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Análise proteômica de variedades convencionais e geneticamente modificadas de soja (Glycine max) visando proteínas bioativas / Proteomics analysis of conventional and genetically modified varieties of soybean (Glycine max) aiming bioactive proteinsSinara Backes 06 December 2011 (has links)
A soja tolerante ao herbicida glifosato é o vegetal geneticamente modificado mais cultivado. Entretanto, questões sobre a biossegurança dos alimentos GM são ainda levantadas, como as incertezas sobre a expressão das novas proteínas, mutações indesejadas, alterações de perfis nutricionais e aparecimento de compostos tóxicos. Apesar dos comprovados efeitos benéficos à saúde, a soja apresenta naturalmente, entre suas proteínas, fatores antinutricionais, que podem: provocar efeitos fisiológicos adversos; diminuir a biodisponibilidade de nutrientes; e induzir reações de hipersensibilidade. Paralelamente, a soja possui sabor e aroma desagradáveis por ação de enzimas lipoxigenases. Os fatores antinutricionais estão relacionados às aglutininas (lectinas) e aos inibidores de proteases (inibidor de tripsina, tipo Kunitz, e inibidor de tripsina e quimotripsina, tipo Bowman-Brik), enquanto as globulinas da soja respondem pelas reações de hipersensibilidade. Objetivou-se neste trabalho fazer a comparação dos mapas protéicos de soja GM, suas isolinhas convencionais e sojas orgânicas visando a detecção de alterações nos perfis protéicos destes diferentes tipos de cultivo, e também a análise da expressão dos fatores antinutricionais, como os inibidores de proteases e aglutininas, considerando a extensão das variações naturais existentes nas amostras. Para tanto, foram comparadas seis amostras de sementes de variedades comerciais de soja cultivadas em paralelo, sob as mesmas condições ambientais e de solo, compostas por três isolinhas genitoras e suas três correspondentes GMs e duas amostras orgânicas, sendo que uma delas é comercial e a outra ainda esta em campos de pesquisa, fornecidas pela Embrapa Soja. Foram analisados extratos protéicos de todas as amostras, após extração com ácido tricloroacético (TCA) e acetona, através de eletroforese unidimensional (1D) e bidimensional (2D). Nestas foi empregado gradiente de pH de 3-10 e as imagens avaliadas pelo software ImageMaster 2D Platinum. Diversos spots selecionados foram identificados por espectrometria de massas. Nas imagens dos géis 2D, foi possível identificar e quantificar os spots correspondentes às proteínas isoladas e não houve diferença estatística ao nível de significância de 5% entre os diferentes tipos de cultivo. Na verificação da sobreposição dos géis, obtivemos porcentagens de matchings superiores a 70% entre as amostras GMs e não GMs. As amostras orgânicas apresentaram % matchings menores que entre convencionais e GMs. Nos resultados da espectrometria de massas foi possível reconhecer os principais grupos protéicos da soja, como as frações e subunidades de β-conglicinina e de glicinina, bem como os inibidores de proteases, aglutininas e lipoxigenases e não foi possível perceber alterações na expressão dos peptídeos identificados e analisados. Podemos concluir que as variações encontradas entre as três amostras convencionais e entre as amostras dos grupos convencionais e orgânicas foram maiores que a comparação das amostras GMs com suas genitoras correspondentes. / The glyphosate tolerant soybean is the most cultivated GM plant. However, questions about the bio-safety of GM foods are still rising, as there are uncertainty about the expression of new proteins, undesired mutations, changes in nutritional profile and the production of toxic compounds. Despite of the beneficial effects to human health, the soybean has anti-nutritional factors that can cause adverse physiological effects, reduce the bioavailability of nutrients, and induce hypersensitivity reactions. At the same time the soybean develop undesirable flavor due to the action of lipoxygenases. The anti-nutritional factors are related to agglutinins (lectins) and to the proteases inhibitors (Kunitz\'s Trypsin Inhibitor and Bowman-Birk\'s Inhibitor of Trypsin and Chymotrypsin) while the soybean globulins are responsible for hypersensitivity reactions. The objective of this work was to compare proteic maps of GM soybean, conventional isolines and organic soybean aiming to detect changes in protein profiles of the different types of cultivation and also analyze the expression of the anti-nutritional factors, such as protease inhibitors and agglutinins, taking into consideration the natural variation existing in the samples. For this, it was performed the comparisons between six seed samples of commercial varieties of soybeans, grown in parallel under the same environmental conditions and soil, composed of three parental isolines and their three corresponding GM and two organic sample, one of them is commercial and the other is still in search fields. The samples were provided by Embrapa Soja. Protein extracts were analyzed from the samples after extraction with trichloroacetic acid (TCA) and acetone using regular monodimensional electrophoresis (1D) and two-dimensional (2D) ones. For 2D were used strips of pH gradient 3-10 and the final images analyzed by ImageMaster 2D Platinum software. Several selected spots were identified by mass spectrometry. In the images of the 2D gels, we could identify and quantify the spots corresponding to proteins isolated and there was no statistical difference at 5% of significance between the different types of cultivation. Checking the overlap of the gels, we obtained matchings above 70% between GM and non GM sample. The organic sample had lower matching index between conventional and GM. It was possible to recognize the major groups of soy protein as a result of mass spectrometry such as¨β-conglycinin fractions and glycinin as well as protease inhibitors, lipoxygenase, and agglutinins. We concluded that the variations found among the tree conventional samples and between samples of conventional and organic groups were higher than the comparison of sample GMs with their corresponding parentals.
