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Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli / A genomic approach for the understanding of the fastidious behavior of Leifsonia xyli subsp. xyli

Rosa, Daniel Dias 02 October 2006 (has links)
A cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) é uma das mais importantes culturas agrícolas. Cultivada em mais de 127 países, a cultura se apresenta como um dos alicerces para a socioeconomia e cultura de muitas regiões do Brasil e do mundo. Sua produtividade depende de diversos fatores, sendo esses atendidos pela intensa hibridação interespecífica visando principalmente à obtenção de cultivares mais produtivas, precoces e resistentes a diversos tipos de estresses. Entre os estresses, os causados por microorganismos são os mais relevantes e, dentre estes, destaca-se o agente causal da doença raquitismo da soqueira da cana-de-açúcar, a bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx). O estudo mais aprofundado sobre esta relação patógenohospedeiro é difícil, visto que Lxx é uma bactéria fastidiosa de difícil cultivo. O sequenciamento completo de seu genoma abriu a oportunidade de se entender às causas fisiológicas da dificuldade do seu cultivo. Assim, os objetivos deste trabalho foram otimizar um meio de cultura para Lxx com base em análise de vias metabólicas importantes e estudar a expressão diferencial de seus genes quando esta é cultivada na presença e ausência de metionina. Análises bioinformáticas do genoma de Lxx indicaram que esta está apta a utilizar diversas fontes de carbono, de vitaminas, de ferro e aminoácidos. De fato, dentre as fontes de carbono testadas verificou-se o crescimento de Lxx utilizando manose, frutose e galactose, embora em menor eficiência do que glicose. Observou-se também a utilização das vitaminas cobalamina, tiamina, biotina e complexo vitamínico de Nitsch, sendo que o acréscimo destes elementos resultou numa maior taxa de crescimento de Lxx. Verificou-se também que Lxx está apta a utilizar citrato, sulfato e cloreto de ferro como fontes deste metal, mas em menor eficiência que quando comparada a hemina bovina. Com estes resultados, verificamos que a adição do aminoácido metionina (1 g/L) e das vitaminas D-biotina (0,01 g/L) e cloreto de tiamina (0,01 g/L) obtém-se um desenvolvimento mais acelerado, em média 30%. Na análise da expressão gênica na presença da metionina, verificou-se uma regulação diferencial de 114 genes, sendo que destes 95 foram regulados positivamente e 19 negativamente. Os resultados indicam que Lxx necessita de metionina e que ela utiliza esse aminoácido como uma possível fonte de nitrogênio. Indicaram também que maior crescimento na presença de metionina está relacionado a uma regulação gênica positiva de genes do metabolismo central. / Sugarcane (Saccharum officinarum L.) is one of the most important tropical crops. Cultivated in more than 127 countries, it is of importance both for the social economy and culture of many regions of Brazil and of the world. Its productivity depends on diverse factors that are dealt with the intense interspecific hybridization aiming for more productive cultivars, that are resistant to diverse types of stress. Of these, stresses caused by microorganisms are the most relevant and among these the bacterium Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx), the causal agent of the ratoon stunting disease is one of the most important. The study of this patosystem, however, is very difficult, since Lxx is a fastidious bacterium. The availability of the complete genome sequence of Lxx made possible the understanding of the physiological causes of its fastidious behavior. Thus, the objectives of this work were to optimize the culture medium of Lxx by analyzing important pathways and to study gene expression when Lxx is cultivated in the presence and absence of methionine. Bioinformatic analyzes of the Lxx genome indicated that it is capable to use diverse sources of carbon, vitamins, metals, iron and amino acids. In fact Lxx was able to grow in the presence of mannose, fructose and galactose as the main sugar components of the medium, but not so efficiently as in glucose. It was also observed that the addition of the vitamins cobalamin, thiamin, biotin and the Nitsch´s vitamin complex resulted in a better Lxx growth. It was also verified that Lxx is capable to use iron citrate, iron sulphate and iron chloride as the main sources of iron, but less efficiently than when compared to hemin bovine chloride. With these results, it was verified that the addition of methionine (1 g/L) and of the vitamins D-biotin (0.01 g/L) and thiamine chloride (0.01 g/L) resulted in a faster growth of Lxx in vitro by as much as 30% on average compared to the standard medium. Gene expression analyses showed that the addition of methionine to the medium resulted in an alteration of expression levels of 114 genes, 95 of which were up regulated and 19 otherwise. This result indicated that Lxx needs an outside source of methionine and that it uses this amino acid a source of nitrogen. Also, it indicated that the improved growth in the presence of methionine is highly correlated with up regulation of genes of the central metabolism pathways.
