Orientador: Áureo Evangelista Santana / Coorientador: Paola Castro Moraes / Banca: José Luiz Laus / Banca: Mirela Tinucci Costa / Banca: Márcio Antônio Brunetto / Banca: Rodrigo Cardoso Rabelo / Resumo: A sepse é uma síndrome de caráter multifatorial e com consequências graves para sobrevida e para os custos de tratamento em cães. Neste contexto a gastroenterite é um representante importante desta síndrome inflamatória de associação infecciosa no campo das urgências veterinárias. Este estudo unicêntrico, prospectivo e de coorte apresentou como objetivo fundamental identificar as variáveis prognósticas associadas com a sobrevivência a curto e médio prazo de 56 cães com gastroenterite, atendidos como urgências e hospitalizados para cuidados intensivos. Foram coletados dados fisiológicos e laboratoriais no momento da admissão de urgência dos pacientes (T0) e 24 horas depois (T24). Desta forma, foram encontradas as relações destes parâmetros com a sobrevivência ou a mortalidade em 24 horas, e aos 7, 30 e 60 dias pós ingresso. Com os resultados obtidos, foram criadas árvores de decisão empregadas na estratificação, previsão e identificação de todas as interações possíveis. A gravidade do quadro clínico, laboratorial e dos antecedentes históricos prediz a mortalidade de pacientes caninos com gastroenterite; e os doentes diagnosticados com parvovirose ou gastroenterite hemorrágica, classificados em sepse grave ou em choque séptico, possuem maior mortalidade tanto às 24 horas quanto aos 7, 30 e 60 dias após atendimento. A queda do potencial de transporte de oxigênio, do potencial oncótico e a alteração metabólica em nível celular foram determinantes no prognóstico dos pacientes, representados respectivamente pelo alto poder prognóstico das variações em 24 horas do hematócrito, das proteínas totais e do lactato sérico, bem como a presença de vasoconstrição periférica grave 24 horas após o início do tratamento, demonstrada pelo maior escore de vasoconstrição. Deste modo, pretendeu-se com este estudo, possibilitar o conhecimento aos Médicos Veterinários de ... / Abstract: Sepsis is a multifactorial syndrome with serious consequences for survival and costs of treatment in dogs. In this context gastroenteritis is an important representative of this inflammatory syndrome infectious association in the veterinary emergencies area. This single-center, prospective cohort study presented as a fundamental objective to identify the prognostic variables associated with survival in the short and medium term of 56 dogs with gastroenteritis treated in emergency and critical care hospital. Physiological and laboratory datas were collected on admission of emergency patients ( T0 ) and 24 hours later ( T24 ). Thus, the relationship between these parameters and the survival or mortality in 24 hours, and at 7, 30 and 60 days after admission were found. With the results, decision trees used in the stratification, prediction and identification of all possible interactions were created. The severity of the clinical, laboratory findings and historical background predicts mortality in canine patients with gastroenteritis , and patients diagnosed with parvovirus or hemorrhagic gastroenteritis, ranked in severe sepsis or septic shock, have higher mortality both at 24 hours as at 7, 30 and 60 days after treatment. The fall of potential oxygen transport, the oncotic potential and metabolic changes at the cellular level were determining the prognosis of patients, respectively represented by the high prognostic power of variations within 24 hours of hematocrit, total protein and lactate as well as presence of severe peripheral vasoconstriction 24 hours after initiation of treatment, as demonstrated by scores greater vasoconstriction. Thus, it is intended with this study, getting familiar to veterinarians to predict survival in dogs with gastroenteritis based on simple parameters, low cost and easy implementation / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:14:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4104_1.pdf: 4701358 bytes, checksum: c2bf9b704717fd8d55f6d7f93556395e (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Apesar de sua comprovada eficácia no manejo da diarréia aguda, com normas amplamente divulgadas em nível mundial, a terapia de reidratação oral (TRO) é frequentemente preterida pelos médicos em relação à hidratação venosa para crianças com desidratação não-grave no setor de emergência. O objetivo do estudo foi observar a aplicação dos princípios da TRO para crianças com diarréia aguda na emergência, verificando características inerentes aos pacientes, médicos e à dinâmica do próprio setor como fatores determinantes em sua prática. Estudo descritivo com componente analítico foi conduzido no período de fevereiro a maio de 2008 em duas unidades de emergência localizadas na cidade de Recife (Brasil), uma delas vinculada a um hospitalescola. Participaram do estudo 369 crianças com diarréia aguda e 43 médicos nos dois serviços. As principais variáveis foram: 1) a indicação da TRO para crianças com desidratação não-grave por diarréia aguda; 2) características clínicas das crianças e o tipo de serviço (com ou sem função de ensino); 3) perfil dos médicos que atuam no setor e 4) estrutura dos serviços global e específica para a realização da TRO. Foi observada uma tendência a declínio no uso da TRO em relação à hidratação venosa (HV), de acordo com o estado de hidratação, com a terapia sendo indicada para 35,6% (47/132) das crianças com desidratação leve e 17,6% (6/34) daquelas com a forma moderada no setor de emergência, sem associação com o tipo de serviço (com ou sem função de ensino). Foi indicada HV para 10,8% (22/203) das crianças hidratadas. Não houve interferência da intensidade dos vômitos ou das evacuações sobre a indicação da TRO. Mais da metade dos médicos (58,1% - 25/43) nas duas unidades refere percepção de sobrecarga importante no trabalho, considerando os serviços inadequados em termos de espaço físico (83,7%) e com insuficiência de equipamentos (76,7%) para a realização das atividades diárias. Não havia sala específica para reidratação em nenhum dos serviços, nem profissional específico para supervisão da TRO. Entre os empecilhos relatados pelos médicos para a aplicação da terapia no setor destacam-se determinantes estruturais (falta de espaço, equipamentos e recursos humanos) e relacionados aos processos de trabalho, como a demanda excessiva da assistência. A ausência de diferença entre os serviços (um assistencial e outro de ensino) em relação ao padrão de indicação da TRO sugere que a contribuição do treinamento médico não é suficiente, assumindo importância questões estruturais e relacionadas à dinâmica dos processos de trabalho no setor

