Background: Great strides have been made in combating malaria, however, the indicators in sub Saharan Africa still do not show promise for elimination in the near future as malaria infections still result in high morbidity and mortality among children. The abundance of the malaria-transmitting mosquito vectors in these regions are driven by climate suitability. In order to achieve malaria elimination by 2030, strengthening of surveillance systems have been advocated. Based on malaria surveillance and climate monitoring, forecasting models may be developed for early warnings. Therefore, in this thesis, we strived to illustrate the use malaria surveillance and climate data for policy and decision making by assessing the association between weather variability (from ground and remote sensing sources) and malaria mortality, and by building malaria admission forecasting models. We further propose an economic framework for integrating forecasts into operational surveillance system for evidence based decisionmaking and resource allocation.  Methods: The studies were based in Asembo, Gem and Karemo areas of the KEMRI/CDC Health and Demographic Surveillance System in Western Kenya. Lagged association of rainfall and temperature with malaria mortality was modeled using general additive models, while distributed lag non-linear models were used to explore relationship between remote sensing variables, land surface temperature(LST), normalized difference vegetation index(NDVI) and rainfall on weekly malaria mortality. General additive models, with and without boosting, were used to develop malaria admissions forecasting models for lead times one to three months. We developed a framework for incorporating forecast output into economic evaluation of response strategies at different lead times including uncertainties. The forecast output could either be an alert based on a threshold, or absolute predicted cases. In both situations, interventions at each lead time could be evaluated by the derived net benefit function and uncertainty incorporated by simulation.  Results: We found that the environmental factors correlated with malaria mortality with varying latencies. In the first paper, where we used ground weather data, the effect of mean temperature was significant from lag of 9 weeks, with risks higher for mean temperatures above 250C. The effect of cumulative precipitation was delayed and began from 5 weeks. Weekly total rainfall of more than 120 mm resulted in increased risk for mortality. In the second paper, using remotely sensed data, the effect of precipitation was consistent in the three areas, with increasing effect with weekly total rainfall of over 40 mm, and then declined at 80 mm of weekly rainfall. NDVI below 0.4 increased the risk of malaria mortality, while day LST above 350C increased the risk of malaria mortality with shorter lags for high LST weeks. The lag effect of precipitation was more delayed for precipitation values below 20 mm starting at week 5 while shorter lag effect for higher precipitation weeks. The effect of higher NDVI values above 0.4 were more delayed and protective while shorter lag effect for NDVI below 0.4. For all the lead times, in the malaria admissions forecasting modelling in the third paper, the boosted regression models provided better prediction accuracy. The economic framework in the fourth paper presented a probability function of the net benefit of response measures, where the best response at particular lead time corresponded to the one with the highest probability, and absolute value, of a net benefit surplus.  Conclusion: We have shown that lagged relationship between environmental variables and malaria health outcomes follow the expected biological mechanism, where presentation of cases follow the onset of specific weather conditions and climate variability. This relationship guided the development of predictive models showcased with the malaria admissions model. Further, we developed an economic framework connecting the forecasts to response measures in situations with considerable uncertainties. Thus, the thesis work has contributed to several important components of early warning systems including risk assessment; utilizing surveillance data for prediction; and a method to identifying cost-effective response strategies. We recommend economic evaluation becomes standard in implementation of early warning system to guide long-term sustainability of such health protection programs.