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Contribuição ao estudo da aderência entre barras de aço e concretos auto-adensáveis / Contribution to the study of the bond between steel bars and self-compacting concreteFernando Menezes de Almeida Filho 18 August 2006 (has links)
A busca por novos materiais estruturais visa a melhoria da qualidade e desempenho das estruturas, impulsionando o desenvolvimento científico e tecnológico. O concreto auto-adensável surgiu da necessidade de se dispensar o difícil e oneroso trabalho de vibração do concreto, sendo definido como um material capaz de fluir dentro de uma fôrma, passando pelas armaduras e preenchendo a mesma, sem o uso de equipamentos de vibração. Esta pesquisa caracteriza-se como um estudo teórico-experimental da aderência aço-concreto, utilizando concreto do tipo auto-adensável, mediante ensaios monotônicos de flexão em vigas e de arrancamento seguindo o modelo padrão do Rilem-Ceb-Fip (1973). O estudo considerou como parâmetros fundamentais o tipo de concreto (auto-adensável e convencional), a resistência à compressão do concreto e os diâmetros das barras. Ainda, realizou-se um estudo com relação à variabilidade do concreto auto-adensável nos estados fresco e endurecido, constatando que este possui pequena variação. De posse dos resultados, buscou-se verificar a previsão das formulações empregadas na literatura e pelos principais códigos internacionais. De acordo com os resultados, o comportamento dos modelos de viga e de arrancamento para ambos os concretos foi similar, mostrando que o concreto auto-adensável possui características semelhantes ao concreto convencional, com as vantagens da trabalhabilidade no estado fresco. Quanto à análise numérica, os modelos desenvolvidos representaram de forma satisfatória o comportamento dos ensaios, e forneceram uma idéia do comportamento da tensão de aderência na sua interface. Com relação às formulações teóricas, verificou-se que tanto para o concreto convencional quanto para o auto-adensável, ocorre uma superestimativa da resistência de aderência. / The search for new structural materials aims the improvement of the structures performance, pushing the scientific and technological development. Self-compacting concrete (SCC) origin was due to the need to avoid the difficult and expensive process of concrete vibration. It has been defined as a material capable to flow inside a formwork, passing through the reinforcement and filling it completely, without using of any special equipment. This research is characterized as a theoretical and experimental study of steel-concrete bond, using SCC, through pull-out tests and beam tests standardized by Rilem-Ceb-Fip model. The study considered as main parameters the concrete type (ordinary concrete and SCC), its compressive strength and the steel bars diameters. Yet, a study of the variability of the properties of SCC, both in fresh and hardened state was also performed, showing that SCC is a very reliable material. The obtained results were compared with the ones established by the related bibliography and by the main international codes. According to the results, the behavior of the beams and pull-out tests were very similar for both concretes (SCC and OC), with the well know advantages for the SCC in fresh state. About the numerical approach, the developed models represented satisfactory the test behavior (beam and pull-out) and gave an idea of the bond stress behavior on the steel-concrete interface. About the theoretical formulations, it was verified the they usually overestimate the bond strength, for both types of concrete.
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Rizogênese incompleta: análise comparativa de dois tipos de irrigação de canais radiculares, em dentes de cães com lesão periapical induzida / Immature teeth: comparative analysis of two types of root canals irrigation, in dogs\'s teeth with induced apical periodontitisCarolina Maschietto Pucinelli 22 June 2015 (has links)
A lesão periapical é uma doença causada por micro-organismos presentes no sistema de canais radiculares, assim como por seus produtos e subprodutos e pelas reações desencadeadas no organismo. A base para a obtenção do sucesso pós-tratamento endodôntico é o controle da infecção. Com essa finalidade, novos sistemas de irrigação dos canais radiculares têm sido desenvolvidos, no qual a irrigação por Pressão Apical Negativa (EndoVac®) tem se destacado. O objetivo desse estudo in vivo foi efetuar uma avaliação histopatológica, histoenzimológica e histomicrobiológica, comparando o sistema EndoVac® com a irrigação convencional, em dentes de cães com rizogênese incompleta e lesão periapical crônica induzida experimentalmente. Um total de 52 canais radiculares de pré-molares com rizogênese incompleta foram aleatoriamente divididos em 4 grupos: Grupo I - Irrigação com EndoVac® (n=15); Grupo II - Irrigação Convencional (n=17); Grupo III - Dente hígido (controle negativo) (n=10) e Grupo IV - Dente com lesão e sem tratamento (controle positivo) (n=10). Após indução de lesões periapicais nos dentes dos Grupos I, II e IV, os dentes dos grupos I e II foram instrumentados com limas manuais, empregando o EndoVac® e a irrigação convencional, respectivamente. Decorridos 90 dias, os animais foram eutanasiados e os espécimes submetidos ao processamento histotécnico para a análise histopatológica morfológica e morfométrica em cortes corados com HE, sob microscopia convencional e de fluorescência. Foi realizada também a histoenzimologia para a Fosfatase Ácida Resistente ao Tartarato (TRAP), para a marcação de osteoclastos, e a coloração de Brown e Brenn, para avaliar a presença de bactérias, sua localização e concentração/intensidade. Os resultados obtidos foram submetidos à análise estatística por meio dos testes de qui-quadrado, Fisher, Anova e pós-teste de Tukey. O nível de significância adotado foi de 5%. Os resultados obtidos na avaliação dos parâmetros histopatológicos evidenciaram diferença significante entre os Grupos I e II (p<0,05), observando-se no Grupo I predomínio de infiltrado inflamatório de menor magnitude, menor espessura do ligamento periodontal e menor reabsorção dos tecidos mineralizados. Embora não tenha sido verificada diferença significante entre esses grupos com relação à extensão das lesões periapicais em microscopia de fluorescência, e