Cinqüenta e seis machos inteiros provenientes dos rebanhos do projeto de melhoramento genético da Estação Experimental de Sertãozinho, selecionados ou não para peso aos 378 dias (P 378), nascidos em 1999, foram confinados na Estação Experimental de Colina. Utilizaram-se animais dos grupos genéticos Nelore Seleção (NeS), Nelore Controle (NeC) e Caracu Seleção (Ca), os quais foram distribuídos, aleatoriamente, nas três categorias experimentais: grupo de abate inicial (AI), grupo de alimentação restrita (AR) e grupo de alimentação Ad Libitum (AL). Na categoria AI alocaram-se 4 animais por grupo genético e nas categorias AR e AL foram alocados 8 animais Ca e NeS, e 6 animais NeC. Determinou-se o período experimental pelo tempo de acabamento dos animais, ou seja, quando os garrotes atingiram, no mínimo, 4,0 mm de espessura de gordura subcutânea, avaliada por ultra-som, sobre o músculo Longissimus dorsi, na posição entre a 12 a e a 13 a costelas. Ao término do período de adaptação, a categoria AI foi abatida e as outras duas (AR e AL) entraram no ensaio de alimentação. Repetiram-se as pesagens e medidas de ultra-som e escore corporal a cada 28 dias. Em cada grupo genético, à medida que o acabamento preconizado para cada animal da categoria AL foi atingido, o animal da categoria AR mais semelhante àquele quanto ao peso e condição corporal, no início do experimento, foi também abatido. Avaliaram-se em todos os animais características de carcaça, composição corporal e rendimento de cortes cárneos comerciais. Os dados foram analisados de acordo com esquema fatorial, utilizando dois tipos de alimentação e três grupos genéticos. Os animais Ca e NeS apresentaram maiores pesos de abate, requerendo mais tempo de confinamento para atingirem o ponto de acabamento preconizado. O maior peso de abate destes animais também influenciou outras características correlacionadas, como peso da carcaça, traseiro, dianteiro e ponta de agulha. Verificou-se que a seleção para peso pós-desmame aumentou o peso de abate, de carcaça e de seus cortes primários, porém os animais selecionados apresentaram carne menos macia, mas ainda dentro dos padrões de maciez considerados bons. Os valores médios para os componentes químicos do corpo vazio em porcentagem de água, gordura, proteína e cinzas foram: Ca (60,4; 15,5; 19,7; 4,4), NeS (58,2; 19,4; 17,8; 4,6) e NeC (57,4; 20,2; 18,3; 4,1). As taxas médias de ganho de peso vazio (kg/dia), água (g/dia), gordura (g/dia), proteína (g/dia), cinzas (g/dia) e energia (Mcal/dia) foram: Ca (1,01; 409; 382; 150; 70; 4,45), NeS (1,00; 355; 482; 113; 46; 5,19) e NeC (0,91; 301; 457; 103; 52; 4,91). A composição química média do ganho do corpo vazio, em porcentagem de água, gordura, proteína, cinzas e energia (Mcal/dia) foi: Ca (40,1; 36,8; 15,2; 8,0; 4,32), NeS (35,8; 48,1; 11,3; 4,8; 5,19) e NeC (32,7; 49,5; 12,0; 5,8; 5,36). A seleção para peso pós-desmame, visualizada na comparação entre os grupos Nelore, não promoveu alterações indiretas na composição corporal desses animais, porém aumentou-lhes o tamanho corporal, exigindo maior tempo de confinamento. Os animais Ca, quando comparados aos Nelore apresentaram porcentagens menores de gordura e maiores de proteína no corpo vazio, fato que pode ser explicado pelo maior tamanho corporal desses animais. / Fifty six bulls, born in 1999, from Sertãozinho Experimental Station herds, selected or not for weight at 378 days of age (W 378), were feedlot at Colina Experimental Station. Animals of the genetic groups Nellore (NeS), Control Nellore (NeC) and Caracu (Ca) were utilized. They were randomnly distributed in three experimental groups: initial slaughter group (AI), restricted feeding group (AR) and Ad Libitum feeding group (AL). The AI class had 4 animals for each genetic group and AR and AL had 8 NeS and Ca, and 6 animals NeC. Animals were slaughtered with 4.0 mm of fat thickness measured by ultrasound. After the adaptation period, the AI class was slaughtered and the other classes (AR and AL) started the feedlot period. In each genetic group, when an animal of the AL class attained the desired ultrasonic fat thickness for slaughter, the animal of AR class with similar weight and body conditions score, at the experiment starting point, was also slaughtered. In all animals carcass traits, body composition and meat cuts income were evaluated. Data were analized according to factorial scheme including two type of diets and three genetic groups. The Ca and NeS bulls were heavier at slaughter requiring longer feeding period to attain the desired ultrasonic fat thickness. The heavier weights at slaughter of these animals also changed correlated traits as carcass, hindquater, forequarter and spare ribs weights. The selection for weight in the Nellore promoted higher slaughter, carcass and primary cuts weights, but selected animals had less tender meat, but inside good tender standards. Average values for chemical components of empty body weight, in percentages of water, fat, protein and ash were: Ca (60.4; 15.5; 19.7; 4.4), NeS (58.2; 19.4; 17.8; 4.6) and NeC (57.4; 20.2; 18.3; 4.1). The average rates of empty gain for body weight (kg/day), water (g/day), fat (g/day), protein (g/day), ash (g/day) and energy (Mcal/day) were: Ca (1.01; 409; 382; 150; 70; 4,45), NeS (1.00; 355; 482; 113; 46; 5,19) and NeC (0.91; 301; 457; 103; 52; 4,91). The average rates of empty body gain chemical composition, in percentages of water, fat, protein, ash and energy (Mcal/day) were: Ca (40.1; 36.8; 15.2; 8.0; 4.32), NeS (35.8; 48.1; 11.3; 4.8; 5.19) and NeC (32.7; 49.5; 12.0; 5.8; 5.36). The selection for post-weaning weights, observed by comparing the two Nellore groups, did not promote any change on body composition of these animals, but increased their body size, so they required longer feedlot period. The animals of genetic group Ca, when compared with Nellore, had less fat and more protein, in percentages of empty body. It is due to their larger mature body size.

