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Epidemiologia e caracterização molecular do vírus da Influenza em quatro espécies de pinguins na Região Antártica. / Epidemiology and molecular characterization of the influenza virus in four penguin species of the antartic region.

Sanfilippo, Luiz Francisco 23 February 2011 (has links)
O Vírus da influenza, apesar de todas as epidemias e pandemias referirem-se a infecções em seres humanos, não está restrita a espécie humana e é capaz de causar debilidade ou mortalidade em várias outras espécies, incluindo cavalos, suínos, mamíferos marinhos e aves, entre outros. Estudos ecológicos das viroses de influenza conduziram a hipótese que todas as que acometem mamíferos derivam de reservatórios destes vírus em aves. Mesmo com programas de monitoramento contínuo de aves silvestres em alguns países do mundo que possuem casos originados pelos vírus aviário H5N1, pouco foi feito na Antártica e por isso, o presente trabalho foi realizado nas estações de verão antártico de 2006, 2007 e 2008 em duas localidades no território Antártico, a Península Keller, localizada na Ilha Rei George e na ilha Elefante 61°08S, 55°07W, a primeira onde está situada a Estação Antártica Comandante Ferraz-EACF e a segunda onde está localizada uma base de apoio a estudos avançados. Para este estudo foi realizada a coleta de 283 amostras de quatro diferentes espécies de pinguins: Pygoscelis adeliae; P. papua; P. antarctica; Aptenodytes patagonicus. Para o diagnóstico das amostras colhidas, foi aplicada a detecção direta dos produtos amplificados pelo método de RT-PCR em gel de agarose confirmados pelo método de Real-Time PCR (Applied Biosystems) e pelo RT-PCR-GeneScan no laboratório de Virologia Clínica e Molecular, do Departamento de Microbiologia, da Universidade de São Paulo. Os resultados obtidos em nosso estudo foram 8 amostras positivas em pinguins para o vírus Influenza A. As amostras positivas por RT-PCR foram encaminhadas para o laboratório de Influenza do Department of Infectious Diseases, St. Jude Children\'s Research Hospital, Memphis, TN, USA, para isolamento em ovos embrionados, não havendo crescimento de vírus da influenza A. Quatro destas amostras positivas puderam ser sequenciadas e comparadas com sequências de Influenza A depositadas no Genbank apresentando uma identidade de 96,8 % a 100 % entre elas e o controle tendo este último uma identidade de 100% com as do banco de dados, confirmando a presença do vírus nestas aves. / Epidemics and pandemics of influenza usually refer to infections in human beings. The influenza virus is not, however, restricted to humans and can cause infirmity and death in other species including horses, swine, marine mammals, birds, and others. Ecological studies of viral infections have led to the hypothesis that the influenza viruses that attack mammals have their origin in the accumulation of these viruses in birds (avian flu). In some countries with influenza cases caused by the avian H5N1 virus, there was monitoring of wild birds but little had been done in Antarctica. The present work was therefore carried out during the Antarctic summer seasons of 2006, 2007, and 2008 in two Antarctic locations: The Commander Ferraz Antarctic Station, on the Keller Peninsula of King George Island, and at the Base of Advanced Studies located on Elephant Island (61°08S, 55°07W). Two hundred eighty-three (283) samples from four different penguin species Pygoscelis adeliae, Pygoscelis papua, Pygoscelis antarctica; and Aptenodytes patagonicus were collected for this study. Diagnoses of the samples were performed not only by application of direct detection and amplification according to the RT-PCR method in agar-gel, but also by Real-Time PCR (Applied Biosystems), and by RT-PCR gene scan at the Laboratory of Clinical and Molecular Virology of the Department of Microbiology of the University of Sao Paulo. Eight of the penguin samples tested positive for the Influenza-A virus. The positive samples, as determined by RT-PCR, were sent to the Influenza Laboratory of the Department of Infectious Diseases of the St. Jude Research Hospital in Memphis, Tennessee, USA, to be isolated in egg embryos where no further growth of the Influenza-A virus took place. Four of these positive samples could be sequenced and compared with those of Influenza-A on deposit at the Gene Bank and ranged from 96.85 to 100% when compared with the control samples (100% positive), thus confirming the presence of the virus in the tested birds.