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Uso de simbiótico para descolonização de pacientes hospitalizados portadores de bacilos Gram-negativos multidrogarresistentes / Use of a symbiotic product to decolonize patients harboring multidrug-resistant Gram-negative bacilli

Mário Augusto Heluany Filho 10 June 2016 (has links)
Nas últimas décadas, a incidência de infecções hospitalares causadas por bactérias Gramnegativas multidrogarresistentes (MDR) vem crescendo de maneira vertiginosa em todo o mundo, de modo que a Organização Mundial de Saúde (OMS) recentemente reconheceu essas infecções como uma preocupação mundial devido ao seu impacto negativo sobre as taxas de mortalidade intra-hospitalar e dos custos da assistência à saúde, afetando tanto os países desenvolvidos quanto os em desenvolvimento. Atualmente considera-se que a higienização das mãos, o uso racional de antimicrobianos e o isolamento de contato são as principais medidas disponíveis para contenção desse avanço. Porém, elas são apenas parcialmente efetivas e de implementação trabalhosa e onerosa. Assim, considera-se necessário o desenvolvimento de formas mais simples e eficientes paralidar com esse problema. No presente estudo, nos propusemos a avaliar o impacto da administração de um produto simbiótico a pacientes colonizados e/ou infectados por bactérias Gram-negativas MDR sobre as taxas de descolonização desses patógenos no trato digestivo. Trata-se de um ensaio clínico randomizado, duplamente cego, controlado com placebo, envolvendo 101 pacientes hospitalizados com colonização prévia por bactérias Gram-negativas MDR, demonstrada por meio de cultura seletiva de swab retal, cuja intervenção consistiu na administração oral ou enteral diária de 1010 unidades de Lactobacillus bulgaricus e 1010 unidades de Lactobacillus rhamnosus associados a fruto-oligossacarídeos durante (FOS) 7 dias. O desfecho primário do estudo foi a descolonização completa do trato digestivo posterior à intervenção, que, na análise do tipo \"intenção de tratar modificada\" foi de 16,7% (8/48) no grupo experimental e 20,7% (11/53) no grupo controle (p=0,600). Na análise \"per protocol\", a descolonização completa do trato observada foi de 18,9% (7/37) no grupo experimental e 23,3% (7/30) no grupo controle (p=0,659). Em uma análise multivariada por meio de modelo de regressão logística o uso do simbiótico não influenciou significativamente o risco de descolonização completa do trato digestivo (OR= 0,80, IC 95%= 0,28-2,27, p= 0,678). A ocorrência de eventos adversos de natureza leve a moderada foi semelhante entre os grupos: 7,55% no grupo que utilizou placebo e 6,25% no grupo sob intervenção (p= 1,000). Nenhum evento adverso grave potencialmente relacionado às medicações de estudo foi observado. Nas condições estudadas, os dados obtidos pelo estudo nos levam à conclusão de que o simbiótico estudado demonstrou-se inefetivo na descolonização do trato digestivo de pacientes previamente colonizados por bactérias Gram-negativas MDR. / In recent decades the incidence of multidrug resistant (MDR) Gram-negative nosocomial infections has been dramatically raising in the whole world. The World Health Organization (WHO) recently recognized nosocomial infections due to MDR pathogens as a global concern due to its negative impact on patients, health-care workers and health-care institutions, affecting developed countries as well as developing ones. They negatively impact in-hospital mortality and health-care related costs. Hand hygiene promotion, antibiotic stewardship and contact precautions are the main available measures to control such MDR Gram-negative