Chickens are ideal model organism to improve understanding of several research areas as phylogenetic, embryology, biomedicine, livestock, and have recently been suggested as a promising model for epigenetic studies. In the livestock area, chickens are source of protein to humans and had been selected to achieve a high production standards based on genetic breeding by the traditional selection. We are now in the genomics and epigenomics era and it is time be concern about the use of new tools to improve selection not only thinking about production, but also in the health and welfare of animals. The use of molecular approaches, have been a fundamental tool to understand biological models and improve selection strategies based on genomic information in breeding programs. Molecular approaches have also contributed to understanding of the evolutionary history of these models and the genetics and epigenetics mechanisms involved in evolution process and genetic diversification of chickens. In this context, many technologies have emerged to produce high-throughput data using Next-generation sequencing (NGS) approaches. NGS provided a large amount of information for diverse purposes such as to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs), and methylated DNA profiles in chickens. In addition, NGS has allowed the development of pre-designed SNP arrays for genome-wide association studies (GWAS) with specific phenotypes of interest. Moreover, although NGS has enough power to detect informative polymorphisms, its high cost makes it impractical to be used in GWAS and Methylated DNA immunoprecipitation sequencing (MeDIPseq) studies. The demand for an economical, efficient, simple-step and reliable genome-wide method of SNPs discovery, validation and characterization, was the reason for the development of this study. We applied reduced representation sequence by restriction enzyme (RE) cleavage of target chicken genome to be applied in GWAS. Thereafter, to combine the reduced representation of the genome with MeDIPseq method, we developed a novel approach to perform differential methylation studies using reduced libraries. These works allowed us to identify SNPs associated with performance traits and differential methylation windows related to different stress conditions in chickens. / A galinha é um organismo modelo ideal para melhorar o entendimento de diversas áreas da pesquisa como: filogenética, embriologia, biomedicina, pecuária, e tem sido recentemente sugerida como um modelo promissor para estudos em epigenética. Na pecuária, as galinhas são fonte de proteína para os seres humanos e tem sido alvo de seleção para alcançar um alto padrão de produção com base no melhoramento genético tradicional. Mas agora, estamos na era genômica e epigenômica e as atenções devem ser voltadas para o uso de novas ferramentas para melhorar a seleção não só pensando em produção, mas também na saúde e bem-estar dos animais. O uso de abordagens moleculares, tem sido uma ferramenta fundamental para compreender modelos biológicos e melhorar as estratégias de seleção baseadas na informação genômica em programas de melhoramento. Abordagens moleculares, também tem contribuído para a compreensão da história evolutiva desses modelos e os mecanismos genéticos e epigenéticos envolvidos no processo de evolução e diversificação genética das galinhas. Neste contexto, tecnologias evoluíram para produção de dados de sequenciamento de alto rendimento por sequenciamento de próxima geração (NGS). NGS forneceu uma grande quantidade de informação a ser utilizado para diversos fins, como para detectar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e perfis de metilação diferencial do DNA em galinhas. NGS tem permitido também o desenvolvimento de painéis de SNP para testes de associações genômica ampla (GWAS) com fenótipos específicos de interesse. Embora NGS tem poder suficiente para detectar polimorfismos informativos, o seu elevado custo o torna impraticável para ser utilizado em GWAS ou estudos de metilação diferencial por sequenciamento de DNA metilado por imunoprecipitação (MeDIPseq). A procura de um método de genotipagem eficiente, simples, econômico e confiável para descoberta, caracterização e validação de SNPs, foi a razão para o desenvolvimento deste estudo. Utilizamos sequenciamento do genoma reduzido por enzima de restrição (RE) que cliva o genoma alvo para identificação de SNPs nestas bibliotecas reduzidas e aplicação deste método em GWAS. Em seguida, para combinar a representação reduzida do genoma com o método MeDIPS, desenvolvemos uma nova abordagem para a realização de estudos de metilação diferencial utilizando as bibliotecas reduzidas. Estes trabalhos permitiram a identificação de SNPs associados com características de desempenho e janelas de metilação diferencial relacionados a diferentes condições de manejo em galinhas.

