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Caracterização molecular de isolados de Mycobacterium bovis de rebanhos de diferentes regiões do Brasil / Molecular characterization of Mycobacterium bovis isolates from cattle from different regions of Brazil

Ramos, Daniela Fernandes 30 November 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_daniela_fernandes_ramos.pdf: 1004504 bytes, checksum: d8fd2e285277928c8af06e08c3527471 (MD5) Previous issue date: 2012-11-30 / Bovine tuberculosis (BTB) caused by Mycobacterium bovis is an infectious disease of zoonotic which mainly affects cattle and buffaloes, and cause economic losses in the production of meat and milk in many countries. In Brazil, the official rates are at 1.3% of the national herd infected, corresponding to approximately 2.5 million animals. To contribute to the control of BTB, many molecular techniques have been developed in order to differentiate isolates and establish epidemiological correlations between them. Among these techniques, the most used are the Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP), Polymorphic Guanine-cytosine-Rich Sequence [1], Spoligotyping [2], Mycobacterial Interspersed Repetitive Units - Variable Number of Tandem Repeat (MIRU-VNTR) and Exact Tandem Repeat [3]. The spoligotyping and MIRU-VNTR are today considered standard methods of molecular techniques for typing of M. bovis. Both are based on PCR techniques that evaluate polymorphism in the number of repeat sequences present in the genome. Taking into account that the molecular characterization enables to increase our knowledge on the epidemiology of M. bovis and in tuberculosis control, this study aimed at the molecular characterization of isolates of M. bovis in the north and south of the Brazil, by isolating agent, identification of M. bovis by amplification of the region RD7 Multiplex PCR and genotyping using the techniques of spoligotyping, MIRU-VNTR and ETR. Nine-nine lymph nodes were collected from beef cattle in the north of the region and 162 dairy cattle in southern Brazil, and only 10 samples were positive for M. bovis in the north and 85 in the south region. Through analysis of molecular combination of spoligotyping and VNTR was possible to identify different genotypic patterns in the regions studied demonstrating the genetic diversity of M. bovis in our country. / A tuberculose bovina (BTB) causada pelo Mycobacterium bovis é uma doença infecto-contagiosa de caráter zoonótico que acomete principalmente bovinos e bubalinos, e causa prejuízos econômicos na produção de carne e leite em muitos países. No Brasil, os índices oficiais estão em 1,3% do rebanho nacional infectado, correspondendo a, aproximadamente, 2,5 milhões de animais. Visando contribuir para o controle da BTB, muitas técnicas moleculares vêm sendo desenvolvidas com o objetivo de diferenciar isolados e estabelecer correlações epidemiológicas entre eles. Dentre essas técnicas, as mais usadas são o Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP), Polymorphic Guanine-cytosine-Rich Sequence [1], Spoligotyping [2], Mycobacterial Interspersed Repetitive Units - Variable Number of Tandem Repeat (MIRU-VNTR) e Exact Tandem Repeat [3]. O spoligotyping e MIRU-VNTR são, hoje, considerados métodos padrões de técnicas moleculares para tipagem de M. bovis. Ambas são técnicas baseadas em PCR que avaliam o polimorfismo do número de sequências repetidas presentes no genoma. Levando em conta que a caracterização molecular possibilita aumentar nosso conhecimento na epidemiologia do M. bovis e no controle da tuberculose, este trabalho teve como objetivo a caracterização molecular de isolados de M. bovis da região norte e sul do Brasil, através do isolamento do agente, identificação de M. bovis pela amplificação da região RD7 por PCR Multiplex e genotipagem usando as técnicas de spoligotyping, MIRU-VNTR e ETR. Foram coletadas 99 linfonodos de bovinos de corte da região norte e 162 de bovinos de leite da região sul do Brasil, sendo que apenas 10 amostras foram positivas para M. bovis no norte e 85 na região sul. Através da análise molecular da combinação de spoligotyping e VNTR foi possível identificar diferentes padrões genotípicos nas regiões estudas demonstrando a diversidade genética de M. bovis no nosso país.
