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Fatores de virulência e sensibilidade antimicrobiana de Plesiomonas shigelloides isoladas de água de rio / Virulence factors and antimicrobial susceptibility of Plesiomonas shigelloides isolated from river water

Nascimento, Cátia Maria Geralda dos Santos, 1971- 21 August 2018 (has links)
Orientador: Tomomasa Yano / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-21T18:53:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nascimento_CatiaMariaGeraldadosSantos_M.pdf: 1717590 bytes, checksum: 6c341cf3cd058cf34bc633755af508d8 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Neste estudo foram analisadas oito isolados de Plesiomonas shigelloides, obtidos da bacterioteca do Laboratório de Fatores de Virulência em Bactérias, Instituto de Biologia -UNICAMP - Campinas/SP: sete isolados são provenientes de água doce do Rio Cambé na região de Londrina/PR e, um isolado de ATCC 14029. Os sobrenadantes de culturas de P. shigelloides foram capazes de induzir efeitos anticarcinogênicos in vitro (em células He-La e HEp-2), apesar de apresentarem efeitos citotóxicos em linhagens celulares não cancerígenas (em células CHO e Vero). A atividade hemolítica dos cultivos de P. shigelloides foi detectada em placas com ágar sangue (meio sólido) e em microplaca (meio líquido) contendo hemácias de carneiro. A atividade citotóxica e hemolítica de Plesiomonas shigelloides apresenta característica de termolabilidade. Os isolados de P. shigelloides aderiram em células HEp-2 e em superfícies inertes como o plástico (microplaca de poliestireno) e vidro (lamínula) e, ainda apresentaram a capacidade de formar biofilme in vitro, sendo possível a colonização e formação de biofilmes em células epiteliais e em dispositivos médicos implantáveis como cateteres, próteses e/ou sondas. A produção de exoenzimas hidrolíticas como lípase e proteases (caseinase e elastase) foi detectada nos isolados de P. shigelloides. No teste de sensibilidade antimicrobiana pelo método de difusão de discos, os isolados de P. shigelloides se mostraram sensíveis à maioria dos antibióticos utilizados. Entretanto, outros testes de sensibilidade antimicrobiana se tornam necessários de modo a assegurar uma terapia antibiótica eficiente em casos de confirmação de diagnóstico clínico microbiológico. Neste estudo, os isolados de P. shigelloides expressaram fatores de virulência in vitro como citotoxicidade, adesão, exoenzimas e resistência antimicrobiana que podem potencialmente estar envolvidos na sua patogenicidade, de modo especial às gastroenterites ou complicações extra-intestinais (septicemia) em indivíduos imunocomprometidos (HIV-soropositivo, câncer ou ainda doenças hepatobiliares) / Abstract: We analyzed eight isolates Plesiomonas shigelloides, obtained from the bacterial collection Laboratory of Virulence Factors in Bacteria, Biology Institute - UNICAMP - Campinas/SP: seven isolates are from freshwater in Cambé River, region of Londrina/PR and a isolate ATCC 14029. The culture supernatants P. shigelloides were able to induce anticarcinogenic effects in vitro (He-La and HEp-2 cells), although having cytotoxic effects on non-cancer cell lines (CHO and Vero cells). The hemolytic activity of cultures P. shigelloides was detected on blood agar plates (solid medium) and microplates (liquid medium) containing sheep erythrocytes. The hemolytic and cytotoxic activity P. shigelloides features characteristics of thermo ability. Isolates P. shigelloides joined in HEp-2 cells and inert surfaces such as plastic (polystyrene microplate) and glass (coverslips) and also had the ability to form biofilm in vitro, it being possible colonization and biofilm formation in epithelial cells and devices implantable medical devices such as catheters, implants and/or probes. The production of hydrolytic exoenzymes such as lipase and protease (caseinase and elastase) was detected in isolates P. shigelloides. In antimicrobial susceptibility testing by the disc diffusion method, isolates P. shigelloides were sensitive to most antibiotics. However, other antimicrobial susceptibility testing has become necessary to ensure efficient antibiotic therapy in cases of clinical diagnostic microbiological confirmation. In this study, isolates P. shigelloides expressed virulence factors in vitro as cytotoxicity, adhesion, exoenzymes and antimicrobial resistance that may potentially be involved in this pathogenicity, specially to gastroenteritis or extraintestinal complications (septicemia) in immunocompromised individuals (HIV-seropositive, cancer or diseases hepatobiliary) / Mestrado / Clinica Medica / Mestra em Clínica Médica
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Aplicação da lipase de geotrichum candidum para biocatálise de óleos vegetais com vistas à produção de biodiesel = Application of lipase from geotrichum candidum to biocatalysis of vegetable oils to biodiesel production / Application of lipase from geotrichum candidum to biocatalysis of vegetable oils to biodiesel production

