Os norovírus (NV) são uma importante causa de hospitalização infantil. Crianças internadas por gastroenterite por NV (GENV) são consideradas portadoras de diarreia grave. O objetivo desse estudo, realizado na cidade do Rio de Janeiro, Brasil, é descrever as características clínicas e a frequência da diarreia por NV em crianças hospitalizadas, comparando as taxas de detecção de NV em crianças vacinadas e não vacinadas contra rotavírus (Rotarix). Foram coletadas 659 amostras de fezes de igual número de crianças e encaminhadas para análise pela reação em cadeia pela polimerase, precedida de transcrição reversa no período de janeiro de 2004 a dezembro de 2009. O percentual de amostras positivas para os NV foi de 27,3% nesse período. Das 180 amostras positivas para NV, 55% tiveram origem na comunidade (aqCo) e 45% foram de aquisição nosocomial (aqNo). O percentual de GENV nos dois anos anteriores (2004 e 2005) à introdução da vacina Rotarix foi de 28,3%, sendo 11,3% o percentual de amostras aqCo. Nos dois anos posteriores (2008 e 2009), a GENV significou 24,4%, e as amostras aqCo foram 14,9% (p<0,05). Em 647 crianças, 494 não receberam a vacina Rotarix, enquanto 151 crianças receberam, pelo menos, uma dose. O percentual de GENV foi de 23,8% e 39,7%, respectivamente (p<0,05). Apesar do comportamento sazonal dos casos de GENV aqCo, esse fato não teve significância estatística. Das 180 crianças, 61,6% tinham peso &#8804; p10 do NCHS, 82,2% tinham idade &#8804; 5anos. As crianças com idade &#8804; 2 anos foram mais acometidas nos casos de aqCo do que àquelas de aqNo (p<0,05). Foram observados em 82 crianças: vômitos (73,2%), febre (54,9%), tosse (20,7%), coriza (2,2%), sangue nas fezes (8,5%), erupção cutânea (4,9%) e broncoespasmo (7,3%). Houve significância estatística com relação à frequência maior de febre, coriza, tosse e broncoespasmo nas crianças com GENV de aqCo do que naquelas de aqNo (p<0,05). De 69 crianças, 73,9% apresentaram desidratação e, dessas, 76,5% necessitaram de hidratação venosa. Esses dados tiveram significância estatística, representada por maiores percentuais nas crianças com GENV de aqCo do que naquelas de aqNo (p<0,05). Esse estudo demonstra que os NV foram um importante agente etiológico nos casos de gastroenterites em crianças hospitalizadas e responsável por altas taxas de infecções nosocomiais. Estatisticamente, não foi comprovada uma tendência de aumento dos casos de GENV no período do estudo, como também do aumento da frequência de GENV nos anos posteriores em relação aos anos anteriores à introdução da vacina Rotarix no Brasil em 2006. No entanto, houve significância estatística quando foi avaliado o percentual de GENV em crianças hospitalizadas vacinadas e não vacinadas contra RV. Um aumento dos casos de GENV em crianças poderá vir a acontecer nos próximos anos, quando é esperado que um número maior de crianças será vacinado contra RV. Tosse, coriza e broncoespasmo são sintomas que devem ser mais detalhadamente investigados. Estratégias de prevenção contra a disseminação dos NV são condutas importantes em unidades de internação. Uma vacina eficaz contra norovírus pode ser um benefício significativo para reduzir o percentual de crianças hospitalizadas por diarreia. / Noroviruses (NV) are a major cause of infant hospitalization. Children hospitalized for gastroenteritis NV (NVGE) are considered to have severe diarrhea. The purpose of this study, conducted in the city of Rio de Janeiro, Brazil, is to describe the clinical characteristics and frequency of norovirus diarrhea in hospitalized children, comparing the rates of detection of NV in vaccinated and unvaccinated children against rotavirus (RV). We collected 659 fecal samples from equal numbers of children and sent for analysis by polymerase chain reaction, reverse transcription from January 2004 to December 2009. The percentage of samples positive for NV was 27.3% in this period. Of the 180 samples positive for NV, 55% meant source community (Coaq) and 45% of nosocomial acquisition (Noaq). The percentage of NVGE the previous two years (2004 and 2005) the introduction of the vaccine against RV was 28.3% and 11.3% represented the percentage of samples Coaq. In the two subsequent years (2008 and 2009), NVGE meant to 24.4%, and the samples were Coaq 14.9% (p <0.05). In 647 children, 494 received no vaccine against RV while 151 children received at least one dose. The percentage of NVGE was 23.8% and 39.7%, respectively (p <0.05). Despite the seasonal behavior of NVGE aqCo cases, this did not reach statistical significance. Of the 180 children, 61.6% had weight &#8804; p10 NCHS, 82.2% were aged &#8804; 5 years old. Children aged &#8804; 2 years were most affected in cases of Coaq than those of Noaq (p <0.05). Were observed in 82 children: vomiting (73.2%), fever (54.9%), cough (20.7%), coryza (2.2%), blood in stools (8.5%), rash (4.9%) and bronchospasm (7.3%). There was statistical significance with respect to the higher frequency of fever, coryza, coughing and wheezing in children with NVGE of Coaq than those of Noaq (p <0.05). Of 69 children, 73.9% had dehydration and of these, 76.5% required intravenous hydration. These data were statistically significant, represented by the highest percentage of children with NVGE of Coaq than those of Noaq (p <0.05). This study demonstrates that the NV were an important etiologic agent in cases of gastroenteritis in hospitalized children and responsible for high rates of nosocomial infections. Statistically, , it was not shown a tendency to increase in cases of NVGE during the study period, as well as the increased frequency NVGE in later years relative to years prior to the introduction of RV vaccine in Brazil. However, statistical significance was assessed as the percentage of NVGE in hospitalized children vaccinated and unvaccinated against RV. An increase in cases of children in NVGE could happen in the next few years, when it is expected that a greater number of children will be vaccinated against RV. Cough, coryza and wheezing are symptoms that should be further investigated. Strategies for preventing the spread of NV are important conduits in inpatient units. An effective vaccine against norovirus can be a significant benefit to reduce the percentage of children hospitalized for diarrhea.

Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2017-04-25T15:22:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_Alana_Tavares.pdf: 523511 bytes, checksum: 0e4a085043934dadf9915c93d3f924f5 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-04-25T17:21:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_Alana_Tavares.pdf: 523511 bytes, checksum: 0e4a085043934dadf9915c93d3f924f5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-25T17:21:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_Alana_Tavares.pdf: 523511 bytes, checksum: 0e4a085043934dadf9915c93d3f924f5 (MD5) Previous issue date: 2015-02-23 / Sem bolsa / Este trabalho foi realizado com o objetivo de determinar as possíveis fontes de contaminação de Yersinia enterocolitica em diferentes pontos do processo de ordenha de vacas leiteiras em oito propriedades da região de Pelotas, RS, distribuídos em quatro períodos diferentes ao longo de um ano. Y. enterocolitica é uma bactéria psicrotrófica, responsável por causar gastroenterite em humanos, principalmente em bebês e crianças, a partir do consumo de água ou alimentos contaminados, sendo o leite cru um destes. Foram analisadas amostras de leite cru de conjunto logo após a ordenha, água de estábulo leiteiro, mão de ordenhador, balde de recolhimento do leite e insuflador de teteiras. As amostras de leite cru e água foram coletadas em frascos estéreis e as amostras de mão de ordenhador, balde e teteiras foram coletadas com o auxilio de zaragatoas estéreis. As amostras de leite cru foram submetidas a um pré-enriquecimento em água peptonada tamponada a 4°C durante 30 dias, sendo posteriormente incubadas em caldo PSTA, adicionado de ampicilina, a 28°C durante 48h. As amostras de água foram filtradas em membrana de éster de celulose e incubadas em caldo TSB a 30°C durante 24h. As amostras de leite após incubação em PSTA, as membranas utilizadas na filtragem da água incubadas em TSB, bem como o material de mãos, balde e teteiras coletadas nas zaragatoas, foram semeadas em ágar MacConkey e incubados a 30°C durante 24h, para a obtenção de colônias. Colônias características foram analisadas através de duplex PCR para confirmação da espécie. Os perfis moleculares dos isolados de Y. enterocolitica foram comparados utilizando a técnica de rep-PCR. Y. enterocolitica foi isolada de 9,37% (3/32) das amostras de leite, 6,25% (2/32) das amostras de água e 12,5% (4/32) das amostras de mão. Não houve similaridade no perfil de bandas dos isolados encontrados, entretanto foi identificada a presença de cepas diferentes na mesma amostra, demonstrando uma variedade grande de cepas distribuídas no ambiente. A presença de Y. enterocolitica em leite cru no Brasil é preocupante, já que uma quantidade considerável do produto ainda é comercializado de forma clandestina, expondo o consumidor ao risco de infecção pela bactéria, ao consumi-lo sem tratamento térmico adequado. / This work was performed in order to determine the possible Yersinia enterocolitica contamination sources at different points of the dairy cows milking process in eight properties of Pelotas, RS, over four different periods distributed in a year. Y. enterocolitica is a psychrotrophic bacterium responsible for causing gastroenteritis in humans, especially in infants and children, from the consumption of contaminated water or food, and raw milk. Raw milk samples were analyzed immediately after milking, water of milking parlor, milker’s hands, milk collection bucket and inflator liners. The samples of raw milk and water were collected in sterile bottles and milker hand samples, bucket and liners were collected with sterile swabs. The raw milk samples were subjected to a pre-enrichment peptone water buffered at 4°C for 30 days and subsequently incubated in PSTA broth ampicillin added at 28°C for 48h. Water samples were filtered through cellulose ester membrane and incubated in TSB medium at 30°C for 24h. The milk samples after incubation in PSTA, the TSB where the membranes used in water filtration were incubated and the material of the hands material, bucket and liners collected in the swabs were plated on MacConkey agar and incubated at 30°C for 24h, to obtain colonies. Characteristics colonies were analyzed by duplex PCR to confirm the species. The molecular profiles of Y. enterocolitica isolates were compared using rep-PCR. Y. enterocolitica was isolated from 9,37% (3/32) of milk samples, 6,25% (2/32) of water samples and 12,5% (4/32) of hand samples. There weren’t similarities in the band profile of the isolates found, however showed the presence of different strains of the same sample, demonstrating a variety of strains distributed in the environment. The presence of Y. enterocolitica in raw milk in Brazil is dangerous, considering that the product is sold clandestinely, exposing consumers to the risk of infection by the bacterium, to consume it without proper heat treatment.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:26:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Talissa de Morais Tavares.pdf: 2094396 bytes, checksum: cca589203914a2c676b55bcf55e62bbc (MD5) Previous issue date: 2008-04-28 / Group A rotaviruses are the major cause of gastroenteritis in children throughout the world. Epidemiological surveys and molecular analysis of rotavirus strains are required for gastroenteritis control and prevention. Studies using VP6, an important immunogenic structural protein, and NSP4, a transmembrane nonstructural glycoprotein which is critical to rotavirus morphogenesis and pathogenesis, have been performed. In this study, 330 rotavirus-positive fecal samples previously obtained from children with or without diarrhea, between 1987 and 2003, in three cities of Central West Region of Brazil (Goiânia, Brasília and Campo Grande), were characterized for VP6- and NSP4-encoding genes. The VP6 and NSP4 genes were amplified by reverse transcription- polymerase chain reaction followed by sequencing and phylogenetic analysis. Detection rates of 84.8% and 78.5% were observed for VP6 and NSP4 genes, respectively. Two distinct genotypes could be recognized for NSP4 (A and B). It was observed that the G9P[6] samples were associated with genotype A, whereas the G1P[6], G1P[8], G2P[8], G3P[8], G4P[8] and G9P[8] samples were associated with genotype B. The analysis of VP6 gene allowed genogrouping of samples in two clusters, genogroups I and II. The G2P[4], G3P[4] and G9P[6] samples were identified as genogroup I, whereas the G1P[6], G1P[8], G2P[8], G4P[6], G4P[8] and G9P[8] samples were identified as genogroup II. In