O objetivo deste trabalho foi caracterizar astrovírus em amostras fecais coletadas de crianças com e sem diarréia, em São Paulo, Brasil, e divididas em dois grupos, EPM e HU, de acordo com a origem. A detecção foi realizada utilizando-se RT-PCR, com primers específicos. Os resultados para as amostras EPM mostram que 66/234 (28,2%) foram positivas para astrovírus. Para as amostras HU, 18/187 (9,6%) foram positivas. A genotipagem foi realizada com a técnica de nested/RT-PCR. De 66 amostras positivas (EPM), 19 (28,7%) foram caracterizadas como HAstV-1, 4 (6,0%) como HAstV-2, 2 (3,0%) como HAstV-3, 1 (1,5%) como HAstV-5 e 3 (4,5%) como HAstV-8. Das 18 positivas do HU, 1 (5,5%) amostra foi caracterizada como HAstV-1, 7 (38,8%) como HAstV-2 e 1 (5,5%) como HAstV-8. As amostras genotipadas em ambos os grupos foram submetidas ao seqüenciamento de nucleotídeos para confirmação dos resultados. Detecção e genotipagem de astrovírus em casos de diarréias pediátricas são técnicas são importantes e descrevem como esse vírus está circulando em São Paulo, Brasil. / The purpose of this study was to characterize astrovirus in faecal samples collected from children with and without diarrhea in São Paulo city, Brazil, and grouped into two distinct groups, EPM and HU. Detection was carried out using RT-PCR with specific primers. Results for EPM set showed that 66/234 (28,2%) were positive. In the HU set of samples, 18/187 (9,6%) were positive for astrovirus. Genotyping was carried out with nested/RT-PCR. Out of 66 astrovirus positive EPM samples, 19 (28,7%) were characterized as HAstV-1, 4 (6,0%) as HAstV-2, 2 (3,0%) as HAstV-3, 1 (1,5%) as HAstV-5 and 3 (4,5%) as HAstV-8. Among 18 astrovirus positive HU samples, 1 (5,5%) was characterized as HAstV-1, 7 (38,8%) as HAstV-2 and 1 (5,5%) as HAstV-8. Genotyped samples were confirmed by nucleotide sequencing. Detection and genotyping of astrovirus in pediatric diarrhea are important and describes how this virus is circulating in São Paulo, Brazil.

Introdução: Norovírus é o principal agente viral de infecções gastrointestinais no mundo e sua alta infectividade gera aumento importante da demanda e dos custos para a saúde pública. Surtos ocorrem em ambientes fechados ou com aglomeração de pessoas. No município de São Paulo, o Norovírus tem se destacado como principal agente etiológico das gastroenterites. Objetivo: Descrever as noroviroses como causa de gastroenterite epidêmica no Município de São Paulo no período de 2010 a 2016. Métodos: Estudo transversal descritivo com dados dos sistemas de Vigilância Epidemiológica de surtos de gastroenterite e da Vigilância Sentinela Laboratorial do Rotavírus do Município de São Paulo entre os anos de 2010 a 2016. A definição de caso foi a identificação laboratorial do Norovírus como agente etiológico de surto de doença diarreica em todas as faixas etárias ou de casos esporádicos em menores de cinco anos internados em unidades sentinelas da Vigilância do Rotavírus. Os dados foram descritos segundo tempo, lugar e pessoa, por meio do Epi InfoTM versão 3.5.4 e ArcGIS versão 10.1. Resultados: O Norovírus foi associado a 20,4 por cento (68/334) dos surtos com pesquisa de agente realizada. Ocorrendo com maior frequência na região Norte, seguida das regiões Sul e Sudeste do Município de SP; principalmente em creches, domicílios e hospitais. Houve um predomínio de casos em crianças menores de 5 anos (47,2 por cento do sexo masculino; 28,6 por cento do sexo feminino) e em mulheres entre 20 a 49 anos (38,9 por cento). Na Vigilância Sentinela Laboratorial do Rotavírus do município de São Paulo, o Norovírus foi associado a 28,4 por cento (444/1565) dos casos menores de 5 anos. Os casos foram provenientes principalmente das regiões Norte e Sul, onde estão localizadas as duas unidades sentinelas. Verificou-se pico de ocorrência do Norovírus nos meses mais quentes. Destaca-se que o perfil das gastroenterites descrito foi fortemente influenciado pelas características da Vigilância Epidemiológica das Doenças de Transmissão Alimentar do Município de São Paulo. Conclusão: O Norovírus foi o principal agente etiológico de surtos de gastroenterite e de casos menores de 5 anos internados por diarreia aguda no Município de São Paulo. A vigilância das gastroenterites por Norovírus é importante para o estabelecimento de uma rede integrada entre diferentes estados e países que possibilitem o conhecimento da doença, planejamento de medidas de prevenção e controle e comunicação da informação. / Introduction: Norovirus is the major viral agent of gastroenteritis in the world and its high infectivity causes an important increase in demand and costs for public health. Outbreaks occur in closed environments or crowded settings. In the city of São Paulo, Norovirus has been highlighted as the main etiological agent of gastroenteritis. Objective: To describe the noroviruses as the cause of epidemic gastroenteritis in the city of São Paulo from 2010 to 2016. Methods: Descriptive cross-sectional study with data from the Epidemiological Surveillance systems of gastroenteritis outbreaks