Maldonado, Rafael Resende, 1981- 20 August 2018 (has links)
Orientadores: Maria Isabel Rodrigues, Gabriela Alves Macedo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-20T23:36:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maldonado_RafaelResende_D.pdf: 966845 bytes, checksum: ddc61b8ed34d47c4c2ebff5a3967c4a7 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: A crescente necessidade por energia e o avanço das preocupações com problemas ambientais devido ao uso de combustíveis fósseis tem levado a busca de alternativas para a área energética. Dentro deste contexto, a produção de biocombustíveis como etanol e biodiesel mostram um grande potencial de avanço e despertam amplo interesse na área de pesquisas.O biodiesel é comumente obtido por reações de transesterificação com catálise alcalina, no entanto a via enzimática constitui-se em uma forma promissora para a produção deste tipo de combustível. Este trabalho analisou as etapas de produção, purificação e imobilização da lipase de Geotrichum candidum NRRLY-552 e aplicação dessa enzima na biocatálise das reações de hidrólise, esterificação e transesterificação de óleos vegetais em diferentes sistemas reacionais. Os resultados obtidos demonstraram que a lipase de Geotrichum candidum NRRLY-552 pode ser obtida a baixo custo, com a utilização de um resíduo agro-industrial (água de maceração de milho) com atividade lipolítica de cerca de 20 U/mL. A purificação parcial desta enzima foi realizada por dois métodos ¿ precipitação com sulfato de amônio e precipitação com etanol, seguido de liofilização em ambos os casos. Tais métodos proporcionaram a obtenção de um preparado enzimático com atividade lipolítica de cerca de 500 U/g em duas ou três etapas. O pequeno número de etapas e a elevada atividade enzimática propiciam a aplicação desta enzima para biocatálise de reações com óleos vegetais para uso na produção de biocombustíveis. A enzima selecionada apresentou um bom desempenho para a reação de hidrólise de óleos vegetais, atingindo taxas de hidrólise de cerca de 80% após 24 horas de reação, em frascos agitados a 210 rpm, 45oC e 15% m/m de água no meio reacional com uma concentração de enzima de 5% m/m da lipase. A enzima não apresentou ação de esterificação suficiente para produção de biodiesel na presença de etanol, no entanto o sistema reacional desenvolvido permite que a associação com outras lipases de boa ação de esterificação possibilite a obtenção do biodiesel a partir do hidrolisado obtido neste trabalho / Abstract: The growing energy necessity and the advancement of environmental concerns due to the use of fossil fuels have led the search for alternatives to the energy area. In this context, the production of biofuels like ethanol and biodiesel shows a great potential for advancement and arouse widespread interest in the area of research. Biodiesel is commonly obtained by transesterification with alkaline catalysis; however, the enzymatic pathway is a promising way to produce this type of fuel. This work studied the stages of production, purification and immobilization of lipase from Geotrichum candidum NRRLY-552 and application of this enzyme in the biocatalysis of the hydrolysis, esterification and transesterification of vegetable oils in different reaction systems. The results showed that the lipase from Geotrichum candidum NRRLY-552 can be obtained at a low cost, using a residue of the agro-industrial (corn steep liquor), with lipolytic activity of about 20 U/mL. Partial purification of this enzyme was performed by two methods - precipitation with ammonium sulphate and precipitation with ethanol, followed by lyophilization in both cases. Such methods provided to obtain an enzyme preparation with lipolytic activity of 500 U/g in two or three steps. The small number of steps and the high enzyme activity provide the application of this enzyme to catalysis of reactions with vegetable oils for the use in biofuel production. The selected enzyme showed a good performance for the hydrolysis of vegetable oils, reaching rates of hydrolysis of about 80% after 24 hours of reaction, in shaken flasks at 210 rpm, 45°C and 15% w/w of water in the reaction with enzyme concentration of 5% w/w of the lipase. The enzyme did not show enough action esterification for biodiesel production in presence of ethanol; however, the reaction system developed permits the association with other lipases with good deed esterification with allows obtainable biodiesel from the hydrolysed produced in this work / Doutorado / Engenharia de Alimentos / Doutor em Engenharia de Alimentos
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Propostas e analise do desempenho de diferentes configurações de sistemas de purificação continua de proteinas

Ribas, Alessandro Marra 17 August 2001 (has links)