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Diffusion d'un virus et évolution de son génome dans les populations de ruminants domestiques : application à l'épidémiosurveillance de la "Peste des petits ruminants" / Spread of virus and evolution of its genome in populations of domestic ruminants : Application to molecular epidemiology and surveillance of 'Peste des petits ruminants'

Salami, Habib 13 February 2015 (has links)
La peste des petits ruminants (PPR), causée par un Morbillivirus, est l'infection virale la plus grave des caprins et ovins. Elle est largement répandue en Asie, au Moyen Orient et en Afrique. En Afrique elle est en émergence au nord et au sud du continent et représente un facteur majeur d'insécurité alimentaire pour la population agricole (70% des populations pauvres des régions considérées). La PPR est un modèle d'étude des maladies transfrontalières ; sa diffusion est très liée aux mouvements régionaux d'animaux vivants. La compréhension de cette diffusion est une condition essentielle à la mise en place de mesures de contrôle efficaces (vaccination, quarantaine, contrôle aux frontières,…). A notre connaissance aucune étude n'a été entreprise pour connaître l'ampleur de la diversité génétique du PPRv au cours d'infections naturelles de petits ruminants et l'accumulation des mutations virales dans un circuit de diffusion. Or dans les pays d'élevages extensifs tropicaux l'identification et la traçabilité animale sont inexistantes, ce qui rend difficile reconstruction des circuits de diffusion des animaux et du virus. Dans ces conditions, la diversité génétique du virus peut être utilisée comme marqueur de diffusion épidémiologique. L'objectif de cette thèse est d'utiliser la variabilité génétique du PPRV pour caractériser les lignées virales circulantes et retracer les processus de transmission du virus à travers un large territoire centré sur le Sénégal. En analysant 2 gènes de PPR nous avons estimé la vitesse d'évolution du virus sur une période de 4 années comprise en 2010 et 2014.Les résultats montrent que les premières souches de la lignée 2 de PPRv ont été introduites en 2005 au Sénégal et dans les pays voisins. L'horloge moléculaire et l'arbre phylogéographique rapportés ici indiquent clairement que la lignée II maintenant enzootique en Afrique de l'ouest prend son origine au Nigeria. Les mouvements trans-africains à l'origine du déplacement est-ouest de la lignée II trouvent leur origine dans le commerce de bétail à la croisée des frontières, une évidence économique et culturelle en Afrique de l'Ouest.Mots clés : peste des petits ruminants ; gène viral ; mutation virale ; circuit de transmission ; phylogénie ; phylogéographie ; surveillance épidémiologique, Sénégal. / Peste des petits ruminants (PPR), caused by a Morbillivirus is one of the most important viral infections in sheep and goats. It is widely spread in Asia, Middle East and Africa. In Africa, it is an emerging disease in the north and the south of the continent. It is a major factor of food insecurity for the farming population (70% of the poor population in the tropical regions). PPR is a study model of transboundary diseases; its spread is highly related to regional movements of livestock. Understanding the spread of PPR is an essential condition for the implementation of efficient control measures (vaccination, quarantine, border controls etc.). Up to our knowledge, no studies have investigated the range of genetic diversity of PPR virus (PPRv) during natural infections in small ruminants and the accumulation of virus mutations during its spread. Further on, in tropical countries with extensive farming, animal identification and traceability are a current problem. In such conditions, the genetic diversity of the PPRv can be used as a marker of animal movement and spread of the virus. The objective of this study was to investigate the genetic diversity of the PPRv in order to characterise the actual viral lineages and to retrace the transmission of the virus in Senegal and its surrounding countries. Analyzing two complete viral genes of the PPR, we have estimated the rate of evolution of this virus, in a four year period, between 2010 and 2014. The results of the study show that the first strains of lineage II of PPRv have been introduced in 2005 in Senegal and its surrounding countries. Molecular clock analysis and phylogeographical reconstitution of the PPRv indicate that the lineage II, actually enzootique in western Africa, has its origins in Nigeria. This viral introduction from the direction east towards west, corresponds to the transboundary movement and commerce of livestock in the countries of western Africa, which represents the economic and cultural tradition of the people of this region.Key words: Peste des petits ruminants, viral gene, virus mutation, transmission, phylogeny, phylogéographie, epidemiosurveillance, Senegal, West Africa
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Rede nacional de vigilância de morbidade materna grave : explorando aspectos metodológicos da abordagem do near miss materno = Brazilian network for surveillance of severe maternal morbidity: exploring methodological aspects of maternal near miss approach / Brazilian network for surveillance of severe maternal morbidity : exploring methodological aspects of maternal near miss approach

Haddad, Samira El Maerrawi Tebecherane, 1981- 10 November 2012 (has links)
Orientador: José Guilherme Cecatti / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-11-27T12:58:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Haddad_SamiraElMaerrawiTebecherane_D.pdf: 11825508 bytes, checksum: 24467eb924ca22a96f39c0067594109d (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Introdução: A saúde materna é um dos focos das Metas de Desenvolvimento do Milênio das Nações Unidas para 2015. As mais recentes estimativas sugerem que o número de mulheres que morrem de complicações durante a gestação e parto caiu 47% de 1990 a 2010. Para alcançar a redução planejada de 75% até 2015, a taxa anual deveria cair em 5,5%. Porém, um pouco além da metade do que seria necessário foi conseguido. Para que as metas sejam atingidas, intervenções efetivas são identificadas como necessárias. Além de melhorias com investimentos estruturais locais, uma das bases para a organização de ações efetivas é a obtenção de dados fidedignos e o desenvolvimento de sistemas de informação em saúde. Até um passado recente, não havia padronização de conceitos para morbidade materna grave. Em 2009, condições ameaçadoras da vida foram definidas pela Organização Mundial da Saúde (OMS). Como resultado, critérios clínicos, laboratoriais e de manejo específicos orientam a identificação de casos de near miss. A criação de uma rede de vigilância no Brasil utilizando os novos critérios de near miss poderia trazer um panorama desta condição em um país de média renda e população heterogênea. Com tais informações, novas