Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2007 / Bibliografia: f. 62-76 / A metaciclogênese é provavelmente um processo regulado principalmente por alterações pós-transcricionais na expressão gênica. A proteólise mediada por ubiquitina pode ter um papel na reposição adaptativa das proteínas que levam o parasita às suas novas ca / Metacyclogenesis is a process driven mainly by post-transcriptional changes in gene expression. Ubiquitin-mediated proteolysis should play a role in the remarkable adaptative protein turnover which leads to new morphology, physiology and behavioral featur

Gliomas são os tumores cefálicos mais comuns na vida adulta, geralmente estão associados a um mau prognóstico. A forma mais agressiva, o Glioblastoma Multiforme (GBM) leva metade de seus pacientes a morte em 12 a 14 meses, e os tratamentos pouco ou nada melhoram esta expectativa. O desenvolvimento de terapias é bastante complexo, uma vez que se trata de um tumor com alta diversidade de células, devido a sua instabilidade genômica. Esta instabilidade interfere no equilíbrio “estequiométrico” da transcrição gênica, implicando alterações na proporção entre proteínas atuantes em um mesmo complexo. Analisando proteínas que participam de um mesmo processo sob uma perspectiva de redes (de interação proteica), pode-se analisar a probabilidade de fluxo de informação entre proteínas conectadas, ponderando pela correlação de expressão gênica, assumindo que altos valores de correlação (de expressão – entre duas proteínas) correspondem a uma maior a probabilidade de fluxo de informação entre elas. Utilizando-se de uma medida de entropia chamada entropia local de rede, é possível analisar a organização do fluxo de informação entre uma determinada proteína e as demais com quem esta se relaciona. O aumento nestes valores de entropia é proposto enquanto uma assinatura sistêmica de tumores, tendo sido primeiramente demonstrada em tumores gástricos, de pulmão, bexiga, pâncreas, fígado e do colo uterino. Compreender como a informação flui ao longo de redes de interação proteica em glioblastomas pode trazer novas perspectivas de tratamento deste tumor. Portanto, este trabalho visa avaliar: I se há aumento da entropia local de rede em glioblastomas quando comparados ao tecido sadio; II: quais os genes responderiam pelo maior aumento de entropia e qual o papel biológico destes genes (em que rotas ou processos biológicos estariam atuando), III: se estas rotas ou processos biológicos apresentam alterações de expressão gênica, e IV: se algum dos genes alterados em nível de transcrição possui associação com prognóstico. Foi verificado: I: que Glioblastomas apresentam um aumento significativo da entropia local de rede em comparação a condição fisiológica normal. II: que os genes de maior ganho de entropia atuam em (28) processos biológicos relacionados com a biologia tumoral; III que estes processos biológicos têm alterações transcricionais (quando comparados com a situação fisiológica normal) em alguns de seus genes; IV que dentre todos os genes diferencialmente expressos nos (28) processos biológicos indicados pelos genes de entropia alterada, os genes PAK6 e MYC tiveram correlação com sobrevida em ambas as coortes analisadas. No entanto ao estratificar por idade, verificamos que esta relação se mantinha apenas em pacientes com idade inferior a 50 anos, onde verificou-se que PLCB1, MAPK8, CDK6 e MYD88 também tinha correlação com sobrevida, enquanto a expressão de duas formas da cinase dependente de cálcio/calmodulina (CAMK2A e CAMK2B) associou-se a um prognóstico ruim. Um estudo ainda mais aprofundado destes genes, bem como de outras enzimas chave nos processos identificados são promissores no sentido do desenvolvimento de estratégias de combate a glioblastomas. / Gliomas are the most common form of brain tumor in adults, being generally associated with dismal prognosis. Glioblastoma Multiform (GBM) is the most aggressive glioma subtype and – despite the recent advances in therapy regimens and patient care – median survival remains between 12 and 14 months after diagnosis, and the treatment is basically palliative. The development of GBM therapy is a difficult task, given that GBM possesses high levels of genomic instability, which consequently promotes the formation of a variety of highly proliferative, invasive and chemoresistant cell phenotypes. Such a genomic instability in tumors potentially impact the “stoichiometric” balance between functionally related proteins, mostly due to changes in transcriptional activity with these entities. Analyzing protein relations under a protein interaction network perspective allow studying the informational flux