Orientador: Rubens Maciel Filho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-02T20:46:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ribas_AlessandroMarra_D.pdf: 5049782 bytes, checksum: 4be66e5d3e2547e77bf9a5c8bfe56056 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Enzimas e proteínas vêm sendo utilizadas em inúmeros produtos nas mais diversas áreas, tais como em indústrias farmacêuticas, alimentícias, e de detergentes. No processo de produção de enzimas e proteínas estas são obtidas em meio a impurezas que precisam ser separadas para que as enzimas tenham as especificações necessárias para cada tipo de aplicação. Os processos de purificação e extração de proteínas e enzimas além de estar diretamente ligado a qualidade final do produto correspondem a uma importante parcela nos gastos de produção. Este trabalho teve como objetivo estudar computacionalmente o desempenho de diferentes configurações de sistemas de purificação de proteínas contínuos. Foram propostas e estudadas diferentes configurações derivadas do sistema CARE (Continuous Adsorption Recyc1e Extraction) de purificação de proteína que tiveram seu desempenho comparado com o desempenho do leito móvel simulado (LMS). Estudou-se também o desempenho do sistema de purificação proposto neste trabalho, o tanque de mistura móvel simulado (TMMS), que consiste da substituição das colunas do leito móvel simulado por tanques de mistura com membrana. Os modelos matemáticos de cada sistema de purificação foram obtidos a partir de um balanço de massa de enzimas e impurezas e os parâmetros cinéticos de adsorção utilizados são das enzimas lisozima e lipase. Para os diferentes sistemas de purificação obteve-se equações diferenciais ordinárias e equações diferenciais parciais que foram discretizadas em dez partes e resolvidos pelo método de Runge-Kutta de quarta ordem. Entre os sistemas de purificação estudados o que apresentou melhor desempenho foi o leito móvel simulado, seguido pelo tanque de mistura móvel simulado e finalmente os sistemas derivados do sistema CARE. O leito móvel simulado apresentou um tempo de troca ótimo no qual obteve-se alto rendimento e alto fator de purificação que são requisitos essenciais a um processo de purificação. O tanque de mistura móvel simulado foi o segundo melhor sistema de purificação pois apesar de apresentar um baixo rendimento teve um bom fator de purificação. Os sistemas derivados do sistema CARE apresentaram os menores fatores de purificação e consequentemente a menor capacidade de purificação / Abstract: Enzymes and proteins have been used in countless products in a great variety of several areas, such as in phannaceutical, nutrition, and detergent industries. In the enzymes and proteins production process these are obtained with impurities that need to be separated so that the enzymes have the necessary specifications for each application type. The protein and enzyme purification and extraction processes, besides being directly tied up to the final quality of the product, correspond to an important portion in the production expenses. The objective ofthis work was to study by computer simulations the performance of different configurations of continuous systems of protein purification. Different configurations were proposed and studied. They were derived from the CARE system (Continuous Adsorption Recycle Extraction) of protein purification that had its performance compared with the performance of the simulated moving bed (SMB). The performance of the purification system proposed in this work was also studied: the simulated moving stirred tank (SMST), which consists of the substitution of the columns of the simulated moving bed by stirred tanks with membrane. The mathematical models of each purification system were obtained from a mass balance of enzymes and impurities and the kinetic parameters of adsorption used are from the lisozima and lipase enzymes. In the different purification systems ordinary differential equations and partial differential equations were obtained. They were subsequently discretizated in ten parts and solved by the Runge-Kutta of fourth order method. Among the purification systems studied, that presented better performance was the simulated moving bed, followed by the simulated moving stirred tank and finally the derived systems of the CARE system. The simulated moving bed presented an optimum time of change (time of valve rotation) in which high yield and high purification factor, which are excellent characteristic in a purification process, were obtained. The simulated moving stirred tank was the second best purification system because, in spite of presenting a low yield it showed a good purification factor. The derived systems of the CARE system presented the smallest purification factors and consequently the smallest purification capacity / Doutorado / Desenvolvimento de Processos Biotecnologicos / Doutor em Engenharia Química
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Compréhension et maîtrise de l'interestérification enzymatique d'huiles végétales sur les plans nutritionnel et technologique / Enzymatic interesterification of plant oils for improvement of their nutritional and functional properties.