O presente estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos e fenotípicos de número diâmetro e área de fibras musculares, bem como de características de desempenho, carcaça e qualidade de carne em uma linhagem de frangos pertencentes a um programa de seleção do tipo sib test, onde foram coletadas informações de carcaça dos irmãos completos dos indivíduos a serem selecionados, oriundos de um rebanho de pedigree, fornecidos pela Agroceres Ross Melhoramento de Aves S.A. Também foram fornecidos pela empresa 73.142 e 34.949 dados de peso à seleção juvenil e medidas de ultra-sonografia do músculo peitoral, respectivamente. As características analisadas foram: peso à seleção (PS), medidas de ultra-sonografia (US), peso de peito (PPEI), medida de pH inicial (pHi), medida de pH final (Phf), teor de luminosidade (L*), teor de vermelho (a*), teor de amarelo (b*), perdas de água por exsudação (EXSU), perdas de água por descongelamento (CONG), perdas de água por cozimento (COZ), força de cisalhamento (FC), número de fibras musculares (NCel), diâmetro de fibras musculares (DIAM) e área de fibras musculares (AREA). Os componentes de (co) variância foram estimados através do método de máxima verossimilhança restrita, utilizando-se o programa MTDFREML. A matriz de parentesco foi composta por 77.474 animais. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram moderadas a altas para as características número de fibras musculares, peso à seleção juvenil, medida de ultra-sonografia, peso de peito, perda de água por exsudação, teor de luminosidade e teor de vermelho. As estimativas de correlações genéticas do número e diâmetro de fibras musculares com as características de perda de água da carne e força de cisalhamento indicaram a existência de uma importante associação genética entre as características, capazes de apresentar satisfatório potencial de resposta à seleção. / This research was conducted to estimate genetic and phenotypic parameters of muscle fibers of number, diameter and area, as well as of performace, carcass and meat quality traits in a male broiler line belonging to a program of selection of the type sib test, in which data from complete brothers of the individuals were selected, bred in a pedigree flock provided by Agroceres Ross Melhoramento de Aves S. A. Also were provided by the company 73,142 and 34,949 data concerning body weight at juvenile selection and ultrasound records of pectoral muscle, respectively. The traits analyzed were: body weight at juvenile selection (PS), ultrasound records of pectoral muscle (US), meat breast weight (PPEI), initial pH measure (pHi), final pH measure (pHf), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*), weep losses (EXSU), drip losses (CONG), shrik losses (COZ), shear force (FC), muscle fibers of number (NCel), muscle fibers of diameter and muscle fibers area (AREA). (Co) variance components were estimated by restricted maximum likelihood method, using the software MTDFREML. The numerator relationship matrix was composed by 77,474 individuals. Heritability coefficients estimates were from moderate to high for muscle fibers number, ultrasound records, meat breast weight, weep losses, lightness and redness traits. Genetic correlation estimates of muscle fibers number and diameter with the measures of meat water losses and shear force traits indicated the existence of an important genetic association between the traits, capable to present potential satisfactory respond to the selection.

A seleção genômica é a mais moderna tecnologia no que tange a utilização de marcadores genéticos para a seleção e melhoramento genético de animais domésticos. Em síntese a metodologia consiste em uma seleção assistida por marcadores em uma escala ampla do Genoma e foi proposta por Meuwissen et al. (2001). O desequilíbrio de ligação (DL) entre os marcadores e loci de características quantitativas (QTL) e a composição da população referência são pontos chave para a confiabilidade da seleção genômica. À medida que os indivíduos se distanciam geneticamente, o DL entre marcadores e QTL diminui, o que dificulta a aplicação da seleção genômica em populações de animais multirraciais e explica o fato de até hoje a maior parte das pesquisas se concentrarem na estimação de valores genômicos apenas para animais de raças puras. A aplicação dessa metodologia em populações multirraciais de bovinos constitui uma possibilidade real de grandes avanços no melhoramento genético do rebanho brasileiro de bovinos de corte. / Genomic Selection is the newest technology into the use of genetic markers at the animal breeding. In sinthesys the metodology consists in a marker assisted selection in a genome wide scale, it was pourpused by Mewissent et al. (2001). The linkage disequilibrium between the marker and quantitative trait loci (QTL) and the composition of the reference population are key points to the reablility of the genomic selection. Once the individuals get genetically distants, the DL between markers and QTLs decays, what turns hard the aplication of genomic selection in multirracial populations of animals and explains the fact of untill today the major part of researchs are dedicated to the estimation of genomic breeding values only to purebreed animals. The aplication of this methodology in multibreed cattle populations consists in a real possibility to reach greats advances in genetic improvement of the brazilian beef cattle heard.