estratégias para melhoria da assistência à saúde materna e perinatal poderiam ser desenvolvidas, com potencial redução real de mortes. Objetivos: Avaliar a homogeneidade amostral dos casos incluídos na Rede, validar os critérios de near miss da OMS, desenvolver um modelo de predição de mortalidade baseado na gravidade dos casos e, a partir deste modelo, avaliar o desempenho dos centros da Rede na prestação de cuidados obstétricos. Métodos: A Rede Nacional de Vigilância de Morbidade Materna Grave foi um estudo de corte transversal multicêntrico implantado em 27 hospitais entre todas as regiões do país, com coleta prospectiva de dados pelo período de um ano, utilizando os novos critérios de near miss da OMS. A partir de 9555 casos incluídos no período, foram calculados os coeficientes de correlação intraclasse (ICC) e efeitos do desenho por cluster das variáveis do estudo. Também, testes de acurácia diagnóstica foram utilizados para validar dos critérios da OMS. Um modelo de regressão logística bivariada foi utilizado para avaliar a correlação entre os critérios de near miss e variáveis distais na ocorrência de morte e desenvolver uma ferramenta para predição de mortalidade, o Maternal Severity Index (MSI). A partir deste modelo, foi analisada a razão entre as mortes observadas e aquelas esperadas de acordo com a gravidade dos casos e avaliados os níveis de desempenhos dos centros na prestação de cuidado obstétrico. Conclusão: Os ICC para as variáveis de desfecho da Rede são considerados pequenos, o que indica adequada heterogeneidade amostral. Seus valores podem ser utilizados para o cálculo do tamanho amostral de estudos futuros na área. O uso dos critérios de near miss da OMS para identificação de casos de morbidade materna grave foi validado. O índice de gravidade materna (MSI) pode ser utilizado como ferramenta para predição de mortalidade e avaliação de desempenho e adequação de cuidado em instituições que prestem atendimento a mulheres com condições ameaçadoras a vida / Abstract: Introduction: Maternal health is one of the focuses of the United Nations' Millennium Development Goals for 2015. The most recent estimates suggest that the number of women who died from complications during pregnancy and childbirth fell 47% from 1990 to 2010. To achieve the planned reduction of 75% by 2015, the annual rate should fall by 5.5%. However, a little more than half of what is required has been obtained. To achieve the goals, effective interventions are identified as necessary. In addition to improvements in local structural investments, one of the bases for the organization of effective actions is obtaning reliable data and the development of health information systems. Until recently, there was no standardazed concept for severe maternal morbidity. In 2009, the World Health Organization (WHO) defined life-threatening conditions. As a result, specific clinical, laboratory and management criteria guide the identification of near miss cases. The development of a surveillance network in Brazil using the new criteria for maternal near miss could bring an overview of this condition in a middle-income country with heterogeneous population. With such information, new strategies to improve maternal and perinatal care could be developed, with potential real reduction of deaths. Objectives: To evaluate the homogeneity of the sample included in the network, to validate the WHO near miss criteria, to develop a predictive model of mortality based on severity of cases and, from this model, to evaluate the performance of the Network facilities in providing obstetric care. Methods: The Brazilian Network for Surveillance of Severe Maternal Morbidity was a multicenter cross-sectional study implemented in 27 hospitals from all regions of the country, with prospective data collection for a one year period, using the new WHO maternal near miss criteria. From 9555 cases included in the period, the intraclass correlation coefficients (ICC) and cluster design effects for the variables of the study were calculated. Also, diagnostic accuracy tests were used to validate the WHO criteria. A bivariate logistic regression model was used to evaluate the correlation between the near miss criteria and distal variables in the occurrence of death and to develop a tool for prediction of mortality, the Maternal Severity Index (MSI). From this model, the ratio between the number of observed and expected deaths was analyzed according to the severity of cases and the performance levels of the centers in providing obstetric care was assessed. Conclusion: The ICC for the outcome variables of the network are considered small, what indicates adequate sample heterogeneity. Their values can be used to calculate the sample size of further studies in the area. The use WHO maternal near miss criteria to identify cases of severe maternal morbidity has been validated. The maternal severity index (MSI) can be used as a tool for assessing the performance and appropriateness of care in facilities providing care for women with life threatening conditions / Doutorado / Saúde Materna e Perinatal / Doutora em Ciências da Saúde
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Epidemiologia espacial da dengue em Araraquara, São Paulo, 2008 a 2015 / Spatial epidemiology of dengue in Araraquara, São Paulo, 2008 to 2015

Ferreira, Aline Chimello 24 February 2017 (has links)
Submitted by ALINE CHIMELLO FERREIRA null (alinechf@gmail.com) on 2017-03-17T16:06:35Z No. of bitstreams: 1 Tese_Aline Chimello Ferreira.pdf: 10793630 bytes, checksum: ae59c58663e759a7faa41e5470ea5604 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-03-22T12:39:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ferreira_ac_dr_arafcf.pdf: 10793630 bytes, checksum: ae59c58663e759a7faa41e5470ea5604 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T12:39:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ferreira_ac_dr_arafcf.pdf: 10793630 bytes, checksum: ae59c58663e759a7faa41e5470ea5604 (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A dengue é uma doença viral febril transmitida por culicídeos, que atinge milhões de pessoas todos os anos e é considerada um grande problema de saúde pública. A cidade de Araraquara – São Paulo vem apresentando um aumento no número de casos notificados da doença. Programas como Sistemas de Informações Geográficas, análise espacial e regressão espacial têm permitido aos pesquisadores entender a distribuição espacial do vetor e da doença, além de levantar possíveis fatores de risco. O objetivo deste trabalho foi conhecer o histórico da dengue na cidade, descrevendo padrões epidemiológicos e espaciais entre os anos de 2008 e 2015. A associação dos casos com variáveis climáticas e positividade para Aedes aegypti em pontos estratégicos foi estudada. Também foi verificada a ocorrência de aglomerados de casos ao longo dos anos e investigadas as possíveis variáveis explicativas (dentre elas, as