and Laboratory Sentinel Surveillance of Rotavirus of the city of São Paulo from 2010 and 2016. The case definition was the laboratory identification of Norovirus as the etiological agent of diarrheal disease outbreak in all age groups or sporadic cases in children under five years of age hospitalized in sentinel units of Rotavirus Surveillance. The data were described by time, place and person, using Epi InfoTM version 3.5.4 and ArcGIS version 10.1. Results: Norovirus was associated to 20.4 per cent (68/334) of outbreaks with agent identification performed. Occurred more frequently in the North region, followed by the South and Southeast regions of the city of São Paulo, especially in nurseries, residences and hospitals. A predominance of cases in children aged <5 years (47.2 per cent male, 28.6 per cent female) and in women aged 20 to 49 years (38.9 per cent) was observed. In the Laboratory Sentinel Surveillance of Rotavirus in the city of São Paulo, Norovirus was associated with 28.4 per cent (444/1565) of cases in children younger than 5 years old. The cases were mainly from the North and South regions, where the two sentinel units are placed. There was a peak of Norovirus occurrence in warmer months. It can be noticed that the profile of gastroenteritis described was strongly influenced by the characteristics of Foodborne Disease Surveillance of the city of São Paulo. Conclusion: Norovirus was the major etiological agent of gastroenteritis outbreaks and diarrhea cases under 5 years old hospitalized in the city of São Paulo. Surveillance of gastroenteritis caused by Norovirus is important for the establishment of an integrated network between different states and countries to contribute to disease knowledge, planning of prevention and control actions and distribution of information.

Introdução: Norovírus é o principal agente viral de infecções gastrointestinais no mundo e sua alta infectividade gera aumento importante da demanda e dos custos para a saúde pública. Surtos ocorrem em ambientes fechados ou com aglomeração de pessoas. No município de São Paulo, o Norovírus tem se destacado como principal agente etiológico das gastroenterites. Objetivo: Descrever as noroviroses como causa de gastroenterite epidêmica no Município de São Paulo no período de 2010 a 2016. Métodos: Estudo transversal descritivo com dados dos sistemas de Vigilância Epidemiológica de surtos de gastroenterite e da Vigilância Sentinela Laboratorial do Rotavírus do Município de São Paulo entre os anos de 2010 a 2016. A definição de caso foi a identificação laboratorial do Norovírus como agente etiológico de surto de doença diarreica em todas as faixas etárias ou de casos esporádicos em menores de cinco anos internados em unidades sentinelas da Vigilância do Rotavírus. Os dados foram descritos segundo tempo, lugar e pessoa, por meio do Epi InfoTM versão 3.5.4 e ArcGIS versão 10.1. Resultados: O Norovírus foi associado a 20,4 por cento (68/334) dos surtos com pesquisa de agente realizada. Ocorrendo com maior frequência na região Norte, seguida das regiões Sul e Sudeste do Município de SP; principalmente em creches, domicílios e hospitais. Houve um predomínio de casos em crianças menores de 5 anos (47,2 por cento do sexo masculino; 28,6 por cento do sexo feminino) e em mulheres entre 20 a 49 anos (38,9 por cento). Na Vigilância Sentinela Laboratorial do Rotavírus do município de São Paulo, o Norovírus foi associado a 28,4 por cento (444/1565) dos casos menores de 5 anos. Os casos foram provenientes principalmente das regiões Norte e Sul, onde estão localizadas as duas unidades sentinelas. Verificou-se pico de ocorrência do Norovírus nos meses mais quentes. Destaca-se que o perfil das gastroenterites descrito foi fortemente influenciado pelas características da Vigilância Epidemiológica das Doenças de Transmissão Alimentar do Município de São Paulo. Conclusão: O Norovírus foi o principal agente etiológico de surtos de gastroenterite e de casos menores de 5 anos internados por diarreia aguda no Município de São Paulo. A vigilância das gastroenterites por Norovírus é importante para o estabelecimento de uma rede integrada entre diferentes estados e países que possibilitem o conhecimento da doença, planejamento de medidas de prevenção e controle e comunicação da informação. / Introduction: Norovirus is the major viral agent of gastroenteritis in the world and its high infectivity causes an important increase in demand and costs for public health. Outbreaks occur in closed environments or crowded settings. In the city of São Paulo, Norovirus has been highlighted as the main etiological agent of gastroenteritis. Objective: To describe the noroviruses as the cause of epidemic gastroenteritis in the city of São Paulo from 2010 to 2016. Methods: Descriptive cross-sectional study with data from the Epidemiological Surveillance systems of gastroenteritis outbreaks and Laboratory Sentinel Surveillance of Rotavirus of the city of São Paulo from 2010 and 2016. The case definition was the laboratory identification of Norovirus as the etiological agent of diarrheal disease outbreak in all age groups or sporadic cases in children under five years of age hospitalized in sentinel units of Rotavirus Surveillance. The data were described by time, place and person, using Epi InfoTM version 3.5.4 and ArcGIS version 10.1. Results: Norovirus was associated to 20.4 per cent (68/334) of outbreaks with agent identification performed. Occurred more frequently in the North region, followed by the South and Southeast regions of the city of São Paulo, especially in nurseries, residences and hospitals. A predominance of cases in children aged <5 years (47.2 per cent male, 28.6 per cent female) and in women aged 20 to 49 years (38.9 per cent) was observed. In the Laboratory Sentinel Surveillance of Rotavirus in the city of São Paulo, Norovirus was associated with 28.4 per cent (444/1565) of cases in children younger than 5 years old. The cases were mainly from the North and South regions, where the two sentinel units are placed. There was a peak of Norovirus occurrence in warmer months. It can be noticed that the profile of gastroenteritis described was strongly influenced by the characteristics of Foodborne Disease Surveillance of the city of São Paulo. Conclusion: Norovirus was the major etiological agent of gastroenteritis outbreaks and diarrhea cases under 5 years old hospitalized in the city of São Paulo. Surveillance of gastroenteritis caused by Norovirus is important for the establishment of an integrated network between different states and countries to contribute to disease knowledge, planning of prevention and control actions and distribution of information.