organisms in hospitals. However, they are only partially effective as well as difficult to be implemented and expensive. Therefore, simpler and more effective actions are thought to be helpful and urgent. In the present study, we analyzed the impact of the administration of a symbiotic product on patients harboring Gram-negative multidrug-resistant bacteria upon the subsequent rates of decolonization of these pathogens from the gastro-intestinal tract.This is a double-blinded and placebo controlled randomized clinical trial evaluating the oral/enteral daily administration of 1010 units of Lactobacillus bulgaricusplus 1010 units of Lactobacillus rhamnosus associated with fructo-oligosacharide (FOS), or placebo, for 7 days, to 101 patients previously colonized by MDR Gram-negative bacteria, identified through selective culture of rectal swab. The primary study outcome was the rate of complete decolonization of the MDR microorganism from the gastro-intestinal tract following the intervention. In the \"modified intention to treat\" analysis, decolonization rates observed were 16.7% (8/48) in the experimental group and 20.7% (11/53) in the placebo group (p=0,600). In the \"per protocol\" analysis, decolonization rates were 18.9% (7/37) in the experimental group and 23.3% (7/30) in the placebo group (p=0,659). In a logistic regression model, symbiotic use did not produce any impact on the chance of decolonization (OR=0.80, CI95%=0.28-2.27, p=0.678). Mild to moderate adverse events occured similarly in both the placebo (7.55%) and the experimental group (6.25%), (p=1,000). No severe adverse event potentially related to the medications was detected during the study period. In the present study conditions, the results obtained lead to the conclusion that the studied symbiotic proved to be ineffective to decolonize patients harboring multidrug resistant Gram-negative bacilli.
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A subordina??o no portugu?s brasileiro : da tradi??o gramatical ? vis?o ling??stica

Moreira, Edelvira A?da da Silva 29 January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:37:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 400601.pdf: 13181921 bytes, checksum: 33ca7a1be68ed3f097c69406211a9cad (MD5) Previous issue date: 2007-01-29 / Este trabalho tem como objetivo investigar a senten?a subordinativa em editoriais jornal?sticos, detendo-se, no estudo prescritivista, como um todo, difundido pelas gram?ticas tradicionais, e nas teorias funcionalistas, para explicar as manifesta??es e interfer?ncia do n?vel funcional da l?ngua na escolha das formas verbais e do modo indicativo para a institui??o da ora??o subordinada nos textos de opini?o. A amostra ? constitu?da por 23 textos de editoriais veiculados pelos principais jornais brasileiros. A partir dos dados levantados, ? poss?vel constatar as ocorr?ncias em ora??es subordinadas das formas verbais e do modo indicativo e analisar as peculiaridades encontradas por esses elementos ling??sticos na composi??o das senten?as subordinativas. Os resultados das an?lises evidenciam que o verbo se apresenta no infinitivo em diferentes estruturas sint?ticas e que o predom?nio das ora??es reduzidas de partic?pio, do modo indicativo e da ora??o adjetiva implica funcionalidade da l?ngua, estabelecida nos diferentes contextos de uso em que est? inserido o editorial jornal?stico. Assim, a subordina??o n?o segue os padr?es gramaticais tradicionais na institui??o da senten?a subordinativa e tem como princ?pio que a escolha das formas e dos modos verbais, em textos de opini?o, tem como determinante o n?vel funcional da l?ngua.
