Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study had as objective to estimate genetic parameters and genetic and phenotypic progress for growing characteristics at pre and post weaning for an Aberdeen Angus cattle breed. The covariance components were obtained by the REML using an animal model. In the article 01 they were analyzed the characteristics birth weight (PN), average daily gain from birth to weaning (GMDND), weaning weight adjusted to 205 days of age (P205) and visual scores (EVs) of conformation (C), precocity (P), musculature (M) and size (T), at the pre weaning phase, from 23,176 animals born between the years 1994 and 2004. The direct and maternal heritabilities were: 0.27 and 0.11, 0.26 and 0.21, 0.24 and 0.07, 0.15 and 0.17, 0.12 and 0.08, 0.12 and 0.10, and 0.19 and 0.09, respectively to PN, GMDND, P205, C, P, M, and T. The genetic correlations between GMDND and EVs ranged from 0.55 to 0.66 and for the EVs in between themselves, from 0.50 to 0.92. The genetic trends for PN, GMDND, P205 (g/year) and for C, P, M e T (points/year) were: 17.5, 1.1, 220.9, 0.0046, 0.003, 0.0044, and 0.0063 and the phenotypic were 29.8, -3.3, 467.9, 0.0037, -0.0044, 0.0153, and -0.0163 respectively. The direct heritabilities suggest that it can be possible to get genetic gain by selection in this population, although for the EVs, this must be expected in low proportions. The genetic correlations between GMDND and EVs shows that selection for GMDND promotes improvement in EVs and vice-versa, suggesting that selection index combining these characteristics can be an efficient alternative selection method. The positive genetic trends indicate that it is occurring genetic progress; however the phenotypic, negative, for same characteristics suggest the necessity that to improve the environmental conditions to permit the expression of the genotype. In article 02 it were analyzed the post weaning characteristics yearling weight adjusted to 550 days of age (P550), average daily gain from weaning to yearling (GMDDS), and the EVs, according to Article 01. In post weaning phase the data were composed by observations on 28,349 animals, born from 1993 to 2003. The direct heritabilities estimated were: 0.23, 0.16 , 0.13, 0.11, 0.16 and 0.13, to P550, GMDDS, C, P, M and T, respectively. The genetic correlations between GMDDS and the EVs range from 0.27 a 0.43 and between the EVs ranged from 0.01 a 0.92. The genetic trends estimated for P550 and GMDDS (g/year) and for C, P, M, and T (points/year) were: 193.2; 0.1, 0.0054, 0.0035, 0.0057, and 0.0026, respectively. The phenotypic trends for the same characteristics were: 3,868, -2.2, 0.0189, -0.0013, 0.0217 and -0.0016, respectively. The direct heritabilities estimated suggest to be possible to get genetic gain by selection in this population. The genetic correlations between GMDDS and the EVs suggest that the selection for GMDDS promote improvement in EVs and vice-versa; for the EVs between themselves the correlations were height between C, P and M (0.79 to 0.92) and low between these and T (0.01 to 0.30). The genetic trends indicate that the selection is promoting, although low, genetic progress; however the phenotypic, negative, for same characteristics suggest that more attention must be given to the environmental conditions to permit the expression of the genotype. / Este estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos e o progresso genético para as características de desempenho na pré e na pós-desmama, para uma população bovina da raça Aberdeen Angus. Os componentes de (co)variância foram estimados por REML, utilizando modelo animal. No artigo 01 foram analisadas as características peso ao nascer (PN), ganho médio diário do nascimento a desmama (GMDND), peso a desmama ajustado para 205 dias (P205) e os escores visuais (EVs) conformação (C), precocidade (P), musculatura (M) e tamanho (T), na fase pré-desmama, de 23.176 animais, nascidos entre os anos de 1994 e 2004. As herdabilidades diretas e maternas foram: 0,27 e 0,11, 0,26 e 0,21, 0,24 e 0,07, 0,15 e 0,17, 0,12 e 0,08, 0,12 e 0,10 e 0,19 e 0,09, para PN, GMDND, P205, C, P, M e T, respectivamente. As correlações genéticas entre o GMDND e os EVs variaram de 0,55 a 0,66, e para os escores visuais entre si de 0,50 a 0,92. As tendências genéticas para PN, GMDND, P205 (g/ano) e para C, P, M e T (pontos/ano) foram 17,5; 1,1; 220,9; 0,0046; 0,003; 0,0044 e 0,0063 e as fenotípicas foram 29,8; -3,3; 467,9; 0,0037; -0,0044; 0,0153 e -0,0163, respectivamente. As herdabilidades diretas sugerem ser possível obter ganho genético através da seleção nesta população, embora, para os EVs, esse deve ser esperado em pequena proporção. As correlações genéticas entre GMDND e os EVs indicam que a seleção para GMDND promove melhoria nos EVs e vice versa, sugerindo que a adoção de índices de seleção combinando essas características pode ser uma alternativa eficiente de seleção. As tendências genéticas, positivas, indicam estar havendo progresso genético; porém, as fenotípicas, negativas para algumas características, sugerem a necessidade de melhorias nas condições ambientais para viabilizar a expressão do genótipo. No artigo 02 foram analisadas as características peso ao sobreano ajustado para 550 dias de idade (P550), ganho médio diário de peso da desmama ao sobreano (GMDDS) e os EVs conforme o Artigo 01. Na fase pós-desmama o banco de dados continha registros de 28.349 animais, nascidos entre os anos de 1993 e 2003. As estimativas de herdabilidade foram: 0,23; 0,16; 0,13; 0,11; 0,16 e 0,13, para P550, GMDDS, C, P, M e T, respectivamente. As correlações genéticas entre o GMDDS e os EVs variaram de 0,27 a 0,43 e para os escores visuais entre si de 0,01 a 0,92. As tendências genéticas estimadas para P550 e GMDDS (g/ano), e para C, P, M e T (pontos/ano) foram: 193,2; 0,1; 0,0054; 0,0035; 0,0057, e 0,0026, respectivamente. As tendências fenotípicas para as mesmas características foram: 3,868; -2,2; 0,0189; -0,0013; 0,0217 e -0,0016, respectivamente. As herdabilidades diretas estimadas sugerem ser possível obter ganho genético através da seleção nesta população. As correlações genéticas entre GMDDS e os EVs sugerem que a seleção para GMDDS promove melhoria nos EVs e vice versa; para os EVs entre si foram altas as correlações entre C, P e M (0,79 a 0,92) e baixas entre estes e T (0,01 a 0,30). As tendências genéticas demonstram que a seleção praticada está promovendo, embora pequeno, ganho genético; entretanto as fenotípicas, negativas para algumas características, indicam que deve ser dada mais atenção ao ambiente visando favorecer a expressão do genótipo.