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T09:40:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tâmera Nunes Vieira Almeida - 2011.pdf: 3539556 bytes, checksum: 0d3229ddfa2244e57c236faf04b328e8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T09:41:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tâmera Nunes Vieira Almeida - 2011.pdf: 3539556 bytes, checksum: 0d3229ddfa2244e57c236faf04b328e8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T09:41:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tâmera Nunes Vieira Almeida - 2011.pdf: 3539556 bytes, checksum: 0d3229ddfa2244e57c236faf04b328e8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2011-04-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The group A rotaviruses (RVA) are recognized as the main viral agents of acute childhood gastroenteritis, and due to the high morbidity-mortality rates vaccination has being considered the best alternative for prevention and control of RVA. In Brazil, in March, 2006 the Ministry of Health included the human rotavirus oral vaccine – VORH, which was developed from a monovalent attenuated strain G1P[8], in the National Immunization Program. In this context, the present study aimed at the investigation of the occurrence of RVA infections in the city of Goiânia after the implementation of the VORH, as well as the comparative analysis of the RVA circulating strains during the pre- and post-vaccination periods. For the RVA identification, 65 fecal samples obtained from children with acute gastroenteritis, in the period from 2008 to 2009, were tested by an immunoenzymatic assay and by polyacrilamide gel electrophoresis, with a total detection rate of 16.9% (11/65). After molecular characterization, the G2 genotype was identified in 10 samples, and four of those were considered as G2P[4] genotype. For the comparative analysis, the G2P[4] samples, as well as other 15 samples, obtained in the pre- and post-vaccination periods, were submitted to genomic sequencing of the coding regions for the proteins VP6, VP7 and NSP4. The molecular characterization of the VP7 gene showed that the G1 samples belonged to lineages I and II, sublineages d and b, respectively, and that all the G2 samples belonged to lineage II, with the differentiation of three sublineages, a, c and d, which were correlated with the collection periods. Regarding the VP6 genogroups and the NSP4 genotypes, a predominance of genogroup I and genotype A in postvaccination period was observed, whereas a predominance of genogroup II and genotype B was identified in the period before de vaccine implementation. The association between the G and P genotypes with VP6 genogroups and NSP4 genotypes revealed the predominance of the G1-P[8]-II-B combination in the pre-vaccination period, and the association G2-P[4]-I-A in the post-vaccination period, which suggests the substitution of these combinations after the implementation of the VORH. / Rotavírus do grupo A (RVA) são reconhecidos como os principais agentes virais da gastroenterite aguda infantil e, devido aos relevantes índices de morbi-mortalidade, a vacinação tem sido considerada a melhor alternativa para a prevenção e o controle de RVA. No Brasil, em março de 2006 o Ministério da Saúde adicionou ao Programa Nacional de Imunização a Vacina Oral de Rotavírus Humano (VORH), a qual foi desenvolvida a partir de uma amostra monovalente atenuada G1P[8]. Neste contexto, o presente estudo objetivou a investigação da ocorrência das infecções por RVA na cidade de Goiânia após a implantação da VORH, bem como proceder a uma análise comparativa das amostras de RVA circulantes nos períodos pré e pós-vacinal. Para identificação de RVA, 65 espécimes fecais coletados no período de 2008 a 2009 de crianças com gastroenterite aguda, foram submetidos ao Ensaio Imunoenzimático e Eletroforese em Gel de Poliacrilamida, sendo observado um índice total de detecção de 16,9% (11/65). Após caracterização molecular, o genótipo G2 foi identificado em 10 amostras, sendo que quatro destas foram definidas como G2P[4]. Para análise comparativa, as amostras G2P[4], bem como outras 15 amostras coletadas nos períodos pré e pós-vacinal, foram submetidas ao sequenciamento genômico para as regiões codificantes das proteínas VP6, VP7 e NSP4. A caracterização molecular do gene de VP7 mostrou que as amostras G1 pertenciam às linhagens I e II, sublinhagens d e b, respectivamente, e que todas as amostras G2 pertencem à linhagem II, com a diferenciação de três sublinhagens, a, c e d, as quais foram correlacionadas com os períodos de coleta. Considerando os genogrupos de VP6 e genótipos de NSP4 identificados, observou-se predominância para genogrupo I e genótipo A no período pós-vacinal, enquanto, genogrupo II e genótipo B foram identificados com maior frequência antes da implantação da vacina. A associação entre os genótipos G e P com genogrupos de VP6 e genótipos de NSP4 revelou predominância da combinação G1-P[8]II-B no período pré-vacinal e da associação G2-P[4]-I-A no período pós-vacinal o que sugere uma substituição destas combinações após a implantação da VORH.