probability between linked proteins. It means that linked proteins with positive correlation are more prone to information flux than negatively correlated links. The local network entropy is an index which measures the “disorder” of the informational flux between a protein and its neighbors. Increased local network entropy was recently shown as a systemic hallmark of diverse tumors. However, to best of our knowledge, there are no studies investigating the significance of local network entropy changes in brain tumors thus far. We believe that understanding the network informational flux, and the biological processes affect in this context, can bring new insights on the pathobiology and drugable pathways in GBM. In this study, we aimed to investigate; i) whether the local network entropy of GBM differs from normal brain tissues; ii) which genes displayed increases in entropy and what biological pathways or processes they are involved in; iii) if the identified biological processes/pathways carry differentially expressed genes and; iv) whether some of the differentially expressed belonging to highly entropic pathways are correlated with GBM patients survival. In view of such a aims, our results showed that: i) GBMs showed a significant increase in local network entropy values when compared to non-tumor brain tissues; ii) genes with high entropy played a role in 28 biological processes potentially related to GBM physiopathology; iii) Several genes with the identified pathways were found overexpressed or down-regulated in tumor versus normal brain tissues and; iv) amidst them, the expressions of PAK6, PLCB1, MAPK8, CDK6 e MYD88 predicted better prognosis, while overexpression of two Calcium/Calmodulin Kinase isoforms (CAMK2A e CAMK2B) were correlated to poor prognosis; an effect only observed in patients younger (<50 years-old) at the age of diagnosis. In summary, this study shows that local network entropy in combination with pathway enrichment analysis are a useful strategy to improve our knowledge on the biological alterations as well as genes relevant to prognosis in GBM under a systems biology perspective.

A infecção por citomegalovírus (CMV) tem efeito duradouro na distribuição dos subtipos de células T, mas pouco se sabe sobre o seu impacto na função celular. Foi realizada uma análise de expressão global gênica em células CD4+ purificadas em 38 recipientes de transplante de células tronco hematopoéticas (HSCT) (mediana de idade 48 anos; variação 20-65 anos) estudados em média cinco anos pós transplante (mediana 4.75 anos; variação 1-20 years). A população estudada incluiu 18 pacientes com GVHD crônico ativo (cGVHD) e 20 pacientes considerados tolerantes. Tolerância foi definida como ausência de sinais e sintomas de cGVHD, assim como ausência de tratamento imunossupressor (IST) por pelo menos 2 meses com seguimento de 1 ano sem tratamento imunossupressor. A expressão gênica foi medida por Illumina bead arrays. O seroestato do CMV foi definido pela sorologia pré transplante (por ELISA). Não havia evidência documentada de reativação do CMV no momento de coleta das amostras estudadas. Doze de 54 genes candidatos associados à função imune foram associados de maneira significativa com CMV+ em pacientes com cGVHD ativo (p<0.05) (PDCD-1; GZMH, IFNG, PRF1, CST7, IL18RAP, ITGAM, CTSW, ITGAL, GBP1, CDKN1B, CXCR4), sendo que somente três genes (CD14; CD86; IER3) foram associados a CMV+ entre os pacientes tolerantes. A expressão de PD-1 significativamente maior em pacientes CMV+ e com cGVHD ativo foi confirmada em uma população independente através de estudos de imunofenotipagem. Os pacientes CMV+/cGVHD ativos tiveram um perfil compatível com ativação de células T efetoras, não sendo detectado com a mesma intensidade em pacientes tolerantes e pacientes CMV-/cGVHD ativos. Tendo como objetivo a latência da infecção, o citomegalovírus tentará evadir-se das tentativas do sistema imune de depuração viral, criando modificações que vão desde mudanças nos subtipos de linfócitos até a remodelação de cromatina por uma série de enzimas e microRNA. O ambiente caracteristicamente inflamatório do cGVHD, a produção aumentada de citocinas, a terapia imunossupressora e a reconstituição imune defeituosa das células T podem aumentar o risco de reativação do CMV, mesmo indetectável, seguido por supra-regulação de genes relacionados à ativação de células T e função efetora. O gene PD-1 pode estar supra-regulado em ativação de células T e função efetora, mas tem papel essencial na prevenção da expansão e função das células T efetoras, sendo um candidato alvo para a prevenção e tratamento do cGVHD. Entender o impacto do CMV na regulação de PD-1 em