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Desenvolvimento de ferramentas biotecnológicas a partir de recursos naturais para o tratamento da doença de Alzheimer

Santos, Rosiane dos 14 February 2013 (has links)
Alzheimer´s disease (AD) is a neurodegenerative disorder responsible for the largest number of cases of dementia in the elderly. The brain regions associated with the frontal cortex and the hippocampus are the most affected by the changes arising from the AD, resulting in loss of neuronal function, and the loss of memory and cognitive ability. In the cellular level, AD is associated with reduced levels of acetylcholine (ACh) in the synaptic process, decreasing cortical cholinergic neurotransmission. ACh is a neurotransmitter found in the brain and at(in the) neuromuscular junctions, forming part of the parasympathetic nervous system, your activity and staying in the synaptic cleft is regulated by hydrolysis catalyzed by acetylcholinesterase (AChE) and butyrylcholinesterase (BuChE) enzymes that modulate the levels of Ach in the nervous system. The outlook for new targets cholinesterase inhibitors has stimulated research using bioactive compounds of natural products and also the use of an animal model that provides better understanding of the mechanisms of cognitive development. Because they are microorganisms that produce secondary given this, metabolites of great importance for bioprospecting, a study of the anticholinesterase activity of compounds isolated from the endophytic fungus Phomopsis sp. (PE) associated with mangabeira (Hancornia speciosa). Furthermore, it was investigated the effect of menthol on the adult zebrafish memory in the passive avoidance test. The menthol was selected taking to account the screening conducted by our research group in previous work, where this compound showed potent anticholinesterase activity. In the search for promising compounds to anticholinesterase drugs, the present study aimed to evaluate the in vitro activity of the crude extract of the fungus, as well as their isolated compounds 5-methyl mellein (1), nectriapyrone (2), tyrosol (3) and tryptophol (4) in AChE and BuChE in vivo evaluation the effect of menthol on the acquisition of learning and memory consolidation. In all assays were obtained encouraging results. The crude extract of PE and its isolated compounds were effective to inhibit cholinesterase, and the tryptophol (4) was the most promising because it showed dual action on the enzymes being selective to BuChE. The study of exposure to menthol zebrafish showed that this compound produces no effect on memory. On the other hand, at all doses tested menthol reverses amnesia induced by scopolamine. This study, therefore, demonstrated the potencial use of these compounds isolated from PE as source of novel agents for the treatment of AD and that menthol may be indicated as therapeutic alternative for the treatment of memory deficits. / A doença de Alzheimer (DA) é uma desordem neurodegenerativa responsável pelo maior número de casos de demência em idosos. As regiões cerebrais associadas ao córtex frontal e ao hipocampo são as mais comprometidas pelas alterações decorrentes da DA, resultando em perda da função neuronal, além de perda progressiva da memória e declínio cognitivo. Em nível celular, a DA está associada à redução das taxas de acetilcolina (ACh) no processo sináptico, diminuindo aneurotransmissão colinérgica cortical. A ACh é um neurotransmissor encontrado no cérebro e nas junções neuromusculares, compondo parte do sistema nervoso parassimpático, sua atividade e permanência na fenda sináptica são reguladas por hidrólise catalisadapela acetilcolinesterase (AChE) e pela butirilcolinesterase (BuChE) enzimas que modulam os níveis de ACh no sistema nervoso. A perspectiva por novos alvos inibidores das colinesterases tem estimulado pesquisas utilizando compostos bioativos de origem natural e também a utilização de modelo animal que proporcione melhor compreensão dos mecanismos do desenvolvimento cognitivo. Diante disso, pelo fato deserem microrganismos produtores de metabólitos secundários de grande importância para bioprospecção, foi realizado um estudo da atividade anticolinesterásica de compostos isolados do fungo endofítico Phomopsis sp. (PE) associado à mangabeira (Hancornia speciosa Gomes). Além disso, foi investigado o efeito do mentol sobre a memória de zebrafishadulto através do teste da esquiva passiva. O mentol foi selecionado tomando-se como base o screening realizado por nosso grupo de pesquisa, onde esse composto apresentou potente atividade anticolinesterásica. Na busca por compostos promissores a fármacos anticolinesterásicos, opresente trabalho teve como objetivo a avaliação in vitroda atividade do extrato bruto do fungo, e de seus compostos isolados 5-metil meleína (1), nectriapirona (2), tirosol (3) e triptofol (4) frente às enzimas AChE e BuChE, assim como a avaliação in vivodo efeito do mentol sobre a aprendizagem e consolidação da memória. O extrato bruto do PE e os seus compostos isolados apresentaram efeito na inibição das colinesterases, sendo o triptofol (4) o mais promissor, pois apresentou ação dual sobre as enzimas sendo seletivo para BuChE. O estudo da exposição de zebrafishao mentol revelou que este composto não produz efeito sobre a memória. Por outro lado, em todas as concentrações testadas o mentol foi capaz de reverter a amnésia induzida por escopolamina. Diante dos resultados, conclui-se que os compostos isolados do PE podem ser considerados como alternativas para o desenvolvimento de novos fármacos anticolinesterásicos e que o mentol pode ser indicado como alternativa terapêutica para tratamento de déficits de memória.
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Micro-organismos envolvidos em infecções urinárias de mulheres com idade superior a 15 anos atendidas no HC-UFG em 2009 e os perfis de suscetibilidade aos antimicrobianos / Micro-organisms involved in urinary tract infections in women aged over 15 years in HC-UFG attended in 2009 and profiles for antimicrobial susceptibility