Os vírus entéricos causam infecções que podem ocasionar uma alta morbidade e mortalidade em cães. A diarreia se destaca como o principal sinal clínico e a subsequente desidratação pode causar a morte do animal. O Carnivore protoparvovirus 1 (CPV-2), Canine mastadenovirus A tipo 1 (CAdV-1), o Canine coronavirus (CCoV), o Canine rotavirus (CRV) e o Canine distemper virus (CDV) são considerados os principais agentes que causam gastroenterite viral aguda em cães jovens. O objetivo deste trabalho foi detectar a presença destas cinco espécies virais na população de cães do Brasil. Para isto, foram coletados 325 suabes retais de cães com ou sem diarreia, jovens (> 6 meses) e adultos (< 6 meses), com ou sem histórico de vacinação e de diversas regiões do Brasil. As amostras foram analisadas através da reação em cadeia da polimerase (PCR) ou transcrição reversa seguida de PCR (RT-PCR) utilizando iniciadores específicos para cada um dos agentes virais. Resultaram 81% (264/325) das amostras positivas para um destes vírus, das quais 30,7% (100/325) foram positivas para o CPV-2, 25,5% (83/325) para o CDV, 17,2% (56/325) para o CCoV, 4,6% (15/325) para o CRV e 2,7% (9/ 325) para o CAdV-1. Algumas amostras apresentaram co-infecções, sendo que as espécies mais predominantemente encontradas em co-infecções foram o CDV e CPV-2 em 15,4% (50/325) e 15,0% (49/325), respectivamente, seguidos do CCoV em 10,1% (33/325,), CRV em 3,0% (10/325) e CAdV-1 em 1,5% (5/325) das amostras. A associação viral mais observada foi CDV e CPV-2 em 31/325 (9,5%) amostras positivas para ambos os vírus. Em conclusão, os resultados demonstram que CPV-2, CDV e CCoV são os principais vírus entéricos patogênicos que circularam no Brasil entre os anos de 2008 e 2014, infectando mais frequentemente animais jovens. / Enteric viruses cause infections that lead to high morbidity and mortality. Diarrhea is the main clinical sign, whose subsequent dehydration can cause death of the animal. Carnivore protoparvovirus 1 (CPV-2), Canine mastadenovirus A (CAdV-1), Canine coronavirus (CCoV), Canine rotavirus (CRV) and Canine distemper virus (CDV) are considered the main agents that cause acute viral gastroenteritis in young dogs. The aim of this study was the detection of these five viral species in dogs from Brazil. Rectal swabs from 325 dogs, puppies (< six months old), adult dogs (> 6 months old), with or without a history of vaccination, were collected from various regions of the country. The samples were analyzed by polymerase chain reaction (PCR) or reverse transcription following followed by PCR (RT-PCR) using oligonucleotides specific for each one of this virus. As result, 81% (264/325) of the samples were observed to be positive for at least one virus, 30,7% (100/325) were positive for CPV-2, 25,5% (83/325) for CDV, 17,2% (56/325) for CCoV, 4,6% (14/325) for CRV and 2,7% (9/325) for CAdV-1. Some samples showed co-infection, where the species most predominantly found were CDV and CPV-2 with 15,4% (50/325) and 15,0% (49/325), respectively, followed by CCoV with 10,1% (33/325,), CRV with 3,0% (10/325) and CAdV-1 1,5% (5/325). The most observed viral association was CDV and CPV-2, with 31/325 (9,5%) positive samples for both viruses. In conclusion, the results showed that CPV-2, CDV and CCoV are the main pathogenic enteric viruses that circulated in Brazil between the years 2008 and 2014, infecting more frequently puppies.