pacientes com cGVHD seria instrumental na implementação de novas terapias; portanto mais estudos com populações maiores são necessários para entendermos o impacto da imunomodulação secundária à infecção prévia por CMV no funcionamento das células T durante cGVHD. / Cytomegalovirus infection (CMV) is known to have a life-long effect on the distribution of T cell subsets, but little is known about the impact on cell function. We performed a gene expression analysis in purified CD4+ T cells from 38 hematopoietic cell transplant (HCT) recipients (median age 48; range 20-65) studied on average 5 years after HCT (median 4.75; range 1-20 years). The study population included 18 patients with active chronic GVHD (cGVHD) and 20 tolerant (TOL) patients. Tolerance was defined by absence of signs, symptoms of cGVHD and immunosuppressive therapy (IST) for at least 2 months and 1 year follow-up without immunosupressive therapy . Gene expression was measured on Illumina bead arrays. CMV status was defined by pre-transplant recipient CMV serology (by ELISA). There was no recorded evidence of CMV reactivation at the time of study. Twelve of 54 candidate genes associated with immune function and inflammation were found to be associated CMV positive serostatus in cGVHD patients at a significance threshold of p<0.05 (PDCD-1; GZMH, IFNG, PRF1, CST7, IL18RAP, ITGAM, CTSW, ITGAL, GBP1, CDKN1B, CXCR4), but only three genes (CD14; CD86; IER3) were associated with CMV serostatus in TOL patients. The significant higher PD-1 expression on CD4+ cells of CMV+/active cGVHD patients was confirmed by immunophenotype testing in an independent population. CMV+/active cGVHD patients had a profile consistent with T effector cell activation that was not present in TOL and CMV serostatus negative/active cGVHD patients. Pursuing latency, cytomegalovirus will try to evade the immune system attempts of viral clearance creating modifications varying from changes in lymphocyte subsets to chromatin remodeling by several enzymes and microRNA. The chronic GVHD characteristic inflammatory environment, increased cytokine production, immunosuppressive therapy, and impaired T cell immune reconstitution, may increase the risk of CMV reactivation, even if not detectable, followed by up-regulation of genes related to T cell activation and effector function. The PD-1 gene can be up-regulated in T cell activation and effector functions, but it also has an essential role in preventing the expansion and function of effector cells, being a candidate target for the prevention or treatment of chronic GVHD. Understanding the CMV impact on the PD-1 regulation in active cGVHD would be key on the implementation of new therapies.Thus, more studies in larger populations are needed in order to understand CMV previous infection immunomodulation impact in T cell function during chronic GVHD.

O eucalipto é uma das espécies arbóreas mais plantadas no mundo atualmente, principalmente devido ao seu uso como matéria prima para as indústrias de celulose, papel e madeireira. Eucalyptus globulus e seus híbridos possuem baixos teores de lignina e despertam grande interesse da indústria, já que essa característica facilita e diminui o custo do processo de extração da celulose. Entretanto, essa espécie é recalcitrante ao enraizamento adventício, o que dificulta a propagação vegetativa de suas mudas. Com o objetivo de melhor entender os mecanismos moleculares envolvidos na recalcitrância ao enraizamento em E. globulus, o presente estudo envolveu análises de parâmetros morfológicos, anatômicos e moleculares durante a rizogênese adventícia nesta espécie. A exposição à auxina exógena reverteu o fenótipo recalcitrante em E. globulus, aumentando significativamente a porcentagem de enraizamento. O câmbio vascular foi identificado como uma região de acúmulo de auxina e local de origem das raízes adventícias. Através de análises da expressão gênica em células do câmbio, observou-se que TOPLESS e IAA12, repressores da sinalização de auxina, e ARR1, envolvido na rota de sinalização de citocininas, parecem atuar como reguladores negativos do enraizamento adventício. A alta expressão destes genes em plantas controle foi significativamente diminuída com aplicação de auxina exógena. Comparativamente, em espécie de fácil enraizamento, E. grandis, a expressão destes genes se manteve em níveis mais baixos em ambas as condições de tratamento, e a concentração de ácido indol-3-acético endógeno em plantas controle mostrou-se mais elevada. Análises do padrão proteico durante o enraizamento em plantas de E. globulus tratadas ou não com auxina exógena identificaram proteínas envolvidas em diversos processos