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Small clauses : infinitivo flexionado vs. Bare & To-Infinitives : a comparison in case assignment

Silva, Adriana C. Ruggeri Quinelo da 21 January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:37:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 400714.pdf: 628183 bytes, checksum: 856482c5538edc2abb20b4e9f0801518 (MD5) Previous issue date: 2008-01-21 / Apesar da Teoria do Caso ser um dos t?picos mais centrais da discuss?o te?rica dentro da GB (Government and Binding Reg?ncia e Liga??o) como disseram Raposo e Uriagereka (1990), esse projeto compreende uma proposta ainda in?dita, tal como: um estudo comparativo da Atribui??o de Caso para os sujeitos das Mini-ora??es Infinitivas em Ingl?s e no Portugu?s Brasileiro. Mais especificamente, ? uma investiga??o completa das rela??es das estruturas sint?ticas a respeito do Infinitivo Flexionado no Portugu?s Brasileiro e do Bare & To-Infinitives do Ingl?s, a fim de demonstrar e explicar a parametriza??o na atribui??o de Caso. Para tanto, o comportamento do NP-sujeito das Miniora??es de ambas as l?nguas foi analisado e contrastado. Devido a uma combina??o rara de valores na Gram?tica Universal, o Portugu?s Brasileiro (PB) ? deveras problem?tico para acomodar a marca??o de Caso. No entanto; a GB (Teoria da Reg?ncia e Liga??o), mais conhecida como Princ?pios e Par?metros, da conta de explicar esse fen?meno totalmente, dado as contribui??es complementares ? teoria de Chomsky.
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Um algoritmo ilustrativo sobre o plural no PB como contribui??o para morfologia computacional : capacidades, limita??es e perspectivas

Concei??o, Celso Augusto Nunes da 27 March 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:37:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 417835.pdf: 1944989 bytes, checksum: 6c093c4bafa0f7e15e8ae411956cca68 (MD5) Previous issue date: 2009-03-27 / Esta tese ? uma aplica??o ling??stico-computacional baseada em Redes Neurais Artificiais (RNA) com um algoritmo ilustrativo sobre o plural na Morfologia do Portugu?s Brasileiro (PB): PluralRNA. Este ? um software criado com o objetivo de fazer com que a m?quina depreenda regras de flex?o de n?mero a partir da inser??o de pares lexicais singular/plural. Essa depreens?o acontece na fase de treinamento depois de a base de dados da rede estar devidamente provida desses pares. A partir da?, digitam-se outras palavras no singular para que o programa aplique a desin?ncia depreendida pelo processamento. A seguir, analisa-se o potencial de aprendizagem do programa para constatar as suas capacidades e limita??es e sugerir perspectivas, pretendendo assim contribuir cientificamente para a Morfologia Computacional do PB. O resultado ? satisfat?rio na medida em que, por um lado, as generaliza??es das regras depreendidas s?o percebidas e cotejadas com o l?xico padr?o, tendo, na maioria dos casos, correspond?ncia com normatiza??o; por outro, alguns ciclos de treinamento refor?am a depreens?o das desin?ncias e alteram, em rar?ssimos casos, aquelas que j? eram dadas como certas pela correla??o gramatical. Portanto, os pares lexicais e a aplicabilidade do PluralRNA oferecem material suficiente para a continuidade dos estudos do processamento flexional de n?mero para a Morfologia Computacional do PB.
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A apresenta??o do expletivo there em livros did?ticos de LI : uma an?lise sob a perspectiva gerativista

Pinto, Lu?s Claudio Molina 31 March 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:38:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431731.pdf: 3538877 bytes, checksum: c4f1e1a97393da700919009eb56ad556 (MD5) Previous issue date: 2011-03-31 / O presente trabalho teve por finalidade verificar a exist?ncia de uma poss?vel intersec??o entre a exposi??o do expletivo there em livros did?ticos de LI e os postulados do programa gerativista de investiga??o, atrav?s da an?lise de quatro livros did?ticos de LI ? luz desta teoria e investigar a natureza da problem?tica da aquisi??o do expletivo por alunos falantes do PB. Para tanto, os aspectos linguisticos envolvidos na produ??o do expletivo foram estudados a fim de fornecer um suporte te?rico para a discuss?o. Verificou-se que a complexidade de elementos dispostos na teoria que envolve o uso do expletivo, tais como a no??o de que h? par?metros nas l?nguas que ir?o determinar as suas diferen?as, ou de que um princ?pio universal das l?nguas postula que n?o ocorram frases destitu?das de sujeito n?o se reflete na maneira como o expletivo ? apresentado nos livros did?ticos analisados, tampouco se pode perceber uma maneira de se promover uma intersec??o entre os postulados te?ricos e as atividades desenvolvidas nos livros. Atrav?s da an?lise realizada, n?o se encontrou evid?ncias de uma tentativa de se fornecer explica??es no sentido de dar ao aprendiz insumos que possam promover um maior esclarecimento sobre o uso do expletivo, com exce??o de um dos livros, que prop?e um questionamento ao aluno sobre o expletivo, podendo se configurar em uma tentativa inicial de promover uma consci?ncia de que a produ??o das senten?as existenciais apresenta diferen?a nas duas l?nguas enfocadas. Portanto, conclui-se que os livros did?ticos analisados n?o est?o alinhados com o modelo te?rico adotado, sendo lan?ada para uma futura pesquisa, a necessidade de se investigar um meio de, atrav?s dos postulados te?ricos do gerativismo, elaborar um instrumento did?tico que auxilie o aluno na compreens?o das diferen?as param?tricas entre as duas l?nguas.