Perignon, Marlène 14 December 2011 (has links)
La nutrition constitue l'un des facteurs déterminants du développement ou de la prévention de diverses pathologies. Parmi les trois classes de nutriments majeurs, les lipides alimentaires occupent une place essentielle dans cette relation nutrition-santé puisque leur déséquilibre qualitatif est impliqué dans l'incidence des maladies cardiovasculaires. L'importance de l'équilibre alimentaire justifie le développement de produits fonctionnels au profil nutritionnel amélioré. En parallèle, suite à la prise de conscience de l'impact environnemental de la production alimentaire, il est aujourd'hui important d'inscrire le choix des matières premières et des procédés dans une démarche de développement durable.Dans ce contexte, les travaux menés durant cette thèse concernent tout d'abord l'amélioration des propriétés nutritionnelles d'une matière grasse végétale tartinable par réduction de sa teneur en acides gras (AG) saturés délétères, mais également la limitation de son impact environnemental par réduction des ingrédients issus de la filière palme. La mise au point d'un procédé d'interestérification enzymatique vise à ajuster les propriétés rhéologiques du produit sans modifier le profil global en AG, et sans utiliser de solvants ou produits chimiques grâce à l'action d'un biocatalyseur (lipase). Ces travaux ont conduit au développement jusqu'au stade pilote d'un substitut interestérifié par voie enzymatique permettant de réduire la teneur en AG saturés délétères de 65% et l'utilisation de dérivés d'huile de palme de 70% tout en maintenant une fonctionnalité similaire au produit actuel. En parallèle, un procédé enzymatique à également été exploité dans l'étude d'une nouvelle méthode d'analyse de la régiodistribution : l'évaluation des sélectivités de la lipase de Rhizopus oryzae a montré son potentiel pour l'analyse de la position sn-2 des triacylglycérols contenant des AG à chaines moyennes. / Nutrition is one of the main factors contributing to various diseases occurrence or prevention. Among the three major types of nutrients, dietary lipids are essential in this nutrition-health relationship since lipid disorder is associated with an increased risk of cardiovascular diseases. Thus, the importance of a healthy diet explains the development of functional foods with improved nutritional properties. Furthermore, with environmental impact of food production being a growing concern for consumers, selection of raw materials and processes should meet the requirements for sustainable development. In this context, this work concerns the improvement of the nutritional properties of a vegetable oil spread by reducing its unhealthy fatty acids (FA) content, but also the limitation of its environmental impact by minimizing the use of palm oil products. An enzymatic interesterification process has been developed to adapt rheological properties without modifying FA profile nor using solvents and chemical products by action of a biocatalyst (lipase). This work led to the pilot-scale development of an enzymatically interesterified substitute allowing to reduce the unhealthy FA content by 65%, and the use of palm oil products by 70% while keeping a functionality similar to the current product.At the same time, an enzymatic approach has also been used in the investigation of a new method for regiodistribution analysis. Thus, Rhizopus oryzae lipase appeared to be a good candidate for the sn-2 position analysis of triacylglycerols containing medium chain fatty acids.