com relação à presença, localização e intensidade da contaminação bacteriana, foi observado menor número de osteoclastos no Grupo I (p<0,05). Os resultados do presente estudo in vivo permitiram concluir que a irrigação por pressão apical negativa (EndoVac®) apresentou melhores resultados biológicos, quando comparada à irrigação convencional, favorecendo a ocorrência do processo de reparo, em dentes com rizogênese incompleta e lesão periapical. / The apical periodontitis is a disease caused by microorganisms from the root canal system, as well as their products, by-products and the reactions triggered in the host. The postendodontic treatment success is based in the control of the infection. For this purpose, new irrigation systems of root canals have been developed, in which apical Negative Pressure (EndoVac®) have been highlighted. The objective of this in vivo study was to perform a histopathological, histoenzymology and histomicrobiologic evaluation, comparing the EndoVac® system with the conventional irrigation, in immature teeth of dogs with apical periodontitis experimentally induced. A total of 52 root canals of immature pre-molars were randomly assigned into 4 groups: Group I - EndoVac® Irrigation (n= 15); Group II - Conventional Irrigation (n= 17); Group III - Sound Tooth (negative control) (n= 10) and Group IV - Tooth with apical periodontitis without treatment (positive control) (n= 10). After induction of apical periodontitis in teeth of the Groups I, II and IV, in the groups I and II, the teeth were instrumented with manuals files, using EndoVac® and conventional irrigation, respectively. After 90 days, the animals were euthanized and the specimens subjected to histotechnic for histopathological, morphologic and morphometric analysis in HE-stained sections, under conventional and fluorescence microscopy. The histoenzymology for the phosphatase-Resistant Acid tartrate (TRAP), for the identification of osteoclasts, and the Brown and Brenn staining method to assess the presence of bacteria, their location and concentration/intensity were also performed. The results obtained were subjected to statistical analysis using the chi-square test, Fisher exact test, ANOVA and Tukey post-test. The level of significance was set at 5%. The results obtained in the evaluation of histopathological parameters demonstrated a significant difference between groups I and II (p< 0.05). In the Group I, the predominance was inflammatory infiltrate of low magnitude, small thickness of the periodontal ligament and less resorption of mineralized tissues. Although the periapical lesions extension in fluorescence microscopy, and the presence, location, and intensity of bacterial contamination was not significant different between these groups, a lower number of osteoclasts in Group I (p< 0.05) was observed. The results of this in vivo study allowed us to conclude that the irrigation with EndoVac® presents best biological results in relation to conventional irrigation, favored the occurrence of the repair process, in immature teeth with apical periodontitis.
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Quantificação de carbono e emissões de gases do efeito estufa sob diferentes tratamentos do solo no cerrado brasileiro.Barreto, Renata da Costa 13 March 2018 (has links)
Submitted by Biblioteca de Pós-Graduação em Geoquímica BGQ (bgq@ndc.uff.br) on 2018-03-13T18:38:52Z
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Tese_Renata_Barreto.pdf: 1872522 bytes, checksum: 0cfc34585aa71696e1eae1cec2ece8cf (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Universidade Federal Fluminense. Instituto de Química. Programa de Pós-Graduação em Geoquímica, Niterói, RJ / Atualmente, há uma preocupação mundial com o aumento dos gases do efeito-estufa
(GEE’s) na atmosfera, devido ao seu papel nas rápidas mudanças no balanço de energia terrestre.
Práticas de mudança do uso do solo estão cada vez mais frequentes, o que pode tornar possível o
aumento ou diminuição de emissões dos GEE’s para a atmosfera. Estudos da qualidade de
carbono (C) em solos e a distribuição deste em compartimentos mostram aspectos relacionados à
sua acumulação no solo. Já as medidas de respiração do solo, emissões de gás carbônico (CO2),
indicam a taxa de oxidação do C. Estima-se que 70% da região do Cerrado é agricultável, sendo 9
milhões de hectares cultivados sob sistemas de plantio direto. O objetivo geral deste trabalho foi
avaliar e comparar os efeitos das operações e atividades do cultivo agrícola, tais como a
semeadura e colheita, no estoque de C no solo e nas emissões líquidas de GEE’s, em dois tipos de
tratamento do solo (Plantio Direto, PD, e Plantio Convencional, PC) em um experimento situado
em Rio Verde, sudoeste de Goiás, região do Cerrado brasileiro. O solo da mata nativa também foi
avaliado como referência às áreas agrícolas. Foram avaliados os parâmetros físicos, químicos do
solo, a distribuição dos agregados do solo, a biomassa microbiana, o estoque de C e nitrogênio
(N) e as emissões de CO2 e óxido nitroso (N2O) através de medições dos fluxos (in situ) e em
incubações em laboratório de amostras de solo total e de agregados do solo. Os resultados de
Diâmetro Médio Ponderado (DMP) mostraram uma melhor agregação dos solos agrícolas,
indicando que a presença do cultivo promoveu a incorporação da Matéria Orgânica do Solo
(MOS). Os estoques de C total, as emissões de CO2 efetivamente iguais em solos sob PC e PD, a
pouca diferença nos seus estados de agregação e a ausência de aumento de C estabilizado em
agregados do solo sob PD, indicam que este solo não responde bem ao PD. A emissão de N2O e o
estoque de N nos solos e em seus agregados também foram avaliada / Currently, there is a global concern with the increase of greenhouse gases (GHGs) in the
atmosphere due to its role in the rapid changes in energy balance. Practice change of land use are
becoming more frequent, which may make it possible to increase or decrease in emissions of
GHGs to the atmosphere. Studies on the quality of carbon (C) in soils and distribution of
aggregates show features related to its accumulation in the soil. Since the measures soil
respiration, carbon dioxide emissions (CO2), indicate the rate of oxidation of C. It is estimated
that 70% of the Cerrado region is susceptible to agriculture, being 9 million hectares under notillage.