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ECM, raising & control infinitival small clauses: case assignment in english and brazilian portuguese revisited in Chomsky's minimalist program

Silva, Adriana C. R. Quinelo da 30 March 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:38:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 439174.pdf: 133394 bytes, checksum: d72dd4f059f7c6e93fe8fac60b00e772 (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 / This dissertation claims that embedded Inflected Infinitival Small Clauses (IISCs) in Brazilian Portuguese (BP) are not well accounted for via any Movement- Approach, such as the Movement Theory of Control (MTC), as opposed to embedded infinitives in English. The main focus for the data analysis and for corroborating this thesis under Chomsky s (2008) Feature Inheritance is Control verb complements in BP and English, which in BP are taken as full φ-CP infinitives/φ-complete infinitival CPs, characterizing an unbounded Phase, while this possibility is not available in English. This difference thus adds evidence in favor of the approach to be pursued for Brazilian IISCs to be a Non-Movement one, so that the φ-features of the embedded subject can be saturated within the embedded CP-Phase. Concerning the embedded subject within this context, this dissertation then claims that in BP it is a noun (D/NP), pronoun or a pro (not a PRO), given the status of the embedded clause as a φ-complete, hence an [+ Agr] infinitival CP-Phase. / Esta Tese defende que as senten?as encaixadas do tipo infinitivas flexionadas (Inflected Infinitival Small Clauses - IISCs) em Portugu?s Brasileiro (PB) n?o s?o tratadas de forma adequada via qualquer abordagem com base em movimento, como a Teoria de Controle via Movimento (Movement Theory of Control - MTC), ao contr?rio das mesmas infinitivas encaixadas em Ingl?s. O foco principal para an?lise dos dados e para corroborar esta Tese sob a abordagem Minimalista de Chomsky (2008), conhecida como Feature Inheritance, s?o as encaixadas infinitivas como complementos de verbos de Controle em Portugu?s Brasileiro e em Ingl?s, as quais em PB s?o consideradas como ―full φ-CP infinitives/φ-complete infinitival CPs‖, ou seja, complementos do tipo CP-completos, caracterizando uma Phase/Fase intranspon?vel, ao passo que esta possibilidade n?o est? dispon?vel em Ingl?s. Tal diferen?a, portanto, contribui para evidenciar que a abordagem adequada a ser adotada para dar conta da atribui??o de Caso do sujeito das senten?as encaixadas infinitivas flexionadas em PB ? aquela que n?o envolva movimento do sujeito da senten?a encaixada para fora do CPencaixado; ou seja, para fora da CP-Phase/Fase-CP. Uma vez n?o havendo o movimento, as features-φ (φ-features) do sujeito da senten?a infinitiva encaixada s?o saturadas dentro da Fase-CP. Dado este contexto em PB, argumento que o sujeito encaixado, uma vez realizado, seja um nome (D/NP) ou um pronome a receber Caso Nominativo. E, bem como, quando n?o realizado, seja um pro (n?o PRO) Nominativo, uma vez que o status da senten?a encaixada infinitiva flexionada em PB ? φ-completo (φ-complete); mais especificamente, uma Fase-CP [+Agr].