SANTOS SOBRINHO, Rosemary Alves dos 06 May 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:29:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Rosemary A S Sobrinho.pdf: 331810 bytes, checksum: 90b92fefc7eba79f810a988a776beca0 (MD5) Previous issue date: 2011-05-06 / A urinary tract infection (UTI) is a very common disease and can occur at any age. The vast majority of UTIs is caused by enteric bacteria. The study aimed to identify the etiologic agents most frequently, the profile of antibiotic susceptibility and the factors possibly associated to the UTIs recurrents in women older than 15 years, cared for and / or admitted to the Hospital of the University of Goias. From March to November 2009, were invited and accepted to participate in the study 923 women in this age group and they were interviewed using a questionnaire about demographics data and risk factors for recurrent infections. Escherichia coli was the most frequent agent accounting for 67.9% of the total, followed by Enterobacter sp (6.2%), Klebsiella sp (6.2%), Proteus mirabilis (4.5%), Morganella morganii (4.0 %), Acinetobacter baumannii (2.8%) and Staphylococcus aureus (2.2%). %). E. coli showed higher rates of resistance to ampicillin in 46.7% patients with recurrent infection and 50.0% in infections nonrecurring; amoxicillin/clavulanate (32.6% and 35.7%), trimethoprim-sulfamethoxazole (30,0 and 25,0%, respectively) and 100,0% susceptibility to imipenem and nitrofurantoin in both groups. Enterobacter sp showed greater resistance to ampicillin, amoxicillin/clavulanic, norfloxacin and gentamicin (>88.0%) and greater susceptibility to amikacin, cefepime, imipinem and cephalosporins. Klebsiella sp showed high resistance to ampicillin and amoxicillin / clavulanate (> 60.0%) and greater susceptibility to quinolones (> 60.0%), amikacin and imipenem (100.0%) in both groups. There were no statistically significant differences between the risk for recurrent infection or not assessed for menopause, hypertension, hysterectomy, SEL (Systemic Erythematosus Lupus) and smoking. The only risk factor associated to recurrent infection in patients older than 50 years with diabetes. In this study, there was a greater number of E. coli in UTIs, followed by other enterobacteria such as Enterobacter sp and Klebsiella sp. Among all drugs tested, all the micro-organisms, were resistant generally to penicillins, being the most effective quinolones and carbapenems. / A infecção do trato urinário (ITU) é uma patologia muito frequente, podendo ocorrer em qualquer idade. A grande maioria das ITUs é causada por bactérias entéricas. O estudo teve como objetivos identificar os agentes etiológicos mais frequentes, o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos e os fatores possivelmente desencadeantes associados às ITUs recorrentes em mulheres com idade superior a 15 anos, atendidas e/ou internadas no Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Goiás. No período de março a novembro de 2009, foram convidadas e aceitaram participar da pesquisa 923 mulheres nesta faixa etária e entrevistadas por meio de questionário sobre dados demográficos e fatores de risco para infecções recorrentes. Escherichia coli foi o agente mais frequente representando 67,9% do total, seguido por Enterobacter sp (6,2%), Klebsiella sp (6,2%), Proteus mirabilis (4,5%), Morganella morganii (4,0%), Acinetobacter baumanii (2,8%) e Staphylococcus aureus (2,2%). E. coli apresentou taxas maiores de resistência à ampicilina 46,7% nas pacientes com infecção recorrente e 50,0% nas com infecções não recorrentes; amoxilina/ácido clavulânico (32,6% e 35,7%), sulfametoxazol-trimetoprima (30,0 e 25,0%) respectivamente e 100,0% de suscetibilidade para nitrofurantoína e imipenem em ambos os grupos. Enterobacter sp demonstrou maior resistência à ampicilina, amoxicilina/ácido clavulânico, norfloxacina e gentamicina (>88,0%) e maior suscetibilidade à amicacina, cefepime, imipinem e cefalosporinas. Klebsiella sp demonstrou alta resistência para ampicilina e amoxicilina/ácido clavulânico (>60,0%) e maior suscetibilidade às quinolonas (>60,0%), amicacina e imipenem (100,0%) nos dois grupos estudados. Não foram detectadas diferenças estatisticamente significantes entre o risco para infecção recorrente ou não avaliado para menopausa, hipertensão, histerectomia, LES (Lúpus Eritematoso Sistêmico) e tabagismo. O único fator de risco associado à infecção recorrente foi diabetes em pacientes com mais de 50 anos. Neste estudo, verificou-se um maior número de E. coli nas ITUs e incidência bem menor de outras enterobactérias como Enterobacter sp e Klebsiella sp. Entre os antimicrobianos testados todos os micro-organismos foram resistentes, de um modo geral, às penicilinas sendo mais efetivos as quinolonas e carbapenemas.
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Tipagem molecular da cápsula de Haemophilus influenzae isolados da nasofaringe de crianças de creches de Goiânia / Molecular typing of the capsule of Haemophilus influenzae isolated from the nasopharynx of children in daycare centers in Goiânia

CARVALHO, Camila Xavier de 19 March 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Camila Xavier de Carvalho_dissertacao.pdf: 504724 bytes, checksum: a41997b1490987005878aa95bc646e53 (MD5) Previous issue date: 2010-03-19 / Haemophilus influenzae (Hi) causes infection in children, and is presented in two ways: with six encapsulated serotypes a-f and non-encapsulated or nontypeable (NTHi). Capsulated strains are responsible for a variety of invasive diseases, with meningitis being the most frequent. Nontypeable strains are responsible for respiratory tract infections and acute otitis media in children under 24 months. Children who attend day care centers have increased risk of developing otitis media when colonized with NTHi. Our goal was to describe the prevalence of colonization by Hi and risk factors associated with carrier status in children attending day care centers. Nasopharyngeal swabs collected from 1192 healthy children under five years of age who attended one of 62 daycare centers in Goiânia - Goiás, Brazil were analyzed. The samples were placed on chocolate agar plates and incubated in an atmosphere containing 5% CO2 at 37 ° C overnight. Hi were identified according with colony morphology in culture, Gram staining, and their requirement for V (hemin) and X (NAD) factors. Capsular typing and the presence of the genes TEM1 and ROB1 for resistance to β-lactams were evaluated by PCR. Differences between proportions and means were tested using Chi-square and Student's t test, respectively. Estimates of relative risk (odds ratio) were evaluated by univariate and multivariate logistic regression, p values less than 5% were considered statistically significant. The prevalence of colonization among the 1192 children was 32.1% and 23.3% for HiNT and 8.8% for encapsulated strains. The prevalence of strains carrying the gene TEM1 was 38.4%. Among HiNT strains the prevalence of TEM1 gene was 43.2%. Previous hospitalization of children in the last 6 months was independently associated with the risk carrier by H. influenzae typeable. The data described in this study will aid investigation on the impact of the 10-valent pneumococcal vaccine (PHiD-CV) introduction. / Haemophilus influenzae (Hi) é uma das espécies de bactéria que causa infecção em crianças, e se apresenta sob duas formas: capsulados com seis sorotipos de a-f e não capsulados ou não tipáveis (HiNT). Cepas capsuladas são responsáveis por uma variedade de doenças invasivas, sendo a meningite a mais freqüente. As cepas não capsuladas ou não tipáveis são responsáveis por infecções do trato respiratório e otite média aguda em menores de 24 meses. As crianças que frequentam creches têm risco aumentado de desenvolverem otite média quando