The objective of this study was to evaluate and compare the effects of the operations and
activities of farming, such as sowing and harvest on carbon storage in soil and net emissions of
GHGs in two types of soil treatment (No-tillage, PD, and conventional tillage-PC) in an
experiment located in Rio Verde, Goias, Brazilian Cerrado. The soil of the native forest was also
evaluated by reference to agricultural areas. We evaluated the physical, chemical properties and
the distribution of aggregates on soil, microbial biomass, carbon and nitrogen (N) storage, the
emissions of CO2 and nitrous oxide (N2O) through-flow measurements (in situ) and laboratory
incubations of bulk soil samples and soil aggregates. The results of mean weight diameter
(MWD) showed a better aggregation of agricultural soils, indicating that the presence of the crop
may have improved the quality of the soil, promoted the incorporation of soil organic matter
(SOM). C stocks total CO2 emissions effectively equal in soils under CT and NT, the little
difference in their states of aggregation and the absence of increased C stabilized the soil
aggregates in NT indicate that this soil does not respond well to the NT in terms of accumulation
and preservation of C. The N2O emissions and N stocks were also evaluated. In addition to lower
emissions of N2O in soils under NT and CT, the soil under native forest in Rio Verde also had
low emissions, even immediately after rain events, suggesting that the soil in the region have
little tendency to emit N2O. The largest stock of N was observed in aggregates of soil under CT,
but these values were not reflected in the analysis of the stock of total nitrogen.
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Avaliação de sistemas de captação de imagem com fonte de raios X em peças de ferro fundidoRuy de Macedo Minari 17 December 2009 (has links)
Atualmente, no Brasil e exterior, as avaliações de peças industriais nos sistemas radiográficos são feitas durante ou após a fabricação de maneira a verificar a integridade interna das mesmas. Esses ensaios são de suma importância para atender os requisitos de normas, de projetos e de utilização, garantindo a qualidade e confiabilidade, reduzindo os riscos de quebra de equipamentos e para vidas humanas. Os ensaios radiográficos e fluoroscópicos industriais são métodos de ensaios não destrutivos que se baseiam na absorção diferenciada da
radiação penetrante pela peça que está sendo ensaiada. Essa variação na quantidade de radiação absorvida é detectada através de um meio que irá nos indicar, entre outras coisas, a
existência de uma descontinuidade interna. Este trabalho tem por objetivo fornecer uma base de dados concreta, baseada em experimentos práticos e reais, que gere conhecimento de suporte ao responsável pela instalação radioativa neste momento decisório através da comparação das diversas técnicas no ensaio de peças de ferro fundido nodular. Os ensaios de campo foram executados com equipamentos de raios X de energia máxima de 320 kV com potencial constante, em 15 peças de ferro fundido nodular, utilizando 05 técnicas de captação de imagem, que são: radiografia convencional, radiografia computadorizada, radiografia digital, fluoroscopia analógica e fluoroscopia digital. As radiografias resultantes dos diversos tipos de captação de imagem foram laudadas por inspetores qualificados pela norma de qualificação de pessoal na área aeronáutica (NAS 410, 2008), e os resultados dos ensaios, para verificar a melhor aderência de cada sistema de imagem com a Norma Nuclear CNEN-NE-3.01, onde qualquer atividade envolvendo radiação deve ser justificada em relação a outras alternativas e produzir um benefício líquido positivo. O nível da aceitabilidade das descontinuidades para que o inspetor possa laudar as radiografias é um acordo entre cliente e fornecedor e, neste caso, foi determinado o nível de qualidade de imagem de 2:4T um nível adequado de qualidade, 2:2T um nível bom e 2:1T um nível ótimo de qualidade de imagem. / Now a days, in Brazil and exterior, the evaluations of industrial parts through X-rays systems are made during or after producing verifying the internal integrity of them. Those testing are sum important for the norms requirements, of projects and utilization, guaranteeing the quality and reliability, reducing the equipment break risks and for human lives. The radiográficos and fluoroscópicos industrial testing are methods of non destructive testing that is based on the differentiated absorption of penetrating radiation by the part that is being
tested. That variation in the radiation quantity absorbed is detected through an indicate environment, between other things, the existence of an internal descontinuidade. This paper
has for objective supply a base of concrete facts, based in real and practical experiments, that manages knowledge of support to the responsible for the radioactive installation in this decisive moment through the comparison of diverse techniques tested in nodular cast iron parts. The field practice were performed with equipment of X-rays 320 kV maximum energy with constant potential, in 15 pieces nodular cast iron, utilizing 05 image collection techniques, that are: conventional x-ray, x-ray computerized, digital x-ray, fluoroscopia analog and fluoroscopia digital. The resultant x-rays of the diverse image collection kinds were attested by inspectors qualified by t personals qualification norm in the aeronautic area (IN THE 410, 2008), and the results of the testing, verify the better adhesion of each system of image to the Nuclear Norm CNEN-NE-3.01, where any activity involving radiation should be justified regarding other alternatives and produce a positive liquid benefit. The level of the acceptability of the descontinuidades for that the inspector be able to laudar the x-rays is an
agreement between client and supplying and, in that case, was determined the image quality level of 2:4T, an adequate level of quality is 2:2T and great level of quality of 2:1T.