Les galaxies elliptiques ne sont des objets astronomiques très simples qu'en apparence: leur forme parfaitement régulière et ellipsoïdale est davantage le vestige d'une histoire tumultueuse semée d'interactions gravitationnelles avec d'autres galaxies plutôt que le signe d'un stade primitif dans leur vie. En effet, ces deux dernières décennies ont révélé la complexité de ces objets au niveau de leur cinématique interne, et surtout récemment avec le spectrographe intégral de champ SAURON qui a permis de dresser la structure bidimensionnelle de la vitesse de nombreuses galaxies elliptiques. La compréhension de la formation et de l'évolution de ces objets est un enjeu majeur de l'astrophysique contemporaine. La théorie hiérarchique de formation et d'évolution des galaxies, selon laquelle une galaxie est le résultat de nombreuses interactions et de fusions d'objets moins massifs, est à l'heure actuelle la mieux soutenue par les observations. Ainsi, elle permet de rendre compte de structures complexes telles les galaxies à coeur cinématiquement distinct, dans lesquelles on observe un brusque changement dans la courbe de rotation. Certains de ces objets montrent même une inversion dans le sens de rotation de la partie interne. De nombreuses études ont été réalisées pour comprendre les mécanismes de formation de ces coeurs, et la plupart d'entre elles semblent nécessiter l'apport d'un corps externe voire la fusion de deux galaxies. Dans ce travail nous réalisons dans un premier temps un catalogue de ces objets, afin d'en dégager les conclusions majeures. Dans un second temps nous présentons une méthode permettant d'extraire la signature orbitale de ces structures découplées en utilisant une modélisation dynamique de Schwarzschild . Nous appliquons cette méthode à trois objets dont nous disposons des données intégrales de champ, et tentons d'en extraire les principaux points communs. Finalement nous soulignons la valeur de cette méthodologie pour contraindre les modèles hiérarchiques de formation.

En France, les Sociétés d'Economie Mixte Locales (SEML) participent depuis 50 ans à l'aménagement du territoire mais paradoxalement la plupart des recherches les concernant traitent de leur nature juridique. Cette thèse resitue les SEML dans les jeux de régulations croisées entre l'Etat, les Collectivités Locales et la Caisse des Dépôts et Consignations. D'outil privilégié de l'Etat elles sont passées progressivement sous l'égide des collectivités locales, accompagnant la diversification des champs d'intervention de celles-ci. Elles sont ainsi témoin des enjeux de pouvoir entre décentralisation et recentralisation, libéralisme et régulation économique et sociale. Localement, les modes de gouvernance et les cultures urbaines influent sur leur rôle et leur positionnement tel qu'en témoigne l'analyse des agglomérations de Bordeaux, Rennes et Montpellier. Les influences européennes alimentent le débat prospectif avec des expériences différentes de la planification urbaine, de la propriété foncière et du rôle respectif des acteurs publics et privés, les SEML s'inscrivant tout à la fois dans le mouvement des Entreprises Publiques Locales européennes et des Partenariats Public Privé. L'apport de cette thèse réside ainsi dans l'approche des politiques urbaines et territoriales avec le regard d'un des acteurs opérationnels de la mise en œuvre de celles-ci, tout à la fois acteur et témoin.

La tesi estudia els conflictes entre Convergència Democràtica de Catalunya i Unió Democràtica de Catalunya. Des de la teoria del conflicte i utilitzant la metodologia de l'anàlisi de contingut, s'hi analitzen els articles de quatre diaris publicats a Barcelona (La Vanguardia, El Periódico, El País i Avui) durant tres moments d'especial confrontació entre CDC i UDC (1996-97, 2001 i 2006). La investigació se centra sobre les característiques del conflicte publicat i el paper dels diaris en relació amb el conflicte mateix i els seus dos actors principals. Les conclusions indiquen que es tracta d'un conflicte estructural, per quotes de poder a CiU, la tensió del qual és proporcional a la progressió en la preparació i execució de la successió de Jordi Pujol. La premsa hi intervé decisivament en el seu desenvolupament, com a tercer involucrat, però no com a part principal. La Vanguardia segueix l'interès d'UDC, enfoca el conflicte des d'UDC i és pro UDC. El Periódico se situa a l'oposició política, enfoca el conflicte des de CDC i s'hi posiciona contra UDC. El País adopta una oposició ideològica, des de fora i contra CDC. L'Avui hi interpreta l'interès de CiU, des de dins i a favor de CDC. / La tesis estudia los conflictos entre Convergència Democràtica de Catalunya y Unió Democràtica de Catalunya. Desde la teoría del