Diseñador Industrial / El proyecto en sí consta de un sistema que permite al científico documentar proteínas en tres canales de emisión a partir sólo de una membrana. El proyecto, desde la visión macro, es resuelto por un equipo multidisciplinar formado por estudiantes de Bioquímica, Biotecnología y Diseño Industrial, dirigidos por un profesional de la ciencia para su tesis doctoral; teniendo cada uno de los integrantes una misión específica, lo que se describe como visión micro del proyecto (proyectos individuales), con el fin de hacer de las investigaciones y desarrollo realizados, un producto que se acomode a las necesidades de los científicos que trabajan día a día con proteínas, poniendo a su disposición un sistema que permite optimizar su trabajo en términos de tiempo, insumos a utilizar y calidad de resultados.

Memoria para optar el título de Bioquímico / Autor no autoriza el acceso a texto completo de su documento hasta diciembre de 2015 / La proteína co-chaperona Bag3 es un factor clave en el control de la autofagia selectiva, un proceso de degradación de proteínas y organelos activado en respuesta a distintos estresores, en tejidos altamente diferenciados, como el músculo esquelético. Este último tejido transforma la energía química del ATP en energía mecánica para la contracción, por lo que el control del metabolismo de la glucosa resulta fundamental para mantener su función fisiológica. En este sentido, insulina, a través de sus efectores intracelulares Akt y mTORC1, promueve el ingreso y metabolismo de la glucosa. No obstante, en condiciones de estrés nutricional la proteína AMPK activa la autofagia para aumentar el metabolismo celular por degradación de diversas macromoléculas. Prueba de esta relación funcional entre metabolismo y autofagia es que la inhibición de la autofagia lleva a resistencia a la insulina en células musculares esqueléticas. Por otro lado, existe evidencia que los ratones knock-out para Bag3 presentan una disminución en los niveles de glucosa e insulina circulantes, y mueren a las 3 semanas de nacimiento con deterioro muscular progresivo. Sin embargo, hasta hoy se desconoce si Bag3 regula el metabolismo energético de la célula, y si las vías que controlan ese metabolismo se relacionan con la autofagia. En vista de estos antecedentes, se investigó si Bag3 altera la señalización de la vía Akt-AMPK-mTORC1, produciendo efectos metabólicos y de autofagia en miotubos L6 (línea celular: músculo esquelético de rata). A través de ensayos de captura de 3H-2-desoxiglucosa, consumo de oxígeno y detección densitométrica de GLUT4-myc en superficie, se determinó que las células con niveles reducidos de Bag3 (RNA interferente) y sin insulina en el sistema, incorporaron mayor cantidad de glucosa por un incremento de transportadores Glut-4 en la membrana celular junto con una mayor capacidad oxidativa mitocondrial. Lo anterior es debido a un aumento de la activación basal de Akt, evidenciado por Western blot contra Fosfo-Ser-473. Además, estas células presentaron una menor capacidad de activar la autofagia debido a un procesamiento disminuido de LC3, además de una menor activación de AMPK (Fosfo-Thr-172) y una sobre-activación de mTORC1 (Fosfo-Ser-2448). Finalmente, en presencia de insulina (100 nM, 20 min), las células con niveles reducidos de Bag3 presentaron una incorporación deficiente de glucosa para la cantidad de transportador Glut-4 exportado a la membrana, y una menor capacidad oxidativa mitocondrial. En estas condiciones, Akt se activó de forma normal ante insulina, observándose sin embargo que AMPK y mTORC1 se activó e inactivó, respectivamente; comportamiento inverso respecto a lo normal. Con estos datos, se propone a Bag3 como un novedoso regulador del metabolismo y la autofagia muscular esquelética / The co-chaperone protein Bag3 is a key factor for the control of selective autophagy, a degradation process of proteins and organelles activated in response to stress, in highly differentiated tissues, as the skeletal muscle. The role of the latter is to transform the chemical energy from ATP into mechanical energy for contraction, thus the metabolism control of glucose is important to keep its biological function. In that way, the hormone insulin, by its