Utilizando dados de produtividade dos experimentos regionais de avaliação de genótipos de algodoeiro (Gossypium hirsutum) conduzidos no estado de Mato Grosso, nos anos agrícolas 1998/99, 1999/00 e 2000/01, foi realizado este trabalho, com a finalidade de estratificar e determinar o número de ambientes para avaliação de genótipos de algodão. Para isso foram avaliados oito genótipos em 1998/99, 14 em 1999/00 e 15 em 2000/01 em oito ambientes, quais sejam: Campo Novo dos Parecis, Sorriso, Primavera do Leste, Rondonópolis, Campo Verde, Sapezal, Pedra Preta e Lucas do Rio Verde. A partir das análises de variância foram aplicadas técnicas fundamentadas na análise AMMI (Additive Main effects and Multiplicative interactions). A primeira estratificação baseou-se na distância entre locais para a interação por um modelo AMMI de análise. O segundo método baseou-se na abordagem de genótipos vencedores, utilizando-se as estimativas dos modelos AMMI1 e AMMI2. As duas metodologias aplicadas permitiram a formação de estratos ambientais para todos os anos de avaliação. As matrizes de coincidências para os três anos de avaliação permitiram inferir que os estratos formados têm caráter preditivo, pois foram identificados a partir de conjuntos de genótipos diferentes em cada ano e se confirmaram nos três anos de estudo. Assim, por meio da metodologia baseada na distância para interação observou-se a formação de um estrato compreendendo Campo Verde e Lucas do Rio Verde. Entretanto a metodologia baseada em genótipos vencedores permitiu a formação de dois estratos envolvendo quatro dos oito locais avaliados, sendo o primeiro grupo constituído por Sorriso e Lucas do Rio Verde e segundo composto por Primavera do Leste e Lucas do Rio Verde. A metodologia baseada em genótipos vencedores possibilitou a formação de estratos ambientais baseados em critérios estatísticos de fácil entendimento e apresentação gráfica clara, permitindo a delimitação de estratos de forma matemática, baseada na performance dos genótipos vencedores. Ela informou de maneira integrada a recomendação de genótipos de adaptação específica para cada estrato de ambientes. / Data of yield were obtained from Regional Yield Trials of cotton (Gossypium hirsutum) genotypes carried out in Mato Grosso State, Brazil in 1998/99, 1999/00 and 2000/01, was used in this study on environmental stratification and evaluation of the minimum number of environments required for cotton genotypes assessments. Eight genotypes were evaluated in 1998/99, fourteen in 1999/00 and fifteen in 2000/01. The genotypes were planted in the following eight locations: Campo Novo dos Parecis, Sorriso, Primavera do Leste, Rondonópolis, Campo Verde, Sapezal, Pedra Preta e Lucas do Rio Verde. From the analysis of variance and the environmental means, two techniques were applied based on AMMI analysis (Additive Main effects and Multiplicative Interactions) analysis. The first method was based on an interaction distance between locations estimated by AMMI analysis. The second method was based on the winning genotypes approach, throught the interactions estimates from models AMMI1 and AMMI2. The methodologies were efficient to provide an environmental stratification at every years of evaluation. The results of the matrix of coincidences over the three years of this study suggested the formed strata have a predictive property, since their identification was based on a different set of genotypes in each year and they remained the same over the years. Then, the method based on an interaction distance between locations estimated by AMMI analysis permited to constitute one stratum involving Campo Verde and Lucas do Rio Verde. However, the method based on the winning genotypes approach has formed a two strata involving four locations; the first group was constitute by Sorriso and Lucas do Rio Verde and the second involved the locations Primavera do Leste and Lucas do Rio Verde. The methodology based on the winning genotypes approach to made possible the formation of environmental strata based on statistical criteria of easy understanding and showing graphic display. This method to allowed the demarcation of strata in a mathematical way through the performance winning genotypes; it provided an integrated understanding about the recommendation of genotypes with specific adaptation for each environmental stratum.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-16T16:47:59Z No. of bitstreams: 1 Hudsonkleio da Costa Silva.pdf: 1360315 bytes, checksum: 496e932ecdd318656c26fc4681553375 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T16:48:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hudsonkleio da Costa Silva.pdf: 1360315 bytes, checksum: 496e932ecdd318656c26fc4681553375 (MD5) Previous issue date: 2012-06-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The sugarcane (Saccharum spp.) presents itself as a culture of great social and economic importance for Brazil. The breeding programs have contributed to increasing productivity in sugarcane areas of the country, due to the replacement and renewal of sugarcane, this increase amounted to thirty percent increases in the last three decades. However, the efficiency of the breeding programs of sugarcane depends on the spatial and temporal repeatability of traits under selection. Thus, assessment surveys genotype x environment interaction and repeatability of characters is crucial to the selection result in success. The objective of this study was to evaluate the behavior of agroindustrial genotypes sugarcane in all three cutting times and reliably determine the number of evaluations needed to select new genotypes based on their production components. The experiments