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:39:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 509482 bytes, checksum: ed32a13244b163a7dcca86f047e20162 (MD5) Previous issue date: 2010-07-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Physic nut (Jatropha curcas L.) is a highly promising species for biofuel production. Its descriptors are known and evaluation of its genetic variability has not been done yet. This is the first study on genetic variability in J. curcas accessions and its aim was to start the definition of morph-agronomical descriptors in juvenile phase, to evaluate the and to estimate genetic parameters in progenies and their matrix. Germplasm bank (GBA) of J. curcas at UFV contains 75 accessions from Brazil and three from Cambodia. Evaluations were done at eight and at 14 months of field. Morph-agronomical descriptors evaluated in progenies were plant height (PH) and height of branches (HEIB), crown diameter (CD) and diameter of stem (DS), number of branches (NB), length (LL) and width (WL) of the leaf, LL/WL ratio and petiole size (PS). Descriptors of seed evaluated in matrix were oil content in the seeds (OIL), weight of 100 seeds (WS), length and width of the seeds and LS/WS ratio. Estimates of genetic parameters, analysis of genotypic correlation among descriptors and Mahalanobis distance, which quantified genetic variability, were processed using softwares SELEGEN e SAS. On this distance matrix, it was applied Tocher and UPGMA clusters. Genetic divergence was also evaluated through canonical variables. The relative contribution from descriptors for divergence was evaluated based on matrix of distances and eigenvectors estimate associated to the later canonical variables. These last analyses were processed using software GENES. Average oil content in seeds was 31% ranging from 16 to 45%. It was found no genetic correlation among morph-agronomical descriptors and oil content. High coefficients of genetic variation were found for seed descriptors (PS and OIL) and for morphagronomical at eight (HEIB, PH, NB and DS) and at 14 (HEIB and PS) months of field. The highest herdability coefficients in a strict sense were found, at eight months of field, for LL, WL and DS, and at 14 months of field, for descriptors LL, PS and WL. Tocher cluster made it possible, in both evaluation times, separation of accessions in three different groups. Dendogram by UPGMA was able to separate accesses, at eight and 14 months of field, in eight and 15 different groups, respectively. Analyses of canonical variable also evidenced divergence among accesses. The two first canonical variables explained 88.67 and 82.35% all variation, at eight and 14 months of field, respectively, forming four different groups for both ages of evaluation. The next step is choosing divergent groups and within them the identification of the most interesting accesses for the breeder. Thus, the existence of genetic diversity in GBA was proven which is important for continuity of genetic breeding works aiming at obtaining cultivars with high production of grain and high productivity of oil. Accessions with high oil content in the seeds were separately grouped, and crossing among them must be explored by the program. For registration of cultivar protection, the descriptors that contributed at most for divergence were PH and DS, the others vary in importance over time. Future evaluations involving the same descriptors and other related to reproductive cycle (inflorescences) and productive cycle (number of bunches, number of fruit per bunch, number of seeds per fruit and production) can increase even more the knowledge on the species and permit the advance on its breeding. / Pinhão manso (Jatropha curcas L.) é uma espécie altamente promissora para produção de biodiesel. Seus descritores são desconhecidos e a avaliação da sua variabilidade genética ainda não foi feita. Este é o primeiro estudo da variabilidade genética em acessos de J. curcas e teve como objetivo iniciar a definição dos descritores morfo-agronômicos da fase juvenil, avaliar a variabilidade e estimar parâmetros genéticos em progênies e suas matrizes. O banco de germoplasma (BAG) de J. curcas da UFV contém 75 acessos do Brasil e três do Camboja. As avaliações foram realizadas aos oito e aos 14 meses de campo. Os descritores morfo-agronômicos avaliados nas progênies foram altura da planta (ALT) e da ramificação (ALTR), diâmetro da copa (DCP) e do caule (DCL), número de ramos (NR), comprimento (CF) e largura foliar (LF), razão CF/LF e tamanho do pecíolo (TP). Os descritores de sementes avaliados nas matrizes foram teor de óleo nas sementes (Óleo), peso de 100 sementes (PS), comprimento (CS) e largura das sementes (LS) e razão CS/LS. As estimativas de parâmetros genéticos, a análise de correlação genotípica entre descritores e a distância de Mahalanobis, que quantificou a variabilidade genética, foram processadas nos softwares SELEGEN e SAS. Sobre esta matriz de distância foram aplicados os agrupamentos de Tocher e UPGMA. A divergência genética também foi avaliada por variáveis canônicas. A contribuição relativa dos descritores para a divergência foi avaliada com base na matriz de distâncias e na estimativa dos autovetores associados às últimas variáveis canônicas. Estas últimas análises foram processadas no software GENES. O teor médio de óleo nas sementes foi 31%, com uma variação de 16 a 45%. Nenhuma correlação genética foi encontrada entre descritores morfo-agronômicos e teor de óleo. Elevados coeficientes de variação genética foram encontrados para os descritores de semente (PS e Óleo) e para os morfo-agronômicos aos oito (ALTR, ALT, NR e DCL) e aos 14 meses de campo (ALTR e TP). Os maiores coeficientes de herdabilidades no sentido restrito foram encontrados, aos oito meses de campo, para CF, LF e DCL e, aos 14 meses de campo, para os descritores CF, TP e LF. O agrupamento de Tocher possibilitou, em ambas as épocas de avaliação, a separação dos acessos em três grupos distintos. O dendrograma por UPGMA possibilitou a separação dos acessos, aos oito e 14 meses de campo, em oito e 15 grupos distintos, respectivamente. A análise de variáveis canônicas também evidenciou divergência entre acessos. As duas primeiras variáveis canônicas explicaram 88,67 e 82,35% de toda variação, aos oito e 14 meses de campo, respectivamente, formando quatro grupos distintos em ambas as idades de avaliação. O próximo passo é a escolha dos grupos divergentes e dentro deles a identificação dos acessos mais interessantes ao melhorista. Assim a existência de diversidade genética no BAG foi comprovada e isso é importante para continuidade dos trabalhos de melhoramento genético, com o objetivo de obter cultivares de elevada produção de grãos e alta produtividade de óleo. Acessos com alto teor de óleo nas sementes foram agrupados separadamente, e o cruzamento entre estes deve ser explorado pelo programa. Para o registro de proteção de cultivares, os descritores que mais contribuíram para a divergência foram ALT e DCL, os demais variam em importância com o passar do tempo. Avaliações futuras envolvendo os mesmos descritores e outros relacionados ao ciclo reprodutivo (inflorescências) e produtivo (número de cachos, de frutos por cacho, de sementes por frutos e produção) podem ampliar ainda mais o conhecimento da espécie e permitir o avanço do seu melhoramento.