biológicos, principalmente estresse oxidativo e metabolismo energético. Diferenças interessantes foram identificadas ao comparar as diferentes condições e fases do enraizamento. Várias proteínas foram claramente relacionadas com o respectivo fenótipo apresentado pela planta em cada situação, principalmente considerando plantas controle. Os resultados aqui apresentados representam avanços relevantes no conhecimento sobre a rizogênese adventícia em plantas lenhosas, podendo ser utilizados como ferramentas no desenho de estratégias visando melhorar o enraizamento em genótipos recalcitrantes de valor para a indústria. / Eucalyptus is one of the most planted tree species in the world today, mainly due to its use as raw material for paper, cellulose and wood industries. Eucalyptus globulus and its hybrids have low lignin contents and are of great interest to industry, as this feature facilitates and reduces costs of the cellulose extraction process. However, this species is recalcitrant to adventitious rooting, making vegetative propagation by cuttings difficult. Aiming at a better understanding of the molecular mechanisms involved in rooting recalcitrance in E. globulus, this study analyzed changes in morphological, anatomical and molecular patterns during adventitious rooting in this species. Exogenous auxin exposure reversed the recalcitrant phenotype in E. globulus, significantly increasing rooting percentage. The vascular cambium was identified as a region of auxin accumulation and also the site from where adventitious roots originated. Gene expression analysis in cambium cells indicated that TOPLESS and IAA12, auxin signaling repressors, and ARR1, involved in cytokinin signaling pathway, appear to act as negative regulators of adventitious rooting. The high expression of those genes in control plants was significantly decreased by exogenous auxin treatment. Comparatively, in an easy-to-root species, E. grandis, the expression of these genes was significantlylower in both treatment conditions, and the concentration of endogenous indole- 3-acetic acid in control plants was higher. Analysis of the protein pattern during rooting in E. globulus plants treated or not with exogenous auxin allowed the identification of proteins involved in diverse biological processes, mainly oxidative stress and energy metabolism. Interesting differences were identified when comparing different rooting conditions or phases. Several proteins were clearly associated with the respective plant phenotype in each situation, particularly considering control plants. These results represent relevant advances in the knowledge about adventitious rooting in woody plants and can be used as tools in the design of strategies aiming at improving adventitious rooting in recalcitrant genotypes of industrial value.

Esta pesquisa, inserida no âmbito da Análise do Discurso de linha francesa, tem por objetivo analisar o enunciado liberdade de expressão, considerando sua aparição em discussões divergentes sobre os meios de comunicação e sobre o acesso a esses veículos, questão que pode ser observada em muitos canais midiáticos como, por exemplo, televisão, jornais e ciberespaço. Para realizar nosso movimento de análise, fizemos, inicialmente, um percurso histórico sobre a concepção de liberdade e sua importância para os sujeitos em diferentes momentos, fato que nos ajudou a compreender as condições existentes em cada período que condicionaram a rede de significações relacionada a essa temática. Por meio do estudo, compreendemos o surgimento e a constituição de sentidos para liberdade de expressão e liberdade de imprensa, assim como a disputa pelos sentidos de tais princípios no âmbito dos veículos de comunicação. Trabalhamos também com a história dos meios de comunicação no Brasil para problematizar a questão da liberdade de expressão em nosso país. Ao situarmos a discussão em dias atuais, percebemos um deslocamento das fronteiras do meio impresso para o ciberespaço, fenômeno que resultou em implicações outras a serem analisadas. Diante de tal conjuntura, estabelecemos como foco principal de nosso trabalho compreender o funcionamento do enunciado liberdade de expressão em weblogs progressistas, tendo em vista que os sentidos produzidos nesses lugares têm estabelecido um posicionamento antagônico em relação aos discursos dos veículos de comunicação tradicionais. Esse fato faz com que os blogs sejam considerados lugares de resistência contra os sentidos dominantes em circulação. Assim, apesar de priorizar os weblogs, tornou-se necessário também analisar o ponto de vista apresentado pelos representantes da grande mídia para entender melhor a disputa travada. Nesse terreno