were conducted: in Santa Teresa Mill (Goiana) in the years 2006/2007, 2007/2008, 2008/2009, evaluating 25 genotypes; in São José Mill (Igarassú) in the years 2005/2006, 2006/2007, 2007 / 2008 and 2008/2009, to evaluate the repeatability of characters in 16 genotypes, located on the northern coast of Pernambuco, both in a randomized block design, with plots consisting of five eight-meter grooves and spaced one meter. In each section were measured variables: ton of pol per hectare (TPH), ton of cane per hectare (TCH) pol in cane corrected (PCC), fiber (FIB), purity (PZA), soluble solids (° BRIX ) and total recoverable sugar (TRS). Data were subjected to analysis of variance, the group averages by testing Skott & Knott and repeatability of the experiment than those we used: ANAVA, principal component analysis (variance and covariance) and structural analysis. Based on the results of gross income, the best genotypes for beginning and middle of harvest were RB86 7515, RB92 579 and SP81 3250, to end of season highlight for genotypes RB86 7515, SP78 4764 and SP81 3250. To select new genotypes based on the coefficient of repeatability, methods of structural analysis and principal components were equivalent, and depending on the variable in the analysis and reliability stipulated, the number of assessments varied: for TPH and TCH were needed for reliability of 2 reviews 90% for FIB, PCC, PZA, BRIX and ATR were 3-4 consecutive assessments. / A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) apresenta-se como uma cultura de grande importância social e econômica para o Brasil. Os programas de melhoramento genético vêm contribuindo para o aumento da produtividade nas áreas canavieiras do país, graças à substituição e renovação dos canaviais, esse incremento atingiu aumentos de trinta por cento nas três últimas décadas. No entanto, a eficácia dos programas de melhoramento de cana-de-açúcar depende da repetibilidade espacial e temporal dos caracteres sob seleção. Com isso, pesquisas de avaliação de interação genótipo x ambiente e repetibilidade de caracteres é de fundamental importância para a seleção resultar em sucesso. Objetivou-se com esse trabalho avaliar o comportamento agroindustrial de genótipos de cana-de-açúcar nas três épocas de corte e determinar com confiabilidade o número de avaliações necessárias para selecionar novos genótipos baseado em seus componentes de produção. Os experimentos foram instalados: na Usina Santa Teresa (Goiana) nos anos agrícolas 2006/2007, 2007/2008, 2008/2009, avaliando 25 genótipos; na Usina São José (Igarassú) nos anos agrícolas 2005/2006, 2006/2007, 2007/2008 e 2008/2009, avaliando-se a repetibilidade de caracteres em 16 genótipos, localizados no Litoral Norte de Pernambuco, ambos em delineamento experimental de blocos casualizados, com parcelas composta de cinco sulcos de oito metros e espaçadas de um metro. Em cada corte foram mensuradas as variáveis: tonelada de pol por hectare (TPH), tonelada de cana por hectare (TCH), pol na cana corrigido (PCC), fibra (FIB), pureza (PZA), teor de sólidos solúveis (ºBRIX) e açúcar total recuperável (ATR). Os dados foram submetidos à análise de variância conjunta, o agrupamento de médias através do teste de Skott & Knott e para o experimento de repetibilidade além desses utilizou-se: ANAVA, análise de componentes principais (variância e covariância) e análise estrutural. Com base nos resultados obtidos de renda bruta, os melhores genótipos para início e meio de safra foram RB867515, RB92579 e SP813250; para final de safra destaque para os genótipos RB867515, SP784764 e SP813250. Para selecionar novos genótipos baseado no coeficiente de repetibilidade, os métodos de componentes principais e análise estrutural se equivaleram, sendo que dependendo da variável em análise e da confiabilidade estipulada, o número de avaliações variou: para TPH e TCH foram necessárias 2 avaliações para confiabilidade de 90%, para FIB, PCC, PZA, BRIX e ATR foram de 3 a 4 avaliações consecutivas.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-22T14:29:22Z No. of bitstreams: 1 Vaubam Antonio Carvalho da Silva.pdf: 686276 bytes, checksum: b93c14b61aea15904fa902f27cdd2442 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-22T14:29:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vaubam Antonio Carvalho da Silva.pdf: 686276 bytes, checksum: b93c14b61aea15904fa902f27cdd2442 (MD5) Previous issue date: 2007-10-10 / Rice (Oryza sativa L.) is one of the most cultivated and consumed crop in all continents. In Brazil, it is one of the basic sources of food, but the Brazilian productivity average is considerad low. That is due to inappropriate cultivation practices in some regions and mainly because there is not a sufficient number of evaluated and recommended cultivars for different systems of cultivation in several producing regions. In this context, theevaluations of genotype performance in different environments, the determination of genetics phenotype variability and the evaluation of implications arising from the interaction effects of genotype x environments allow to evaluate the genetic control of characters. Also, this evaluation makes possible the selection of genotypes with favorable characters for cultivation and enables the indication of genotypes for using in genetic breding programs. The objective of this work was to evaluate the upland rice genotypes in Zona da Mata of Pernambuco,Brazil. Two experiments were carried out in 2006, at the Agricultural School of Palmares,South of Zona da Mata, and at Agrotechnical School of Vitória de Santo Antão, Center of Zona da Mata. Twelve genotypes were used in both experiments according to randomized plots with four