addition, it was showed that samples identified as VP6 genogroup I were associated with NSP4 genotype A and samples identified as VP6 genogroup II were associated with NSP4 genotype B. This investigation described different genetic groups representing diversity of group A rotavirus samples circulating in the Central West Region of Brazil. / Os rotavírus do grupo A são considerados como os principais agentes de gastroenterite em crianças em todo o mundo. Investigações de vigilância epidemiológica e molecular são importantes para o controle e prevenção da doença. Nesse sentido, destacam-se os estudos utilizando VP6, proteína estrutural que se tem mostrado como a mais imunogênica, e NSP4, uma glicoproteína não estrutural transmembrana envolvida na morfogênese e patogênese viral. No presente estudo, 330 amostras de rotavírus coletadas de 1987 a 2003, provenientes de espécimes fecais de crianças com ou sem diarréia, em três cidades da Região Centro-Oeste do Brasil (Goiânia, Brasília e Campo Grande), foram caracterizadas em relação aos genes que codificam as proteínas VP6 e NSP4. Inicialmente, foi feita a amplificação dos genes de VP6 e NSP4 pela reação em cadeia pela polimerase pós-transcrição reversa, seguida do seqüenciamento genômico e de análise filogenética. Os genes de VP6 e NSP4 foram detectados em 84,8% e 78,5% das amostras, respectivamente. Dois genótipos de NSP4 foram identificados (A e B). Foi observado que as amostras G9P[6] associaram-se ao genótipo A e as amostras G1P[6], G1P[8], G2P[8], G3P[8], G4P[8] e G9P[8] associaram-se ao genótipo B. A análise do gene VP6 permitiu a identificação de dois genogrupos distintos (I e II). As amostras G2P[4], G3P[4] e G9P[6] foram caracterizadas como genogrupo I, enquanto as amostras G1P[6], G1P[8], G2P[8], G4P[6], G4P[8] e G9P[8] foram caracterizadas como genogrupo II. Ainda foi evidenciado que as amostras genogrupo I de VP6 estavam associadas com genótipo A de NSP4, e as amostras genogrupo II de VP6 estavam associadas com genótipo B de NSP4. A presente investigação identificou diferentes variantes genéticas, mostrando a diversidade dos rotavírus do grupo A circulantes na Região Centro-Oeste do Brasil.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:56:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Saick Genotipos Rotavirus.pdf: 1758385 bytes, checksum: 51837cea2c3389401234f70c01e946ff (MD5) Previous issue date: 2007-09-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os rotavirus do grupo A (RVA) são uma das principais causas de diarréia aguda em crianças até cinco anos tanto em países desenvolvidos como em desenvolvimento. O virion possui genoma constituído por 11 segmentos de RNAdf, contido por um triplo capsídeo concêntrico, cujo padrão de migração após eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA) permite a classificação em grupos (A-G) e em perfis longo, curto e super-curto. O capsídeo externo é formado pelas proteínas VP4 e VP7, cujos genes formam a base do sistema de classificação em genótipos P e G, respectivamente. O conhecimento dos genótipos de RVA em uma determinada área geográfica é essencial para o estabelecimento e o monitoramento de estratégias preventivas. Considerando a carência de estudo de genotipagem no Espírito Santo, esta pesquisa se propôs: i) determinar os genótipos de RVA obtidos de crianças com diarréia aguda, residentes na Região Metropolitana de Vitória - ES, provenientes do Pronto Socorro do Hospital Infantil Nossa Senhora da Glória (PS-HINSG) (80/253), entre fevereiro de 2003 e junho de 2004 e; ii) determinar a freqüência e os genótipos de RVA em crianças atendidas na emergência (n=5) ou hospitalizadas (n=63) na pediatria do Hospital CIAS-UNIMED, entre julho de 2004 e novembro de 2006. RNAdf viral foi extraído a partir de suspensão fecal, através do método de guanidina-sílica. EGPA foi realizado nas amostras do CIAS/UNIMED para detecção de RVs e determinação do perfil eletroforético. DNA complementar foi sintetizado por transcrição reversa utilizando o iniciador randômico pdN6 TM. PCR foi realizado utilizando um par de iniciadores consenso para VP4 (4con2/4con3) ou para VP7 (9con1/9con2) e os produtos foram utilizados na Multiplex semi-nested PCR com iniciadores específicos para G e P (G1-G5, G9, P[4], P[6], P[8], P[9]). Das cepas de RVA do PS-HINSG, observou-se os genótipos G1P[8] (83,6%), G9P[8] (7,5%), G1P[4] (2,5%), G1P[6] (1,3%), G4P[6] (1,3%) e G?P[8] (3,8%). Das amostras obtidas no CIAS/UNIMED, 20,6% (14/68) foram positivas para RVA, quatro e dez com perfis curto e longo, respectivamente. Destas cepas, foram observados os genótipos G9P[8] (50%), G2P[4] (28,7%), G2P[8], G1P[8] e G?P[8] (7,1%, cada). Nenhuma infecção mista foi observada em ambos hospitais. Estes dados revelam: i) G1P[8] e G9P[8], genótipos prevalentes no PS-HINSG e no CIAS/UNIMED, espectivamente; ii) G9P[8], detectado no final do período de coleta das amostras do PS-HINSG, sugere flutuação temporal na circulação; iii) G2P[4], encontrado somente em 2006 nas crianças hospitalizadas. Os resultados obtidos sugerem que a vacina Rotarix® utilizada no Brasil poderá ser eficiente em reduzir o número de casos e a gravidade da doença na região do estudo. Entretanto, destaca-se o surgimento do genótipo G2 para o qual a vacina apresenta menor proteção, reforçando a necessidade de vigilância contínua dos genótipos circulantes como monitoramento da eficácia da vacina. / Group A rotaviruses (RVA) are a major cause of acute diarrhea in children up to 5 years in both developing and developed countries. The virion consists of 11 double-stranded RNA (dsRNA) genome enclosed in a triple-shelled capsid, which migration pattern in polyacrilamide gel eletrophoresis (PAGE) permit the classification in groups (A-G) and in long, short and super-short profiles. The outer shell is composed by VP4 and VP7 proteins which genes form the basis of the classification system in P and G genotypes, respectively. The knowledge about RVA genotypes distribution is essential for the establishment and the monitoring of preventive strategies. Considering the lack of these studies in Espírito Santo State, this investigation proposed: i) to determine RVA genotypes obtained from children with acute diarrhea, resident in Metropolitan region of Vitória - ES, from the Emergency Room at Hospital Infantil Nossa Senhora da Glória (HINSG) (80/253), collected between February 2003 and June 2004 and; ii) to determine