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-11-12T11:55:30Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ailton José Crispim Filho - 2018.pdf: 3672012 bytes, checksum: b365991a12b8e3c0cfd0eacb8a2eb939 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-12T13:02:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ailton José Crispim Filho - 2018.pdf: 3672012 bytes, checksum: b365991a12b8e3c0cfd0eacb8a2eb939 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-12T13:02:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ailton José Crispim Filho - 2018.pdf: 3672012 bytes, checksum: b365991a12b8e3c0cfd0eacb8a2eb939 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-10-19 / Recurrent selection in half-sib progenies is the most used method for breeding maize populations. To be efficient, this method needs to count on populations that have genetic variability potential to be explored for agronomic traits of interest. In this sense, genetic and phenotypic parameters are estimated at each cycle in order to verify the magnitude and maintenance of the present variability, the possible gains with the selection and, thus, the potential and permanence of the population in the recurrent selection program. These parameters guide the best selection strategies to be adopted for the management of the breeding program. The objective of this study was: (i) to evaluate the genetic potential of the “Composto Calor” maize population (CCR1) for grain yield and its components to recurrent selection; (ii) compare the genetic gains obtained by the direct selection in grain yield with those obtained by the Z Index and the Mulamba & Mock Index; and (iii) to estimate genetic and phenotypic correlations between agronomic traits and the cause and effect relationships of the yield components with grain yield to establish criteria in the indirect selection process. Thus, 141 half-siblings progenies and three checks were evaluated using a 12 x 12 triple lattice design in 2017/2018 growing season in the UFG, Goiânia-GO and second crop 2017/2018 in the UFJ, Jataí-GO. The traits evaluated were: number of days to anthesis, number of days to silking, anthesis-silking interval, plant height, ear height, ear ratio, stalk lodging, ear prolificacy, kernels per row, number of grains per row, ear diameter, ear length, cob diameter, grains length, ear weight and grain yield. Significant differences were found among progenies for all traits, indicating the presence of variability. The genetic gains with selection ranged from -38.19% for anthesis-silking interval to 10.86% for grain yield, and the selection index of Mulamba & Mock showed better indirect response for this last trait. All traits exhibited at least one significant genetic or phenotypic correlation estimate, indicating that changes in one trait may change the mean of other correlated. Therefore, the CCR1 population has potential to recurrent selection, the selection index of Mulamba & Mock is more efficient in the selection of the progenies to be recombined in successive selection cycles, and plant height, ear diameter, and ear weight are the most appropriate traits to perform selection aiming to achieve indirect genetic gains for grain yield. / A seleção recorrente com progênies de meios-irmãos é o método mais utilizado no melhoramento de populações de milho. Para que esse método seja eficiente, é necessário contar com populações que possuam variabilidade genética potencial a ser explorada para caracteres agronômicos de interesse. Nesse sentido, são estimados, a cada ciclo, parâmetros genéticos e fenotípicos, a fim de verificar a magnitude e manutenção da variabilidade presente, os possíveis ganhos com a seleção e, assim, o potencial e permanência da população no programa de seleção recorrente. Esses parâmetros orientam sobre as melhores estratégias de seleção a serem adotadas para a condução do programa de melhoramento. Objetivou-se com este estudo: (i) avaliar o potencial genético da população de milho “Composto Calor” (CCR1) em produtividade de grãos e seus componentes para seleção recorrente; (ii) comparar os ganhos genéticos obtidos com a seleção direta na produtividade de grãos aos obtidos pelos índices de seleção Z e de Mulamba & Mock; e (iii) estimar as correlações genéticas e fenotípicas entre os caracteres, e as relações de causa e efeito dos componentes de produção com a produtividade de grãos para estabelecer critérios no processo de seleção indireta. Para isso, 141 progênies de meios-irmãos e três testemunhas comerciais foram avaliadas em delineamento látice triplo 12 x 12 na primeira safra de 2017/2018 na UFG, Goiânia-GO, e na segunda safra de 2017/2018 na UFJ, Jataí-GO. Os caracteres avaliados foram: florescimento masculino, florescimento feminino, intervalo de florescimento, altura de plantas, altura de espigas, posição relativa das espigas, acamamento e quebramento de plantas, prolificidade, número de fileiras de grãos na espiga, número de grãos por fileiras, diâmetro de espigas, comprimento de espigas, diâmetro de sabugos, comprimento de grãos, peso de espigas e produtividade de grãos. Foram encontradas diferenças significativas entre as progênies para todos os caracteres, indicando presença de variabilidade genética. Os ganhos genéticos com a seleção variaram de -38,19% para intervalo de florescimento a 10,86% para produtividade de grãos, sendo que o índice de seleção de Mulamba & Mock apresentou melhor resposta indireta neste último caráter. Todos os caracteres apresentaram ao menos uma estimativa de correlação genética ou fenotípica significativa, indicando que mudanças em um dado caráter, podem alterar a média de outros correlacionados. Conclui-se que a população CCR1 tem potencial para ser utilizado em um programa de seleção recorrente, sendo o índice de seleção de Mulamba & Mock mais eficiente na seleção das progênies a serem recombinadas nos sucessivos ciclos de seleção, e que a altura de plantas, diâmetro de espigas e peso de espigas são os caracteres mais apropriados para realizar a seleção visando ganhos genéticos indiretos na produtividade de grãos.