replicates.In each plot there were 4m-rows, separated 50 cm from each other in which 75 seeds were distributed per linear meter.Data collection was done in three central lines of each plot. Planting was accomplished in the second half of April so that the greater pluviometric index and the regularity of rainfall at each place coincided with the critical period of the culture, which is the flowering phase. The Zona da Mata of Pernambuco has climatic components such as luminosity, temperature and precipitation suitable for upland rice culture. The genotypes evaluated were IAC 47, Bonança, Rio Parnaíba, Maravilha,Caiapó, BRA 1506,BRA 1600, CNAs 9045, CNAs 9025,BRSMG curinga, BRS primavera and PB 5. It was observed that the genotypes Bonança, BRA 1506, BRA 1600, CNAs 9045 and BRSMG curinga had adequate performances for cultivation on upland conditions in the Zona da Mata of Pernambuco. / O arroz (oryza sativa L.) é um dos cereais mais cultivados e consumidos emtodos os continentes. No Brasil é uma das fontes básicas de alimento, porém a produtividade média brasileira é considerada baixa. Isto se deve ao manejo inadequado da cultura em algumas regiões e, principalmente, à carência de um número maior de cultivares avaliadas e recomendadas para os diversos sistemas de cultivo nas diferentes regiões produtoras.Neste contexto, a avaliação do comportamento de genótipos em diferentes ambientes, e as implicações dos efeitos da interação genótipo x ambiente permitem conhecer o controle genético dos caracteres e selecionar genótipos que apresentam caracteres favores à cultura,tornando possível a indicação de cultivares tanto para uso comercial como para serem utilizados em programas de melhoramento genético. O objetivo deste trabalho foi avaliar o comportamento de genótipos de arroz de terras altas na Zona da Mata do Estado de Pernambuco,Brasil.Dois experimentos foram conduzidos em 2006 na referida região, mais especificamente, na Escola Agrícola de Palmares, Zona da Mata Sul e na Escola Agrotécnica de Vitória de Santo Antão, Zona da Mata Centro.Foram avaliados 12 genótipos em ambos experimentos, em 4 blocos, de acordo com o delineamento experimental de blocos ao acaso.As parcelas foram constituídas de 5 linhas paralelas de 5m, espaçadas em 50 cm, nas quais foram distribuídas 75 sementes por metro linear. Todas as observações foram feitas nas três linhas centais de cada parcela.O plantio foi realizado na segunda quinzena do mês de abril para que o maior índice pluviométrico e a regularidade das chuvas coincidissem com o período crítico da cultura, que é a fase de emborrachamento.A Zona da Mata de Pernambuco apresenta condições climáticas como, luminosidade, temperatura e índice pluviométrico compatível com esta cultura. Os genótipos avaliados foram IAC 47, Bonança, Rio Parnaíba, Maravilha, Caiapó, BRA 1506, BRA 1600, CNAs 9045, BRASMG curinga, BRS primavera e PB5. Sendo que o Bonança, BRA 1506, BRA 1600, CNAs 9045 e BRSMG Curinga mostraram promissores para serem explorados em cultivo de terras altas na Zona da Mata de Pernambuco.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-03-16T13:33:25Z No. of bitstreams: 1 Djayran Sobral Costa.pdf: 864511 bytes, checksum: 0918bc6a1c7d21a4ec2f91315aa810ee (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T13:33:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Djayran Sobral Costa.pdf: 864511 bytes, checksum: 0918bc6a1c7d21a4ec2f91315aa810ee (MD5) Previous issue date: 2015-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Sesame (Sesamum indicum L.) is one of the oldest cultivated plant species by man. The locality of its origin is somewhat uncertain and may be between Africa and Asia. Sesame arrived in Brazil, mainly in the Northeast, brought by the Portuguese in the sixteenth century and its cultivation used traditionally as a backyard crop or small areas of plots of separation more known with terraces. Exploration attempts in the Northeast has always been an obstacle to the expansion of sesame in this region, because the lack of incentive is great making the culture remain only at subsistence level, with the need to test inputs and more apt to local cultivars production. The plant growth regulators produced in research labs focused on improving production, while similar plant hormones (cytokinins, gibberellins, auxin and ethylene), is an option to stimulate the growth and development of sesame. Given the constant search of the population by edible oil which will benefit human health and the lack of technical information to improve the management of sesame culture, aimed to evaluate four sesame cultivars productivity gap, in two growing seasons under the influence of the application of Stimulate® plant hormone. The experiment was carried out in crop years 2014 and 2015 in areas belonging to the Academic Unit of Garanhuns, located in Garanhuns. The experiment was conducted in a randomized block design, using four genotypes (BRS SEDA, CNPA G4, Lineage 1 and Lineage 2) and four sesame lines with and without fitoestimulante (Stimulate®). Data were subjected to analysis of variance and means compared by Tukey test at 5% probability. Upland condition (2014) are recommended for planting genotypes in launching Lineage 1 and Lineage 2 with application fitoestimulante. With use of irrigation (2015) plants of the genotypes BRS SEDA and CNPA G4 with fitoestimulante employment are more productive. Productivity of genotypes is influenced by the application of fitoestimulante. / O Gergelim (Sesamum indicum L.) é uma das espécies vegetais mais antigas cultivadas pelo homem. O gergelim chegou ao Brasil, principalmente no Nordeste, trazido pelos portugueses por volta do século XVI, tendo seu