Em diferentes programas de melhoramento genético, o acompanhamento do progresso genético é essencial para possibilitar ajustes necessários à sua utilização. No Brasil, além de ser considerada uma das raças mais utilizadas para a produção de fêmeas mestiças leiteiras, a raça Gir Leiteiro lidera a lista das raças exportadoras de sêmen. Por conta disso, este estudo objetivou estimar os parâmetros e as tendências genéticas para vinte características de produção, conformação e manejo de animais puros da raça, integrantes do Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro, além das tendências fenotípicas e das tendências genéticas para quatro trajetórias de seleção para produção de leite e de gordura. A metodologia utilizada foi a da Máxima Verossimilhança Restrita em um modelo animal. As tendências genéticas para todas as características foram obtidas via regressão linear das médias dos valores genéticos em função do ano de nascimento dos animais, que em geral, variou de 1935 a 2013. As herdabilidades foram de 0,23 (leite), 0,10 (gordura) e variaram de 0,01 a 0,53 para as características lineares de conformação e manejo. Para produção de leite em 305 dias, houve favorável progresso genético ao longo do tempo, para fêmeas mensuradas (14,04 kg/ano), fêmeas (8,27 kg/ano) e machos (6,12 kg/ano), quanto para as quatro trajetórias de seleção (pais de touros, pais de vacas, mães de touros e mães de vacas). As tendências genéticas para produção de gordura em 305 dias, embora positivas, foram de baixa magnitude. As mudanças genéticas nas características lineares foram em geral, variáveis e inexpressivas, sugerindo que a seleção no Gir Leiteiro tenha sido direcionada essencialmente para maior produção de leite. A provável maior adesão pelos criadores ao uso de reprodutores comprovadamente geneticamente superiores e as melhorias ambientais (nutrição e manejo), possibilitaram incrementos fenotípicos nas produções de leite (55,38 kg/ano) e de gordura (0,91 kg/ano) em bovinos puros da raça Gir Leiteiro no Brasil. / In different breeding programs for genetic improvement, the monitoring of genetic progress is essential to allow for the necessary adjustments to its use. In Brazil, besides being considered one of the most used breeds for the production of crossbred dairy females, the Dairy Gir breed leads the list of semen export breeds. The objective of this study was to estimate parameters and genetic trends for nineteen traits of production, conformation and management of purebred animals of the National Breeding Program for Dairy Gir, in addition to the phenotypic trends and genetic trends for four selection trajectories for the milk yield and fat yield productions. The methodology used was that of Restricted Maximum Likelihood in an animal model. The genetic trends for all traits were obtained through linear regression of the means of genetic values according to the year of birth of the animals, which generally varied from 1935 to 2013. The heritabilities were 0.23 (milk), 0.10 (fat) and ranged from 0.01 to 0.53 for the linear conformation and management traits. The milk yield in 305 days presented favorable genetic progression over time for both mensured females (14.04 kg/year), females (8.27 kg/year) and males (6.12 kg/year), and for the four selection trajectories. The genetic trends for fat yield production in 305 days, although positive, were of low magnitude. The genetic changes in the linear characteristics were in general, variable and inexpressive, suggesting that the selection in Dairy Gir has been directed essentially to a greater milk yield. The probable higher adhesion by breeders to the use of genetically superior breeding herds and environmental improvements (nutrition and management), allowed for phenotypic increases in the milk yield (55.38 kg/year) and fat yield (0.91 kg/year) in the Dairy Gir cattle in Brazil.

O objetivo do presente estudo foi estimar valores econômicos para características componentes de índices de seleção em bovinos de corte na fase de cria. Os dados produtivos analisados foram simulados e representativos de sistemas de produção que fazem uso dos programas de melhoramento genético animal. Os valores de custos e receitas aplicados foram coletados de empresas ligadas ao setor econômico da pecuária de corte nacional. As características assumidas como critérios de seleção, para as quais estimaram-se valores econômicos, foram: probabilidade de prenhez aos 14 meses (PP14), habilidade de permanência (HP) e peso a desmama (PD). Para a estimação de valores econômicos, foi aplicada a metodologia de Modelo Bioeconômico, a qual estima o lucro adicional a partir da alteração no desempenho produtivo da característica de influência genética, enquanto mantendo constante todas as demais variáveis analisadas. O valor econômico da PP14 foi de R$0,71 por percentual de prenhez, avaliado por novilha e de R$1,16 por kg bezerro(a) desmamado, para a característica de PD. Os valores econômicos da HP, avaliados por vaca, foram de R$1,37, R$1,87, R$2,37 e R$2,87, considerando-se o custo de compra da novilha a R$450,00, R$500,00, R$550,00 e R$600,00, respectivamente. Os resultados econômicos obtidos foram padronizados para o valor genético-econômico, medida resultante do produto entre o desvio padrão genético aditivo da característica e o respectivo valor econômico. A HP, apesar de, em valores absolutos, ser a característica de maior importância econômica para o sistema produtivo analisado, apresenta o valor genético-econômico inferior em relação às características de PP14 e PD, as quais têm maior herdabilidade e variabilidade genética. O valor genético-econômico da soma das características PP14 e HP foi maior do que PD, sugerindo serem as características de fertilidade as mais economicamente importantes para o sistema produtivo simulado, específico ao comércio de bezerros desmamados para o mercado. / The objective of the present study was to estimate economic values for component of selection indexes in beef cattle herds during suckling phase. Analyzed productive data was simulated and representative of production systems assisted by breeding program. Values of costs and incomes were collected from companies related to the economical study of national cattle raising. Selection criteria, for which economic values was estimated, were: heifer pregnancy at 14 months (PP14), stayability (HP) and weight weaning (PD).) The methodology of Bioeconomic Model was applied to estimation of economic values (VE). This methodology estimates the impact in the profit from the alteration in performance for each trait of genetic influence, keeping constant all the others variables analyzed. The VE for PP14 was R$0.71 for percentage of heifer pregnant, evaluated for heifer, and R$1.16 for kg of calves weaned analyzed for PD. The VE of the HP, analyzed for cow, were R$1.37, R$1.87, R$2.37 and R$2.87 considering the heifer cost purchase of R$450.00, R$500.00, R$550.00 and R$600.00, respectively. The VE were standardized for the genetic-economic value, result of multiplication of additive genetic standard deviation of the trait by respective VE. Although HP, in absolute values, was the trait of larger economic importance to the analyzed productive system, it presents inferior genetic-economic value compared PP14 and PD. This inversion is due to greater heritability and genetic variability of PP14 and PD. The genetic-economic value of the PP14 and HP together, was more important than WW, showing that the traits of fertility are the most economically important for this simulated productive system, specific to the commerce of calves weaned for the market.

