the functional significance of the male guard behavior. The occurrence of diploid males was detected and their origin discussed. / Vespas crabronídeas do gênero Trypoxylon se caracterizam por serem solitárias e nidificarem em cavidades pré-existentes ou em ninhos de barro. A espécie Trypoxylon (Trypargilum) albitarse está incluída no segundo grupo, pois exclusivamente constrói seus ninhos. Esses são constituídos por tubos de barro com a porção inferior aberta. São formados internamente por uma série linear de células aprovisionadas com aranhas capturadas, sobre uma das quais ela oviposita um ovo para, então, começar o fechamento da célula com uma parede de barro e iniciar o aprovisionamento da célula seguinte. Os machos dessas vespas possuem um comportamento incomum entre os himenópteros. Eles auxiliam as fêmeas na construção e no aprovisionamento de seus ninhos, além de permanecerem nestes até o seu término, expulsando parasitóides ou outros machos que eventualmente se aproximem do ninho. Essa peculiaridade do macho-guarda sempre foi associada à sua paternidade da prole feminina do ninho que guardava. No entanto, esta hipótese até hoje não fora testada, constituindo assim, o objetivo principal deste trabalho. Neste, foi acompanhado o comportamento de nidificação da espécie Trypoxylon albitarse e, para tal, foram necessárias a observação de casais nidificando e a coleta dos mesmos e de suas proles. Os adultos capturados foram congelados a -20°C para posterior análise genética. A prole foi coletada após a formação do casulo e, após a sua emergência, ela foi pesada, sexada e congelada a -20°C para o mesmo fim. O acompanhamento do processo de nidificação permitiu colher dados desta espécie que constrói ninhos expostos, complementando a maioria dos trabalhos realizados no gênero que se baseiam em espécies que nidificam em ninhos armadilha. Foi observado maior atividade de nidificação na época fria e seca do ano, a emergência dos adultos se concentra principalmente em dois momentos, imediatamente antes e após o inverno, além de que, a maior parte dos indivíduos passa por um estado de quiescência no estado de larva durante essa época. Uma razão sexual secundária 1:1 foi observada nas duas populações amostradas, São Carlos e Araras. Porém a alocação de recursos foi maior para as fêmeas, já que elas são em média 28% maiores que os machos. Para os testes genéticos de paternidade, foi necessário desenvolver uma biblioteca genômica para Trypoxylon albitarse, o que permitiu o desenvolvimento de oito marcadores de regiões de microssatélites, dos quais quatro foram polimórficos e suficientes para as análises necessárias. Essas ferramentas genéticas foram as primeiras a serem desenvolvidas para o gênero. Elas, em conjunto com as observações a campo, permitiram atribuir a prole feminina de um ninho ao macho que o guardou. No entanto, usurpações e cópulas extra-par também foram evidenciadas, contribuindo para o maior conhecimento do sistema de acasalamento na espécie e para o entendimento do significado funcional do comportamento de guarda. A ocorrência de machos diplóides foi detectada e sua origem discutida.