intracellular effectors Akt and mTORC1, promotes the uptake and metabolism of glucose. However, in nutritional stress conditions the AMPK protein activate autophagy in order to increase cellular metabolism by macromolecular degradation. Proof of this functional relationship between metabolism and autophagy is that autophagy abrogation leads to insulin resistance in muscle cells. On the other hand, there is evidence that shows that Bag3 Knock-out mice present diminished glucose and insulin in blood, and die after 3 weeks from birth with progressive muscle wasting. However, it is not known yet whether Bag3 regulates energy metabolism in the cell, nor whether the pathways that control that metabolism are related with Bag3 mediated autophagy. With this in mind, we decided to determine if Bag3 was able to alter the Akt-AMPK-mTORC1 signaling pathway, leading to metabolic and autophagy effects, in L6 myotubes (cell line: skeletal muscle from rat). By 3H-2-desoxyglucose uptake, oxygen consumption and GLUT4-myc surface detection assays, we were able to determine that cells with reduced levels of Bag3 (interference RNA), and without insulin in the system, had increased glucose uptake because of an augmented Glut-4 translocation to the cell membrane, along with an enhanced mitochondrial oxidative capacity. This is explained by an increased Akt basal activation, evidenced by Phospho-Ser-473 western blot. Furthermore, these cells showed a diminished capacity to produce autophagy, because of a decreased LC3 processing, along with a diminished activation of AMPK (Phospho-Thr-172) and an over activation of mTORC1 (Phospho-Ser-2448). Finally, in the presence of insulin (100 nM, 20 minutes), cells with diminished levels of Bag3 showed a deficient glucose uptake for the amount of Glut-4 transporter exported to cell membrane, and a decreased mitochondrial oxidative capacity. Under these conditions, Akt protein increased its activation, as normal, but AMPK was activated and mTORC1 was inactivated, an inverted behavior with respect to normal metabolism. With these data, we propose Bag3 as a novel regulator of metabolism and autophagy in muscle

Orientador: Maria Cecilia F. de A. Veiga / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-07-20T08:19:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Benetton_SilvanaLandiBernardes_M.pdf: 3450441 bytes, checksum: 747721a844a9264d737ae07dc8efe257 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Este trabalho foi realizado com o objetivo de verificar a influencia do teor protéico da dieta na gênese do tecido de reparo em animais diabéticos. Foram selecionados 80 ratos da linhagem wistar, com 30 dias de idade, pesando em média 110& distribuídos em 4 grupos de 20 animais cada e subdivididos em grupo I(controle - nonnoprotéico), D(diabético - nonnoprotéico), m(diabético - hipoprotéico) e IV(diabético - hiperprotéico). Os animais foram mantidos com suas respectivas dietas até completarem 60 dias, após os quais, foi realizada a indução do diabetes que constituiu na administração de uma dose única de aloxana [ Alloxm (5,6 - Dioxyurac~1) Monohydrate), na concentração de 130mg1kg para os animais do grupo m ',e 150mg1kg para os animais dos grupos D e IV em um volume mmca superior a ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Thi$ work was perfonned with the pmpose of verifYing the inttuence of the proteic content of the diet in genesis of the healing tissue in diabetics animais. 80 rats of the Wistar lineage, of 30 days old, weigbing on the average 110g were selected and distributed in 4 groups of 20 animais each and subdivided in group I(control - nonnoproteic), n( diabetic - nonnoproteic), m(diabetic hipoproteic) e IV(diabetic - hiperproteic). The animais were kept with its respective diets until they had completed 60 days, after wich ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Fisiologia e Biofisica do Sistema Estomatognatico / Mestre em Ciências