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Estudo epidemiológico da coinfecção por toxoplasma gondii e pelo vírus da imunodeficiência felina em gatos domésticos (felis catus) em Goiânia, Goiás / Epidemiological study of the coinfection by toxoplasma gondii and by the feline immunodeficiency virus in domestic cats (felis catus) in Goiânia, GoiásCosta, Rebeka Cristine de Bastos 25 August 2015 (has links)
Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-01-14T16:38:41Z
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Previous issue date: 2015-08-25 / Toxoplasmosis is a zoonotic disease in which mammals and birds can join the cycle as intermediate hosts, and felids as definitive hosts. Felis catus is recognized as the main responsible for the environmental contamination by Toxoplasma gondii oocysts. Serological diagnosis reveals little about the elimination of oocysts of T. gondii into the environment, principally by F. catus, which plays an important role in Public Health. There are few data on the frequency of feline toxoplasmosis in the State of Goiás. Therefore, the aim of this research was to evaluate the frequency of toxoplasmosis infection in domestic cats and their potential role in its transmission through the oocyst elimination into the environment and the respective factors associated with the infection. For this, we collected 102 blood samples and 98 fecal samples from 102 cats from Goiânia, State of Goiás. The animals were divided into groups according to age, gender and free access to the street or not. Indirect hemagglutination test was performed to determine the level of anti-T. gondii and indirect ELISA for the detection of infection by feline immunodeficiency virus (FIV). For search and detection of T. gondii oocysts elimination in the feces of cats we performed a centrifugal-flotation with Sheather's solution, subsequently we extracted DNA and used conventional PCR. The results showed that 18.63% (19/102) of the cats were positive for T. gondii, with titers ranging from 1:32 to 1: 8.192, while none of the fecal samples were positive in the PCR. The frequency of positive animals for FIV was 55.91% (52/93), and 18.28% (17/93) presented coinfection. By multivariate logistic regression we found the associated factors were the same for both infections, but one did not interfere with another. The factors associated with infection by T. gondii and feline immunodeficiency virus were free life and age under six months, since the sex was not statistically related to any of the illnesses. / A toxoplasmose é uma zoonose na qual, mamíferos e aves podem participar do seu ciclo como hospedeiros intermediários e os felídeos como hospedeiros definitivos. O Felis catus é reconhecido como o principal responsável pela contaminação ambiental por oocistos de Toxoplasma gondii. O diagnóstico sorológico pouco revela sobre a eliminação de tal fase no ambiente, o que representa o real impacto daquela espécie na Saúde Pública frente à toxoplasmose. São escassos os dados da frequência da toxoplasmose felina no Estado de Goiás. Assim sendo, objetivou-se com esta pesquisa avaliar a frequência da infecção da toxoplasmose em gatos domésticos e o seu potencial papel na sua transmissão, através da eliminação de oocistos no ambiente e dos respectivos fatores associados à infecção. Para isto, foram coletadas 102 amostras de sangue e 98 amostras fecais, de 102 gatos provenientes de Goiânia-Goiás. Os animais foram divididos em grupos de acordo com a faixa etária, gênero e livre acesso à rua ou não. Foi realizada a hemaglutinção indireta para a determinação do nível de anticorpos anti-T. gondii e o ELISA indireto para a detecção da infecção pelo vírus da imunodeficiência felina (FIV). Para a pesquisa e detecção da eliminação de oocistos de T. gondii nas fezes dos gatos foi feita a centrifugo-flutuação em solução de Sheather, posterior extração de DNA e realização da PCR convencional. Os resultados revelaram que 18,63% (19/102) dos gatos foram positivos para o T. gondii, com títulos variando entre 1:32 a 1:8.192, sendo que nenhuma das amostras fecais foi positiva na PCR. A frequência de positivos para o FIV foi de 55,91% (52/93), com coinfecção de 18,28% (17/93). Com a regressão logística multivariada verificou-se que os fatores associados foram os mesmos para as duas infecções, porém uma não interferiu diretamente na outra. Os fatores associados para a infecção pelo T. gondii e pelo vírus da imunodeficiência felina foram a vida livre e a idade igual ou superior a seis meses, já o gênero não apresentou relação estatística com nenhuma das enfermidades.