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A constru??o que : uma avalia??o da produ??o de chineses aprendizes do portugu?s brasileiro

Aires, Elisete Poncio 13 January 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:39:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 465205.pdf: 869183 bytes, checksum: 0118a83367b1577297c17c5a2084ac24 (MD5) Previous issue date: 2015-01-13 / This work, theoretical and descriptive nature, aimed to evaluate the Brazilian Portuguese (BP) buildings that in argumentative texts written by Chinese students, native Mandarin speakers, according to the Theory of Grammar. Therefore, it presented a theoretical chapter focusing on Universal Grammar and the Principles and Parameters model, especially the verbal inflection parameter, axioms of Theory undertaken in this research. It presented phrases and their constituents, with X-bar Theory to represent the relationship established between them and the structure of sentences, the largest unit of parsing (HAEGMAN, 1998; RAPOSO, 1992); besides bring a section on the structure of PB sentences that, evaluation object of this study. Secondly, evaluated the production of the group of students, maternal Mandarin speakers, analyzing the structures produced over a year, when they were in Portuguese Program for Foreigners PUCRS. The analysis showed that the majority of subjects represented the structure expected by PB, performing proper verbal inflection. Some, however, had difficulties to perform the verbal inflection, perhaps under the influence of L1, an insulating language. We found also that, over time, the apprentices were restructuring the grammar of L2 and using the appropriate verbal inflection, going to meeting to the thesis held by Flynn (1996) that the human being has an innate faculty of language and that, regardless of age, everyone has access to Universal Grammar. / Este trabalho, de cunho te?rico-descritivo, teve por objetivo avaliar as constru??es que do portugu?s brasileiro (PB) em textos argumentativos escritos por estudantes chineses, falantes nativos de mandarim, ? luz da Teoria da Gram?tica. Para tanto, apresentou um cap?tulo te?rico enfocando a Gram?tica Universal e o modelo de Princ?pios e Par?metros, especialmente o Par?metro da Flex?o Verbal, axiomas da Teoria assumidos nesta pesquisa, com a apresenta??o dos sintagmas e seus constituintes, mediante o uso da Teoria X-barra para representar a rela??o estabelecida entre eles e a estrutura das senten?as, a maior unidade da an?lise sint?tica (HAEGMAN, 1998; RAPOSO, 1992); al?m de trazer uma se??o sobre a estrutura das senten?as que do PB, objeto de avalia??o deste estudo. Num segundo momento, avaliou a produ??o do grupo de estudantes, falantes maternos do mandarim, analisando as estruturas produzidas ao longo de um ano, per?odo em que estiveram no Programa de Portugu?s para Estrangeiros da PUCRS. A an?lise dos dados demonstrou que a maioria dos sujeitos representou a estrutura esperada pelo PB, realizando a flex?o verbal adequada. Alguns, entretanto, apresentaram dificuldades para a realiza??o da flex?o verbal, talvez por influ?ncia da L1, uma l?ngua isolante. Constatou-se, ainda, que, ao longo do tempo, os aprendizes foram reestruturando a gram?tica da L2 e utilizando a flex?o verbal adequada, indo ao encontro da tese defendida por Flynn (1996) de que o ser humano tem uma faculdade inata ? linguagem e que, independentemente da idade, todos t?m acesso ? Gram?tica Universal.