colonizadas por HiNT. Nosso objetivo foi descrever a prevalência de colonização por Hi e fatores de risco associados ao estado de portador em crianças atendidas em creches. Foram analisados swabs de nasofaringe coletados de 1192 crianças saudáveis menores de cinco anos de idade que frequentavam uma das 62 creches de Goiânia - Goiás, Brasil. As amostras foram semeadas em placas de ágar chocolate e incubadas em atmosfera contendo 5% de CO2 a 37°C durante a noite. Os Hi foram identifiados de acordo com a morfologia da colônia em meio de cultura, coloração de Gram e a exigência dos fatores V (hemina) e X (NAD). A tipagem capsular assim como a presença dos genes TEM1 e ROB1 para resistência a β-lactâmicos foi avaliada pela PCR. Diferenças de proporção e de média foram avaliadas pelo teste do Chi-quadrado e teste t de student, respectivamente. Estimativas de risco relativo (odds ratio) foram avaliadas por regressão logística uni e multivariada, valores de p menores que 5%, foram considerados estatisticamente significantes. A prevalência de colonização entre as 1192 crianças foi de 32,1% sendo 23,3% para HiNT e 8,8% para cepas capsuladas. A prevalência de cepas portadoras do gene TEM1 foi de 38,4%. Dentre os HiNT a prevalência de cepas portadoras do gene TEM1 foi de 43,2%. Internação prévia da criança nos últimos 6 meses esteve independentemente associado ao risco de portador por H. influenzae tipável. Os dados obtidos neste estudo poderão subsidiar o impacto da introdução da vacina pneumocócica decavalente PHiD-CV.
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Caracterização e identificação de leveduras do gênero Candida em pacientes transplantados de medula óssea / Characterization and identification of Candida species in bone marrow transplant patients

SILVA, Hildene Meneses e 31 August 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissert_mestrado_Hildene.pdf: 565864 bytes, checksum: 757a27963d59fc60689199a0ec35fa95 (MD5) Previous issue date: 2011-08-31 / Fungal infections in immunocompromised patients, especially in hospitalized individuals, which are submitted to differente types of treatment have increased in recent decades and are cause of death of these patients. The diagnoses of infection as well as the correct identification of the fungus, in addition to the in vitro susceptibility tests are important to control the disease and thus avoid death. This work was conducted to identify the species that causes candidemia in patients with hematologic malignancies and in those submitted to bone marrow transplantation from Araujo Jorge Hospital in the city of Goiânia. The main predisposing factors for the acquisition of candidiasis, the virulence factors inherent to the microorganism, as well as the in vitro susceptibility to different antifungal agents of Candida isolates were verified in this work. Clinical samples from patients were collected and cultived in brain heart infusion and Sabouraud agar dextrose and incubated at room temperature and at 36ºC. The identification of yeasts was performed by culture in cornmeal agar to check the chlamydospore production, by germ tube production in fetal bovine serum plus 1% tween 80, by inoculation onto chromogenic agar, CHROMagar and methods of assimilation of carbohydrates. The isolates were subjected to hemolytic activity and proteinase testing as well as to in vitro susceptibility testing using broth microdilution and Etest methods. Of the 410 clinical samples originated from 144 transplant patients we identified eleven yeasts, included three (3) Candida albicans, five (5) C. parapsilosis, one (1) C. tropicalis and two (2) Candida spp. All isolates of C. parapsilosis were susceptible to all antifungal agents, while two (2) isolates of C. albicans and one (1) C. tropicalis were resistant to three azole derivatives, fluconazole, itraconazole and voriconazole. Candida spp isolates did not show hemolytic activity, they were not able to secrete the enzyme proteinase either, they were resistant to fluconazole, itraconazole and amphotericin B and susceptible to caspofungin and voriconazole. In this study we can conclude that C. parapsilosis was prevalent, showing that the emergence of Candida non albicans. Besides we can conclude that in vitro susceptibility tests are of great importance for the adequate therapy to avoid the death of patients. / As infecções fúngicas em pacientes imunocomprometidos, principalmente em indivíduos hospitalizados, que são submetidos a diferentes tipos de tratamento têm aumentado nas últimas décadas, sendo causa de mortalidade entre estes pacientes. O diagnóstico da infecção bem como a identificação correta do fungo além dos testes de suscetibilidade in vitro são importantes para controlar a doença e por conseguinte evitar a morte. Neste trabalho, foi realizada a identificação das espécies causadoras de candidemia em pacientes portadores de doenças hematológicas e submetidos a transplantes de medula óssea provenientes do Hospital Araújo Jorge na cidade de Goiânia. Os principais fatores predisponentes para aquisição de candidiases, os fatores de virulência inerentes ao microorganismo bem como a suscetibilidade in vitro a diferentes antifúngicos dos isolados de Candida foram verificados para estes pacientes. Amostras clínicas dos pacientes foram coletadas e semeadas em ágar Brain Heart Infusion bifásico e ágar Sabouraud dextrose, incubadas a temperatura ambiente e a 36ºC, e observadas diariamente. A identificação das leveduras foi realizada através de cultivo em ágar cornmeal para verificar a produção de clamidoconidios, produção de tubo germinativo em soro fetal bovino acrescido de 1% de tweeen 80, inoculação em agar cromogênico, CHROMagar e por métodos de assimilação de hidratos de carbono. Os isolados de leveduras obtidos foram submetidos aos testes de suscetibilidade in vitro usando o método da microdiluição em caldo e Etest. Testes de atividade hemolítica e de proteinase foram também realizados para estes isolados. Das 410 amostras clínicas procedentes de 144 pacientes transplantados foram identificadas onze leveduras do gênero Candida, sendo três (3) Candida albicans, cinco (5) Candida parapsilosis, uma (1) Candida tropicalis e duas (2) Candida spp. Os isolados de C. parapsilosis foram suscetíveis a todos os antifúngicos, enquanto dois (2) isolados de C. albicans e o de C. tropicalis (um) mostraram-se resistentes aos três derivados azólicos, fluconazol. Itraconazol e voriconazol. As amostras de Candida não identificadas com relação a espécie foram suscetíveis ao voriconazol e a caspofungina. não apresentaram atividade hemolítica e não foram capazes de secretar a enzima proteinase. Neste trabalho pode-se concluir que C. parapsilosis foi prevalente mostrando a emergência de outras espécies não albicans como agentes de candidíase e ainda que os testes de suscetibilidade in vitro são de grande importância para que a terapia seja usada adequadamente evitando a morte dos pacientes.