varáveis socioeconômicas, demográficas, ambientais) para a incidência de dengue no ano de 2015, a maior epidemia registrada na história da cidade no período estudado. A primeira epidemia registrada foi em 2008 e a partir deste ano a dengue se tornou endêmica na cidade, com casos autóctones ocorrendo em todos os meses do ano. As maiores incidências foram observadas entre os meses de março a maio, um ou dois meses após o aumento da chuva. Dos 15.729 casos notificados entre 2008 e 2015, 46% acometeram pessoas do sexo masculino e 54% do sexo feminino. Pessoas entre 20 e 59 anos foram as mais acometidas. Foram utilizadas diferentes técnicas de análise espacial para detectar dependência espacial e aglomerados de casos de dengue. Foi possível identificar visualmente áreas com maior e menor concentração de eventos, padrões que podem servir de pistas para a identificação de vias para conter a propagação da doença e que possam ser úteis na previsão da ocorrência de dengue. A análise das variáveis associadas à incidência de dengue apontou que áreas com baixo número de responsáveis alfabetizados e maior proporção de crianças nos domicílios estiveram associados com a dengue no ano de 2015. Os resultados mostraram-se adequados para a identificação de áreas de risco e do melhor momento para direcionamento de ações e recursos dos órgãos de saúde responsáveis. / Dengue fever is a febrile vector borne disease transmitted by Culicidae that affects millions of people every year and is considered a major public health problem. Araraquara (São Paulo/Brazil) has been presenting an increase in the number of reported cases of the disease. Tools such as Geographic Information Systems, spatial analysis and spatial regression have allowed researchers to understand the spatial distribution of the vector and the disease, in addition looking for risk factors. This study was to know the history of dengue in Araraquara by describing epidemiological and spatial patterns of dengue cases from 2008 to 2015. It was investigated the association between cases, climate and positivity for Aedes aegypti at strategic points. It was also searched for explanatory variables (which included socioeconomic, demographic and environmental) for dengue incidence in 2015, the highest epidemic recorded in the period. The first recorded outbreak was in 2008 and from this year dengue has become endemic in the city, with the cases occurring every month. The highest incidences were seen between the months of March and May following months of high rainfall. Of the 15729 cases reported between 2008 and 2015, 46% affected male and 54% female. People between 20 and 59 years old were more affected. To detect spatial dependence and clusters of dengue cases was performed several techniques of spatial analysis. It was possible to identify areas with highest and lowest concentration of dengue cases, patterns that can serve as clues to stop the spread of the disease and to predict the occurrence of dengue. It was found two variables associated with dengue, areas with low responsible literate and high proportion of children in the households were associated with dengue in 2015. The results were adequate to identify areas of risk and the best moment for directing actions and resources for the public health services. / FAPESP: 2013/02338-9 / FAPESP: 2015/24821-9
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Eventos químicos no Regulamento Sanitário Internacional (2005): do estado da saúde local ao global / Chemical events in the International Health Regulations (2005): from local to global health statecraft

Agnes Soares da Silva 12 March 2018 (has links)
A produção e o uso global de produtos químicos é alta e está em ascensão. Provocado pela globalização econômica, o movimento trans-fronteiriço de produtos químicos e seus resíduos tornam a exposição humana a produtos químicos um grande risco para a saúde pública. O Regulamento Sanitário Internacional (RSI-2005) revisado reconhece os riscos impostos pelos produtos químicos à saúde pública ao incorporá-los entre aqueles com potencial para se tornar uma Emergência de Saúde Pública de Importância Internacional (ESPII). A falta de implementação do RSI-2005 em um país pode ameaçar a segurança sanitária global. Objetivos: O objetivo geral desta tese é apresentar uma proposta para superar o problema da baixa implementação das capacidades de saúde pública em produtos químicos no RSI-2005 e usar o regulamento como uma plataforma para fortalecer a governança para a saúde pública em produtos químicos em todos os níveis de complexidade dos sistemas de saúde. Os objetivos específicos são: desvendar os determinantes, forças motrizes, caminhos e processos que poderiam levar a eventos químicos com potencial ESPII; propor um construto teórico que possa orientar a governança para a saúde pública nesta questão; e identificar os mecanismos que poderiam facilitar a implementação das principais capacidades de saúde pública em produtos químicos para mitigar riscos. Métodos: A secção de métodos inclui: uma revisão sobre riscos químicos locais e globais, apresentando seus determinantes; revisão do conceito de bens públicos, aplicando-o a aspectos relacionados à segurança química; revisão de eventos químicos passados que poderiam atender aos critérios de potencial ESPII; revisão dos princípios da atenção primária à saúde, explorando possibilidades e oportunidades de incorporar a capacidade em riscos ambientais no contexto dos sistemas locais de saúde para fortalecer a vigilância, o monitoramento e a análise da saúde ambiental em todos os níveis; e proposição de um kit de ferramentas de apoio à implementação das capacidades básicas do RSI-2005 em produtos químicos. Resultados: Esta tese constrói seu argumento na seguinte sequência: \"Segurança Química é um Bem Público Global para a Saúde\"; \"Lições Aprendidas de Surtos Químicos Mortais\"; \"O Estado da Vigilância em Saúde Pública para Incidentes Químicos: Dez Anos de RSI-2005 na América Latina e no Caribe\"; \"Capacidade de Vigilância em Saúde e Resposta: do Local ao Global\"; e \"Um Guia para a Implementação de Capacidades Básicas de Saúde Pública para Eventos Químicos\". Discussão: Existe relação entre as agendas globais e locais. O RSI-2005 pode ser interpretado como uma oportunidade para rever os princípios e as capacidades essenciais de saúde pública e para revitalizar a forma como os sistemas de saúde são organizados, fortalecendo os mecanismos de governança para a saúde e a produção de bens públicos globais para a saúde. Isto requer o envolvimento do setor saúde com a sociedade em geral e um papel proeminente e proativo de liderança da OMS. Conclusão: Atuação local não resolverá problemas globais, mas ela não pode ser desvinculada da atuação global. A necessidade de revisitar e atualizar os sistemas nacionais de saúde para responder a esse contexto de globalização é clara e urgente e o RSI-2005 fornece uma plataforma que pode ser