de embates, percebemos que o enunciado liberdade de expressão desencadeia sentidos divergentes, tendo em vista sua enunciação em diferentes formações discursivas, o que significa que seu funcionamento está diretamente relacionado ao exterior contraditório, resultando na série de conflitos associados ao domínio sobre o setor de comunicação. No percurso, percebemos ainda que o direito à liberdade de expressão em veículos de comunicação de grande circulação está associado ao domínio sobre o território, ou seja, sobre o espaço ocupado e produzido pelos sujeitos. Na contemporaneidade, o território é transnacional e seu funcionamento ocorre por relações verticais que estabelecem um controle sobre a parcela política da produção mundial. Tal prática é realizada e mantida, dentre outras formas, por meio de um controle sobre a produção discursiva de informações em circulação, principalmente, em canais midiáticos. Embora essa problemática perdure, o ciberespaço possibilitou a existência de um processo de resistência a partir da criação de linhas de fuga que fizeram surgir novos sentidos. Trata-se de um movimento que altera o que está instituído sobre liberdade de expressão. Abordar esse movimento e o surgimento ou emersão de dizeres que desestabilizam a ordem pré-estabelecida remete-nos ao conceito de arquivo, que é regido por relações de força que determinam o que será produzido e posto em circulação. Pode-se dizer que o arquivo sobre liberdade de expressão sempre foi controlado pelos meios de comunicação tradicionais, responsáveis por fixar determinados sentidos, mas os weblogs progressistas têm contribuído para a modificação do arquivo existente, ao possibilitar a visibilidade de discursos outros. / Current research featuring French Discourse Analysis investigates the enunciation freedom of speech, a term used in divergent discussions on the social media and their access. The term occurs on several media channels such as television, newspapers and cyberspace. A historical analysis of the term freedom and its importance for agents at different moments is provided and reveals the situation that conditioned the network of meaning in each period related to the theme. The rise and constitution of meanings in the terms freedom of speech and freedom of the press are analyzed, coupled to the discussion of the meanings of these principles within the communication vectors. The history of social communications in Brazil was also discussed to problematize current issue on freedom of speech. A displacement of borders from the printed media to cyberspace has occurred which brought about further implications to be analyzed. Current analysis focuses on the functioning of the enunciation freedom of speech in progressive weblogs since the meaning established on these sites features an antagonistic stance with regard to the discourses of traditional communication vectors. Blogs are now considered resistance sites against predominant meanings. Although weblogs are given priority, the point of view provided by the representatives of streamline media should be discussed to understand better the theme. Within this conflicting stance, the enunciation freedom of speech triggers divergent meanings due to different discursive formations. This boils down to the fact that its function is directly related to the contradictory exterior which results in a series of conflicts associated to the dominion on the communication segment. The right to freedom of speech in streamline media is associated with dominion to territory or space occupied and produced by the subjects. is associated with dominion to territory or space occupied and produced by the subjects. Territory is currently transnational and its functioning occurs by vertical relationships that establish control on the political segment of world production. Among other forms, practice is materialized and maintained by control on the discursive production of information, especially in media channels. Even though such an issue is long-lasting, cyberspace makes possible a resistance process through the establishment of escape lines that provide new meanings. It is a movement that changes the established freedom of speech. Dealing with the movement and with the emergence of enunciations that destabilize the pre-established order provides the concept of archive ruled by power relationships that determine what will be produced and what will be circulated. The freedom of speech archive has always been controlled by tradition communication media which fix meanings. However, progressive weblogs contribute towards the modification of current archive when they make possible the visibility of other discourses.