cultivo empregado tradicionalmente, como cultura de fundo de quintal ou em pequenas áreas de separação de glebas mais conhecidos com terreiros. As tentativas de exploração no Nordeste sempre foi um entrave para a expansão do gergelim nesta região, pois a falta de incentivo é grande fazendo com que a cultura permaneça apenas a nível de subsistência, havendo a necessidade de se testar insumos e cultivares mais aptas aos locais de produção. Os reguladores vegetais produzidos em laboratórios de pesquisas voltados para a melhoria da produção, quando similar os hormônios vegetais (citocininas, giberelinas e auxinas), é uma opção para estimular o crescimento e desenvolvimento do gergelim. Em vista da constante busca da população por óleo comestível que venha trazer benefícios a saúde humana e a falta de informações técnicas de melhorar o manejo da cultura do gergelim, objetivou-se avaliar a produtividade de quatro genótipos de gergelim, em duas épocas de cultivo, sob a influência da aplicação do hormônio vegetal Stimulate®. O experimento foi realizado nos anos agrícolas 2014 e 2015, em áreas pertencentes à Unidade Acadêmica de Garanhuns, localizada na cidade de Garanhuns. O experimento foi conduzido em blocos casualizados, com a utilização de quatro genótipos (BRS SEDA, CNPA G4, Linhagem 1 e Linhagem 2) e quatro linhas de gergelim com e sem fitoestimulante (Stimulate®). Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey, a 5% de probabilidade. Em condição de sequeiro (2014) são recomendados para plantio os genótipos em lançamento Linhagem 1 e Linhagem 2 com aplicação de fitoestimulante. Com uso da irrigação (2015) as plantas dos genótipos BRS SEDA e CNPA G4 com emprego do fitoestimulante são mais produtivos. A produtividade dos genótipos é influenciada pela aplicação do fitoestimulante.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Enterococcus faecalis (E. faecalis), conhecidamente patógeno oportunista, tem sido frequentemente associado a infecções sistêmicas graves. É também encontrado na cavidade oral, com destaque em infecção endodôntica refratária. O objetivo deste estudo foi avaliar características moleculares de E. faecalis isolados de infecção endodôntica primária no Brasil e comparar com isolados orais e não orais de pacientes do Reino Unido e do Japão, assim como E. faecalis resistentes à vancomicina. O presente estudo também investigou o relacionamento entre E. faecalis de diferentes origens (oral e não oral) e de diferentes áreas geográficas para obter uma melhor compreensão do envolvimento dos diferentes reservatórios no surgimento e propagação de clones virulentos, aqueles que possuem genes que conferem infectividade e virulência, assim como resistência aos antibióticos. Para tal, foram estudados E. faecalis isolados em infecções endodônticas no Brasil (n = 20) e orais no Reino Unido (n = 10), e em infecções não orais no Japão (n = 9). Além disso, 20 E. faecalis isolados ambientais do Hospital Universitário de Gales (Cardiff, Reino Unido), classificados como Enterococcus resistentes à vancomicina (VRE) também foram examinados. A Concentração Inibitória Mínima (CIM) dos isolados do Brasil foi obtida pelo método de diluição em agar de acordo com as recomendações do Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Reação em cadeia da polimerase (inglês - PCR) foi a técnica empregada para detectar os genes de virulência e aqueles associados à resistência aos antibióticos, enquanto Reação de Amplificação Aleatória de DNA Polimórfico (inglês - RAPD-PCR) foi escolhida para a tipagem molecular. Dentre os genes de virulência examinados, o gene que codifica a gelatinase gelE foi o mais prevalente entre os isolados (77-100%). Entre isolados orais, foram detectados os genes agg de substâncias de agregação, esp de proteína de evasão imune, cylB de citolisina, genes de resistência à tetraciclina tetM e tetL e à eritromicina ermB com diferentes prevalências. Os isolados clínicos hospitalares do Japão apresentaram perfil genético similar aos isolados orais, mas com maior prevalência de ermB e cylB. Todas as amostras de VRE foram positivas para os genes gelE, esp, agg, vanA, ermB e tetM, 95% foram positivos para cylB e 17% positivo para tetL. Todas as amostras foram negativas para ermA, asa373, vanB, vanC1 e vanC2/3. RAPD-PCR revelou agrupamento de VRE em comparação com outros isolados. Neste estudo, os isolados de E. faecalis de infecções orais apresentaram genes de resistência à tetraciclina, um antimicrobiano frequentemente usado no tratamento local de infecções dentárias, abrindo um debate muito importante sobre o papel e a eficácia desta droga para infecções orais. Claramente, são necessários mais estudos nesta área principalmente em relação à expressão de fatores de virulência entre isolados endodônticos para melhor nortear as estratégias de tratamento. As pressões externas no microambiente dos canais radiculares podem ser responsáveis pela seleção de espécies mais resistentes e virulentas. Por fim, embora isolados orais apresentem genes de virulência fundamentais para a patogenicidade, estes foram detectados em menor incidência em comparação com os isolados não-orais e VRE. / Enterococcus faecalis is an opportunistic pathogen known to cause serious systemic infection. It is also encountered in the oral cavity and has been implicated in persistent root canal infection. The aim of this study was to evaluate a range of molecular characteristics of E. faecalis isolated from primary endondontic infections in Brazil and compare to isolates from oral and non-oral infections in patients from UK and Japan, as well as isolates of vancomycin resistant E. faecalis, VRE, from a hospital environment. The present study