Orientador : Humberto de Araujo Rangel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-16T07:12:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Salata_Ednir_M.pdf: 2557397 bytes, checksum: 35f37adc0d10c994869db3ef6c53d4b6 (MD5) Previous issue date: 1977 / Resumo: Não informado / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed. / Abstract: Not informed. / Mestrado / Imunologia / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador : Ladaslav Sodek / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-16T14:07:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leite_IzabelCristina_D.pdf: 4698775 bytes, checksum: 3b30589c68197e3d1513dc94499c51ce (MD5) Previous issue date: 1988 / Resumo: O milho é considerado uma fonte pobre em proteínas para os mamíferos em crescimento, por causa do teor relativamente baixo de alguns aminoácidos essenciais no seu endosperma, como é o caso da lisina. Assim, a descoberta de que o gene mutante opaco-2 melhora a qualidade nutricional do milho, tem estimulado investigação sobre o mecanismo que direciona esta alteração, bem como a seleção de mutantes com qualidade nutricional superior. Assim, foi feita uma caracterização da lisina cetoglutrato redutase (LKR), enzima que converte lisina a sacaropina, o que parece ser o primeiro passo no catabolismo de lisina, em endosperma de milho. Verificou-se também a correlação entre o nível de atividade da enzima e a síntese de proteínas específicas do endosperma. Utilizaram-se duas linhagens de milho nas versões normal e opaco-2, das quais se utilizaram plântulas e também endospermas imaturos, ao longo do desenvolvimento (10 aos 52DAP). Os extratos e a fração proteica contendo a enzima foram obtidos de acordo com a metodologia proposta por ARRUDA et alii (Plant Physiol., 69: 988-989. 1982)... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Maise is considered a poor source of proteins for mammals during growth, in view of its relatively low levels of some essential amino acids in the endosperm, such as lysine. Thus, the discovery that the opaque-2 mutant gene nutritional value of maize has stimulated research improves the into the mechanism underlying this alteration, together with the selection of mutants with improved nutritional qualities. In this study, the enzyme lysine a-ketoglutarate redutase (LKR), which transform lysine in saccharopine, was characterized. Apparently, this is the first step of ly sine catabolism in the maize endosperm. Two lines of maize, with their normal and opaque-2 versions, were used in this study. Both seedlings and immature endosperms were studied, the latter in particular during development (lO-52DAP). The extracts for enzyme assay. Were obtained according to Arruda et aZii (PZant PhysioZ., 69: 989. 1982)... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Ciencias Biologicas

Orientador : Oswaldo E. S. Godinho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-16T16:17:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RaimundoJunior_IvoMilton_M.pdf: 3578327 bytes, checksum: 005ed43688101e128c8f4be9bc35d173 (MD5) Previous issue date: 1989 / Mestrado

Orientador : Nelson Jose Beraquet / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-19T06:53:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Galvao_MariaTeresaEstevesLopes_M.pdf: 3452733 bytes, checksum: 1871523b9a932939d0010b7e9c256d43 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: Nesse estudo, resíduos provenientes da separação de dorsos de frango sem pele, com teor de proteína na faixa de 15,9-19,7% e teor de gordura na faixa de 8,9-11,7%, foram submetidos,numa primeira fase, a três tratamentos de extração a nível de laboratório: a) extração alcalina a pH 10,5 seguida de precipitação ácida; b) extração salina utilizando-se solução NaCl a 6% e c) hidrólise enzimática utilizando enzima alcalase com relação enzima:substrato de 2g:100g proteína. Cinco ensaios foram conduzidos para cada tratamento. O extrato protéico proveniente da extração alcalina apresentou teores de umidade e gordura na faixa de 88,1-92,9% e 1,0-2,2%, respectivamente. O teor de proteína foi o componente que mais apresentou variações entre os ensaios, situando-se na faixa de 5,1 a 11,1%. Como no extrato alcalino, o teor de umidade do extrato salino situou-se na faixa de 88,1-91,9%. Os teores de gordura e proteína situaram-se na faixa de 1,9-4,8% e 4,1-6,3% respectivamente. A extração enzímica produziu um extrato com teores de umidade e proteína na faixa de 92,3-93,8% e 4,8-6,4%, respectivamente. O teor de