Introdução. A enzima iodotironina desiodase tipo 2 (D2) converte o pró-hormônio T4 em sua forma ativa, T3, um passo essencial no metabolismo da tiróide. O polimorfismo Tre92Ala no gene que codifica a D2 foi associado com resistência à insulina em algumas populações. Interessantemente, um estudo recente relatou que o polimorfismo D2 Tre92Ala interage com o polimorfismo Pro12Ala, no gene que codifica o fator de transcrição PPARγ2, na modulação da síndrome metabólica em indivíduos nãodiabéticos, sendo que os portadores do genótipo D2 Ala/Ala e do alelo PPARγ2 12Ala apresentam os piores fenótipos de síndrome metabólica e pressão arterial sistólica e diastólica. Objetivos. Avaliar o efeito isolado ou combinado dos polimorfismos D2 Tre92Ala e PPARγ2 Pro12Ala na modulação da resistência à insulina em pacientes com diabetes mellitus tipo 2 (DM2). Material e Métodos. Os polimorfismos D2 Tre92Ala e PPARγ2 Pro12Ala foram genotipados em 711 pacientes com DM2 brancos, utilizando-se a técnica de discriminação alélica por PCR em tempo real. Todos os pacientes incluídos no estudo foram submetidos a um exame físico completo e a exames laboratoriais padrões. A resistência à insulina foi avaliada através do cálculo do índice HOMA (Homeostasis Model Assessment) em um subgrupo de 215 pacientes sem uso de insulina e com creatinina sérica < 1,5mg/dL. Resultados. As frequências dos alelos D2 92Ala e PPARγ2 12Ala foram 0,32 e 0,076, respectivamente, e suas frequências genotípicas estavam em equilíbrio de Hardy- Weinberg (p > 0,05). Pacientes com o genótipo D2 Ala/Ala apresentaram níveis mais altos de insulina plasmática no jejum e índice HOMA quando comparados com pacientes portadores dos genótipos Tre/Ala ou Tre/Tre (p = 0,015 e p = 0,001; respectivamente). Além disso, um efeito sinérgico significativo foi observado entre os polimorfismos D2 Tre92Ala e PPARγ2 Pro12Ala na modulação do índice HOMA: portadores do genótipo D2 Ala/Ala e do alelo PPARγ2 12Ala apresentaram valores mais elevados de HOMA (mediana 8,5 [valor máximo 28,2 - valor mínimo 1,3]) do que os pacientes portadores das outras combinações genotípicas destes polimorfismos (4,0 [17,6-0,3] no grupo de pacientes com os genótipos D2 Tre/Tre - PPARγ2 Pro/Pro, 5,8 [35,2-0,9] no grupo D2 Ala/Ala - PPARγ2 Pro/Pro e 3,5 [17,2-0,5] no grupo D2 Tre/Tre- PPARγ2 12Ala), após ajuste para sexo, idade e índice de massa corporal (p da interação = 0,010). Conclusões. Pacientes com DM2 portadores dos genótipos D2 Ala/Ala e PPARγ2 12Ala apresentam níveis mais severos de resistência à insulina quando comparados aos pacientes com outras combinações genotípicas dos polimorfismos D2 Tre92Ala e PPARγ2 Pro12Ala. Isso sugere que esses dois polimorfismos interagem na modulação da resistência à insulina em indivíduos brancos, o que pode constituir um alvo terapêutico potencial.

Acinetobacter baumannii é um patógeno oportunista, geralmente resistente a muitos antimicrobianos, que causa surtos de infecções hospitalares. Assim, a sua habilidade de formar biofilme pode explicar a capacidade de sobreviver no ambiente hospitalar e em utensílios médicos. O objetivo desse estudo foi avaliar a capacidade de duas cepas clínicas de A. baumannii obtido de hospitais de Porto Alegre, Brasil (abC e abH) e uma cepa controle ATCC 19606 (abA) formar biofilme e realizar a análise transcricional dos genes possivelmente envolvidos na produção e manutenção do biofilme: bap, abaI, ompA, bfmRS, csuAB, pgaA, pilZ, wspR, eal, eagg, IscRSU e csdA. A capacidade de formação de biofilme foi avaliada pelo método cristal violeta em superfície plástica a 25°C e 37°C nos meios LB, LB + 1% glicose, urina pura e LB + 10% sangue de carneiro. A análise transcricional foi feita por real time PCR. A cepas AbH, AbC e AbA foram fortes formadoras de biofileme em LB e LB+glicose à 25 e 37°C. Em LB+sangue, as cepas AbH e AbA foram fortes formadoras e AbC foi fraca formadora de biofilme. Em urina, a cepa AbH foi moderadamente formadora, AbC e AbA foram fracas formadoras de biofilme. Os genes wspR, pgaA, ompA, bap, abaI de AbA, csdA de AbH e o operon IscRSU foram superexpressos em biofilme; os genes eagg de AbH, pilZ e csuAB foram inibidos e os genes bfmRS, eal, eagg de AbA, csdA de AbA e abaI de AbH não possuíram uma variação significativa na expressão durante o biofilme. Portantanto, a regulação positiva dos genes