conflicto y utilizando la metología del análisis de contenido, se analizan los artículos de cuatro diarios publicados en Barcelona (La Vanguardia, El Periódico, El País i Avui) durante tres momentos de especial confrontación entre CDC y UDC (1996-97, 2001 i 2006). La investigación se centra en las características del conflicto publicado y el papel de los diarios en relación con el conflicto mismo y sus dos actores principales. Las conclusiones indican que se trata de un conflicto estructural, por cuotas de poder en CiU, cuya tensión es proporcional a la progresión en la preparación y ejecución de la sucesión de Jordi Pujol. La prensa interviene decisivamente en su desarrollo, como tercero involucrado, pero no parte principal. La Vanguardia sigue el interés de UDC, enfoca el conflicte desde UDC y es pro UDC. El Periódico se sitúa en la oposición política, enfoca el conflicto desde CDC y se posiciona contra UDC. El País adopta una oposición ideológica, desde fuera y contra CDC. L'Avui interpreta el interés de CiU, desde dentro y a favor de CDC. / The thesis studies the conflicts between CDC and UDC as portrayed by some Barcelona newspapers. From the startpoint of the conflict theory and using the methodology of content analysis, articles published by four dailies (La Vanguardia, El Periódico, El País i Avui) during three moments of particular tension between CDC and UDC (1996-97, 2001 i 2006) are analysed. The research is focused on the characteristics of the conflict, as it was published, and on the role that the newspapers had relating to the development of the conflict itself and to its two protagonists. The conclusions from the study indicate that it is a structural conflict, motivated by a power struggle within CiU. The tension increases as the succession to Jordi Pujol's leadership approaches and it is implemented. The press, as a third party, albeit with a secundary role, has a decisive intervention in the conflict development. La Vanguardia follows the interests of UDC, looks at the conflict from UDC's viewpoint and it is pro-UDC. El Periódico adopts a political opposition, viewing the conflict from the stadtpoint of CDC and against UDC. El País adopts an ideological opposition looking at the conflict from the outside and against CDC. Avui follows the interests of CiU, acting from within and favouring CDC.

L'objectif principal de cette thèse était d'examiner dans quelle mesure il est possible d'étendre l'approche de la courbe maîtresse à des composants complexes afin de déterminer des conditions de déverminage et de réaliser une prédiction de durée de vie en fonction de ces conditions de déverminage. Nous avons considéré la stabilité d'un réseau dit élémentaire (réseau carré, à pas constant et droit) puis le problème de la stabilité (selon des critères spécifiques) des composants complexes: les CDC et les monofiltres GFF. Cette thèse a permis de décrire de façon rigoureuse, puis d'utiliser le cadre de travail VAREPA pour résoudre des problèmes issus de l'industrie de télécoms. A cet effet, des séries d'études de vieillissement accéléré sur des réseaux simples et complexes ont été menées. Un protocole de mesure permettant de déterminer les incertitudes de mesure a été mis au point afin de déterminer de façon fiable des intervalles de confiance sur les prédictions de durée de vie.Nous avons étudié les cinétiques de croissance des réseaux inscrits dans une fibre dédiée à l'inscription des CDC (Coreactive). Cette étude nous a permis de montrer que la réaction prédominante à l'origine des changements d'indice de réfraction est activée par une absorption à 1 photon. D'autre part, nous avons étendu le cadre de travail utilisé pour prédire l'effacement des réseaux (VAREPA) afin de rendre compte de leurs cinétiques d'inscription. Puis nous avons cherché à déterminer les conditions de passivation et à prédire la durée de vie des réseaux déverminés en présence d'hydrogène résiduelle (procédé industriel actuel). Pour cela, nous avons établi la courbe maîtresse de réseaux photoinscrits non déverminés puis nous avons validé les conditions de déverminage et les prédictions de durée de vie en construisant une nouvelle courbe maîtresse sur des réseaux déverminés.Nous avons étudié la stabilité thermique des réseaux inscrits dans une fibre hydrogénée dédiée aux futurs monofiltres GFF dans des conditions d'inscription similaires à celles de ces composants. Nous avons utilisé les courbes maîtresses établies à partir des réseaux élémentaires (mais apodisés) simplement dégazés " à froid " (ici 2jours à 50°C puis 2 jours à 110°C). Puis, nous avons fait vieillir le profil d'indice (cœur et gaine) d'un monofiltre GFF. Puis, nous avons recalculé la réponse spectrale de ce filtre vieilli (e.g. 30jours