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Conception et étude d'un réacteur enzymatique à membrane fonctionnant en milieu supercritique : application à la synthèse enzymatique d’esters / Conception and study of an enzymatic membrane reactor working in supercritical media

Ben Ameur Villain, Sawsen 24 January 2012 (has links)
Ce travail de thèse vise à développer un procédé de synthèse d'esters dans un réacteur enzymatique membranaire fonctionnant en milieu CO2 supercritique. Un tel procédé représente une alternative intéressante à la synthèse chimique classiquement utilisée en industrie car il permet, d'une part, d'utiliser le CO2 supercritique comme solvant et de substituer ainsi les solvants organiques généralement utilisés et, d'autre part, d'avoir un produit final doté d'un label naturel grâce à l'utilisation d'un catalyseur biologique. Dans cette étude, une membrane enzymatique de taille industrielle a été développée. Un pilote spécifique permettant la conduite de réactions enzymatiques en milieu supercritique a été conçu. Le procédé a été testé à l'aide d'une réaction modèle : la synthèse d'acétate d'anisyle à partir d'alcool et d'acétate de vinyle. L'influence de divers paramètres opératoires tels que la température, la pression, ou le débit sur les performances du procédé a été évaluée. Les performances du procédé ont été également comparées à celles d'un réacteur à lit fixe. / This study deals with the development of an enzymatic membrane reactor working in supercritical carbon dioxide for ester synthesis. This process is an alternative to the chemical synthesis classically used in industry because it allows, on the one hand, the use of supercritical carbon dioxide as a solvent instead of organic solvents and on the other hand it leads to natural label ester thanks to the use of a biological catalyst. In this work, an industrial size enzymatic membrane was developed. A special pilot plant was designed to achieve enzymatic reactions in supercritical carbon dioxide medium. The process was studied with a model reaction : the anisyl acetate synthesis from anisic alcohol and vinyl acetate. The impact of several operating conditions like temperature, pressure and flow rate on the process performances was studied. The enzymatic membrane developed in this study was active and showed an interesting conversion rate. The performances were compared to those obtained with a packed bed reactor.
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Expressão e caracterização estrutural e funcional de sequências genômicas codificadoras de enzimas lipolíticas. / Expression and functional and structural characterization of genomic sequences encoding lipolytic enzymes.

Thais Carvalho Maester 27 August 2015 (has links)
Duas enzimas do clone PL14.H10 de biblioteca metagenômica de consórcio microbiano degradador de óleo diesel, EST3, da família IV, e EST5, da família V das enzimas lipolíticas, foram caracterizadas. Os modelos estruturais mostraram cap-domínio e grande cavidade interna. A EST3 hidrolisou pNP-ésteres de até 12 carbonos, com Kcat/Km para pNP-acetato foi 1533,27 s-1.mM-1. Já a EST5 hidrolisou pNP-ésteres de 2 a 14 átomos de carbono, com maior atividade em pNP-valerato, e Kcat/Km de 1732,3 s-1.mM-1. Ambas apresentaram o fenômeno da ativação térmica. A atividade máxima da EST5 se deu a 45°C e em pH 7,5. A EST3 exibiu atividade máxima em pH 6,0, a 41°C. A atividade das enzimas aumentou na presença de quase todos os íons testados, e a EST5 quase não foi influenciada por detergentes. Foram relativamente estáveis em solventes orgânicos. Um dos cristais da proteína EST5 difratou a 2,311 Å e espera-se resolver a estrutura desta proteína. Os resultados deste trabalho revelaram interessantes características da EST3 e EST5 para possíveis aplicações biotecnológicas. / Two enzymes of PL14.H10 clone from a metagenomic fosmid library from a microbial consortium specialized for diesel oil degradation, EST3, from family IV, and EST5, from the V of lipolytic enzymes were characterized. Structural models showed cap-domain and large internal cavity. EST3 hydrolyzed pNP-esters of up to 12 carbons, with Kcat/Km in pNP-acetate of 1533.27 s-1.mM-1. EST5 hydrolyzed pNP-esters from 2 to 14 carbon atoms, with greater activity on pNP-valerate, and Kcat/Km of 1732.3 s-1.mM-1. Both showed the thermal activation phenomenon. EST5 activity was optimal at 45°C and pH 7.5. EST3 exhibited maximum activity at pH 6.0, 41°C. The esterases activity increased in the presence of almost all ions tested, and EST5 was not influenced by detergents. They were relatively stable in organic solvents. One of the crystals of EST5 protein diffracted at 2.311 Å and is expected to solve the structure of this protein. The results of this study revealed interesting features of the EST3 and EST5 proteins for possible biotechnological applications.
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Prospecção de sequências genômicas codificadoras de enzimas lipolíticas degradadoras de hidrocarbonetos de petróleo. / Screening for genomic sequences which codify lipolytic enzymes specialized in petroleum hydrocarbons degradation.