O ciclo reprodutivo de Spilotes pullatus na região sudeste do Brasil é descrito para machos e fêmeas a partir de análises macroscópicas e microscópicas do aparelho reprodutor e órgãos acessórios envolvidos na reprodução ao longo do ano. Os machos da espécie apresentam o ciclo sazonal com o início da espermatogênese no verão, e durante o outono ocorre a espermiação. Os gametas são estocados ao longo dos ductos deferentes que possuem um formato convoluto. Os testículos entram em regressão e durante o inverno e a primavera apresentam-se inativos. Não é incomum encontrar machos de Spilotes com anomalia gonadal, apresentando uma massa testicular funcional próximo aos testículos. A cópula ocorre durante o inverno, principalmente na metade final da estação, os gametas estocados nos ductos deferentes não são esgotados durante a estação de acasalamento de forma que durante todo o ano os machos possuem espermatozóides estocados nos ductos. Os rins, órgão reprodutor acessório em Squamata, não apresentam variação em tamanho ao longo das estações em nenhum dos sexos, mas mudanças microscópicas ocorrem no néfron dos machos na região do segmento sexual renal, essa estrutura encontra-se hipertrofiada durante a estação de acasalamento. Combate pode ocorrer durante a primavera e os machos tendem a ficar com a porção cranial do corpo na vertical durante o duelo, diferentemente da maioria dos outros colubrídeos que mantém quase todo o corpo na horizontal. Durante o combate os machos podem expor o hemipênis. As fêmeas iniciam a vitelogênese no outono quando os folículos menores do que 10 mm começam a receber depósito de vitelo. O forrageio das fêmeas diminui de acordo com o desenvolvimento folicular. No final do inverno os folículos encontram-se pré-ovulatórios e no oviduto médio observa-se uma hipertrofia das glândulas da casca. As fêmeas parecem apresentar um período de proestro de seis dias e em seguida o estro. Os hemipênes da espécie são únicos, sem nenhum tipo de bifurcação, enquanto que a fêmea possui uma cloaca longa e com bolsas (vaginas) marcadamente bilobadas. Após a cópula, no final do inverno, ocorre a ovulação. Nessa espécie parece haver ovulação reflexa, sendo a cópula o estímulo para que ocorra a ovulação. A primavera é a estação onde as fêmeas encontram-se prenhas e realizam a ovipostura. As fêmeas que não ovularam parecem ter os folículos absorvidos pelo organismo. As caninanas produzem em média oito ovos que 12 podem estar distribuídos igualmente ou não entre os ovários. Os ovos postos na prprimavera são incubados em média por 73 dias e a eclosão ocorre durante o verão. / The reproductive cycle of Spilotes pullatus in southeastern of Brazil is described for males and females from macroscopic and microscopic analysis of the reproductive tract and accessory organs involved in reproduction throughout the year. Males of the species exhibit a seasonal cycle with the onset of spermatogenesis in the summer and during autumn spermiation occurs. The gametes are stored along the vas deferens, which have a convoluted shape. The testicles come in regression and during the winter and spring appear inactive. It is not unusual to find male Spilotes with gonadal failure, with a testicular mass function next to the testicles. Mating occurs during the winter, especially in the latter half of the season, gametes stored in the vas deferens are not depleted during the breeding season so that throughout the years, males have sperm stored in the vas. The kidneys, reproductive organ accessory in Squamatas not show variation in size throughout the seasons in either sex, but microscopic changes occur in the nephron of male sexual segment in the region of the kidney, this structure is hypertrophied during the mating season. The kidneys, reproductive organ accessory Squamatas not show variation in size throughout the seasons in either sex, but microscopic changes occur in the nephron of male sexual segment in the region of the kidney, this structure is hypertrophied during the mating season. Combat can occur during the spring and the males tend to stay with the cranial portion of the body vertical during the duel, unlike most other colubrids that keeps most of the body horizontally. During combat, males may expose the hemipenis. The females begin the vitellogenesis on fall when the follicles smaller than 10 mm start receiving tank calf. Female foraging decreases with the follicle development. At the end of winter follicles are pre-ovulatory and in the medium oviduct there is a hypertrophy of gland shell. Females appear to have a period of six days of proestrus and then estrus. The specie hemipenes are unique, without any kind of bifurcation, while the female has a long cloaca with pouch (or vaginal pouch) markedly bilobed. After mating in the end of winter, ovulation occurs. In this species seems to be reflex ovulation, copulation being the stimulus for ovulation to occur. Spring is the season when females are pregnant and do the oviposition. Females that did not ovulate have to seem the follicles absorbed by the body. The 14 tiger rat snake produce an average of eight eggs that may or may not be distributed equally between the ovaries. The eggs laid in spring are incubated in medium for 73 days and hatching occurs during the summer.