inteligentemente usada na elaboração desta resposta. Não para proteger o comércio e a economia, mas a saúde do povo. / The global production and use of chemicals is high and on the rise. Triggered by economic globalization, the transboundary movement of chemicals and their waste makes human exposure to chemicals a widespread public health risk. The revised International Health Regulations (IHR-2005) recognized the risks posed by chemicals to public health by incorporating them among those with the potential to become a Public Health Emergency of International Concern (PHEIC). Lack of implementation of the IHR-2005 in one country can threaten global health security. Objectives: The general objective of this thesis is to present a proposal to overcome the problem of low implementation of the public health capacities on chemicals in the IHR-2005 and to use the regulations as a framework to strengthen governance for public health on chemicals at all levels of complexity of the health systems. The specific objectives are: to unveil the determinants, main drivers, pathways and processes that could lead to chemical events with potential PHEIC; to propose a theoretical construct that could guide governance for public health on this matter; and to identify the mechanisms that could facilitate the implementation of the core public health capacities on chemicals to mitigate risks. Methods: The methods section includes: a literature review of local and global chemical risks, presenting their drivers; review of the concept of public goods, applying it to aspects related to chemical safety; review of past chemical events that could meet the criteria of potential PHEIC; review of the principles of primary health care, exploring possibilities and opportunities of incorporating capacity on environmental risks in the context of local health systems to strengthen environmental health surveillance, monitoring and analysis at all levels; and proposition of a toolkit for the implementation of the IHR-2005 core capacities on chemicals. Results: This thesis builds its argument in the following sequence: \"Chemical Safety is a Global Public Good for Health\"; \"Lessons Learned from Deadly Chemical Outbreaks\"; \"Status of Public Health Surveillance for Chemical Incidents: Ten Years of IHR-2005 in Latin America and the Caribbean\"; \"From Local to Global Capacity for Health Surveillance and Response\"; and \"A Guide for the Implementation of Core Public Health Capacities on Chemicals\". Discussion: There are linkages between the global and local agendas. The IHR-2005 can be taken as an opportunity to revisit public health principles and core capacities, and revitalize the way health systems are organized, strengthening mechanisms of governance for health, and the delivery of global public goods for health. This requires the engagement of the health sector with the society in general, and a prominent and proactive leadership role of the WHO. Conclusion: Acting local will not solve global problems, but it can no longer be disentangled from acting global. The need to revisit and update national health systems to respond to this context of globalization is clear and urgent, and the IHR-2005 provides a framework that can be smartly used in the elaboration of this response. Not to protect trade and the economy, but the health of the people.
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Desenvolvimento e avaliação de modelo computacional para geração de alertas a partir de notificações de casos de meningite meningocócica / Development and evaluation of a computing model of alerts from meningococcal meningitis notification cases

Wagner Zaparoli 24 November 2008 (has links)
INTRODUÇÃO: este trabalho apresenta a arquitetura de um sistema de emissão de alertas para surtos e epidemias em tempo real, baseado em notificações eletrônicas da meningite, e discute os resultados dos testes e simulações realizados. MÉTODOS: esse sistema foi desenvolvido em quatro etapas: Concepção, Análise, Construção e Teste/Simulações. A Concepção contemplou a elicitação de requisitos, a qual definiu o que o sistema deve fazer. A Análise se preocupou com a modelagem e especificação das regras que definem como o sistema deve trabalhar. A Construção abrangeu a transformação das regras definidas e modeladas em linguagem de programação. A última etapa, Teste/Simulação, foi responsável por garantir que o sistema construído estava em conformidade com os requisitos elicitados na etapa de Concepção. RESULTADOS: vários artefatos foram criados e algumas constatações foram verificadas nesta etapa. Sobre os artefatos podemos citar os requisitos, casos de uso, diagrama de classes, modelo físico de dados, casos de teste e programas. Sobre as constatações podemos citar o disparo de alertas nas simulações realizadas pelo sistema dois dias antes que o alerta feito pelas autoridades de saúde do Estado de São Paulo usando os procedimentos habituais. DISCUSSÃO e CONCLUSÃO: O sistema desenvolvido pode ser classificado como um Early Warning System. Nas simulações, observamos que em duas oportunidades ele conseguiu evidenciar ocorrência de surto antecipadamente ao método tradicional utilizado pelo Centro de Vigilância Epidemiológico de São Paulo. Comparando-o com sistemas semelhantes em produção, verificamos que esse sistema se diferencia ao emitir ativamente alertas de surtos em tempo real. / INTRODUCTION: this essay presents the architecture of an alert system for epidemics based on real-time electronic notification of meningococcal meningitis, and discusses the results of tests and simulations made. METHODS: this system was developed in four stages: Conception, Analysis, Construction and Test/Simulation. The Conception covered the requirements elicitation, which defined what the system should do. The Analysis involved the modeling and specification rules that defined how the system should work. The Construction covered the transformation of defined and modeled rules in programming language. The last stage, Test/Simulation, checked the system under known scenarios, comparing the timing of outputs with the Brazilian notification surveillance framework. RESULTS: many artifacts were made and some evidences were verified. About the artifacts we can mention the requirements, use cases, class diagram, physical data model, test cases, and algorithms. About the evidences we can mention the fast alert production in simulations of this system as compared with the current procedure in use by health authorities. DISCUSSION AND CONCLUSION: this system can be classified as an Early Warning System. In simulations we observed that in two opportunities, it managed to put in evidence outbreak occurrence in advance to the traditional used method by Epidemiological Surveillance Center of São Paulo. In comparison with the similar systems under operation, we note this system is distinguished from them in issuing real-time outbreak alerts.