gordura foi de cerca de 0,8%. Os resultados obtidos não mostraram diferenças significativas entre as técnicas de extração com relação ao teor de proteína. Numa segunda fase, com extrações realizadas a nível de planta piloto utilizou-se inicialmente dois métodos de extração: salino e enzímico. No método salino, realizado em duas épocas diferentes, o extrato protéico apresentou teor de proteína na faixa de 1,30-2,84% e baixo rendimento global, na faixa de 43,5- 50,4%, devido a problemas de obstrução da centrífuga. A extração enzímica em planta piloto, conduzida em três épocas diferentes, forneceu um extrato protéico com teor de proteína total na faixa de 5,64-8,84%e teor de nitrogênio solúvel de 0,85-1,29%. Os teores de umidade e gordura situaram-se na faixa de 89,57-93,03% e 0,61-0,74% respectivamente. O extrato enzímico obtido em planta piloto nas três épocas foi utilizado para a elaboração de produto emulsionado tipo salsicha. Utilizou-se formulação básica contendo carne bovina e suína na proporção de 3,3 carne bovina:1,0 carne suína e toucinho. A formulação foi balanceada de modo a conter cerca de 22% de gordura e 13% de proteína. O extrato protéico foi utilizado em substituição à água adicionada. Produtos elaborados com extrato protéico apresentaram perda de peso na cocção na faixa de 8,97-11,54%, estatisticamente inferior ao controle, nos ensaios 1 e 3, que apresentou perda de peso na faixa de 9,06-12,52%. Com relação à análise objetiva da cor, observaram-se diferenças significativas entre as amostras (P<0,05) nos parâmetros L*, a* e b*. No entanto, essas diferenças variaram ao longo dos três ensaios tanto para a porção externa como para a porção interna. De uma forma geral, os valores de L*, a* e b*, para a porção externa, situaram-se na faixa de 53,80 - 57,30, 15,46 - 16,54 e 12,40 - 13,95 respectivamente. Para a porção interna, os valores de L*, a* e b* foram de 61,24 - 64,43, 11,43 - 12,28 e 9,77 - 10,75 respectivamente. Os resultados da avaliação objetiva da firmeza (força de cisalhamento) indicou um pequeno aumento na maciez com a utilização do extrato protéico. No entanto, essa diferença só foi considerada estatisticamente significativa no ensaio 3. Salsichas elaboradas com extrato apresentaram força de cisalhamento de 2,44 Kgf/cm, estatisticamente inferior ao valor 2,59Kgf/cm obtido no produto sem extrato protéico. Em nenhum dos ensaios realizados foram detectadas diferenças significativas no parâmetro maciez entre as amostras na análise sensorial. Os produtos controle e com extrato protéico receberam pontuação na faixa de 5,46-6,18, próximas ao valor 5, considerado ideal. Resultados similares foram obtidos com relação ao parâmetro suculência. Os produtos receberam pontuação na faixa de 4,13-5,05, próxima ao valor 5, considerado ideal. Com relação ao sabor, não foram detectadas diferenças entre os tratamentos nos três ensaios realizados. Em todos os ensaios o sabor dos produtos foi considerado "moderadamente característico". Não foram detectadas diferenças entre os produtos com relação a qualidade global. Os produtos controle foram considerados "moderadamente aceitáveis" e os produtos contendo extrato protéico, "ligeiramente aceitáveis". Os resultados obtidos no presente estudo não mostraram, na etapa de laboratório, diferenças significativas entre os métodos de extração. Os teores de proteína obtidos apresentaram ampla faixa de variação. Na etapa de planta piloto houve redução do teor de proteína no extrato salino quando comparado com os teores obtidos na etapa de laboratório, havendo portanto necessidade de estudos subseqüentes para otimização do processo. Com relação ao extrato enzímico os teores de proteína foram similares nas duas etapas. O uso do extrato enzímico em formulações de produtos emulsionados tipo salsicha não afetou significativamente as características sensoriais quando comparado com produto controle / Abstract: In this study, bone residues from the mechanical separation of chicken backs without skin, with protein and fat contents in the range of 15, 9-19,7% and 8,9-11,7% were submitted to three methods of extraction in a laboratory scale and two methods in the pilot plant. The methods used in the laboratory scale were: a) alkaline extraction at pH 10,5 