wspR, pgaA, ompA, bap, csdA e do operon IscRSU é um indício de sua importância na formação e manutenção do biofilme por esse patógeno. / Acinetobacter baumannii is an opportunistic pathogen which causes a wide range of nosocomial infections, being usually multirresistent to drugs. Their ability to form biofilm can explain the feature of surviving inside hospital environment and on medical devices. The aim of the present study was to evaluate the ability of two clinically isolated MDR A. baumannii strain, obtained from a general hospital of Porto Alegre, RS, Brazil (AbH and AbC), and the reference ATCC 19606 strain (AbA), to form biofilm and to analyze the relative expression of genes putatively involved in biofilm formation: bap, abaI, ompA, bfmRS, csuAB, pgaA, pilZ, wspR, eal, eagg, IscRSU e csdA. The biofilm formation capability was evaluated by the crystal-violet staining method on plastic surfaces at 25°C and 37°C using the broth LB, LB + 1% glucose, pure urine and LB + 10% sheep blood. The trancritional profiling of the genes was analyzed through real time PCR methodologies. The strains AbH, AbC e AbA were strong biofilm producers in LB e LB+glucose at 25 and 37°C. In the broth LB+blood, the strains AbH and AbA were strong biofilm producers and AbC was week biofilm producer. In urine, the strain AbH was moderated producer, AbC and AbA were week biofilm producers. The genes wspR, pgaA, ompA, bap, abaI from AbA, csdA from AbH and the operon IscRSU were overexpressed in biofilm; the genes eagg de AbH, pilZ e csuAB were suppressed and the genes bfmRS, eal, eagg from AbA, csdA from AbA e abaI from AbH did not vary their expression significantly during the biofilm condition. In conclusion, the factors wspR, pgaA, ompA, bap, csdA and of the operon IscRSU, that were positively regulated, appear to have an important role during the process of biofilm formation by A. baumannii.

Resumo não disponível.

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:45:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013 / Associação Fundo de Incentivo à Psicofarmacologia (AFIP) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A privacao de sono (PS) e um problema cada vez mais comum na sociedade moderna e esta diretamente relacionada a diversas alteracoes metabolicas, hormonais, neuroquimicas e comportamentais. Tem sido proposto que a falta de sono promove efeitos significativos nos padroes de expressao genica em cerebro em modelos animais. Entretanto, dados de expressao genica em humanos sao ainda incipientes, e o mesmo e valido para estudos em tecidos perifericos de roedores. Nesse sentido, a robusta tecnologia de microarray abriu uma nova janela para os estudos dos processos moleculares envolvidos no ciclo vigilia-sono. Os objetivos principais sao observacao da expressao genica global em tecidos perifericos de humanos (sangue) e camundongos (pulmao e coracao). Parte 1. Humanos: Avaliamos a expressao genica de 9 voluntarios submetidos a privacao de sono total, os quais permaneceram em alerta e ativos durante 60 horas consecutivas. As coletas de sangue para os experimentos de microarray foram realizadas na manha seguinte a noite de sono basal, na manha seguinte apos 48 horas de privacao de sono e, finalmente, na manha seguinte apos uma noite de sono rebote. Os resultados demonstraram a diminuicao da expressao de genes ligados ao sistema imune na PS, como por exemplo, os receptores de Natural killers, as granzimas A e B e os receptores de celulas T, os quais tem um importante papel na defesa do organismo. Um resultado interessante e que corrobora a literatura foi a alteracao da expressao de genes ligados ao reticulo endoplasmatico (RE), como genes codificadores de proteinas chaperonas. Parte 2. Camundongos: Os experimentos foram realizados em camundongos machos (C57BL/6J) com 10 semanas de idade pelo metodo de gentle-handling. Os animais foram eutanasiados por deslocamento cervical e decaptacao seguindo 3, 6, 9, e 12 horas de privacao de sono total (N = 8 ou 9 em cada ponto de tempo). Em paralelo, um grupo de animais em que nao foram realizadas perturbacoes (grupo de animais de sono espontaneo, tambem foi eutanasiado nos mesmos pontos de tempo que os animais privados de sono (N=8 para cada tempo respectivamente). Um grupo de controle adicional (tempo basal 0) (N=10), que estava acordado