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Sífilis congênita: panorama do agravo em um hospital de ensino / Congenital syphilis: an overview of the disorder in a teaching hospital

COUTINHO, Rosalete Landim de Castro January 2014 (has links)
COUTINHO, Rosalete Landim de Castro. Sífilis congênita: panorama do agravo em um hospital de ensino. 2014. 85f. – Dissertação (Mestrado) – Universidade Federal do Ceará, Programa de Pós-graduação em Políticas Públicas e Gestão da Educação Superior, Fortaleza (CE), 2014. / Submitted by Márcia Araújo (marcia_m_bezerra@yahoo.com.br) on 2014-09-03T11:06:24Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_rlccoutinho.pdf: 2963690 bytes, checksum: 1ac8cedc0a6f4b02ca7092d68778f410 (MD5) / Approved for entry into archive by Márcia Araújo(marcia_m_bezerra@yahoo.com.br) on 2014-09-03T13:09:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_rlccoutinho.pdf: 2963690 bytes, checksum: 1ac8cedc0a6f4b02ca7092d68778f410 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-03T13:09:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_rlccoutinho.pdf: 2963690 bytes, checksum: 1ac8cedc0a6f4b02ca7092d68778f410 (MD5) Previous issue date: 2014 / A sífilis congênita permanece no século XXI como problema de saúde pública. Este estudo teve como objetivo avaliar o perfil epidemiológico da sífilis congênita de modo a compreender melhor o processo saúde/doença em mulheres acometidas pela sífilis. Trata-se de um estudo documental de natureza quantitativa. A amostra está composta 787 observações de mulheres com diagnóstico de sífilis no momento do parto ou curetagem, atendidas em um hospital de ensino, no período 2007-2012. Foi realizada análise descritiva e inferencial, vez que se hipotetizou uma associação entre fatores de risco e o desfecho da gestação. Os resultados mostram que a taxa de prevalência em parturientes no hospital de ensino é de 2,7%. As puérperas acometidas são, predominantemente, adultas jovens, com baixa escolaridade, e prendas do lar. Em relação à assistência à saúde da gestante, 57,82% realizaram o pré-natal, embora o diagnóstico de sífilis materna da grande maioria (59,47%) somente tenha sido realizado no momento do parto ou curetagem, e somente 9,89% delas, tratadas adequadamente neste seguimento. Em relação ao manejo dos recém-nascidos, os dados mostraram que 51,96% tiveram a titulação do VDRL menor ou igual à titulação da mãe. A maioria dos recém-nascidos (62,20%) apresentou sinais e sintomas de sífilis congênita; 93,30% deles foram tratados adequadamente, embora, 66,85% desse grupo não tenham passado por exame de Rx de ossos longos. Encontrou-se uma associação positiva entre a realização do pré-natal, o diagnóstico no pré-natal, o tratamento adequado, e o desfecho favorável da gestação. Conclui-se que a redução dos casos de sífilis congênita depende da qualidade do pré-natal ofertado a essas mulheres, o que pressupõe a capacitação e o envolvimento profissional no que concerne ao cumprimento do que é preconizado pelas políticas de saúde atinentes ao combate à sífilis.
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Vigilância hospitalar: possibilidades e obstáculos de uma prática integrada / Hospital surveillance: possibilities and obstacles of a integrated practice

Patricia Alexandra Schettert 24 June 2008 (has links)
O presente estudo discute a questão da integração das vigilâncias em âmbito hospitalar (vigilância epidemiológica hospitalar e vigilância do controle de infecção hospitalar), analisando as possibilidades e impossibilidades dessa integração. Examina os aspectos histórico-políticos e as concepções teórico-práticas de organização dos serviços de vigilância hospitalar, buscando identificar as diferenças e semelhanças entre as duas vigilâncias. A análise inicial permitiu examinar em que medida os limites impostos pelas especificidades de cada vigilância contribuem para sua prática de forma desintegrada. Em seguida realizou-se pesquisa de natureza qualitativa, por meio de entrevistas com grupos focais de profissionais que atuam na vigilância das infecções hospitalares e da vigilância epidemiológica em âmbito hospitalar. O material localizado nos grupos focais foi analisado utilizando-se categorias construídas a partir do próprio material. As vigilâncias hospitalares têm tentado encontrar formas de mudar suas práticas, buscando romper com os caminhos neutralizados, buscando uma aproximação entre as vigilâncias, pois havia muito conflito relacionado a questões técnicas advindas da formação diversificada entre os profissionais que atuam na área. Hoje a busca de novos caminhos foi possível pela mudança da percepção dos profissionais apenas, sem a imposição da gestão, ao perceberem a necessidade de reorganizar o serviço de vigilância hospitalar de forma horizontalizada, construindo um diagnóstico com múltiplos olhares/saberes, como práticas aliançadas com a transformação da realidade de sua unidade hospitalar. Alguns apontam a necessidade de se discutir um novo conceito para Vigilância Hospitalar, capaz de reconhecer além da vigilância das infecções hospitalares e vigilância epidemiológica, capaz de incluir também a vigilância ambiental, assim o conceito de vigilância em saúde no território hospitalar deve possibilitar uma visão mais ampla para a VH. Esta vem enfrentando dificuldades ao tentar reorganizar suas práticas, principalmente em sua infra-estrutura, e os recursos humanos têm sido o maior problema. Reconhecem que um serviço de VH requer normas, fluxos, protocolos, etc. para integrar suas práticas, o que exige construir a integração. Embora acreditem que a integração não deva começar pela mudança da estrutura do serviço, mas pelo processo de trabalho, esperam que, ao final dessa construção, seja criada uma regulamentação que proponha a integração das vigilâncias, efetivando a proposta. / This study discusses the integration between surveillances in hospitals (epidemiological surveillance and hospital infections control), analyzing the possibilities and impossibilities of such integration. It assesses the historical and political aspects, and the theoretical and practical concepts of services organizations in hospital surveillance, trying to identify the differences and similarities between both surveillances. The initial analysis allowed examining how limits imposed by the specificities of each surveillance help their practice in a non-integrated way. Then a qualitative research was carried out, through interviews with focal groups that work in hospital surveillance and epidemiological surveillance in hospitals, and in the hospital infection