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Segmentação, classificação e quantificação de bacilos de tuberculose em imagens de baciloscopia de campo claro através do emprego de uma nova técnica de classificação de pixels utilizando máquinas de vetores de suporteXavier, Clahildek Matos 02 July 2012 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-15T14:04:04Z
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Previous issue date: 2012-07-02 / Não Informada / Tuberculosis (TB) is a contagious disease caused by Mycobacterium tuberculosis that primarily affects the lungs and reaches over 8.8 million people worldwide. Although the number of cases of TB disease and deaths has fallen over the past years, this disease still remains a serious health problem in developing countries. Currently, as initial tests for the diagnosis of TB are used methods of smear bright field and fluorescence. The first is used mostly in developing countries, due to low cost, the second is the preferred method in developed countries to be more sensitive. Among the many challenges for the control of this disease is the development of a rapid, efficient and low cost for the diagnosis of tuberculosis. The process of diagnosis of smear-field course is time consuming, manual and error-prone, so that there is a high rate of false negatives. Various techniques for pattern recognition in the image smear bright field microscopy have been designed to recognize and count of the rods. This paper describes a new method for segmentation of
tubercle bacilli in sputum bright field. The method proposed in this dissertation uses a classifier consisting of a support vector machine. The differential method is proposed in the variables selected for the input of the classifier. They were selected from four color spaces: RGB, HSI, YCbCr and Lab used to both individual characteristics such as subtractions of characteristics of the same color space and different color spaces. We investigated a total of 30 features. The best features were selected using the selection technique scalar features. With the proposed method was reached a sensitivity of 94%. However, further steps for noise reduction are required to minimize the classification errors. / A tuberculose (TB) é uma doença contagiosa causada pelo Mycobacterium tuberculosis que afeta, principalmente, os pulmões e atinge mais de 8,8 milhões de pessoas em todo o mundo. Embora o número de casos de doenças e mortes por TB tenham caído ao longo dos últimos anos, essa doença ainda continua sendo um grave problema de saúde nos países em desenvolvimento. Atualmente, como exames iniciais para o diagnóstico da TB são usados os métodos de baciloscopia de campo claro e baciloscopia de fluorescência. O primeiro é mais usado em países em desenvolvimento, devido ao baixo custo; o segundo é o método preferencial em países desenvolvidos por ser mais sensível. Entre os vários desafios para o
controle dessa doença, está o desenvolvimento de um método rápido, eficiente e de baixo custo para o diagnóstico da TB. O processo de diagnóstico de baciloscopia de campo claro é demorado, manual e propenso a erros, fazendo com que haja uma alta taxa de falsos negativos. Várias técnicas de reconhecimento de padrão em imagens baciloscópicas de microscopia de campo claro têm sido desenvolvidas para o reconhecimento e contagem dos bacilos. Este trabalho descreve um novo método para segmentação de bacilos da tuberculose em baciloscopia de campo claro. O método proposto utiliza um classificador constituído por uma máquina de vetores de suporte. O diferencial do mesmo em relação a outros trabalhos está nas variáveis selecionadas para a entrada do classificador. Essas variáveis foram
selecionadas a partir de quatro espaços de cor: RGB, HSI, YCbCr e Lab. Investigou-se tanto características individuais, como subtrações de características de um mesmo espaço de cor e de espaços de cores diferentes, num total de 30 características. As melhores características foram selecionadas utilizando-se a técnica de seleção escalar de características. Alcançou-se uma sensibilidade de 94%. No entanto, novas etapas para a redução de ruído são necessárias para minimizar os erros de classificação.
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Validação de protocolo para detecção de Guignardia citricarpa em citros por PCR convencional e PCR em tempo real / Validation of protocol of detection for Guignardia citricarpa in citrus by conventional PCR and real time PCRFaganello, Fernanda de Sillos 21 November 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-11-21 / Citrus Black Spot (CBS) caused by Guignardia citricarpa is classified as
quarantine disease, imposing restrictions to fresh fruits shipping to the European Union
countries. In the state of Goiás, despite systematic phytosanitary surveys, its distribution
and occurrence are unknown due to lack of available technologies for diagnosis. The
occurrence of latent infections, the presence of an endophytic species morphologically
similar to G. citricarpa, as well as time consuming for diagnosis through conventional
methods require the validation of fast, efficient, reproducible, safe and sensitive methods
of diagnosis to provide reliability of diagnosis and disease surveys for its detection and
delimitation. Modifications of the “Cationic hexadecyl trimethyl ammonium bromide”
method (CTAB) to extract DNA of G. citricarpafrom symptomatic tissues with validation