the frequency and RVA genotypes in children attended at Emergency (n=5) or hospitalized (n=63) from Pediatric Setor of CIAS/UNIMED hospital, between July 2004 and November 2006. dsRNA were extracted from fecal suspensions by guanidine-silica procedure. PAGE was performed in CIAS/UNIMED samples for rotaviruses detection and eletropherotype determination. Complementary DNA was obtained by reverse transcription with pdN6 TM random primer. PCR were done with a pair of consensus primers for VP4 (4con2/4con3) or VP7 (9con1/9con2) and the products were submitted to Multiplex semi-nested PCR with specific primers for the G and P types (G1-G5, G9, P[4], P[6], P[8], P[9]). RVA genotypes observed from HINSG were G1P[8] (83.6%), G9P[8] (7.5%), G1P[4] (2.5%), G1[6] (1.3%), G4P[6] (1.3%) and G?P[8] (3.8%). Among samples stools from CIAS/UNIMED, 20.6% (14/68) were RVA positive, four and ten with short and long eletropherotypes, respectively. The following genotypes were observed: G9P[8] (50%), G2P[4] (28.7%), G2P[8], G1P[8] and G?P[8] (7%, each). No mixed infection was observed in both hospitals. These data reveal: i) G1P[8] and G9P[8] were the most common genotypes from HISNG and CIAS/UNIMED, respectively; ii) G9P[8] was detected in the end of the samples obtainment, suggesting temporal fluctuation on genotype circulation; iii) G2P[4] was found only in 2006 from hospitalized children. The results suggest that RotarixTM vaccine used in Brazil may efficiently reduce the severity and the number of RVA cases in the region studied. However, it must be emphasize the emergence of G2 type for which the vaccine shows lower protection, reforcing the need of continuous surveillance of RVA genotypes as vaccine efficacy monitoring.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-13T10:36:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thairiny Neres Silva - 2017.pdf: 2022674 bytes, checksum: a9ff46169fe46df4f2909e2719e18791 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-13T10:36:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thairiny Neres Silva - 2017.pdf: 2022674 bytes, checksum: a9ff46169fe46df4f2909e2719e18791 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T10:36:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thairiny Neres Silva - 2017.pdf: 2022674 bytes, checksum: a9ff46169fe46df4f2909e2719e18791 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-10-03 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Sapoviruses are important agents causing acute gastroenteritis worldwide, and are most often detected in children under five years of age. The present study aimed to evaluate the positivity and viral load index of sapovirus in faecal samples and nasopharyngeal swab of children, in association with the symptoms presented by these children. The study included 102 children hospitalized at the Hospital Materno Infantil, presenting symptoms of gastroenteritis, attended between May 2014 and May 2015, with a sample of faeces and a nasopharyngeal swab sample from each of them. Samples of faeces and nasopharyngeal swabs from all children were submitted to extraction of the genetic material from a commercial kit and screened for sapovirus by RT-qPCR. The viral load was determined by constructing a standard curve from recombinant plasmid. A faecal sample and a nasopharyngeal swab sample were obtained and 47% of the children were positive for sapovirus in at least one of the samples collected, being 10.7% positive only in faecal samples and 28.4% positive only in the samples of nasopharyngeal swab. Regarding viral load, a median of 7.77 x 108 CG / mL was found for stool samples. Regarding the viral load of the nasopharyngeal swab samples, a median 1.54 x 108 CG / mL was observed and a statistically significant result was observed (13/14 p = 0.01), for the samples with viral load above the median obtained in the rainy season. The median viral load of samples from positive children in both clinical specimens was 2.33 x 108 CG / mL in the faeces and 2.67 x 108 CG / mL in the nasopharyngeal swab. Two of these children presented a considerably higher viral load when compared to the others. It is hoped that the data obtained may contribute to a better understanding of the molecular epidemiology of sapoviruses, as well as to the development of better preventive measures, in order to limit the risk of transmission of sapoviruses, especially in a hospital environment. This is the first study to carry out the research and detection of sapovirus in a respiratory tract sample, which could suggest a possible alternative route of viral transmission. / Sapovírus são importantes agentes causadores de gastroenterite aguda no mundo todo, sendo mais frequentemente detectados em crianças menores de cinco anos. O presente estudo teve como objetivo, avaliar o índice de positividade e carga viral de sapovírus em amostras de fezes e swab nasofaringeano de crianças, em associação com os sintomas apresentados por essas crianças. Participaram do estudo 102 crianças hospitalizadas no Hospital Materno Infantil, apresentando sintomas de gastroenteríte, atendidas entre o período de maio de 2014 a maio de 2015, sendo obtidas uma amostra de fezes e uma amostra de swab nasofaringeano de cada uma delas. As amostras de fezes e de swab nasofaringeano de todas as crianças, foram submetidas a extração do material genético a partir de kit comerciale triadas para sapovírus por RT-qPCR. A carga viral foi determinada através da construção de uma curva padrão, a partir de plasmídeo recombinante. Foram obtidas uma amostra de fezes e uma de amostra de swab nasofaringeano sendo 47% das crianças foram positivas para sapovírus em pelo menos uma das amostras coletadas, sendo 10,7% positivas apenas nas amostras de fezes e 28,4% positivas apenas nas amostras de swab nasofaringeano. Em relação a carga viral constatou-se uma mediana 7,77 x 10 8 CG/mL para as amostras de fezes. Em relação a carga viral das amostras de swab nasofaringeano, foi observada uma mediana 1,54 x 10 8 CG/mL e um resultado estatisticamente significativo foi observado (13/14 p= 0,01), para as amostras com carga viral acima da mediana obtidas no período chuvoso. A mediana da carga viral das amostras proveniente das crianças com positividade em ambos espécimes clínicos foi de 2,33 x 10 8 CG/mL nas fezes e de 2,67 x 10 8 CG/mL nos swab nasofaringeano. Duas dessas crianças apresentaram carga viral consideravelmente mais elevada, quando comparada com as demais. Espera-se que os dados obtidos possam contribuir para um melhor entendimento da epidemiologia molecular dos sapovírus, bem como para que melhores medidas preventivas sejam desenvolvidas, a fim de limitar os riscos de transmissão dos sapovírus, especialmente em ambiente hospitalar. Este é o primeiro estudo a realizar a pesquisa e detecção de sapovírus em amostra do trato respiratório, o que poderia sugerir uma possível rota alternativa de transmissão viral.