Foram estudados dados provenientes do experimento de seleção estabelecido na Estação Experimental de Zootecnia de Sertãozinho (IZ - SP), com o objetivo de avaliar a resposta direta no peso ao sobreano de machos e fêmeas e as respostas correlacionadas no tamanho e caracteres reprodutivos das matrizes. O experimento iniciou em 1978, com três rebanhos da raça Nelore, seleção (NeS), tradicional (NeT) e controle (NeC), sendo os dois primeiros selecionados para maior peso ao sobreano e o terceiro para a média deste peso. O NeT diferencia-se de NeS por ter recebido, eventualmente, touros de outros rebanhos, inclusive comerciais. Registros de dias ao parto foram analisados separadamente nas novilhas, vacas e vacas e novilhas sem incluir e incluindo as fêmeas não paridas. Nenhuma diferença significativa (P<0,05) foi detectada entre os desempenhos das fêmeas dos rebanhos selecionados (NeS e NeT) e as do controle (NeC). As herdabilidades variaram de 0,02 a 0,16, sendo as mais altas obtidas em arquivos nos quais foram incluídos os registros das fêmeas não paridas. Os registros repetidos de dias ao parto de vacas e novilhas incluindo as fêmeas não paridas foram também analisados por modelo de regressão aleatória com polinômios ortogonais (Legendre) da idade na monta (em anos) como a covariável independente, para avaliar este caracter longitudinalmente durante a vida produtiva das fêmeas. As herdabilidades estimadas aumentaram de 0,08 a 0,28 da 1 a à 6 a monta. A seleção para peso não alterou o valor genético médio das vacas de NeS e NeT, entretanto os valores genéticos das vacas do NeC mostraram tendência de queda no decorrer dos anos, além de longitudinalmente, com o avanço da idade. Registros de peso ao sobreano dos animais nascidos de 1978 a 1998, e da altura na garupa ao sobreano das fêmeas nascidas a partir de 1985 foram analisados por modelo animal para obter a tendência genética de 1981 a 1996. Médias de peso, altura e escore de condição corporal na entrada da monta, dias ao parto e sucesso ao parto das matrizes nascidas nos últimos 4 anos foram contrastadas entre os selecionados e o NeC, em análise de quadrados mínimos. As tendências genéticas médias obtidas em 16 anos foram 1,7±0,2; 2,3±0,2 e -0,1±0,1 kg/ano nos machos e 1,9±0,2; 2,4±0,2 e -0,1±0,1 kg/ano nas fêmeas para peso, e 0,25±0,03; 0,24±0,04 e -0,04±0,03 cm nas fêmeas para altura ao sobreano, respectivamente em NeS, NeT e NeC. Novilhas e vacas de NeS e NeT foram 19% e 15% mais pesadas e 4% mais altas na entrada da monta, em relação às do NeC. Não foram detectadas diferenças significativas (P<0,05) no desempenho reprodutivo das matrizes selecionadas em relação ao NeC. Os resultados indicaram que a seleção para peso corporal promoveu respostas altas e consistentes nos pesos e alturas ao sobreano e em idades mais tardias, sem comprometer o desempenho reprodutivo das matrizes. / Data from a selection experiment, carried out AT Experimental Station of Sertãozinho, State of São Paulo, Brazil, were analyzed in order to evaluate the direct response of yearling weight and the correlated responses of the size and reproduction traits of cows. The experiment started in 1978, with three lines of Nelore cattle, selection (NeS), traditional (NeT), both selected for greater yearling weight, and control (NeC), selected for mean yearling weight. The NeT line is different from the NeS one because sires from another herds were eventually introduced into the NeT line. Records of days to calving were analyzed separately for heifers, cows and cows and heifers with and without non-calver females. There were no significant differences (P<0.05) between the performance of females from the selection lines (NeS and NeT) and those from the control line (NeC). The heritabilities were between 0.02 and 0.06, and the higher estimates were from data sets including non-calver females. The repeated records of days to calving of cows and heifers with non-calvers, were too analyzed using a random regression model, with orthogonal polynomials (Legendre) of age in the breeding season (in years) as the independent covariable, to order to evaluate this trait longitudinally during the herd life of the females. The estimates of heritability increased from 0.08 to 0.28, from first up to 6 th breeding season. The selection for weight did not alter the average breeding value of cows from NeS and NeT, although the average genetic breeding values of cows declined throughout the years, and too longitudinally, with advancing age. Yearling weight of the animals born from 1978 to 1998, and the yearling hip height of females born from 1985 to 1998, were evaluated using an animal model, in order to obtain the genetic trends for the years 1981 to 1996. The averages for weight, height and body condition score at the start of the breeding season, days to calving and calving success of cows born in the last 4 years, were contrasted between the selected (NeS and NeT) and control lines. The genetic trends obtained after 16 years were 1.7±0.2; 2.3±0.2 and -0.1±0.1 kg/year for males and 1.9±0.2; 2.4±0.2 e -0.1±0.1 kg/year for females with respect to weight, and 0.25±0.03; 0.24±0.04 and -0.04±0.03 cm for females with respect to yearling height for the NeS, NeT and NeC lines, respectively. Heifers and cows from NeS and NeT were 19% and 15% heavier and 4% taller at the start of the breeding season than those from NeC. Significant differences (P<0.05) were not detected with respect to the reproductive performance between selected (NeS and NeT) and control females. The results indicated that the selection according to body weight gave high and consistent responses for weight and height both at the yearling and later ages, without compromised the reproductive performance of the cows.