was undertaken to explore the relatedness of E. faecalis from different origins, oral and non oral, and from different geographic areas to gain a better understanding of the involvement of the different reservoirs in the emergence and spread of virulent clones, those that acquired a number of genes conferring infectivity and virulence and in addition antibiotic resistance. To do this, E. faecalis from oral infections in Brazilian (n=20) and UK patients (n=10), and non-oral infection in japanese patients (n=9) were studied. In addition, 20 environmental VRE isolates from the University Hospital of Wales (Cardiff, UK) were also examined. For braziliam isolates, antimicrobial susceptibility was ascertained by agar dilution, using the recommendations of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). For all isolates, PCR with validated primers was used to detect genes associated with antibiotic resistance and virulence, whilst RAPD-PCR was used to fingerprint isolates. Of the virulence genes examined, gelatinase gene gelE was most prevalent amongst isolates (77-100%). In the case of oral isolates, the genes of aggregation substances agg, immune evasion protein esp, cytolysin cylB, tetracycline resistance tetM and tetL and erythromycin resistance ermB were detected with varying prevalence. Japanese hospital isolates had a similar genetic profile to oral isolates but with higher prevalence of ermB and cylB. All VRE strains were positive for gelE, esp, agg, vanA, ermB and tetM, 95% were positive for cylB and 17% positive for tetL. All isolates were negative for ermA, asa373 vanB, vanC1 and vanC2/3. RAPD-PCR revealed clustering of VRE compared with other isolates. In this study, isolates of E. faecalis from oral infections showed antibiotic resistance genes for tetracycline, an agent used in the local treatment of dental infection. This opens up a much-needed debate on the role and efficacy of this antibiotic for oral infections. Clearly, more research in this area is required particularly in relation to the possession and expression of virulence factors in the root canal environment, to better inform our management strategies. Environmental pressures in root canals may be responsible for the selection of more resistant species and the possession of virulence determinants. This knowledge is important in guiding procedures for controlling the increasing problem of antibiotic resistance amongst clinically relevant bacteria. Furthermore, whilst oral isolates had genes that could contribute to pathogenicity, these were detected at lower incidence compared with non-oral and VRE isolates.

O eritrovírus humano (parvovírus), gênero Erytrovírus, é o único representante da família Parvoviridae responsável por um amplo espectro de doenças. Estudos recentes têm demonstrado variações entre o eritrovírus e orientam a reclassificação destas variantes em três genótipos distintos: genótipos 1, 2 e 3. O papel do eritrovírus na etiopatogenia de doenças hematológicas em humanos permanece incerto. Este estudo teve como objetivo principal avaliar a relação etiopatogênica dos genótipos do eritrovírus e as citopenias de origem desconhecida. Materiais e Métodos: Participaram do estudo 285 indivíduos procedentes do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Destes, 120 apresentavam citopenias de origem desconhecida (grupo 1 Casos), 45 eram doadores de medula óssea (grupo 2 Controles Saudáveis) e 120 eram pacientes com doenças oncohematológicas crônicas (grupo 3 Controles com Neoplasias Hematológicas). A pesquisa do vírus foi realizada pelo método de semi-nested PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) em amostras de medula óssea e de sangue periférico. As fitas complementares foram seqüenciadas diretamente do produto da PCR. Amostras de plasma de todos os indivíduos incluídos no estudo foram testadas para presença de anticorpos IgG e IgM específicos contra o eritrovírus por ensaio imunoenzimático. Resultados: Dos 40 indivíduos com resultado positivo na PCR em amostra da medula óssea, o genótipo 1 foi encontrado em 22 (55%), o genótipo 2 em 5 (12,5%), o genótipo 3 em 13 (32,5%). Quando comparadas as freqüências de positividade entre os casos e controles (Grupo 1 VS Grupos 2 e 3), não encontramos diferença significativa com relação ao genótipo 1 (p=0, 192) nem com relação aos genótipos 2 e 3 (p= 0.143). A soroprevalência encontrada na amostra foi de 71%. Conclusão: Concluímos que a infecção isolada pelo eritrovírus, independente do genótipo encontrado, não tem relação etiopatogênica com as citopenias de origem desconhecida, uma vez que o vírus foi encontrado com a mesma freqüência nos casos e nos controles estudados / The human erythrovirus (parvovirus), genus Erytrovirus, is the only representative of the family Parvoviridae responsible for a broad spectrum of diseases. Recent studies have shown variations within the erythrovirus and guide the classification of these variants in three distinct genotypes: genotypes 1, 2 and 3. The role of the erythrovirus in the etiopathogenesis of hematological diseases in humans remains uncertain. This studys main objective was to evaluate the etiopathogenic relationship between the genotypes of the erythrovirus and the cyptopenias of unknown origins. Methods and Materials: 285 individuals coming from the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo participated in the study. Of these, 120 represented cytopenias of unknown origins (group one Cases), 45 were bone marrow donors (group two - Healthy Controls), and 120 were patients with chronic oncohematological diseases (group three Controls with Hematological Disorder). The research of the virus was done through the semi-nested