Submitted by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-11-19T11:21:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Taynara Raimundo Martins - 2018.pdf: 8253406 bytes, checksum: a7da32a235e58e0bd75d8ec73ca6bb5a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-19T11:43:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Taynara Raimundo Martins - 2018.pdf: 8253406 bytes, checksum: a7da32a235e58e0bd75d8ec73ca6bb5a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-19T11:43:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Taynara Raimundo Martins - 2018.pdf: 8253406 bytes, checksum: a7da32a235e58e0bd75d8ec73ca6bb5a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-09-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The search for more efficient and profitable production systems is well connected with the choice of genetic resources that optimize genetic trinomics, nutrition and sanity. Measuring the density of the resources, we have a Senepol breed, an adapted taurine, which represents an interesting option of use. As this breed as controller of genetic parameters for economic aspects is non-existent, the focus of this work is the estimation of the genetic parameters of the growth, reproductive and carcass traits of Senepol cattle. The parameters for the traits of birth weight (BW), weight at 120 days of age (W120), weaning weight (WW), yearling age weight (YW), scrotal circumference overhead (SC), backfat thickness (BF), rib eye area (REA) and slaughter conformation at yearling age (SCY). The themes were used, group of contemporaries, and age of cow at birth as covariate. maternal and residual permanent environment. As for post-weaning characteristics, the maternal genetic effect of the permanent environment and the age of the cow as a covariate were not included. Consider null covariance between the direct and maternal twins. The (co) variance components were obtained, using the GIBBS2F90 software, assuming an animal model for 4 traits (BW, W120, WW and YW) and another one for 5 traits (YW, SC, BF, REA and SCY). The following statistics were obtained for BW (0.19), W120 (0.22), WW (0.15), YW (0.23), SC (0.25), BF (0.11), REA (0.26) and SCY (0.12) indicated the probability of genetic selection and incorporation in the herd. As for the occurrence of maternal herds for BW (0,09), W120 (0,11) and WW (0,10), genetic alterations of the progenies were recorded. Genetic variations between growth variables ranged from 0.49 to 0.94 and between growth traits, the rate of change from 0.17 to 0.81. Genetic conditions between reproductive and starting traits were low from 0.02 to 0.17. The coefficients of genetic correlations, in general, were favorable. The result is that there is a genetic variability among cattle of the breed and that the selection of the genetic gene is part of the selection process. This study will make it possible to better delineate the Senepol breed breeding program, thus providing a better response to breed selection. / A busca por sistemas de produção mais eficientes e rentáveis, está inteiramente relacionada com a escolha de recursos genéticos que otimizem o trinômio genética, nutrição e sanidade. Mediante a diversidade desses recursos, tem-se a raça Senepol, um taurino adaptado, que representa uma interessante opção de utilização. Como nessa raça as estimativas de parâmetros genéticos para características de interesse econômico são escassas, o foco deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos das características de crescimento, reprodutivas e de carcaça de bovinos da raça Senepol. Foram estimados parâmetros genéticos para as características de peso ao nascer (PN), peso aos 120 dias de idade (P120), peso a desmama (PD), peso ao sobreano (PS), perímetro escrotal ao sobreano (PES), espessura de gordura subcultânea (EGS), área de olho de lombo (AOL) e conformação frigorífica ao sobreano (CFS). Dois modelos foram utilizados, sendo um para as características pré-desmama, que incluiu como efeito fixo, grupo de contemporâneos, e idade da vaca ao parto como covariável (efeito linear e quadrático) e como efeitos aleatórios foram considerados os efeitos genéticos direto, materno, ambiente permanente materno e residual. Já para as características pós-desmama, não foi incluso o efeito genético materno, de ambiente permanente materno. Considerou- se covariância nula entre os efeitos genéticos diretos e maternos. Os componentes de (co)variância foram obtidos, empregando-se o software GIBBS2F90, assumindo um modelo animal para 4 características (PN, P120, PD e PS) e outro para 5 características (PS, PES, EGS, AOL e CFS). As estimativas de herdabilidades diretas encontradas para PN (0,19), P120 (0,22), PD (0,15), PS (0,23), PES (0,25), EGS (0,11), AOL (0,26) e CFS (0,12) foram de baixa a média magnitude e indicaram possibilidade de seleção genética e incorporação no rebanho. Já as estimativas de herdabilidades maternas para PN (0,09), P120 (0,11) e PD (0,10) de baixa magnitude, indicando efeitos genéticos das matrizes no desempenho das progênies. As correlações genéticas das características de crescimento variaram de 0,49 a 0,94 e entre as características de crescimento, carcaça e reprodutiva variaram de 0,17 a 0,81. As associações genéticas entre as características reprodutivas e de carcaça foram baixas 0,02 a 0,17. Os coeficientes de correlações genéticas, de modo geral, foram favoráveis. Esses resultados apontam que há variabilidade genética entre os bovinos da raça Senepol e que ao selecionar para determinada característica de crescimento, haverá seleção nas demais, indicando a possibilidade de progresso genético se as mesmas forem incluídas como critérios de seleção. Este estudo possibilitará que seja melhor delineado o programa de melhoramento genético da raça Senepol no Brasil, proporcionando assim, uma maior resposta a seleção na raça.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-27T11:35:22Z No. of bitstreams: 2 Tese - Renata Cristina Alvares - 2015.pdf: 6545735 bytes, checksum: 57eee901abeda481f65a8b76157955fc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-27T12:04:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Renata Cristina Alvares - 2015.pdf: 6545735 bytes, checksum: 57eee901abeda481f65a8b76157955fc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-27T12:04:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Renata Cristina Alvares - 2015.pdf: 6545735 bytes, checksum: 57eee901abeda481f65a8b76157955fc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-03-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The breeding of common bean cultivars with Carioca grain, slow grain darken-ing, upright plant architecture, and high yield has become a growing challenge. Slow grain darkening will increase the storage time, providing flexibility for producers for the time of sale, and consequently increasing profitability. Studies have demonstrated the existence of genetic variability for this trait, allowing the selection of lines with slow grain darkening. The objectives of this study were i) to estimate genetic and phenotypic parameters of lines of four segregating common bean populations; ii) select those with slow grain darkening, upright plant architecture and high yield; iii) seek an association between slow darkening and cooking time of grains after storage; iv) evaluate two induction methods of grain dark-ening and v) validate the markers Pvsd-1158 and PVM02TC116, associated with grain darkening. The tested lines were derived from four segregating populations resulting from crosses between the cultivar BRSMG Madrepérola with slow grain darkening and the par-ents BRS Estilo, BRS Cometa, BRS Notável, and CNFC 10429. Three trials were installed with 220 lines (55 per population), and 