O gene DMRT3 tem sido descrito como o principal gene a atuar na determinação da marcha em diversas raças equinas. O alelo A do SNP 23:g.22999655C&gt;A do DMRT3 foi apontado como responsável por essa característica. Na raça brasileira Mangalarga Marchador, a qual apresenta dois padrões de marcha com características bem definidas, os genótipos AA e CA vem sendo associados à marcha picada e o genótipo CC à marcha batida. O objetivo geral do presente prospectar regiões genômicas associadas às marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador. Foram utilizados 1.230 dados fenotípicos sobre o tipo de andamento (marcha batida N = 1.006; marcha picada N = 227) e, considerando a totalidade da genealogia conhecida para cada animal, 3172 animais no pedigree. Primeiramente foram testadas estratégias de modelagem para esta característica a fim de determinar os efeitos a serem considerados no modelo, bem como a melhor forma de inclusão (efeito fixo ou aleatório). Posteriormente, foi estudada a relação entre as frequências alélicas e genotípicas do gene DMRT3 com os padrões de parentesco e endogamia de acordo com cada tipo de marcha. Um estudo de associação genômica ampla em passo único (considerando informações de animais genotipados e não-genotipados simultaneamente) foi conduzido para verificar regiões genômicas, polimorfismos de nucleotídeo único e genes relacionados com a determinação do tipo de marcha em cavalos Mangalarga Marchador. Vinte e dois polimorfismos de nucleotídeo único localizados nos cromossomos 4(N = 5), 6 (2), 16 (1), 23 (11), 26 (1) e 29 (2), foram responsáveis por 42,43% da variância genética aditiva. Foram associados ao tipo de marcha 69 genes, mas cerca de 39 não estavam anotados em equinos. Foi conduzido um blast a fim de recuperar a função mais provável destes genes. Foram encontradas oito vias metabólicas associadas ao tipo de marcha. Os principais genes envolvidos estavam relacionados à percepção de estímulos externos, metabolismo energético-oxidativo, sistema imune e aprendizado e ritmo da locomoção. Não foi possível identificar a(s) variante(s) causal(ais) do tipo de marcha, contudo este estudo foi o primeiro e verificar que a possível determinação genética do tipo de marcha em cavalos Mangalarga Marchador passa por diferenças em níveis metabólicos que garantem a adaptação dos animais ao tipo de andamento. / The DMRT3 gene has been described as the main gene to act in gait determination in several equine breeds. The allele A of the SNP 23:g.22999655C&gt;A of DMRT3 gene was identified as responsible for this trait. In the Brazilian Mangalarga Marchador breed, which presents two gait patterns with characteristics well defined, the AA and CA genotypes have been associated with marcha picada gait and CC genotype with marcha batida gait. The general aim of this study was to prospect genomic regions associated with marcha batida and marcha picada gaits in Mangalarga Marchador equines. 1,230 phenotypic data were used on the type of gait (marcha batida N = 1.006; marcha picada N = 227) and, considering the totality of known genealogy for each animal, 3,172 animals in the pedigree. Firstly, modelling strategies were tested for this trait in order to determine the effects to be considered in the model, as well as the best form of inclusion (fixed or random effect). Based on the best modelling strategy to be used, the relationship between the allelic and genotypic frequencies of the DMRT3 gene with kinship and inbreeding patterns was studied according to each type of gait. A single-step wide genomic association study (considering information from both genotyped and non-genotyped animals simultaneously) was conducted to verify genomic regions, single nucleotide polymorphisms and genes related to determination of gait type in Mangalarga Marchador horses. Twenty two single nucleotide polymorphisms located on chromosomes 4 (N = 5), 6 (2), 16 (1), 23 (11), 26 (1) and 29 (2) were responsible for 42.43% of the additive genetic variance. 69 genes were associated with gait type, but about 39 were not annotated in horses. A blast was conducted in order to recover the most likely function of these genes. Eight metabolic pathways were found associated with gait type and the main genes involved were related to the perception of external stimuli, energy-oxidative metabolism, immune system and learning and rhythm of locomotion. It was not possible to identify the causal variant(s) of the type of gait; however, this study was the first and to verify that the possible genetic determination of gait type in Mangalarga Marchador horses goes through differences in the metabolic levels that guarantee the adaptation of the animals to the type of gait.

Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2019-03-19T17:15:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Henrique Alberto.pdf: 1188431 bytes, checksum: 906cfffe0deaf5f7b89d9a4c17dc419e (MD5) / Made available in DSpace on 2019-03-19T17:15:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Henrique Alberto.pdf: 1188431 bytes, checksum: 906cfffe0deaf5f7b89d9a4c17dc419e (MD5) Previous issue date: 2019-01-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com avanço das biotecnologias da reprodução animal, como a inseminação artificial, possibilitou a difusão de mesmos materiais genéticos em diferentes regiões pelo mundo todo. A partir desse ponto, o aumento de estudos da interação genótipo ambiente começa a ser observado, uma vez que o desempenho genético de alguns animais tende a modificar de acordo com o ambiente onde está sendo avaliado. Com isso o objetivo desse trabalho foi investigar a presença da Interação Genótipo Ambiente, via modelos de normas de reação, para as características leite, gordura e proteína, em diferentes temperaturas regionais do estado do Paraná, em animais da raça Holandesa. Dados de 67.360 vaca primíparas pertencentes a Associação Paranaense dos Criadores de Bovinos da Raça Holandesa, obtidas através de controle leiteiro oficial, foram utilizadas nas análises. Adotou-se o modelo de regressão aleatória para análise de normas de reação, assumindo a variância residual como heterogênea. Aplicou-se nas análises a avaliação de quarta ordem sob polinômios de Legendre assumindo o modelo misto de análise por método REML através do software WOMBAT. Posterior as análises do rebanho completo, avaliou-se o comportamento genético dos 15 touros mais representativos, conforme as mudanças do gradiente de temperatura. As médias para Produção de Leite, Gordura e Proteína foram 8.374,82 kg, 277,81 kg e 255,47 kg, respectivamente. As herdabilidades variaram de 0,18 a 0,23, 0,21 a 0,27 e 0,14 a 0,20 para Produção de Leite, Gordura e Proteína, respectivamente, condizendo com estudos anteriores realizados no estado. A correlação entre os gradientes de temperatura para todas as características ficou acima de 0,80 indicando ausências de interações relevantes entre o genótipo e o ambiente. Apesar disso, houve modificações genéticas no aumento de temperatura chegando a diferença de até 289 kg de leite, 10,69 kg de gordura e 9,47kg de proteína, apresentando modificações pontuais dos touros de acordo com a característica analisada. A partir dessas informações, conclui-se que não é necessária a inclusão da variável temperatura nos modelos de análises genéticas da raça Holandesa, aplicados no estado do Paraná. / The reproductive animal biotechnology advances, such as artificial insemination, has enabled the diffusion of the same genetic material in different regions all over the world. From there, more studies of the genotype environment interaction have begun to be observed, since the genetic performance of some animals tend to modify according to the environment where it is being evaluated. The objective of this study was to investigate the presence of genotype-environment interaction, through reaction norm models, for the milk yield, fat yield and protein yield, in different regional temperatures in the state of Paraná, in animals of the Holstein cattle. Data from 67,360 primiparous cows belonging to the Paraná Holstein Breeders Association database were analyzed through official dairy control. It was adopted the random regression model for the analysis of reaction norms, assuming the residual variance as heterogeneous. The fourth-order evaluation under Legendre polynomial was applied to the analysis, assuming the mixed model of analysis by REML method through the WOMBAT software. After the full herd analysis, the genetic behavior of the 15 most representative bulls was evaluated, as the temperature gradient changes. The averages for Milk, Fat and Protein yield were 8,374.82 kg, 277.81 kg and 255.47 kg, respectively. Heritabilities ranged from 0.18 to 0.23, 0.21 to 0.27 and 0.14 to 0.20 for Milk, Fat and Protein yield, respectively, consistent with previous studies performed in Holstein Cattle in Paraná State. The correlation between temperature gradients for all traits was above 0.80 indicating an absence of significant interactions between genotype and environment. Despite of this, there were genetic modifications in the temperature increase, reaching a difference of up to 289 kg of milk, 10.69 kg of fat and 9.47 kg of protein, presenting specific modifications of the bulls according to the analyzed characteristic. From this information, it is concluded that it is not necessary the inclusion of temperature variable on genetic analysis model at Paraná Holstein Cattle.