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HANSENÍASE NO ESTADO DO MARANHÃO:análise das estratégias de controle e os impactos nos indicadores epidemiológicos / LEPROSY IN MARANHÃO STATE: analysis of control strategies and the impact on epidemiological indicators

Passos, Carlos Eduardo de Castro 23 October 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-19T17:47:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_CARLOS EDUARDO DE CASTRO PASSOS.pdf: 2150267 bytes, checksum: d1c6d6465e01f688b14c5f9beb57ae0b (MD5) Previous issue date: 2013-10-23 / Leprosy control strategies have been improving over the decades. However, in 2011, Brazil still has the largest number of leprosy cases in the Americas (93%) and ranks second case in the world, behind India and ahead of Indonesia. Strengthening this statistic is Maranhão, Brazil placed 4th in the detection of new cases, 3 children under 15 years of age and generally more prevalent in the northeast. This study aimed to analyze the epidemiological indicators recommended for monitoring and evaluation, describing strategies for leprosy control in the state of Maranhão. Thus, we developed a exploratory ecological study of the temporal evolution of the epidemiological leprosy and public policies to control the disease in the period 2002-2011. Regarding control strategies was observed that the state follows the recommendations of the Ministry of Health, however, with low resolution, the administrative and political difficulties for social abyss in which the state is. Identified the main epidemiological and operational indicators of leprosy, in which one might observe a trend of decreasing detection of new cases with strong statistical significance (R2 = 0,83, P <0,0001). On the other hand, new cases multibacillary revealed in inverse trend (R2 = 0,95, P <0,0001). Should be highlighted in the value of maintaining the proportion of cases with grade 2 disability at diagnosis generating a stable trend in the course of the study series. The analysis also showed that the ratio of new cases was significantly higher in Maranhão 74,3 / 100.000 in the country than the average 24,9 / 100.000 , with RR = 2,96 , 95% CI: 1,88 to 4,66 ; p < 0,0001 ; followed the same trajectory as the ratio of new cases in children under 15 years and the annual rate of prevalence. Regarding covariates case detection calls attention to the fall of the difference between the sexes, even keeping a significant difference with respect to male OR = 2,36 [ 95% CI 2,28 to 2,46 ] , p < 0,0001, and the stagnation of prevalence and incidence reason . It was also observed, keeping the number of cities in the five biennia hyperendemic situation of the study and the total period , causing the results pointed to a standard number of cases in the northwest not yet reported by other studies, central and western state, emonstrated by a vision of periods of study and map bubbles that can pass a real dimension of the disease in each municipality analyzed. Thus, the study reveals that even with the control strategies of leprosy undergoing constant maturation processes, leprosy continues as a neglected disease, hyperendemic diagnosed later in the study area with no prospect of exhausting these cases in the coming years, leading to believe that the process of social maturity is a big step towards achieving the goal of disease control. / As estratégias de controle da hanseníase vêm se aprimorando ao longo das décadas. No entanto, em 2012, o Brasil ainda detinha o maior número de casos de hanseníase das Américas (93%) e ocupa o segundo lugar de casos no mundo, atrás da Índia e à frente da Indonésia. Fortalecendo tal estatística encontra-se o Maranhão, 4º colocado do Brasil em detecção de casos novos, 3º em menores de 15 anos de idade e no geral mais prevalente do nordeste. Este trabalho teve como objetivo analisar os indicadores epidemiológicos recomendados para monitoramento e avaliação, descrevendo as estratégias de controle da hanseníase no Estado do Maranhão. Desta forma, desenvolveu-se um estudo ecológico exploratório, da evolução temporal dos indicadores epidemiológicos da hanseníase e das políticas públicas de controle da endemia no período de 2002-2011. Quanto às estratégias de controle, observou-se que o Estado segue as recomendações do Ministério da Saúde, no entanto, com baixa resolutividade, pelas dificuldades politico- administrativas e sociais na qual o Estado se encontra. Identificou-se os principais indicadores epidemiológicos e operacionais da hanseníase, no qual se pôde observar um padrão de tendência decrescente de detecção de casos novos com significância estatística forte (R2=0,83; P<0,0001). Por outro lado, a proporção de casos novos multibacilar revelou-se em tendência inversa (R2=0,95; P<0,0001). Deve ser destacada a manutenção no valor de proporção de casos com grau 2 de incapacidade física no momento do diagnóstico gerando uma tendência estável no decorrer da série do estudo. A análise mostrou ainda que o coeficiente de casos novos no Maranhão foi significativamente maior 74,3/100.000 que a média no país de 24,9/100000, apresentando RR=2,96, IC95%: 1,88-4,66; p<0,0001; seguiu na mesma trajetória o coeficiente de casos novos em menores de 15 anos e o coeficiente anual de prevalência. Com relação às covariáveis de detecção de casos, chama atenção à queda da diferença entre os sexos, mesmo mantendo-se uma diferença significativa com relação ao sexo masculino OR=2,36 [IC95%2,28-2,46]; p<0,0001, e a estagnação da razão prevalência e incidência. Observou-se, também, a manutenção do número de municípios em situação hiperendêmica nos cinco biênios do estudo e no período total, fazendo com que os resultados apontassem um padrão de concentração de casos nas regiões noroeste, ainda não apontada por outros estudos, central e oeste do Estado, demonstrados através de uma visão dos períodos de estudo e mapa em bolhas que conseguem passar uma real dimensão da endemia em cada município analisado. Sendo assim, o estudo revela que mesmo com as estratégias de controle da hanseníase passando por constantes processos de maturação, esta prossegue como uma doença negligenciada, hiperendêmica, com diagnóstico tardio na área de estudo, sem perspectiva de exaurir estes casos nos próximos anos, levando a crer que os processos de avanços sociais e reorganização das políticas públicas sejam o grande passo para o alcance da meta de controle da doença.