Os vírus entéricos causam infecções que podem ocasionar uma alta morbidade e mortalidade em cães. A diarreia se destaca como o principal sinal clínico e a subsequente desidratação pode causar a morte do animal. O Carnivore protoparvovirus 1 (CPV-2), Canine mastadenovirus A tipo 1 (CAdV-1), o Canine coronavirus (CCoV), o Canine rotavirus (CRV) e o Canine distemper virus (CDV) são considerados os principais agentes que causam gastroenterite viral aguda em cães jovens. O objetivo deste trabalho foi detectar a presença destas cinco espécies virais na população de cães do Brasil. Para isto, foram coletados 325 suabes retais de cães com ou sem diarreia, jovens (> 6 meses) e adultos (< 6 meses), com ou sem histórico de vacinação e de diversas regiões do Brasil. As amostras foram analisadas através da reação em cadeia da polimerase (PCR) ou transcrição reversa seguida de PCR (RT-PCR) utilizando iniciadores específicos para cada um dos agentes virais. Resultaram 81% (264/325) das amostras positivas para um destes vírus, das quais 30,7% (100/325) foram positivas para o CPV-2, 25,5% (83/325) para o CDV, 17,2% (56/325) para o CCoV, 4,6% (15/325) para o CRV e 2,7% (9/ 325) para o CAdV-1. Algumas amostras apresentaram co-infecções, sendo que as espécies mais predominantemente encontradas em co-infecções foram o CDV e CPV-2 em 15,4% (50/325) e 15,0% (49/325), respectivamente, seguidos do CCoV em 10,1% (33/325,), CRV em 3,0% (10/325) e CAdV-1 em 1,5% (5/325) das amostras. A associação viral mais observada foi CDV e CPV-2 em 31/325 (9,5%) amostras positivas para ambos os vírus. Em conclusão, os resultados demonstram que CPV-2, CDV e CCoV são os principais vírus entéricos patogênicos que circularam no Brasil entre os anos de 2008 e 2014, infectando mais frequentemente animais jovens. / Enteric viruses cause infections that lead to high morbidity and mortality. Diarrhea is the main clinical sign, whose subsequent dehydration can cause death of the animal. Carnivore protoparvovirus 1 (CPV-2), Canine mastadenovirus A (CAdV-1), Canine coronavirus (CCoV), Canine rotavirus (CRV) and Canine distemper virus (CDV) are considered the main agents that cause acute viral gastroenteritis in young dogs. The aim of this study was the detection of these five viral species in dogs from Brazil. Rectal swabs from 325 dogs, puppies (< six months old), adult dogs (> 6 months old), with or without a history of vaccination, were collected from various regions of the country. The samples were analyzed by polymerase chain reaction (PCR) or reverse transcription following followed by PCR (RT-PCR) using oligonucleotides specific for each one of this virus. As result, 81% (264/325) of the samples were observed to be positive for at least one virus, 30,7% (100/325) were positive for CPV-2, 25,5% (83/325) for CDV, 17,2% (56/325) for CCoV, 4,6% (14/325) for CRV and 2,7% (9/325) for CAdV-1. Some samples showed co-infection, where the species most predominantly found were CDV and CPV-2 with 15,4% (50/325) and 15,0% (49/325), respectively, followed by CCoV with 10,1% (33/325,), CRV with 3,0% (10/325) and CAdV-1 1,5% (5/325). The most observed viral association was CDV and CPV-2, with 31/325 (9,5%) positive samples for both viruses. In conclusion, the results showed that CPV-2, CDV and CCoV are the main pathogenic enteric viruses that circulated in Brazil between the years 2008 and 2014, infecting more frequently puppies.

Made available in DSpace on 2015-11-18T13:20:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 yasmin_farias_ioc_mest_2013.pdf: 2570192 bytes, checksum: 08f3d8b50b732ac0d3d33ed27c715211 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os rotavírus da espécie A (RVA) são os principais responsáveis pela gastroenterite aguda (GA) em diversas espécies animais. Em humanos, as crianças \2264 5 anos de idade são as mais afetadas. Cerca de 453.000 mortes infantis são causadas pela infecção por RVA, anualmente. Devido a este impacto na saúde pública algumas medidas de controle e prevenção foram estabelecidas: no Brasil, em março de 2006 foi introduzida uma vacina monovalente (G1P[8]) atenuada contra RVA, denominada Rotarix®. Segundo a Organização Mundial da Saúde, é necessário uma extensa e contínua monitorização dos genótipos circulantes de RVA, além de estudos de vigilância para que se possa avaliar os impactos da vacina, sua eficácia e o surgimento de novas variantes virais que possivelmente possam escapar do processo de imunização. Para uma melhor caracterização e entedimento da diversidade genética dos RVA, foi proposto um novo sistema de classificação baseada na análise dos 11 segmentos gênicos, no qual os genótipos de cada um dos segmentos devem ser caracterizados. Esta abordagem está fornecendo dados para apoiar a existência de três genogrupos dominantes entre humanos: Wa-like(I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1), DS1-like (G2-P[4]- I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2) e AU1-like ((G3-P[9]-I3-R3-C3-M3-A3-N3-T3-E3-H3), sendo este último menor e compartilhado por estirpes de origem felina/canina. No Brasil, trabalhos envolvendo a caracterização de todos os segmentos gênicos são escassos. No presente estudo foram selecionadas 40 espécimes fecais entre 1994-2012 de crianças hospitalizadas devido a GA causada por RVA G1, G2, G3, G4, G9 e G12, na região Norte do Brasil A principal finalidade do estudo foi avaliar a diversidade genética dos RVA circulantes antes e depois da introdução da vacina Rotarix®. Para