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Contribuições para a construção de taxonomias de tópicos em domínios restritos utilizando aprendizado estatístico / Contributions to topic taxonomy construction in a specific domain using statistical learning

Moura, Maria Fernanda 26 October 2009 (has links)
A mineração de textos vem de encontro à realidade atual de se compreender e utilizar grandes massas de dados textuais. Uma forma de auxiliar a compreensão dessas coleções de textos é construir taxonomias de tópicos a partir delas. As taxonomias de tópicos devem organizar esses documentos, preferencialmente em hierarquias, identificando os grupos obtidos por meio de descritores. Construir manual, automática ou semi-automaticamente taxonomias de tópicos de qualidade é uma tarefa nada trivial. Assim, o objetivo deste trabalho é construir taxonomias de tópicos em domínios de conhecimento restrito, por meio de mineração de textos, a fim de auxiliar o especialista no domínio a compreender e organizar os textos. O domínio de conhecimento é restrito para que se possa trabalhar apenas com métodos de aprendizado estatístico não supervisionado sobre representações bag of words dos textos. Essas representações independem do contexto das palavras nos textos e, conseqüentemente, nos domínios. Assim, ao se restringir o domínio espera-se diminuir erros de interpretação dos resultados. A metodologia proposta para a construção de taxonomias de tópicos é uma instanciação do processo de mineração de textos. A cada etapa do processo propôem-se soluções adaptadas às necessidades específicas de construçao de taxonomias de tópicos, dentre as quais algumas contribuições inovadoras ao estado da arte. Particularmente, este trabalho contribui em três frentes no estado da arte: seleção de atributos n-gramas em tarefas de mineração de textos, dois modelos para rotulação de agrupamento hierárquico de documentos e modelo de validação do processo de rotulação de agrupamento hierárquico de documentos. Além dessas contribuições, ocorrem outras em adaptações e metodologias de escolha de processos de seleção de atributos, forma de geração de atributos, visualização das taxonomias e redução das taxonomias obtidas. Finalmente, a metodologia desenvolvida foi aplicada a problemas reais, tendo obtido bons resultados. / Text mining provides powerful techniques to help on the current needs of understanding and organizing huge amounts of textual documents. One way to do this is to build topic taxonomies from these documents. Topic taxonomies can be used to organize the documents, preferably in hierarchies, and to identify groups of related documents and their descriptors. Constructing high quality topic taxonomies, either manually, automatically or semi-automatically, is not a trivial task. This work aims to use text mining techniques to build topic taxonomies for well defined knowledge domains, helping the domain expert to understand and organize document collections. By using well defined knowledge domains, only unsupervised statistical methods are used, with a bag of word representation for textual documents. These representations are independent of the context of the words in the documents as well as in the domain. Thus, if the domain is well defined, a decrease of mistakes of the result interpretation is expected. The proposed methodology for topic taxonomy construction is an instantiation of the text mining process. At each step of the process, some solutions are proposed and adapted to the specific needs of topic taxonomy construction. Among these solutions there are some innovative contributions to the state of the art. Particularly, this work contributes to the state of the art in three different ways: the selection of n-grams attributes in text mining tasks, two models for hierarchical document cluster labeling and a validation model of the hierarchical document cluster labeling. Additional contributions include adaptations and methodologies of attribute selection process choices, attribute representation, taxonomy visualization and obtained taxonomy reduction. Finally, the proposed methodology was also validated by successfully applying it to real problems
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Efeitos das radiações gama e ultra-sônica em suco de laranja contaminado por Alicyclobacillus acidoterrestris / Effects of the gamma and ultrasound radiation in orange juice contaminated by Alicyclobacillus acidoterrestris

Pires, Cristiane Cassiolato 28 August 2006 (has links)