controlling committee. The material collected from the focal groups was analyzed through categories that arose from this same material. Hospital surveillances have been trying to change their practices, trying to break with neutralized ways, since there were many conflicts concerning technical issues coming from the differentiated formation of professionals who work in this field. Nowadays the search for new ways has been made possible by the change of perception among these professionals only, not imposed by managers, when they realized the need to reorganize hospital surveillance in a horizontal manner, building a diagnosis with multiple lights/knowledge, as practices committed to transforming reality in their hospital unit. Some point to the need of discussing a new concept for hospital surveillance, able to recognize hospital infection and epidemiological surveillances, as to include environmental surveillance, so the concept of health surveillance in hospital will allow a wider view of hospital surveillance. This one has hardly reorganized its practices, mainly its infrastructure, and human resources are the main problem. They realize that hospital surveillance demands rules, trends, protocols etc. to integrate their practices, and this requires integration. Although they believe integration must not start with changes in the services structure, but in the work process, they hope that, after this construction, legislation is created to propose integration among surveillances, thus making this proposal affective.
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Vigilância hospitalar: possibilidades e obstáculos de uma prática integrada / Hospital surveillance: possibilities and obstacles of a integrated practice

Patricia Alexandra Schettert 24 June 2008 (has links)
O presente estudo discute a questão da integração das vigilâncias em âmbito hospitalar (vigilância epidemiológica hospitalar e vigilância do controle de infecção hospitalar), analisando as possibilidades e impossibilidades dessa integração. Examina os aspectos histórico-políticos e as concepções teórico-práticas de organização dos serviços de vigilância hospitalar, buscando identificar as diferenças e semelhanças entre as duas vigilâncias. A análise inicial permitiu examinar em que medida os limites impostos pelas especificidades de cada vigilância contribuem para sua prática de forma desintegrada. Em seguida realizou-se pesquisa de natureza qualitativa, por meio de entrevistas com grupos focais de profissionais que atuam na vigilância das infecções hospitalares e da vigilância epidemiológica em âmbito hospitalar. O material localizado nos grupos focais foi analisado utilizando-se categorias construídas a partir do próprio material. As vigilâncias hospitalares têm tentado encontrar formas de mudar suas práticas, buscando romper com os caminhos neutralizados, buscando uma aproximação entre as vigilâncias, pois havia muito conflito relacionado a questões técnicas advindas da formação diversificada entre os profissionais que atuam na área. Hoje a busca de novos caminhos foi possível pela mudança da percepção dos profissionais apenas, sem a imposição da gestão, ao perceberem a necessidade de reorganizar o serviço de vigilância hospitalar de forma horizontalizada, construindo um diagnóstico com múltiplos olhares/saberes, como práticas aliançadas com a transformação da realidade de sua unidade hospitalar. Alguns apontam a necessidade de se discutir um novo conceito para Vigilância Hospitalar, capaz de reconhecer além da vigilância das infecções hospitalares e vigilância epidemiológica, capaz de incluir também a vigilância ambiental, assim o conceito de vigilância em saúde no território hospitalar deve possibilitar uma visão mais ampla para a VH. Esta vem enfrentando dificuldades ao tentar reorganizar suas práticas, principalmente em sua infra-estrutura, e os recursos humanos têm sido o maior problema. Reconhecem que um serviço de VH requer normas, fluxos, protocolos, etc. para integrar suas práticas, o que exige construir a integração. Embora acreditem que a integração não deva começar pela mudança da estrutura do serviço, mas pelo processo de trabalho, esperam que, ao final dessa construção, seja criada uma regulamentação que proponha a integração das vigilâncias, efetivando a proposta. / This study discusses the integration between surveillances in hospitals (epidemiological surveillance and hospital infections control), analyzing the possibilities and impossibilities of such integration. It assesses the historical and political aspects, and the theoretical and practical concepts of services organizations in hospital surveillance, trying to identify the differences and similarities between both surveillances. The initial analysis allowed examining how limits imposed by the specificities of each surveillance help their practice in a non-integrated way. Then a qualitative research was carried out, through interviews with focal groups that work in hospital surveillance and epidemiological surveillance in hospitals, and in the hospital infection controlling committee. The material collected from the focal groups was analyzed through categories that arose from this same material. Hospital surveillances have been trying to change their practices, trying to break with neutralized ways, since there were many conflicts concerning technical issues coming from the differentiated formation of professionals who work in this field. Nowadays the search for new ways has been made possible by the change of perception among these professionals only, not imposed by managers, when they realized the need to reorganize hospital surveillance in a horizontal manner, building a diagnosis with multiple lights/knowledge, as practices committed to transforming reality in their hospital unit. Some point to the need of discussing a new concept for hospital surveillance, able to recognize hospital infection and epidemiological surveillances, as to include environmental surveillance, so the concept of health surveillance in hospital will allow a wider view of hospital surveillance. This one has hardly reorganized its practices, mainly its infrastructure, and human resources are the main problem. They realize that hospital surveillance demands rules, trends, protocols etc. to integrate their practices, and this requires integration. Although they believe integration must not start with changes in the services structure, but in the work process, they hope that, after this construction, legislation is created to propose integration among surveillances, thus making this proposal affective.