5 parents in a 5x15 triple lattice design, with plots of two 3-m rows, at three locations. The experiments were conducted in the winter grow-ing season 2012, one in Santo Antônio de Goiás and two in Brasilia. The traits grain yield, plant architecture, grain darkening, 100-grain weight, and cooking time were evaluated. The variance components and genetic and phenotypic parameters were estimated, and the phenotypic, genetic and environmental correlation coefficients between grain darkening and cooking time, 90 and 180 days after harvest. Induction methods of accelerated and slow darkening were compared. From the markers Pvsd- 1158 and PVM02TC116, identi-fied as previously linked to the gene that controls grain darkening, the frequency of recom-bination and selection efficiency of the markers was estimated for each population and environment and in the mean of the environments. For slow grain darkening, the estimates of heritability, genetic variance and expected gain with selection were high, indicating good chances of successful selection. For yield, plant architecture and commercial grain size, the estimates of heritability and genetic variance were high, but indicated no high gains with simultaneous selection. Lines with slow grain darkening were obtained from the four populations; the highest number of lines that combined slow darkening with upright plant architecture, high yield, and commercial grain size were derived from the crosses BRSMG Madrepérola x BRS Estilo and BRSMG Madrepérola x BRS Cometa. No im-portant genetic correlation between grain darkening and cooking time was identified, there-fore, light-colored grains do not indicate a short cooking time. The induction methods of slow and accelerated darkening, provide similar information in the discrimination of lines with slow and regular darkening. The estimates of the recombination frequency for marker Pvsd-1158 were always low, indicating the close linkage of this marker to the gene that controls slow darkening, and were stable in the different environments and populations. Marker PVM02TC116 however was not polymorphic in three of the four populations. The recombination frequency of this marker in the polymorphic population was high, showing that it is unsuitable for marker-assisted selection for grain darkening. / A obtenção de cultivares de feijoeiro-comum de grãos carioca que associem escurecimento lento dos grãos, arquitetura ereta e alta produtividade é uma demanda cres-cente para os melhoristas. O escurecimento lento de grãos permitirá aumentar o tempo de armazenamento, proporcionando aos produtores flexibilidade no momento de venda e, consequentemente, maior lucratividade. Estudos têm demostrado a existência de variabili-dade genética para este caráter, possibilitando a seleção de linhagens com escurecimento lento de grãos. Os objetivos do presente trabalho foram i) estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos de linhagens obtidas de quatro populações segregantes de feijoeiro-comum; ii) selecionar linhagens que associem escurecimento lento dos grãos, arquitetura de plantas ereta e alta produtividade; iii) verificar a existência de associação entre o escurecimento lento e o tempo de cocção dos grãos, após o armazenamento, iv) avaliar dois métodos de indução do escurecimento dos grãos; e v) validar os marcadores SSR Pvsd-1158 e PVM02TC116, associados ao escurecimento dos grãos. As linhagens avaliadas foram ori-undas de quatro populações segregantes, derivadas do cruzamento entre a cultivar de escu-recimento lento dos grãos BRSMG Madrepérola e os genitores BRS Estilo, BRS Cometa, BRS Notável e CNFC 10429. Foram instalados três ensaios com 220 linhagens, sendo 55 de cada população, e os cinco genitores, em delineamento experimental látice 15x15, com parcelas de duas linhas de três metros em três locais. Os experimentos foram realizados na safra de inverno/2012, sendo um em Santo Antônio de Goiás e outros dois em Brasília. Os caracteres avaliados foram produtividade de grãos, arquitetura de plantas, escurecimento de grãos, massa de cem grãos e tempo de cocção. Foram estimados componentes de vari-ância, parâmetros genéticos e fenotípicos e coeficientes de correlação fenotípica, genética e ambiental entre o escurecimento de grãos e tempo de cocção aos 90 e aos 180 dias após a colheita. Foi realizada a comparação entre os métodos de indução de escurecimento acele-rado e prolongado. A partir dos marcadores Pvsd-1158 e PVM02TC116, identificados co-mo previamente ligados ao gene que controla o escurecimento dos grãos, estimou-se a fre-quência de recombinação e a eficiência de seleção dos marcadores para cada população em cada ambiente. Para escurecimento lento dos grãos as estimativas de herdabilidade, variân-cia genética e ganho esperado com a seleção foram elevadas, indicando boa possibilidade de sucesso com a seleção. Para produtividade, arquitetura de plantas e tamanho comercial dos grãos, as estimativas de herdabilidade e variância genética foram elevadas, no entanto, não evidenciou altos ganhos com a seleção simultânea. As quatro populações possibilitaram a obtenção de linhagens com escurecimento lento dos grãos, sendo BRSMG Madrepé-rola x BRS Estilo e BRSMG Madrepérola x BRS Cometa as que forneceram maior número de linhagens que associaram o escurecimento lento com arquitetura ereta, alta produtivida-de e tamanho comercial de grãos. Não foi identificada correlação genética importante entre o escurecimento e tempo de cocção dos grãos, portanto, grãos claros não são indicativo de baixo tempo de cocção. Os métodos de indução ao escurecimento, prolongado e acelerado, permitem discriminar as linhagens que possuem escurecimento lento e normal e fornecem informações semelhantes. As estimativas de frequência de recombinação para o marcador Pvsd- 1158 foram sempre baixas, indicando que o marcador é intimamente ligado ao gene que controla escurecimento lento, sendo estável nos diferentes ambientes e populações. Já o marcador PVM02TC116 não se mostrou polimórfico em três das quatro populações, para a população polimórfica, apresentou elevada frequência de recombinação, sendo, pois, inadequado para utilização da seleção assistida para escurecimento dos grãos.

Objetivou-se com o presente estudo foram caracterizar e definir ambientes homogêneos de produção de bovinos de corte compostos no Brasil com relação às variáveis climáticas e geográficas, utilizando técnicas exploratórias multivariadas. Verificar a presença de interação genótipo-ambiente (GxE) nas características peso ao nascimento (PN), peso a desmama (PD), ganho de peso da desmama ao sobreano (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUS). Pela análise de agrupamento não-hierárquico foram agrupadas as regiões similares com relação às variáveis ambientais. Foram formados seis grupos de fazendas. A inclusão do efeito de interação touro-grupo foi avaliada em análises uni-característica. Comparou-se um modelo com o efeito de interação touro-grupo com outro sem esse efeito. Incluir o efeito de interação touro-GEO no modelo de avaliação genética do PN, PD e PE não resultou melhor ajuste aos dados, no entanto não deve ser descartada a hipótese de se considerar outros tipos de efeitos de GxE. Foram estimados parâmetros genéticos por meio de análises multi-característica, considerando-se a mesma característica como diferente em cada grupo de fazendas. Foi verificada heterogeneidade de variância para todas as características. Os coeficientes de herdabilidade nos grupos de fazendas para PN, PD, GP, PE e MUS variaram de 0,15 a 0,25; 0,16 a 0,25; 0,10 a 0,20; 0,17 a 0,31 e 0,17 a 0,24, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,19 a 0,90 para PN, -0,02 a 0,92 para PD, 0,31 a 0,93 para GP, 0,64 a 0,89 para PE e de 0,18 a 