O suco de laranja possui características que dificultariam ou mesmo impediriam o crescimento de microrganismos, mesmo assim já foram isolados fungos filamentosos, leveduras, bem como bactérias lácticas e termorresistentes. Dentre as bactérias termorresistentes e deteriorantes está a Alicyclobacillus acidoterrestris que tem causado prejuízos no setor de suco de laranja concentrado e congelado. Esta bactéria está apta a crescer em temperaturas abaixo de 35°C, constituindo um risco aos sucos de laranja que estejam contaminados. Mesmo os que já passaram por tratamento térmico, se forem estocados em local sem refrigeração, podem sofrer deterioração. Como os métodos tradicionais de descontaminação e conservação não têm se mostrado eficientes na inviabilização dessa bactéria, outras formas de esterilização tornam-se necessárias, dentre elas destacam-se as radiações gama e ultra-sônica. A radiação gama é capaz de esterilizar alimentos e reduzir as cargas microbiológicas, permitindo assim ampliar o período de armazenamento. A aplicação de ultra-som tem sido utilizada atualmente com o objetivo de controle microbiológico, sendo essa técnica eficiente por causar a destruição das células microbianas. Sendo o Brasil o maior produtor e exportador de suco de laranja concentrado congelado, no presente trabalho foram conduzidos dois experimentos com o objetivo de determinar a resistência da bactéria A. acidoterrestris às radiações gama e ultra-sônica, em suco de laranja previamente contaminado. As amostras de suco de laranja foram diluídas a 11,5 °Brix e inoculadas com uma suspensão bacteriana, passando pelos processos de radiação gama com as doses de 0, 2; 4; 6 e 8, kGy e ultra-sônica com as freqüências de 25, 35 e 42 kHz e com os tempos de exposição de 0, 1, 5, 10 e 20 minutos. Após o tratamento, as amostras foram armazenadas em temperatura ambiente (25±2°C) e de refrigeração (4±1°C). Para as análises microbiológicas as amostras foram diluídas em escala decimal, plaqueadas pela técnica de \"pour plate\". As placas de Petri permaneceram em estufa a46±2°C, por 48 horas, após esse período procedeu-se a contagem das UFC mL-1. A qualidade microbiológica do suco foi avaliada em determinados períodos de armazenamento (1, 10, 20, 30 e 40 dias). Através de análise de variância dos experimentos conduzidos com as radiações, observou-se que houve efeito significativo (p<0,05) com relação à dose de radiação gama que apresentou uma redução da carga microbiana com o aumento da dose de radiação e à interação do período com a temperatura de armazenamento demonstrou que houve uma oscilação na contagem total para a temperatura ambiente, mas para a temperatura de refrigeração uma diminuição gradativa com o aumento do período de armazenamento, A freqüência do ultra-som mostrou uma diminuição da contagem microbiana com o aumento da freqüência e o período de armazenamento apresentou a maior contagem no primeiro dia. Os dois tratamentos mostraram-se eficientes na redução bacteriana, mas não na completa eliminação da A. acidoterrestris. / The orange juice has attributes could make that hard or even block the growth. of microorganisms, even so already have been isolated filamentous fungi, yeast, as well lactics and heat resistant bacteria. Alicyclobacillus acidoterrestris is a heat resistant bacteria that has done damage in the orange juice concentrated and frozen business. This bacterium is able the grown in temperatures below 35°C constituting a risk to orange juices that have been contaminated. Even those that already pass trough thermal treatment may deteriorated, if they are storage in place without refrigeration. As the traditional methods of decontamination and conservation have not been effective in inviabilizated this bacterium, others methods of sterilization are need, among them are gamma and ultrasound radiation. The gamma radiation is able to sterilize foods and reduce the microbiology density, allowing in this way to enhance the period of storage. The ultrasound application has been used currently with the aim to microbiology control, been this technique effective in the microbial cell destruction. The Brazil, are the major producer and exporter of concentrated frozen orange juice, due to it, the present work was carried out to two experiments with the aim to determinate the resistance of the bacterium Alicyclobacillus acidoterrestris to gamma and ultrasound irradiation, in the orange juice, priory contaminated. The orange juice samples was diluted to 11,5°Brix and the bacteria suspensions was added, passed by process of radiation gamma with dose of 0, 2, 4, 6 and 8 kGy and ultrasonic with the frequency of 25, 35 and 42 kHz and with the time of exposition of 0, 1, 5, 10 and 20 minutes. After the treatment, the samples were storaged in room temperature (25±2°C) and of refrigeration (4±1°C). For the microbial analyses, the samples were diluted in to decimal scale, plated by \"pour plate\" technique. The Petri plates were storage in warn temperature (46±2°C) by 48 hours, after it the UFC was counted mL. The microbiological quality of the juice was evaluated in determinated period of storaged (1, 10, 20, 30 e 40 days). By statistical of variance of the experiment conducted with the radiations, it was noted that has been significant effect (p>0,05) to gamma radiation doses where occurred microbial density reduction with the raised of radiation doses and the interaction of the period with the storage temperature, where at room temperature occurred a oscillation in the total counting of bacteria, but for refrigeration temperature the total counting of bacteria reduced with the raised of storage period. The ultrasound frequency showed also reduction to the microbial counting with the raised of the ultrasound frequency and the period of storage showed the highest bacteria counting in the first day. Both treatment, were effective to promote bacteria reduction, but not completed elimination of A. acidoterrestris.

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