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-10-18T15:23:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoAntigenicaMolecular.pdf: 852780 bytes, checksum: 806b4dbb0193f1fa8e86dda957e30ca4 (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-11-14T12:28:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoAntigenicaMolecular.pdf: 852780 bytes, checksum: 806b4dbb0193f1fa8e86dda957e30ca4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-14T12:28:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoAntigenicaMolecular.pdf: 852780 bytes, checksum: 806b4dbb0193f1fa8e86dda957e30ca4 (MD5) Previous issue date: 2006-07-03 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A mortalidade infantil permanece como um importante problema de saúde pública em escala mundial, principalmente nos países em desenvolvimento. Dos mais de 50 agentes etiológicos implicados nessa moléstia, os rotavírus se destacam por estarem associados a 111 milhões de episódios diarréicos, resultando em mais de 600.000 óbitos entre crianças menores de cinco anos, dos quais 82% são notificados nos países mais pobres do mundo. O estudo em questão objetivou a caracterização antigênica e molecular de amostras de rotavírus do tipo G1, obtidas de crianças participantes de estudos em gastroenterites virais, no período de 1982 a 2003, em Belém, Pará, Brasil. Cento e quarenta e oito espécimes de rotavírus G1 foram analisados na presente investigação. A prevalência global do tipo G1 foi de 41,3%, sendo que a freqüência deste genotipo no decorrer dos estudos analisados variou de 11,0% a 67,6%. A caracterização dos eletroferotipos, sorotipos G e genotipos P de rotavírus G1 ocorreram em freqüências de 78,4%, 89,9% e 87,8%, respectivamente. Foram identificadas três variedades de eletroferotipos longo, sendo que a variedade L1 foi encontrada com maior freqüência (79,3%). Os sorotipos G1, G9 e G1+G4 foram detectados em 88,0%, 9,8% e 2,2% dos espécimes, respectivamente. Detectou-se a infecção mista G1+G4 em uma amostra. A combinação binária prevalente foi P[8],G1, sendo responsável por 72,3% dos casos. Infecções mistas circularam em percentual de 20,0% , sendo detectados os genotipos P[4]+P[8],G1, P[6]+P[8],G1, P[4]+P[6],G1, P[4]+P[6]+P[8],G1 e P[6]+ P[8],G1+G4. O tipo G1 circulou do 2° ao 35° meses de idade e registrou-se maior número de casos na faixa compreendida entre 6 a 16 meses de idade. Não se verificou diferença de gravidade entre as variedades genotípicas G1 e outros tipos de rotavírus. A presente análise assume um caráter pioneiro no Brasil, permitindo ampliar os conhecimentos acerca da diversidade antigênica e molecular das infecções pelo tipo G1 de rotavírus e esses resultados permitirão entender a complexidade genética de tais agentes virais. / Infant mortality remains an important problem of public health worldwide, mainly in developing countries. Of more than the 50 etiologic agents implied in this disease, rotavirus causes 111 million episodes of diarrhoea, resulting in more than 600,000 deaths among children less than five years, of which 82% are notified in the poorest countries of the world. This study aimed at the antigenic and molecular characterization of G1 rotavirus strains among children participanting of viral gastroenteritis studies, carried out from 1982 to 2003, in Belém, Pará, Brazil. One hundred and forty-eight specimens of G1 rotavirus were analyzed in the present investigation. Overall, the prevalence of the G1 type was of 41.3%, being that frequencies of this genotype through studies ranged from 11.0% to 67.6%. Eletropherotypes, G serotypes and P genotypes characterization of G1 rotavirus occurred in frequencies of 78.4%, 89.9% and 87.8%, respectively. Three long eletropherotypes varieties were identified, being that the L1 variety was found frequently (79.3%). The G1, G9 and G1+G4 serotypes were detected in 88.0%, 9.8% and 2.2% of the specimens, respectively. Mixed infection by G1+G4 genotype was detected in one sample. The prevalent binary combination was P[8],G1, being responsible for 72.3% of the cases. Mixed infections circulated in percentage of 20.0%, including genotypes P[4]+P[8],G1, P[6]+P[8],G1, P[4]+P[6],G1, P[4]+P[6]+P[8],G1 and P[6]+P[8],G1+G4. The G1 genotype circulated among 2nd to 35th months of age and a highest number of cases was registered between 6 to 16 months of age. Clinical severity differences among G1 and other genotypes of rotavirus were not verified. The present analysis gathers pioneer findings in Brazil, allowing to extend the knowledge concerning the antigenic and molecular diversity of the infections by G1 rotavirus and these results will allow to understand the genetic complexity of such viral agents.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-03-18T22:13:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EficaciaClinicaVacina.pdf: 66114716 bytes, checksum: 787dcfd6b603abd9f8aa5a7844e0815d (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-03-20T17:15:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EficaciaClinicaVacina.pdf: 66114716 bytes, checksum: 787dcfd6b603abd9f8aa5a7844e0815d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-03-20T17:15:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EficaciaClinicaVacina.pdf: 66114716 bytes, checksum: 787dcfd6b603abd9f8aa5a7844e0815d (MD5) Previous issue date: 1999 / Acumulam-se evidências presentemente, indicando que o efetivo controle das gastroenterites por rotavírus só poderá ser alcançado com o advento de um imunizante eficaz para uso nos primeiros meses de vida. Com o objetivo de avaliar a eficácia da vacina geneticamente rearranjada, rhesus-humana, tetravalente (RRV-TV, 4 X 10(4) pfu/dose) frente aos parâmetros clínicos mais relevantes das gastroenterites por rotavírus, procedeu-se ao reexame de 91 episódios diarréicos em crianças no âmbito de uma investigação prévia conduzida em Belém, Pará, Brasil. As informações para o estudo foram obtidas