0,80 para MUS nos grupos fazendas. As diferentes estimativas de herdabilidade obtidas entre grupos de fazendas implicam resposta à seleção diferenciada conforme o ambiente em que os animais são criados e selecionados. Pelas correlações genéticas entre as características nas diversas regiões, constatou-se GxE, indicando que os melhores reprodutores para uma determinada região não são sempre os mesmos para as demais. Um modelo hierárquico de norma de reação sob abordagem Bayesiana também foi utilizado para estimação dos componentes de variância, parâmetros genéticos e verificação da existência de GxE. Os gradientes ambientais baseados nas soluções para o efeito de grupo de contemporâneos para PN, PD, GP e PE foram -6,45 a +4,75 kg, -65 a +65 kg, -72 a +112 kg e -6.5 a +5.5 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade foram crescentes no gradiente ambiental, PN (0,04 a 0,55), PD (0,39 a 0,47), GP (0,01 a 0,43) e PE (0,21 a 0,23). A correlação entre o nível e a inclinação da norma de reação para PN e GP foi de alta magnitude, indicando que os animais de maior valor genético médio foram os que apresentaram maior resposta à melhoria das condições ambientais, caracterizando o efeito de escala da GxE. Para PD e PE, a correlação entre intercepto e inclinação foi baixa implicando reclassificação dos animais em ambientes diferentes. O modelo hierárquico de normas de reação foi útil para descrever alterações nos componentes de variância decorrentes do ambiente e para descrever a presença de GxE nas características estudadas de bovinos compostos. Existe variação genética com respeito à sensibilidade dos animais, o que possibilita a seleção de genótipos mais plásticos ou mais robustos. / The objectives of this study were to characterize and define homogenous production environments of composite beef cattle in Brazil in terms of climatic and geographic variables using multivariate exploratory techniques; to evaluate the presence of genotype by environment interaction (GxE) for birth weight (BW), weaning weight (WW), postweaning gain (PWG), scrotal circumference (SC) and muscling. Nonhierarchical cluster analysis was used to group farms located in regions with similar environmental variables into clusters. Six clusters of farms were formed. The effect of sire-cluster interaction was tested by single-trait analysis. The inclusion of sire-cluster interaction in the genetic evaluation model may not result in better fit to the data for BW, WW and SC. Genetic parameters were estimated by multiple-trait analysis considering the same trait to be different in each cluster. The heritability coefficient in the clusters for BW, WW, PWG, SC and muscling ranged from 0.15 to 0.25; 0.16 to 0.25; 0.10 to 0.20; 0.17 to 0.31 and 0.17 to 0.24, respectively. The genetic correlations ranged from 0.19 to 0.90 for BW, -0.02 to 0.92 for WW, 0.31 to 0.93 for PWG, 0.64 a 0.89 for SC and 0.18 to 0.80 for muscling in the clusters of farms. The different heritability estimates between groups of farms indicates that the response to selection varies with the environment in which animals are selected. The low genetic correlations between traits in the different regions demonstrated the presence of GxE, indicating that the best sires in a certain region are not the same for the other regions. A reaction norm hierarchical model using Bayesian approach was also used for estimation of variance components, genetic parameters and to verify the existence of GxE. Environmental gradients based in solutions for the effect of contemporary groups for BW, WW, PWG and SC were -6.45 to +4.75 kg, -65 kg to +65, -72 to +112 kg and -6.5 to +5.5 cm, respectively. Heritability estimates were increasing in the environmental gradient, BW (0.04 to 0.55), WW (0.39 to 0.47), PWG (0.01 to 0.43) and SC (0.21 to 0.23). The correlation between the level and slope of reaction norm for BW and PWG was of high magnitude, indicating that animals of higher average breeding value were the ones which presented a best response to environmental improvement, characterizing a scale effect on GxE. For WW and SC, the correlation between intercept and slope was low implying reranking of animals in different environments. The reaction norm hierarchical model has been useful to describe changes in the variance components due to the environment and to describe the presence of GxE traits in composite beef cattle. There is genetic variation with respect to the sensitivity of the animals, which enables the selection of genotypes most plastics or more robust.

E comum encontrar nos ensaios experimentais a analise de dois fatores, cada um com diferente numero de níveis, eles proporcionam uma tabela de dados de dupla entrada. Geralmente a analise destes dados e feita através da analise de variância - ANOVA, cumprindo algumas pressuposições básicas do modelo, mas ha outros estudos nos quais e de grande importância a interação, como e o caso dos estudos de melhoramento genético, em que o objetivo e selecionar genótipos com ótimos desempenhos em diferentes ambientes. A pouca eficiência na analise da interação dos genótipos com os ambientes (GE) da ANOVA pode representar um problema aos melhoristas, que devem tirar proveito dessa interação para os seus estudos. Os modelos aditivos com interação multiplicativa - AMMI, traz vantagens na seleção de genótipos quando comparados com métodos convencionais, pois proporcionam uma melhor analise da interação (GE), alem de permitir combinar componentes aditivos e multiplicativos em um mesmo modelo; estes modelos tem demonstrado ser eficientes na analise quando se tem apenas uma variável resposta, mas quando há mais de uma, ainda n~ao existe um procedimento geral para realizar a analise. O presente trabalho propõe uma metodologia de analise quando se têm modelos AMMI bivariados, realizando analises individuais das variáveis respostas seguidas de uma analise de procrustes, que permite fazer comparações dos resultados obtidos nas analises individuais e finalmente uma confirmação destes resultados através da analise multivariada de variância - MANOVA. Os resultados obtidos permitem concluir que a analises AMMI e procrustes proporcionam uma boa alternativa de analise para os modelos AMMI bivariados. / Is frequently nd in the studies the two way factor analysis, each factor with dierent number of levels, they conform a two way table of data, generally the analysis of the data is made with the analysis of variance - ANOVA, satisfying some assumptions, but there are some studies in which is very important the interaction, like the case of the improvement studies, where the objetive is select genotypes with optimum performance in dierents environments. The poor eciency in the genotypes and environment interaction (GE) analysis of the ANOVA can represents a problem for the researchers, that need to take advantage of the interaction. The additive main eects and multiplicative interactions model - AMMI, give advantages in the selection of genotypes when is compare with traditional methods, because give a better interaction (GE) analysis, also permit combine additive and multiplicative components in the same model, these models have demonstrated be ecient in the analysis with just one response variable but when there is more than one there is not a clear procedure to do the analysis. This work presents a analysis methodology for the bivariate AMMI models, doing individuals analysis in the response variables follow by the procrustes, which permit compare the results of the individuals analysis, and nally a conrmation of theses results with the multivariate analysis of variance - MANOVA. From the results can be concluded that the AMMI and the procrustes analysis give a good alternative for the bivariate AMMI models analysis.