followed by acid precipitation) salt extraction using 6% NaCl solution and c) enzymatic extraction using the enzyme alcalase and enzyme: substrate ratio of 2g:100g protein. Five trials were conducted for each treatment. The alkali extract had moisture and fat contents in the range of 88, 1-92,9% and 1,0-2,2% respectively. Protein content was the component that showed larger variations in the range of 5,1- 11,1%. As in the alkaline extract, moisture content from the saline extract was in the range of 88,1-91,9%. Fat and protein contents were in the range of 1,9-4,8% and 4,1-6,3% respectively. The enzymatic extraction produced an extract with moisture and protein contents of around 92,3-93,8% and 4,8-6,4% respectively. The fat content was around 0,8%. The results did not showed differences between the extraction techniques in relation to the protein content. In the pilot plant studies the saline method and the enzymatic method were used. In the saline method, two types of centrifuge were evaluated. Two trials were conducted using the saline method of extraction. The protein extract obtained had a total protein content of around 1,30-2,84% and low yield, in the range of 43,5- 50,4% because problems of obstruction with the centrifuge. The enzymatic extraction in the pilot plant, conducted in three trials, produced a protein slurry with a total protein content in the range of 5,64-8,84% and 0,85-1,29% of soluble nitrogen. The moisture and fat content were in the range of 89,57-93,03% and 0,61-0,74% respectively. The enzymatic extract obtained in the pilot plant in the three different trials was used to produce a frankfurter type sausage. A basic formulation containing beef meat and pork meat at a ratio of 3,3 beef meat: 1,0 pork meat and backfat was used. The formula was balanced to produce a final product with around 22% fat and 13% protein. The protein extract replaced water. Three trials were conducted for each treatment. Products containing protein extract had lower weight loss during cooking, around 8,97-11,54%, than the control which presented weight loss in the range of 9,06-12,52%. The objective color measurement (L*, a* and b* parameters) showed significant differences (P<0,05) between the products. The parameters L*, a* and b* for the external portion were in the range of 53,80-57,30, 15,46-16,54 and 12,40-13,95 respectively. For the internal portion the L*, a* and b* values were in the range of 61,24-64,43, 11,43-12,28 and 9,77-10,75 respectively. The use of protein extract decreased slightly the shear force, but differences were not considered statistically significant, except in trial 3. Sausages containing protein extract had a shear value of 2,44Kgf/cm, statistically lower than the value 2,59Kgf/cm obtained in the sausage without protein extract. Sensory analysis showed that odor, firmness, juiciness, flavor and overall quality were not affected by the protein extract. Sausages containing protein extract and the control group received a score for firmness in the range of 5,46-6,18, close to the value 5, considered "ideal". Similar results were obtained for juiciness. The products received a score in the range of 4,13-5,05, close to the value 5, considered "ideal". In relation to flavor both products were considered "moderately characteristic". It was not detected differences among the products in relation to overall quality. The control sausages were considered "moderately acceptable" and the sausages containing protein extract were considered "slightly acceptable". The results obtained in this study did not show, in the laboratory scale, differences between the methods of extraction. The protein contents showed great variability. In the pilot plant scale the saline extract showed a reduction in the protein content when compared with the contents obtained in the laboratory scale. In this area it is necessary more studies to optimize the process. In relation to the enzymatic extract the protein contents were similar in the laboratory scale and pilot plant scale. The use of enzymatic extract in formulations of frankfurter type sausage did not affect the sensory characteristics of the product / Mestrado / Mestre em Tecnologia de Alimentos