a partir de dados contidos em fichas utilizadas na rotina de vigilância dos episódios diarréicos, bem como daqueles com registro clínico diário enquanto persistisse a diarréia. A eficácia relativa foi especificamente avaliada frente aos seguintes indicadores clínicos de gravidade: a) duração da diarréia; b) número máximo de evacuações líquidas/semilíquidas por dia; c) duração dos vômitos; d) número máximo de vômitos/24h; e) febre (temperatura retal); f) desidratação; e g) necessidade de tratamento. A gravidade clínica global das gastroenterites por rotavírus foi determinada por um sistema de escores (somatória máxima de 20 pontos) que permitiu classificar os episódios diarréicos em: leves (0-8), moderados a severos (9-14) e muito graves (>14). Uma significativa (p<0,05) proteção conferida pela RRV-TV foi observada em cinco das sete condições clínicas avaliadas, quais sejam: a) duração da diarréia (episódios puros, eficácia de 52%); b) número máximo de evacuações líquidas/semilíquidas por dia (todos os episódios, 42% e os puros, 53%); c) número máximo de vômitos (todos, 56% e os puros, 62%); d) desidratação (todos, 46%) Elevados índices de proteção foram obtidos frente aos episódios associados ao sorotipo G2, durante o segundo ano de acompanhamento, se considerados o número máximo e a duração de vômitos: 90% e 100% respectivamente. Ainda em relação ao tipo G2, a eficácia cumulativa foi de 100% contra os episódios com escore clínico >14. Taxas similares de eficácia frente às infecções mistas (35%) e puras (37%) foram registradas nos dois anos de estudo. Embora não se tenha registrado proteção quanto aos casos leves (escores de 0 a 8), a RRV0TV foi 75% (p=0,02) eficaz contra os episódios mais graves de gastroenterites por rotavírus; houve tendência à proteção contra todos os quadros diarréicos e os puros, com escores clínicos de 9 a 14: 44% (p=0,06) e 45% (p=0,08), respectivamente. Os resultados do estudo sustentam o conceito vigente de que a RRV-TV parece proteger seletivamente contra os quadros diarréicos revestidos de maior gravidade clínica. / There is currently growing evidence that infantile rotavirus gastroenteritis will be controlled only through the development of an effective vaccine targeted for use in early childhood. This study was conducted with the aim of assessing the protective efficacy of the lower-titer rhesus-human reassortant rotavirus tetravalent vaccine (RRV-TV, 4 x 104 ) against the major clinical indicators of severity cases of rotavirus diarrhoea; for this, were re-examined 91 rotavirus-associated diarrhoeal episodes that were recorded during an efficacy trial carried out previously in Belem, Para, Brazil. The source of information for study were the data recorded in field forms used to perform the routine surveillance for diarrhoeal episodes, as well as those forms in which daily clinical records were made while diarrhoea persisted. Relative efficacy was specifically against the following clinical parameters: a) duration of diarrhoea; b) maximum number of liquid /semiliquid stools per day; c) duration of vomiting episodes/24h; d) maximum number of vomiting episodes / 24h; e) fever (rectal temperature); f) dehydration; and g) need for treatment. The overall clinical severity of rotavirus gastroenteritis has been graded using a numerical twenty-point scoring system (i.e., maximum of 20 points) which allowed the classification of diarrhoeal cases in mild (0-6 scoring interval), moderate/severe (9- 14) and very severe (>14). A significant (p<0.05) protection conferred by RRV-TV was observed in five of the seven clinical parameters under analysis, as follows: a) duration of diarrhoea (52%, pure rotavirus diarrhoea; b) maximum number of liquid/semi-liquid stools per day (42% and 53% against all- and- pure diarrhoeal episodes, respectively); c) maximum number of vomiting (56% and 62% for all-andpure diarrhoeal cases, respectively); d) dehydration (42% and 48% against all-andpure cases of diarrhoea, respectively); and e) the need for rehidration (42% and 46% for all-and-pure cases, respectively). High protective efficacy levels were achieved against rotavirus type G2-related diarrhoea during the second year of follow-up, if considered both the number-and-the maximum number vomiting episodes: 90% and 100%, respectively. Also for G2 type, the overall cumulative protection of 100% against those episodes scored greater than 14. Similar rates of protection against mixed - (35%) and - pure (37%) rotavirus gastroenteritis were yielded after two years of follow-up. While no efficacy was achieved against mild (0- 8 scored) diarrhoea, RRV-TV was 75% (p = 0.02) efficacious against the very severe cases of rotavirus gastroenteritis; there was a tendency for protection against alland- pure diarrhoeal episodes with clinical scores ranging from 9 to 14: 44% (p = 0.06) and 45% (p = 0.08), respectively. The results of study support the view that RRV-TV appears to selectively protect against the most severe rotavirus disease.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:14:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-04T14:55:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-04T14:55:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_AnaliseMolecularGenes.pdf: 1713438 bytes, checksum: c87a3877b195a2f8284332c3ab05f12f (MD5) Previous issue date: 2011 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os rotavírus são os principais agentes virais causadores de gastrenterite aguda e responsáveis por 36% dos casos hospitalizações entre crianças menores de cinco anos, resultando em 453.000 óbitos anualmente, principalmente em países em desenvolvimento. Pertencem à família Reoviridae, gênero Rotavirus, possui RNA de dupla fita (dsRNA) com 11 segmentos codificando 12 proteínas. O genótipo G1 se apresenta geralmente com maior frequência nas investigações epidemiológicas, circulando em várias partes do mundo sob diferentes prevalências. Este estudo teve como objetivo analisar a variabilidade genética dos genes VP4, VP7 e NSP4 dos rotavírus G1 circulantes nos municípios de Belém e Marituba, Pará, Brasil, no período de 1982 a 2008. Foram selecionadas 83 amostras previamente caracterizadas como G1 e submetidas a RT-PCR. Os espécimes foram provenientes de sete estudos realizados no IEC. Foi possível a amplificação para os três genes em estudo de 63 (75,9%) espécimes. Foram detectadas as linhagens 1 (8/63, 12,7 %), 2 (29/63, 