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Caracterização molecular e sensibilidade a antimicrobianos de Listeria monocytogenes isoladas de carcaças bovinas no sul do Brasil / Molecular characterization and antimicrobial susceptibility of Listeria monocytogenes isolated from cattle carcasses in southern Brazil

Iglesias, Mariana Almeida 06 March 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_mariana_almeida_iglesias.pdf: 683600 bytes, checksum: 7c2d99601551e443f9b19dd649609f3f (MD5) Previous issue date: 2014-03-06 / Listeria monocytogenes is a foodborne pathogen that can cause listeriosis, both in humans and in animals. The contamination by this microorganism is difficult to control, given its wide dissemination and physiological adaptability, which allow its development under conditions which are usually unfavorable to other pathogenic bacteria. Therefore, this pathogen has become of concern to the food industry as well as consumers, since it is highly pathogenic, especially in relation to risk group and may be fatal in 30% of cases of listeriosis. Although any isolate of L. monocytogenes can be considered potentially pathogenic for humans, several studies suggest that this micro-organism has a heterogeneous pathogenicity of the strains, which makes it essential to know the gene expression of the pathogen can be understood that the differences in their virulence mechanisms, and how different potential pathogenicity. The present study aimed to verify the occurrence of. L. monocytogenes in slaughterhouses in southern Rio Grande do Sul, and through the isolates, assess their sensitivity to antibiotics, and perform a genotypic characterization by verifying the presence of virulence genes. L. monocytogenes occured in 6% of the samples, detected after bleeding at the point where the collect was held in the leather of the animal, and point 4 (pre-cooling after washing).Twelve isolates were obtained, which were evaluated for sensibility to 15 antimicrobials, of which 100% were susceptible to most antibiotics tested. Resistance to gentamycin (8%), ampicilin (8%), kanamycin (8%) and sulfonamide (83%) were observed in some isolated of L. monocytogenes. Intermediate susceptibility to clindamycin (60%) and erythromycin (8%) was observed, and multidrug-resistant strains were also observed. Proceeded to evaluate the presence of virulence genes (hlyA, plcA, inlA, inlB, inlC, inlJ, plcB, iap, actA, mpl and PrfA) and, through the results of PCR, it was observed that all isolates possessed the evaluated genes, also confirmed the expression of the gene of internalin A by RT-PCR, showing the potential pathogenic strains of L. monocytogenes isolated from food in southern Brazil. / Listeria monocytogenes é um patógeno de origem alimentar capaz de causar listeriose, tanto em humanos como em animais. A contaminação por este micro-organismo é de difícil controle, tendo em vista sua ampla disseminação e capacidade fisiológica de adaptação, as quais permitem seu desenvolvimento sob condições que usualmente são desfavoráveis a outras bactérias patogênicas. Assim sendo, esse patógeno tornou-se motivo de preocupação para a indústria de alimentos bem como para os consumidores, uma vez que é altamente patogênica, principalmente em relação ao grupo de risco, podendo ser fatal em até 30% dos casos de listeriose. Embora qualquer isolado de L. monocytogenes possa ser considerado potencialmente patogênico para humanos, vários estudos sugerem que este micro-organismo apresenta patogenicidade heterogênea, o que torna essencial a caracterização molecular de cada isolado, bem como o conhecimento de sua expressão gênica, para que possam ser entendidas as diferenças nos seus mecanismos de patogenicidade.. Em vista do exposto, o presente estudo objetivou verificar a ocorrência de L. monocytogenes em carcaças bovinas abatidas em dois frigoríficos-matadouros do sul do Rio Grande do Sul e, a partir dos isolados, avaliar sua sensibilidade a antimicrobianos, e realizar a caracterização genotípica, através da verificação da presença de genes de virulência e da expressão da internalina A. A ocorrência de L. monocytogenes nas carcaças foi de 6%, a qual foi detectada no Ponto 1 (após a sangria) e no Ponto 4 (após a lavagem pré-resfriamento). Foram obtidos 12 isolados, os quais foram avaliados quanto a sensibilidade a 15 antimicrobianos, dos quais 100% mostraram-se sensíveis a maioria dos antibióticos testados. Resistência à gentamicina (8%), ampicilina (8%), canamicina (8%) e a sulfonamida (83%) foram observadas em parte dos isolados. Suscetibilidade intermediária foi observada para clindamicina (60%) e eritromicina (8%). Quanto aos isolados multirresistentes, dois deles apresentaram resistência a mais de um agente antimicrobiano. Procedeu-se à avaliação da presença de genes de virulência (prfA, plcA, plcB, hlya, iap, actA, mpl, inlA, inlC e inlJ) e, através dos resultados da PCR, foi possível observar que todos os isolados possuíam os genes avaliados, sendo também confirmada a expressão do gene da internalina A através da técnica de RT-PCR, evidenciando o potencial patogênico das cepas de L. monocytogenes isoladas de alimentos no sul do Brasil.