Orientador: Valdemiro Carlos Sgarbieri / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-20T07:30:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antunes_PedroLuiz_M.pdf: 4311721 bytes, checksum: 08abd03fdeb3c69821ea72cc2db58dcb (MD5) Previous issue date: 1974 / Resumo: Algumas características físicas e químicas das proteínas da soja e o valor biológico (PER) foram estudados em produtos preparados no laboratório e de procedência industrial. O tratamento térmico, na soja, é inerte á necessidade de inativação dos agentes antinutricionais. Contudo, quando em excesso, diminui a disponibilidade dos elementos nutricionais. Face a isso, estudou-se a inativação dos fatores antinutricionais mais importantes - antitripsina e hemaglutinina em função do tempo de tratamento térmico em água fervente e das condições iniciais do preparo da. amostra de soja (sem em 25,0, 15,0 e 10,0 minutos, respectivamente, são necessários para total inativação da antitripsina nas amostras em grão e 30 minutos em autoclave a 12l°C, no caso do extrato. Para a hemaglutinina, tal inativação necessitou de 45 minutos de aquecimento, nas amostras em grão, e de 7,5 minutos, no extrato. Essas determinações servem, para avaliar a eficiência do tratamento térmico nos produtos de soja. Entretanto, são de relativa complexidade, levando a indústria, em geral, a fazer tal avaliação em função da atividade ureática e da solubilidade das proteína.s que se constituem em testes mais simples e mais rápidos de serem realizados. Determinou-sê a atividade ureática e a solubilidade das proteínas em água, nas mesmas amostras, e estabeleceu-se um paralelo entre esses fatores e os agentes antinutricionais (antitripsina e hemaglutinina). Verificou-se que existe boa correlação gráfica entre esses fatores, quando, o tratamento térmico é feito na amostra de soja sem embebição. No grão embebido, a uréase é inativada muito mais rapidamente que o fator antitripsina. Extrações, usando-se diferentes relações de sólido:solvente (farinha:água), demonstraram que a mais eficiente, para. As proteínas da soja, sem tratamento térmico, foi a de 1:30 (P:V). Estudou-se o efeito do pH e da concentração de base (KOH) na extração das proteínas da soja, constatando-se que, quanto maior for a desnaturação térmica das proteínas, maior será a influencia do aumento desses fatores na extração. Verificou-se que 0,1% de KOH promove uma extração de 70-80%, quando a soja é tratada termicamente, sendo que, em água, é inferior a 10%. Para a soja: que não sofreu tratamento térmico, encontrou-se um rápido aumento da lisina: disponível, quando aquecida em água fervente até 30 minutos, notando-se um decréscimo com tratamentos mais prolongados. Estudos do valor nutritivo (valores de PER) foram conduzidos para as seguintes matérias, provenientes das diversas fases da indústria de processamento da soja: 1) soja tritura da e sem tratamento térmico; 2) soja laminada e com pequeno tratamento térmico; 3) farelo na saída da rosca secadora;. 4) farelo tostado; 5) isolado protéico de procedência industrial, na forma de proteinato de sódio. O mesmo estudo foi feito nos produtos preparados no laboratório, os quais foram triturados até granulometria de 50 mesh e que são: 6) farinha de soja desengordurada; 7) leite integral de soja, em pó; 8) isolado protéico no ponto isoelétrico; 9) resíduo do leite de soja; 10) padrao de caseína. Os valores de PER encontrados foram, respectivamente: (-1,08); 2,24; 2,44; 2,31; 1,72; 2,66; 1,75; 2,02; 1,30 e 3,36. / Abstract: The abstract is available with the full electronic document / Mestrado / Mestre em Tecnologia de Alimentos

Orientador: Alessandro de Mello Varani / Resumo: As plantas como organismos sésseis requerem a síntese e o acúmulo de uma ampla variedade de moléculas envolvidas no crescimento, desenvolvimento e processos relacionados à defesa. Os transportadores Proteínas de Extrusão Multi- Antimicrobianas (MATE), Cassette de Ligação de ATP (ABC) e Superfamília dos Facilitadores Maioritários (MFS) são as principais famílias de transportadores de membrana em plantas, desempenhando um papel central nos processos relacionados à defesa nas interações planta-patógenos. Por exemplo, protegem as células das espécies de Citros sob a infecção de Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), o