of chemical purity, structural integrity, and absence of DNA inhibiting substances, for
further use in diagnosis by PCR were tested. There was no difference in the average of
DNA extracted for hygienized and non-hygienized tissues (328.62 ng µL
-1
and
322.79 ng µL
-1
, respectively), with low concentration of proteinsin the DNA solution. The
extractor of DNA in amount (>300 ng µL
-1
) and quality (structural integrity) was sufficient
to perform the conventional and real-time PCR analyses. The absence of inhibitors was
demonstrated by real-time PCR, adding 0.1 % genetically modified standard corn DNA
(event MON 810 standard ERM®-BF413b), with the amplification of the specific region
of this event in all test samples. The modified CTAB method sowed repeatability and
partial reproducibility among the limits acceptablein the methodology with coefficient of
variability lower than 30 %. To comply with the ISO/TEC 17025:2005 norm, the method
for the diagnosis of the fungus G. citricarpaby PCR conventional and real time PCR was
validated with the specific evaluation of the limitof detection. Conventional and real time
PCR methods were specificity and adequacy to detect G. citricarpa. Conventional PCR
presented detecting limit of 10 ng µL
-1
of the fungus DNA, with repeatability. Real time
PCR presented higher sensitivity, having the detecting limit determined for the technique
with repeatability, at the concentration of 10 fg of DNA of the fungus. In two farms 24
external asymptomatic leaves from orange trees variety Pera Rio were collected; eight
from each third (lower, medium and upper); totaling twent plants. The modified CTAB
method for DNA extraction was used. The presence of the fungus in very low
concentrations was detected in the asymptomatic leaves, which made it impossible when
we used the conventional PCR technique. In those conditions, the real-time PCR proved to
be feasible, reproducible and highly sensitive for G. citricarpa detection, amplifying between 232 and 232 x 10
2
DNA copies of the fungus from asymptomatic leaf samples;
being an excellent option for the diagnosis of thispathogen in asymptomatic orchards. / A pinta preta dos citros (PPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa, é
considerada uma doença quarentenária, que impõe restrições ao transporte de frutas frescas
para países da União Europeia. Em Goiás, apesar dos sistemáticos levantamentos
fitossanitários, ainda não se conhece a real distribuição da ocorrência da PPC em função da
tecnologia disponível para o diagnóstico. A ocorrência de infecção latente, a presença de
uma espécie endofítica muito semelhante morfologicamente à G. citricarpae o tempo para
o diagnóstico por métodos convencionais levam à necessidade de validar métodos
moleculares rápidos, eficientes, reprodutíveis, seguros e sensíveis de diagnóstico, que
garantem confiabilidade dos diagnósticos e dos levantamentos de detecção e delimitação
da distribuição dessa doença. Foram testadas modificações do método “Cationic hexadecyl
trimethyl ammonium bromide” (CTAB) para extração de DNA de G. citricarpaem tecidos
de frutos cítricos sintomáticos, com a avaliação dapureza química, integridade estrutural e
ausência de substâncias inibidoras na solução de DNA, para posterior uso em diagnóstico
por reação em cadeia da polimerase (PCR). Não houve diferença significativa na
quantidade média de DNA extraído para tecidos higienizados e não higienizados
(328,62 ng µL
-1
e 322,79 ng µL
-1
, respectivamente), com baixa concentração de proteínas
na suspensão de DNA. A obtenção de DNA em quantidade (>300 ng µL
-1
) e qualidade
(integridade estrutural) foi suficiente para realização das análises de PCR convencional e
PCR em tempo real. A ausência de compostos inibidores foi demostrada por PCR em
tempo real pela adição de DNA padrão de milho, geneticamente modificado 0,1 % (evento
MON 810 padrão ERM®-BF413b), com a amplificação da região específica desse evento
em todas as amostras teste. O método CTAB modificado apresentou repetitividade e
reprodutibilidade parcial dentro dos limites aceitáveis para a metodologia, apresentando
coeficientes de variação inferiores a 30 %. Em atendimento à norma ISO/IEC 17025:2005,
foi validado o método para diagnóstico do fungo G. citricarpa por PCR convencional e
PCR em tempo real com a avaliação da especificidadee do limite de detecção. Os métodos
de PCR convencional e PCR em tempo real demonstraram serem específicos e adequados
para a detecção de G. citricarpa. A PCR convencional apresentou o limite de detecção de
10 ng µL
-1
de DNA do fungo, com repetitividade. A PCR em tempo real apresentou maior
sensibilidade, sendo o limite de detecção determinado para a técnica, com repetitividade,
na concentração 10 fg de DNA do fungo. Em duas propriedades foram coletadas 24 folhas
externas assintomáticas de laranja-pera rio, sendo oito em cada terço (inferior, médio e
superior) da planta, em um total de vinte plantas. Para a extração do DNA, foi utilizado o
método CTAB modificado. Em folhas assintomáticas, apresença do fungo foi detectada
em baixíssimas concentrações, o que inviabiliza a utilização da técnica PCR convencional.
Nessas condições, a PCR em tempo real demonstrou ser viável, reprodutível e altamente
sensível para a detecção de G. citricarpa, sendo detectado na concentração de 232 a 232 x 10² números de cópia do DNA do fungo em amostras de folhas assintomáticas,
constituindo uma excelente opção para o diagnóstico desse patógeno em pomares
assintomáticos.