à 200°C) et nous l'avons comparé à des mesures expérimentales. Cette approche reste générale et permet de changer les conditions de déverminage au besoin. Cette étude nous a permis de mettre en évidence que la stabilité des variations d'indice photo-induites dans le cœur dépend peu de l'amplitude initiale de la modulation pour des valeurs comprises entre quelques 10-5 et 10-3. Du fait de la présence d'une gaine optique fortement photosensible (car fortement dopée en Ge), nous avons établi les courbes maîtresses des variations d'indice photo-inscrites dans le cœur et la gaine optique pour des valeurs allant jusque 10-3 dans le cœur et 3.10-3 dans la gaine. Nous avons ainsi obtenu des courbes maîtresses présentant le même k0 (fréquence d'essai, i.e facteur pré exponentiel) mais dont la forme est légèrement différente. La stabilité des variations d'indice est meilleure dans le cœur (moins dopé en Ge) que dans la gaine photosensible. Dans un second temps, nous avons cherché à déterminer les conditions de passivation et à prédire la durée de vie des réseaux déverminés à partir des réseaux de Bragg qualifiés d'élémentaires. Pour la première fois à notre connaissance, nous avons validé de façon fiable les conditions de passivation et les prédictions de durée de vie en construisant une nouvelle courbe maîtresse sur des monofiltres GFF préalablement déverminés. Conformément à la théorie, cette courbe maîtresse présente le même k0 et une forme similaire à celle établie au moyen de réseaux non déverminés, ce qui valide la fiabilité de nos prédictions.

Zikaviruset är ett virus som fått stor uppmärksamhet i framför allt Sydamerika från 2015 och framåt då allt fler fall uppmärksammats. Detta arbete har utförts som en litteraturstudie med mål att sammanfatta kunskapsläget kring Zikavirusets morfologi, spridning, historia, komplikationer, diagnostik samt rådande behandlingsmöjligheter. Som källor används information från Folkhälsomyndigheten, CDC, PAHO och WHO samt MeSH-sökningar via PubMed. Viruset tillhör familjen Flaviviridae. Liknande andra virus i samma grupp kan infektionen ge feber, makulopapulösa hudutslag, konjunktivit, ledvärk, huvudvärk och myalgi. Det beskrevs först redan på slutet av 1940-talet i Afrika och har sedan rapporterats ha spridit sig till Asien, Oceanien, Stilla havsöarna och nu senast med utbrott i Sydamerika. Virusinfektionen har blivit mycket omdiskuterad då allt mer bevis kunnat läggas fram för att den kan leda till Guillain-Barrés syndrom samt även utöva teratogena effekter med mikrocefali som följd. Man har kartlagt spridning framför allt via myggarten Aedes men bevis finns även för att sexuell spridning kan ske samt att sjukdomen förefaller även kunna spridas från mor till foster. Diagnostiken baseras på RT-PCR och serologiska tester. I nuläget finns ingen aktiv behandling. Sammanfattningsvis har Zikavirus spridit sig snabbt genom Syd- och latinamerika sista åren och visat sig utgöra ett hot mot folkhälsan i dessa områden varför ett framtagande av ett fungerande vaccin är önskvärt.

Many people may have become increasingly concerned about the risks associated with vaccines. At the same time, there is a lack of qualitative research on the impact of various vaccinations schedules on individuals' physio-psychological health. In addition, "mandatory" versus "nonmandatory, but recommended" vaccines are still under debate in some Western countries. The purpose of this ethnographic study was to provide an in-depth understanding of the beliefs, experiences, and perceptions of adolescents, parents, and health care providers regarding different vaccination schedules. The health belief model was used as the theoretical framework. The sample consisted of adolescents and parents from different vaccination backgrounds, as well as of healthcare providers who were involved with vaccination schedules (N=72). Purposeful sampling strategy was applied and individual interviews were conducted. All interviews were recorded and transcribed verbatim, and the obtained data were analyzed thematically. According to the results of the study, participants' perceptions on vaccination were generally positive, and a mandatory vaccination schedule was mostly recommended. Adolescents who received mandatory vaccination reported that this scheme was appropriate against several diseases. Further, health care members indicated that vaccination side effects were mainly emotional, and they suggested that public health agencies should disseminate more scientifically-sound information on the benefits and risks of vaccination. The findings of this study may be used as the basis for the formulation of an effective public health policy to adopt a nationally-and internationally-accepted vaccination schedule.