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Fatores preditivos para o resultado de tratamento da tuberculose pulmonar no município de Recife-PE: uma contribuição para as ações de vigilância epidemiológica / PREDICTIVE FACTORS OF PULMONARY TUBERCULOSIS TREATMENT OUTCOMES IN RECIFE-PE: a contribution to epidemiological surveillance actions

Cinthia Midori Sassaki 21 December 2006 (has links)
O objetivo desta investigação foi identificar e analisar fatores preditivos para o resultado favorável de tratamento dos casos de tuberculose pulmonar, diagnosticados no período de 2001 a 2004 e residentes no município de Recife-PE. Inicialmente, foi realizado um estudo exploratório para identificar dados perdidos (brancos, ignorados e inconsistentes) nos dados selecionados no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN): ano do diagnóstico; município de residência; desfecho do tratamento; idade; sexo; escolaridade; ocupação; distrito de residência; forma clínica; tipo de entrada; tratamento supervisionado; data diagnóstico, início e encerramento do tratamento; distrito da unidade de saúde; HIV e outros agravos. Observou-se registros em branco nos dados Outros Agravos (42,85%) e Ocupação (82,10%); ignorados, nos dados Escolaridade (39,40%), Outros Agravos (39,73%) e Tratamento Supervisionado (63,96%) e inconsistentes, nos dados Ocupação (2,53%), Data do diagnóstico (0,98%), Data do início do tratamento (9,94%) e Data do encerramento do tratamento (17,66%). Posteriormente, foram identificados e analisados os fatores preditivos ao resultado favorável de tratamento por meio de métodos estatísticos uni e multivariado de regressão logística. Na análise univariada, as variáveis que apresentaram associação foram: sexo; idade; escolaridade; tipo de entrada; tratamento supervisionado; Tempo 1; Tempo 2 e distrito da unidade de saúde. As variáveis que permaneceram no modelo multivariado ajustado final foram: Idade, 0 a 9 anos (OR=4,27; p=0,001) e 10 a 19 anos (OR=1,78; p=0,011) que tiveram maior chance de cura do que mais de 60 anos; Escolaridade, 8 a 11 anos (OR=1,52; p=0,049) que teve maior chance de cura do que nenhuma escolaridade; Tipo de entrada, casos novos (OR=3,31; p<0,001) e recidiva (OR=3,32; p<0,001) que tiveram maior chance de cura do que reingresso pós abandono; Tempo 2, 5 ¾| 6 meses(OR=9,15; p<0,001); 6 ¾| 9 meses (OR=27,28; p<0,001) e Mais de 9 meses (OR=24,78; p<0,001) que tiveram maior chance de cura do que aqueles que o fizeram em tempo menor; Distrito da Unidade de Saúde, DS I (OR=1,60; p=0,018) e DS IV (OR=2,87; p<0,001) que tiveram maior chance de cura do que DS VI. Sugere-se desenvolver nos serviços de saúde uma organização de assistência voltada às necessidades individuais priorizando os grupos com menor chance de cura garantindo a equidade da atenção e conseqüentes transformações nos indicadores epidemiológicos da tuberculose no município de Recife. / This study aimed to identify and analyze predictive factors of favorable treatment outcome related to pulmonary tuberculosis cases residing in Recife and diagnosed between 2001 and 2004. Initially, an exploratory study was carried out to identify lost data (blank, unknown and inconsistent) in the selected data in the Reportable Health Events Information System (SINAN): year of diagnosis; city of residence; treatment outcome; age; gender; education level; occupation; district of residence; form; type of entry; Supervised Treatment; date of diagnosis, start and end of treatment; health unit district; HIV and other health problems. Blank registers were found for Other Health Problems (42.85%) and Occupation (82.10%); unknown data were found for Education level (39.40%), Other Health Problems (39.73%) and Supervised Treatment (63.96%); and inconsistent data for Occupation (2.53%), Date of diagnosis (0.98%), Treatment start date (9.94%) and Treatment end date (17.66%). Then, we identified and analyzed predictive factors of favorable treatment outcome by means of uni and multivariate logistic regression methods. In univariate analysis, the following variables were associated with favorable treatment outcome: gender; age; education level; type of entry; supervised treatment; Time 1; Time 2 and health unit district. The variables that remained in the final adjusted multivariate model were: Age, 0 to 9 years (OR=4.27; p=0.001) and 10 to 19 years (OR=1.78; p=0.011) had a greater chance of cure than those older than 60 years; Education, 8 to 11 years (OR=1.52; p=0.049) had greater chance of cure than no education; Type of entry, new cases (OR=3.31; p<0.001) and relapse (OR=3.32; p<0.001) had a greater chance of cure than reentry after abandonment; Time 2, 5 ¾| 6 months (OR=9.15; p<0.001); 6 ¾| 9 months (OR=27.28; p<0.001) and More than 9 months (OR=24,78; p<0,001) had greater chance of cure than patients who terminated treatment in less time; Health Unit District, DS I (OR=1.60; p=0.018) and DS IV (OR=2.87; p<0.001) had a greater chance of cure than DS VI. We suggest that health services develop a care organization that is directed at individual needs, prioritizing groups with lower chances of cure, guaranteeing equity and consequent transformations in the city s epidemiological TB indices.

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