Os experimentos multiambientes são um tipo especial dos experimentos bifatoriais, muito usados em melhoramento genético de plantas, nos quais algumas cultivares são avaliadas em diferentes locais. Geralmente nesses estudos se encontra uma resposta diferencial das cultivares em cada local que é chamada de interação genótipo x ambiente ou G x E, que é bem explicada por modelos de efeitos aditivos e interação multiplicativa (AMMI). Frequentemente os experimentos G x E podem ser desbalanceados e um ou vários genótipos não serem testados em alguns locais. Às vezes para o pesquisador recomendar os ambientes pode ser de interesse obter estimativas daquelas combinações genótipo ambiente que não foram testadas e tais estimativas podem ser calculadas explorando a informação inerente a aquelas combinações que foram atualmente obtidas. Além do interesse do pesquisador por essas estimativas, os da- dos ausentes podem causar alguma modificação na estimação tradicional dos parâmetros nos modelos AMMI, pois para estimar os parâmetros é necessário um processo sequencial fazendo uma análise de variância com uma posterior decomposição por valor singular da matriz de residuais, a qual não pode ser calculada se existir uma matriz de interação com dados faltantes. Para resolver esses problemas Bergamo (2007) e Bergamo et al. (2008) propuseram uma nova técnica através do uso de imputação múltipla livre de distribuição (IMLD) e é por essa razão que se decidiu avaliar o recente desenvolvimento comparando-o com algumas metodologias de imputação que têm sido usadas com sucesso nos experimentos G x E com dados ausentes como os mínimos quadrados alternados ALS(0), ALS(1) (CALINSKI et al., 1992) e estimativas robustas r-AMMI1 e r-AMMI2 (DENIS; BARIL, 1992). Assim, foi de- senvolvido um estudo de simulação baseado em uma matriz de dados reais genótipos (15) ambientes (27) do ensaio estadual de algodoeiro herbáceo 2000/01 (FARIAS, 2005), fazendo retiradas aleatórias de 10%, 20% e 30%, imputando os dados e comparando os métodos através da raiz quadrada da diferença preditiva média (RMSPD), a estatística de similari- dade de Procrustes e o coe…ciente de correlação não paramétrico de Spearman. Também foi feita uma análise sobre a escolha de componentes multiplicativos de um modelo AMMI quando se têm matrizes completadas (observados + imputados). Os resultados do estudo de simulação mostraram que segundo a distribuição da RMSPD padronizada, o método r- AMMI1 é o melhor, superando o IMLD. Entretanto, utilizando a estatística de Procrustes se encontrou que completando matrizes com ALS(0) se obtém a maior similaridade com relação à matriz de dados originais, também foi mostrado que os cinco métodos considerados têm uma alta correlação entre as imputações e os correspondentes dados reais. Finalmente, recomenda-se utilizar a imputação de dados para a estimação dos parâmetros de um modelo AMMI sob ocorrência de dados ausentes, mas para determinar o número de componentes multiplicativos é preferível tomar a decisão somente sobre a informação observada. / The multienvironment trials are a special type of the two-factor experiments, widely used in genetic improvement of plants, where some cultivars are assessed in diferent locations. Generally, in these studies there is a di¤erential response of cultivars in each location that is called genotype environment interaction, or G x E, which is well explained by the additive main e¤ects and multiplicative interaction models (AMMI). Often the experiments GE may be unbalanced and one or several genotypes were not tested in some locations. Sometimes for the environments recommendations, the researcher may be interested in obtain estimates of those combinations G x E that were not tested and such estimates can be calcu- lated using the information of those combinations that were actually obtained. Additionally to the interest of the researchers in these estimates, the missing data may cause some pro- blems in the classical estimation of parameters in the AMMI models, because the parameter estimation need of a sequential process doing an analysis of variance followed by a singular value decomposition, which can not be calculated if there is a matrix of interaction with missing data. To solve these problems Bergamo (2007) and Bergamo et al. (2008) proposed a new technique using the distribution free multiple imputation (IMLD), and for this reason was decided to evaluate the recent development through the comparison with some methods of imputation that have been used successfully in experiments GE with missing data like the AMMI estimates based on alternating least squares ALS(0), ALS(1) (CALINSKI et al. 1992) and AMMI estimates with robust sub-model r-AMMI1 and r-AMMI2 (DENIS; BARIL, 1992). Thus, was developed a simulation study based on a matrix of true data genotypes (15) environments (27) of the upland cotton variety trials (ensaio estadual de algodoeiro her- báceo) 2000/01 (FARIAS, 2005), doing missed random (10%, 20%, 30%), imputing the data and comparing the methods through the root mean square predictive di¤erence (RMSPD) of the true value, the Procrustes statistic and the Spearman´s ranks correlation coe¢ cient. Also was made an analysis on the choice of the multiplicative components of an AMMI model after imputation on the complete data sets (observed + imputed). The results of the simulation study has shown that according to the distribution of RMSPD standardized, the r-AMMI1 method is better than the IMLD. However, using the Procrustes statistic was found that imputing data matrix with ALS(0), is obtained the greatest similarity related to the true data matrix. The …ve methods considered show high correlation between the true and the imputed missing values. Finally, is recommended using the imputation data for the estimation of the parameters of an AMMI model under the presence of missing data, but for choosing the number of multiplicative terms is preferable take the decision only on the observed information.

O grupo de percevejos que mais frequentemente causa perdas econômicas à soja no Brasil é composto pelas espécies: Nezara viridula, Piezodorus guildinii e Euchistus heros. Assim, os objetivos desta pesquisa foram avaliar parâmetros genéticos e correlações entre as diferentes características de desenvolvimento e produção, mapear QTL associados à resistência da soja aos percevejos e determinar respostas de expressão gênica associadas à alimentação do inseto. Uma população F2:3 foi desenvolvida através do cruzamento de IAC- 100 (resistente) e CD-215 (suscetível) e avaliada em campo experimental. As características agronômicas avaliadas foram: número de dias para o florescimento (NDF), altura da planta no florescimento (APF), número de dias para a maturidade (NDM), altura da planta na maturidade (APM), acamamento (AC), valor agronômico (VA) e produtividade de grãos (PG). As características de resistência a percevejos avaliadas foram: período de enchimento de grãos (PEG), retenção foliar (RF), índice percentual de danos nas vagens (IPDV), número de vagens por planta (NVP), número de sementes (NS), peso de sementes manchadas (PSM), peso de sementes boas (PSB), e peso de cem sementes (PCS). Para se ter um total de 96 amostras, os dois pais foram genotipados juntamente com as 12 mais resistentes e 12 mais suscetíveis plantas F2 para as características PEG, PCS e PSB, e as 11 mais resistentes e 11 mais suscetíveis para a característica RF. Para determinar o tempo de resposta de expressão gênica nas vagens à alimentação de percevejos, um estudo de microarranjo foi realizado com CD-215 avaliando a expressão relativa 5.5, 21, 24 e 41 horas após infestação em condições de casa-de-vegetação. Dentre as características de resistência, os maiores valores de herdabilidade foram observados para PCS e PEG. O caráter PCS apresentou correlação genética positiva e significativa com PSM e PEG. Neste estudo, 337 SNP, 28 SSR, 13 TRAP e 41 AFLP foram mapeados em 20 grupos de ligação. Quatorze QTL foram encontrados usando o modelo restrito de múltiplos QTL e análise de Kruskal-Wallis. A maioria dos QTL foi detectada para mais de uma característica e composta por genes com efeito menor. Na análise de microarranjo foi observada uma expressão diferencial clara para as amostras de 21, 24 e 41 horas com P. guildinii. Assim, para o experimento de campo as vagens foram infestadas com esta espécie e amostras de vagens foram coletadas 0, 8, 24 e 46 horas após infestação. Nesta etapa foi sequenciado somente o RNA mensageiro da amostra 24 horas. Na análise de RNA-seq