Philosophiae Doctor - PhD / This dissertation constructs a social history of African women in Cape Town from the vantage point of their varied attempts over the last five decades to map 'home' in the urban setting: in the physical structures of their homes; the character of their social and kinship networks; and in the ways a notion of 'place' was re-worked. An historiographical examination of existing research has shown that, especially in the South African context, much scope remains for a regionally specific historical analysis of the urbanisation process, and African women's unique role in it. The use of oral histories and the adoption of a trans-generational interviewing strategy have helped fashion a textured account of African women's settlement strategies, and the underlying social and personal transformations that their design and use suggested. 'First-generational' women, who entered Cape Town at mid-century, led an uncertain and highly regulated urban existence, by virtue of their enforced marginalisation under apartheid. Until the late-1980s, Cape Town retained a distinctive demographic composition, and an historical association as the 'home' of the Coloured population. This made state and local efforts to control the entry and residence of the minority African populace more coercive and successful, at least in the first two decades of apartheid rule. Despite these restrictions, African women constructed and managed a dense set of strategies which affirmed their material livelihoods in the city and increasingly enmeshed their identities in the workings of a modern and commoditised world. However, first-generational women also actively contested these developments to some extent, evident particularly in their efforts to regulate the movement of and compel financial support from their increasingly mobile daughters and granddaughters. Evidence from second and third-generational respondents show a growing reluctance to utilise first-generational women's settlement strategies and the conceptual frameworks which underpinned them. For instance, associational links were increasingly organised along non-racialised lines. Third-generational women's desire to establish residence in other areas of the city, or in other cities entirely, was indicative of a similar dynamic. This was also reflective of their embrace of mobility as an expression of greater economic and social freedoms possible in a post-apartheid world. This dissertation constructs a social history of African women in Cape Town from the vantage point of their varied attempts over the last five decades to locate 'home' in the urban setting. It charts the experiences of a group of women who first moved to Cape Town in the 1940s and 50s, and their children and grandchildren. My focus is on the way in which succeeding generations of women developed differing strategies of settlement, in the context of sometimes dramatic social and political change. The social as well as the physical elements of locating home are key elements in the analysis, including the redefinition of kinship and associational networks, as well as the re-casting of identities and a sense of place. Until the late 1980s, Cape Town retained a distinctive demographic composition, and an historical association as the 'home' of the Coloured- population. This made state and local efforts to control the entry and residence of the minority African populace more coercive and successful, at least in the first two decades of apartheid rule. Rather than painting a comprehensive portrait of urban African life in the apartheid era (1948- 1994), this dissertation hopes to map a few significant dynamics which were manifest in the encounters between a select group of African women and the distinctive terrain of this city during the apartheid years.

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Cell cycle regulation is an important part for the detection and destruction of mutated and dysregulated cells as it is a natural protection against degenerative diseases and cancer. The ability of the body to detect and destroy these cells is a vital part in maintaining homeostasis in the body. Once cells have circumvented this line of defence, dismantling these cells would become very difficult.  Research into new ways to target and destroy mutated cells are constantly evolving in hopes of being able to control and direct lysis of target cells using therapeutic drugs. One of the possibilities for such a method are Cholesterol Dependent Cytolysins (CDC), specific proteins found in bacteria. These proteins are dependent on the ability to bind to cholesterol in cell-walls to form pores that lyse and effectively destroy cells.   This project aims to study the structure and mechanistic details of pore formation by CDC mitilysin using cryogenic electron microscopy (cryo-EM). Mitilysin was purified by affinity chromatography and its pore formation ability was confirmed by calcein release assay and hemolysis assay. The pore structures of mitilysin were observed by transmission electron microscopy (TEM) using liposomes composed of both 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC) and cholesterol as model membranes. Detergent screening directed separation of pores from liposomes; so that they could be visualized by cryo-EM. While these steps were optimized and proven successful, they were time-consuming. An initial 3D-model of pore-structures was rendered, but no molecular characteristics could be determined at the end of the allotted time. The study does lay the ground steps for obtaining the complete structure of mitilysin pores.