Thais Carvalho Maester 30 May 2011 (has links)
Enzimas lipolíticas possuem enorme potencial biotecnológico. O objetivo foi prospectar genes para a codificação de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica com 4224 clones. A atividade lipolítica foi avaliada pela formação de halo ao redor das colônias através do cultivo dos clones em meio de cultura suplementado com tributirina, sendo positiva para 30 clones, e dois foram selecionados e tiveram o DNA sub-clonado. Os DNAs das sub-bibliotecas foram sequenciados, gerando um contig completo para o clone PL28.F10, que foi comparado com as sequências do banco NCBI. Uma ORF codificadora de esterase/lipase de 303 aminoácidos e 61% de identidade com micro-organismo não cultivável foi encontrada. Árvores filogenéticas indicam que o clone possui a ORF15 mais próxima da família IV das esterases/lipases. Foi possível identificar os sítios ativos representativos da família, confirmando o resultado das árvores filogenéticas. Com sequências já patenteadas, a ORF15 é um grupo irmão das sequências de esterases/lipases da BASF e de uma proteína não identificada da CAMBIA. / Lipolytic enzymes have show enormous biotechnological potential. The work was done to find genes which codify lipolytic enzymes in a metagenomic library with 4224 clones. Clones were selected according to lipolytic activity and were assessed by cultivation in medium supplemented with tributyrin. Assessment was done by observation of halos formed around the colonies, with 30 clones producing halos. Of these, two were selected. DNA from the sub libraries was sequenced, generating a complete contig for clone PL28.F10 that was compared to sequences from the NCBI. An ORF of 303 amino acids with 61% of identity with uncunturable microorganism were found. The clone presented the ORF15 similar to that of lipolytic enzyme family IV. The alignments made possible the identification of active sites which represent the family, confirming the results obtained with the construction of the cladograms. The ORF15 showed similarities to patented BASF esterase/lipase and an unnamed protein of CAMBIA.
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Prospecção de genes codificadores de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica de consórcio microbiano degradador de óleo diesel. / Screening for lipolytic enzyme codification genes in a metagenomic library of consortia specialized in diesel oil degradation.

Mariana Rangel Pereira 03 March 2011 (has links)
As enzimas lipolíticas vêm atraindo atenção no mercado global devido ao enorme potencial biotecnológico, como: na formulação de detergentes; na indústria de couro; produção de cosméticos, fármacos, aromas, biodiesel, etc. O objetivo deste trabalho foi prospectar genes codificadores de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica de um consórcio microbiano degradador de óleo diesel. A seleção foi feita pela atividade lipolítica através do cultivo dos clones em placa de petri e a avaliação foi pela observação de halo ao redor da colônia, sendo positiva para 30 clones dentre os quais dois se destacaram. Estes dois clones foram selecionados e subclonados. Os DNAs das sub-bibliotecas foram sequenciados, gerando um contig completo para cada clone. Através do ORF Finder foi identificado cinco ORFs de esterase/lipase, dentre as quais uma alcançou 58% de identidade com uma bactéria não cultivável. As árvores filogenéticas indicam que duas ORFs são similares à família IV das enzimas lipolíticas, enquanto que as outras três ORFs à família V. / Lipolytic enzymes have been attracting global market attention because they show enormous biotechnological potential. The present work was done as an attempt to find genes which codify lipolytic enzymes in a metagenomic library composed of diesel oil degradation microbe consortia. Clones were selected according to lipolytic activity and were then evaluated after cultivation in Petri dishes by observation of halo formation around the colonies. 30 clones produced halo formations and were identified as positives, two of which showed prominent results. These two were then selected and sub cloned. DNA from the sub libraries was sequenced, generating a complete contig for each clone. Using the ORF Finder five esterase/lipase ORFs were identified, with one of these attaining 58% of identity to a non cultivatable bacteria species. Assessment of the cladograms showed that two ORFs were similar to lipolytic enzyme family IV, while the other three ORFs were similar to family V.
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Padrões de especificidade e expressão das lipases digestivas durante o desenvolvimento e o processo infeccioso no mosquito Aedes aegypti. / Patterns of specificity and digestive lipases expression during the infectious process and development on the mosquito Aedes aegypti.