realizada nas vagens sem nenhum tratamento, a cultivar resistente (IAC- 100) apresentou 39,4% dos genes com maior expressão e 11,68% dos genes com menor expressão do que a cultivar suscetível (CD-215). Baseado nos resultados, a seleção indireta para PCS associado com PSB pode ser realizada com sucesso para a obtenção de genótipos resistentes a percevejo. Além disso, os resultados de mapeamento de QTL foram parcialmente consistentes com estudos anteriores para característica agronômicas, sugerindo que QTL reais foram mapeados. / The group of stink bugs most frequently causing economic losses in soybean in Brazil consists of the species: Nezara viridula, Piezodorus guildinii, and Euchistus heros. Therefore, the objectives of the current research were to evaluate genetic parameters and correlations among distinct development and yield traits, map QTL associated with soybean resistance to stink bugs, and determine plant gene expression profiles associated to insect feeding. An F2:3 population was developed by crossing IAC-100 (resistant) and CD-215 (susceptible) and it was evaluated at an experimental field. The agronomic traits evaluated were number of days to flowering (NDF), plant height at flowering (PHF), number of days to maturity (NDM), plant height at maturity (PHM), lodging (L), agronomic value (AV), and grain yield (GY). The characteristics of stink bug resistance evaluated were grain filling period (GFP), leaf retention (LR), percentage index of pod damage (PIPD), number of pods per plant (NPP), number of seeds (NS), weight of spotted seeds (WSS), healthy seed weight (HSW), and weight of a hundred seeds (WHS). To have a total of 96 samples, the two parent lines were genotyped along with the 12 most resistant and 12 most susceptible F2 plants for the traits GFP, WHS, and HSW, and the 11 most resistant and 11 most susceptible for the trait LR. In order to determine the timing of gene expression response in pods under stink bug feeding, a microarray study was carried out with the cultivar CD-215, evaluating relative transcription levels at 5.5, 21, 24, and 41 hours post-infestation under greenhouse conditions. Among the characteristics of resistance, the highest values of heritability were observed for WHS and GFP. The trait WHS exhibited positive and significant genotypic correlation with WSS and GFP. In this study, 337 SNP, 28 SSR, 13 TRAP, and 41 AFLP markers were mapped to 20 linkage groups. Fourteen QTL were found using the restricted multiple QTL model and Kruskal-Wallis analyses. The majority of the QTL was detected for more than one trait and consisted of genes with minor effects. A clear differential gene expression was observed in the microarray analysis for the samples at time points 21, 24, and 41 hours infested with P. guildinii. Thus, in field trials the pods were infested with this species and samples of pods were taken at 0, 8, 24, and 46 hours. In this study, only RNA from the 24 hour sample was sequenced. From RNA-seq analysis performed on pods without treatment, the resistant cultivar (IAC-100) showed 39.4% of genes with induced expression and 11.68% of genes with repressed expression in comparison to the susceptible cultivar (CD-215). Based on the results, indirect selection for WHS associated with HSW can be successfully employed for obtaining stink bug resistant genotypes. Moreover, mapping QTL results were partially consistent with previous studies for agronomic traits, suggesting that real QTL were mapped.

O elevado valor sócioeconômico da soja é atribuído, em grande parte, à combinação muito favorável de altos teores de proteína e óleo, juntamente com níveis adequados de produtividade de grãos. Porém, existe uma alta correlação negativa entre os teores de proteína e óleo, fato que dificulta o melhoramento simultâneo destes caracteres. Além disso, também existe tendência de correlação negativa e moderada entre o teor de proteína e a produtividade de grãos. Existem evidências de que a seleção para densidade da semente pode promover ganhos indiretos simultâneos no teor de proteína e na produtividade de grãos. Assim, os principais objetivos deste trabalho foram: a) estimar parâmetros genéticos relacionados com a herança da densidade da semente; b) avaliar a eficiência da seleção para densidade da semente no melhoramento do teor de proteína e da produtividade de grãos. Para o estudo de herança foram utilizados quatro cruzamentos diferentes: USP98-06.011.10 x Abura, MSOY 8001 x Abura, USP98-06.027.03 x Biloxi e USP98-06.009.01 x PI 239.235, sendo que os parentais e as plantas F2 foram avaliados durante a safra 2006/07. Já para avaliar as respostas correlacionadas à seleção para densidade da semente foram delineados três experimentos distintos: Experimento Inicial, no qual foram avaliadas 520 progênies F7:6, durante a safra 2005/06; Experimento Densidade, em que foram avaliadas 100 progênies F8:6 selecionadas para densidade da semente; Experimento Alimentos, em que foram avaliadas 100 progênies F8:6 selecionadas para soja tipo alimento. Os dois últimos experimentos foram realizados durante a safra 2006/07, e as progênies avaliadas neles foram selecionadas dentre as 520 progênies F7:6 do Experimento Inicial. Os resultados permitiram chegar as seguintes conclusões: a) existe ampla variabilidade genética para densidade da semente; b) a herdabilidade no sentido amplo para este caráter é baixa quando estimada na geração F2, mas em geração avançada de endogamia atinge valor alto; c) a herança genética é aditiva e, assim, o caráter não manifesta heterose; d) existe correlação moderada e positiva da densidade da semente com a produtividade de grãos e o teor de proteína e, por outro lado, a correlação entre a densidade da semente e o teor de óleo é negativa; e) é possível identificar genótipos tipo alimento com médias altas de produtividade de grãos e teor de proteína; f) a seleção para aumentar a densidade da semente é eficiente no melhoramento simultâneo do teor de proteína e da produtividade de grãos, permitindo a obtenção de genótipos com alta produtividade de proteína; g) a seleção para reduzir a densidade da semente não promove aumentos significativos do teor de óleo. / The high socioeconomic importance of soybean is mainly attributed to its much favorable combination of high protein and oil contents, together with appropriate levels of seed yield. However, there is a high negative correlation between protein and oil contents, fact that difficult the simultaneous breeding of these traits. Besides, also there is tendency of negative and moderate correlation between protein content and seed yield. There are evidences that the selection for seed density can promote indirect responses in protein content and seed yield, simultaneously. The main objectives of this work were: a) to estimate genetic parameters related to inheritance of seed density; b) to evaluate the efficiency of selection for seed density in breeding protein content and seed yield. In the inheritance study, four different crosses were used: USP98-06.011.10 x Abura, M-SOY 8001 x Abura, USP98-06.027.03 x Biloxi e USP98-06.009.01 x PI 239.235. The parents and F2 plants were evaluated during the 2006/07 season. For evaluating the correlated responses to selection for seed density three different experiments were designed: the Initial Experiment, in which were evaluated 520 F7:6 progenies, during the 2005/06 season; the Seed Density Experiment, in that were evaluated 100 F8:6 progenies selected for seed density; and the Food Soybean Experiment, in that were evaluated 100 F8:6 progenies selected for food type soybean. The last two experiments were accomplished during the 2006/07 season, and the progenies were selected among the 520 F7:6 progenies of the Initial Experiment. The results allowed the following conclusions: a) there is genetic variability for seed density; b) the broad sense heritability for seed density is low in F2 and high in advanced generations; c) the genetic inheritance is additive, because this, there is no heterosis for seed density; d) there is moderate and positive correlation of seed density with seed yield and protein content, but the correlation between seed density and oil content is negative; e) is possible to identify food type genotypes with high means of seed yield and protein content; f) the selection to increase seed density is efficient in breeding protein content and seed yield simultaneously, obtaining genotypes with high protein yield; g) the selection to reduce seed density promote no significant increases of oil content.