espontaneamente, foi eutanasiado no tempo zero, isto e, no momento em que as luzes foram acesas, as 7 horas da manha. Os resultados em pulmao e coracao demonstraram que houve alteracao da expressao em genes de chaperonas e do RE endoplasmatico, estresse oxidativo e enxofre no pulmao, e degradacao de proteinas no coracao. Os dados dao suporte a hipotese de que a falta de sono pode levar a alteracoes moleculares que resultam em perturbacoes da imunidade celular, assim como na inducao de inflamacao e equilibrio homeostatico. Assim, o intuito deste estudo foi de contribuir para a identificacao de possiveis marcadores biologicos representativos das alteracoes moleculares ocorridas em tecidos perifericos como: sangue, coracao e pulmao, no sono e na privacao de sono em humanos e camundongos, a partir da caracterizacao dos eventos moleculares envolvidos nos processos homeostaticos do sono nao restritos ao Sistema Nervoso Central / FAPESP: 98/14303-3 / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Objetivo: Desenvolver um software para identificar a expressao facial de dor do recem-nascido, por meio do reconhecimento de imagens, a ser utilizado em tempo real, nas unidades de terapia intensiva, para auxiliar profissionais de Saúde a monitorar sua presenca e a necessidade de intervencao. Metodo: Desenvolvimento de sistema para reconhecimento dos movimentos faciais de dor, de acordo com escala validada (Sistema de Codificacao Facial Neonatal, NFCS), a saber: testa proeminente com aproximacao das sobrancelhas, olhos espremidos, fenda nasolabial aprofundada e labios esticados de forma horizontal ou vertical. O sistema foi criado em um ambiente Delphi para plataforma Windows orientado a objetos. Para a calibragem inicial dos pontos nodais, foram filmados cinco neonatos durante o repouso, procedimento doloroso e recuperacao, sendo as imagens da face analisadas segundo a NFCS e o sistema desenvolvido para detectar as distancias dos pontos nodais principais. Para validar o sistema, as imagens de 30 recem-nascidos submetidos a procedimento doloroso foram adquiridas por filmagem com 3 cameras digitais, sendo comparadas com as imagens calibradas utilizadas na criacao do software. Dos 30 neonatos analisados pelo sistema, foram selecionadas 12 imagens faciais de cada (duas a tres em repouso, uma durante o procedimento doloroso e oito a nove durante a recuperacao) para analise por seis profissionais de Saúde experientes no reconhecimento da dor neonatal. Verificou-se a concordancia entre o sistema e os seis avaliadores para as 360 imagens por meio do kappa generalizado. Analisou-se a concordancia do sistema e de cada um dos avaliadores com a situacao real de repouso ou de procedimento dolorosos. Avaliou-se ainda a heterogeneidade entre os resultados do sistema e da media dos 6 avaliadores para as situacoes de repouso, procedimento dolorosos e recuperacao por meio do Grafico de Bland-Altman. Resultado: O sistema foi desenvolvido com 35 telas de interacao com o usuario, permitindo a calibracao e analise de imagens, assim como a monitoracao do recem-nascido durante o tempo determinado pelo usuario. Foram capturadas 8.457 imagens dos 30 recem-nascidos, sendo 5.644 identificadas pelo sistema como face (188/recem-nascido). A analise da concordancia entre os seis avaliadores e o sistema para as 360 imagens analisadas mostrou kappa generalizado de 0,975 (p<0,001). O sistema mostrou uma sensibilidade de 85% e especificidade de 100% para detectar a face neutra no repouso, enquanto a sensibilidade e a especificidade foram de 100% para detectar dor durante o procedimento doloroso. A pontuacao do numero de movimentos faciais percebidos pelo software e pela media dos seis avaliadores foi homogenea para a situacao de repouso, procedimento dolorosos e recuperacao, segundo o grafico de Bland-Altman. Conclusao: O software desenvolvido mostrou excelente sensibilidade e especificidade para detectar dor durante os procedimentos dolorosos no recem-nascido, sendo homogenea a deteccao do numero de movimentos faciais entre avaliadores e sistema. O sistema desenvolvido pode ajudar os neonatologistas a monitorar a dor de recem-nascidos criticamente doentes. Palavras-Chave: Dor, Recem-Nascido, Avaliacao da dor, Escalas de dor, Expressao facial de dor, Reconhecimento facial. / FAPESP: 2012/50157-0 / BV UNIFESP: Teses e dissertações