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Metabolismo antioxidante e qualidade durante a maturaÃÃo de frutos tropicais produzidos pelos sistemas de produÃÃo orgÃnico e convencional / Antioxidant metabolism and quality during ripening of tropical fruits produced by organic farming systems and conventionalAurelice Barbosa de Oliveira 08 March 2012 (has links)
Banco do Nordeste do Brasil / CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / The growth of the organic cultivation of vegetables is driven by consumers seeking healthier foods free of pesticides and chemical fertilizers. Thus the aim of this study was to evaluate changes in quality and antioxidant metabolism during fruit ripening of five species that have economic importance grown by organic farming systems and
conventional. The yellow passion fruit, banana, tomato, sugar apple and acerola cultivated under organic and conventional farming were manually harvested at different
stages of development, the pulp were processed and stored at 18 ÂC. The results indicate that the organic cropping system induced stress in passion fruit as shown by the greater
degree of peroxidation and lowest phenolic content and CAT activity, however it stimulated vitamin C. The higher SOD and PAL activities indicate that organic bananas suffered an oxidative stress, but their nutritional quality parameters were not affected. The organic farming system also induced stress in tomato evidenced by the greater degree of lipid peroxidation and increased PAL and SOD activities, but also positively influenced all nutritional antioxidants components. Although the present results for sugar apple do not allow a comparison between cropping systems, there are strong indications that the organic cropping system did not induce stress in sugar apple. For acerola BRS 235, there are signs that organic system induced an oxidative stress due to
the higher lipid peroxidation degree. As the data obtained, the organic system induced stress in passion fruits, tomato, banana and acerola. The organic cropping system positively influenced the non-enzymatic antioxidants in yellow passion fruit and tomatoes, however for the others fruits, there was no influence or it was negative, as in acerola. Therefore, it can be concluded that stress induced by organic cropping system will not necessarily stimulate the production of antioxidant compounds. / O crescimento do cultivo orgÃnico de vegetais vem sendo impulsionado por consumidores que buscam alimentos mais saudÃveis, livres de agrotÃxicos e de adubos quÃmicos. Desta forma o objetivo desse trabalho foi avaliar as alteraÃÃes na qualidade e metabolismo antioxidante durante a maturaÃÃo de frutos de cinco espÃcies que apresentam importÃncia econÃmica cultivadas pelos sistemas de cultivo orgÃnico e convencional. Os frutos do maracujazeiro, bananeira, tomateiro, ateira e aceroleira sob cultivo orgÃnico e convencional foram colhidos manualmente em diferentes estÃdios de desenvolvimento e as polpas foram processadas e armazenadas em freezer domÃstico à --18 ÂC visando a realizaÃÃo das anÃlises de qualidade e do metabolismo antioxidante. Os resultados indicam que o sistema de cultivo orgÃnico induziu um estresse nos frutos do maracujazeiro evidenciado pelo maior grau de peroxidaÃÃo associado ao menor conteÃdo de fenÃlicos e menor atividade da catalase (CAT), porÃm estimulou a concentraÃÃo de vitamina C. A maior atividade da dismutase do superÃxido (SOD) e da fenilalanina amÃnia liase (PAL) indicam que as bananas orgÃnicas sofreram um estresse oxidativo, porÃm suas variÃveis de qualidade nutricional nÃo foram afetadas diferentemente pelos sistemas de cultivo. O sistema de cultivo orgÃnico tambÃm induziu um estresse nos frutos do tomateiro evidenciado pelo maior grau de peroxidaÃÃo lipÃdica e aumento da atividade da PAL e SOD, porÃm influenciou positivamente todos os componentes antioxidantes de qualidade nutricional. Apesar dos resultados aqui encontrados para ata nÃo permitirem uma comparaÃÃo entre os sistemas de cultivos, hà fortes indÃcios de que o sistema de cultivo orgÃnico nÃo induziu ao estresse em atas. Jà com as acerolas BRS 235, hà indÃcios de que o sistema orgÃnico induziu um estresse oxidativo pelo maior grau de peroxidaÃÃo lipÃdica encontrado. Conforme os dados obtidos, o sistema orgÃnico induziu estresse nos frutos de maracujazeiro, tomateiro, bananeira e aceroleira. O sistema de cultivo orgÃnico influenciou positivamente os antioxidantes nÃo enzimÃticos em maracujà e em tomate, nos demais frutos nÃo houve influÃncia ou ela foi negativa, como no caso das acerolas. Portanto, pode-se concluir que o estresse induzido pelo sistema de cultivo orgÃnico nÃo irà necessariamente estimular a produÃÃo de componentes antioxidantes de qualidade em frutos.
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Produção e viabilidade nas primeiras intervenções de dois métodos de condução de desbrota em talhadia de eucalipto / Production and viability in first intervention of two driving sprouting methods in eucalyptus coppiceSousa, Juliano Pereira de 10 August 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-08-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The insertion of new forestry methods of operation can change plant growth
beneficially, bringing larger increments to a forest. This work was conducted to
study biomass, carbon and nutrient allocation in the first interventions sprouting
eucalyptus. The study was developed in the Forest II farm belonging to Co-op
COMIGO in the town of Rio Verde - GO. The experimental design used was a
randomized block with two treatments and four replications. The treatments
were early sprouting and conventional sprouting. Seventeen months after
clearcutting forest, one tree per plot were harvested for quantification of
biomass, carbon and nutrient allocation. With regard to biomass, carbon and
nutrients for the tree, the study showed no statistical difference between the
early and conventional treatments of sprouting. However, when the values of
biomass, carbon and nutrients was analyzed per hectare occurred no significant
statistical difference between treatments, it was caused by low survival in the
conventional sprouting treatment, showing greater increase for carbon biomass
and nutrients for early sprouting treatment. / A inserção de novos métodos de operação florestal pode alterar o
crescimento das plantas beneficamente, trazendo maiores incrementos para
uma floresta. Assim, este trabalho foi realizado com objetivo de estudar
biomassa, carbono e alocação de nutrientes nas primeiras intervenções de
desbrotas em eucalipto. O estudo foi desenvolvido na fazenda Florestal II
pertencente a Cooperativa COMIGO situada na cidade de Rio Verde - GO. O
delineamento usado foi em blocos ao acaso, com dois tratamentos e quatro
repetições. Os tratamentos aplicados foram: desbrota precoce e desbrota
convencional. Dezessete meses após o corte raso da floresta, uma árvore por
parcela foi colhida para quantificação de biomassa, carbono e alocação de
nutrientes. No que tange a biomassa, carbono e nutrientes por árvore, o estudo
não apresentou diferença estatísticas entre os tratamentos desbrota precoce e
convencional, mas quando foi analisado o valor de biomassa, carbono e
nutrientes por hectare houve diferença estatística significativa entre
tratamentos, causada pela baixa sobrevivência no tratamento desbrota
convencional, mostrando maior incremento para biomassa, carbono e nutrientes
para o tratamento desbrota precoce.
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