46,0%), 3 (18/63, 28,6%) e 9 (8/63, 12,7%) para o gene VP7. Co-predominaram as sublinhagens 2E e 3A concorrendo com um total de 57,1% (36/63) das amostras. Foram observadas três substituições de aminoácidos (97 [D→E], 147 [S→N] e 218 [I→V]) no gene VP7 nas regiões antigênicas (A, B e C) nas amostras das linhagens 1, 2 e 9. Todas as amostras apresentaram a especificidade P[8] para o gene VP4 e as linhagens 2 (21/63, 33,3%) e 3 (42/63, 66,7%) foram detectadas. No gene da VP4 ocorreram duas alterações (35 [I→V] e 38 [S→G]) na região antigênica em todas as amostras analisadas. Para o gene NSP4, todas as amostras pertenceram ao tipo E1. Houve mudanças de nucleotídeos nas posições 47 (C→T) e 101 (T→C), resultando em alteração aminoacídica nos resíduos 16 (S→P) e 34 (L→P) em todas as amostras analisadas e nove espécimes demonstraram alteração no sítio de toxicidade da NSP4 (aa 131). Tal análise permitiu ampliar o conhecimento da diversidade genética e da circulação de variantes de rotavírus G1, representando o primeiro estudo da epidemiologia molecular deste genótipo no Brasil e confirmar a alta heterogeneidade que este tipo apresenta. / Rotaviruses are major viral agents of acute gastroenteritis and responsible for 36% of hospitalization for diarrhea among children less than five years of age, resulting in 453.000 deaths annually, mostly in developing countries. Rotavirus is a member of Reoviridae family, and its genome consists of 11 double-stranded RNA (dsRNA) which encode 12 proteins. G1 rotavirus is commonly detected in epidemiological investigations, occurring under different prevalence rates. The aim of this study was to analyze the VP4, VP7 and NSP4 diversity genetic of G1 rotavirus circulating in Belém and Marituba, Pará, Brazil, from 1982 to 2008. We selected 83 samples previously characterized as G1 type and submitted to RT-PCR. The samples were from seven studies conducted in IEC. It was possible amplification for 63 (75.9%) specimens. Lineages 1 (8/63, 12.7%), 2 (29/63, 46.0%), 3 (18/63, 28.6%) and 9 (8/63, 12.7%) of VP7 gene were detected. The sublineages 2E and 3A were co-predominant detected in 57.1% (36/63) of samples. Three amino acid substitutions (97 [D→E], 147 [S→N] and 218 [I→V]) were observed in VP7 antigenic regions (A, B and C) in samples of 1, 2 and 9 lineages. All samples showed P[8] specificity for VP4 gene and lineages 2 (21/63, 33.3%) and 3 (42/63, 66.7%) were detected. Two substitutions (35 [I→V] and 38 [S→G]) occurred in antigenic region of VP4 of samples analyzed. For NSP4 gene, all samples belonged to E1 type. Phylogenetic analysis of NSP4 gene revealed that occurred changes in nucleotide positions 47 (C→T) and 101 (T→C), resulting in amino acid substitutions at positions 16 (S→P) and 34 (L → P) in all samples and 9 specimens displayed amino acid substitution in NSP4 toxicity residue (aa 131). This study allowed us to broaden our understanding about genetic diversity and circulation of G1 variants and represents the first molecular epidemiology analyze of this genotype in Brazil corroborating the high heterogeneity of this genotype.

Submitted by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-26T13:32:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) INACIO MANASSI DA CONCEICAO BRANDOLT.pdf: 2443790 bytes, checksum: d59c0a593aeb1377a8b491abcd42714e (MD5) / Approved for entry into archive by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-26T13:33:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) INACIO MANASSI DA CONCEICAO BRANDOLT.pdf: 2443790 bytes, checksum: d59c0a593aeb1377a8b491abcd42714e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-26T13:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) INACIO MANASSI DA CONCEICAO BRANDOLT.pdf: 2443790 bytes, checksum: d59c0a593aeb1377a8b491abcd42714e (MD5) Previous issue date: 2016-08-02 / As enfermidades gastrointestinais acometem bovinos e equinos com grande frequência e causam impacto direto na economia, demonstrando a necessidade de modernizar a medicina veterinária com conceitos de medicina populacional baseada na epidemiologia que permite o estabelecimento de estratégias preventivas e de controle das doenças. Desta forma, este trabalho, através de um estudo retrospectivo, teve como objetivo determinar as principais doenças gastrointestinais não infecciosas de equinos e gástricas de bovinos na mesorregião sudoeste Rio-grandense, atendidos no Hospital Universitário Veterinário (HUVet) da UNIPAMPA, seja no setor de Clínica e Cirurgia de Grandes Animais (CCGA), seja no Laboratório de Patologia Veterinária (LPV). Foram revisadas as fichas dos bovinos e equinos atendidos na CCGA e diagnosticados com doenças gastrointestinais não infecciosas desde a sua abertura em agosto de 2011 até dezembro de 2015 e no LPV desde setembro de 2010 até dezembro de 2015. Em relação aos equinos foram 228 pacientes da CCGA e do LPV com predominância da raça crioula, com casuística de afecções gastrointestinais não infecciosas de 10,9% e 15,6% respectivamente, onde predominaram os casos de compactação na CCGA e enterite no LPV, sendo que ainda houve uma significante frequência de enterolitíase. A maioria dos animais atendidos na CCGA recebeu tratamento clínico (83,3%), enquanto 16,7% dos pacientes necessitaram tratamento cirúrgico, sendo que 22,2% dos pacientes da CCGA morreram, o tempo médio de evolução da doença desde o aparecimento dos sinais clínicos até chegar no HUVet foi de 55 horas. Em relação aos bovinos, foram analisados os dados de 208 bovinos necropsiados no LPV que apresentaram 23 distúrbios gástricos, divididos em 61% de aterações no rúmen, 17% no abomaso, 13% de acometimento simultâneo em duas câmaras e 9% no retículo. O timpanismo bolhoso por ingestão excessiva de Trifolium repens foi a principal causa de morte de bovinos, demonstrando também a importância de acidose láctica e alcalose ruminal por intoxicação por ureia e intoxicação por Baccharis coridifolia, neste estudo que demonstrou que as plantas tóxicas juntas às toxiinfecções representaram 22,8% VI dos casos com diagnóstico conclusivo. As afecções gastrointestinais não-infecciosas de equinos e gástricas de bovinos têm grande importância na região, e estão bastante relacionadas ao manejo alimentar nos equinos e a fatores ambientais resultantes do sistema de criação de bovinos, predominantemente extensivo, adotado na região, o que demonstra o papel do médico veterinário, do criador e do tratador