agente etiológico do Cancro Cítrico tipo A, uma das doenças de Citros mais devastadoras envolvidas em sérios impactos econômicos e ambientais. Aqui, identificamos genes e transcritos das famílias MATE, ABC e MFS usando o genoma disponível de Citrus sinensis (v2.0 HZAU) e o Transcriptoma Referência de Citros (CRT) re-anotado da base de dados CitrusKB (http://bioinfo.deinfo.uepg.br). Foram identificados 67 genes MATE, 91 MFS e 143 ABC no genoma de C. sinensis e 82 transcritos MATE, 139 MFS e 226 ABC no CRT. Os transcritos foram mapeados no genoma de C. sinensis, revelando uma alta taxa de genes parálogos e putativos eventos de splicing alternativo (AS), cujos perfis de expressão gênica e potenciais papéis na interação Citros-Xac foram propostos. As cópias de genes em tandem e cópias dispersas juntamente com genes que possivelmente sofreram eventos de AS representam fon... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Plants as sessile organisms require the synthesis and accumulation of a large array of molecules involved in growth, development, and defense-related processes. The Multi-Antimicrobial Extrusion Protein (MATE), ATP-Binding Cassette (ABC) and Major Facilitator Superfamily (MFS) transporters are the largest families of membrane transporters in plants, playing a central role in the defense-related processes in plant- pathogen interactions. For instance, protecting Citrus species cells under the infection of Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), the etiologic agent of the Citrus Canker type A, one of the most devastating Citrus diseases involved with serious economic and environmental impacts. Herein, we identified genes and transcripts from MATE, ABC, and MFS families using the available Citrus sinensis genome (v2.0 HZAU) and the re-annotated Citrus Reference Transcriptome (CRT) from CitrusKB Knowledge Base (http://bioinfo.deinfo.uepg.br). We identified 67 MATE, 91 MFS, and 143 ABC genes in the C. sinensis genome and 82 MATE, 139 MFS, and 226 ABC transcripts in the CRT. The transcripts were mapped in the C. sinensis genome revealing a high rate of paralogs genes and probably alternative splicing (AS) events, whose expression profiles and potential roles in the Citrus-Xac interaction were proposed. The tandem and dispersed copies along with genes that underwent AS events represents sources of transporters’ genes diversity and complexity. Moreover, we also highlighted potential bi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Ingeniero Civil en Biotecnología / El cultivo de células animales ha crecido continuamente en los últimos años, debido al avance en las técnicas de cultivo y al entendimiento de los procesos celulares. La venta de productos obtenidos a partir de estas técnicas deja importantes utilidades y la obtención de nuevos medicamentos deja grandes ganancias sociales. Dentro de los factores que ayudan a mejorar la productividad, se ha estudiado la posibilidad de intervenir los procesos de apoptosis y degradación de proteínas. En este contexto es donde cobra relevancia la obtención de modelos que estudien estas vías. En este documento se busca estudiar y modelar la degradación de proteínas via lisosomal. Para ello se realiza una investigación bibliográfica, se eligen los componentes del modelo, se plantean reacciones para poder deducir ecuaciones y simularlas. Se obtienen gráficos que describen diferentes procesos del sistema. Uno de los proncipales resultados fue la ratificación de que la degradación via lisosoma es más lenta que el replegamiento de proteínas. Las proteínas son degradadas entre 16 y 30 minutos luego de comenzada la simulación. Se logra describir tanto la generación de autolisosoma como la degradación de este. Se propone y realiza una simplificación de la formación del complejo Atg12Atg5Atg16, la que no altera visiblemente la degradación de autolisosoma. Por otra parte, se propone en un futuro modificar las condiciones gatillantes del estrés celular, con el fin de robustecer el modelo Finalmente se destaca la utilidad que puede tener un modelo de degradación de proteínas agregadas vía lisosomal. La aplicación de este podría generar utilidades y posicionar a la industria en un nivel más competitivo.