PCR method (polymerase chain reaction) in bone marrow and peripheral blood samples. The complementary strands were sequenced directly from the product of the PCR. Plasma samples from all of the individuals included in the study were tested through immunosorbent assay for the presence of lgG and IgM antibodies specific to the eritrovírus. Results: Of the 40 individuals that had positive PCR bone marrow results, the genotype 1 was found in 22 (55%), the genotype 2 in 5 (12.5%), and genotype 3 in 13 (32.5%). When the frequency of positivity was compared between the cases and the controls (Group 1 vs. Groups 2 and 3), we did not find a significant difference in relation to genotype 1 (p=0.192), nor did we find a significant difference in relation to genotypes 2 and 3 (p=0.143). The overall seroprevalence found in the samples was 71%. Conclusion: We conclude that the infection isolated by the erytrovirus, independent of the genotype found, does not have a etiopathogenic relationship with the cytopenias of unknown origins, hence the virus was found with the same frequency in the cases and the controls studied

A utilização de genótipos de culturas com potencial alelopático superior é considerada uma importante alternativa para manejo de plantas daninhas. Estas cultivares também podem ser utilizadas para isolamento de substâncias potencialmente alelopáticas, como base para produção de herbicidas sintéticos. Contudo, há dificuldades para reproduzir-se a campo os resultados de atividade obtidos em ensaios conduzidos em laboratório. Este trabalho objetivou determinar a existência de variabilidade entre genótipos de sorgo quanto à produção de extratos hidrofóbicos de raízes; relacionar o potencial alelopático mensurado em laboratório com a supressão diferencial de plantas daninhas por estes genótipos a campo; e verificar a importância de fatores limitantes do desempenho da substância sorgoleone em nível de campo. Realizaram-se experimentos em casa de vegetação e em laboratório para testar o potencial alelopático de extratos hidrofóbicos e hidrofílicos de plantas de sorgo e quantificar a produção e o comportamento ambiental de sorgoleone. No campo, foram quantificados os efeitos de diversos genótipos dessa cultura. Há variabilidade entre genótipos de sorgo quanto à produção de extratos hidrofóbicos. O aleloquímico sorgoleone é o principal componente de extratos hidrofóbicos de raízes de sorgo. Não se constatou relação de dependência entre produção de sorgoleone por genótipos de sorgo em laboratório e capacidade de supressão de plantas daninhas a campo, por estes genótipos. O genótipo de sorgo BR 601 apresenta potencial alelopático superior em laboratório, e pertence ao grupo de genótipos com maior efeito alelopático a campo. A limitada ação de sorgoleone a campo deve-se à elevada sorção aos colóides do solo e à reduzida concentração no ambiente externo às raízes.

Introdução: As variações da CYP2D6 estão associadas com o desfecho clínico das pacientes na terapia adjuvante do câncer de mama com tamoxifeno (TAM). Esta associação deve-se principalmente a hidroxilação do N-desmetiltamoxifeno (NDT) pela CYP2D6 a endoxifeno (EDF) que, por sua alta potência antiestrogênica, é o principal responsável pela eficácia terapêutica. O objetivo deste estudo foi avaliar a relação entre o genótipo e o fenótipo da CYP2D6 com os níveis de EDF e a razão metabólica [NDT]/[EDF] em uma população do Sul do Brasil. Métodos: Foram obtidas amostras de plasma em vale de 97 pacientes em terapia com o tamoxifeno. A genotipagem da CYP2D6 foi realizada com ensaio Luminex, com determinação de escores de atividade genotípica (EAG). As concentrações do TAM e seus metabólitos foram determinados por CLAE-DAD e classificadas em metabolizadores lentos (ML), intermediários (MI), rápidos com atividade diminuída (MR-D), rápidos com atividade rápida (MR-R) e ultra-rápidos (UR). A fenotipagem foi realizada através da determinação do dextrometorfano (DMT) e do dextrorfano (DTF) por CLAE-FL nas amostras de plasma coletadas três horas após administração oral de 33 mg de DMT. A atividade da CYP2D6 foi avaliada pela razão metabólica [DMT]/[DTF]. Resultados: A genotipagem da CYP2D6 mostrou prevalência de 4,1% de ML, 4,1% de MI, 49,5% de MR-D, 39,2% de MR-R e 3,1% de UR. O genótipo (EAG) foi significativamente correlacionado com o fenótipo ([DMT]/[DTF]), com uma associação moderada (rs= -0,463; p<0,001). As medianas das concentrações plasmáticas do TAM e seus metabólitos (ng mL-1) foram: TAM 57,17; HTF 1,01; EDF 6,21; NDT 125,50. Os níveis de EDF foram inferiores nos ML em comparação aos MR (p<0,05). O fenótipo apresentou maior associação, porém ainda moderada, com os níveis de EDF e [NDT]/[EDF] em comparação ao genótipo (r= -0,507 r=0,625, p<0,001 versus r= 0,356 r=0,516; p<0,01). Ao fenótipo da CYP2D6 foram atribuídas 26% da variabilidade dos níveis de EDF e 38 % das razões metabólicas [NDT]/[EDF], enquanto que ao genótipo foram atribuídas 12% e 27 %, respectivamente. Conclusão: A genotipagem e/ou fenotipagem da CYP2D6 não foram capazes de predizer completamente as concentrações de EDF. Desta forma, sugerimos que estudos futuros utilizem o monitoramento dos níveis de EDF durante a terapia com TAM, com o objetivo de avaliar a sua efetividade. / Background: An association between CYP2D6 variation and clinical outcomes among women with breast cancer treated with tamoxifen (TAM) has been demonstrated, such that the presence of 2 functional CYP2D6 alleles was associated with better clinical outcomes. This association is mainly due the CYP2D6 mediated hydroxylation of N-desmethyltamoxifen (NDT) to yield endoxifen (EDF), which because of its high antiestrogenic potency, is the