na prevenção destas doenças, minimizando os riscos através de um manejo correto e que busque ainda o bem estar dos animais, além de contribuir bastante encaminhando os animas doentes para um centro de referência o mais breve possível, melhorando assim o prognóstico. / Gastrointestinal diseases frequently affecting bovines and equines and cause direct impact on the economy, demonstrating the need to modernize veterinary medicine with concepts of population medicine based in epidemiology that allows the establishment of preventive strategies and control of diseases. This work through a retrospective study, aimed determine the main non-infectious gastrointestinal diseases of equines and gastric diseases of bovines in the southwest mesoregion of Rio Grande do Sul, attended at the Hospital Universitario Veterinário (HUVet) of UNIPAMPA, either in the Clínica e Cirurgia de Grandes Animais sector (CCGA), either in the Laboratório de Patologia Veterinária (LPV). Were reviewed records of bovines and equines treated at CCGA since its opening in August 2011 until December 2015 and at LPV since September 2010 until December 2015, and who were diagnosed with non-infectious gastrointestinal diseases. Regarding equines were 228 patients from the CCGA and LPV, predominantly Criolo race, with casuistry of non-infectious gastrointestinal disorders of 10.9% and 15.6% respectively, where the predominant impaction cases in the CCGA and enterolitiasis in the LPV, and that there was still a significant frequency enterolitiasis. The most animals treated at CCGA received clinical treatment (83.3%), while 16.7% patients required surgical treatment, and 22.2% CCGA patients died, the average time to disease progression since the onset clinical signs until arrival to HUVet was 55 hours. For bovine, the dates of 208 necropsied bovines in LPV were analyzed showed 23 gastric diseases, divided into 61% rumen disorders, 17% abomasum, 13% simultaneous involvement in two chambers and 9% reticulum. The bloat foamy by excessive intake of Trifolium repens was the main cause of cattle death, also shows the importance of lactic acidosis and ruminal alkalosis poisoning by urea and poisoning Baccharis coridifolia, this study showed that toxic plants together to toxinfections represented 22.8% of cases with a conclusive diagnosis. Gastrointestinal non infectious diseases of equines and gastric diseases of bovines have great importance in the region and are closely related to feeding management in equines and environmental factors resulting from bovines breeding system, predominantly VIII extensive, adopted in the region, which shows the role the Veterinarian, the creator and treater in the prevention of these diseases, minimizing risks through correct management and still seek animals welfare, as well as contributing enough forwarding sick animals to a referral center as soon as possible, thus improving the prognosis.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-10-23T13:30:15Z No. of bitstreams: 1 carlos_a_p_nascimento_ioc_bcm_0045_2011.pdf: 1006058 bytes, checksum: e670c764b773d1d5bd9fa107d877a76b (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-23T13:30:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carlos_a_p_nascimento_ioc_bcm_0045_2011.pdf: 1006058 bytes, checksum: e670c764b773d1d5bd9fa107d877a76b (MD5) Previous issue date: 2011 / CNPq FAPERJ / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / O Torque teno virus (TTV) é um vírus de DNA do gênero Alphatorquevirus da família Anelloviridae. O TTV é altamente prevalente em populações de todo o mundo. Isolados foram classificados em cinco grupos filogenéticos (1-5) com grande distância genética entre eles. A presença do TTV já foi detectada nas fezes, porém, não se sabe se todos os cinco genogrupos do TTV são excretados nas fezes, e qual a distribuição do TTV entre os genogrupos. A fim de avaliar a presença, a diversidade genômica e a carga viral do TTV em fezes, 135 amostras de pacientes com gastroenterite foram analisadas. O DNA do TTV foi extraído de suspensão fecal e três diferentes métodos de reação em cadeia da polimerase (PCR), dois qualitativos e um quantitativo, foram avaliados. Nas amostras de fezes estudadas, 123 (91,1%) foram positivas em pelo menos um dos três métodos. O DNA do TTV pertencente aos genogrupos de 1 a 5 foi detectado em 37 (27,4%), 27 (20,0%), 57 (42,2%), 29 (21,5%) e 33 (24,4%) amostras, respectivamente. Co-infecções com dois, três, quatro e cinco genogrupos do TTV foram encontradas em 23 (17,0%), 15 (11,1%), 7 (5,2%) e 7 (5,2%) amostras fecais, respectivamente. Assim, 52 (38,5%) amostras continham mais de um genogrupo de TTV. A carga viral variou de 2,6 a 6,5 log de genoma equivalentes por grama de fezes. No entanto, variações de carga viral foram observadas em função do genogrupo detectado e do número de genogrupos presentes simultaneamente. Os resultados encontrados são os primeiros a mostrar a alta prevalência e a diversidade de TTV nas fezes humanas. / Torque teno virus (TTV) is a DNA virus of the genus Alphatorquevirus of Anelloviridae family. The TTV is highly prevalent in populations from around the world. Isolates have been classified into at least five main phylogenetic groups (1-5) showing a large genetic distance between them. The presence of TTV has been detected in feces. However, are presently unknown whether all five TTV genogroups are excreted in feces and the genogroup distribution. To evaluate the presence and the genomic distribution of TTV DNA in feces, 135 samples of patients with gastroenteritis were analyzed. The DNA was extracted of fecal suspension and three different PCR methods, two qualitative and one quantitative, were used. One hundred and twenty three (91.1%) samples were positive with at least one method. The TTV DNA belonging to the genogroups 1 to 5 was detected in 37 (27.4%), 27 (20.0%), 57 (42.2%), 29 (21.5%) and 33 (24.4%) fecal samples, respectively. Coinfections with two, three, four and five TTV genogroups were found in 23 (17.0%), 15 (11.1%), 7 (5.2%) and 7 (5.2%) fecal samples, respectively. Thus, 52 (38.5%) samples contained more than one TTV genogroup. Viral loads ranged from 2.6 to 6.5 log genome equivalents per gram of feces. However, variations of viral load were noted depending on genogroup and number of coinfecting TTV genogroups. These results are the first to show high prevalence and the diversity of TTV isolates in human feces.