tal, os genes de RVA foram amplificados, sequenciados e analisados por reconstrução filogenética. Através desta análise foi possível identificar pelo menos três alelos subgênicos distintos para cada gene, permitindo evidenciar constelações genotípicas diferentes, porém conservadas relacionadas aos três principais genogrupos: Wa-like, DS1-like e AU-like, sendo que neste último,uma amostra (PID084) se relacionou com estirpes de origem felina. Foram evidenciados mecanismos de variabilidade genética viral, como: reassortment inter-genogrupos ocorrendo em amostras de origem humana e entre humana-animal; reassortment intra-genogrupos ocorrendo em cepas G1P[8], G2P[4], G4P[8] e G9P[8] e com genes de origem animal; e ainda mutações pontuais ocorrendo na sequência de todos os genes das estirpes analisadas. O maior grau de variabilidade genética foi encontrado em cepas circulantes antes da introdução da vacina. Com relação aos genes que codificam para proteínas externas, foi possível identificar mudanças em resíduos localizados em regiões antigências de estirpes circulantes nos dois períodos, podendo refletir em modificações estruturais importantes na proteína. Os dados do presente estudo contribuem para uma melhor compreensão acerca da diversidade genética dos RVA e de seus mecanismos evolutivos, sendo um dos poucos trabalhos sobre a caracterização dos 11 segmentos gênicos de estirpes circulantes na Região Norte, contribuindo para esclarecer caracterísiticas que podem representar um desafio para o Programa Nacional de Imunização no Brasil / Specie A Rotaviruses (RVA) are responsible for acute gastroenteritis (GA) in many animal species. In humans, children under five years old are the most affected. Each year, a bout 453,000 infant deaths are caused by RV infections . Due to this public health impact, prevention and control measures were established: in March 2006, the Brazilian Health Ministry made available an monovalent att enuated vaccine, called Rotarix®. According to World Health Organization, extensive and continuous monitoring of RVA strains and surveillance studies are necessary to evaluate the impact and efficacy vaccine and to investigate appearance of new viral varia nts that could possibly escape the immunization procedure. For a better characterization and understanding of the RVA genetic diversity, proposed a new classification system encompassing all 11 RVA gene segments. This approach has facilitated the exponenti al growth of complete RVA genome data during recent years. On the basis of complete RVA genome sequence comparisons, two major genotype constellations (genogroups): I1 - R1 - C1 - M1 - A1 - N1 - T1 - E1 - H1 (Wa - like) and I2 - R2 - C2 - M2 - A2 - N2 - T2 - E2 - H2 (DS1 - like), have been shown to circulate worldwide among humans. A third (minor) human genotype constellation, referred to as AU1 - like (I3 - R3 - C3 - M3 - A3 - N3 - T3 - E3 - H3).In Brazil, studies involving the characterization of all genes segments are rare . In the current study, a total of 40 fecal specimens were selected between 1994 and 2011 from children hospitalized due to acute diarrhea caused by RVA G1, G2, G3, G4, G9 and G12 in Northern Brazil region, aiming to evaluate the RVA genetic diversity in the pre - vaccine period and post - va ccine.For this, the RVA genes were amplified, the amplicons were sequenced and analyzed for phylogenetic reconstruction. Based this analysis were identified three subgenotype alleles for each gene, allowing evidence con served genotypic constellations, thou gh related to three distinct genogroups: Wa - like, DS1 - like e AU - like. AU1 - like strain (PID084) revealed close relationship with genes feline origin. The results also show evidence some genetic variability mechanisms: inergenogroup reassortments events occ ourring between human - human and human - animal genes ; intragenogroup reassortment events in G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[6], G4P[8] RVA strains between human - human and human - animal gene, newly; and still occurring point mutations in the sequences of all gene s of strains analyzed. A large degree of variability has been found in circulating strains before vaccine introduction.Regarding genes encoding foreign proteins, it was possible to identify changes in residues located in antigenic regions and may reflect s ignificant changes in structural proteins.In conclusion, the current work help to increase the knowledge on the genomic diversity of RVA, aiming detect new variants and possible antigenic changes, whose potential effect on vaccine effectiveness should be s tudied. Additionally, our findings identified close relationships between human and animal RVA, contribute to clarify characteristics that can pose a challenge for the Brazilian National Immunization Program