main responsible for the therapeutic efficacy of TAM. The aim of this study was to evaluate the relation of CYP2D6 genotyping and phenotyping with EDF levels and [NDT]/[EDF] metabolic ratio in breast cancer patients from South of Brazil under TAM therapy. Methods: Trough blood samples were collected from 97 patients. CYP2D6 genotyping was performed with a Luminex assay and calculation of Genotypic activity scores (GAS). Tamoxifen and metabolites EDF, NDT and 4-hidroxy-tamoxifen (HTF) were measured in plasma by HPLC-PDA. CYP2D6 phenotyping was performed by determination of dextromethorphan (DMT) and dextrorphan (DTF) by HPLC-FL at plasma collected three hours after oral administration of 33 mg of DMF. Phenotypes were given according to [DMT]/[DTF] metabolic ratio. Results: CYP2D6 genotyping indicated a prevalence of 4.1% PM, 4.1% IM, 49.5% EM-S, 39.2% EM-F and 3.1% UM. Genotype (GAS), was significantly correlated with phenotype ([DMT]/[DTF]), with a moderate association (rs= -0.463; p<0.001). Median plasma concentrations (ng mL-1) (N=97) were: TAM 57.17; HTF 1.01; EDF 6.21; NDT 125.50. EDF levels were lower in PM than in EM (p<0.05). Phenotype showed stronger, but still moderate, association with EDF and [NDT]/[EDF] than genotype (r= -0.507 r=0.625, p<0.001 versus r= 0,356 r=0.516, p<0.01). Phenotype accounted for 26% of the variability in EDF levels and 38 % of [NDT]/[EDF], while genotype for 12% and 27 %, respectively. Conclusion: CYP2D6 genotyping and/or phenotyping could not fully predict EDF concentrations. Monitoring EDF itself could be considered in further studies during TAM therapy in order to evaluate its efficacy

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 562430 bytes, checksum: 182da810cb5c6524a339ad2ea7c37142 (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In plant breeding, when the objective is to select or recommend genotypes to be planted, the study of the interaction between genotype and environment plays a important role. However, this kind of study does not provide detailed information on the behavior of each cultivar due to environmental variations. Thus become necessary to perform analyzes of stability and adaptability for identification and recommendation superior materials in different environments. Although the literature presents several methods for performing analysis of adaptability and stability, none of them take account of the presence of non-normal phenotype, in other words, phenotypic values asymmetric distributions or heavy tails. Thus, if there is the presence of such phenotypic values, the methods can be influenced and the recommendation may be mistaken, that is, the use of such methods cause inadequate estimates that do not reflect the true relationship between the variation environmental and phenotypic response. An interesting solution for treating this problem in a unified way, that is, the presence of outliers or asymmetry is to use the quantile regression (QR). Such methodology, besides the usual regression methods, using the conditional mean to explain the functional relationship between environmental variation and phenotypic response, makes use of conditional quantile functions. This way the QR possible to choose the quantile which best represents the functional relationship of interest in order to naturally cover the lack of normality cited above. Thus, this paper aims to present the methodology of quantile regression, through a detailed discussion of its theorical foundations, demonstrating it by concrete applications, its use in analysis of adaptability and stability, thus providing a easily and accessible material for readers interested in that subject, contributing researchers and those interested in this area. To the technic evaluation symmetric distributions phenotypic values, symmetric with outliers, right asymmetric, right asymmetric with outliers, left asymmetric and left asymmetric with outliers were simulated. Furthermore, we used data from an experiment on dry matter yield of 92 genotypes of alfalfa (Medicago sativa) evaluated in 20 environments. It is suggested that, for symmetrical phenotypic values should be determined if it has outlier, if it has a QR ( &#964; = 0,50 ) should be used, if not, should be used either Eberhart and Russell methodology (1966) or QR ( &#964; = 0,50 ). Since the phenotype is asymmetric, with or without the presence of outlier, it uses QR ( &#964; = 0,25 ) to right asymmetry and QR ( &#964; = 0,75) to the left asymmetry. According to the results the QR method was efficient for classifying alfalfa genotypes. / No melhoramento genético de plantas, quando o objetivo é selecionar ou recomendar genótipos para o plantio, o estudo da interação entre genótipo x ambiente é de extrema importância. Entretanto, tal estudo não fornece informações pormenorizadas sobre o comportamento de cada cultivar diante das variações ambientais. Assim, tornam-se necessárias as análises de adaptabilidade e de estabilidade para a identificação e recomendação de materiais superiores em diferentes ambientes. Embora a literatura apresente diversos métodos, para realização da análise de adaptabilidade e estabilidade, nenhum leva em consideração a presença de fenótipos não normais, ou seja, distribuições de valores fenótipos assimétricos ou com caudas pesadas. Desta forma, caso haja a presença desse tipo de valores fenotípicos, os métodos podem sofrer a influência de modo que a recomendação pode ser errônea, ou seja, o uso de tais métodos ocasionam estimativas inadequadas, que não refletem a verdadeira relação existente entre a variação ambiental e a resposta fenotípica. Uma solução interessante para tratar este problema de maneira unificada, isto é, a presença de pontos discrepantes ou assimetria, é a utilização de regressão quantílica (RQ). Tal metodologia, diferentemente dos métodos de regressão usuais, que utilizam a média condicional para explicar a relação funcional entre a variação ambiental e a resposta fenotípica, faz uso de funções quantílicas condicionais. Desta forma, a RQ possibilita escolher o quantil que melhor representa a relação funcional de interesse com o intuito de contemplar naturalmente a mencionada falta de normalidade. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo apresentar a metodologia de regressão quantílica, através de uma discussão detalhada de seus fundamentos teóricos, evidenciando, com aplicações concretas, seu uso em análise de adaptabilidade e estabilidade, fornecendo assim um material de fácil acesso para leitores interessados no assunto, contribuindo com pesquisadores e interessados nesta área. Para avaliação da técnica foram simulados valores fenotípicos, com distribuições simétrica, simétrica com outliers, assimétrica à direita, assimétrica à direita com outliers, assimétrica à esquerda e assimétrica à esquerda com outliers. Além disso, foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produção de matéria seca de 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa) avaliados em 20 ambientes. Sugere-se que, para valores fenotípicos simétricos deve-se averiguar se este possui outlier, se sim é utilizada ou a regressão não paramétrica ou a RQ (&#964; = 0,50) , se não, se utiliza ou a metodologia de Eberhart e Russell (1966) ou a RQ (&#964; = 0,50) . Já se o fenótipo for assimétrico, com ou sem a presença de outlier, utiliza-se RQ (&#964; = 0,25) para assimetria a direita e RQ (&#964; = 0,75) para assimetria à esquerda. De acordo com os resultados encontrados a RQ foi eficiente para classificação de genótipos de alfafa.

Submitted by Ricardo Lozano Teixeira de Carvalho (rlcarvalho@dow.com) on 2018-08-04T19:38:47Z No. of bitstreams: 1 REPOSITÓRIO_Dissertacao_Ricardo_Carvalho.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-06T18:12:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carvalho_rlt_me_jabo.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-06T18:12:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carvalho_rlt_me_jabo.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) Previous issue date: 2018-06-18 / Genótipos superiores têm alta capacidade de produção e resistência às principais doenças, porém o efeito do ambiente pode alterar essas características. Quando plantados em várias localidades, os genótipos podem se comportar de maneira diferente devido a sua adaptabilidade a cada região e a interação destes com o ambiente. O uso de sementes não adaptadas a região e o manejo inadequado são as principais causas de baixo rendimento nas lavouras de milho. Genótipos que respondem ao manejo utilizado, e que se comportam de maneira estável são fundamentais para obtenção de boa produtividade. Com base nisso este trabalho teve como objetivo avaliar a adaptabilidade, estabilidade e produtividade de grãos de híbridos experimentais e comerciais de milho para a segunda safra brasileira. Foram avaliados 33 híbridos, na segunda safra de 2016, em 39 locais, divididos em três macrorregiões (Tropical Sul, Tropical Centro Oeste e Tropical Centro Leste). Com as médias de produtividade de grãos obtidas após a realização da análise de variância, foram estimados os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade através de regressão linear bissegmentada. Os genótipos foram discriminados de acordo com sua adaptabilidade e estabilidade para cada região. Na região Tropical Sul o híbrido HC04 e HE16 são recomendados para ambientes favoráveis, pois respondem as melhorias de ambiente. Na região Tropical Centro Oeste o genótipo experimental HE16 também foi classificado como responsivo. E na tropical Centro Leste 85% dos genótipos foram estáveis. O genótipo HC07 é de adaptabilidade a ambientes desfavoráveis em todas as regiões. Os genótipos HC09 e HC10 são estáveis, de adaptabilidade ampla e com boa produtividade de grãos em todas as regiões. / Superior genotypes have a high production capacity and resistance to major diseases, but environment effect can alter these traits. When planted in multiple locations, genotypes may behave differently due to their adaptability to each region and interaction with the environment. The planting of seeds not adapted to a region and the management used is one of the main causes of low yields in corn crops. Genotypes that respond to the management and behave in a stable way are essential to obtain a good yield. Thus, the aim of this study was to assess the adaptability, stability, and grain yield of experimental and commercial corn hybrids in the second Brazilian crop. Thirty-three hybrids were assessed in the second crop of 2016 in 39 sites divided into three macro-regions (Tropical South, Tropical Central West, and Tropical Central East). Adaptability and stability parameters were estimated by means of bissegmented linear regression with the average grain yield obtained after performing the analysis of variance. Genotypes were discriminated considering their adaptability and stability for each region. In the Tropical South region, the hybrids HC04 and HE16 are recommended for favorable environments since they respond to environmental improvements. The genotype HE16 was also recommended for favorable environments in the Tropical Central West. In the Tropical Center East 85% of hybrids were stable. The genotype HC07 is adaptable to unfavorable environments in all regions. The genotypes HC09 and HC10 are stable, with broad adaptability and good grain yield in all regions.