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UTILIZAÇÃO DO QUORUM SENSING NA EXPRESSÃO DE ANTÍGENOS VACINAIS EM Escherichia coli Enterotoxigênica / THE USE OF QUORUM SENSING FOR EXPRESSION OF VACCINAL ANTIGENS OF Escherichia coli ENTEROTOXIGENIC

Sturbelle, Régis Tuchtenhagen 29 October 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_regis_sturbelle.pdf: 477794 bytes, checksum: d7692995394f46dd2524f4a667bb1ce6 (MD5) Previous issue date: 2009-10-29 / One of the most important sanitary problems that cause economic losses in swine industry is the diarrhea caused by Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC). It is the main infectious cause of mortality for animals in suckling and post-weaning periods. Their primary factors of pathogenicity are the fimbriae, which bond the bacteria to specific receptors of the enterocytes. This causes a succession of events, brought about by the enterotoxins, the stable toxins (ST) and heat-labile toxins (LT), leading to diarrhea. Another important structure is the flagellum, which has an important role in cell stimulation to produce pro-inflammatory cytokines through the interaction with Toll-like receptors (TLR5), signaling cell recruitment and activation, thus increasing local inflammation as well as antigen presentation to lymphocytes. Quorum Sensing is a signaling system among bacteria that uses substances denominated autoinducers (AI). When the auto-inducers reach a certain concentration, due to an increase of cell density, there is an activation of transcriptional factors, which regulate the gene expression. The catecholamines (adrenaline and noradrenalin), produced by nervous cells, use the auto-inducer type 3 (AI-3) pathway. These have a significant role in gene expression as they stimulate the growth and the expression of virulence factors of the Escherichia coli. The goal of the present study was to produce experimental vaccines containing total cultures of ETEC cultivated in different induction conditions, mediated by the conditioned media (mc) so as to study the expression of vaccine antigens. Different concentrations of mc were used, with the 50% of conditioned media added with 500 μM of adrenaline having the major initial growth and antigen expression. In the motility assay, a sixteen-fold increase was observed in comparison to the control. By the ELISA, hemoagglutination, hemoagglutination inhibition and Dot Blot techniques, a higher expression of fimbriae (F4) was observed, whereas by Dot Blot, ELISA and RT-PCR techniques an increase of LT expression was observed. Based on this data a bacterin was prepared using 50% of mc and 500 μM of adrenaline, with Al(OH)3 as an adjuvant. Five weeks old Swiss female mice were vaccinated twice with 250 μL subcutaneously on days 0 and 8 14. The vaccine immune response was evaluated by ELISA and hemoagglutination inhibition. The mc bacterin vaccinated group respond with a seroconversion significantly higher that the control group. These results suggest that the presence of mc with adrenaline is capable of activating the expression of important vaccine antigens, therefore making bacterin more efficient. / Um dos maiores problemas sanitários que causam prejuízo à suinocultura é a diarréia causada por Escherichia coli Enterotoxigênica (ETEC). Esta é a causa infecciosa mais comum de mortalidade em animais em aleitamento e no período pós-desmame. Os fatores primários de patogenicidade desta bactéria são as fímbrias, que as ancoram a receptores específicos dos enterócitos permitindo que as enterotoxinas, toxinas termo estáveis (ST) e toxinas termo lábeis (LT) desencadeiem uma sucessão de eventos levando à diarréia. Outra estrutura é o flagelo que possui um papel na estimulação de células na produção de citocinas pró-inflamatórias através da interação com receptores Toll-like 5 (TLR5), sinalizando o recrutamento e ativação de células, desta forma ampliando a inflamação local bem como a apresentação de antígeno aos linfócitos. Quorum Sensing é um sistema de sinalização entre as bactérias, os quais produzem substâncias denominadas de auto-indutores (AI). Quando os auto-indutores alcançam uma determinada concentração, decorrente do aumento da densidade celular ocorre uma ativação de fatores transcricionais que acabam regulando a expressão gênica. As catecolaminas (adrenalina e noradrenalina), produzidas pelas células nervosas, utilizam a via de sinalização do auto-indutor tipo 3 (AI-3) que têm um papel significante na expressão gênica, estimulando o crescimento e a expressão de fatores de virulência de Escherichia coli. O objetivo deste estudo foi utilizar o sistema de sinalização Quorum Sensing para induzir a expressão in vitro de antígenos vacinais de Escherichia coli Enterotoxigênica cultivadas em diferentes condições de indução mediada pelos meios condicionados (mc). Diferentes concentrações de mc foram utilizadas, sendo que o maior crescimento inicial e a maior expressão de antígenos de interesse foram obtidos com 50% de meio condicionado adicionado de 500 μM de adrenalina. No ensaio de motilidade foi observado um aumento de 16 vezes em relação ao controle. Pelas técnicas de ELISA, hemaglutinação, inibição da hemaglutinaçõa e Dot blot foi observado uma maior expressão de fimbria (F4) e pelas técnicas de Dot blot, ELISA e RT-PCR foi observado aumento da expressão de LT. Baseado nesses dados 6 testou-se uma bacterina utilizando 50% de mc e 500 μM de adrenalina com Al(OH)3 como adjuvante. Foram utilizados camundongos Swiss fêmeas com 5 semanas de idade que foram vacinados por via subcutânea com 250 μL nos dias 0 e 14. A avaliação da resposta imune foi realizada através de soroconversão frente aos antígenos estudados por meio de ELISA e inibição da hemaglutinação. O grupo vacinado com a bacterina com mc obteve uma soroconversão significativamente superior ao grupo controle. Estes resultados sugerem que a presença de mc com adrenalina são capazes de ativar a expressão de importantes antígenos vacinais, tornando desta forma a bacterina mais eficiente.