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:50:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESEfinal20nov.pdf: 1675526 bytes, checksum: d87e98395556fe1f79698375acf1eb1b (MD5) Previous issue date: 2005-10-14 / Acute diarrhea is one of the main causes of infantile mortality worldwide (WHO), mainly in developing countries. In the present work, the prevalence of Rotavirus (RV), adenovirus (Ad), diarrheogenic E. coli (EPEC, ETEC, EIEC, EHEC, EAEC, DAEC), Salmonella, Shigella, Cryptosporidium spp., Entamoeba histolytica and Giardia lamblia was studied among children up to 3 years old with acute diarrhea. From February 2003 to June 2004, stools samples were obtained prospectly from 253 children with acute diarrhea and 78 without diarrhea attending to the emergency room in a pediatric hospital - Hospital Infantil Nossa Senhora da Glória (HINSG), in Vitória Espírito Santo state, Brazil. Bacterial detection was done in 241 stools samples (12 were excluded because were in use of antimicrobian drugs) and E. coli were isolated in 219 and 68 cases with and without diarrhea, respectively. These cases were submited to serology with policlonal anti-seros (EPEC e EIEC) and hybridization tests (Hybr) to detect virulence genes of EPEC, ETEC, EIEC, EHEC, EAEC e DAEC. RV were studied in 147 cases for immune enzymatic assay (EIARA) and in 230 cases by poliacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and Ad, only in 147 cases for immune enzymatic assay (EIARA). Protozoan infection was studied in 88 cases for immune enzymatic assay (EIA). Children with diarrhea were divided in Group I (88 cases = all enteropathogens studied), Group II (147 cases = bacterias, RV e Ad - EIARA) and Group III (230 cases = bacterias and RV - PAGE) and children without diarrhea were Group IV (78 cases = bactérias and RV - PAGE). Enteropathogens were detected in more than 60% in children with acute diarrhea and bacterial infection was the most prevalent: DEC were detected in 41,1%; EPEC in 3,6% (serology) e 9,1% (Hybr); Typical EPEC (0,9%); Atypical EPEC (8,2%); EAEC (9,1%); DAEC (20,6%); EIEC (0,9%); ETEC (4,2%). In stools samples from children without diarrhea, we found Atypical EPEC (10,3%); EAEC (20,6%); DAEC (16,2%); ETEC (1,5%). EHEC was not detected in the studied population. Shigella and Salmonella were detected in 4,6% e 2,9%, respectively, only in children with acute diarrhea. RV were detected in 35,2% (GEPA) and 50% (EIARA); Ad, in 8,2% and E. histolytica, Cryptosporidium spp. and G. lamblia in 8%, 11,4% and 14,8% of cases with diarrhea, respectively. In conclusion, Typical EPEC, EIEC and ETEC were detected only or predominantly in children with acute diarrhea. Atypical EPEC, EAEC and DAEC were not causes of acute diarrhea, except for EAEC in children more than two years old (p = 0,026). RV was the most prevalent agent when the classic enteropathogen DEC (Tipical EPEC, ETEC, EIEC and Shigella e Salmonella) was considered in this study. RV was more frequent in children below 18 months of life and in a period of March, 2003 up September, 2003. Associations among enteropathogens were frequent in the studied population and protozoa were the most of them. Comparing all of protozoa detected, only G. lamblia suggesting being a cause of acute diarrhea, isolately. / A diarréia aguda é uma causa importante de mortalidade infantil, nos países em desenvolvimento (OMS). A prevalência de rotavírus (RV), adenovírus (Ad), categorias diarreiogênicas de E. coli (DEC), Salmonella, Shigella, Cryptosporidium spp., Entamoeba histolytica e Giardia lamblia, foi pesquisada em crianças até 3 anos de idade. De fevereiro de 2003 a junho de 2004, foram obtidas 253 amostras fecais de crianças com diarréia aguda e 78 sem diarréia, atendidas no Hospital Infantil Nossa Senhora da Glória (HINSG), Vitória ES. O estudo das bactérias foi feito em 241 amostras fecais (12 excluídas por uso de antimicrobiano) com isolamento de colônias caracterizadas bioquimicamente como E.coli em 219 e 68 casos com diarréia e sem diarréia, respectivamente. Estes casos foram submetidos à sorologia com anti-soros polivalentes (EPEC e EIEC) e testes de hibridização (Hibr) para pesquisa de genes de virulência para detecção de EPEC, ETEC, EIEC, EHEC, EAEC e DAEC. RV foram pesquisados em 147 casos por ensaio imunoenzimático (EIERA) e em 230, através da eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA), e Ad em 147 casos, por ensaio imunoenzimático (EIERA). Os protozoários foram pesquisados 88 amostras por ensaio Imunoenzimático (EIE). As crianças com diarréia foram divididas em: Grupo I (88 casos = todos os agentes pesquisados), Grupo II (147 casos = bactérias, RV e Ad - EIERA) e Grupo III (230 casos = bactérias e RV - EGPA) e as crianças sem diarréia compuseram o Grupo IV (78 casos = bactérias e RV - EGPA). Mais de 60% das amostras colhidas de crianças com diarréia aguda foram positivas para enteropatógenos, sendo as bactérias, os mais prevalentes, seguidos pelos vírus. DEC foram detectadas em 41,1% dos casos de diarréia aguda: EPEC em 3,6% (sorologia) e 9,1% (Hibr); EPEC típica (0,9 %); EPEC atípica (8,2%); EAEC (9,1%); DAEC (20,6%); EIEC (0,9%); ETEC (4,2%). Nas crianças sem diarréia, detectou-se EPEC (10,3%); EAEC (20,6%); DAEC (16,2%); ETEC (1,5%). EHEC não foi detectada. Nas crianças com diarréia aguda foram detectados Shigella (4,6%), Salmonella (2,9%), RV em 35,2% (EGPA) e 50% (EIERA); Ad (8,2%) e E. histolytica (8%), Cryptosporidium spp. (11,4%) e G. lamblia (14,8%). Concluindo, EPEC típica, EIEC e ETEC foram detectadas apenas ou predominantemente nas crianças com diarréia. EPEC atípica, EAEC e DAEC não estiveram relacionadas com diarréia aguda, exceto EAEC nas crianças acima dos dois anos de idade (p = 0,026). RV foi agente infeccioso mais prevalente considerando somente DEC classicamente patógenas (EPEC típica, ETEC, EIEC, Shigella e Salmonella), nos menores de 18 meses de vida e nos meses de março a setembro de 2003. As associações entre enteropatógenos foram freqüentes, sendo os protozoários, o grupo de enterópatógenos com o maior número de associações. Dos protozoários avaliados, apenas G. lamblia parece ser agente etiológico isolado de diarréia aguda.