Carlos Felipe Tasso Filietáz 28 November 2016 (has links)
O mosquito Aedes aegypti é vetor de doenças como a febre amarela, dengue, chinkungunya e zika. O sistema digestório é responsável pela digestão e absorção de nutrientes, é também uma interface com o ambiente externo sendo a porta de entrada de organismos infecciosos. A presença de duas lipases digestivas foi confirmada por qPCR, uma na fase larval (L-Aa7051) e outra na fase adulta (L-Aa7055). Estas enzimas foram agrupadas na família das lipases neutras e apresentam alterações em resíduos envolvidos na especificidade, domínio tampa e alça β9. A L-Aa7055 recombinante foi expressa heterologamente em Escherichia coli na porção insolúvel, com atividade após a renaturação. Observamos que a expressão da lipase L-Aa7055 sofre uma redução de 30% na infecção Plasmodium gallinaceum, não sendo afetada pelo vírus dengue sorotipo 2 (DENV2). A digestão de lipídeos é importante na fase larval, com altos níveis de transcrito. Um estudo mais aprofundado ainda será necessário para compreender completamente o papel das lipases no processo infeccioso. / The Aedes aegypti borne diseases yellow fever, dengue fever, chinkungunya and zica are important public healthy problems. The digestion and absorption of nutrients are performed in the digestive system, which is also an external environment interface that allows the infection by pathogenic microorganisms. The presence of two digestive lipases were identified by qPCR, L-Aa7051 in the larval phase and L-Aa7055 in the adult female. The lipase sequences were grouped in the neutral family, and exhibit alterations in residues involved in specificity, lid domain and β9 loop. The recombinant L-Aa7055 was expressed in the insoluble fraction, and show activity after a renaturation process. We notice that the expression levels of L-Aa7055 are reduced by 30% in the Plasmodium gallinaceum infection and were not affected by serotype 2 dengue virus (DENV2). The lipid digestion is important in the larval phase, with higher transcript levels. New studies will be necessary to the complete understanding of lipase contribution in the infectious process.
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Avaliação da atividade lipolítica de fungos filamentosos da costa brasileira. / Evaluation of the lipolytic activity of filamentous fungi from the brazilian coast.

Alexandre Kopte Garcia 25 February 2011 (has links)
A produção de compostos biologicamente ativos por micro-organismos marinhos tem atraído crescente interesse de biotecnólogos e microbiologistas nas últimas décadas. No presente trabalho 162 isolados de fungos filamentosos recuperados de amostras de água do mar e de dez diferentes macro-organismos marinhos foram avaliados quanto a produção de lipases pelo método de High Throughput Screening (HTS). Destes, 45 isolados tiveram a produção de lipases confirmada individualmente. A atividade lipolítica foi quantificada, e os resultados sugerem que fungos filamentosos oriundos de ambientes marinhos tem maior potencial para produção de lipases estáveis em pH alcalino. Entre estes, Fusarium sp. CBMAI 1227, Aspergillus parasiticus CBMAI 1228 e Trichoderma sp. CBMAI 1229 apresentaram atividade expressiva e de interesse biotecnológico em pH 8,0 (23,1, 12,7 e 12,2 U respectivamente). Os resultados deste trabalho demonstram o potencial dos fungos provenientes de ambiente marinho para aplicações biotecnológicas, e estimulam novos estudos envolvendo lipases. / The production of biologically active compounds by marine microorganisms has been drawing increasing interest of biotechnologists and microbiologists in the last decades. In the present work 162 filamentous fungi isolates recovered from water samples and ten different marine macroorganisms were evaluated for the production of lipases by the method of High Throughput Screening (HTS). Out of those, 45 had the lipase production individually confirmed. The lipolytic activity was quantified, and the results suggest that marine-derived filamentous fungi have a greater potential for the production of lipases stable under alkaline pH. Among these, Fusarium sp. CBMAI 1227, Aspergillus parasiticus CBMAI 1228 and Trichoderma sp. CBMAI 1229 showed expressive and biologically interesting activity in pH 8,0 (23,1, 12,7 and 12,2 U/min respectively). The results of the present work show the potential of marine-derived fungi in biotechnological applications, and stimulate new studies involving lipases.

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