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Produção de Polihidroxibutirato: Bioprospecção de Beijerinckia sp., da coleção de bactérias do Laboratório de Biopolímeros do CDTec - UFPel / Production of Polyhydroxybutyrate: Bioprospecting for Beijerinckia sp. Collection of bacteria from the Laboratory of Biopolymers CDTec - UFPel

Oliveira, Claudio Fernando de 22 July 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_claudio_fernando_oliveira.pdf: 4911756 bytes, checksum: 14504fcb4c0f3469413049df6651ec64 (MD5) Previous issue date: 2010-07-22 / Factors like the frequent worry with the environmental impact cause by the discard of petrochemical plastic waste in the environment due to its low degradability and the constant increase of petrol price took to a world search for innovations with the production of bioplastics. They are the polymers produced by microorganisms from the renewable raw material with properties similar plastic derived from petrol, such as polypropylene and polyethylene. The more promising bioplastics are the polyhydorxyalkanoates, which comprehend a great polyester family accumulated in the form of intracellular granules by microorganisms like bacteria. The most common type is the poli(3 hydroxybutyrate) P(3HB); this polymer brings great interest for being biocompatible, biodegradable and thermoplastic. The objective of this study was to realize a bioprospecting between Beijerinckia sp. strains from the collection of microorganism culture from CDTec UFPel for the selection of possible producer strains of P (3HB). Initially, 7 strains were cultivated in solid mean, YM and YDC, and colored cell with Sudan Black for Optic Microscopy visualization, when 3 strain were selected for further analysis through Transmission Electronic Transmission; the data revealed a strong evidence of granules P(3HB) production by strain C31 in the cellular multiplication phase. The biopolymer production was evaluated in 3 means, the best result was obtained with F4 mean, being a concentration of 0,93 gl of polymer and content of 34%. The polymer was identified, and measured, by Gas Chromatography as P(3HB). The polymer identity was confirmed for Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). The spectra revealed characteristic bands of P(3HB), confirming the production of this polymer by C31 strain, which was considered with great power for the industrial production / Fatores como a crescente preocupação com o impacto ambiental causado pelo descarte dos resíduos plásticos petroquímicos no meio ambiente devido sua baixa degradabilidade e o constante aumento do preço do petróleo levaram a uma busca mundial por inovações como a produção dos bioplásticos. Os bioplásticos são polímeros produzidos por microrganismos a partir de matérias-primas renováveis com propriedades semelhantes aos plásticos derivados do petróleo, como polipropileno e polietileno. Os bioplásticos mais promissores são os polihidroxialcanoatos, que compreendem uma grande família de poliésteres acumulados na forma de grânulos intracelulares por microrganismos como as bactérias. O tipo mais comum é o poli(3-hidroxibutirato) (P(3HB); este polímero desperta grande interesse por ser biocompatível, biodegradável e termoplástico. O objetivo deste trabalho foi realizar uma bioprospecção entre cepas de Beijerinckia sp. da coleção de cultura de microrganismos do CDTec UFPel para seleção de cepas possivelmente produtoras de P(3HB). Inicialmente, foram cultivadas 7 cepas em meio sólido, YM e YDC, e as células coradas com Negro de Sudão B para visualização por Microscopia Óptica, sendo selecionadas 3 cepas para posterior análise por Microscopia Eletrônica de Transmissão; os dados revelaram um forte indício da produção de grânulos de P(3HB) pela cepa C31 já na fase de multiplicação celular. Foi avaliada a produção de biopolímero em 3 meios; o melhor resultado foi obtido com o meio F4, sendo uma concentração de 0,93gL-1 de polímero e conteúdo de 34 %. O polímero foi identificado, e dosado, por Cromatografia Gasosa como P(3HB). A identidade do polímero foi confirmada por espectroscopia na região do infravermelho com transformada de Fourier (FT-IR). Os espectros revelaram bandas características de P(3HB), confirmando a produção deste polímero pela cepa C31, que foi considerada com potencialidade para produção industrial.
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Avaliação da genotoxicidade e caracterização de xantana produzida por xanthomonas arboricola pv pruni / Assessment of genotoxicity and characterization of xanthan gum produced by xanthomonas arboricola pv pruni.

Rodrigues, Amanda Ávila 03 December 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_amanda_avila_rodrigues.pdf: 890698 bytes, checksum: 1d955a8f7fba6dc5e374721390bc09da (MD5) Previous issue date: 2010-12-03 / Xanthan gum is one the most important commercial hydrocolloids. / A goma xantana é um dos mais importantes hidrocolóides comerciais.

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